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不同抗性棗種質(zhì)響應(yīng)植原體侵染的差異研究

2024-12-12 00:00:00王超許亞茹焦立軍薄文浩曹明孔德倉張瓊龐曉明
關(guān)鍵詞:棗樹

摘要 為揭示抗病性棗種質(zhì)響應(yīng)植原體侵染的關(guān)鍵生物學(xué)途徑,通過嫁接侵染法對324 份棗種質(zhì)進行棗瘋病抗性鑒定。以篩選到的抗病種質(zhì)‘QS10’‘UU12’‘EQ15’和易感種質(zhì)‘中陽木棗’‘壺瓶棗’‘魯棗5 號’為材料,分別測定侵染后90、120 d 時保存的葉片組織的植原體含量,并通過轉(zhuǎn)錄組測序揭示響應(yīng)差異。結(jié)果顯示,嫁接感染后抗病種質(zhì)的植原體濃度水平低且逐漸下降,易感種質(zhì)的植原體濃度高且逐漸上升??共『鸵赘蟹N質(zhì)的差異表達基因(differentially expressed genes,DEG)都顯著富集在植物病原體互作、植物激素信號轉(zhuǎn)導(dǎo)、次生代謝產(chǎn)物的生物合成等通路中,并在過氧化物酶體、光合作用途徑和類黃酮生物合成途徑中存在表達差異。WGCNA分析發(fā)現(xiàn),脂質(zhì)磷酸酶、RNA 編輯因子 MORF 3、LysM 結(jié)構(gòu)域受體樣激酶、絲氨酸/蘇氨酸蛋白激酶sty13 樣等核心基因和抗病種質(zhì)相關(guān)。研究表明,應(yīng)對植原體入侵時,植物病原體互作、次生代謝產(chǎn)物的合成、植物激素信號轉(zhuǎn)導(dǎo)、MAPK 信號途徑的基因差異表達可能是抗病種質(zhì)和易感種質(zhì)響應(yīng)差異的原因;抗病種質(zhì)中過氧化物酶體相關(guān)的基因上調(diào)表達,光合作用的基因受植原體入侵的影響較小,可能有助于能量代謝的正常進行和氧化還原的平衡,增強其抗病性,黃酮類、萜類等次級代謝產(chǎn)物可能在消除活性氧的危害方面發(fā)揮作用。

關(guān)鍵詞 棗樹; 棗瘋病; 植原體互作; 次生代謝物; WGCNA

中圖分類號 S436.65 文獻標識碼 A 文章編號 1000-2421(2024)06-0240-13

棗(Ziziphus jujuba Mill.)是鼠李科(Rhamnaceae)棗屬(Ziziphus)植物,具有悠久的栽培歷史。棗果既可以鮮食也可制干,是食品工業(yè)重要的原料[1]。棗瘋病是由植原體引起的一種嚴重的病害,樹體染病后出現(xiàn)花柄伸長、花變?nèi)~、叢枝化、矮化和黃化等癥狀,逐漸失去結(jié)果能力;進而衰退甚至死亡[2]。植原體主要通過葉蟬等媒介昆蟲傳播,并且在棗樹中有潛伏期,棗園一旦發(fā)現(xiàn)有植株感染,病情往往已傳播開來。植原體尚無法人工培養(yǎng),嚴重影響致病機理和防治方法的研究。因缺乏有效的根治方法,棗瘋病對棗產(chǎn)業(yè)發(fā)展、棗種質(zhì)保存及利用威脅嚴重[3]。

篩選抗棗瘋病種質(zhì)資源,并挖掘抗病相關(guān)基因,可為防治和控制棗瘋病的有效措施開發(fā)奠定基礎(chǔ)。通過嫁接的方式侵染待鑒定的材料,是非常有效的鑒定方法[4],利用這種方法,研究人員篩選出若干具有一定棗瘋病抗性的種質(zhì),如在北京市的古棗樹群體中篩選得到的抗病種質(zhì)[5],以及棗樹種質(zhì)‘ 星光’[6]、‘T13’[7]等。但研究人員也發(fā)現(xiàn)各種質(zhì)應(yīng)對植原體的表現(xiàn)并不穩(wěn)定[8]。河北滄縣國家棗樹良種基地等各種質(zhì)庫保存了大量的棗種質(zhì),但目前尚缺乏大規(guī)模的種質(zhì)抗病性鑒定。

隨著測序技術(shù)的發(fā)展,轉(zhuǎn)錄組測序在發(fā)掘植物與病原體相互作用的重要基因上起到了重要作用,一些響應(yīng)棗瘋病侵染的基因被發(fā)現(xiàn),如編碼絲氨酸/蘇氨酸蛋白激酶家族成員 ZjMAPKKKs 的基因[9],AP2/ERF 轉(zhuǎn)錄因子家族中的ZjAP2*9、ZjERF49和 ZjERF91 等基因[10]。此外,Ye 等[11]利用iTRAQ蛋白質(zhì)組學(xué)和轉(zhuǎn)錄組分析了棗樹應(yīng)對植原體侵染的多重調(diào)控水平。棗樹感染植原體后,光合作用相關(guān)途徑和碳水化合物的代謝通路發(fā)生改變[12]。通過對健康和感病‘木棗’轉(zhuǎn)錄組測序發(fā)現(xiàn),各樣品的差異表達基因(differentially expressed genes, DEG)顯著富集在黃酮類化合物、苯丙烷類化合物和不飽和脂肪酸生物合成途徑[13];感病后棗樹發(fā)育畸形可能和保護酶和激素的代謝紊亂有關(guān)[14]。目前研究多針對棗瘋病的侵染后響應(yīng),對抗病棗種質(zhì)應(yīng)對植原體侵染的分子機制的研究相對較少。

