秦?zé)ㄈ?,吳祥鍇,江哲宇,張 赟,林麗云,王黎洲,周 石
在肝細(xì)胞癌(hepatocellular carcinoma,HCC)進(jìn)展過程中有多種基因改變,其中微小核糖核酸(miRNA)參與細(xì)胞分化、代謝和發(fā)育等各種生物過程,在腫瘤組織中異常表達(dá),與腫瘤發(fā)生密切相關(guān)[1-5]。研究發(fā)現(xiàn),乳腺癌患者miR-155 水平升高有利于抗腫瘤免疫特征且與更好的預(yù)后相關(guān)[6];而宮頸癌患者miR-155 水平升高與不良預(yù)后相關(guān)[7]。miR-155 在肝癌中表達(dá)上調(diào),通過PI3K-AKT 通路抑制磷酸酶和緊張素同源物(PTEN)進(jìn)而促進(jìn)肝癌的進(jìn)展[8]。然而miR-155 是否存在其他下游靶點(diǎn)影響肝癌的進(jìn)展仍不清楚。本研究通過構(gòu)建miR-155 沉默穩(wěn)轉(zhuǎn)株以探討miR-155 對肝癌細(xì)胞增殖、侵襲、遷移和凋亡影響的機(jī)制。
用含10%FBS,1%青、 鏈霉素的完全培養(yǎng)基培養(yǎng)Huh7 人肝癌細(xì)胞(中國科學(xué)院細(xì)胞庫),當(dāng)細(xì)胞融合度達(dá)到85%以上時(shí)進(jìn)行傳代培養(yǎng),3 次傳代后待細(xì)胞狀態(tài)穩(wěn)定后進(jìn)行檢測。
取對數(shù)增長期的Huh7 肝癌細(xì)胞1×105個(gè)接種于6 孔板,待細(xì)胞生長至30%~40%,根據(jù)慢病毒說明書中推薦的復(fù)感染指數(shù)=5,換算最佳接種病毒滴度進(jìn)行轉(zhuǎn)染操作,分別轉(zhuǎn)染shNC、sh-miR-155慢病毒,轉(zhuǎn)染16 h 后進(jìn)行細(xì)胞換液。待細(xì)胞長至85%左右將細(xì)胞傳代至T25 培養(yǎng)瓶,3~4 d 基因表達(dá)穩(wěn)定后,將細(xì)胞用胰酶消化離心傳代,細(xì)胞貼壁后用含2 μg/mL 嘌呤霉素的完全培養(yǎng)基進(jìn)行穩(wěn)轉(zhuǎn)細(xì)胞株的篩選,反復(fù)藥篩。待無細(xì)胞死亡時(shí),實(shí)時(shí)熒光定量聚合酶鏈反應(yīng)(RT-qPCR)檢測病毒轉(zhuǎn)染效果,轉(zhuǎn)染成功后傳代凍存10 管穩(wěn)轉(zhuǎn)株,以備后續(xù)實(shí)驗(yàn)使用,在此過程中用含1 μg/mL 嘌呤霉素的完全培養(yǎng)基維持。陰性對照組為轉(zhuǎn)染空載病毒細(xì)胞(shNC),轉(zhuǎn)染抑制基因病毒(sh-miR-155)為沉默組。
將Blank、shNC、sh-miR-155 三組細(xì)胞分別取2×104個(gè)接種于6 孔板,待細(xì)胞長至90%左右,采用RNA 快速提取試劑盒(上海奕杉生物科技有限公司)分別提取各組RNA,反轉(zhuǎn)錄試劑盒(日本TaKaRa)將RNA 反轉(zhuǎn)錄為cDNA,RT-qPCR 得到各組Ct 值。U6 作為內(nèi)參,根據(jù)公式:①ΔCt=各組Ct1(miR-155)-Ct2(U6);②ΔΔCt=各組ΔCt 值-Blank 組的ΔCt 均值;③miR-155 表達(dá)=2-ΔΔCt;④miR-155 相對表達(dá)=各組2-ΔΔCt/Blank 組2-ΔΔCt。
將Blank、shNC、sh- miR- 155、sh- miR- 155+Recilisib、shNC+Recilisib 等5 組細(xì)胞分別用胰酶消化后用完全培養(yǎng)基重懸,調(diào)整細(xì)胞數(shù)量為1×104個(gè)/mL。以每孔100 μL 接種于96 孔板,每組設(shè)置三個(gè)復(fù)孔,待細(xì)胞貼壁生長后,每孔加入MTT 溶液(5 mg/mL,即0.5%MTT)10 μL ,繼續(xù)培養(yǎng)4 h,加入結(jié)晶紫溶液,放入酶標(biāo)儀A490 nm 和A630 nm 處測量各孔的吸光度值。按照公式計(jì)算細(xì)胞增殖率=[A experimental group(630 nm-490 nm)/A blank group(630 nm-490 nm)] × 100%。
