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中國(guó)龜類動(dòng)物遺傳多樣性的研究進(jìn)展

2012-04-29 00:44:03賀剛何力程碧軍方春林楊雪海喻亞麗李彩剛
湖北農(nóng)業(yè)科學(xué) 2012年18期
關(guān)鍵詞:烏龜遺傳群體

賀剛 何力 程碧軍 方春林 楊雪海 喻亞麗 李彩剛

摘要:龜類動(dòng)物是中國(guó)水產(chǎn)養(yǎng)殖業(yè)的重要組成部分。對(duì)中國(guó)龜類動(dòng)物的種類進(jìn)行了概述,結(jié)合目前的研究成果,從遺傳多樣性的個(gè)體、細(xì)胞、分子水平上進(jìn)行了全面介紹。

關(guān)鍵詞:龜;種類;遺傳多樣性

中圖分類號(hào):S917文獻(xiàn)標(biāo)識(shí)碼:A文章編號(hào):0439-8114(2012)18-3937-04

Research Progress on the Genetic Diversity of the Turtle in China

HE Gang1,2,HE Li1,CHENG Bi-jun3a,FANG Chun-lin2,YANG Xue-hai3b,YU Ya-li4,LI Cai-gang2

(1. Fishery Resources and Environment Key Field Station of Upper-middle Reaches of the Yangtze River, Ministry of Agriculture / Yangtze River Fisheries Research Institute, Chinese Academy of Fishery Sciences, Wuhan 430223, China; 2. Fisheries Research Institute of Jiangxi Province, Nanchang 330039, China; 3. Huibei Academy of Agricultural Sciences, a. Institute of Agricultural Quality Standards and Testing Technology Research; b. Institute of Animal Husbandry and Veterinary Sciences, Wuhan 430064,China; 4.Fisheries Colleges, Huazhong Agriculture University, Wuhan 430070,China)

Abstract:The turtles are the important ingredients of aquaculture in China. A scientific clarification about the species of the turtle in China and a detailed introduction about the study of turtle genetics at the levels of individual, cell and molecule according to the last research results.

Key words: turtle; species; genetic diversity

目前,中國(guó)龜鱉動(dòng)物現(xiàn)存1目6科21屬41種[1]。平胸龜科(Platysternidae)和棱皮龜科(Dermochelyidae)均是單科單屬單種,在中國(guó)均有分布;海龜科(Cheloniidae)5屬7種,中國(guó)現(xiàn)存4屬4種,平胸龜(Platysternon megacephalum)和海產(chǎn)龜類物種豐富度最大,是研究平胸龜和海產(chǎn)龜類生物多樣性不可多得的好材料;淡水龜科(Bataguridae)25屬68種,中國(guó)現(xiàn)存8屬25種;鱉科(Trionychidae)14屬26種,中國(guó)有4屬7種,對(duì)研究和保護(hù)淡水龜科及鱉科都具有十分重要的意義;陸龜科(Testudinidae)11屬45種,中國(guó)僅存3屬3種,占世界陸龜種類的不足8%[2]。遺傳多樣性(Genetics diversity)又稱為基因多樣性,是生物多樣性的重要組成部分。廣義遺傳多樣性是指種內(nèi)或種間表現(xiàn)在分子、細(xì)胞、個(gè)體3個(gè)水平的遺傳變異程度,即具體表現(xiàn)在種內(nèi)或種間外部形態(tài)特征、核型特征、基因表達(dá)產(chǎn)物以及DNA分子水平的多態(tài)性;狹義上則主要指種內(nèi)不同群體和個(gè)體間的遺傳多態(tài)性程度。不同物種遺傳多樣性的豐富程度存在很大差異;同一物種又由許多群體或無數(shù)個(gè)體組成,它們之間的遺傳多樣性也存在很大差異。本文從外部形態(tài)、核型特征、基因表達(dá)產(chǎn)物及DNA分子水平等4個(gè)方面對(duì)龜類動(dòng)物的遺傳多樣性研究作一個(gè)較為全面的介紹。

1龜類動(dòng)物遺傳多樣性的研究現(xiàn)狀

1.1外部形態(tài)(數(shù)量遺傳學(xué))

