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金屬元素探針標(biāo)記策略的研究進(jìn)展

2024-11-24 00:00:00胡悅莉張程超李嫣位艷雪劉睿呂弋
分析化學(xué) 2024年10期
關(guān)鍵詞:評述

關(guān)鍵詞 金屬元素探針;標(biāo)記策略;電感耦合等離子體質(zhì)譜;生物分子;評述

2001年,清華大學(xué)張新榮課題組[1]在對促甲狀腺激素的研究工作中率先提出了金屬元素探針標(biāo)記策略。自此之后,基于金屬元素標(biāo)記的分析方法研究受到了廣泛關(guān)注,已經(jīng)開發(fā)出了DNA 和蛋白質(zhì)等生物分子以及爆炸物和納米塑料等環(huán)境污染物的定量分析方法[2-6]。生物體復(fù)雜精密,由核酸和蛋白質(zhì)等多種生物分子共同構(gòu)成,其中,核酸是生命的遺傳密碼,蛋白質(zhì)是生命活動的執(zhí)行者[7]。這些生物分子在機(jī)體內(nèi)的相互作用對于生物體的生長、發(fā)育和衰老等生命過程具有重要的調(diào)節(jié)作用[8]。在疾病的發(fā)生發(fā)展過程中,生物分子的種類和數(shù)量會發(fā)生變化,因此,對人體內(nèi)的生物分子進(jìn)行精確分析對于疾病的預(yù)防和早期診斷具有重要意義[9-12]。

金屬元素標(biāo)記與電感耦合等離子體質(zhì)譜(Inductively coupled plasma-mass spectrometry, ICP-MS)技術(shù)聯(lián)用的方法具有靈敏度高、可進(jìn)行多重分析以及基質(zhì)效應(yīng)低等獨(dú)特優(yōu)勢,拓寬了生物分子定量分析的研究思路。近二十年來,研究者開發(fā)了很多基于金屬元素標(biāo)記構(gòu)建的生物分子高效檢測方法,實現(xiàn)了靈敏分析和多組分同時檢測,并有效克服了生物體復(fù)雜基質(zhì)環(huán)境對生物分子的干擾,在生物分析領(lǐng)域展現(xiàn)出良好的應(yīng)用前景。本文從金屬元素探針標(biāo)記策略出發(fā),系統(tǒng)地總結(jié)了近十年來常用的標(biāo)記策略及其發(fā)展,并討論了其優(yōu)缺點(diǎn),介紹了金屬元素探針在生物分子高靈敏度分析和多重檢測中的應(yīng)用研究進(jìn)展,最后對其發(fā)展趨勢進(jìn)行了展望。

1 金屬元素標(biāo)記的優(yōu)勢及檢測原理

1.1 金屬元素標(biāo)記的優(yōu)勢

基于金屬元素標(biāo)記策略的研究中,檢測金屬元素的儀器通常為ICP-MS[2]。利用ICP-MS 對金屬元素進(jìn)行分析具有許多優(yōu)勢:(1)由于來自標(biāo)記中的金屬原子可被直接檢測,因此不需要其在電學(xué)和光學(xué)等方面具有特殊性質(zhì);(2)多數(shù)的元素和同位素都能夠通過ICP-MS 進(jìn)行分析,并且可實現(xiàn)低至pg/mL 量級的檢測[13];(3)金屬元素標(biāo)記策略中可供選擇的金屬元素較多,得益于ICP-MS 優(yōu)異的譜線分辨率,能有效實現(xiàn)多組分同時檢測,并且不存在如熒光檢測中多波長激發(fā)譜帶重疊的問題[14]。

1.2 生物分子的檢測原理

將金屬離子或納米顆粒標(biāo)記在生物分子上形成信號探針,再通過DNA 鏈間互補(bǔ)配對或抗原-抗體相互作用等生物識別方式與目標(biāo)物結(jié)合,進(jìn)而引起ICP-MS 中金屬信號發(fā)生改變[15-16]。以簡單的三明治結(jié)構(gòu)檢測核酸或蛋白質(zhì)為例闡述金屬元素標(biāo)記策略的檢測原理,如圖1 所示[17]。首先,將金屬納米顆粒與核酸或抗體結(jié)合,形成信號探針,相應(yīng)的生物分子通過鏈霉親和素和生物素相互作用預(yù)先結(jié)合在磁珠表面。然后,在目標(biāo)分子存在下,通過堿基互補(bǔ)配對原則或抗原抗體識別,金屬納米顆粒會被連接到磁珠表面,磁分離后被硝解,最后進(jìn)行ICP-MS 檢測,從而實現(xiàn)定量分析。

