潘璐璐 王澤敏 陳輝 何穎雪 胡文雯 邵國(guó)建
作為終末期腎臟病患者的主要替代治療方法,維持性血液透析(maintenance hemodialysis, MHD)可有效延長(zhǎng)患者的生存期。但隨著透析時(shí)間的增加,MHD 患者容易出現(xiàn)多種并發(fā)癥,其中睡眠障礙較為常見(jiàn),其會(huì)增加MHD 患者心血管疾病的發(fā)生風(fēng)險(xiǎn)以及死亡率[1-3]。目前對(duì)于MHD 患者睡眠障礙發(fā)生的影響因素及機(jī)制的研究,結(jié)論尚不一致。近年來(lái),研究者發(fā)現(xiàn)腸道菌群能夠影響大腦的活動(dòng),可能是睡眠機(jī)制的關(guān)鍵調(diào)節(jié)因素[4-5]?;诖?,本研究通過(guò)分析睡眠障礙MHD 患者和非睡眠障礙MHD 患者腸道菌群結(jié)構(gòu)的差異,探討MHD 患者睡眠障礙與腸道菌群的關(guān)系,以期為臨床上MHD 患者睡眠障礙的治療提供新策略。
1.1 對(duì)象 選取2022 年1 至7 月在溫州市中心醫(yī)院根據(jù)匹茲堡睡眠質(zhì)量指數(shù)(Pittsburgh sleep quality index,PSQI)量表[6]評(píng)估為睡眠障礙(PSQI 總分≥5 分)和非睡眠障礙(PSQI 總分<5 分)的MHD 患者各30例。納入標(biāo)準(zhǔn):(1)年齡18~80 歲;(2)在本院規(guī)律接受MHD 治療至少3 個(gè)月以上;(3)至少3 個(gè)月內(nèi)無(wú)抗菌藥物及益生菌制劑服用史。排除標(biāo)準(zhǔn):(1)存在以下情況或疾?。壕窦膊?、認(rèn)知功能障礙、嚴(yán)重心肺功能不全、惡性腫瘤、劇烈疼痛、消化系統(tǒng)感染、膽囊或結(jié)腸切除術(shù)后等;(2)正處于禁食或腸內(nèi)、外營(yíng)養(yǎng)支持患者;(3)患者或家屬不能合作。兩組患者性別、年齡、BMI 及原發(fā)病等一般資料比較差異均無(wú)統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(均P>0.05),見(jiàn)表1。本研究經(jīng)本院醫(yī)學(xué)倫理委員會(huì)審查通過(guò)(批準(zhǔn)文號(hào):快K2021-04-040),所有患者知情同意并簽署知情同意書(shū)。
表1 兩組患者一般資料比較
1.2 方法
1.2.1 糞便標(biāo)本采集 使用糞便微生物DNA 專用采集管收集患者新鮮糞便標(biāo)本(約2~5 g),于30 min內(nèi)放入-80 ℃冰箱保存。
1.2.2 標(biāo)本DNA 提取和檢測(cè) 采用糞便DNA 提取試劑盒(德國(guó)QIAGEN 公司)提取糞便標(biāo)本總DNA,再通過(guò)瓊脂糖凝膠電泳儀(美國(guó)Bio-RAD 公司)和紫外分光光度計(jì)(美國(guó)Thermo 公司)進(jìn)行DNA 濃度及純度的檢測(cè)。
1.2.3 PCR 擴(kuò)增 取50 ng 稀釋后的基因組DNA 作為模板DNA,使用美國(guó)NEB 公司的Phusion Hot start flex 2X Master Mix 高效高保真酶對(duì)16S rDNA 基因V3-V4 可變區(qū)進(jìn)行PCR 擴(kuò)增,引物序列為341F(5'-CCTACGGGNGGCWGCAG-3'),805R(5'-GACTACHVGGGTATCTAATCC-3')。PCR 產(chǎn)物由核酸純化試劑盒(美國(guó)Beckman 公司)純化,Qubit 熒光儀(美國(guó)Invitrogen 公司)定量。
