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前列腺六次跨膜蛋白-2基因多態(tài)性與新疆維吾爾族人糖尿病的相關(guān)性

2012-08-09 03:47:56韓瑞梅李南方嚴(yán)治濤郭艷英張菊紅王紅梅
關(guān)鍵詞:維吾爾族基因型變異

韓瑞梅,李南方,嚴(yán)治濤,郭艷英,張菊紅,王紅梅,洪 靜,周 玲

1新疆醫(yī)科大學(xué) 研究生院,烏魯木齊 830054

2新疆維吾爾自治區(qū)人民醫(yī)院高血壓診療研究中心 新疆高血壓診療研究中心,烏魯木齊 830000

前列腺六次跨膜蛋白-2(six transmembrance protein of prostate 2,STAMP2)(又稱為腫瘤壞死因子誘導(dǎo)的脂肪相關(guān)蛋白或者前列腺六次跨膜上皮抗原-4)屬于前列腺六次跨膜上皮抗原家族成員之一[1],在內(nèi)臟脂肪組織高度表達,存在于脂肪細胞的跨膜蛋白,在脂肪形成重塑時其以劑量-時間依賴模式被腫瘤壞死因子-α 誘導(dǎo)[2]。Wellen 等[3]發(fā)現(xiàn)在維持脂肪細胞功能和全身代謝過程中,STAMP2聯(lián)系著炎癥和飲食因素,STAMP2的表達對于胰島素信號通路是必需的。STAMP2基因敲除鼠在正常飲食條件下,自發(fā)的發(fā)生代謝性疾病,表現(xiàn)為葡萄糖耐量降低、脂質(zhì)異常、脂肪肝和炎癥與氧化應(yīng)激,STAMP2基因隨脂肪細胞分化成熟表達逐漸下調(diào),可促進脂肪細胞的分化成熟和脂質(zhì)積聚,與肥胖和胰島素抵抗的發(fā)生有關(guān)。Arner等[4]報道人脂肪組織中STAMP2的表達與胰島素抵抗和肥胖有關(guān)。因此,從功能上可以說STAMP2基因是2型糖尿病的候選基因。目前,關(guān)于STAMP2基因多態(tài)性與維吾爾族糖尿病的關(guān)聯(lián)研究報道較少,因此,本研究通過測序法篩查STAMP2基因變異位點,在確定基因代表性變異位點的基礎(chǔ)上,應(yīng)用TaqMan-PCR技術(shù)在維吾爾族自然人群中進行基因分型,分析其與維吾爾族糖尿病的相關(guān)性,從遺傳學(xué)角度探討糖尿病和胰島素抵抗的易感機制,以期為今后糖尿病的防治奠定一定的遺傳學(xué)基礎(chǔ)。

對象和方法

對象 1838例來自2007年1至2月新疆和田地區(qū)維吾爾族人肥胖、高血壓、糖尿病、血脂紊亂的橫斷面調(diào)查研究人群[5],其中男性694例、女性1144例,年齡 (51.2±10.7)歲。所有受試者均生活在相對隔離地區(qū),3代無異族通婚及近親結(jié)婚。根據(jù)1999年中華醫(yī)學(xué)會糖尿病學(xué)會制訂的2型糖尿病診斷標(biāo)準(zhǔn)建議,將研究對象分為2組,糖尿病組:274例,男性114例、女性160例,空腹血糖≥7.0 mmol/L或隨機血糖≥11.0 mmol/L或既往已經(jīng)診斷為糖尿病的患者;對照組:1564例,男性580例、女性984例,空腹血糖≤5.6 mmol/L且隨機血糖或餐后2 h血糖≤7.8 mmol/L的個體為對照。同時排除正在服用降糖或影響血糖水平藥物的病例,以及繼發(fā)性高血壓、惡性腫瘤、服用避孕藥者、肝腎疾病及甲狀腺疾病者,以上兩組資料性別比例匹配。本研究經(jīng)新疆維吾爾自治區(qū)人民醫(yī)院倫理委員會批準(zhǔn),研究對象均取得知情同意。

