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MicroRNA在阿爾茨海默病發(fā)病機(jī)制中的作用

2011-02-11 15:05:11梁春聯(lián)
關(guān)鍵詞:腦組織位點(diǎn)調(diào)控

梁春聯(lián),秦 川

(中國(guó)醫(yī)學(xué)科學(xué)院,北京協(xié)和醫(yī)學(xué)院,醫(yī)學(xué)實(shí)驗(yàn)動(dòng)物研究所,衛(wèi)生部人類疾病比較醫(yī)學(xué)重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室,國(guó)家中醫(yī)藥管理局人類疾病動(dòng)物模型三級(jí)實(shí)驗(yàn)室,北京 100021)

阿爾茨海默?。ˋ lzheimer's disease,AD)是一種以進(jìn)行性認(rèn)知功能障礙和記憶損害為特征的神經(jīng)退行性疾病。主要病理特征為皮質(zhì)神經(jīng)元數(shù)量減少,神經(jīng)纖維纏結(jié)(neurofibrillary tangle,NFT),老年斑沉積(senile plaque,SP)等。

miRNA是一類長(zhǎng)約22個(gè)核苷酸的內(nèi)源性小分子RNA,由基因組轉(zhuǎn)錄生成。迄今為止,已鑒定的miRNA多達(dá)上千種(miRBase version 13.0,http:// m iRNA.sanger.ac.uk),調(diào)控機(jī)體約90%以上的基因表達(dá),據(jù)推測(cè),人體組織細(xì)胞內(nèi)的每一個(gè)生理過(guò)程幾乎均受miRNA的調(diào)控[1]。miRNA調(diào)控紊亂可能是人體多種疾病發(fā)生的潛在因素,其中,m iRNA在神經(jīng)生物學(xué)及神經(jīng)退行性疾病中的作用也日益為研究人員所關(guān)注,本文就m iRNA與神經(jīng)退行性疾病AD發(fā)生的相關(guān)研究進(jìn)展做一綜述。

1 miRNA的生物合成

miRNA編碼基因在基因組中有多種存在形式:?jiǎn)慰截悺⒍嗫截惢蚧虼氐?。在哺乳?dòng)物體內(nèi),80%的miRNA位于基因的內(nèi)含子區(qū),而這些基因大多由RNA聚合酶Ⅱ聚合生成,因此,RNA聚合酶Ⅱ相關(guān)的轉(zhuǎn)錄因子參與調(diào)控m iRNA的時(shí)空特異性表達(dá)模式。此外,還有一些miRNA位于基因間隔區(qū),其轉(zhuǎn)錄活化由自身的啟動(dòng)子介導(dǎo)。m iRNA基因由RNA聚合酶Ⅱ或Ⅲ轉(zhuǎn)錄生成原始轉(zhuǎn)錄本 miRNA(prim iRNA),在細(xì)胞核內(nèi)pri-miRNA經(jīng)屬于RNaseⅢ家族Drosha酶剪切生成長(zhǎng)度約70nt核苷酸的發(fā)夾前體m iRNA(pre-miRNA),隨后pre-m iRNA被核轉(zhuǎn)運(yùn)受體exportin-5由細(xì)胞核運(yùn)送至胞漿,后在Dicer酶的作用下,被切割成19~23 bp的成熟的miRNA,成熟的m iRNA同RNA沉默誘導(dǎo)復(fù)合物(RISC)結(jié)合,通過(guò)不完全互補(bǔ)配對(duì)作用于mRNA的3'UTR區(qū),抑制mRNA的翻譯或促使其脫腺苷酸化而加速降解。經(jīng)數(shù)據(jù)庫(kù)預(yù)測(cè),一種m iRNA可調(diào)控上百種靶基因的表達(dá),反之,一種 mRNA也可同時(shí)接受若干種miRNA的協(xié)同調(diào)控。此外,miRNA尚可調(diào)控轉(zhuǎn)錄因子及與其前體pre-miRNA剪切相關(guān)的蛋白質(zhì)的表達(dá),從而在m iRNA與其靶基因之間形成一個(gè)反饋調(diào)控機(jī)制,由此可見(jiàn)機(jī)體 miRNA調(diào)控網(wǎng)絡(luò)的復(fù)雜性[2]。

