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基于SSR熒光標(biāo)記的新疆甜瓜種質(zhì)資源遺傳多樣性與群體結(jié)構(gòu)分析

2024-02-22 00:00:00李超楊英鄭賀云楊建麗陳偉楊咪孫玉萍
新疆農(nóng)業(yè)科學(xué) 2024年11期
關(guān)鍵詞:遺傳多樣性

摘"要:【目的】""分析新疆甜瓜種質(zhì)資源的遺傳多樣性與群體結(jié)構(gòu),為甜瓜種質(zhì)資源收集、遺傳改良和高效利用提供理論基礎(chǔ)。

【方法】""選取甜瓜種質(zhì)182份,利用152對(duì)SSR引物對(duì)其進(jìn)行檢測(cè)。篩選出19對(duì)多態(tài)性較高的引物,利用TP-M13-SSR分子標(biāo)記分析182份新疆甜瓜種質(zhì)材料的遺傳多樣性,并根據(jù)Nei's遺傳距離(D)進(jìn)行聚類分析,以Structure軟件的混合模型聚類法分析其群體遺傳結(jié)構(gòu)。

【結(jié)果】""SSR標(biāo)記共檢測(cè)到160個(gè)等位基因,等位基因數(shù)(Na)的變化幅度為3~16個(gè),平均每對(duì)引物8.421 1個(gè),有效等位基因數(shù)(Ne)的變化幅度為1.092 0~6.087 9,平均為3.077 0;觀測(cè)雜合度(Ho)為0.011 0~1.000 0,平均0.309 7;期望雜合度(He)為0.084 5~0.838 0,平均為0.599 1;香農(nóng)信息指數(shù)(I)范圍為0.190 6~2.061 3,平均為1.239 9;各位點(diǎn)的多態(tài)性信息含量(PIC)為0.081 1~0.815 8,平均為0.555 8,大多數(shù)位點(diǎn)表現(xiàn)為高度多態(tài)性。182份甜瓜種質(zhì)材料被分為兩大亞群,亞群Ⅰ為88份甜瓜種質(zhì)材料,亞群Ⅱ?yàn)?4份甜瓜材料。當(dāng)K=2時(shí),ΔK出現(xiàn)明顯的峰值,182份甜瓜種質(zhì)材料分為2個(gè)亞群較為合適,且存在過度的純合性。

【結(jié)論】""新疆甜瓜種質(zhì)資源遺傳多樣性較為豐富,但與傳統(tǒng)4個(gè)變種的品種群分類結(jié)果不同。新疆甜瓜種質(zhì)資源可分為兩大亞群,群體中純合個(gè)體較多,但其他雜合個(gè)體間存在一定的基因交流。

關(guān)鍵詞:""甜瓜種質(zhì);遺傳多樣性;SSR;熒光標(biāo)記;群體結(jié)構(gòu)

中圖分類號(hào):"S652;S603.2""""文獻(xiàn)標(biāo)志碼:"A""""文章編號(hào):"1001-4330(2024)11-2614-12