形態(tài)學(xué)方法是基于不同形態(tài)學(xué)特征,通過形態(tài)測(cè)量構(gòu)建判別方程來鑒定種質(zhì)的一種方法[2]。研究方法常包括形態(tài)性狀、年齡與生長(zhǎng)、繁殖性能等方面。在形態(tài)性狀上常常使用傳統(tǒng)形態(tài)測(cè)量方法和框架分析方法[3,4]。傳統(tǒng)形態(tài)測(cè)量方法是通過對(duì)魚類個(gè)體的可數(shù)性狀(如鰭條、鰓耙等)和可量性狀(如體重、體長(zhǎng)、懷卵量和性成熟年齡等)的測(cè)定,然后進(jìn)行分析和判別。框架分析是通過對(duì)魚體外形輪廓若干坐標(biāo)之間間距的測(cè)定,采用多元分析來描述魚類的外部輪廓特征的一種方法。這些都是屬于數(shù)量性狀,一般來說,它們?cè)谝粋€(gè)種群內(nèi)的變異呈正態(tài)分布。該方法為傳統(tǒng)方法,由于簡(jiǎn)單直觀、容易觀察記載,長(zhǎng)期以來,物種的分類、資源鑒定、生物起源和進(jìn)化研究都是以形態(tài)標(biāo)記為主要的基本指標(biāo)。

國(guó)內(nèi)對(duì)龜類動(dòng)物這方面的研究做出了一些工作,主要是采用傳統(tǒng)測(cè)量法。在年齡與生長(zhǎng)方面,朱新平等[5]對(duì)黃喉擬水龜、三線閉殼龜和鱷龜?shù)纳L(zhǎng)研究表明,3種龜?shù)谋臣组L(zhǎng)與背甲寬、背甲長(zhǎng)與體重、背甲寬與體重均呈正相關(guān);李貴生等[6]和周貴潭[7]研究發(fā)現(xiàn)I齡黃喉擬水龜稚龜生長(zhǎng)要快于烏龜;劉毅輝等[8]在自然和人工飼養(yǎng)條件下,認(rèn)為烏龜?shù)纳L(zhǎng)方程為w=10.19e1.176 4(r=0.981 9),不同年齡段的烏龜其生長(zhǎng)速度不同;黃斌[9]研究表明,黃緣閉殼龜?shù)捏w重與背甲長(zhǎng)、背甲寬,背甲寬與腹甲寬存在比較顯著的線性關(guān)系,黑頸烏龜(Chinemys nigricans)[10]、平胸龜(Platystenon megacephalum)[11]、三線閉殼龜[11]和鱷龜(Chlydre serpentine)[7]等也有類似的特征。在繁殖性能上,研究龜類動(dòng)物的性腺發(fā)育對(duì)于掌握龜類人工繁殖及其在生產(chǎn)上應(yīng)用有著重要意義。趙偉華等[12]研究發(fā)現(xiàn),在繁殖季節(jié)中,以大型個(gè)體母本作為繁殖親本,可獲得數(shù)量更多、質(zhì)量更好的后代。有關(guān)龜?shù)姆敝成飳W(xué)研究較少,如黃緣盒龜(Cistolemmys flavomarginata)[13]、黃喉擬水龜(Mauremys mutica)[14]。近年來,雜交龜品種日益增加,但其相關(guān)研究報(bào)道中,僅見金石雜交龜[15]、烏花雜交龜[16]與其親本的形態(tài)特征比較。

1.2核型特征(細(xì)胞遺傳學(xué))

魚類染色體研究始于20世紀(jì)60年代,先后有學(xué)者用壓片法、胚胎細(xì)胞-低滲-空氣干燥法、外周血淋巴細(xì)胞(或腎細(xì)胞)體外培養(yǎng)-低滲-空氣干燥法、腎細(xì)胞PHA活體注射-空氣干燥法(或火焰干燥法)等多種方法相繼用于魚類染色體標(biāo)本制備,使魚類染色體的研究工作得到迅速發(fā)展,同時(shí)各種顯帶技術(shù)C帶、Ag-NORs、Q帶、G帶和RE帶應(yīng)用到魚類染色體研究中[17]。

對(duì)龜類染色體的研究,雖然近年來發(fā)展很快,但大多數(shù)工作仍偏重于常規(guī)的核型分析。與魚類研究相比,龜類動(dòng)物研究滯后。染色體組型特征是一種分類性狀。迄今為止,已報(bào)道過核型的約34種[18,19],其中近70%為2n=52,模式為9m+5st+12t。有關(guān)學(xué)者認(rèn)為該模式屬于龜科核型的原始類型[20],如烏龜(Chinemys reevesii)[21]、四爪陸龜(Testudo horsfieldi Gray)[22]、中華花龜(Ocadia sinensis)[23]、凹甲陸龜[Testudo impressa(Guenther)][24]、四眼斑水龜[Sacalia quadriocellata (Siebenrock)]和黃喉擬水龜[Mauremys mutica(Cantor)][25]等。中國(guó)龜類染色體及其組型研究的種類較少,相對(duì)魚類研究的步伐來說差距較大。有些目和科尚未涉及,部分龜科的染色體研究還是空白。對(duì)于龜類動(dòng)物染色體的精細(xì)結(jié)構(gòu)、基因組結(jié)構(gòu)和基因定位與表達(dá)調(diào)控有待深入。