本研究對324 份棗種質(zhì)進行嫁接侵染、篩選抗病種質(zhì),然后以2 組不同抗病性的種質(zhì)為材料對不同感染時期的葉片進行轉(zhuǎn)錄組對比分析,以揭示抗病性棗種質(zhì)響應(yīng)植原體侵染的關(guān)鍵生物學(xué)途徑,為棗瘋病抗性育種提供依據(jù)。

1 材料與方法

1.1 材料

2022 年4 月5 日采集河北滄縣國家棗樹良種基地資源圃中保存的324 份種質(zhì)的健康穗條,封蠟處理后置于冷庫保存。5 月25 日將所有的接穗嫁接到患棗瘋病2 a 以上的的金絲小棗植株上。以插皮接的方式每株嫁接2~4 個接穗,每個種質(zhì)至少嫁接2 個接穗作為重復(fù)。

轉(zhuǎn)錄組材料為通過嫁接篩選得到的具有一定抗病性的種質(zhì)‘QS10’‘UU12’‘EQ15’和易感種質(zhì)‘中陽木棗’‘壺瓶棗’‘魯棗5 號’。通過觀察,抗病種質(zhì)感染植原體后表現(xiàn)穩(wěn)定,沒有明顯棗瘋病的癥狀,所選易感種質(zhì)在嫁接90 d 后,棗瘋病癥狀變化明顯,取保存90、120 d 時的6 個種質(zhì)的葉片材料,進行轉(zhuǎn)錄組測序。

1.2 接穗的發(fā)病情況觀察和篩選

對嫁接后各種質(zhì)每30 d 的花變?nèi)~、叢枝、小葉等表型進行觀察、分級和統(tǒng)計,將其發(fā)病級別分為5 級:0 級,無明顯癥狀;1 級,新發(fā)枝花梗明顯延長,或頂梢葉變小、變淡,小葉比率低于整枝的10%;2 級,新梢小葉、節(jié)間縮短、腋芽明顯伸長或花變?nèi)~比率為1%~20%;3 級,叢枝小葉比率達21%~50%;4 級,從枝小葉比率達51%~90%;5 級,從枝小葉比率達91%~100% ,分級標準參照文獻[15]。嫁接侵染后60 d,采集尚未表現(xiàn)棗瘋病癥狀的種質(zhì)枝葉液氮處理后保存。根據(jù)嫁接后第 3、4 個月的觀察,取該期間仍然未表現(xiàn)棗瘋病癥狀的種質(zhì)為具有一定棗瘋病抗性的種質(zhì),取該期間接穗癥狀由正常轉(zhuǎn)變?yōu)閲乐氐囊赘蟹N質(zhì)為相應(yīng)的易感種質(zhì)。

1.3 植原體濃度檢測

通過熒光定量PCR 對所選抗病和易感種質(zhì)90、120 d 時的樣品進行植原體含量檢測,取各個種質(zhì)的葉片1~2 g,加入液氮充分研磨后,取0.2 g 粉末進行總DNA 提取,其DNA 濃度均一化后,以此DNA 為模板檢測植原體濃度,檢測方法參照文獻[16]。

1.4 轉(zhuǎn)錄組測序和數(shù)據(jù)分析

采集樣品經(jīng)過RNA 抽提、純化、建庫后,對這些文庫進行雙末端(paired-end,PE)測序,轉(zhuǎn)錄組測序在北京諾禾致源科技股份有限公司完成。對獲得的Raw reads 通過trim_galore 軟件去除接頭,去掉未知核苷酸數(shù)量超過10% 的reads、低質(zhì)量reads 進行數(shù)據(jù)過濾和質(zhì)量控制。使用hisat2 軟件建立包含剪切位點和exon 信息的基因組索引,然后將過濾后的cleanreads 和冬棗參考基因組比對[17],得到下游分析文件,轉(zhuǎn)換文件格式并校驗文件的完整性后,使用軟件featureCounts 對基因表達量定量,獲得表達量矩陣后,去除矩陣中表達量FPKM 值低于5 的基因。

1.5 轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)分析

在進行轉(zhuǎn)錄組分析時,各使用3 份抗病種質(zhì)和3份易感種質(zhì)作為抗病組和易感組的重復(fù)。使用DESeq2(https://github.com/mikelove/DESeq2)對抗病組(RG)和易感組(SG)2 個時期的基因進行差異表達分析,3 種抗病種質(zhì)和3 種易感種質(zhì)分別作為抗病組(RG)和易感組(SG)的重復(fù),分別計算抗病組(RG)和易感組(SG)3 個種質(zhì)的后期對比前期的基因變化情況,以|log2FoldChange|gt;1(FoldChange 為差異倍數(shù)) 、padj 值lt;0.05 為標準篩選差異基因。將獲得的DEG 映射到GO 數(shù)據(jù)庫(http://geneontology.org/)分析生物學(xué)功能,同時進行KEGG(https://www.kegg.jp/)富集分析代謝途徑或信號轉(zhuǎn)導(dǎo)通路。具體方法參照文獻[18]。