0"引 言

【研究意義】甜瓜(Cucumis melo L., 2n=2x=24)屬葫蘆科黃瓜屬1年生草本植物,具有高度多樣化和多態(tài)化的特點(diǎn)[1-2]。甜瓜可分為長(zhǎng)毛亞種C.melon L.subsp.melo和短毛亞種C.melo subsp.agrestis (Naudin) Pangalo)及其若干變種[3-6] 。分析新疆甜瓜種質(zhì)資源的多樣性,對(duì)于甜瓜新品種選育、物種進(jìn)化及分類具有重要意義[7-8]?!厩叭搜芯窟M(jìn)展】形態(tài)學(xué)方法可用于甜瓜種質(zhì)資源類群劃分和馴化聚類結(jié)構(gòu)分析[7,9,10],中國(guó)新疆甜瓜地方品種與塔吉克斯坦甜瓜遺傳關(guān)系較近,可分為3個(gè)類群[11-13]。但分子標(biāo)記技術(shù)穩(wěn)定,較傳統(tǒng)形態(tài)學(xué)方法更能正確反映材料的遺傳背景和親緣關(guān)系[14]。SSR(Single nucleotide polymorphism,單核苷酸多態(tài)性)因其良好的再現(xiàn)性、多等位性和共顯性等優(yōu)點(diǎn)[15]被應(yīng)用于不同作物的遺傳圖譜[16,17]、指紋圖譜構(gòu)建[18]、遺傳多樣性和群體結(jié)構(gòu)分析等研究[19,20]。在甜瓜種質(zhì)資源研究方面,SSR分子標(biāo)記更多地被應(yīng)用于指紋圖譜的構(gòu)建[21]和遺傳多樣性分析[2,5,6,22-24]。TP-M13-SSR分子標(biāo)記(Tailed primer M13 microsatellite markers)技術(shù)結(jié)合了SSR分子標(biāo)記和熒光測(cè)序技術(shù)的優(yōu)點(diǎn),具有分辨率高、重復(fù)性強(qiáng)、結(jié)果準(zhǔn)確、數(shù)據(jù)記錄工作量小等優(yōu)點(diǎn),被廣泛應(yīng)用于不同作物種質(zhì)資源的遺傳多樣性[24-27]、指紋圖譜構(gòu)建[28,29]和品種鑒定等[30]?!颈狙芯壳腥朦c(diǎn)】新疆是厚皮甜瓜的主產(chǎn)區(qū),種質(zhì)資源多樣復(fù)雜。目前利用TP-M13-SSR技術(shù)對(duì)新疆甜瓜種質(zhì)資源遺傳多樣性及群體結(jié)構(gòu)的研究分析鮮見報(bào)道。需基于SSR熒光標(biāo)記分析新疆甜瓜種質(zhì)資源遺傳多樣性與群體結(jié)構(gòu)?!緮M解決的關(guān)鍵問題】以收集保存的182份新疆甜瓜種質(zhì)資源為研究對(duì)象,應(yīng)用TP-M13-SSR分子標(biāo)記分析其遺傳多樣性和群體結(jié)構(gòu),研究厚皮甜瓜種質(zhì)之間的遺傳關(guān)系,為甜瓜種質(zhì)資源的收集、引進(jìn)以及品種改良提供科學(xué)依據(jù)。"

1"材料與方法

1.1"材 料

以收集的182份新疆地方厚皮甜瓜種質(zhì)(其中南疆97份,東疆58份,北疆24份,不確定的3份)為材料,目前均保存于種質(zhì)庫(kù)中。所有試驗(yàn)材料均種植于新疆維吾爾自治區(qū)葡萄瓜果研究所西甜瓜基地溫室中。表1

1.2"方 法

1.2.1"基因組DNA的提取與檢測(cè)

采集供試材料幼嫩葉片,采用改良CTAB法[31]提取其基因組DNA。用美國(guó)Thermo Scientific NanoDrop One 超微量分光光度計(jì)和1%瓊脂糖凝膠電泳檢測(cè)DNA濃度、純度和質(zhì)量,并用ddH2O將母液質(zhì)量濃度稀釋至50 ng/μL,-20℃保存,備用。

1.2.2"引物合成與篩選

普通引物由北京華大基因科技有限公司合成。從報(bào)道的152對(duì)SSR引物中,通過8%非變性聚丙烯酰胺凝膠電泳、銀染檢測(cè),初步篩選出條帶清晰、多態(tài)性高、穩(wěn)定性強(qiáng)的引物。

TP-M13-SSR引物由5′端帶M13接頭序列(5′-TGTAAAACGACGGCCAGT-3′)的上下游引物和具有熒光標(biāo)記(HEX-green、TAMRA-yellow、6-FAM-blue)的M13引物組成。所用引物由上海派森諾生物科技有限公司合成。