2 金屬元素探針標(biāo)記策略

生物體內(nèi)存在的S 和P 等元素能夠被直接應(yīng)用于生物分子的定量分析,但是,元素的低離子化效率和光譜干擾使得該分析方法的檢出限較高[18]。引入金屬元素標(biāo)記策略,能夠有效提高方法的靈敏度。目前,金屬元素標(biāo)記策略主要分為金屬離子標(biāo)記策略、金屬納米顆粒標(biāo)記策略和DNA 模板化金屬納米顆粒的無標(biāo)記策略。

2.1 金屬離子標(biāo)記策略

金屬離子標(biāo)記策略是將1,4,7,10 四氮雜環(huán)十二烷-1,4,7-三乙酸-10-馬來酰亞胺乙基乙酰胺(MMADOTA)大環(huán)化合物與金屬離子螯合,形成的復(fù)合物通過加成反應(yīng)與帶有巰基修飾的DNA 連接,完成金屬離子標(biāo)記,標(biāo)記過程如圖2 所示[19]。王秋泉研究組[20-22]致力于對肽段進(jìn)行金屬元素標(biāo)記;譚蔚泓研究組[23]以二乙烯三胺五乙酸(DTPA)為基元合成了一種新型聚合物,用于螯合多種金屬離子,合成了一系列核酸適配體-金屬標(biāo)簽探針。目前,金屬離子標(biāo)記策略最常用的是鑭系金屬元素,由于其在生物體內(nèi)的含量很低,將其作為元素標(biāo)簽?zāi)軌颢@得優(yōu)異的分析性能。

鑭系金屬元素共有15 種,其中, Tb、Ho 和Tm 為單同位素元素(159Tb、165Ho 和169Tm),通常被作為檢測生物分子的元素標(biāo)簽,完成多組分分析。但是,金屬離子標(biāo)記策略的缺點(diǎn)也很明顯,即1 個目標(biāo)物僅對應(yīng)1 個金屬離子,可能出現(xiàn)靈敏度較低的問題。針對上述問題,有研究者采用將多個金屬離子通過高分子材料結(jié)合在一個生物分子上的標(biāo)記策略,以此提高檢測靈敏度[24];還有研究者利用四面體DNA、多組分核酸酶等提高檢測靈敏度[25-27]。

2.2 金屬納米顆粒標(biāo)記策略

隨著納米科學(xué)技術(shù)的快速發(fā)展,考慮到金屬離子標(biāo)記策略存在的不足,研究者開發(fā)了金屬納米顆粒標(biāo)記策略以提高分析方法的靈敏度[28]。與金屬離子相比,金屬納米顆粒內(nèi)含有大量可被檢測到的金屬原子,例如, 1 顆直徑為10 nm 的金納米顆粒(AuNPs)中約含有30000 個金原子[29]。常用的金屬納米顆粒有金、銀、鉑納米顆粒和鑭系金屬元素納米顆粒,由于不需要金屬納米顆粒具有特殊性質(zhì),金屬納米簇也被作為元素標(biāo)記應(yīng)用在實際研究工作中[30-32]。

AuNPs 是在實際應(yīng)用中使用最多的納米顆粒, AuNPs 的DNA 標(biāo)記方法主要為鹽老化法,操作復(fù)雜且耗時長[33]。近年來,已開發(fā)出冷凍法、微波法和蒸發(fā)干燥法等一系列簡單且快速的標(biāo)記方法將DNA或蛋白質(zhì)標(biāo)記在AuNPs 表面[34-37]。其中,冷凍法已被廣泛應(yīng)用于金屬元素標(biāo)記策略,標(biāo)記原理如圖3 所示。該方法簡單方便,標(biāo)記過程可在短時間內(nèi)完成, DNA 負(fù)載量更高,適用于多尺寸的AuNPs。

使用AuNPs 較易獲得高靈敏度,并且制備簡單,尺寸在2~100 nm 范圍內(nèi)的AuNPs 可以滿足不同的需求。但是,與鑭系金屬離子相比,金屬納米顆粒不夠穩(wěn)定,并且非特異性干擾較大,在多重檢測應(yīng)用中受限。雖然AuNPs 標(biāo)記生物分子的方法得到了較好的優(yōu)化,但是對于銀和鉑等其它納米顆粒簡單快速的標(biāo)記方法目前仍存在較大挑戰(zhàn)。