1.3基因表達(dá)產(chǎn)物(生化遺傳學(xué))

自從20世紀(jì)60年代以來,綜合蛋白質(zhì)電泳分析法、組化染色法和生物統(tǒng)計(jì)學(xué)為一體的生化遺傳技術(shù),為分析蛋白質(zhì)與酶的遺傳差異,也為了解生物基因的變異水平,提供了一種有效的手段。中國(guó)在20世紀(jì)70年代中期開始這方面的研究。目前,同工酶和蛋白質(zhì)電泳分析技術(shù)已廣泛應(yīng)用于魚類的物種鑒定、親緣關(guān)系與系統(tǒng)分類、胚胎發(fā)育過程中的基因表達(dá)與調(diào)控研究以及群體遺傳結(jié)構(gòu)分析等理論和實(shí)際應(yīng)用[26,27]。

龜類動(dòng)物的同工酶的研究甚少,僅見安南龜(Ananmemy sannanmensis)[28]。彭婧等[28]對(duì)冬眠前安南龜酯酶同工酶的比較研究表明,安南龜同工酶酶譜的組織差異性顯著,其冬眠前后代謝過程和代謝水平不同。而在血液生化指標(biāo)方面,烏龜血清總蛋白測(cè)定值與中華鱉的相近[29]。

1.4DNA分子(分子遺傳學(xué))

隨著DNA重組、限制性內(nèi)切酶消化、分子雜交、DNA序列快速分析和PCR等一系列分子生物學(xué)技術(shù)的建立,使在DNA水平上檢測(cè)物種的遺傳多樣性成為可能[30]。目前,除了RAPD技術(shù)、擴(kuò)增片段長(zhǎng)度多態(tài)性(AFLP)、簡(jiǎn)單序列長(zhǎng)度多態(tài)性(SSSLP)、單鏈構(gòu)型多態(tài)性(SSSCP)、變性梯度凝膠電泳(DGGE)、DNA測(cè)序(DNA Sequence)外,還有 DNA 指紋分析(DFA)等分子檢測(cè)方法,上述各種檢測(cè)手段的研究對(duì)象不僅包括核 DNA,還可以是 RNA 和線粒體DNA(mt DNA),并由此產(chǎn)生多種新技術(shù)。目前,分子標(biāo)記在龜類種質(zhì)資源及遺傳研究上主要應(yīng)用在以下幾個(gè)方面。

1.4.1遺傳多樣性水平及遺傳變異的評(píng)價(jià)物種遺傳多樣性能反映出物種種群的生存狀態(tài),是屬于稀少物種,還是瀕危種類,以便于采用不同的人工繁殖、捕撈方案等,還能反映物種不同群體之間的基因交流行為。

朱新平等[31]采用RAPD技術(shù)對(duì)湖北烏龜群體遺傳多樣性分析結(jié)果表明,烏龜?shù)倪z傳多樣性水平較高,種內(nèi)遺傳差異較大。馬麗莎等[32]和于冬梅等[33]對(duì)廣東省平胸龜野外群體的遺傳多樣性分析研究表明,其遺傳多樣性仍較豐富,并沒有形成明顯的種群分化。朱學(xué)峰[34]對(duì)廣西中華草龜遺傳多樣性的RAPD分析發(fā)現(xiàn),平均遺傳距離指數(shù)為(0.209 2±0.062 3),認(rèn)為中華草龜遺傳多樣性較豐富,但個(gè)體間的親緣關(guān)系較近,遺傳變異程度較小。

1.4.2種間分化和系統(tǒng)進(jìn)化變異是生物進(jìn)化的基礎(chǔ),而變異首先是發(fā)生在DNA水平,只有累積到一定的程度才能夠表現(xiàn)為可識(shí)別的形態(tài)差異。早期生物進(jìn)化的研究主要利用形態(tài)學(xué)方法,但是形態(tài)學(xué)方法在很多種魚類的分類進(jìn)化地位上的準(zhǔn)確定位較為困難,而分子遺傳標(biāo)記的使用為系統(tǒng)進(jìn)化研究提供了非常有用的證據(jù)。