1.2.3"PCR擴(kuò)增及其產(chǎn)物檢測(cè)

20 μL的SSR反應(yīng)體系包括DNA模板1 μL,正向熒光引物(10 μmol/L)1 μL,反向普通引物(10 μmol/L)1 μL,10×buffer 2 μL,dNTP 0.5 μL,Taq酶0.5 μL,ddH2O 14 μL。PCR反應(yīng)在PCR儀ABI-2720上進(jìn)行,PCR反應(yīng)條件為:95℃預(yù)變性5 min;95℃變性30 s,52~62℃退火30 s,72℃延伸30 s,10個(gè)循環(huán);95℃變性30 s,52℃退火30 s,72℃延伸30 s,25個(gè)循環(huán);72℃延伸7 min。

取1 μL 的PCR產(chǎn)物加入LIZ500分子量?jī)?nèi)標(biāo)0.1 μL和去離子甲酰胺8.9 μL,混合加入PCR儀,95℃變性5 min,迅速冷卻到 4℃后離心,在ABI3730XL DNA遺傳分析儀上進(jìn)行自動(dòng)熒光檢測(cè)。

1.3"數(shù)據(jù)處理

用GeneMapper4.0軟件對(duì)ABI3730XL Date collection軟件收集的182份甜瓜種質(zhì)資源的原始數(shù)據(jù)進(jìn)行初步處理,分析擴(kuò)增片段峰值,讀取擴(kuò)增片段大??;運(yùn)用PoPGen32軟件統(tǒng)計(jì)觀測(cè)等位基因數(shù)(Na)、有效等位基因數(shù)(Ne)、Shannon's 信息指數(shù)(I)、觀測(cè)雜合度(Ho)、期望雜合度(He)、Nei's遺傳距離值(D)、多態(tài)性信息含量指數(shù)(PIC)(由PIC_CALC計(jì)算)等遺傳學(xué)參數(shù)。在 MEGA5.1中構(gòu)建遺傳聚類圖,用Origin軟件進(jìn)行PCoA分析,用 STRUCTURE軟件(由structure2.3.4、CLUMPP_Windows.1.1.2、distrut1.1計(jì)算)進(jìn)行群體結(jié)構(gòu)分析,burnin period和MCMC iterations參數(shù)分別為10 000 和100 000,亞群數(shù)目(K)設(shè)置為1-20個(gè),每個(gè)K值獨(dú)立運(yùn)算10次,根據(jù)ΔK法確定最佳亞群數(shù)。根據(jù)最大遺傳比例進(jìn)行亞群歸類。

2"結(jié)果與分析

2.1"SSR引物的篩選

研究表明,利用156對(duì)SSR引物對(duì)21份果實(shí)差異性大的甜瓜品種進(jìn)行PCR擴(kuò)增,并對(duì)PCR產(chǎn)物進(jìn)行8%非變性聚丙烯酰胺凝膠電泳檢測(cè),篩選出19對(duì)條帶清晰、多態(tài)性高、擴(kuò)增穩(wěn)定的SSR引物,并用于182份甜瓜種質(zhì)材料的熒光毛細(xì)管電泳試驗(yàn)。其中19對(duì)SSR引物的峰圖簡(jiǎn)單、等位變異合理,可用于試驗(yàn)材料的遺傳多樣性分析。以引物SSR12083為例,毛細(xì)管電泳檢測(cè)結(jié)果能準(zhǔn)確地讀取具體的片段大小。供試材料多為純合。表2,圖1