2.3 DNA 模板化金屬納米顆粒的無標(biāo)記策略

除了上述金屬離子標(biāo)記策略和金屬納米顆粒標(biāo)記策略兩種方式外, DNA 模板化金屬納米顆粒的無標(biāo)記策略也備受關(guān)注。當(dāng)還原劑存在時,以單鏈DNA 為模板,溶液中的金屬離子可被還原形成納米顆粒,例如金、銀和銅納米顆粒[3,38-39],如圖4 所示。大部分納米顆粒模板化合成都需要較長的時間,但是模板化合成銅納米顆粒只需要5 min, 該方法已被應(yīng)用于生物分子的定量分析[40]。

DNA 模板化金屬納米顆粒表現(xiàn)出的物理和化學(xué)性質(zhì)在很大程度上受DNA 模板設(shè)計的影響,例如,調(diào)節(jié)DNA 模板序列可以使納米顆粒發(fā)出明亮的熒光[41],并且具有可調(diào)的發(fā)射顏色和增強(qiáng)的穩(wěn)定性[42-43],以及DNA 調(diào)控的金屬納米催化活性[44]。DNA 模板化金屬納米顆粒標(biāo)記方法制備簡單、效率高并且生物毒性低,但是在多組分分析領(lǐng)域中的效果并不理想。

3 金屬元素標(biāo)記策略的應(yīng)用研究進(jìn)展

3.1 金屬元素標(biāo)記策略在提高檢測靈敏度方面的研究進(jìn)展

金屬離子標(biāo)記策略通常會面臨靈敏度較低的問題,將標(biāo)簽換成金屬納米顆粒能夠在一定程度上解決該問題。許多研究者通過優(yōu)化標(biāo)記策略和核酸酶輔助等方式提高方法的分析性能[45-52]。通過AuNPs 標(biāo)記策略,催化銀沉積信號放大的方式可以對抗原進(jìn)行高靈敏度檢測,檢出限為0.03 ng/mL[45]。由于鑭系金屬元素在自然界的含量極低,鑭系納米顆粒被認(rèn)為是提高靈敏度最有前途的標(biāo)簽,用于評估嚴(yán)重急性呼吸綜合征冠狀病毒2 型(SARS-CoV-2)RNA 的3 種基因片段的檢出限分別為1.2、1.3 和1.3 pmol/L[46]。將AuNPs 作為標(biāo)記,在具有高反式裂解活性的CRISPR/Cas12a 酶輔助下,實現(xiàn)了對DNA 的高靈敏檢測,檢出限低至1.05 amol/L[47]。修飾在AuNPs 表面的DNA 負(fù)載量過高會影響酶的剪切活性,因此應(yīng)對AuNPs 進(jìn)行選擇性功能化。Wang 等[48]使用比例優(yōu)化的AuNPs 標(biāo)記策略,以單靶點(diǎn)DNA 制備實物功能化AuNPs 作為信號探針,應(yīng)用于ICP-MS 分析。實驗原理如圖5 所示,目標(biāo)miRNA 與單靶功能化的AuNPs 雜交形成雙鏈體,進(jìn)而被雙鏈特異性核酸酶(DSN)切割,釋放AuNPs。選擇性功能化使得DSN 的每次切割都能釋放AuNPs,極大地提高了分析方法的靈敏度,檢出限低至0.47 fmol/L。

采用時間分辨模式下的Sp-ICP-MS 對充分稀釋的金屬納米顆粒懸浮液中的單個納米顆粒進(jìn)行檢測,其中,信號頻率與納米顆粒的濃度直接相關(guān),瞬時信號強(qiáng)度與納米顆粒大小直接相關(guān)。Sp-ICP-MS 可區(qū)分單個納米顆粒在大小和濃度方面的信號差異,防止該差異在平均信號中被掩蓋,這是降低背景信號的有效方式。Xu 等[52]利用不同尺寸的AuNPs 在Sp-ICP-MS 中產(chǎn)生的信號差異,基于滾環(huán)擴(kuò)增技術(shù)對DNA進(jìn)行高靈敏檢測,檢出限低至5.1 fmol/L。