2 m iRNA在神經(jīng)系統(tǒng)中的功能

人和嚙齒類動(dòng)物的腦組織富含miRNA的表達(dá),相對(duì)于其它器官而言,腦組織中表達(dá)的miRNA種類更多,水平也更高。Sempere等[3]通過(guò) Northern雜交發(fā)現(xiàn)了小鼠及人腦中特有的 m iRNA:miR-9,-124a,-124b,-135,-153,-183,-219。小鼠及人腦中富含的7種miRNA:miR-9,-125a,-125b,-128,-132,-137,-139,然而,人和老鼠胎腦的m ir表達(dá)模式可能有所不同。

腦miRNA的表達(dá)受到精細(xì)的調(diào)控,在腦發(fā)育過(guò)程中,m iRNA的表達(dá)有一定的時(shí)序性。如:Mir-9,-125b,181a在胚胎發(fā)育初期低表達(dá),隨著發(fā)育過(guò)程的演進(jìn)表達(dá)增加,在出生后逐漸減少。此外,腦組織不同類型細(xì)胞有著不同的miRNA表達(dá)譜,如:有些m iRNA(m iR-124,m iR-128)在神經(jīng)元細(xì)胞中優(yōu)勢(shì)表達(dá),有些miRNA(miR-23,miR-26,miR-29)僅在星形膠質(zhì)細(xì)胞中或少突膠質(zhì)細(xì)胞中高表達(dá)[4]。miRNA在胚胎腦組織發(fā)育中的作用已得到了充分證實(shí),早期即通過(guò)Dicer酶缺失突變體證實(shí)了m iR-430家族在斑馬魚(yú)及小鼠腦組織形態(tài)發(fā)生中起著重要作用[5]。

隨著研究的進(jìn)展,miRNA在神經(jīng)系統(tǒng)中的的作用進(jìn)一步得到了細(xì)化,而對(duì)某種特異性miRNA生理功能的深入研究也逐步顯示出miRNA與神經(jīng)退行性疾病的潛在相關(guān)性,如:miR-134可影響樹(shù)突棘的形成[6],m iR-124、m ir-132與軸突的生長(zhǎng)有關(guān)[7,8],而軸突生長(zhǎng)不良及突觸結(jié)構(gòu)的喪失均為AD發(fā)生的早期事件。此外,m iRNA還參與細(xì)胞周期及凋亡的調(diào)控[9,10],而AD患者腦內(nèi)神經(jīng)元的丟失與細(xì)胞周期紊亂及凋亡水平的增加緊密相關(guān)。另Lukiw[11]等還發(fā)現(xiàn)AD患者腦內(nèi)m ir-146a表達(dá)增加與其體內(nèi)炎癥及應(yīng)激反應(yīng)有關(guān)。由此可見(jiàn),miRNA可能通過(guò)多條途徑影響AD的發(fā)生與發(fā)展。

3 AD患者腦內(nèi)m iRNA表達(dá)譜的改變

早期對(duì)miRNA在神經(jīng)退行性疾病中的作用主要是通過(guò)缺失Dicer的細(xì)胞或動(dòng)物模型進(jìn)行的,如:敲除Dicer酶的小鼠海馬樹(shù)突棘可發(fā)生與AD相似的變化[12]。然而,敲除 Dicer是一種很粗略的實(shí)驗(yàn)方法,因?yàn)槠淇蓪?dǎo)致細(xì)胞內(nèi)所有miRNA成熟障礙,此外,敲除 Dicer的動(dòng)物模型所呈現(xiàn)出的表型不僅僅是m iRNA缺失的后果,因?yàn)槌齧 iRNA的剪切成熟之外,Dicer還有其它的功能,如:參與小干擾RNA的合成、維持異染色質(zhì)結(jié)構(gòu)等。但這些研究結(jié)果至少表明腦內(nèi)m iRNA調(diào)控網(wǎng)絡(luò)的異常是神經(jīng)退行性疾病發(fā)生的一個(gè)潛在因素。

