曹 平 趙 玉 張麗麗 沈 婕 鄧蓉蓉 宋志霞 趙俊麗 王 靜
系統(tǒng)性紅斑狼瘡(SLE)是一種多系統(tǒng)損傷的自身免疫性疾病,狼瘡性腎炎(LN)是其最嚴(yán)重的并發(fā)癥之一,累積發(fā)病率亞洲人群最高(55%),其中23%約10年后進(jìn)展至終末期腎?。?-3]。LN發(fā)病可能與遺傳、激素、感染、環(huán)境等因素有關(guān)。近年研究表明,機(jī)體的遺傳因素在SLE的易感性發(fā)病方面處于主導(dǎo)地位,且是多基因協(xié)調(diào)控制[4,5],但有關(guān) SLE并發(fā)LN的機(jī)制仍不明確。Kalaaji等[6]研究顯示,SLE患者細(xì)胞凋亡異常介導(dǎo)的核小體與抗核小體抗體間的作用是LN發(fā)生、發(fā)展的中心環(huán)節(jié)。但是,目前對(duì)LN凋亡清除機(jī)制障礙的始動(dòng)原因仍不明確。由于細(xì)胞凋亡是多基因嚴(yán)格調(diào)控的過程,而LN又是多基因表達(dá)異常所致的自身免疫性疾病,因此,對(duì)LN發(fā)病過程中與細(xì)胞凋亡有關(guān)基因的研究,可望成為闡明LN發(fā)病機(jī)制的突破口。還有研究顯示瓣?duì)顑?nèi)切核酸酶1(Fen1)基因的單核苷酸多態(tài)性與SLE有關(guān)[7],F(xiàn)en1 基因位于人類染色體 11q12,長 1144 bp,含有一個(gè)外顯子,編碼380個(gè)氨基酸,構(gòu)成Fen1核酸酶的一級(jí)結(jié)構(gòu),是一種結(jié)構(gòu)特異性多功能核酸酶,在DNA的多條代謝途徑、維護(hù)染色體的穩(wěn)定及細(xì)胞凋亡過程中發(fā)揮著重要作用[8]。該基因的變異與腫瘤及自身免疫性疾病有關(guān)[9,10]。Zheng 等[10]通過對(duì)Fen1基因E160D點(diǎn)突變模型小鼠研究發(fā)現(xiàn),該模型小鼠細(xì)胞凋亡的清除機(jī)制發(fā)生障礙,導(dǎo)致凋亡產(chǎn)物在腎臟及肺組織中堆積增多,誘發(fā)自身免疫反應(yīng),造成腎臟免疫性損傷。我們推測在以細(xì)胞凋亡異常為主導(dǎo)作用的LN發(fā)病機(jī)制中,F(xiàn)en1基因異常可能發(fā)揮了很重要的作用,為此,我們檢測LN患者腎臟組織細(xì)胞凋亡情況和Fen1基因61563142~61563342目的片段,確定其突變及與LN的相關(guān)性。
對(duì)象 為2009年10月至2012年5月期間蘭州大學(xué)第二醫(yī)院腎內(nèi)科住院確診LN患者50例,(其中女性45例,男性5例,均為漢族,年齡13~50歲,平均年齡33.48歲),診斷標(biāo)準(zhǔn)符合1997年美國風(fēng)濕病學(xué)會(huì)修訂的SLE分類診斷標(biāo)準(zhǔn)的基礎(chǔ)上出現(xiàn)以下四條中的任意一條且排除其他導(dǎo)致腎炎因素:(1)24h尿蛋白定量>0.5 g/d;(2)尿中紅細(xì)胞或白細(xì)胞>5個(gè)/HP;(3)血清肌酐(SCr)>133 μmol/L;(4)腎活檢明確診斷。
健康組選自2009年7月在本院體檢中心進(jìn)行健康檢查的漢族健康者25例(女性14例,男性11例),年齡21~43歲(平均29.6歲);胃癌組為2010年10月至2012年5月期間蘭州大學(xué)第二醫(yī)院普外科住院漢族患者20例(女性11例,男性9例),年齡45~70歲(平均52歲),所有患者均經(jīng)胃鏡及病理檢查確診而入院接受手術(shù)治療。30例LN患者腎穿刺組織來自于蘭州大學(xué)基礎(chǔ)醫(yī)學(xué)院病理研究所標(biāo)本庫。
主要儀器及試劑 Bio-Rad S1000 PCR儀,JY200 電泳儀,ImageQuant-300,DNA Marker B,柱式全血基因組抽提試劑盒,PCR試劑盒(美國Promega),凱基TUNEL細(xì)胞凋亡檢測試劑盒。
研究方法
