孫希野 蔣燦 羅旭 舒佩 王森 周科訊 黃媚娟
摘要: 為了解并評(píng)估食管癌患者的預(yù)后,提前預(yù)測其疾病進(jìn)展和生存情況. 本研究在基因表達(dá)綜合數(shù)據(jù)庫(GEO)中收集食管癌相關(guān)基因和臨床數(shù)據(jù),篩選與預(yù)后相關(guān)的細(xì)胞焦亡和鐵死亡基因,并利用隨機(jī)森林算法開發(fā)構(gòu)建食管癌預(yù)后風(fēng)險(xiǎn)模型,最終在癌癥基因組圖譜(TCGA)-ESCA 隊(duì)列中進(jìn)行驗(yàn)證,同時(shí)分析不同風(fēng)險(xiǎn)組腫瘤微環(huán)境中免疫細(xì)胞的浸潤情況.結(jié)果顯示訓(xùn)練隊(duì)列中低風(fēng)險(xiǎn)組的生存明顯優(yōu)于高風(fēng)險(xiǎn)組(P<0. 05). 訓(xùn)練隊(duì)列中低風(fēng)險(xiǎn)組與高風(fēng)險(xiǎn)組患者相比有更多CD4+T 細(xì)胞,低風(fēng)險(xiǎn)組中CD8A、GZMB、PRF1 的表達(dá)水平高于高風(fēng)險(xiǎn)組(P<0. 05). 以上結(jié)果表明基于焦亡和鐵死亡基因組學(xué)所構(gòu)建的ESCA 預(yù)后模型可為食管癌患者的臨床治療提供參考.
關(guān)鍵詞: 食管癌;焦亡;鐵死亡;預(yù)后風(fēng)險(xiǎn)模型;公共數(shù)據(jù)庫
中圖分類號(hào): R735. 1 文獻(xiàn)標(biāo)志碼: A DOI: 10. 19907/j. 0490-6756. 2024. 036005