范海燕,李勝棉,張瑞星,楊 華,郭占軍*,高詠梅
(1.河北醫(yī)科大學第四醫(yī)院消化內科,河北石家莊 050011;2.河北北方學院附屬第一醫(yī)院消化內科,河北張家口 075000)
線粒體D-loop區(qū)單核苷酸多態(tài)性與食管鱗狀細胞癌患者發(fā)病年齡關系的研究
范海燕1,李勝棉1,張瑞星1,楊 華1,郭占軍1*,高詠梅2
(1.河北醫(yī)科大學第四醫(yī)院消化內科,河北石家莊 050011;2.河北北方學院附屬第一醫(yī)院消化內科,河北張家口 075000)
目的探討線粒體D-1oop區(qū)單核苷酸多態(tài)性與食管鱗狀細胞癌患者發(fā)病年齡關系。方法2003—2005年在河北醫(yī)科大學第四醫(yī)院完成食管鱗狀細胞癌患者線粒體D-1oop區(qū)測序55例,單核苷酸多態(tài)性與患者發(fā)病年齡的關系分析采用Kap1an-Meier法,組間比較使用Log-rank檢驗。結果經(jīng)Log-rank檢驗,單核苷酸多態(tài)位點16266C/T基因型與發(fā)病年齡有關,多態(tài)位點16266T基因型患者發(fā)病早于16266C基因型患者,差異有統(tǒng)計學意義(P<0.05)。結論線粒體DNA D-1oop區(qū)基因多態(tài)性位點可作為食管鱗狀細胞癌患者發(fā)病年齡的預測標記,同時線粒體D-1oop區(qū)多態(tài)性位點有助于識別早發(fā)的食管鱗狀細胞癌患者。
食管腫瘤;多態(tài)性,單核苷酸;線粒體
食管癌是人類常見的惡性腫瘤之一,年發(fā)病率>125/100 000[1]。食管癌的確切病因和發(fā)病機制至今尚未明確,到目前為止關于基因和腫瘤發(fā)病年齡關系的研究甚少[2-3]。人類線粒體基因組為環(huán)狀DNA分子,線粒體DNA處在活性氧自由基和其他自由基包圍之中,缺乏組蛋白保護,且其內缺乏完整的修復系統(tǒng),與核內基因相比,線粒體DNA很容易發(fā)生突變[4];近來研究發(fā)現(xiàn)在多種腫瘤中可見線粒體DNA存在廣泛變異,因此包括食管癌在內的多種腫瘤中線粒體(disp1acement 1oop,D-1oop)區(qū)已成為基因突變和多態(tài)性研究的熱點區(qū)域[5]。我們參照線粒體數(shù)據(jù)庫(www.mitomap.org)已經(jīng)完成食管鱗狀細胞癌患者線粒體D-1oop區(qū)域的測序,其中共發(fā)現(xiàn)了88個單核苷酸多態(tài)位點,并且已經(jīng)探討了單核苷酸多態(tài)位點與食管鱗狀細胞癌疾病預后的關系[6-7];本研究旨在探討線粒體D-1oop區(qū)單核苷酸多態(tài)性與食管鱗狀細胞癌患者發(fā)病年齡的關系。
1.1 臨床資料:2003—2005年河北醫(yī)科大學第四醫(yī)院胸外科住院食管鱗狀細胞癌患者55例,均來自中國河北食管癌高發(fā)病地區(qū),男性34例,女性21例,年齡39~76歲,平均(59.3±8.56)歲,其中≤40歲患者1例(男性1例),>40~50歲患者6例(男性5例,女性1例),>51~60歲患者29例(男性17例,女性12例),>60歲患者19例(男性11例,女性8例),患者術前未進行任何臨床治療。術前均空腹抽取外周靜脈血,外周血標本當天提取線粒體后置于-80℃恒溫冰箱保存,病理類型由2名資深病理專家確認。
1.2 研究方法:使用全血線粒體DNA萃取試劑盒迅速提取線粒體DNA,PCR擴增線粒體DNA的D-1oop 區(qū), 上 游 引 物 為 5’ -CCCCATGCTTACAAGCAAGT-3’,下游引物為5’-GCTTTGAGGAGGTAAGCTAC-3’,擴增的目的片段長度為982bp,PCR的具體參數(shù)參照PCR預混試劑盒說明,將PCR產(chǎn)物純化測序,測序使用美國ABI PRISM 3100 DNA序列分析儀,同一標本采用雙向重復測序,隨后檢測血標本線粒體D-1oop區(qū)單核苷酸多態(tài)性。
1.3 統(tǒng)計學方法:應用SPSS11.5軟件分析數(shù)據(jù),每個單核苷酸多態(tài)位點與發(fā)病年齡之間的關系分析使用Kap1an-Meier法,組間比較采用Log-rank檢驗。P<0.05為差異有統(tǒng)計學意義。
本研究將單核苷酸多態(tài)性最小等位基因頻率<5%的位點剔除,共得到16個單核苷酸多態(tài)位點進一步分析?;诿總€單核苷酸位點基因型的不同將食管鱗狀細胞癌患者分為16266T基因型和16266C基因型2組。采用 Kap1an-Meier法,通過 1ogrank檢驗發(fā)現(xiàn)多態(tài)位點16266與食管鱗狀細胞癌患者的發(fā)病年齡之間有關(圖1),多態(tài)位點16266T基因型患者發(fā)病早于16266C基因型患者,差異有統(tǒng)計學意義(P<0.05)。
圖1 16266位點與食管鱗狀細胞癌患者發(fā)病年齡之間的關系Figure 1 Comparison of age onset of ESCC patients by 16266 genotype in the D-1oop
以往研究發(fā)現(xiàn)在本實驗中的線粒體D-1oop區(qū)單核苷酸多態(tài)位點在多種腫瘤中與致癌風險和疾病預后有關[8],而本研究進一步發(fā)現(xiàn)線粒體D-1oop區(qū)一段連續(xù)的序列(16190~16583位點)中的單核苷酸多態(tài)性與食管鱗狀細胞癌患者發(fā)病年齡有關(P<0.05)。
