第四軍醫(yī)大學(xué)西京醫(yī)院整形科(西安710032) 張冠華 易成剛 馬戈甲 楊 力
基質(zhì)金屬蛋白酶9(Matrix metalloproteinase 9,Mmp9)是92 k Da IV型膠原酶的糖化形式,其底物是變性的間質(zhì)膠原、V型膠原和IV型膠原。它通過切割包括彈性蛋白、纖維連接蛋白和層粘連蛋白在內(nèi)的非膠原細(xì)胞外基質(zhì)來破壞血管結(jié)構(gòu),為腫瘤侵襲性生長、復(fù)發(fā)及轉(zhuǎn)移提供條件[1]。因此,日益引起學(xué)者重視。
RNA干擾 (RNA interf erence,RNAi)是內(nèi)源性基因或人工導(dǎo)入基因,是進(jìn)入細(xì)胞后與靶基因互補(bǔ)的小干擾雙鏈RNA(si RNA)序列引起轉(zhuǎn)錄后基因沉默的一種現(xiàn)象[2]。因其簡便易行并且具有特異性和高效性,已經(jīng)成為研究基因功能和基因表達(dá)調(diào)控的重要方法。本研究構(gòu)建靶向抑制小鼠Mmp9的si RNA干擾載體,并進(jìn)行慢病毒包裝制成慢病毒濃縮液,為血管化性疾病的防治研究提供理論依據(jù)及實驗室數(shù)據(jù)。
1 主要試劑和儀器 慢病毒載體系統(tǒng)由p SILRFP載體、p Hel per1.0載體和p Helper2.0載體三質(zhì)粒組成。大腸桿菌菌株DH5α感受態(tài)細(xì)胞。LB培養(yǎng)基(Sig ma,美國);PCR試劑盒(Takara,大連);ds DNA oligo(奧科生物,北京);質(zhì)粒小提試劑盒(Bio mega,美國);質(zhì)粒大提試劑盒(Qiagen,美國);CaCl2(Sig ma,美國);Mg SO4(Sig ma,美國);T4DNA ligase試劑盒(NEB,英國);瓊脂糖(賽百盛,北京);限制性內(nèi)切酶(NEB,英國);測序(華大基因,北京)。
2 方 法
2.1 sh RNA的設(shè)計:針對靶基因序列,按照RNA干擾設(shè)計序列設(shè)計原則,運(yùn)用美國Ambition公司的軟件設(shè)計攜帶小鼠Mmp9基因(NM-013599)si RNA序列的sh RNAs結(jié)構(gòu)單鏈寡核苷酸,并合成3對單鏈寡核苷酸。每一正向單鏈內(nèi)的寡核苷酸以正反向組合,中間添加Loop結(jié)構(gòu),使寡核苷酸形成發(fā)夾結(jié)構(gòu),每對寡核苷酸兩端分別帶有AgeΙ和Eco RΙ酶切位點(diǎn)。
2.2 Mmp9-sh RNA慢病毒質(zhì)粒的構(gòu)建:在37°C條件下用限制性內(nèi)切酶AgeⅠ(ACCGGT)和Eco RⅠ(GAATTC)酶切p SIL-RFP載體以使其線性化,將酶切回收的線性載體質(zhì)粒和退火的雙鏈DNA連接,連接反應(yīng)條件如下:退火產(chǎn)物(按1∶100稀釋)5μl,p SIL-RFP(100ng)3μl,T4DNA ligase(NEB)1μl,10×Ligation Buff er 2μl,Sterile water 9μl共20μl反應(yīng)體系于16℃,連接過夜,準(zhǔn)備轉(zhuǎn)化。取10μl連接產(chǎn)物,轉(zhuǎn)化DH5α感受態(tài)菌,轉(zhuǎn)化后菌鋪至LB-Ampr+平板,37℃溫箱孵育過夜。挑取平板上長出的單克隆至LBAmpr+液體培養(yǎng)基,37℃,200r p m,振蕩培養(yǎng)15h,提取細(xì)菌培養(yǎng)物中的質(zhì)粒。步驟按照小量提取質(zhì)粒的方法進(jìn)行(質(zhì)粒提取純化試劑盒,Bio mega)。
