趙 欽,周恩民,孫培明,董施偉,張 璐,孫亞妮,姜世金1,2,
(1.山東農(nóng)業(yè)大學(xué)動(dòng)物醫(yī)學(xué)院“泰山學(xué)者”免疫生物學(xué)實(shí)驗(yàn)室,山東泰安271018;2.山東省動(dòng)物生物技術(shù)與疫病防控重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室,山東泰安271018;3.山東農(nóng)業(yè)大學(xué)動(dòng)物醫(yī)學(xué)院預(yù)防獸醫(yī)系,山東泰安271018)
禽戊型肝炎病毒(Hepatitis E virus,HEV)屬于肝炎病毒屬,為無(wú)囊膜、單股正鏈RNA病毒。禽HEV由Ritchie等經(jīng)患有肝脾腫大綜合征(Hepatitissplenomegaly syndrome,HSS)的病雞組織中分離得到[1],通過(guò)血清學(xué)和分子流行病學(xué)調(diào)查,證實(shí)了禽HEV為HSS主要病原[3-5]。我國(guó)部分地區(qū)流行病學(xué)調(diào)查表明:雞群中禽HEV的血清抗體陽(yáng)性率達(dá)到30%左右[6-7]。禽HEV基因組全長(zhǎng)約6.6 nt,包含3個(gè)開(kāi)放閱讀框(ORF),分別為 ORF1、ORF2和ORF3。已有研究報(bào)道采用RT-套式PCR方法對(duì)禽HEV進(jìn)行檢測(cè)[2-4,7],其中Sun等設(shè)計(jì)的針對(duì)ORF2基因保守序列的引物得到了廣泛應(yīng)用[7],Bilic等利用該引物對(duì)歐洲部分國(guó)家和澳大利亞的禽HEV感染狀況進(jìn)行了檢測(cè),發(fā)現(xiàn)以該引物擴(kuò)增的序列構(gòu)建的進(jìn)化樹(shù)與以全基因組序列構(gòu)建的進(jìn)化樹(shù)一致[4]。本實(shí)驗(yàn)從山東省某雞場(chǎng)收集糞便和肝脾腫大雞的膽汁,利用Sun設(shè)計(jì)的引物[7]進(jìn)行禽HEV ORF2基因的檢測(cè),并對(duì)獲得的部分禽HEV ORF2基因片段與其它國(guó)家的參考序列進(jìn)行比較分析。
1.1 樣品來(lái)源 10份雞糞便和8份膽汁樣品采自山東省某肉種雞場(chǎng)HSS病雞。糞便進(jìn)行預(yù)處理,-80℃保存?zhèn)溆谩?/p>
1.2 引 物 參照文獻(xiàn)[7]方法,合成擴(kuò)增ORF2部分序列的套式PCR引物,外側(cè)引物序列為ORF2/F-1/SD:5'-TCGCCT(C)GGTAAT(C)ACA(T)AAT GC-3',ORF2/R-1/SD:5'-GCGTTC(G)CCG(C)AC AGGT(C)CGGCC-3';內(nèi)側(cè)引物序列為ORF2/F-2/SD:5'-ACA(T)AATGCT(C)AGGGTCACCCG-3',ORF2/R-2/SD:5'-ATGTACTGA(G)CCA(G)CTG(C)GCCGC-3',由上海生工生物技術(shù)服務(wù)有限公司合成,目的片段分別為278 bp和242 bp。
1.3 糞便和膽汁樣品中禽HEV RNA的檢測(cè) 參照文獻(xiàn)[7]的RT-PCR程序,用TRIzol試劑(Invitrogen)從140 μL 10%糞便上清和膽汁中提取總RNA,反轉(zhuǎn)錄制備cDNA。以cDNA為模板,采用引物ORF2/F-1/SD和ORF2/R-1/SD進(jìn)行ORF2部分基因的第一次PCR擴(kuò)增,反應(yīng)條件為:95℃10 min;95℃45 s、48℃ 45 s、72℃ 45 s,39個(gè)循環(huán);72℃10 min。以該產(chǎn)物為模板,采用引物ORF2/F-2/SD和ORF2/R-2/SD進(jìn)行第二次擴(kuò)增,反應(yīng)條件中退火溫度為54℃,35個(gè)循環(huán),其余條件同第一次PCR。PCR產(chǎn)物瓊脂糖凝膠電泳觀察結(jié)果。
1.4 PCR產(chǎn)物的克隆與序列分析 瓊脂糖凝膠純化與回收PCR產(chǎn)物,連接pMD18-T載體,陽(yáng)性重組質(zhì)粒由南京金思瑞生物科技公司進(jìn)行測(cè)序。將獲得的序列采用生物學(xué)軟件與NCBI上登錄的序列(EU919193~EU919196、 FM872311~FM872320和AY870812~AY870831)進(jìn)行同源性和進(jìn)化樹(shù)分析。
2.1 樣品檢測(cè)結(jié)果 10份雞糞便樣品中,7份樣品能用禽HEV ORF2引物擴(kuò)增出大小約為250 bp的目的片段;8份雞膽汁樣品中,6份擴(kuò)增出目的片段(圖1)。證明已利用該引物檢測(cè)到禽HEV RNA,從病毒的核酸水平證實(shí)禽HEV感染的存在。這是我國(guó)首次報(bào)道禽HEV核酸檢測(cè)陽(yáng)性。
2.2 禽HEV部分ORF2基因序列的測(cè)定與分析獲得的13份陽(yáng)性樣品序列均為242 bp禽HEV ORF2基因的部分片段。挑選其中的4個(gè)序列錄入GenBank,序列號(hào) 分 別 為 GQ398039、GQ398040、GQ398041和GQ398042,分別命名為China 09-Z56,China 09-A5,China 09-B3和China 09-G57。13個(gè)序列的同源性在97.1%~98.3%之間,具有很高的同源性,這可能是樣品來(lái)自同一雞場(chǎng)的原因;與其它國(guó)家的禽HEV參考序列同源性為77.3%~95.5%,其中與歐洲的病毒株同源性最高,為95.5%~97.6%,可能是由于本實(shí)驗(yàn)所用種雞是由歐洲某種雞場(chǎng)引進(jìn)的有關(guān);而與美國(guó)的和西班牙來(lái)源的禽HEV的序列之間同源性較低,為77.3%~77.9%。同時(shí),本實(shí)驗(yàn)獲得的序列與其它國(guó)家的禽HEV參考序列構(gòu)建的進(jìn)化樹(shù)顯示,與歐洲的在同一分支上,同屬禽HEV基因3型(圖2),證實(shí)了Bilic等指出的禽HEV基因分型的地域性特點(diǎn)[4],但其與致病性的關(guān)系則有待進(jìn)一步的實(shí)驗(yàn)研究。
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