使用rstudio 軟件中的WGCNA 程序包進行加權(quán)基因共表達網(wǎng)絡(luò)構(gòu)建,將過濾后標準化的轉(zhuǎn)錄組表達量矩陣作為輸入,得到無尺度化鄰接矩陣后,將鄰接矩陣轉(zhuǎn)化為拓撲重疊矩陣( topological overlap matrix,TOM),采用動態(tài)剪切算法進行基因聚類及模塊劃分,使用WGCNA 自動網(wǎng)絡(luò)構(gòu)建函數(shù)blockwise‐Modules 構(gòu)建網(wǎng)絡(luò),相似模塊的合并閾值為0.25,分別計算模塊的特征向量與抗病和感病種質(zhì)之間的相關(guān)系數(shù)r 和P 值,選擇|r|gt;0.70 且Plt;0.01 的模塊為特異性模塊[19]。選擇模塊內(nèi)連接度最高的前10 個基因作為該模塊的核心基因,對這些基因及其關(guān)聯(lián)基因使用Cytoscape 軟件進行可視化繪圖[20]。同時使用NCBI 數(shù)據(jù)庫(https://www.ncbi.nlm.nih.gov/)獲得核心基因的功能注釋信息。

2 結(jié)果與分析

2.1 種質(zhì)抗病性鑒定

經(jīng)過4 個月的嫁接侵染和表型篩選,發(fā)現(xiàn)312 個種質(zhì)在嫁接后1 個月內(nèi)表現(xiàn)出叢枝、花變?nèi)~、小葉等棗瘋病癥狀。其中‘金絲小棗’‘冬棗’等272 個種質(zhì)病情發(fā)展迅速,表現(xiàn)出嚴重的棗瘋病癥狀,發(fā)病級別為5 級,這些為極易感種質(zhì)。60 d 后,大部分種質(zhì)發(fā)病嚴重,第90 天僅有11 個種質(zhì)仍有處于沒有明顯叢枝、葉片顏色正常的較低發(fā)病水平的接穗。120 d 后,發(fā)病較低的種質(zhì)縮減為5 個。60 d 后對病癥不明顯的接穗持續(xù)觀察并取樣保存,將120 d 仍未表現(xiàn)明顯發(fā)病癥狀的‘QS10’‘UU12’‘EQ15’確定為抗病種質(zhì),將120 d 發(fā)病嚴重的‘中陽木棗’‘壺瓶棗’‘魯棗5號’確定為易感種質(zhì),90 d 后,這3 份種質(zhì)仍有接穗從只有輕微發(fā)病逐漸發(fā)展成嚴重發(fā)病(圖1)。

2.2 嫁接侵染后不同抗性種質(zhì)植原體濃度變化

植原體濃度測定結(jié)果表明,2 個時期的6 份種質(zhì)樣品均含有植原體,相同時期對比,不論在90 d 時還是在120 d 時,抗病種質(zhì)植原體含量都比易感種質(zhì)的植原體含量低,抗病種質(zhì)植原體含量數(shù)量級在105~106 個/μL,易感種質(zhì)的植原體含量的數(shù)量級在106~108 個/μL。抗病種質(zhì)中,后期與前期相比,植原體含量顯著下降。易感種質(zhì)中,后期植原體含量相較于前期顯著上升(表1)。

2.3 差異表達基因分析

使用DESeq2 軟件對2 個時期的抗病組(RG)和易感組(SG) 各自3 個樣品的基因表達量對比篩選,抗病組(RG)獲得DEG 2 836 個,上調(diào)1 534 個、下調(diào)1 302 個;易感組(SG)獲得DEG 2 061 個,上調(diào)951個、下調(diào)1 110 個(圖2A)。其中,只在抗病組(RG)鑒定到的DEG 數(shù)為1 974 個,只在易感組(SG)鑒定到的DEG 數(shù)為1 199 個(圖2B)。

2.4 GO富集結(jié)果

為了分析抗病種質(zhì)和易感種質(zhì)應(yīng)對植原體侵染的生物學(xué)功能,分別從生物過程、細胞組件和分子功能三方面對抗病組(RG)和易感組(SG)獲得的DEG進行GO 富集分析,在抗病組(RG)中883 個DEG 注釋到64 個GO Term 中,顯著性高(Plt;0.05)的Term為轉(zhuǎn)錄因子活性、序列特異性DNA 結(jié)合、UDP 糖基轉(zhuǎn)移酶活性、水解酶活性(圖3A)。在易感組(SG)中有1 579 個DEG 注釋到67 個GO Term 中,其中顯著性較高(Plt;0.05)的Term 分別為碳水化合物代謝過程、胞外區(qū)、作用于酯鍵水解酶活性(圖3B)。GO 富集結(jié)果表明,植原體對抗病種質(zhì)和易感種質(zhì)侵染主要影響了信號轉(zhuǎn)導(dǎo)、細胞代謝過程、能量代謝等方面。