2.3 PCR鑒定及DNA測序:挑取重組陽性克隆進(jìn)行PCR鑒定,并設(shè)陰性對照(排除系統(tǒng)中外源核酸污染導(dǎo)致的假陽性結(jié)果)。PCR鑒定陽性克隆的上游引物(+)5’-CCTATTTCCCATGATTCCTTCATA-3’和下游引物(-)5’-GTAATACGGTTATCCACGCG -3’,PCR 條 件:94℃30s-94℃30s-55℃30s-72℃30s-72℃30s,30個循環(huán)。反應(yīng)結(jié)束后進(jìn)行瓊脂糖凝膠電泳。挑出陽性克隆進(jìn)行測序。測序準(zhǔn)確后,該陽性 克 隆 分 別 命 名 為 p SIL-RFP/Mmp9-sh RNA1,p SIL-RFP/Mmp9-sh RNA2, p SIL-RFP/Mmp9-sh RNA3。
2.4 高效Mmp9-sh RNA慢病毒質(zhì)粒的篩選:①M(fèi)mp9質(zhì)粒轉(zhuǎn)染293 T細(xì)胞:轉(zhuǎn)染前1d接種細(xì)胞于6孔板,2 ml無抗生素培養(yǎng)基每孔,第2天轉(zhuǎn)染時細(xì)胞達(dá)到60%~80%每孔。在一管中將5μg pc DNA3.1(+)/Mmp9質(zhì)粒分別與240μl Opti-MEM 無血清培養(yǎng)基混合,然后在另一管中取10μl lipofectamine 2000與240μl Opti-MEM無血清培養(yǎng)基,均在室溫下靜止5 min。再把兩管混合,室溫靜止20 min后,將混合液均勻加入6孔板,37°C培養(yǎng)48h。②半定量RT-PCR篩選高效 Mmp9-sh RNA質(zhì)粒:分別提取各組RNA,根據(jù)Mmp9的基因信息,運(yùn)用Pri mer Premier 5.0軟件,設(shè)計上下游引物擴(kuò)增Mmp9的部分CDS區(qū)。Mmp9-S:5'ACGGCAACGGAGAAGGCAAAC3',Mmp9 ‐ AS:5'GCTTAGAGCCACGACCATACAGATA3’,β‐actin‐669S:5'CGTGACATTAA GGAGAAGCTG3',β‐actin‐1169:5'CTAGAAGCATTTGCGGTGGAC3'。PCR條件如下:94℃3 min-94℃40s-56℃60s-72℃60s-25cycle-72℃10s。反應(yīng)結(jié)束后,進(jìn)行半定量RT-PCR驗證,以β-actin(PCR產(chǎn)物長度為500bp)為內(nèi)參,用凝膠成像系統(tǒng)記錄觀察結(jié)果,并用Lab wor ks 4.0凝膠分析軟件對電泳結(jié)果進(jìn)行分析,并進(jìn)行定量分析。③Wester n blot篩選高效Mmp9-sh RNA質(zhì)粒:轉(zhuǎn)染72h后加入RIPA裂解液收集蛋白,10%的 SDS-PAGE凝膠電泳,4°C 350 mA 下電轉(zhuǎn)移120 min,將蛋白樣品轉(zhuǎn)移到PVDF膜上,雜交封閉一二抗孵育后,最后用 Wester n Lightning(R)– ECL,Enhanced Chemilu minescence Substrate(Per kin El mer,NEL100001EA)檢測,顯影。挑選出最佳重組p SIL-RFP/Mmp9-sh RNA 質(zhì)粒,準(zhǔn)備將其制成慢病毒。
2.5 慢病毒包裝:將對數(shù)生長期的293T細(xì)胞用含10%胎牛血清的DMEM培養(yǎng)基調(diào)整細(xì)胞濃度為6×105/ml。接種于15 c m細(xì)胞培養(yǎng)皿,37℃ 、5%CO2培養(yǎng)箱內(nèi)培養(yǎng)24h。待細(xì)胞密度達(dá)70%~80%時即可用于轉(zhuǎn)染。轉(zhuǎn)染前2 h將細(xì)胞培養(yǎng)基更換為無血清培養(yǎng)基。向一滅菌離心管中加入所制備的各DNA溶液(p SIL-RFP 載 體 20μg,p Helper 1.0 載 體 15μg,p Hel per 2.0載體10μg),與相應(yīng)體積的 Opti-MEM 混合均勻,調(diào)整總體積為2.5 ml,在室溫下溫育5 min。將Lipofecta mine 2000試劑輕柔搖勻,取100μl Lipofectamine 2000試劑在另一管中與2.4 ml Opti-MEM混合,在室溫下溫育5 min。