①遷移: 取各組對數(shù)生長期細(xì)胞,將細(xì)胞消化、離心后,細(xì)胞計(jì)數(shù),每室鋪2×104個(gè)細(xì)胞,向小室下室加入含20%FBS 的高糖培養(yǎng)基,再輕輕向小室上室加入細(xì)胞懸液,避免出現(xiàn)氣泡,將培養(yǎng)板置于培養(yǎng)箱48 h 后收樣,上室細(xì)胞用棉簽擦拭,接著使用4%多聚甲醛固定30 min,0.1%結(jié)晶紫染色20 min,用水清洗后晾干,使用倒置顯微鏡于200 倍視野下拍5 個(gè)視野。②侵襲:提前將槍頭和小室放入-20°冰箱預(yù)冷,向小室上室加入基質(zhì)膠使其均勻地鋪在小室,第2 天提前半小時(shí)將小室置于無血清的培養(yǎng)基中水化,取各組對數(shù)生長期細(xì)胞,按每室鋪5×104個(gè)細(xì)胞計(jì)算細(xì)胞懸液量,接著向小室下室加入含20%FBS 培養(yǎng)基。然后將小室置于24 孔板內(nèi),每孔加入無血清細(xì)胞懸液到小室上室中,細(xì)胞生長48 h 后,棄去培養(yǎng)基,用棉簽輕輕擦拭干凈上室中的基質(zhì)膠,下室加入1 mL 多聚甲醛固定約30 min,然后用0.1%結(jié)晶紫浸泡20 min,PBS 涮洗3 遍,晾干后將24 孔板置于200 倍顯微鏡下選取5 個(gè)視野拍照并計(jì)數(shù)。
將各組細(xì)胞消化、離心后,計(jì)數(shù)并調(diào)整細(xì)胞為2×105個(gè)/mL,培養(yǎng)體系為2 mL 接種于6 孔板,培養(yǎng)箱培養(yǎng)24 h,離心收取細(xì)胞沉淀,按照試劑盒說明書依次加入Annexin V-APC/PI 結(jié)合液,Annexin V-APC 和PI 染液混勻,輕輕吹打重懸細(xì)胞,室溫孵育10~15 min,加入預(yù)冷PBS 混勻,上機(jī)檢測各組細(xì)胞凋亡情況。
為了檢測PTPN21 與miR-155 結(jié)合,取對數(shù)生長期293T 細(xì)胞,將其隨機(jī)分為轉(zhuǎn)染miR-155模擬物組(mimicNC 組)和轉(zhuǎn)染miR-155 抑制劑組(miR-155-3p mimic 組),細(xì)胞計(jì)數(shù),計(jì)算細(xì)胞密度為5×104個(gè)/mL 所需細(xì)胞懸液量,分別接種至48 孔細(xì)胞培養(yǎng)板,每個(gè)濃度梯度3 個(gè)復(fù)孔。制備轉(zhuǎn)染復(fù)合物,轉(zhuǎn)染后48 h,收集細(xì)胞檢測各組熒光素酶活性,取樣品20 μL,加入100 μL 熒光素酶檢測試劑測得相對光單位1(RLU1),完成后,加入100 μL 海腎熒光素酶檢測試劑測得相對光單位2(RLU2)。目的基因的激活程度=RLU1/RLU2。
胰酶消化細(xì)胞獲得細(xì)胞沉淀,向Western 及IP裂解液中加入蛋白酶抑制劑和磷酸酶抑制劑(Western 及IP 裂解液∶酶抑制劑=100∶1)。在冰上充分裂解30 min,每5 min 震蕩1 次,超聲破碎后通過高速離心機(jī)(12 000 r,15 min)獲得蛋白上清液,并使用BCA 試劑盒(索萊寶)配合酶標(biāo)儀在562 nm 波長條件下測量細(xì)胞的蛋白濃度。在60 V(30 min)和110 V (1 h)下,采用一步法聚丙烯酰胺凝膠快速制備試劑盒(10%)(上海雅酶生物醫(yī)藥科技有限公司)凝膠電泳分離蛋白。電泳后,在4℃冷室中用濕電轉(zhuǎn)移法將蛋白轉(zhuǎn)移到聚偏二氟乙烯(PVDF)膜(德國Amersham 公司)上。然后,將PVDF 膜用5%脫脂牛奶密封,室溫孵育2 h,一抗在4℃孵育過夜。次日用含0.1%Tween-20 的Tris 緩沖鹽溶液(TBST)洗滌3 次,加入羊抗兔IgG 二抗,室溫孵育2 h,再次用TBST 洗滌3 次,將膜用ECL 曝光液浸泡在暗盒里孵育30 s左右放入凝膠成像系統(tǒng)中,最后再將條帶導(dǎo)入Image J 軟件進(jìn)行各組蛋白表達(dá)水平灰度分析。
