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2022—2023年新冠疫情期間及疫情后手足口病流行病學(xué)及分型分析

2024-01-20 14:53:54肖雪梁妤婷古銳李莉陳娟鐘家禹
關(guān)鍵詞:通用型病原陽性率

肖雪 梁妤婷 古銳 李莉 陳娟 鐘家禹

1 廣州天愛兒科??崎T診部,廣州 510630;2 佛山南海天愛普通專科門診部,佛山528299;3廣州醫(yī)科大學(xué)附屬廣州市婦女兒童醫(yī)療中心,廣州 510120

手足口?。╤and, foot and mouth disease,HFMD)是腸道病毒(enterovirus,EV)引起的常見小兒急性傳染病之一,多發(fā)生于5 歲以下的嬰幼兒,臨床癥狀以手掌、腳掌、口腔黏膜上發(fā)生水皰、發(fā)燒、嘔吐為特征的一種病毒性皮膚?。?]。2008 年暴發(fā)時(shí)HFMD 病原主要以腸道病毒71 型(enterovirus 71,EV71)、柯薩奇病毒 A 組 16 型(Coxsaekievirus group A 16,CA16)為主要病原[2],隨后在2013 年前后HFMD 的病原譜逐漸發(fā)生改變,非EV71 非CA16 腸道病毒成為HFMD 的主要病原體[3-5],其中以CA6 為HFMD 的主要流行病原體[6-7]。HFMD 從2008 年暴發(fā)以來,10多年來持續(xù)流行,也說明了HFMD的病原譜是在不斷變化,需要長期監(jiān)測與跟蹤。

2020 年,新冠病毒突然暴發(fā),改變了人們的生活方式,戴口罩,減少了傳染病的流行。為了解新冠疫情期間及疫情后廣佛地區(qū)的HFMD 病原感染情況,我們選取了新冠疫情期間及疫情后的兩年進(jìn)行對比,以分析廣佛地區(qū)EV 的感染情況。

資料與方法

1.一般資料

2022 年1 月至2023 年8 月,采集到廣州天愛兒科??崎T診部和佛山南海天愛普通??崎T診部就診的疑似HFMD患者標(biāo)本共659 份,其中2022 年362 份,2023 年1—8 月297份;標(biāo)本大部份是咽拭子和肛拭子,小部份是皰疹液等。

2.方法

2.1.病原學(xué)熒光逆轉(zhuǎn)錄聚合酶鏈反應(yīng)(RT-PCR)方法檢測 2022 年1 月至2023 年8 月門診收集659 份標(biāo)本都外送到廣州金域檢測公司同時(shí)進(jìn)行EV 通用型、EV71、CA16 熒光PCR 檢測;檢測試劑是金域公司的EV71、CA16 和EV 通用型三重?zé)晒釶CR 試劑盒,結(jié)果按說明書進(jìn)行判斷。

2.2.EV 型別5'非編碼區(qū)(UTR)的引物設(shè)計(jì)與擴(kuò)增 在對熒光PCR 檢測結(jié)果為EV71 和CA16 病毒陰性而EV 通用型為陽性的標(biāo)本,設(shè)計(jì)了UTR合成兩對引物,引物參考之前的文章[8],提取病毒RNA 進(jìn)行RT-PCR,電泳片段符合預(yù)期大小的PCR產(chǎn)物送上海英駿生物技術(shù)有限公司進(jìn)行序列測定,根據(jù)UTR基因核苷酸序列的同源性進(jìn)行型別鑒定。

結(jié)果

1.2022年HFMD病原體檢出情況

2020 年新冠病毒突然暴發(fā)后,EV 陽性率明顯下降,2022 年同時(shí)進(jìn)行EV 通用型、EV71、CA16 檢測的標(biāo)本有362份,總陽性47份,陽性率為12.98%,EV71全年沒有檢測到,CA16病毒陽性率為1.38%(5/362),CA16僅在4—7月份檢測到,且檢出率不高。非EV71非CA16的EV全年陽性率為11.60%(42/362)。全年檢出率較高在5—7 月份,最高檢出率在6月份,為22.22%。見表1。

