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聯(lián)用多步驟虛擬篩選方法發(fā)現(xiàn)具有新母核的GABAA受體正性變構(gòu)調(diào)節(jié)劑

2024-07-02 00:00:00孔維愷忻廉靖靖彭超朱杰鄭鈺琳黃巍然張博段桂芳馬琳彭曉東馬維寧朱素杰黃卓
物理化學(xué)學(xué)報(bào) 2024年1期
關(guān)鍵詞:分子對接離子通道機(jī)器學(xué)習(xí)

摘要:GABAA受體主要介導(dǎo)哺乳動物中樞神經(jīng)系統(tǒng)的抑制性信號傳遞,是鎮(zhèn)靜催眠藥的關(guān)鍵靶點(diǎn)。在尋找具有新母核的鎮(zhèn)靜催眠藥的過程中,計(jì)算機(jī)輔助藥物設(shè)計(jì)(CADD)方法顯示出巨大的優(yōu)勢。在這項(xiàng)研究中,首先,我們通過機(jī)器學(xué)習(xí)模型、分子對接模型和分子力學(xué)廣義玻恩比表面積(MMGBSA)方法篩選了來自于商業(yè)數(shù)據(jù)庫中的41112種化合物。經(jīng)過篩選,我們得到了16個化合物,然后我們通過全細(xì)胞膜片鉗電生理學(xué)實(shí)驗(yàn)驗(yàn)證了4個結(jié)構(gòu)新穎的化合物確實(shí)為有效的GABAA受體正性變構(gòu)調(diào)節(jié)劑。其中,化合物GPR120在細(xì)胞水平和動物水平都得到了實(shí)驗(yàn)驗(yàn)證。在重組表達(dá)α1β2γ2型受體的皮層神經(jīng)元中,在10和50 μmol?L?1濃度下,GPR120可將GABA EC3-10電流分別增強(qiáng)71.5%和163.8%。通過全分解貢獻(xiàn)分析和點(diǎn)突變實(shí)驗(yàn),我們發(fā)現(xiàn)GPR120與GABAA受體結(jié)合的關(guān)鍵位點(diǎn)是H102,與陽性藥物地西泮相似。為了進(jìn)一步驗(yàn)證GPR120在動物水平上的功能,我們進(jìn)行了運(yùn)動活動測試和翻正反射消失(LORR)實(shí)驗(yàn)。GPR120對小鼠的運(yùn)動活動有抑制作用,6 h后可恢復(fù),說明GPR120是一種中度鎮(zhèn)靜劑。在戊巴比妥鈉(PB)誘導(dǎo)的翻正反射消失實(shí)驗(yàn)中,與生理鹽水組相比,GPR120 (20 mg?kg?1)可顯著縮短開始LORR的時間并延長LORR的持續(xù)時間。綜上所述,通過聯(lián)用多種虛擬篩選方法,我們發(fā)現(xiàn)了GPR120是一種具有新型母核的中度強(qiáng)度鎮(zhèn)靜劑。

關(guān)鍵詞:機(jī)器學(xué)習(xí);離子通道;分子對接;虛擬篩選;GABAA受體

中圖分類號:O641

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