采用SPSS 26.0 統(tǒng)計(jì)軟件分析實(shí)驗(yàn)數(shù)據(jù)。正態(tài)分布的計(jì)量資料以表示,多組資料比較采用單因素方差分析,組間兩兩比較用LSD-t檢驗(yàn),P<0.05為差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義。折線圖及柱狀圖通過GraphPad 8.0 軟件制作。
RT-qPCR 檢驗(yàn)轉(zhuǎn)染效果,sh-miR-155 組中miR-155 的表達(dá)水平顯著低于Blank 組及shNC 組(P<0.000 1),miR-155 在Blank 組及shNC 組表達(dá)水平差異無統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P>0.05),見圖1。
圖1 轉(zhuǎn)染shNC、sh-miR-155 后熒光圖及其轉(zhuǎn)染效率
根據(jù)microRNA 靶基因預(yù)測在線數(shù)據(jù)庫(http://www.targetscan.org/vert_70/)(http://mirwalk.umm.uniheidelberg.de/)和(http://mirdb.org/miRDB/)預(yù)測PTPN21 基因3' 非翻譯區(qū)(PTPN21-3'-UTR)上存在與miR-155 的潛在靶向結(jié)合點(diǎn)。雙熒光素酶實(shí)驗(yàn)結(jié)果顯示,miR-155-3p 與PTPN21 有2 個(gè)結(jié)合位點(diǎn),2 個(gè)位點(diǎn)分別設(shè)計(jì)PTPN21- 3'UTR 突變序列(PTPN21-3'UTR MUT-1)和(PTPN21-3'UTR MUT-2)。miR-155-3p 可以和PTPN21-3'UTR 野生型(PTPN21-3'UTR WT)結(jié)合使雙熒光素酶活性增強(qiáng),MUT-1 位點(diǎn)突變后雙熒光素酶的活性也增強(qiáng),說明該位點(diǎn)不是結(jié)合位點(diǎn); 而MUT-2 位點(diǎn)突變后雙熒光素酶活性沒有變化,說明該位點(diǎn)是結(jié)合位點(diǎn)。通過雙熒光素酶實(shí)驗(yàn)得出:miR-155-3p 可與PTPN21 結(jié)合,且結(jié)合位點(diǎn)是MUT-2 對應(yīng)的序列,見圖2。
圖2 雙熒光素酶實(shí)驗(yàn)檢測miR-155 與PTPN21 的關(guān)系
MTT 結(jié)果顯示,sh-miR-155 組中Huh7 細(xì)胞在2、3、4、5 d 時(shí)A 值均低于Blank 組及shNC 組(P<0.000 1),而Blank 組與shNC 組差異無統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P>0.05);sh-miR-155 組在2、3、4、5 d 時(shí)A 值低于sh-miR-155+Recilisib 組及shNC+Recilisib 組(P=0.005 2,P<0.000 1),而sh-miR-155+Recilisib 在2、3、4、5 d 時(shí)A 值低于shNC+Recilisib 組(P<0.000 1),見圖3。
圖3 MTT 檢測各組細(xì)胞增殖能力(**** 與Blank 組相比,P<0.000 1)
