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基于腹部CT 平掃圖像對急性闌尾炎的診斷:影像組學(xué)研究

2024-12-31 00:00:00曲別雪蕾王可欣劉想張耀峰張曉東王霄英
關(guān)鍵詞:急性闌尾炎

【摘 要】目的:探索使用影像組學(xué)模型在腹部CT平掃圖像上診斷急性闌尾炎的可行性。方法:回顧性收集2015年5月至2021年8月北京大學(xué)第一醫(yī)院經(jīng)手術(shù)病理確診的急性闌尾炎患者的術(shù)前腹部CT掃描的影像和臨床數(shù)據(jù)210例,以及同期因其他急腹癥行腹部CT平掃的患者210例用于影像組學(xué)模型訓(xùn)練。420例患者的CT檢查采集于4臺不同CT掃描設(shè)備。由2位影像科醫(yī)生手工標(biāo)注闌尾區(qū)域。將數(shù)據(jù)按7∶3的比例隨機分為訓(xùn)練集和測試集。使用特征提取102種圖像特征后,使用Pearson相關(guān)分析進(jìn)行特征降維,以遞歸特征消除法選擇最相關(guān)的20種特征訓(xùn)練支持向量機(support vector machine,SVM)進(jìn)行二分類,得到影像組學(xué)模型。得到影像組學(xué)模型后,對測試集進(jìn)行預(yù)測結(jié)果,以受試者工作特征曲線(receiver operating characteristic,ROC)評價影像組學(xué)模型的效能。結(jié)果:經(jīng)過特征降維、特征選擇后,共有3種形態(tài)特征、3種一級特征和14種紋理特征用于訓(xùn)練SVM模型。測試集中SVM模型正確預(yù)測114例(闌尾炎60例,非闌尾炎54例),錯誤預(yù)測12例(闌尾炎3例,非闌尾炎9例)敏感度為95.2%,特異度為85.7%,準(zhǔn)確率為90.5%,ROC曲線下面積為0.931(95%CI=0.887~0.976)。結(jié)論:基于腹部CT平掃圖像的影像組學(xué)模型可用于急性闌尾炎的預(yù)測,未來有望用于急腹癥CT檢查的流程優(yōu)化。

【關(guān)鍵詞】急性闌尾炎;CT;影像組學(xué)

【中圖分類號】R445 【文獻(xiàn)標(biāo)志碼】A 【收稿日期】2023-08-03

闌尾炎是外科急診手術(shù)最常見的原因,全球范圍內(nèi)年發(fā)病率為(96.5~100)/10萬成人[1-2]。急性闌尾炎的診斷要求依靠病史、體格檢查、實驗室檢查和影像檢查。臨床表現(xiàn)典型的急性闌尾炎患者,90% 可依據(jù)上述信息做出準(zhǔn)確診斷[3]。超聲和CT是常用的闌尾炎影像檢查方法,對非妊娠成人CT是首選的影像檢查方法[4]。急性闌尾炎的典型CT表現(xiàn)為闌尾增粗、壁增厚水腫、闌尾結(jié)石、周邊脂肪間隙模糊索條影等,診斷困難不大。闌尾炎的CT診斷仍存在個別困難情況,如解剖變異導(dǎo)致闌尾不易識別、早期炎癥表現(xiàn)輕微導(dǎo)致漏診等[5]。更重要的是,在急診行CT檢查時,要求影像診斷醫(yī)生不僅快速檢出闌尾炎,而且要對全腹其他臟器是否存在急腹癥情況也作出迅速、準(zhǔn)確性的評估。因此,有必要研究高效、自動的診斷工具以輔助急性闌尾炎的CT診斷。

使用影像組學(xué)方法可以提取CT圖像中的高維特征,基于特征工程和統(tǒng)計建模對目標(biāo)疾病進(jìn)行分類或回歸預(yù)測,近年來有不少關(guān)于胃腸道腫瘤的影像組學(xué)研究[6],但在急腹癥的報告較少。本研究的目的是探索使用影像組學(xué)模型在腹部CT平掃圖像上診斷急性闌尾炎的可行性。