鑒于腫瘤發(fā)生中m iRNA表達(dá)譜研究所取得的重大收獲,眾多科研人員也展開(kāi)了對(duì)散發(fā)性AD患者腦內(nèi) miRNA表達(dá)譜的研究。Lukiw等[13]使用DNA芯片及Northern雜交的方法對(duì)胚胎、健康成年人及 AD患者腦內(nèi)海馬區(qū)12種腦組織相關(guān)的miRNA的表達(dá)進(jìn)行了分析,結(jié)果發(fā)現(xiàn)AD患者腦內(nèi)miR-9,miR-125b,miR-128的表達(dá)升高,而miR-124a的表達(dá)降低。之后,Hebert[14]等對(duì)同齡對(duì)照及散發(fā)性AD患者大腦顳葉皮質(zhì)區(qū)miRNA的表達(dá)進(jìn)行了檢測(cè),結(jié)果顯示AD患者腦內(nèi)有13種miRNA的表達(dá)顯著降低,經(jīng)數(shù)據(jù)庫(kù)比對(duì)后發(fā)現(xiàn)在這13種m iRNA中,有 7種具有與 AD相關(guān)的靶基因,即: m ir-15a,29b-1,9,19b與BACE1的3'UTR有結(jié)合位點(diǎn);mir-let-7,101,15a.106b與 APP3'UTR有結(jié)合位點(diǎn);m ir-9與PS 1的3'UTR有結(jié)合位點(diǎn)。

對(duì)AD患者疾病早期腦及腦脊液中miRNA表達(dá)譜的分析顯示,除已知的作用機(jī)制外,miRNA還可通過(guò)一些新的途徑來(lái)影響AD的發(fā)生,如:氧化應(yīng)激、胰島素抵抗、天然免疫等。研究發(fā)現(xiàn)[15],AD患者海馬區(qū) mir-423的表達(dá)上調(diào),小腦 mir-98的表達(dá)下調(diào),而這兩種 m iRNA均可調(diào)控異檸檬酸脫氫酶(IDH2)的表達(dá),IDH2表達(dá)的降低與氧化應(yīng)激的耐受性有關(guān),這部分說(shuō)明了腦不同部位對(duì)AD病理?yè)p傷的易感性(AD的病理?yè)p傷主要發(fā)生在海馬、皮質(zhì)和皮質(zhì)下區(qū),而小腦相對(duì)較輕)。另外,該研究還發(fā)現(xiàn)在AD患者腦脊液中有6種m iRNA呈差異性表達(dá),這提示miRNA有望成為疾病診斷的一種新的生化標(biāo)記。目前,對(duì)患者腦脊液中 Aβ、總tau蛋白及磷酸化tau蛋白等分子的含量的檢測(cè)表明其具有高度的可重復(fù)性,然而,miRNA能否同上述指標(biāo)一起作為AD早期診斷的分子標(biāo)記物,尚有待進(jìn)一步的研究。

最近,有研究人員通過(guò)芯片對(duì)AD患者大腦皮質(zhì)m iRNA及mRNA的表達(dá)譜同時(shí)進(jìn)行了檢測(cè)[16]。在差異表達(dá)的miRNA及mRNA中,有些miRNA與靶基因 mRNA負(fù)相關(guān),這些 m iRNA多參與調(diào)控RNA的剪切及翻譯延長(zhǎng)。而意外的是有些參與調(diào)控碳水化合物、脂肪酸代謝以及蛋白質(zhì)重構(gòu)的m iRNA的表達(dá)與其靶基因mRNA的表達(dá)呈正相關(guān),這與傳統(tǒng)的m iRNA對(duì)靶基因的負(fù)調(diào)控作用相悖,然而,結(jié)合細(xì)胞周期阻滯時(shí)miRNA可活化靶基因表達(dá)的報(bào)道[17],研究人員推測(cè) m iRNA對(duì)靶基因的活化作用可能不僅是促進(jìn)其翻譯,還可能與增強(qiáng)mRNA的穩(wěn)定性有關(guān)。這些研究拓展了人們對(duì)m iRNA功能的認(rèn)識(shí),說(shuō)明了在不同的細(xì)胞狀態(tài)和不同生理病理環(huán)境下miRNA可能具有不同的調(diào)節(jié)作用。2010年另有篇文獻(xiàn)報(bào)道[18]對(duì)早期 AD患者顳葉皮質(zhì)區(qū)灰質(zhì)和白質(zhì)miRNA的表達(dá)譜分別進(jìn)行了檢測(cè),并對(duì)差異表達(dá)的m iRNA與AD病理特征-神經(jīng)纖維纏結(jié)及老年斑的相關(guān)性進(jìn)行了對(duì)比分析,表明灰質(zhì)區(qū)一系列miRNA(如:mir-15,107及mir-29家族)的下調(diào)與老年斑的數(shù)量緊密相關(guān),即:灰質(zhì)miRNA的異常表達(dá)可能是導(dǎo)致AD病理改變的因素之一。