把稀釋后的DNA與稀釋后的Lipof ectamine 2000進(jìn)行混合,室溫下溫育20 min后。將該混合液轉(zhuǎn)移至293 T細(xì)胞的培養(yǎng)液中,繼續(xù)培養(yǎng)。8 h后倒去含有轉(zhuǎn)染混和物的培養(yǎng)基,每瓶細(xì)胞加入20 ml的PBS液洗滌后,加入含10% 血清的細(xì)胞培養(yǎng)基25 ml,于37℃、5%CO2培養(yǎng)箱內(nèi)繼續(xù)培養(yǎng)48h。收集上清液,于4℃,4000 g 離心10 min,除去細(xì)胞碎片。以0.45μm濾器過濾上清液于40 ml超速離心管濃縮,即為病毒濃縮液。將病毒濃縮液移出,分裝后保存在病毒管中,-80℃長期保存,進(jìn)行病毒生物學(xué)滴度測定。
1 Mmp9基因sh RNAs序列:經(jīng)設(shè)計并合成的Mmp9基因1~3序列,正義鏈(sense strand,S鏈)及反義鏈(antisense strand,A鏈)DNA,見表1。
2 連接轉(zhuǎn)化產(chǎn)物陽性克隆的PCR鑒定:連接入片段的陽性克隆PCR片段大小為:343bp(從載體中切掉24bp);沒有接入片段的空載體克隆PCR片段大小為:306 bp。瓊脂糖凝膠電泳(圖1)。圖1中,1#:陰性對照(dd H2O);2#:自連對照(空載體自連對照組);3#:Mar ker:5 Kb,3 Kb,2 Kb,1.5 Kb,1 Kb,750,500,250,100 bp;4~8#:clone1,clone 2,clone 3,clone 4,clone 5。
圖1 陽性克隆的PCR鑒定
圖2 Mmp9-sh RNA質(zhì)粒測序結(jié)果
表1 各組sh RNA序列DNA片段
圖3 RT-PCR檢測篩選最佳干擾質(zhì)粒為si R-2
圖4 Western Blot檢測篩選最佳干擾質(zhì)粒為si R-2
3 DNA測序鑒定:挑選上述陽性克隆進(jìn)行DNA序列測定,由測序結(jié)果可知Mmp9合成的雙鏈寡聚DNA插入到重組短發(fā)卡RNA載體中,成功構(gòu)建了RNA干擾慢病毒載體(圖2)。
4 RT-PCR和 Wester n-bl ot篩選、驗證最佳干擾質(zhì)粒:Mmp9-2干擾效果最好(圖3、4)。
5 慢病毒載體的包裝和滴度測定:重組p SILRFP/Mmp9-sh RNA2質(zhì)粒與慢病毒包裝系統(tǒng)其他兩種質(zhì)粒共轉(zhuǎn)染293 T細(xì)胞,慢病毒自動進(jìn)行包裝,48h收集到的高純度上清液,即為制備成功的p SIL-RFP/Mmp9-sh RNA2慢病毒。測定病毒滴度為1×1010pf u/L。
基質(zhì)金屬蛋白酶(Mmps)是一組鋅依賴性的肽鏈內(nèi)切酶,可以降低包括膠原、明膠、纖維連接蛋白、彈力蛋白和蛋白多糖等在內(nèi)的細(xì)胞外基質(zhì)成分[3],在炎癥、組織修復(fù)、腫瘤的侵襲和轉(zhuǎn)移等病理進(jìn)展的組織重構(gòu)中起著重要作用[4]。此外,有學(xué)者發(fā)現(xiàn)多種基質(zhì)金屬蛋白酶是血管化和腫瘤進(jìn)展中的調(diào)節(jié)因子,例如,Mmp9/gelatinase B,Mmp2/gelatinase A,Mmp3/str o melysin1 和 Mmp7/matr ylysin[5]。 其 中,Mmp9是腫瘤血管化的關(guān)鍵因素,是VEGF-VEGFR系統(tǒng)的信號[6]。國內(nèi)外大量研究證實,Mmp9與腫瘤的發(fā)生、侵襲和轉(zhuǎn)移有密切關(guān)系,并且主要是通過誘導(dǎo)血管化而發(fā)揮作用。例如,有學(xué)者報道[7],遠(yuǎn)處原發(fā)性腫瘤肺轉(zhuǎn)移前,肺內(nèi)的Mmp9就已開始呈現(xiàn)出高表達(dá)。進(jìn)一步研究發(fā)現(xiàn),Mmp9是通過遠(yuǎn)處原發(fā)腫瘤的VEGFR-1/Flt-1酪氨酸激酶(TK)來特異性的誘導(dǎo)肺血管內(nèi)皮細(xì)胞和巨噬細(xì)胞來促進(jìn)肺轉(zhuǎn)移。