Blank 組與shNC 組遷移及侵襲細(xì)胞數(shù)差異無統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P>0.05),在激活PI3K-AKT 信號通路后,與Blank 組相比,shNC+Recilisib 組肝癌細(xì)胞的遷移、侵襲能力顯著增加(P<0.000 1)。相反,沉默miR-155 后Huh7 細(xì)胞的遷移及侵襲細(xì)胞數(shù)明顯低于Blank 組及shNC 組(P<0.000 1),而PI3K 激動劑逆轉(zhuǎn)了這一現(xiàn)象,與sh-miR-155 組相比,sh-miR-155+Recilisib 組肝癌細(xì)胞的遷移、 侵襲能力增強(qiáng)(P=0.000 2),見圖4。
圖4 Transwell 檢測各組細(xì)胞侵襲及遷移能力
流式細(xì)胞術(shù)結(jié)果顯示,Blank 組、shNC 和shNC+Recilisib 組之間細(xì)胞凋亡率差異無統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P>0.05)。與Blank 組相比,sh-miR-155 組細(xì)胞凋亡率顯著增加(P<0.000 1),并且sh-miR-155 組細(xì)胞凋亡率高于sh-miR-155+Recilisib 組(P<0.000 1),見圖5。
圖5 各組肝癌細(xì)胞流式細(xì)胞術(shù)圖及凋亡分析柱狀圖(與Blank 組相比,ns:P>0.05;****:P<0.000 1)
蛋白印跡實(shí)驗(yàn)結(jié)果顯示,與Blank 組相比,沉默miR-155 后促凋亡蛋白Caspase-3 和BAX 表達(dá)水平顯著增加(P<0.000 1),而抗凋亡蛋白BCL2 的表達(dá)量明顯降低(P<0.000 1); 此外,sh-miR-155 組與Blank 組相比PTPN21 表達(dá)明顯下調(diào)(P<0.000 1),而在PI3K-AKT 信號通路激活時(shí)PTPN21 表達(dá)較shmiR-155 組高(P<0.000 1),但sh-miR-155+Recilisib組PTPN21 表達(dá)仍低于Blank 組(P=0.000 2);與Blank組相比,在沉默miR-155 后P-AKT 和P-PI3K 的表達(dá)顯著下降(P<0.000 1),且sh-miR-155+Recilisib 組P-AKT 和P-PI3K 表達(dá)也較Blank 組低(P=0.017 7,P=0.031 3),而sh-miR-155+Recilisib 組P-AKT和P-PI3K 表達(dá)較sh-miR-155 組高(P<0.000 1,P=0.001 4),PI3K 與AKT 在各組肝癌細(xì)胞之間的差異無統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P>0.05),見圖6。
圖6 蛋白質(zhì)印跡檢測PTPN21、PI3K-AKT 信號通路及凋亡相關(guān)蛋白
研究表明,miRNA 與腫瘤的發(fā)生有密切關(guān)系,致癌相關(guān)miRNA 的過表達(dá)通過沉默腫瘤抑制因子或參與細(xì)胞分化中的某一過程,最終影響腫瘤組織血管生成、增殖及侵襲水平導(dǎo)致腫瘤形成[9-11]。miR-155 作為一類癌癥相關(guān)miRNA,在各種腫瘤細(xì)胞中表達(dá)量增加,如胃癌、膀胱癌、結(jié)直腸癌、乳腺癌和其他實(shí)性惡性腫瘤,并發(fā)揮不同的作用[12]。此外,miR-155 在肝癌中高表達(dá),并與HCC 患者不良的臨床病理特征和較低生存率相關(guān)[13]。本研究通過構(gòu)建miR-155 沉默穩(wěn)轉(zhuǎn)株,探討下調(diào)miR-155 后對肝癌細(xì)胞增殖和侵襲遷移影響的機(jī)制。