綜上,迄今為止盡管已有多篇文獻(xiàn)報(bào)道AD患者腦內(nèi)miRNA表達(dá)譜的改變,然而,其結(jié)果之間缺乏一致性。這歸因于在腦m iRNA表達(dá)譜的分析中,技術(shù)方法的重要性,如:組織標(biāo)本的來(lái)源、處理、病理?yè)p傷的程度、RNA的分離、芯片檢測(cè)技術(shù)及后續(xù)的數(shù)據(jù)分析等。需注意的事項(xiàng)有:①取材部位,腦組織由多種細(xì)胞類型構(gòu)成,而不同細(xì)胞類型中miRNA的表達(dá)譜不同,因此,取材差異會(huì)導(dǎo)致標(biāo)本的細(xì)胞成分發(fā)生變化從而影響試驗(yàn)結(jié)果的可靠性;②標(biāo)本來(lái)源,需注意女性患者和男性患者的疾病特征及 miRNA表達(dá)譜均有不同。③操作過(guò)程中miRNA的降解也是需要考慮的重要因素。

4 m iRNA調(diào)控AD致病基因的表達(dá)

至今,已有多篇文獻(xiàn)報(bào)道 BACE1的表達(dá)受miRNA的調(diào)控。Wang等報(bào)道[19],與同齡對(duì)照相比,AD患者腦內(nèi)mir-107的水平顯著降低,此外,他們檢測(cè)到在BACE1 mRNA的3'UTR區(qū)存在有mir-107的結(jié)合位點(diǎn),在疾病進(jìn)展中,隨著 m ir-107的降低,BACE1蛋白水平呈增高趨勢(shì)。同年,Hebert[14]也報(bào)道發(fā)現(xiàn)mir-29a,mir-29b-1,mir-9能夠在體外調(diào)節(jié)BACE1的表達(dá)、β內(nèi)分泌酶的活性及Aβ肽的產(chǎn)生。對(duì)臨床伴有BACE1蛋白水平異常增高的 AD患者腦內(nèi) mir-29a,mir-29b-1的檢測(cè)發(fā)現(xiàn)其表達(dá)顯著降低。值得注意的是上述兩項(xiàng)研究均表明: miRNA的降低并不與腦組織特定區(qū)域的疾病易感性相關(guān),即:AD患者腦內(nèi)運(yùn)動(dòng)皮層區(qū)m ir-107的表達(dá)、小腦mir-29a/b的表達(dá)也是減少的,這說(shuō)明雖然這兩種m iRNA降低可誘發(fā)BACE1高表達(dá),但其并非導(dǎo)致腦特定區(qū)域?qū)膊∫赘械囊蛩?。Boissonneault等[20]通過(guò)細(xì)胞試驗(yàn)證實(shí) mir-298、mir-328也可調(diào)控BACE1的表達(dá),而AD模型小鼠海馬區(qū)miRNA的檢測(cè)結(jié)果顯示mir-298、mir-328的表達(dá)降低,表明其抑制作用的喪失是導(dǎo)致BACE1蛋白表達(dá)增加的因素之一。