2.2023年1—8月HFMD病原體檢出情況

2023年是新冠病毒全國放開管控的第一年,EV 陽性明顯增多,2023 年1—8 月同時(shí)進(jìn)行EV 通用型、EV71、CA16 3種病毒檢測的手足口病標(biāo)本有297份,總陽性100份,陽性率為33.67%,1—8 月沒有檢出EV71,CA16 的檢出率為2.36%(7/297),非EV71 非CA16 的EV 共檢測出93 份,陽性率為31.31%(93/297),2023 年6、7 月份維持于較高的陽性率。2023年1—8月各月同時(shí)檢測3種病毒情況見表1。

3.非EV71非CA16的EV型別擴(kuò)增與分析

我們選取了熒光PCR檢測結(jié)果中的EV71和CA16是陰性而EV 通用型為陽性的部份標(biāo)本提取RNA,選取2022 年標(biāo)本26份、2023年標(biāo)本38份,提取RNA進(jìn)行RT-PCR,對電泳片段符合預(yù)期大小的PCR產(chǎn)物送上海英駿生物技術(shù)有限公司測序,2022 年標(biāo)本成功測序20 份,可分型為18 份,2023年成功測序31份,可分型為28份。序列用美國國家生物技術(shù)信息中心(NCBI)的BLAST 程序進(jìn)行比較后,確定序列屬于EV 型別,各序列屬于病原譜如表2。在2022—2023 年中檢出的非EV71 非CA16 的EV 有9 種,分別為:CA6、CA10、CA4、CA2、CA8、柯薩奇病毒B 組5 型(CB5)、CB2、CB3、??刹《?0 型(E30)。其中CA6 在非EV71 非CA16 的EV 中占主要病原,檢出率為27.45%,第二位是CA10,檢出率為15.69%,這兩種病毒占到非EV71 非CA16的EV的43.14%。各種型別的EV檢出情況見表2。

討論

HFMD 在我國從2008 年大規(guī)模暴發(fā)以來,連續(xù)多年在我國尤其是華南地區(qū)普遍流行,HFMD是一種對5歲以下兒童具有嚴(yán)重危害性的傳染病,2008 年已將HFMD 納入國家法定傳染病丙類傳染病。2020年,新冠病毒的突然暴發(fā),導(dǎo)致管控措施的出現(xiàn):如戴口罩、城市局部封閉,同時(shí)限制人口流動,改變了人們的生活方式,2022 年底才放開疫情管控。為了解新冠疫情期間及放開后廣州地區(qū)的HFMD 病原感染情況,我們選取了新冠疫情期間及新冠疫情期放開后這段時(shí)間進(jìn)行對比,分析廣州和佛山地區(qū)手足口病的感染情況。

2022 年是新冠病毒暴發(fā)的第3 年,也是疫情管控的最后一年,2022年上半年廣佛地區(qū)疫情管控相對較松的,下半年從國慶節(jié)后收緊直到11 月底放開,12 月份大規(guī)模感染新冠病毒,反映在HFMD 病原體流行特征為:上半年相對有流行,下半年流行明顯下降。2022 年全年我們門診HFMD 的總陽性檢出率為12.98%(47/362),2022 年全年沒有檢出EV71,CA16 檢出率也較低,僅在4—7 月有檢出,在同時(shí)進(jìn)行3 種病毒檢測標(biāo)本中,非EV71 非CA16 的EV,除12 月外全年11 個(gè)月都有檢出,因?yàn)?2 月是疫情放開的第一個(gè)月,很多人感染了新冠病毒,12月份沒有檢出EV,5—7月是EV檢出較高的月份,其中全年最高檢出率在6月份,為22.22%(8/36)。2023 年是新冠疫情放開的第一年,在1—4 月,EV的檢出率不算高,而到了5 月份,EV 的檢出率突然增加,到了8 月份又下降明顯,2023 年1—8 月的檢出率為33.67%,最高檢出率為6月,為54.55%。2023年廣佛地區(qū)的EV檢出在5—7 月陽性率有一個(gè)突然上升的趨勢,增加明顯,而到8 月份又下降明顯。2022 年的HFMD 流行特征與前兩年我們收集的數(shù)據(jù)(2020、2021)有些不一樣[9],2022 年因?yàn)橄掳肽甑墓芸嘏c放開,2022年下半年HFMD并沒有明顯的流行,與2020年上半年管控相似,而在2021年HFMD 還是存在兩個(gè)明顯的流行時(shí)期,到了2023 年,前4 月EV 并沒有明顯流行,可能是人們剛剛感染了新冠病毒,而到了5 月份后,EV感染突然開始上升,到了8月份又比7月份下降明顯。新冠疫情結(jié)束后的2023 年比疫情期間的2022 年EV 陽性率高,今后的EV 感染趨勢是否存在與2019 年之前那樣存在夏秋兩季流行,有待觀察。