2.5 差異表達基因KEGG富集的關(guān)鍵通路

為了揭示棗感染植原體后的代謝通路的變化,對2 組差異表達基因進行KEGG 富集分析(圖4),結(jié)果顯示,抗病組(RG)中765 個差異基因富集在19 個通路中,易感組(SG)622 個差異基因富集在24 個通路中。對2 對DEG 得到的通路進行對比后發(fā)現(xiàn),抗病和易感種質(zhì)在應(yīng)對植原體侵染時,在能量代謝、合成次生代謝產(chǎn)物、代謝途徑、激素信號轉(zhuǎn)導(dǎo)等方面的基因表達均會發(fā)生改變。值得注意的是,真核生物中核糖體的發(fā)生,苯丙氨酸、酪氨酸和色氨酸的生物合成,MAPK 信號通路、過氧化物酶體、倍半萜和三萜生物合成和半乳糖代謝通路在抗病種質(zhì)中單獨地富集到;易感種質(zhì)中,氨基糖和核苷酸糖代謝、核苷酸糖的生物合成、光合作用、氮代謝、脂肪酸生物合成和降解、碳代謝被單獨地富集到。表明對病原體的反應(yīng)、激素合成和信號轉(zhuǎn)導(dǎo)、氧化還原相關(guān)過程、能量代謝可能與抗病和易感種質(zhì)應(yīng)對植原體侵染有關(guān)。

2.6 代謝通路中差異表達基因分析

1)應(yīng)對病原體侵染相關(guān)通路分析。為解析抗病種質(zhì)和易感種質(zhì)被植原體侵染時的表現(xiàn)差異,對植物病原體互作通路進行分析。圖5 結(jié)果顯示,抗病種質(zhì)中,PTI 中過敏反應(yīng)和防御相關(guān)基因誘導(dǎo)相關(guān)的編碼環(huán)腺苷酸門離子通道 (CNGCs,LOC107414602、LOC107414559、LOC112490923、LOC107423657、LOC107431294) 基因、鈣依賴蛋白激酶 (CDPK,LOC1074243669)基因、呼吸爆發(fā)氧化酶 (Rboh,LOC107424617)基因、鈣結(jié)合蛋白 (CaM/CML,LOC107434111、LOC107421107、LOC107416249、LOC107431392、LOC107409684、LOC107422102、LOC107425895、LOC107432911、LOC107427870、LOC107418972、LOC107404544)基因、WRKY 轉(zhuǎn)錄因子24(WRKY24,LOC107411616)、WRKY 轉(zhuǎn)錄因子39 (WRKY39, LOC107431286) 、WRKY22(LOC107432881)、甘油激酶(LOC107407412)、發(fā)病機制相關(guān)基因轉(zhuǎn)錄激活因子( Pti5,LOC107411165)和(Pti6,LOC107411595)基因,以及ETI 中編碼和植物過敏反應(yīng)(HR)相關(guān)的互作蛋白RIN4、RPM1、RPS2、RAR1、SGT1、HSP90、SGT1 相關(guān)的10 個基因均在前期上調(diào)表達,后期表達量下降。在易感種質(zhì)中,編碼環(huán)腺苷酸門離子通道(CNGCs,LOC107431294、LOC107414559、LOC112490923、LOC107414573、LOC107414597)基因、鈣結(jié)合蛋白(CaM/CML, LOC107424823、LOC107422810、LOC107432911)基因、發(fā)病機制相關(guān)基因轉(zhuǎn)錄激活因子(Pti6,LOC107411595)基因、熱休克蛋白HSP90(HSP90,LOC107420419)基因和WRKY 轉(zhuǎn)錄因子2(LOC107412508)基因在后期下調(diào)表達。

分析植物病原體互作通路中的MAPK 信號轉(zhuǎn)導(dǎo)途徑中參與H2O2、乙烯、茉莉酸、脫落酸和植物對損傷的反應(yīng)等途徑的12 個差異基因,這些基因包括絲氨酸/蘇氨酸蛋白激酶OX1、MAPK3、WRKY22、MAPK9、乙烯響應(yīng)轉(zhuǎn)錄因子ERF1、轉(zhuǎn)錄因子MYC2、脫落酸受體PYL4、鈣結(jié)合蛋白CaM 和呼吸爆發(fā)氧化酶同源蛋白RbohD。在抗病種質(zhì)中,這些差異基因均在前期高表達。在易感種質(zhì)中,前期編碼絲氨酸/蘇氨酸蛋白激酶OXI1 的基因表達量低,編碼WRKY22、MAPK9 的基因在后期下調(diào)表達。易感種質(zhì)中編碼轉(zhuǎn)錄因子MYC2 的基因在前后時期差別不明顯。脫落酸受體PYL4 在易感種質(zhì)后期下調(diào)表達,鈣結(jié)合蛋白CaM 和呼吸爆發(fā)氧化酶同源蛋白RbohD 的基因變化不明顯(圖6A)。

在茉莉酸的合成和信號轉(zhuǎn)導(dǎo)方面,合成途徑的烯氧化物環(huán)化酶AOC、12-氧植二烯酸還原酶OPDR、4-香豆酰-CoA 連接酶OPCL1 在抗病和易感種質(zhì)中均在前期上調(diào)表達,抗病種質(zhì)的表達量更高。茉莉酸o-甲基轉(zhuǎn)移酶JMT 在抗病種質(zhì)中前期高表達,后期下調(diào)表達,而在易感種質(zhì)中前后2 個時期表達量均低(圖6B) 。