2.2"SSR分子標(biāo)記多態(tài)性

研究表明,19個(gè)SSR位點(diǎn)在182份新疆甜瓜種質(zhì)資源中檢測(cè)到160個(gè)等位基因,Na的變化幅度為3~16個(gè),平均為8.42個(gè),這些引物可適于182份新疆甜瓜種質(zhì)資源的遺傳多樣檢測(cè)。Ne是反映群體遺傳變異大小的指標(biāo),Ne和Na差異越大,等位基因在群體中分布越不均勻。Ne的變化幅度為1.092 0~6.087 9,平均為3.077 0,其中最高的是CMATN89,為6.087 9,其次為PM4和CMCTN71,該3對(duì)引物有較高的檢測(cè)效率。多態(tài)性信息含量(PIC)值大于 0.50 的位點(diǎn)為高度多態(tài)位點(diǎn),處于0.25~0.50 的為中度多態(tài)位點(diǎn),小于0.25 時(shí)為低度多態(tài)位。182份甜瓜種質(zhì)資源材料的PIC值的變化范圍為 0.081 1~0.815 8,平均為0.555 8,其中12對(duì)引物的PIC值大于0.50,大部分屬于高度多態(tài)性SSR標(biāo)記。表1

2.3"群體遺傳多樣性

研究表明,觀測(cè)雜合度(Ho)是指隨機(jī)抽取的2個(gè)樣本等位基因不同的概率;期望雜合度(He)是指理論計(jì)算得出的雜合度。He可以衡量群體的遺傳多樣性高低,He值越高,反映群體的遺傳一致性就越低,其遺傳多樣性就越豐富。Ho值范圍在0.011 0~1.000 0,平均為0.309 7;He值范圍在0.084 5~0.838 0,平均為0.599 1,且19對(duì)引物中,有13對(duì)的He均大于平均值,182份資源的遺傳多樣性豐富;Ho平均值明顯小于He平均值,且有15對(duì)引物的Ho低于He,絕大多數(shù)位點(diǎn)均出現(xiàn)了純合子偏多的現(xiàn)象。 Shannon's 指數(shù)(I)較He相比,更能反映遺傳多樣性程度的,I越大,群體離散度越高,遺傳多樣性越豐富。19對(duì)SSR引物的I值變化幅度為0.190 6~2.061 3,平均為1.239 9,研究群體遺傳多樣性比較豐富。SSR引物CMATN89、CMGAN21、CMTCN6對(duì)應(yīng)的Nei's遺傳距離值(D)較高,分別為0.835 7、0.813 4、0.814,群體間這些基因位點(diǎn)的遺傳多樣性高。19對(duì)SSR引物鑒定計(jì)算的遺傳分化系數(shù)(Fst)值范圍在0.334 5~0.983 0,平均為0.783 9,大于0.25,種群間的遺傳分化水平處于較高水平,有78.39%的變異存在于甜瓜種質(zhì)群體間,21.61%的變異存在于甜瓜種質(zhì)群體內(nèi)的個(gè)體間,182份新疆甜瓜種質(zhì)資源的遺傳變異主要來(lái)源于種質(zhì)群體間。基因流(Nm)值為0.004 3~0.497 4,平均為0.113 5且均小于1,種群間某些基因交流受到影響。表3