方法 體格檢查及生化檢測測定身高、體重、腹圍、血壓等。在受試者知情并同意的情況下,空腹自肘靜脈抽取靜脈血10 ml,離心處理,-70℃保存。葡萄糖氧化酶法測定空腹血糖 (fasting blood glucose,F(xiàn)BG),放射免疫法測定空腹血胰島素 (fasting insulin,F(xiàn)INS),穩(wěn)態(tài)模型評估法 (homeostasis model of assessment,HOMA)計算胰島素抵抗 (insulin resistance,IR)指數(shù) (HOMA-IR=FBG×FINS/22.5),β細胞功能指數(shù) (HOMA-B)以HOMA-B=20×FINS/(FBG-3.5)評估。

基因組DNA提取 所有被調(diào)查者留取血細胞5 ml,應(yīng)用試劑盒 (PAXgene blood DNA kit,A QIAGEN/BD Company)提取人血白細胞DNA,使用分光光度儀(貝克曼公司,美國)測定DNA濃度及純度,DNA溶于緩沖溶液-80℃凍存?zhèn)溆谩?/p>

STAMP2基因篩查及代表性位點的基因型鑒定 選取48例 (男性24例、女性24例)無親緣關(guān)系的維吾爾族糖尿病患者樣本,對STAMP2基因的所有外顯子、外顯子-內(nèi)含子交界區(qū)、5’和3’非編碼區(qū)~1kb序列進行PCR擴增及測序分析 (BigDye3.1測序試劑,加利福尼亞,美國),以NT_007933.14為參考核酸序列。從測序發(fā)現(xiàn)的變異中,考慮可能的功能 (錯義突變)和連鎖不平衡關(guān)系 (r2>0.8)后選擇最小等位基因頻率 (minor allele frequency,MAF)>5%的常見變異位點和低頻率的錯義突變,應(yīng)用TaqMan-PCR(ABI PRISM 7900HT,UK)技術(shù)在大樣本自然人群中進行基因型鑒定。引物及探針由美國ABI公司設(shè)計并合成。PCR反應(yīng)體系:Master Mix 2.25 μl,引物 0.125 μl,DAN 1.0 μl,加去離子水至5 μl。PCR反應(yīng)條件:95℃預(yù)變性10 min,43個循環(huán) (95℃變性15 s,60℃退火1 min,72℃延伸1 min),最后72℃延伸7 min。

統(tǒng)計學(xué)處理 采用SPSS 16.0軟件包進行統(tǒng)計學(xué)分析,定量資料根據(jù)是否正態(tài)分布用均數(shù)±標(biāo)準(zhǔn)差或中位數(shù)及均數(shù)的95%可信區(qū)間表示,組間一般資料的比較采用t檢驗及χ2檢驗;組間基因型頻率分布采用χ2檢驗。Hardy-Weinberg平衡檢驗及連鎖不平衡用SNPAlyze 7.0專業(yè)版 (DYNACOM Co.Ltd.,Mobara,Japan)軟件完成;采用多元線性回歸控制年齡、性別、吸煙和飲酒影響后比較不同基因型間血糖水平、胰島素、HOMA指數(shù)等指標(biāo)。P<0.05為差異具有統(tǒng)計學(xué)意義。

結(jié) 果

臨床資料比較 糖尿病組和對照組年齡、體重指數(shù)、腹圍、血壓及飲酒差異具有統(tǒng)計學(xué)意義 (P<0.05),但性別比例和吸煙差異無統(tǒng)計學(xué)意義 (P>0.05)(表1)。