1 資料與方法

1.1 數(shù)據(jù)入組

回顧性納入北京大學(xué)第一醫(yī)院手術(shù)病例記錄系統(tǒng)中2015年5月至2021年8月經(jīng)病理證實的急性闌尾炎患者,納入標(biāo)準(zhǔn):有完整的術(shù)前檢查資料,行急性闌尾炎手術(shù)并有完整的病理報告,共獲得424例數(shù)據(jù)。按上述病例資料的病案號查詢本院影像存儲及傳輸系統(tǒng)及放射管理信息系統(tǒng)中相對應(yīng)的腹部CT數(shù)據(jù),排除標(biāo)準(zhǔn):無本院CT圖像;本院CT圖像為術(shù)后;掃描范圍不完整;圖像質(zhì)量不合格,最終納入210例急性闌尾炎患者的CT圖像。查找同期因急腹癥行腹部CT平掃的圖像資料,在性別、年齡匹配后入組210例非急性闌尾炎患者的CT圖像。合計420例(210例急性闌尾炎,210例非急性闌尾炎)納入研究。本項目為回顧性研究,獲得了倫理審查委員會的批準(zhǔn)(批件號:2019-170)。

1.2 成像參數(shù)

共使用4臺CT設(shè)備進(jìn)行圖像采集。掃描范圍為全腹,上界達(dá)膈面,下界恥骨聯(lián)合,均為平掃。層厚=1~1.25 mm,層間距=1~1.25 mm,矩陣=512×512。

1.3 數(shù)據(jù)標(biāo)注和測量

使用ITK-SNAP 3.8.0軟件(http://www.itksnap.org)標(biāo)注闌尾感興趣區(qū)(region of interest,ROI)。由1位影像醫(yī)生(影像工作13年)標(biāo)注,由1位腹部影像專業(yè)醫(yī)生(影像工作30年)檢查并修改標(biāo)注。如果闌尾顯示清晰,則標(biāo)注區(qū)域包括闌尾根部至闌尾尖部;如果闌尾顯示不佳,則標(biāo)注盲腸末端區(qū)域以及其后內(nèi)側(cè)(圖1)。

1.4 影像組學(xué)模型訓(xùn)練

影像組學(xué)模型訓(xùn)練過程包括:特征提取、特征歸一化、特征降維、特征選擇、分類器訓(xùn)練等過程。

特征提取:使用PyRadiomics軟件包(https://pyradiomics.readthedocs.io/en/latest/)從ROI提取特征。共提取14種形態(tài)(shape)特征、18種一級(first order)特征、24種灰度共生矩陣(gray-level co-occurrence matrix,GLCM)特征、14 種灰度依賴矩陣(gray-level dependence matrix,GLDM)特征、16 種灰度游程矩陣(gray-level run length matrix,GLRLM)特征和16灰度大小區(qū)域矩陣(gray-level size zone matrix,GLSZM)特征,最終每個ROI共提取102個圖像特征。

特征歸一化:使用標(biāo)準(zhǔn)差標(biāo)準(zhǔn)化方法,即對提取出的原始特征數(shù)據(jù)的均值(mean)和標(biāo)準(zhǔn)差(standard deviation)進(jìn)行數(shù)據(jù)的標(biāo)準(zhǔn)化,公式為:x'=x-μσ。其中μ 為所有樣本數(shù)據(jù)的均值,σ 為所有樣本數(shù)據(jù)的標(biāo)準(zhǔn)差。

特征降維:使用Pearson相關(guān)性分析(pearson correlationanalysis)判斷各個特征之間的兩兩相關(guān)性。如果兩個特征的Pearson相關(guān)性系數(shù)(pearson correlation coefficient,PCC)gt;0.10則認(rèn)為有相關(guān)性,隨機刪除一個特征,直到所有特征之間的PCClt;0.10。