1.2.4 16S rDNA 高通量測(cè)序及生物學(xué)信息分析 對(duì)純化后的PCR 產(chǎn)物使用Agilent 2100 生物分析儀(美國(guó)Agilent 公司)和文庫(kù)定量試劑盒(美國(guó)Illumina 公司)進(jìn)行評(píng)估。合格擴(kuò)增產(chǎn)物使用NovaSeq 6000 測(cè)序儀(美國(guó)Illumina 公司)進(jìn)行2×250 bp 的雙端測(cè)序。將得到的原始數(shù)據(jù)進(jìn)行拆分、拼接和過(guò)濾,再使用QIIME2 軟件進(jìn)行分析,將數(shù)據(jù)中有效序列以97%的相似度進(jìn)行操作分類單元(operational taxonomic units,OUT)劃分?;贜T-16S 與SILVA 數(shù)據(jù)庫(kù)注釋OUT,獲得各樣品在門(mén)和屬分類學(xué)水平上的群落結(jié)構(gòu)圖。采用α 多樣性和β 多樣性進(jìn)行菌群多樣性分析。本研究α 多樣性分析主要通過(guò)Chao1 指數(shù)、Shannon 指數(shù)和Simpson 指數(shù)進(jìn)行樣本內(nèi)物種多樣性的評(píng)估,其中Chao1 指數(shù)和Shannon 指數(shù)越大,Simpson 指數(shù)越小,代表群落α 多樣性越高。β 多樣性分析通過(guò)基于Bray-Curtis 距離的主坐標(biāo)分析(principal co-ordinates analysis,PCoA)來(lái)反映樣本間物種多樣性。采用線性判別分析及效應(yīng)量(linear discriminant analysis effect size,LEfSe)分析進(jìn)行菌群差異性分析。
1.3 觀察指標(biāo) 觀察并比較睡眠障礙組與非睡眠障礙組患者腸道菌群α 多樣性、β 多樣性、腸道菌群結(jié)構(gòu),并分析兩組腸道菌群結(jié)構(gòu)差異的顯著性。
1.4 統(tǒng)計(jì)學(xué)處理 采用SPSS 25.0 統(tǒng)計(jì)軟件。正態(tài)分布的計(jì)量資料以表示,組間比較采用兩獨(dú)立樣本t檢驗(yàn);非正態(tài)分布的計(jì)量資料以M(P25,P75)表示,組間比較采用Mann-WhitneyU檢驗(yàn)。計(jì)數(shù)資料以頻數(shù)和構(gòu)成比表示,組間比較采用χ2檢驗(yàn)。腸道菌群生物學(xué)信息的統(tǒng)計(jì)分析和作圖使用R 軟件(Version 2.15.3)完成。P<0.05 為差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義。
2.1 睡眠障礙組與非睡眠障礙組患者腸道菌群α 多樣性比較 睡眠障礙組患者腸道菌群的Chao1 指數(shù)為233.35±65.22,Shannon 指數(shù)為4.80±0.48,Simpson指數(shù)為0.0749±0.0253;非睡眠障礙組患者腸道菌群的Chao1 指數(shù)為235.91±59.73,Shannon 指數(shù)為4.24±0.51,Simpson 指數(shù)為0.1295±0.0570。兩組患者腸道菌群的Chao1 指數(shù)比較差異無(wú)統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(t=-0.159,P=0.874)。睡眠障礙組的Shannon 指數(shù)高于非睡眠障礙組(t=4.342,P<0.001),睡眠障礙組的Simpson指數(shù)低于非睡眠障礙組(t=-4.799,P<0.001)。這提示睡眠障礙組患者腸道菌群的α 多樣性高于非睡眠障礙組患者。
2.2 睡眠障礙組與非睡眠障礙組患者腸道菌群β 多樣性比較 PCoA 分析顯示,PC1 對(duì)于樣本差異的貢獻(xiàn)值為15.01%,PC2 對(duì)于樣本差異的貢獻(xiàn)值為10.18%。睡眠障礙組與非睡眠障礙組樣本在坐標(biāo)圖中雖有一定重合,但整體距離存在一定分離趨勢(shì),進(jìn)一步Anosim 分析提示睡眠障礙組與非睡眠障礙組的群落結(jié)構(gòu)差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(R=0.10,P=0.04),見(jiàn)圖1。
