孫 超,謝達(dá)平
(湖南農(nóng)業(yè)大學(xué)生物科學(xué)技術(shù)學(xué)院,湖南 長沙 410128)
隨著全球化石能源的日益枯竭和環(huán)境污染的惡化,生物丁醇作為一種生物能源和重要化工原料以其新型、潔凈、可再生等特點開始受到人們的高度重視[1]。就傳統(tǒng)的丙酮丁醇發(fā)酵而言,依然存在著菌種耐受有機溶劑能力低、丁醇產(chǎn)量、產(chǎn)率低等缺點[2]。針對傳統(tǒng)丙酮丁醇發(fā)酵中存在以上問題,以發(fā)酵菌種的改良為主要目的,采用分子生物學(xué)手段、基因工程及代謝工程來提高丁醇的產(chǎn)量已成為研究的熱點。
丙酮丁醇發(fā)酵的主要菌種是丙酮丁醇梭菌(Clostridium acetobutylicum),是一種革蘭氏陽性、細(xì)胞呈梭狀、能產(chǎn)生丙酮、丁醇和乙醇(3∶6∶1,w/w)溶劑的厭氧芽孢桿菌。丙酮丁醇梭菌細(xì)胞代謝過程中,通過解除代謝過程中各種可能的中間產(chǎn)物的抑制,調(diào)控強化各種關(guān)鍵酶,如丁醛脫氫酶(BAD)、乙酰乙酸脫羧酶(AADC)、乙酰乙酰-CoA:乙酸/丁酸∶CoA 轉(zhuǎn)移酶(CoAT)、丁醇脫氫酶(BDH)等,對加強丁醇的合成代謝,提高丁醇的產(chǎn)量具有重要的意義[3-4]。其中丁醇脫氫酶BDH(EC 1.1.99.8)作為丁醇代謝途徑中的關(guān)鍵酶之一,直接影響到最終產(chǎn)物丁醇產(chǎn)量的高低。丁醇脫氫酶是一種誘導(dǎo)酶,在產(chǎn)溶劑階段酶活力達(dá)到最高[5],其分子量為82±2 kDa,由兩個分子量都為42 kDa的同工酶(Ⅰ和Ⅱ)組成,其中BDHⅠ作用于丁醇合成初期,BDHⅡ作用于丁醇濃度較高的時期,根據(jù)對輔酶的依賴性可分為依賴NADH的BDH和依賴NADPH的BDH[6-9],該菌株中依賴NADH的BDH在國內(nèi)未見報道,為此,本文研究了丙酮丁醇梭菌發(fā)酵過程中依賴NADH的BDH的分離純化,旨在為丙酮丁醇梭菌代謝途徑的調(diào)控提供一定的理論基礎(chǔ)和實驗依據(jù)。
1.1.1 菌 種 丙酮丁醇梭菌(Clostridium acetobutylicum),中國微生物菌種保藏管理委員會普通微生物中心(CGMCC)保存,菌種編號1.0133。
1.1.2 試劑及儀器 供試試劑為NADH,L-半胱氨酸,正丁醛,硫酸銨等。儀器為超聲波破碎儀,紫外分光光度計,冷凍離心機,恒溫培養(yǎng)箱,冷凍干燥機等。
1.1.3 培養(yǎng)基 (1)活化培養(yǎng)基:玉米粉2%,蛋白胨0.05%,葡萄糖0.2%,L-半胱氨酸0.05%,硫代乙醇酸鈉0.02%。過40目篩的玉米粉需煮沸60min,pH調(diào)至6.8,分裝于厭氧管中,裝液量5 mL,于121℃滅菌20min。(2)種子培養(yǎng)液:葡萄糖4%,牛肉膏0.2%,酵母膏0.2%,蛋白胨0.6%,乙酸銨0.3%,K2HPO40.05%,MgSO40.02%,F(xiàn)eSO40.001%,pH調(diào)至6.5,分裝于帶硅膠塞的厭氧瓶中,裝液量60mL,于 121℃滅菌 20min。(3)發(fā)酵培養(yǎng)基:同種子培養(yǎng)液,分裝于厭氧瓶中,裝液量150 mL,于121℃滅菌20min。
1.2.1 菌種活化與發(fā)酵培養(yǎng) 從保存的丙酮丁醇梭菌斜面上挑取一環(huán)細(xì)菌接種于新鮮的活化培養(yǎng)基中,35℃培養(yǎng)48 h。從已經(jīng)產(chǎn)生氣體的活化培養(yǎng)基中吸取0.5 mL菌液接種于種子培養(yǎng)液,35℃靜置培養(yǎng)24 h,再取種子培養(yǎng)液以5%的接種量接種于發(fā)酵培養(yǎng)基中,35℃靜置培養(yǎng)48 h。
1.2.2 丁醇脫氫酶粗酶液的制備 細(xì)胞培養(yǎng)約48 h,檢測是否有代謝產(chǎn)物的產(chǎn)生,若有則置于冰浴中停止培養(yǎng),5 000 r/min,4℃,離心10min收集細(xì)胞。蒸餾水洗滌2次,測定細(xì)胞濕重,并以1:3的比例用 0.1 mol/L Tris-HCl(含 0.1mmol/L DTT)pH 7.5的緩沖液使細(xì)胞重懸。細(xì)胞重懸液置于冰浴中,超聲波細(xì)胞破碎儀破碎細(xì)胞,功率20W,10 min,間歇10 s。細(xì)胞破碎液經(jīng) 10 000 r/min,4℃,離心 10min,所得上清液即為粗酶液,4℃?zhèn)溆肹10]。
1.2.3 丁醇脫氫酶酶活測定 對細(xì)胞粗酶液測定BDH酶活可通過(1)式進(jìn)行反應(yīng)換算:
通過測定NADH在340 nm下的降低量從而測定丁醇脫氫酶酶活。反應(yīng)體系為:3mL 0.01mol/L Tris-HCl,pH 6.0緩沖液中含2 mmol/L丁醛,0.5 mmol/LNADH及50μL酶液[11]。加入丁醛之前,含有酶液的反應(yīng)體系先于35℃水浴中平衡30min,然后補加適當(dāng)?shù)腘ADH,再加入底物丁醛,35℃反應(yīng)10 min,迅速置于冰浴中5min,終止反應(yīng),在340 nm下比色,計算NADH在340 nm下讀數(shù)的降低值,空白對照用等體積的去離子水替代底物丁醛[12]。酶活力單位定義:每1min NADH的OD值下降0.001為1個酶活力單位[13]。
1.2.4 蛋白質(zhì)濃度的測定 用考馬斯亮藍(lán)結(jié)合法測定蛋白質(zhì)的質(zhì)量濃度[14]。
1.2.5 丁醇脫氫酶的分離純化 將研細(xì)的(NH4)2SO4按照20%的飽和度加入到粗酶液中,4℃下靜置1 h,再在10 000 r/min下離心30min,棄去沉淀(沉淀為初步分離的雜蛋白),取上清液加硫酸銨至60%飽和度,4℃下靜置1 h后10 000 r/min下離心30 min,棄去上清液,沉淀用10 mmol/L pH 6.4的磷酸鹽緩沖液溶解[15]。取上述酶液2mL,以0.5mL/min的流速進(jìn)行Sephadex G-75凝膠層析,分部收集洗脫液,每管收集4 mL,在280 nm下測定各管OD值,并測定各部分活性[16]。
1.2.6 丁醇脫氫酶的SDS-PAGE分析 將經(jīng)過硫酸銨沉淀及Sephadex G-75凝膠層析后具有酶活的酶液進(jìn)行SDS-PAGE電泳檢測[17-18]。
丁醇脫氫酶純化結(jié)果如表1所示。結(jié)果表明經(jīng)過2次硫酸銨沉淀,硫酸銨飽和度為60%,可除去部分非蛋白質(zhì)雜質(zhì),酶比活力由20.21 U/mg提高到33.14 U/mg,純化倍數(shù)為1.64。再經(jīng)過Sephadex G-75凝膠層析進(jìn)一步純化,通過分子篩作用酶比活力提高到256.7 U/mg,純化倍數(shù)為12.7。
表1 丙酮丁醇梭菌中丁醇脫氫酶的純化
將收集到的洗脫液分別測定280 nm下的蛋白濃度和具有蛋白峰管數(shù)的酶活,其結(jié)果如圖1。結(jié)果表明蛋白濃度在第12,16和23管分別出現(xiàn)三個峰,其中第16管峰值最大,而具有丁醇脫氫酶活性的出現(xiàn)在第18~20管,將其冷凍干燥保存?zhèn)溆茫鳛殡娪捐b定分析。
圖1 Sephadex G-75凝膠層析曲線圖
將每步純化收集的具有酶活的組分進(jìn)行SDSPAGE,結(jié)果見圖2。在42.0 kDa附近出現(xiàn)了一條帶,與報道的目的蛋白結(jié)果相符。
圖2 SDS-PAGE電泳分析丁醇脫氫酶
2.4.1 粗酶液中丁醇脫氫酶的穩(wěn)定性 按照1.2.3方法在有氧狀態(tài)下每24 h測定粗酶液中丁醇脫氫酶的活力,觀察保存于4℃下丁醇脫氫酶的穩(wěn)定性,結(jié)果如圖3。丁醇脫氫酶在10 d后其活力下降至初始活力的30%。
圖3 丁醇脫氫酶的穩(wěn)定性
2.4.2 丁醇脫氫酶的最適反應(yīng)溫度 按照1.2.3中的方法,分別取 20、25、30、35、40、45、50℃下測定其酶活,結(jié)果見圖4。由圖4可以看出在35℃下丁醇脫氫酶的活力達(dá)到最高值,其最適反應(yīng)溫度為35℃。
圖4 溫度對丁醇脫氫酶的影響
2.4.3 丁醇脫氫酶的最適反應(yīng)pH值 按照1.2.3中的方法,在35℃下,將緩沖液的pH值分別調(diào)制4.0、5.0、6.0、7.0、8.0、9.0、10.0 并測定其酶活,結(jié)果見圖5。由圖5可以看出丁醇脫氫酶在pH為6.0的時候達(dá)到最高值,但是酶受pH的影響并不顯著。
圖5 pH值對丁醇脫氫酶的影響
本實驗從丙酮丁醇梭菌中分離純化了依賴NADH的丁醇脫氫酶,經(jīng)過硫酸銨沉淀和Sephadex G-75凝膠層析,酶比活力達(dá)到256.7 U/mg,純化倍數(shù)為12.7,回收率為28.9%,丁醇脫氫酶在有氧狀態(tài)下保存10 d酶活力為初始酶活的30%,其最適反應(yīng)溫度是35℃,最適反應(yīng)pH是6.0。由于細(xì)胞內(nèi)有關(guān)丁醇代謝途徑的關(guān)鍵酶含量不高,且易氧化失活,胞外反應(yīng)體系構(gòu)建中其它酶和天然底物與NADH存在耦聯(lián)反應(yīng),給酶活測定造成一定的難度。本文將丁醇脫氫酶酶活測定方法進(jìn)行適當(dāng)改良從而避免其它酶和天然底物對實驗結(jié)果所帶來的影響。
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