除BACE1外,APP也是m iRNA靶向調(diào)控分子之一。據(jù)數(shù)據(jù)庫(kù)預(yù)測(cè)分析,APP mRNA3'UTR區(qū)存在多個(gè)miRNA的潛在結(jié)合位點(diǎn)。研究表明[21]m iR-106a,miR-520c可負(fù)向調(diào)控APP的表達(dá),細(xì)胞水平實(shí)驗(yàn)表明,miR-106a,miR-520c過(guò)表達(dá)時(shí)可使 APP蛋白水平降低約 50%左右。另有研究報(bào)道[22],miR-106b也可調(diào)節(jié)APP的表達(dá),同時(shí),該研究人員還發(fā)現(xiàn)AD患者顳葉皮質(zhì)區(qū)m iR-106b的表達(dá)降低可能為AD發(fā)病的誘因之一。最近,有文獻(xiàn)報(bào)道[23]mir-101可調(diào)控APP的表達(dá),原代培養(yǎng)的海馬神經(jīng)元細(xì)胞試驗(yàn)表明,m ir-101的表達(dá)與 APP蛋白水平負(fù)相關(guān),并證實(shí)其可能為炎性細(xì)胞因子 IL-1B影響APP蛋白水平的機(jī)制之一。同時(shí),對(duì) AD模型鼠(SAMP8)的研究發(fā)現(xiàn)其 mir-16的表達(dá)顯著降低[24],體內(nèi)外試驗(yàn)均表明mir-16高表達(dá)可顯著降低APP的蛋白水平,表明模型鼠體內(nèi) APP的聚集與m ir-16的表達(dá)降低相關(guān)。

值得注意的是,盡管目前對(duì)于m iRNA在AD發(fā)病機(jī)制中作用的探討已取得了一定的進(jìn)展,但相關(guān)方面的研究還存在有一定的局限性:1)動(dòng)物模型在疾病發(fā)病機(jī)制中的研究具有重要的價(jià)值,然而鑒于人體功能的特異性及復(fù)雜性,其結(jié)果并不能直接類推到人體內(nèi)。2)每種m iRNA可靶向調(diào)控多種基因的表達(dá),集中研究針對(duì)一種靶基因的作用雖有利于研究工作的進(jìn)行,但這無(wú)疑忽視了m iRNA改變后的總體效應(yīng),即:上百種靶蛋白表達(dá)的改變,而這些改變的靶蛋白如何協(xié)同調(diào)控機(jī)體的功能尚有待進(jìn)一步的研究。3)組織細(xì)胞內(nèi)同時(shí)表達(dá)有多種miRNA,這些m iRNA協(xié)調(diào)一致共同發(fā)揮作用,聚焦單一m iRNA的作用就如同針對(duì)單一靶蛋白研究一樣,會(huì)混淆其生物效應(yīng)的真實(shí)性。4)目前研究中多通過(guò)轉(zhuǎn)染使細(xì)胞高表達(dá)某種miRNA,繼而研究其功能,然而,人為的高表達(dá)miRNA會(huì)使其與細(xì)胞內(nèi)源性表達(dá)的 m iRNA發(fā)生競(jìng)爭(zhēng)(如:使內(nèi)源性 m iRNA與RISC的結(jié)合幾率降低),導(dǎo)致內(nèi)源性miRNA靶基因的表達(dá)增加。

此外,在研究m iRNA在AD發(fā)病機(jī)制中作用時(shí),還有問(wèn)題尚需探討:導(dǎo)致AD患者腦內(nèi)miRNA異常表達(dá)原因是什么?其改變是疾病發(fā)生的誘因還是繼發(fā)事件?研究人員推測(cè)其合理的解釋有兩方面:1)隨著機(jī)體的老化及功能狀態(tài)的減退,m iRNA的合成及加工成熟發(fā)生障礙,miRNA表達(dá)水平改變成為疾病的誘發(fā)因素。2)其它始動(dòng)因素導(dǎo)致疾病的發(fā)生,神經(jīng)元毒性蛋白生成并影響miRNA的表達(dá),繼而其靶蛋白表達(dá)發(fā)生改變(如:APP、BACE1),而反過(guò)來(lái),靶蛋白含量的改變又可進(jìn)一步影響m iRNA的表達(dá),從而形成惡性循環(huán)促進(jìn)疾病的演進(jìn)及發(fā)展。