圖1 兩組患者腸道菌群β 多樣性的PCoA 圖
2.3 睡眠障礙組與非睡眠障礙組患者腸道菌群結(jié)構(gòu)比較 在門(mén)分類水平,兩組患者腸道菌群主要由厚壁菌門(mén)(Firmicutes)、擬桿菌門(mén)(Bacteroidetes)、放線菌門(mén)(Actinobacteria)及變形菌門(mén)(Proteobacteria)構(gòu)成,這4 個(gè)菌門(mén)包含了所有樣本豐度95%以上的腸道細(xì)菌。與非睡眠障礙組比較,睡眠障礙組中厚壁菌門(mén)的相對(duì)豐度明顯下降,而變形菌門(mén)的相對(duì)豐度明顯升高。在屬分類水平,與非睡眠障礙組比較,睡眠障礙組中雙歧桿菌屬(Bifidobacterium)、羅氏菌屬(Roseburia)及乳桿菌屬(Lactobacillus)的相對(duì)豐度明顯下降,而大腸桿菌-志賀氏菌屬(Escherichia-Shigella)和毛螺菌屬(Lachnospira)的相對(duì)豐度明顯升高。
2.4 睡眠障礙組與非睡眠障礙組腸道菌群結(jié)構(gòu)差異顯著性分析 兩組患者腸道菌群結(jié)構(gòu)差異行LEfSe 分析,并制作LEfSe 分析柱狀圖。柱狀圖縱坐標(biāo)是腸道菌群,橫坐標(biāo)是線性判別分析(linear discriminant analysis,LDA)分值,其長(zhǎng)度代表差異的顯著性。本研究LEfSe 分析的閾值設(shè)置為L(zhǎng)DA>2.5,P<0.05。結(jié)果顯示,在門(mén)水平,睡眠障礙組患者腸道菌群中擬桿菌門(mén)相對(duì)豐度顯著高于非睡眠障礙組患者,厚壁菌門(mén)、放線菌門(mén)相對(duì)豐度顯著低于非睡眠障礙組患者。在屬水平,MHD 睡眠障礙組患者腸道菌群中擬桿菌屬、大腸桿菌-志賀氏菌屬、毛螺菌屬、鏈球菌屬(Streptococcus)、副擬桿菌屬(Parabacteroides)、巴恩斯氏菌屬(Barnesiella)及顫桿菌克屬(Oribacterium)相對(duì)豐度顯著高于非睡眠障礙組患者(均P<0.05),乳桿菌屬、雙歧桿菌屬及羅氏菌屬相對(duì)豐度顯著低于非睡眠障礙組患者(均P<0.05)。見(jiàn)圖2。
圖2 兩組患者腸道菌群LEfSe 分析柱狀圖
近年來(lái),終末期腎臟病的患病人數(shù)呈現(xiàn)上升趨勢(shì),目前我國(guó)MHD 患者約63.2 萬(wàn)人[7]。睡眠障礙是困擾MHD 患者最突出的臨床問(wèn)題之一。睡眠障礙不僅造成MHD 患者虛弱、認(rèn)知功能障礙、生活質(zhì)量下降,還導(dǎo)致MHD 患者心血管疾病并發(fā)癥和病死率的增加,嚴(yán)重影響MHD 患者的預(yù)期壽命。
人體腸道中存在著種類繁多的微生物群,其中厚壁菌門(mén)和擬桿菌門(mén)占整個(gè)菌群95%以上。此外還包括變形菌門(mén)、放線菌門(mén)和梭桿菌門(mén)等[8]。這些微生物不僅直接參與了人體的多項(xiàng)生理活動(dòng)(如消化、免疫、內(nèi)分泌等),還對(duì)大腦發(fā)育、情緒和認(rèn)知功能具有多重影響[9]。研究發(fā)現(xiàn),腸道菌群可通過(guò)多種途徑影響中樞神經(jīng)系統(tǒng)功能,并影響睡眠過(guò)程[10-11]。機(jī)體睡眠障礙的發(fā)生亦與腸道菌群的失調(diào)相關(guān)[12]。本研究初步探討了睡眠障礙MHD 患者和非睡眠障礙MHD 患者腸道菌群的結(jié)構(gòu)變化。結(jié)果顯示,睡眠障礙組患者腸道菌群的α 多樣性高于非睡眠障礙組患者,并且兩組患者腸道菌群的β 多樣性存在統(tǒng)計(jì)學(xué)差異。α 多樣性分析是度量單個(gè)樣本內(nèi)有多少種微生物物種(豐富度),以及每個(gè)微生物物種所占的比例(均勻度),即關(guān)注樣本自身的菌群組成與分布。當(dāng)一個(gè)樣本中所含微生物物種種類越多,則它的豐富度越高,所含的每種微生物物種的占比越平均,則均勻度越高。β多樣性分析是度量不同樣本間菌群組成的相似度大小,即關(guān)注各樣本間的菌群組成差異。筆者推測(cè),睡眠障礙MHD 患者腸道菌群結(jié)構(gòu)發(fā)生紊亂,一些有害菌的增加可能導(dǎo)致了菌群豐富度增高。