我們已經(jīng)在消化道腫瘤對線粒體D-1oop區(qū)單核苷酸多態(tài)性進行了詳細研究[8],本研究首次發(fā)現(xiàn)線粒體D-1oop區(qū)單核苷酸多態(tài)性不只作為致癌風險因素和疾病預后的預測指標,而且對食管鱗狀細胞癌患者來說也是發(fā)病年齡早晚的一個預測指標,單核苷酸多態(tài)位點16266在線粒體基因組中位于MT-5基因和MT3L基因之間,盡管以往我們通過病例對照研究發(fā)現(xiàn)其與肝癌患者致癌風險有關[8],但到目前為止其具體的功能尚不明了,最小等位基因16266T基因型與食管鱗狀細胞癌患者早發(fā)病有關,本研究結果顯示,16266T基因型患者發(fā)病年齡曲線迅速下降,患者發(fā)病年齡較早。但仍需大量樣本繼續(xù)研究該多態(tài)位點與食管鱗狀細胞癌患者發(fā)病年齡的關系。
線粒體D-1oop區(qū)在線粒體基因復制和表達過程中起著重要作用,這個區(qū)域內的基因突變有可能影響線粒體DNA復制并導致氧化呼吸鏈的改變,活性氧自由基大量釋放進而損傷細胞核基因組,并最終促使腫瘤的發(fā)生和發(fā)展[9-10]。本研究發(fā)現(xiàn)的單核苷酸多態(tài)位點16266有可能使線粒體基因組轉錄發(fā)生改變,基因組轉錄的改變導致了大量活性氧自由基的產(chǎn)生,這些氧自由基調節(jié)機制異??赡艽龠M了腫瘤的發(fā)生。
總之,本研究發(fā)現(xiàn)線粒體D-1oop區(qū)單核苷酸多態(tài)性可作為食管鱗狀細胞癌患者發(fā)病早晚的預測指標,線粒體D-1oop區(qū)單核苷酸多態(tài)性研究有助于早期對食管鱗狀細胞癌患者發(fā)病年齡早晚進行分組,進而確定患者的治療方案。
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(本文編輯:劉斯靜)
SINGLE NUCLEOTIDE POLYMORPHISMS IN THE MITOCHONDRIAL DISPLACEMENT LOOP AND AGE-AT-ONSET OF ESOPHAGEAL SQUAMOUS CELL CARCINOMA
FAN Haiyan1,LI Shengmian1,ZHANG Ruixing1,YANG Hua1,GUO Zhanjun1*,GAO Yongmei2
(1.Department of Gastroenterologt and Hepatologt,the Fourth Hospital of Hebei Medical Universitt,Shijiazhuang 050011,China;2.Department of Gastroenterologt and Hepatologt,the First Attached Hospital of Hebei Northern Institute,Hebei Province,Zhangjiakou 75000,China)
ObjectiveTo investigate the association of age-at-onset of esophagea1 squamous ce11 carcinnoma(ESCC)patients and sing1e nuc1eotide po1ymorpyisms(SNPs)in mitochondria1 D-1oop.MethodsThe D-1oop region of mtDNA was sequenced in 55 ESCC patients recorded in the Fourth Hospita1 of Hebei Medica1 University between 2003 to 2005.The age-at-onset curve was ca1cu1ated with the Kap1an-Meier method and compared by the Log-rank test at each SNP site.ResultsThe SNP sites of nuc1eotides 16266 C/T were corre1ated with age-at-onset by the Log-rank test. The onset age of patients with 16266T genotype was significant1y younger than that of patients with 16266C at the 16266 site(P<0.05).ConclusionGenetic po1ymorphisms in the D-1oop are predictive markers for age-at-onset in ESCC patients.According1y,the ana1ysis of genetic po1ymorphisms in the mitochondria1 D-1oop can he1p to identify ESCC patient subgroups at high risk of ear1y onset.
po1ymorphisms,sing1e nuc1eotide;esophagea1 neop1asms;mitochondria1
R735.1
A
1007-3205(2012)04-0391-03
2011-12-20;
2012-03-29
范海燕(1978-),女,河北石家莊人,河北醫(yī)科大學第四醫(yī)院主治醫(yī)師,醫(yī)學碩士,從事消化系統(tǒng)疾病診治研究。
*通訊作者。E-mai1:zjguo5886@yahoo.com.cn
10.3969/j.issn.1007-3205.2012.04.007