3.2 金屬元素標(biāo)記策略在多組分同時分析中的研究進(jìn)展

同時對多種生物分子進(jìn)行分析能夠降低檢測成本,簡化檢測步驟,是生命科學(xué)等領(lǐng)域關(guān)注的熱點(diǎn)問題, ICP-MS 的多重分析能力為解決上述問題提供了新的選擇。序列的高度相似性和生物系統(tǒng)的復(fù)雜性使得鑒別多個同源序列面臨挑戰(zhàn)?;阼|系元素標(biāo)記并結(jié)合邏輯門, Kang 等[53]成功開發(fā)了高特異性準(zhǔn)確鑒別let-7 家族中8 種miRNA 的分析平臺,并可擴(kuò)展到更多類型的同源序列分析。Li 等[54]通過金屬納米顆粒標(biāo)記策略,對疾病標(biāo)志物甲胎蛋白和亞型甲胎蛋白L3 進(jìn)行同時分析,為肝癌的早期診斷提供了技術(shù)支持。目前,針對同種疾病,同時檢測兩種或多種標(biāo)志物已成為單標(biāo)記物分析的替代方法。Li 等[17]探索了針對肝癌疾病標(biāo)志物miRNA 223和AFP 同時分析的方法,將核酸和蛋白質(zhì)混合后進(jìn)行ICP-MS 多重測定,擴(kuò)展了多重檢測的生物分子種類。此外, Wen 等[55]基于鑭系金屬納米顆粒標(biāo)記,通過納米衛(wèi)星和催化發(fā)夾組裝實現(xiàn)了對10 種miRNA 的同時分析,該方法具有超高靈敏度,檢出限低至0.01 fmol/L;通過機(jī)器算法分析,該方法對多種miRNA 信號實現(xiàn)了準(zhǔn)確診斷和分類,適用于臨床無創(chuàng)癌癥篩查。

SARS-CoV-2在全世界范圍內(nèi)流行對公共衛(wèi)生安全產(chǎn)生了嚴(yán)重影響,由此衍生的多種SARS-CoV-2變異株也導(dǎo)致發(fā)生了多批次流行性感染。為了解決SARS-CoV-2 變體診斷對靈敏度和多重性的需求, Li 等[56]構(gòu)建了三價的DNA四面體納米結(jié)構(gòu)用于金屬元素標(biāo)記,可同時鑒別3種變異的Omicron變體(圖6)。DNA四面體中1 個頂點(diǎn)用于連接磁珠,其它3 個頂點(diǎn)用于標(biāo)記鑭系金屬離子并輸出信號,這種獨(dú)特的多頂角結(jié)構(gòu)使其成為理想的多組分生物分析平臺。此外,四面體結(jié)構(gòu)為后續(xù)反應(yīng)提供了可控的納米級空間距離,有效減少了非特異性吸附,分析性能優(yōu)于單鏈DNA 探針。

4 總結(jié)與展望

金屬元素標(biāo)記策略的研究發(fā)展迅速,基于金屬元素標(biāo)記的生物分析方法具有以下優(yōu)勢:(1)靈敏度高,可顯著提升檢測性能,融合元素標(biāo)記策略和Sp-ICP-MS 兩者的優(yōu)勢可在無需任何信號放大的情況下,實現(xiàn)高靈敏的生物分析;(2)可進(jìn)行多組分分析,數(shù)量高達(dá)上百種的同位素使得高通量多組分靈敏分析在生物檢測領(lǐng)域發(fā)揮了不可替代的作用;(3)具有良好的生物相容性與穩(wěn)定性,通過采用生物相容性良好且不含其它特殊性質(zhì)的金屬同位素對不同生物分子進(jìn)行穩(wěn)定標(biāo)記,確保了對細(xì)胞和生物分子的低毒性和低干擾;(4)擁有靈活性與可定制性,元素標(biāo)記策略可根據(jù)不同的實際需求進(jìn)行定制,選擇適合的金屬同位素和標(biāo)記方式?;谝陨蟽?yōu)勢,金屬元素標(biāo)記策略在多種生物傳感器的構(gòu)建方面具有廣闊的應(yīng)用前景。例如, ICP-TOF-MS 以及飛行時間流式細(xì)胞儀(CyTOF 或流式細(xì)胞儀)可以精確地定量分析細(xì)胞表面不同的金屬同位素。因此,金屬元素標(biāo)記策略在不同生物分子分析方法中的應(yīng)用將為開發(fā)更實用、準(zhǔn)確和高效的分析技術(shù)提供更廣泛的思路。

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