目前,針對基質(zhì)金屬蛋白酶家族開發(fā)了抑制劑,但還沒有只針對某一種Mmp的特異性抑制劑。例如,馬馬司他(Mari mastat)就是一個Mmp家族的廣譜抑制劑。它可以抑制除了 Mmp3以外的所有 Mmp[8]。但這對于我們研究某一種Mmp是不利的。相比之下,RNAi技術(shù)效率高、特異性強(qiáng)。但是,常規(guī)化學(xué)合成法合成的si RNA經(jīng)脂質(zhì)體轉(zhuǎn)染效果差,轉(zhuǎn)移到細(xì)胞內(nèi)的si RNA半衰期短,轉(zhuǎn)染率低,體外合成si RNA對基因表達(dá)的抑制作用短暫,不適合體內(nèi)實驗研究,因而使其應(yīng)用受到較大的限制。而本實驗采用體外構(gòu)建能夠表達(dá)sh RNA的慢病毒載體,然后轉(zhuǎn)移到細(xì)胞內(nèi)轉(zhuǎn)錄si RNA的方法,具有可以感染非分裂細(xì)胞、目的基因整合至靶細(xì)胞基因組長期表達(dá)、免疫反應(yīng)小、轉(zhuǎn)染率高等優(yōu)勢。因而適用于體內(nèi)基因治療。
本文設(shè)計合成3對針對小鼠Mmp9基因的干擾序列,分別構(gòu)建質(zhì)粒,轉(zhuǎn)染293 T細(xì)胞,與p SIL-RFP連接、轉(zhuǎn)化大腸桿菌感受態(tài)細(xì)胞,構(gòu)建成攜帶Mmp9-sh(AAF)等,其中DEN和 AFB1更為常用[4]。DEN為國際腫瘤研究中心機(jī)構(gòu)(International agency for research on cancer,IARC)確定的致癌物質(zhì),對腫瘤的發(fā)生具有啟動和促進(jìn)的雙重作用。此模型特點(diǎn)為誘癌成功率高,對肝臟專一,肝細(xì)胞癌所占比例大,是迄今應(yīng)用最廣泛的一種肝癌模型[5]。常用的造模方式有口咽插管灌喂、DEN飲水等方式。后者操作簡單,不易導(dǎo)致口腔和消化道感染,不失為一種較好的造模方式。
本研究采用飼以含DEN飲水誘發(fā)的大鼠肝癌模型,并對40pp m、64pp m、80pp m三種不同濃度進(jìn)行比較,觀察發(fā)現(xiàn)第16周其病死率為0,對其進(jìn)行處死解剖,經(jīng)病理證實40pp m未見肝癌發(fā)生,64pp m、80pp m誘癌率分別為83.33%、91.66%,后續(xù)觀察發(fā)現(xiàn):第22周80pp m組成癌后大鼠出現(xiàn)4只死亡,至26周病死率為100%;而64pp m組大鼠第25周出現(xiàn)死亡,第30周病死率為100%;40pp m組第30周病死率為16.67%,處死解剖發(fā)現(xiàn)肝癌誘癌率為50%、自由飲水對照組在第30周無死亡,處死解剖未發(fā)現(xiàn)肝癌。各組大鼠所形成肝癌為肝細(xì)胞性肝癌,形成過程沒有經(jīng)過肝硬化階段,但均有程度不同的肝細(xì)胞炎癥、脂肪侵潤、纖維化情況。
本實驗提示,16周DEN64pp m、80pp m誘癌均可成功造模,80pp m組成癌后存活期僅僅只有10周,且在22周就開始出現(xiàn)死亡,若16周后開展藥物干預(yù)療程不宜超過6周,一般以4周較為科學(xué);而64pp m組大鼠相對存活期長,藥物干預(yù)可以在10周以內(nèi),療程可以控制在2月內(nèi)。根據(jù)成模情況和死亡時間以及存活期,我們初步認(rèn)為64pp m濃度的造模效果不亞于80pp m濃度,一定程度上64pp m似乎更優(yōu)于80pp m,因為后者出現(xiàn)巨塊型肝癌,肝癌進(jìn)展較快,相對生存期較短,不利于進(jìn)一步的藥物干預(yù)觀察,64pp m濃度誘癌是一種較理想的用于藥物療效評價的大鼠肝癌模型。
(本文圖見封3)
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