PTPN21 在肺癌[14]、膀胱腫瘤[15]及非霍奇金淋巴瘤[16]中高表達(dá),同時(shí)參與腫瘤細(xì)胞的生長過程,但其在肝癌中的作用機(jī)制尚不明確。本研究發(fā)現(xiàn),PTPN21 基因3'-UTR 上存在與miR-155 相結(jié)合的潛在靶點(diǎn)。雙熒光素酶實(shí)驗(yàn)結(jié)果顯示,miR-155-3p與PTPN21 有2 個(gè)結(jié)合位點(diǎn),2 個(gè)位點(diǎn)分別設(shè)計(jì)突變序列MUT-1 和MUT-2,MUT-1 位點(diǎn)突變后雙熒光素酶的活性增強(qiáng),而MUT-2 位點(diǎn)突變后雙熒光素酶活性沒有變化,說明MUT-2 是結(jié)合位點(diǎn),并且miR-155 沉默可以抑制PTPN21 的表達(dá),提示PTPN21 是miR-155 的下游靶點(diǎn)。
PI3K-AKT 通路是調(diào)控細(xì)胞生長、代謝、增殖、存活、轉(zhuǎn)錄和蛋白質(zhì)合成的關(guān)鍵調(diào)控中心[17]。研究表明,miRNA 在調(diào)控PI3K-AKT 通路中發(fā)揮著至關(guān)重要的作用,其通過靶向PI3K-AKT 信號軸,在調(diào)節(jié)細(xì)胞增殖、凋亡和代謝方面具有重要意義[18-19]。本研究發(fā)現(xiàn)下調(diào)miR-155 后,各組PI3K、AKT 總蛋白變化不明顯,而磷酸化蛋白P-PI3K、P-AKT 表達(dá)量明顯下降,提示miR-155 的表達(dá)與PI3K-AKT 通路呈正相關(guān)。為了進(jìn)一步驗(yàn)證miR-155 對肝癌細(xì)胞生長影響是通過PI3K-AKT 通路實(shí)現(xiàn)的,本實(shí)驗(yàn)在shNC組及沉默miR-155 的同時(shí)應(yīng)用PI3K-AKT 通路激動劑,觀察PI3K-AKT 通路相關(guān)蛋白的變化情況,結(jié)果顯示,與shNC+Recilisib 組相比,miR-155 可抑制P-PI3K 及P-AKT 的表達(dá),提示miR-155 可通過調(diào)控PI3K-AKT 通路影響HCC 生長。MTT 實(shí)驗(yàn)發(fā)現(xiàn),沉默miR-155 可抑制肝癌細(xì)胞的增殖。此外,流式細(xì)胞術(shù)結(jié)果顯示,與Blank 組及shNC 組相比,shmiR-155 組細(xì)胞凋亡率顯著增加,Blank 組和shNC組細(xì)胞凋亡量無顯著變化,差異無統(tǒng)計(jì)學(xué)意義。細(xì)胞凋亡常與多個(gè)信號傳導(dǎo)通路密切相關(guān),其中BCL-2及Caspase 家族蛋白扮演著重要角色,當(dāng)細(xì)胞進(jìn)入凋亡途徑時(shí),抑凋亡蛋白BCL-2 表達(dá)水平下調(diào),而促凋亡蛋白BAX 表達(dá)上調(diào),其下游Caspase 家族蛋白接受凋亡信號,進(jìn)而激活Caspase-3 活化,執(zhí)行凋亡程序[20]。本研究結(jié)果顯示,sh-miR-155 組與Blank組及shNC 組相比,抑凋亡蛋白BCL-2 表達(dá)水平顯著降低,促凋亡蛋白Caspase-3 及BAX 表達(dá)水平顯著提高,加速了肝癌細(xì)胞凋亡進(jìn)程。
有研究表明,沉默PTPN21 通過調(diào)控PI3K-AKT信號通路抑制膠質(zhì)瘤的進(jìn)展[21]。本研究中,Transwell結(jié)果顯示,沉默miR-155 明顯抑制肝癌細(xì)胞侵襲及遷移。以上實(shí)驗(yàn)表明,miR-155 通過靶向PTPN21 調(diào)控PI3K-AKT 信號通路,進(jìn)而影響肝癌細(xì)胞生長,提示miR-155 在肝癌發(fā)生發(fā)展過程中發(fā)揮促癌基因的作用。
綜上所述,沉默Huh7 細(xì)胞中miR-155 通過靶向PTPN21 調(diào)控PI3K-AKT 信號通路抑制肝癌細(xì)胞生長。因此,miR-155 可能是未來HCC 患者的輔助診斷指標(biāo)之一,也為臨床治療HCC 患者提供了新的治療靶點(diǎn)。