2) 過氧化物酶體、光合作用和類黃酮生物合成通路DEG 分析。對單獨在抗病種質(zhì)中富集到的過氧化物酶體與單獨在易感種質(zhì)中富集到的光合作用和類黃酮合成通路的DEG 進行分析。結(jié)果顯示,抗病種質(zhì)中的PXMP2、ACAA1、ACSL、PIPOX、HMGCL、IDH、HAO 和SOD 等過氧化物酶體相關(guān)的10 個基因后期上調(diào)表達。主要涉及脂肪酸氧化、氨基酸代謝和抗氧化系統(tǒng)。編碼光系統(tǒng)Ⅱ中的PsbQ、PsbY,光系統(tǒng)Ⅰ中的PsaK、PsaL、PsaE、PsaG、PsaH、PsaO,光合電子傳遞鏈中的PetE、PetF 的10 個基因在抗病種質(zhì)中后期下調(diào)表達,在易感種質(zhì)后期顯著下調(diào)。類黃酮生物合成途徑中,與易感種質(zhì)相比,編碼CHS、CHI、F3H、FLS 的基因在抗病種質(zhì)的前期高表達。表明抗病種質(zhì)和易感種質(zhì)應(yīng)對植原體侵染的過程中,活性氧的生成和平衡的維持、黃酮類的合成方面表現(xiàn)出差異,易感種質(zhì)的光合作用受到很大的影響,可能與抗病和易感種質(zhì)的抗病性的差異有關(guān)(圖7)。

2.7 WGCNA分析

數(shù)據(jù)分析獲得16 293 個基因的表達數(shù)據(jù),過濾掉表達量低的基因后,根據(jù)基因的FPKM 值進行相關(guān)度分析并聚類,相關(guān)度高的基因被分配至1 個模塊中,共劃分了26 個模塊(圖8A),WGCNA 分析展示了26 個模塊與抗病和易感種質(zhì)的相關(guān)性和顯著性。相關(guān)性系數(shù)的絕對值高且顯著性值低(|r|gt;0.70 且Plt;0.01)的模塊與性狀高度相關(guān)。鑒定到與抗病種質(zhì)顯著正相關(guān)的模塊為grey60 模塊(r=0.75,P=0.005)和darkgrey 模塊(r=0.87,Plt;0.001)(圖8B)。對grey60 和darkgrey 模塊可視化分析(圖8C),在grey60 模塊中連接度最高的前3 個基因為脂質(zhì)磷酸酶γ 樣(LPPG)、泛素樣蛋白5(UBL5)和RNA 編輯因子 MORF 3;在darkgrey 模塊中連接度最高的前3 個基因分別為LysM 結(jié)構(gòu)域受體樣激酶3(LYK3)、絲氨酸/蘇氨酸蛋白激酶sty13 樣(STK13)和胱硫氨酸-合成酶1(CGS1),在這2 個和抗病種質(zhì)相關(guān)性高的模塊中,和植物免疫相關(guān)的基因有編碼泛素樣蛋白5、RNA 編輯因子 MORF 3、DEAD-box 依賴atp 的RNA 解旋酶50 樣、抗病蛋白at4g27190 樣、抗病樣蛋白DSC1、LysM 結(jié)構(gòu)域受體樣激酶3、絲氨酸/蘇氨酸蛋白激酶sty13 樣、E3 泛素蛋白連接酶BRE1 樣2 等的基因。2 個模塊的核心基因和注釋信息見表2。

3 討論

前人研究表明,棗瘋病的病癥表現(xiàn)和植原體的濃度有一定的相關(guān)性[21],經(jīng)過嫁接侵染和發(fā)病癥狀觀察,本研究發(fā)現(xiàn),抗病種質(zhì)中植原體濃度水平較低且是逐漸下降的,而易感種質(zhì)中的植原體濃度有大幅度上升,同時病癥變得越來越嚴重,植原體在棗樹中的大量繁殖可能破壞了棗樹正常的生長代謝,將來,通過各種組學(xué)手段揭示導(dǎo)致這些差異出現(xiàn)的原因?qū)⒂兄诮沂緱棷偛】剐詸C制。

棗樹感染植原體后,受侵染棗樹的免疫反應(yīng)和生理生化活動變化會對植物的正常生長產(chǎn)生影響[22]。轉(zhuǎn)錄組分析結(jié)果表明,抗病種質(zhì)和易感種質(zhì)在應(yīng)對植原體侵染時,模式觸發(fā)免疫(PTI)和效應(yīng)子觸發(fā)免疫(ETI)過程都產(chǎn)生了積極響應(yīng),PTI 和 ETI是植物病原互作的重要途徑[23]??共》N質(zhì)中PTI 過程的編碼CNGCs、CDPK、Rboh、CaM/CML 和ETI過程中編碼互作蛋白的基因前期高表達,后期下調(diào)表達。易感種質(zhì)中,編碼CNGC、CaM/CML 的基因后期下調(diào)表達,編碼CDPK 和Rboh 的基因表達沒有差異。推測抗病種質(zhì)PTI 和ETI 過程差異基因后期下調(diào)可能和植原體濃度降低有關(guān)。隨著植原體入侵,易感種質(zhì)的PTI 和ETI 過程前后時期差異基因較少,基因的變化趨勢不明顯,這和已有研究[24]的結(jié)果相同。