2.4"SSR分子標(biāo)記的甜瓜種質(zhì)聚類

研究表明,南疆(97份)、東疆(吐魯番市、哈密市58份)、北疆(24份)及其他(3份)的182份甜瓜種質(zhì)資源進(jìn)行聚類可分為2個(gè)亞群。Ⅰ 類分別包含東疆甜瓜種質(zhì)41份、南疆甜瓜種質(zhì)29份、北疆甜瓜種質(zhì)15份及其他甜瓜種質(zhì)3份,共計(jì)88份,占總供試材料的48.35%,包括瓜旦甜瓜變種3份、夏甜瓜變種37份、冬甜瓜變種22份及未明確分類種質(zhì)26份。其中來(lái)自皮山縣的努拉伊與其他種質(zhì)遺傳距離較遠(yuǎn),單獨(dú)成一支,屬于夏甜瓜變種納西甘品種群;白巴登也單獨(dú)成一支;圓球密極甘(編號(hào)36)、阿比那瓦提(編號(hào)38)、一窩旦(編號(hào)47)和賽熱克吐木休克(編號(hào)96)聚為一支,其中編號(hào)38屬于夏甜瓜變種可口奇夏甜瓜品種群,編號(hào)96屬于冬甜瓜變種可口奇冬瓜品種群;Ⅱ 類分別包含南疆甜瓜種質(zhì)69份、東疆甜瓜種質(zhì)17份以及北疆甜瓜種質(zhì)8份,共94份,占總供試材料的51.65%。Ⅱ類又可分為3個(gè)小群A、B和C。小群A包括41份甜瓜種質(zhì),其中南疆35份,東疆6份,含有夏甜瓜變種23份、冬甜瓜變種5份、未確定分類種質(zhì)12份和瓜旦甜瓜變種1份;小群B包括24份甜瓜種質(zhì),其中南疆18份,東疆4份,北疆2份,包含夏甜瓜變種15份、冬甜瓜變種4份、未確定分類種質(zhì)5份;小群C包括29份甜瓜種質(zhì),其中南疆16份,東疆7份,北疆6份,含有夏甜瓜變種8份、冬甜瓜變種5份、瓜旦甜瓜變種2份、卡沙巴甜瓜變種1份和未確定分類種質(zhì)13份。供試材料中不同地方收集到的同名種質(zhì)并未聚在1類,存在同名異物現(xiàn)象,如編碼1、21、72、85、92、145和159同為賽熱克可口奇,編碼67、77和176同為伯謝克辛,卻未能聚為一類。也存在疑似同名同物的,如編號(hào)93和129、編號(hào)15和136,聚類位置相同。圖2"

2.5"群體結(jié)構(gòu)與主坐標(biāo)

研究表明,當(dāng)K=2時(shí),ΔK出現(xiàn)峰值,將全部調(diào)查資源分為2個(gè)亞群。圖中每一種顏色代表一個(gè)亞群,每個(gè)小柱狀堆疊圖代表一個(gè)個(gè)體,亞群I(綠色所示)由份(48.35%)種質(zhì)組成,亞群II(紅色所示)由份(51.65%)種質(zhì)組成,與聚類結(jié)果一致。如果個(gè)體至少有20%的血統(tǒng)來(lái)自其他不同群體,則被認(rèn)為是混合個(gè)體,亞群I中純合個(gè)體和混合個(gè)體的數(shù)量分別為66個(gè)(75.00%)和22個(gè)(25.00%)。亞群體II中則分別為66(70.21%)和28(29.79%)。對(duì)182份新疆甜瓜種質(zhì)的SSR標(biāo)記數(shù)據(jù)進(jìn)行主坐標(biāo)分析(PCoA),南疆(紅色)、東疆(綠色)和北疆(藍(lán)色)聚為兩大亞群,與群體結(jié)構(gòu)分析相互驗(yàn)證,結(jié)果一致。圖3,圖4,圖5

3"討 論

3.1

進(jìn)行品種遺傳改良必須了解種質(zhì)資源的遺傳信息與特點(diǎn),遺傳多樣性作為生物所攜帶遺傳信息的總和,對(duì)分析重要性狀和輔助育種具有無(wú)可替代的作用[32]。

