《旅行者》(短篇小說,1989)
《藤纏樹》(長(zhǎng)篇小說,2002)
《一個(gè)青年小說家的誕生》(長(zhǎng)篇小說,2004)
《沉尸、流亡、二·二八》(1991)
《幌馬車之歌》(1991)
《尋訪被湮滅的臺(tái)灣史與臺(tái)灣人》(1994)
《人間正道是滄?!罚?999)
《共產(chǎn)青年李登輝》(2000)
《天未亮——追憶一九四九年四·六事件(師院部分)》(2000)
《麥浪歌詠隊(duì)——追憶一九四九年四·六事件(臺(tái)大部分)》(2001)
《臺(tái)灣好女人》(2001)
《消失在歷史迷霧中的作家身影》(2001)
《紅色客家人》(2003)、《紅色客家莊》(2004)
《消失的臺(tái)灣醫(yī)界良心》(2005)
《二·二八野百合》(2006)
《青春戰(zhàn)斗曲》(2006)
《消失在二·二八迷霧中的王添燈》(2008)
《戰(zhàn)風(fēng)車——一個(gè)作家的參選記事》(2009)
《老紅帽》(2010)
《尋找祖國(guó)三千里》(2010)
《你是什么派》(2011)
《日據(jù)時(shí)期臺(tái)灣學(xué)生運(yùn)動(dòng),1913——1945》(1993)
《白色恐怖》(1993)
《高雄縣二·二八暨50年代白色恐怖民眾史》(1997)
《50年代白色恐怖臺(tái)北地區(qū)案件調(diào)查與研究》(1998)
《我們?yōu)槭裁床桓璩罚?0年代白色恐怖紀(jì)錄電影,侯孝賢電影社,1995)
《臺(tái)灣思想起》40集(50年代白色恐怖紀(jì)錄電視,T.V.B.S,1997)
《好男好女》(侯孝賢導(dǎo)演,1994)
《悲情城市》(侯孝賢導(dǎo)演)