絲裂原活化蛋白激酶(MAPK)級聯(lián)是受體下游關(guān)鍵信號模塊,在植物免疫、環(huán)境應(yīng)激反應(yīng)和正常生長發(fā)育中起重要的作用[25]。在本研究中,MAPK 信號通路中的12 個DEG 在抗病種質(zhì)中均在前期高表達,在后期下調(diào)表達。在易感種質(zhì)的H2O2信號通路中,編碼OXI1 基因的上調(diào)表達是由H2O2 引起且OXI1 的活性能被H2O2誘導(dǎo)并向下游傳遞信號,影響細胞死亡、H2O2 生成和活性氧的內(nèi)穩(wěn)態(tài)[26],H2O2 作為防御信號分子,誘導(dǎo)核基因表達。OXI1 能使MAPK3 完全活化,但是編碼MAPK3 的基因后期相對前期輕微下調(diào)表達,下游WRKY22 基因下調(diào)表達,可能會影響H2O2的生成及其介導(dǎo)的信號傳遞。茉莉酸合成途徑中的AOC、OPDR、OPCL1,抗病和易感種質(zhì)均在前期高表達,后期下調(diào)表達,而和茉莉酸甲酯合成有關(guān)的JMT,在易感種質(zhì)中2 個時期表達量低。茉莉酸信號通路中,編碼JAZ 的基因在兩種質(zhì)中后期下調(diào)表達,易感種質(zhì)合成MYC2 的基因后期輕微上調(diào)表達,JAZ 作為JA 信號的轉(zhuǎn)錄抑制因子,能夠抑制MYC2 的活性。MYC2 在不同的植物體內(nèi)可能發(fā)揮不同的作用,在擬南芥中,MYC2 對病原體基因具有負調(diào)節(jié)作用,但番茄SlMYC2 抗灰霉病的過程中,SlMYC2 對病原體反應(yīng)基因有正調(diào)節(jié)作用[27]。抗病種質(zhì)中編碼MYC2 的基因下調(diào)表達,可能有助于后續(xù)防御反應(yīng)。

轉(zhuǎn)錄組分析發(fā)現(xiàn),抗病種質(zhì)的過氧化物酶體的基因在后期上調(diào)表達,抗病種質(zhì)受植原體入侵的影響,光合作用相關(guān)的基因輕微下調(diào)表達,易感種質(zhì)則大幅度下調(diào)表達。易感種質(zhì)中高濃度的植原體可能破壞了光合作用,對后續(xù)氧化還原信號的傳遞,活性氧產(chǎn)生和清除的動態(tài)平衡產(chǎn)生影響[28]。有研究表明,過氧化物酶體產(chǎn)生的H2O2可以提高植物對脅迫的耐受力,而葉綠體產(chǎn)生的H2O2主要和植物的過敏反應(yīng)相關(guān)[29]。在感染前期,雖然抗病種質(zhì)的植原體濃度較低,但類黃酮生物合成途徑中合成CHS、CHI、F3H、FLS 的基因的表達量與易感種質(zhì)相比較高,這些基因的表達會影響異黃酮、黃酮和黃酮醇以及花青苷的合成,使抗病性種質(zhì)更好地應(yīng)對活性氧暴發(fā),異黃酮可以作為植物的植保素發(fā)揮作用[30]??共》N質(zhì)中還富集到了倍半萜和三萜的合成途徑,表明萜類物質(zhì)可能作為植保素發(fā)揮作用。

綜上,應(yīng)對植原體入侵時,植物病原體互作、次生代謝產(chǎn)物的合成、植物激素信號轉(zhuǎn)導(dǎo)、MAPK 信號途徑的基因差異表達可能是抗病種質(zhì)和易感種質(zhì)響應(yīng)差異的原因;抗病種質(zhì)中過氧化物酶體相關(guān)的基因上調(diào)表達,光合作用的基因受植原體入侵的影響較小,可能有助于能量代謝的正常進行和氧化還原的平衡,增強其抗病性,黃酮類、萜類等次級代謝產(chǎn)物可能在消除活性氧的危害方面發(fā)揮作用。本研究揭示了抗病性棗種質(zhì)響應(yīng)植原體侵染的關(guān)鍵生物學(xué)途徑,可為棗瘋病抗性育種提供依據(jù)。

參考文獻References

[1] 高京草.中國棗資源研究與利用[D]. 楊凌:西北農(nóng)林科技大學(xué),2005.GAO J C.Research and utilization of jujube resourcesin China[D].Yangling:Northwest A amp; F University,2005( inChinese with English abstract).

[2] 王海妮,吳云鋒,安鳳秋,等. 棗瘋病和酸棗叢枝病植原體16S rDNA 和tuf 基因的序列同源性分析[J]. 中國農(nóng)業(yè)科學(xué),2007,40(10):2200-2205.WANG H N,WU Y F,AN F Q,etal.The homology analysis for sequences of 16S rDNA and tufgene of Phytoplasma from jujube witches’ broom and wild jujubewitches’ broom[J]. Scientia agricultura sinica,2007,40(10):2200-2205( in Chinese with English abstract).

[3] 郭建民,楊俊強,薛新平,等. 棗瘋病研究進展[J]. 山西農(nóng)業(yè)科學(xué),2017,45(8):1389-1392.GUO J M, YANG J Q, XUEX P, et al.Research progress on jujube witches’ broom disease[J]. Journal of Shanxi Agricultural Sciences,2017,45(8):1389-1392( in Chinese with English abstract).