特征選擇:使用遞歸特征消除(recursive feature elimination,REF)方法篩選最小20個特征集合用于最終訓(xùn)練分類器。

分類器訓(xùn)練:按照7∶3 的比例將數(shù)據(jù)隨機分為訓(xùn)練集(train set)和測試集(test set),訓(xùn)練支持向量機(supportvector machine,SVM)模型。SVM 的損失函數(shù)為Hinge loss,公式為:

分類器評價:計算分類模型中每個樣本的組學(xué)得分(rad-score),應(yīng)用sigmoidal函數(shù)將組學(xué)得分轉(zhuǎn)換為急性闌尾炎的概率P(P 介于0~1)。使用受試者工作特征曲線(receiveroperating characteristic,ROC)來評估模型預(yù)測的性能。計算ROC曲線下面積(area under curve,AUC)。

1.5 統(tǒng)計學(xué)方法

使用R4.2.0軟件進(jìn)行統(tǒng)計分析。以Kolmogorov-Smirnov檢驗計量數(shù)據(jù)的正態(tài)性。符合正態(tài)分布的計量資料用均數(shù)±標(biāo)準(zhǔn)差(x±s)表示,不符合正態(tài)分布的計量資料用四分位間距[Md(P25,P75)]表示。計量數(shù)據(jù)的比較采用t 檢驗或Mann Whitney U 檢驗。AUC的置信區(qū)間使用Delong檢驗計算。檢驗水準(zhǔn)α=0.05。

2 結(jié)果

2.1 入組病例特征

420例患者的病例特征和掃描參數(shù)見表1,患者平均年齡42(31.0,59.0)歲,女性48.6%,98.8% 的患者使用GELightSpeed VCT 掃描。按7∶3隨機分為訓(xùn)練集和測試集,2組間病例特征和掃描參數(shù)見表1。各指標(biāo)在2組間的差異均無統(tǒng)計學(xué)意義(Pgt;0.05)。

2.2 影像組學(xué)特征

經(jīng)特征提取、特征歸一化、特征降維、特征選擇后,共20個影像組學(xué)特征用于訓(xùn)練分類器。測試集闌尾炎及非闌尾炎組各特征數(shù)值見表2、圖2。

2.3 模型效能

SVM對測試集的126例數(shù)據(jù)的預(yù)測結(jié)果見圖3,ROC分析結(jié)果見圖4。測試集中SVM模型正確預(yù)測114例(闌尾炎60例,非闌尾炎54例),錯誤預(yù)測12例(闌尾炎3例,非闌尾炎9例)敏感度為95.2%,特異度為85.7%,準(zhǔn)確率為90.5%,陽性預(yù)測值為0.946,陰性預(yù)測值為0.857,ROC曲線下面積為0.931(95%CI=0.887~0.976)。

3 討 論

急腹癥表現(xiàn)為突發(fā)、嚴(yán)重腹痛,CT是急腹癥常用的影像檢查手段,其任務(wù)是發(fā)現(xiàn)可能存在的炎癥、感染、缺血、梗阻、穿孔等情況,及時篩選出需要外科干預(yù)的患者[7]。全腹CT檢查后,影像醫(yī)師應(yīng)快速、準(zhǔn)確地完成全腹部臟器的診斷。急性闌尾炎是急腹癥中最常見的情況,本研究發(fā)現(xiàn)使用影像組學(xué)方法可以準(zhǔn)確地診斷急性闌尾炎,敏感性可達(dá)95.2%,未來有可能用于優(yōu)化急診CT的診斷流程,提高診斷效率。

國內(nèi)外關(guān)于急性闌尾炎的CT診斷效能研究很多,診斷準(zhǔn)確性的報告差異較大[5,8-9]。檢索Cochrane數(shù)據(jù)庫[10],在71項研究中,醫(yī)生診斷的敏感性估計值為0.72~1.00,特異性估計值為0.5~1.0。盡管報道結(jié)果各異,但可以認(rèn)為總體上醫(yī)生通過CT圖像診斷急性闌尾炎的準(zhǔn)確性是較高的。本研究提出的影像組學(xué)模型對急性闌尾炎的診斷效能與既往醫(yī)生診斷結(jié)果對比,診斷效能是類似的。