STAMP2基因功能區(qū)測序結(jié)果 48例維吾爾族糖尿病患者中STAMP2基因功能區(qū)測序共發(fā)現(xiàn)16個變異位點,內(nèi)含子區(qū)7個,外顯子區(qū)3個,3'非翻譯區(qū)6個 (表2)。6個單核苷酸多態(tài)性在NCBI的SNP數(shù)據(jù)庫中已有記錄,10個變異位點為此次研究新發(fā)現(xiàn)。在最小等位基因頻率>5%的8個常見變異中,根據(jù)連鎖不平衡關(guān)系 (r2>0.8)選取7414G/A(rs8122)、224A/G(rs1981529、Gly75Asp)、364G/A(rs34741656、Ala122Thr)和6031T/G(新發(fā)現(xiàn))作為代表性變異位點,其中6031T/G(新發(fā)現(xiàn))分型失敗。

STAMP2基因代表性變異基因型頻率的分布STAMP2基因的3個變異位點在各組的基因型分布符合Hardy-Weinberg平衡定律 (P>0.05)。在總?cè)巳褐?,rs8122位點基因型頻率在對照組與糖尿病組間的差異具有統(tǒng)計學(xué)意義 (P=0.05),而在總體及按性別分層中,rs1981529和rs34741656位點基因型分布頻率的差異無統(tǒng)計學(xué)意義 (P>0.05)(表3)。

STAMP2基因rs8122變異不同基因型組間糖尿病表型資料 在總?cè)巳褐胁煌蛐徒M間空腹胰島素及在女性不同基因型組間HOMA指數(shù)差異具有統(tǒng)計學(xué)意義 (P<0.05),但在校正P值后差異無統(tǒng)計學(xué)意義 (P>0.05)。在男性人群中,STAMP2基因rs8122變異不同基因型組間各項指標(biāo)差異無統(tǒng)計學(xué)意義 (P>0.05)(表4)。

STAMP2基因多態(tài)位點單體型分析 3個常見變異位點rs8122、rs1981529和rs34741656共構(gòu)建了6個單體型,其中頻率>9%的4個常見單體型解釋了糖尿病組所有單體型99.57%的作用,兩組間各單體型構(gòu)成比的差異無統(tǒng)計學(xué)意義 (P=0.216)(表5)。

表1 臨床資料在對照組和T2DM組間的比較Table 1 Basic characteristics of subjects in T2DM group and control group

表2 48例維吾爾族糖尿病患者STAMP2基因功能區(qū)測序結(jié)果Table 2 Identified polymorphisms of the STAMP2 gene in 48 Uygur subjects with T2DM

表3 STAMP2基因rs1981529、rs34741656、rs8122變異在T2DM組和對照組中的基因型頻率分布(%)Table 3 Genotype distributions of rs1981529,rs34741656,and rs8122 polymorphism in T2DM group and control group(%)

討 論

STAMP2是一種腫瘤壞死因子-α誘導(dǎo)的脂肪組織相關(guān)蛋白,受多種細胞因子調(diào)節(jié)[6-8],與代謝性疾病密切相關(guān)[3]。前列腺六次跨膜上皮抗原-4基因敲除動物內(nèi)臟脂肪組織中炎癥因子表達明顯增高,機體表現(xiàn)出明顯的炎癥反應(yīng)和氧化應(yīng)激改變,進一步導(dǎo)致胰島素抵抗、葡萄糖代謝障礙等一系列代謝障礙[3]。為此,本研究觀察了STAMP2基因變異與糖尿病的關(guān)系,以探討糖尿病、胰島素抵抗的發(fā)病機制。