為了解2022—2023年EV 中除CA16、EV71外的具體哪些病毒流行,我們選取了熒光PCR 檢測結(jié)果為EV71 和CA16 是陰性而EV 通用型為陽性的部份標(biāo)本直接提取RNA,設(shè)計(jì)了EV 5'UTR 的引物進(jìn)行PCR 擴(kuò)增,之后進(jìn)行測序及序列分析。2022—2023 年共選取了64 份標(biāo)本進(jìn)行PCR 擴(kuò)增測序分析,有效分析了51 份序列,可以分型的有46 份,而5 份不能確定型別的,占9.80%,本次非EV71 非CA16 病毒確定了9 種病毒型別,這些型別存在于我們之前的統(tǒng)計(jì)數(shù)據(jù)中[8-9],HFMD 經(jīng)過10 多年的演變,感染型別趨于多樣化[10],這次我們分析的序列中分型的型別相對偏少,這可能與我們擴(kuò)增的標(biāo)本數(shù)量、分析的序列偏少有關(guān)。我們確定的型別中占主要的是腸道病毒A 組,為CA6、CA10、B5 等,其中CA6 和CA10 是最主要的兩種病毒,這與國內(nèi)別的地區(qū)流行趨勢基本一致[11-13],CA6 和CA10 已成為全球HFMD流行的主要病原[14-16]。

2022—2023年的檢測標(biāo)本中沒有檢測出EV71感染,這與我國多年來推行EV71 疫苗相關(guān)[17],而CA16 感染率也是較低,非EV71非CA16的病毒占主要,這種感染狀況在全國持續(xù)多年[3-4,18],非EV71 非CA16 的EV 中存在較多型別,型別復(fù)雜,現(xiàn)在主要以CA6、CA10為主,CA6從2013年前后在我國開始流行[7,19],現(xiàn)在已成為HFMD 的主要病原體,而近年來柯薩奇病毒B 組型別檢出率也相對較高,其中以CB5 為多,同時(shí)??刹《拘蛣e也檢出較多[13],在我們測序中,有一定比例的非EV71 非CA16 的EV 難以定型,可能還有別的型別沒有區(qū)分,這表明HFMD 感染型別較多,也側(cè)面說明我國HFMD 這10 多年長期一直流行,可能與EV 型別多樣化相關(guān)。因此,在監(jiān)測EV71 和CA16 這兩種主要型別EV 的同時(shí),需要加強(qiáng)對非EV71 非CA16 的EV 的監(jiān)測及分子流行病學(xué)研究。

利益沖突 所有作者均聲明不存在利益沖突

作者貢獻(xiàn)聲明 肖雪:構(gòu)建思路,論文寫作,設(shè)計(jì)試驗(yàn);梁妤婷、古銳:標(biāo)本采集,數(shù)據(jù)收集,整理資料;李莉、陳娟:標(biāo)本采集,實(shí)施試驗(yàn),分析數(shù)據(jù);鐘家禹:審核論文,修改論文

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