[4] 溫秀軍,郭曉軍,田國忠,等. 幾個棗樹品種和婆棗單株對棗瘋病抗性的鑒定[J]. 林業(yè)科學(xué),2005,41(3):88-96.WEN XJ, GUO X J, TIAN G Z, et al.Identification of resistances ofseveral jujube cultivars and selected pozao single trees againstjujube witches-broom disease[J].Scientia silvae sinicae,2005,41(3):88-96( in Chinese with English abstract).

[5] 王合,任爭光,潘彥平,等. 北京市區(qū)古棗樹單株種源抗棗瘋病測定與抗病品種(系)篩選[J]. 林業(yè)科學(xué),2018,54(8):124-132.WANG H,REN Z G,PAN Y P,et al.Determinationof individual jujube trees against jujube witches’-broom diseaseand screening of resistant varieties from the ancient individualjujube trees growing in Beijing[J]. Scientia silvae sinicae,2018,54(8):124-132( in Chinese with English abstract).

[6] 劉孟軍,周俊義,趙錦,等. 極抗棗瘋病棗新品種‘星光’[J].園藝學(xué)報,2006,33(3):687.LIU M J,ZHOU J Y,ZHAO J,et al.An excellent new cultivar of Chinese jujube with high resistanceto jujube witches broom disease‘ Xingguang’[J].Actahorticulturae sinica,2006,33(3):687( in Chinese with Englishabstract) .

[7] WANG L X,LIU S Y,GAO M J,et al.The crosstalk of thesalicylic acid and jasmonic acid signaling pathways contributedto different resistance to Phytoplasma infection between thetwo genotypes in Chinese jujube[J/OL].Frontiers in microbiology,2022,13:800762 [2024-03-28]. https://doi. org/10.3389/fmicb.2022.800762.

[8] 田國忠,李志清,趙俊芳,等. 我國部分棗樹品種(系)對棗瘋病的抗性研究: 第三屆中國森林保護學(xué)術(shù)大會論文摘要集[C]. 北京:中國林學(xué)會, 2010: 25. TIAN G Z, LI Z Q,ZHAO J F, et al. Some Chinese jujube varieties (strains) onthe resistance of JWB:Third China Forest Protection AcademicConference Abstract Book[C]. Beijing: Chinese Academyof Forestry ,2010: 25(in Chinese).

[9] LIU Z G,WANG L X,XUE C L,et al.Genome-wide identificationof MAPKKK genes and their responses to phytoplasmainfection in Chinese jujube (Ziziphus jujuba Mill.)[J/OL].BMC genomics,2020,21(1):142[2024-03-28]. https://doi.org/10.1186/s12864-020-6548-6.

[10] 李繼東,倪靜,葉霞,等. 棗AP2/ERF 轉(zhuǎn)錄因子鑒定及其響應(yīng)棗瘋病植原體表達分析[J]. 園藝學(xué)報,2020,47(8):1463-1474.LI J D,NI J,YE X,et al.Genomic identification of jujubeAP2/ERF transcription factors and their expression patternduring jujube witches′ broom pathogenesis process[J]. Actahorticulturae sinica,2020,47(8):1463-1474 (in Chinese withEnglish abstract).

[11] YE X,WANG H Y,CHEN P,et al.Combination of iTRAQproteomics and RNA-seq transcriptomics reveals multiple levelsof regulation in phytoplasma-infected Ziziphus jujuba Mill[J]. Horticulture research,2017,4:17080 [2024-03-28].https://doi.org/10.1038/hortres.2017.80.

[12] 劉偉,霍辰思,王國平,等.棗瘋病導(dǎo)致的花異常發(fā)育相關(guān)基因鑒定及表達分析[J]. 山西農(nóng)業(yè)大學(xué)學(xué)報(自然科學(xué)版),2021,41(6):57-66.LIU W,HUO C S,WANG G P,et al.Identificationand expression analysis of genes related to abnormal flowerdevelopment induced by jujube madness disease[J].Journalof Shanxi Agricultural University (natural science edition),2021,41(6):57-66( in Chinese with English abstract).

[13] 李玲,閆旭宇,張昊,等. 基于高通量測序的棗瘋病轉(zhuǎn)錄組分析[J]. 分子植物育種,2020,18(11):3537-3543.LI L,YANX Y,ZHANG H,et al.Transcriptome data analysis of witches’broom disease in Ziziphus jujube based on high-throughput sequencing[J]. Molecular plant breeding,2020,18(11):3537-3543( in Chinese with English abstract).

[14] 張舒怡,張鐘,張春梅,等. 基于轉(zhuǎn)錄組水平的棗瘋病發(fā)病機理研究[J]. 園藝學(xué)報,2017,44(7):1287-1298.ZHANG S Y,ZHANG Z,ZHANG C M,et al. Transcriptomic analysis onpathogenesis of witches’ broom disease in Ziziphus jujuba[J].Acta horticulturae sinica,2017,44(7):1287-1298 (in Chinesewith English abstract).