本研究共篩查出16個STAMP2基因的變異位點,其中10個位點首次發(fā)現(xiàn),一定程度上證實了STAMP2基因種族特異性,不同民族具有特異的突變位點。本研究選擇3個代表性SNP在研究人群中進行基因型鑒定并進行病例-對照關(guān)聯(lián)研究,在總?cè)巳褐?,rs8122位點基因型頻率在對照組與糖尿病組間的差異為“臨界”,為進一步探討rs8122變異與糖尿病的關(guān)系,比較了rs8122變異不同基因型組間糖尿病的相關(guān)表型資料 (空腹血糖、2h血糖、空腹胰島素、HOMA指數(shù)、HOMA-B),發(fā)現(xiàn)在總?cè)巳褐胁煌蛐徒M間空腹胰島素及在女性不同基因型組間HOMA指數(shù)差異具有統(tǒng)計學(xué)意義,但在校正P值后差異無統(tǒng)計學(xué)意義。通過不同角度、不同層面的分析,反映了STAMP2基因rs8122、rs1981529和rs34741656變異與維吾爾族糖尿病不相關(guān)。

表4 糖尿病相關(guān)數(shù)量性狀在STAMP2基因rs8122不同基因型間的比較Table 4 Comparison of diabetes quantitative phenotypes among rs8122 genotypes of STAMP2 polymorphisms in Uygur population

表5 T2DM組和對照組STAMP2基因單體型頻率比較Table 5 Comparison of haplotype frequency of STAMP2 polymorphism between T2DM group and control group

本研究首次在小樣本新疆維吾爾糖尿病人群中篩查STAMP2基因功能區(qū)的所有變異位點,選擇代表性變異位點在大樣本人群中進行基因型鑒定而開展的病例-對照研究。本研究采用這種研究策略主要基于以下幾點:(1)研究人群為新疆維吾爾族,為糖尿病高發(fā)民族,而NCBI數(shù)據(jù)庫中無維吾爾族相關(guān)遺傳信息,如果按照數(shù)據(jù)庫中其他民族的信息選取SNP,必定會存在誤差,同時會錯失該民族某些特異性位點的發(fā)現(xiàn),以便發(fā)現(xiàn)該民族特異性、新的變異位點。(2)小樣本篩查變異,大樣本驗證的關(guān)聯(lián)研究,相對于大樣本測序研究可以大大節(jié)省研究費用。選取新疆維吾爾族人群中開展此項研究主要是由于:(1)既往的流行病學(xué)調(diào)查顯示,新疆維吾爾族是代謝性疾病的高發(fā)民族,明顯高于同地區(qū)的其他民族[5,9-10],同時有研究報道該民族胰島素抵抗的發(fā)病率非常高[11];(2)由于文化、宗教、地域、經(jīng)濟等原因,本研究選擇的和田地區(qū)維吾爾族仍保留有大量相對完整的隔離遺傳體系,并且人口相對穩(wěn)定,是遺傳研究寶貴的資源。本研究在小樣本糖尿病人群中共篩查發(fā)現(xiàn)16個變異位點,其中6個SNPs在NCBI的SNP數(shù)據(jù)庫中已有記錄,10個變異位點為此次研究新發(fā)現(xiàn),為該民族在STAMP2基因遺傳數(shù)據(jù)庫提供了更多信息。

本研究尚存在局限性,即未在相同民族的正常人群中進行基因測序分析,且本研究的樣本量仍不足以顯著區(qū)分中度效應(yīng)的STAMP2基因多態(tài)位點,因此應(yīng)該進一步在其他人群或更大樣本量中重復(fù)驗證該研究結(jié)果?;蚪M掃描連鎖分析顯示,7號染色體長臂是2型糖尿病、胰島素抵抗等的易感區(qū)[12-14],因此,有必要擴展STAMP2基因區(qū)域進一步研究基因多態(tài)性與糖尿病、胰島素抵抗的關(guān)系。

綜上,本研究通過對STAMP2基因功能區(qū)測序篩選維吾爾族糖尿病患者特異的變異位點進行人群關(guān)聯(lián)研究分析,報道了STAMP2基因rs8122、rs1981529及rs34741656位點多態(tài)性與新疆維吾爾族糖尿病之間的關(guān)聯(lián)研究,研究未顯示STAMP2多態(tài)性與新疆維吾爾族糖尿病相關(guān),但結(jié)果尚待進一步在大樣本、不同種族人群中進行驗證。

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