本研究提出影像組學(xué)模型不是為了進(jìn)一步提高診斷準(zhǔn)確率,而是期望在保證診斷準(zhǔn)確的前提下使用軟件輔助醫(yī)生診斷,以提高醫(yī)生工作效率。急腹癥的疾病譜很廣,影像醫(yī)生診斷時對胃腸道疾病、泌尿系統(tǒng)疾病、婦產(chǎn)科疾病以及血管性疾病等均需要給予關(guān)注[7,11]。如果能使用輔助診斷工具對各個臟器病變逐個做出診斷,就有可能優(yōu)化讀片流程,軟件在醫(yī)生讀片時給予提醒,由醫(yī)生最終做出診斷。相信在輔助工具效能較高的情況下,有望縮短讀片時間,提高醫(yī)生工作效率,類似的工作在其他影像診斷任務(wù)中已經(jīng)得到證實[12]。具體到急腹癥的輔助診斷,目前已有腎結(jié)石自動檢出[13]和急性胰腺炎的分類診斷[14],未來隨著急性闌尾炎以及等其他急腹癥的輔助診斷軟件的研發(fā),將多種輔助診斷工具集成在一起,就可以達(dá)到優(yōu)化整體急腹癥診斷流程的目的。對于急性闌尾炎,還有必要進(jìn)一步對其分類進(jìn)行評價,結(jié)合CT圖像和臨床信息進(jìn)行綜合建模,判斷其為單純性闌尾炎與非單純性闌尾炎,對制定治療方案提供建議。

本研究使用了常用的影像組學(xué)技術(shù)進(jìn)行研究。在特征提取過程中,使用經(jīng)典的影像特征提取工具PyRadiomics 包,使用的特征類型符合本領(lǐng)域的共識,包括形態(tài)特征、一級特征和紋理特征[15-16]。在紋理特征中,GLCM類表征的是圖像灰度相關(guān)性信息,GLRLM 類表征的是圖像中1D 連通域的大小和數(shù)目,GLSZM類表征的是圖像中2D/3D連通域的大小和數(shù)目,GLDM類也表征了圖像中2D/3D連通域的大小和數(shù)目,但是限制關(guān)注鄰域的面積[16-17]。由于紋理特征之間存在關(guān)聯(lián)性和相似性,因此使用了Pearson相關(guān)分析去除相關(guān)性較強的特征,以達(dá)到特征降維的目的。SVM是機器學(xué)習(xí)中常用的監(jiān)督學(xué)習(xí)分類器,可適用于小樣本數(shù)據(jù),對非線性和高維模式識別效果較好[18]。本研究發(fā)現(xiàn)在測試集中,CT圖像中ROI區(qū)域的紋理特征、形狀特征和一級特征均可能對鑒別闌尾炎和非闌尾炎有貢獻(xiàn),但其中主要貢獻(xiàn)是紋理特征,這跟胰腺炎的相關(guān)研究是相似的[14]。

本研究有一定的局限性。①研究隊列為回顧性收集,未來應(yīng)進(jìn)行前瞻性數(shù)據(jù)收集和驗證,以確定模型實際效能。②本研究中闌尾區(qū)域的ROI是手工標(biāo)注的,將來應(yīng)基于統(tǒng)計或基于模型自動標(biāo)注闌尾ROI然后自動預(yù)測,以達(dá)到優(yōu)化流程的目標(biāo)。③本研究未進(jìn)行讀片研究,將來在前瞻性研究時,應(yīng)觀察醫(yī)生在模型幫助下是否可以提高診斷效率。④未來應(yīng)收集診療過程中的臨床綜合信息和隨訪結(jié)果,對非典型的急性闌尾炎進(jìn)行影像組學(xué)診斷研究,以提升模型對臨床工作的適用性??傊?,基于當(dāng)前的回顧性研究結(jié)果,可以認(rèn)為腹部CT平掃圖像的影像組學(xué)模型可用于急性闌尾炎的預(yù)測,有進(jìn)一步研究的必要。

參 考 文 獻(xiàn)

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(責(zé)任編輯:周一青)

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