通過(guò)LEfSe 多級(jí)物種差異判別分析,筆者發(fā)現(xiàn),相對(duì)于非睡眠障礙MHD 患者,睡眠障礙MHD 患者腸道菌群中擬桿菌屬、大腸桿菌-志賀氏菌屬、毛螺菌屬及鏈球菌屬的相對(duì)豐度顯著升高,而雙歧桿菌屬、乳桿菌屬及羅氏菌屬的相對(duì)豐度顯著降低。動(dòng)物研究表明,睡眠質(zhì)量低下小鼠的腸道菌群中毛螺菌屬豐度增多,而乳桿菌屬豐度減少[13]。在人群中,失眠患者腸道菌群中擬桿菌屬和毛螺菌屬的豐度顯著高于健康人群,而能夠產(chǎn)生短鏈脂肪酸(short chain fatty acid,SCFA)的菌屬的豐度顯著降低[14]。作為腸道的有益菌,雙歧桿菌屬、乳桿菌屬及羅氏菌屬能夠合成SCFA,在結(jié)腸運(yùn)動(dòng)、免疫調(diào)節(jié)及抗炎方面發(fā)揮重要作用[15-17]。一項(xiàng)研究表明,腸道菌群產(chǎn)生的SCFA 能夠增加?jì)雰旱乃邥r(shí)間[18]。雙歧桿菌屬和乳桿菌屬還能夠合成γ-氨基丁酸(gamma-aminobutyric acid,GABA),通過(guò)微生物-腸-腦軸,影響大腦功能。GABA 作為一種抑制性神經(jīng)遞質(zhì),能夠緩解機(jī)體的焦慮行為,起到改善睡眠的作用。Spiegelhalder 等[19]亦證明GABA 水平低下能夠引起睡眠障礙。大腸桿菌-志賀氏菌屬歸屬于腸桿菌科。有研究者發(fā)現(xiàn),對(duì)小鼠進(jìn)行人為的睡眠剝奪后,其腸道內(nèi)腸桿菌科的豐度顯著升高[20]。鏈球菌屬是一種革蘭陽(yáng)性兼性厭氧菌,主要將葡萄糖分解代謝產(chǎn)生乳酸,可能會(huì)降低腸道pH 值,導(dǎo)致兼性厭氧菌和厭氧菌的豐度變化,改變腸道微生物代謝,還可以穿過(guò)血腦屏障導(dǎo)致神經(jīng)系統(tǒng)癥狀[21]。研究表明,鏈球菌能夠?qū)е滤哒系K[22],并且相較于腦卒中后非睡眠障礙患者,腦卒中后睡眠障礙患者腸道菌群中鏈球菌屬的豐度顯著升高[23]。國(guó)內(nèi)研究發(fā)現(xiàn),Parabacteroides、Barnesiella 為抑郁癥患者優(yōu)勢(shì)菌群[24-25],產(chǎn)后抑郁患者在其抑郁情緒的緩解與Oribacterium 相對(duì)豐度減少相關(guān)[26]。睡眠障礙往往與焦慮、抑郁等情況相伴隨。本研究亦發(fā)現(xiàn),睡眠障礙MHD 患者腸道菌群中Parabacteroides、Barnesiella 及Oribacterium 的相對(duì)豐度顯著增加。
綜上所述,睡眠障礙組MHD 患者腸道菌群的α多樣性高于非睡眠障礙組MHD 患者,兩組患者的腸道菌群結(jié)構(gòu)組成存在差異。其中擬桿菌屬、大腸桿菌-志賀氏菌屬、毛螺菌屬、鏈球菌屬、Parabacteroides、Barnesiella 及Oribacterium 是MHD 睡眠障礙患者腸道菌群中的優(yōu)勢(shì)菌屬,可能與MHD 患者的睡眠障礙存在相關(guān)性。但本研究樣本量較小,也并未排除兩組患者的生活因素及飲食因素方面的影響,上述結(jié)論有待后續(xù)更多的大樣本研究明確。另外,本研究無(wú)法證實(shí)MHD 患者睡眠障礙與腸道菌群結(jié)構(gòu)改變之間的因果關(guān)系及相互作用機(jī)制,亦有待后續(xù)進(jìn)一步的研究探討,以期更好地為臨床治療和干預(yù)提供理論依據(jù)。