Lukiw等[25]通過(guò)實(shí)驗(yàn)對(duì)這一推論給與了驗(yàn)證:用硫酸鋁鐵處理原代培養(yǎng)的神經(jīng)元細(xì)胞,誘導(dǎo)細(xì)胞ROS的產(chǎn)生。7天后對(duì)細(xì)胞中m iRNA進(jìn)行分析,結(jié)果發(fā)現(xiàn),在產(chǎn)生ROS的細(xì)胞中出現(xiàn)一系列表達(dá)上調(diào)的miRNA:miR-9、miR-125、miR-128,而如前所述這些m iRNA在AD腦中表達(dá)上調(diào)。這一發(fā)現(xiàn)說(shuō)明氧化應(yīng)激可通過(guò)改變miRNA的表達(dá)來(lái)影響神經(jīng)系統(tǒng)的功能和退行性變的發(fā)生。最近,又有文獻(xiàn)報(bào)道[26]Aβ肽可影響細(xì)胞及體內(nèi)m iRNA的表達(dá)。將原代培養(yǎng)的小鼠海馬神經(jīng)元細(xì)胞經(jīng) Aβ肽處理后,檢測(cè)其miRNA的表達(dá),結(jié)果發(fā)現(xiàn)47%的miRNA表達(dá)降低,18%的 miRNA表達(dá)增加,其中,下調(diào)最顯著的m iRNA的表達(dá)(m ir-409-3p、361、20b、181c、148b)可降低4倍左右,而對(duì) APP23模型鼠海馬區(qū)miRNA的檢測(cè)也在體內(nèi)證明了這一點(diǎn)。

結(jié)語(yǔ)及展望

隨著研究的進(jìn)行,新的m iRNA不斷的被分離鑒定出來(lái),對(duì)已鑒定的m iRNA在神經(jīng)系統(tǒng)發(fā)育、正常功能及疾病狀態(tài)時(shí)表達(dá)模式的研究將具有重要的意義。而鑒于腦組織的多細(xì)胞類型成分及解剖和功能結(jié)構(gòu)域的復(fù)雜性使得這一工作的開(kāi)展具有一定的難度,但聯(lián)合使用原位雜交及其它技術(shù)(如免疫組化)來(lái)鑒定細(xì)胞類型及組織區(qū)域表達(dá)方式可望為其提供幫助。

鑒于miRNA在AD發(fā)病機(jī)制中作用的逐步揭示,通過(guò)寡核苷酸抑制或高表達(dá)miRNA有望成為疾病治療的新途徑,然而,其實(shí)際應(yīng)用尚面臨著一定的挑戰(zhàn):1)一種miRNA可在多大程度上調(diào)控哪些蛋白的表達(dá)有待探討;2)細(xì)胞內(nèi)miRNA自身的表達(dá)調(diào)控及反饋調(diào)控機(jī)制尚不明了;3)如何克服血腦屏障在腦內(nèi)抑制或高表達(dá)miRNA有待新的技術(shù)支持,此外,相關(guān)的生物利用度及毒性也是需要考慮的問(wèn)題。

基于miRNA在神經(jīng)系統(tǒng)發(fā)育、分化及突觸生成等方面的研究成果,miRNA在AD中的研究?jī)r(jià)值日益凸顯,篩選與疾病相關(guān)的m iRNA及其靶基因和相應(yīng)的蛋白表達(dá)的改變?nèi)詫⑹窃擃I(lǐng)域的研究焦點(diǎn)。隨著年齡的老化及細(xì)胞分裂的進(jìn)行,機(jī)體m iRNA的合成、代謝及功能也有可能會(huì)發(fā)生一系列的變化,而對(duì)這一過(guò)程的深入了解將有助于其在AD等老年性疾病中作用的探討。此外,基因3'UTR區(qū)的多態(tài)性也可能與AD患者腦內(nèi)Aβ肽聚集等病理變化相關(guān),因?yàn)?3'UTR的多態(tài)性有可能會(huì)增加或減少miRNA的靶向作用位點(diǎn),因此,進(jìn)一步鑒定致病基因(如:APP等)3'UTR區(qū)m iRNA結(jié)合位點(diǎn)的遺傳多態(tài)性將有望為AD發(fā)病機(jī)制提供新的詮釋。

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