[15] 田國忠,李志清,胡佳續(xù),等. 我國部分棗樹品種(系)的棗瘋病抗性鑒定[J]. 林業(yè)科技開發(fā),2013,27(3):19-25.TIAN GZ,LI Z Q,HU J X,et al.Resistance evaluation of a collectionof Chinese jujube cultivars (line) against jujube witches’broom phytoplasma in China[J]. China forestry science andtechnology,2013,27(3):19-25 (in Chinese with English abstract).

[16] 任爭光,王合,林彩麗,等. 實時熒光定量PCR(SYBR GreenⅠ)檢測不同抗棗瘋病棗樹品種嫁接接穗中的植原體濃度[J]. 植物病理學(xué)報,2015,45(5):520-529.REN Z G,WANGH,LIN C L,et al.A real-time (SYBR Green Ⅰ) PCR assayfor detection and quantification of jujube witches’-broom phytoplasmain the grafted jujube cultivar scions with different resistance[J]. Acta phytopathologica sinica,2015,45(5):520-529( in Chinese with English abstract).

[17] HUANG J,ZHANG C M,ZHAO X,et al.The jujube genomeprovides insights into genome evolution and the domesticationof sweetness/acidity taste in fruit trees[J/OL].PLoS genetics,2016,12(12):e1006433[2024-03-28]. https://doi. org/10.1371/journal.pgen.1006433.

[18] XU Y,WANG C,KONG D, et al. Identification of high toleranceto jujube witches’ broom in indian jujube (Ziziphus mau?ritiana Lam.) and mining differentially expressed genes relatedto the tolerance through transcriptome analysis [J/OL]. Plants,2023,12(11):2082[2024-03-28]. https://doi.org/10.3390/plants12112082.

[19] 張毅,吳萬億,劉霞宇,等.利用WGCNA鑒定甘薯耐鹽相關(guān)共表達網(wǎng)絡(luò)及核心基因[J]. 河南農(nóng)業(yè)科學(xué),2021,50(6):16-27.ZHANG Y, WU W Y, LIU X Y, et al.Identification of salttolerance co-expression modules and hub genes in Ipomoeabatatas by WGCNA[J].Journal of Henan agricultural sciences,2021,50(6):16-27( in Chinese with English abstract).

[20] KOHL M,WIESE S,WARSCHEID B.Cytoscape:softwarefor visualization and analysis of biological networks[J].Methodsin molecular biology,2011,696:291-303.

[21] 趙錦,劉孟軍,周俊義,等.棗瘋植原體的分布特點及周年消長規(guī)律[J]. 林業(yè)科學(xué),2006,42(8):144-146.ZHAO J, LIU M J,ZHOU J Y, et al. Distribution and YearRound concentrationvariation of jujube witches’ broom (JWB) Phytoplasma in theplant of Chinese jujube[J].Scientia silvae sinicae,2006,42(8):144-146( in Chinese with English abstract).

[22] KARASOV T L,CHAE E,HERMAN J J,et al.Mechanismsto mitigate the trade-off between growth and defense[J].Theplant cell,2017,29(4):666-680.

[23] ZHANG S Y,LI C,SI J P,et al.Action mechanisms of effectorsin plant-pathogen interaction[J/OL].International journalof molecular sciences,2022,23(12):6758[2024-03-28].https://doi.org/10.3390/ijms23126758.

[24] 王會魚. 棗響應(yīng)植原體侵染及恢復(fù)的轉(zhuǎn)錄組和蛋白組分析[D]. 鄭州:河南農(nóng)業(yè)大學(xué),2018.WANG H Y.Transcriptomeand proteome analysis of jujube in response to phytoplasma infectionand recovery[D].Zhengzhou:Henan Agricultural University,2018( in Chinese with English abstract).

[25] ZHANG M M, ZHANG S Q. Mitogen-activated protein kinasecascades in plant signaling[J].Journal of integrative plantbiology,2022,64(2):301-341.

[26] RENTEL M C,LECOURIEUX D,OUAKED F,et al.OXI1kinase is necessary for oxidative burst-mediated signalling inArabidopsis[J].Nature,2004,427(6977):858-861.

[27] DU M M,ZHAO J H,TZENG D T W,et al.MYC2 orchestratesa hierarchical transcriptional cascade that regulates jasmonate-mediated plant immunity in tomato[J].The plant cell,2017,29(8):1883-1906.

[28] XUE C L,LIU Z G,WANG L H,et al. The antioxidant defensesystem in Chinese jujube is triggered to cope with phytoplasmainvasion[J].Tree physiology,2020,40(10):1437-1449.

[29] SEWELAM N,JASPERT N,VAN DER KELEN K,et al.Spatial H2O2 signaling specificity:H2O2 from chloroplasts andperoxisomes modulates the plant transcriptome differentially[J].Molecular plant,2014,7(7):1191-1210.

[30] 郭艷玲,張鵬英,郭默然,等.次生代謝產(chǎn)物與植物抗病防御反應(yīng)[J]. 植物生理學(xué)報,2012,48(5):429-434.GUO Y L,ZHANGP Y,GUO M R,et al.Secondary metabolites and plant defenceagainst pathogenic disease[J].China industrial economics,2012,48(5):429-434( in Chinese with English abstract).

(責任編輯:邊書京)

基金項目:國家重點研發(fā)計劃項目(2022YFD2200404);雄安新區(qū)科技創(chuàng)新專項(2022XACX1100);河北省院士合作重點單位棗瘋病病原菌、根際微生物與宿主棗的互作和致病機制項目

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