研究利用19個(gè)多態(tài)性SSR標(biāo)記對(duì)中國(guó)新疆"的182份甜瓜種質(zhì)進(jìn)行檢測(cè),平均等位基因數(shù)"(Na)為8.421 1,平均多態(tài)信息含量(PIC)為0.555 8,均大于Ansari等[33]研究的印度甜瓜、Carvalho等[34]研究的巴西商品甜瓜、Chikh-Rouhou等[35]研究的突尼斯甜瓜以及Kaar等[36]研究的土耳其甜瓜相應(yīng)參數(shù),說明新疆的甜瓜種質(zhì)資源遺傳多樣性較為豐富,支持新疆為厚皮甜瓜的次級(jí)起源中心的假說[37]。期望雜合度值越高,反映群體的遺傳一致性就越低,其遺傳多樣性就越豐富。觀測(cè)雜合度(Ho)小于期望雜合度(He),純合子偏多。研究中觀測(cè)雜合度(Ho)值平均為0.309 7,期望雜合度(He)值平均為0.599 1,除SSR標(biāo)記CMCTN7、CMGAN21、CMTCN6、PM4外其余的期望雜合度均高于觀測(cè)雜合度,大部分表現(xiàn)出純合子偏多的現(xiàn)象,可能由于早期交通閉塞形成小群體的分布模式,容易引起近交,從而導(dǎo)致群體內(nèi)純合個(gè)體增加。基因流(Nm)表示基因在種群之間交換的多少?;蛄鲾?shù)值大說明群體之間遺傳關(guān)系較近,反之亦然[38]。研究遺傳分化研究結(jié)果表明,基因流(Nm)為0.113 5,相對(duì)較低,說明群體間基因交流受到一定限制,可能是由于新疆地理?xiàng)l件影響,空間相對(duì)隔離,形成“島式”分布,導(dǎo)致群體間遺傳分化增大。遺傳分化系數(shù)(Fst)為0.783 9,大于0.25,新疆甜瓜群體間有很大遺傳分化。此結(jié)果與zhang等[23]研究結(jié)果一致。

3.2

試驗(yàn)研究收集的各地域甜瓜種質(zhì)數(shù)量分別為97份、24份、58份及3份未確定種質(zhì)。利用19對(duì)SSR標(biāo)記可將供試種質(zhì)材料聚為2大亞群,Ⅰ類主要為新疆東疆和北疆收集的88份甜瓜種質(zhì)資源,Ⅱ 類主要為南疆的94份甜瓜種質(zhì)資源,Ⅱ類又可分為3個(gè)小群A、B和C,并未嚴(yán)格按地理位置區(qū)分,主坐標(biāo)分析(PCoA)結(jié)果也說明這一點(diǎn)。張永兵等[13]利用表型數(shù)據(jù)對(duì)新疆121份甜瓜種質(zhì)進(jìn)行聚類分析表明,除哈密野瓜和炮彈瓜外,其余材料被聚為兩類,與研究結(jié)果一致。同時(shí)也顯示研究收集的甜瓜種質(zhì)可能存在同名異物的現(xiàn)象,如卡拉尕西(編號(hào)49和153)、卡拉可口奇(編號(hào)49、170和178)、卡拉麥蓋(編號(hào)88、89和122)、波斯皮牙子(編號(hào)86、169、180和181)等。

群體結(jié)構(gòu)分析可以揭示出種質(zhì)材料的內(nèi)在遺傳結(jié)構(gòu),有助于闡明其遺傳組成[39]。研究利用Structure軟件對(duì)182份新疆甜瓜種質(zhì)進(jìn)行分析,以確定研究群體的最佳亞群數(shù)目。參照Evanno等[40]的方法將甜瓜種質(zhì)分為2個(gè)亞群,并且與張永兵等[13]利用表型分析對(duì)121份新疆甜瓜進(jìn)行分類的結(jié)果相一致。類似地,Saha等[2]將印度46份甜瓜材料分為2個(gè)亞群,Andrade等[41]將巴西46份甜瓜分為2個(gè)亞群,說明中國(guó)新疆甜瓜和印度、巴西的甜瓜具有相似的遺傳馴化進(jìn)程或遺傳背景或有某種聯(lián)系。陳蕓等[42]利用SRAP對(duì)61份甜瓜種質(zhì)進(jìn)行遺傳多樣性分析,結(jié)果顯示中國(guó)新疆甜瓜與土耳其、伊朗、阿富汗的厚皮甜瓜有共同的起源。楊永等[14]研究結(jié)果表明中國(guó)新疆甜瓜與印度、西班牙的甜瓜親緣關(guān)系較近。研究群體結(jié)構(gòu)分析結(jié)果表明,供試的一些甜瓜種質(zhì)存在較高的純合性,說明新疆地方甜瓜品種之間缺乏雜交或與其他群體異交[23],從而形成了獨(dú)特的基因庫(kù)。"