顏亮等[35]分析了大鱷龜、小鱷龜和平胸龜?shù)模恚簦模危?CR區(qū)序列,發(fā)現(xiàn)這3種龜該區(qū)終止序列區(qū)的長(zhǎng)度范圍為280~311 bp,差異明顯。該終止區(qū)的序列可以為物種的種群分化研究和資源保護(hù)研究提供基礎(chǔ)。萬全等[36]測(cè)定了15種龜類線粒體12SrRNA基因片段的序列,構(gòu)建了分析系統(tǒng)樹,結(jié)果顯示:7種閉殼龜種間差異在0~0.043,平均為0.022;淡水龜科屬間遺傳距離為0.007~0.140,平均為0.074;曲頸龜亞目9個(gè)科間遺傳距離為0.055~ 0.197,平均為0.139。由此認(rèn)為,淡水龜科與陸龜科親緣關(guān)系比龜科更近;不支持將閉殼龜屬拆分為閉殼龜屬和盒龜屬;支持將平胸龜屬歸為鱷龜科的1個(gè)屬。

1.4.3自然群體和人工養(yǎng)殖群體的遺傳差異人工養(yǎng)殖群體和天然群體經(jīng)受的選擇壓力不同,其遺傳多樣性因此而有所不同。天然群體的遺傳多樣性明顯要高于養(yǎng)殖群體,而遺傳多樣性的下降,很有可能導(dǎo)致抗病能力和生長(zhǎng)速度等生產(chǎn)性狀的衰退。

劉至治等[37]對(duì)黃河鱉、淮河鱉、洞庭湖鱉、鄱陽湖鱉及太湖鱉等5個(gè)群體的RAPD分析結(jié)果表明,5個(gè)群體具有從黃河到淮河到長(zhǎng)江、從長(zhǎng)江的中游到下游逐步降低的遺傳漸變現(xiàn)象;聚類分析顯示,太湖鱉在基因組上與其他4個(gè)群體鱉存在明顯歧化。鄭光明等[38]比較了廣東、福建2個(gè)地理種群平胸龜?shù)倪z傳差異,結(jié)果表明,2個(gè)群體均具有較高的遺傳多樣性,且廣東種群的遺傳多樣性高于福建種群,均有較明顯的種群分化。

2展望

綜上所述,中國(guó)龜類種質(zhì)資源非常豐富,但遺傳多樣性面臨著嚴(yán)重威脅。特別是龜類繁殖場(chǎng)管理不善、養(yǎng)殖群體和引種移殖對(duì)野生種群的影響、過度捕撈、人工選擇、水利工程、圍湖造田、水質(zhì)嚴(yán)重污染、水生生物餌料消失等因素使龜類的生存空間不斷縮小,導(dǎo)致遺傳多樣性急劇下降。目前,龜類遺傳多樣性的認(rèn)識(shí)和研究尚存在許多薄弱環(huán)節(jié),研究的種類少、水平低。因此,進(jìn)一步評(píng)估中國(guó)龜類的遺傳多樣性,在進(jìn)行物種分類、系統(tǒng)分化及群體遺傳等研究時(shí),應(yīng)將遺傳多樣性結(jié)果與物種形態(tài)、生理特征、生存環(huán)境及地理分布等因素綜合考慮和分析,才能制定出科學(xué)合理的利用、保護(hù)和管理措施,有效保護(hù)中國(guó)龜類的生物多樣性。

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(責(zé)任編輯潘峰)

收稿日期:2012-01-04

基金項(xiàng)目:國(guó)家公益性行業(yè)(農(nóng)業(yè))科研專項(xiàng)(200903048,201003076);農(nóng)業(yè)部長(zhǎng)江中上游漁業(yè)資源環(huán)境重點(diǎn)野外科學(xué)觀測(cè)試驗(yàn)站開放課題資助

項(xiàng)目(YWTZ/1001)

作者簡(jiǎn)介:賀剛(1982-),男,湖北天門人,助理研究員,主要從事種質(zhì)資源與魚類分子生態(tài)學(xué)研究工作,(電話)15070865732(電子信箱)

xyz001619@163.com;通訊作者,何力,研究員,(電子信箱)heli28@sohu.com。

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烏龜遺傳群體
非遺傳承
通過自然感染獲得群體免疫有多可怕
還有什么會(huì)遺傳?
還有什么會(huì)遺傳
還有什么會(huì)遺傳?
烏龜胖胖
小烏龜
“群體失語”需要警惕——“為官不言”也是腐敗
烏龜
和烏龜賽跑
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