4"結(jié) 論

供試甜瓜種質(zhì)的SSR分子標(biāo)記分析揭示了新疆甜瓜種質(zhì)資源存在較為豐富的遺傳多樣性。甜瓜種質(zhì)聚類和PCoA分析未按照地域區(qū)分,且與傳統(tǒng)4個(gè)變種的品種群分類結(jié)果不同。新疆甜瓜種質(zhì)資源可分為2大亞群,群體中純合個(gè)體較多,但其他混合個(gè)體間存在一定的基因交流。

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Genetic diversity and population structure analysis of melon"""germplasm resources in Xinjiang based on SSR fluorescence markers

LI Chao, YANG Ying, ZHENG Heyun, YANG Jianli, CHEN Wei, YANG Mi, SUN Yuping

(Research Institute of Grape and Melon of Xinjiang Uighur Autonomous Region, Shanshan Xinjiang 838200, China)

Abstract:【Objective】 ""To analyze the genetic diversity and population structure of Xinjiang melon germplasm resources in the hope of providing a theoretical basis for future collection, genetic improvement, and efficient utilization of melon germplasm resources.

【Methods】 """182 melon germplasms were selected, and 19 pairs of primers with high polymorphism were selected from 152 pairs of SSR primers.The genetic diversity of 182 Xinjiang melon germplasms was analyzed using TP-M13-SSR molecular markers, and the cluster analysis was conducted according to Nei's genetic distance (D), and the population genetic structure was analyzed using the hybrid model cluster method of Structure software.

【Results】 """The results showed that a total of 160 alleles were detected using SSR markers, with a variation range of 3-16 allele numbers (Na), an average of 8.421,1 per primer pair, and a variation range of 1.092,0-6.087,9 effective allele numbers (Ne), an average of 3.077,0; The observed heterozygosity (Ho) ranges from 0.011,0 to 1.000,0, with an average of 0.309,7; The expected heterozygosity (He) is 0.084,5-0.838,0, with an average of 0.599,1; The Shannon’ S Diversity Index (I) from 0.190,6 to 2.061,3, with an average of 1.239,9; The polymorphism information content (PIC) of each site from 0.081,1 to 0.815,8, with an average of 0.555,8.Most sites exhibit high polymorphism.The cluster analysis results showed that 182 melon germplasm materials were divided into two major subgroups, with subgroup I consisting of 88 melon germplasm materials and subgroup II consisting of 94 melon materials.The analysis of population genetic structure showed that when K=2, ΔK showed a significant peak, indicating that 182 melon germplasm materials were more suitable to be divided into two subgroups and there was excessive homozygosity.

【Conclusion】 """The genetic diversity of Xinjiang melon germplasm resources is relatively rich, but the classification results are different from the four traditional varieties.It can be seen that Xinjiang melon germplasm resources can be divided into two major subgroups from the analysis of population structure.There are more homozygous individuals in the population, but there is some gene exchange between other heterozygous individuals, which may be due to variety improvement or germplasm innovation by breeders.

Key words:""melon germplasm; genetic diversity; SSR; fluorescence markers; population structure analysis

Fund projects:""Tianshan Youth Program Project (2020Q140);Key Ramp;D Projects in Turpan City (2023003) ; Tianshan Innovation Team Plan (2021D14009) ; Basic Scientific R amp;D Program of Public Welfare Research Institutions of Xinjiang Uygur Autonomous Region (KY2022109); National Consortium Research Project on Muskmelons Breeding of Characteristic Species; Tianshan Talent Plan Phase III of Xinjiang Uygur Autonomous Region

Correspondence author:"""SUN Yuping (1979-) , female, from Gansu,research associate,research direction:breeding of watermelon and melon, (E-mail) 1501218842@qq.com

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