細(xì)胞凋亡檢測 按凱基TUNEL細(xì)胞凋亡檢測試劑盒說明書操作:(1)石蠟切片按常規(guī)方法進(jìn)行脫蠟及水合;(2)切片浸入1×PBS漂洗三次,5 min/次;(3)配制1%Triton X~100通透液;(4)切片浸入通透液中,室溫促滲3~5 min;(5)切片浸入1 ×PBS漂洗三次,5 min/次;(6)配制3%H2O2封閉液;(7)切片浸入封閉液,室溫(15℃~25℃)封閉10 min;(8)切片浸入1×PBS漂洗三次,5 min/次;(9)配制Proteinase K工作液;(10)每個(gè)樣本上滴加100 μl Proteinase K 工作液,37℃反應(yīng) 30 min;(11)切片浸入1×PBS漂洗三次,每次5 min/次;(12)配制100 μl含3000 U 的DNaseⅠ反應(yīng)液;(13)在一張樣本切片上滴加100 μl上述 DNaseⅠ反應(yīng)液,室溫~37℃處理10~30 min;(14)制好的陽性片浸入1×PBS漂洗三次,每次5 min/次;(15)配制 TdT酶反應(yīng)液;(16)樣本周圍用吸水紙吸干,每個(gè)樣本上滴加50 μl TdT酶反應(yīng)液,加蓋玻片放入溫盒中,37℃避光反應(yīng)60 min(陰性對(duì)照樣本不加TdT酶反應(yīng)液);(17)反應(yīng)后的樣本片浸入1×PBS漂洗三次,5 min/次;(18)配制Streptavidin~HRP工作液;(19)樣本周圍用吸水紙吸干,每個(gè)樣本上滴50 μl Streptavidin~HRP工作液,加蓋玻片放入溫盒中,37℃避光反應(yīng)30 min;(20)反應(yīng)后的樣本片浸入1×PBS漂洗三次,5 min/次;(21)配制DAB工作液;(22)樣本周圍用吸水紙吸干,每個(gè)樣本上滴加50 μl DAB工作液,室溫顯色反應(yīng)30s~5 min;(23)顯色后的樣本片浸入1×PBS漂洗三次,5 min/次,光鏡下觀察、拍照;(24)蘇木素、甲基綠等常規(guī)染液復(fù)染。
計(jì)算細(xì)胞凋亡指數(shù) 切片隨機(jī)選5個(gè)視野,每個(gè)視野視察100個(gè)細(xì)胞,計(jì)算凋亡指數(shù)?;仡櫺苑治瞿I活檢患者的病例資料,根據(jù)ISN/RPS 2003狼瘡性腎炎分型標(biāo)準(zhǔn)進(jìn)行病理分型,應(yīng)用SLE活動(dòng)度評(píng)分(SLEDAI)2000判斷其疾病活動(dòng)度,并進(jìn)行相關(guān)性分析。
標(biāo)本采集 取受檢者清晨空腹外周靜脈血2 ml至EDTA抗凝管,輕輕混勻,-80℃保存,待統(tǒng)一提取基因組DNA。
基因組DNA的制備 標(biāo)本解凍,提取基因組DNA,步驟如下:(1)在500 μl血液中加入800 μl的TBP Buffer用1 ml的 Tip頭輕輕吹打使其混勻,4000 r/min離心3min,棄上清;(2)重復(fù)上述步驟一次,若血樣仍顯紅色則需再次重復(fù)上述步驟,當(dāng)沉淀為無色或淡紅色后用200 μl TE懸浮即可;(3)在準(zhǔn)備好的200 μl樣品中加入500 μl TBM Buffer,混勻;再加入4 μl Proteinase K,混勻,55.0℃保溫 10~20 min;(4)加入260 μl無水乙醇,混勻,用 1 ml Tip 頭將樣品全部轉(zhuǎn)移到套放于2 ml Collection Tube的UNIQ-10柱中;(5)臺(tái)式離心機(jī)8000 r/min,室溫離心1 min;(6)取下UNIQ-10柱,棄去Collection Tube中的廢液。將柱子放回同一根Collection Tube中,加入500 μl Wash Solution,10 000 r/min,室溫離心2 min;(7)重復(fù)步驟(6)一次;(8)取下柱,棄去的全部廢液。將柱子放回同一根 Collection Tube中,10 000 r/min,室溫離心15s,以除去殘留的 Wash Solutions;(9)將UNIQ-10柱放入新無菌的1.5 ml離心管中,在柱膜中央加入40 μl Elution Buffer,室溫放置2 min;(10)10 000 r/min室溫離心1 min。離心管中的液體即為基因組DNA,-20℃保存。
引物設(shè)計(jì) Fen1基因序列來自GenBank(gi|224589802)。引物采用olige 7.0軟件設(shè)計(jì),引物序列:(1)上游引物-TCAGGCGAGCTGGCCAAACG,下游引物-GTCGCCGCACGATCTCCTCG;(2)上游引物-GCGGGCTGAGGCAGAGAAGC,下游引物-CCAGCCTTCACCAGGGCAGC,設(shè)計(jì)后由北京華大基因公司合成。
PCR反應(yīng) Fen1基因PCR擴(kuò)增產(chǎn)物為201 bp,PCR試劑盒購于Promega公司,50 μl PCR反應(yīng)體系及條件見表1。
表1 50 μl PCR反應(yīng)體系及條件
PCR產(chǎn)物瓊脂糖凝膠電泳鑒定 (1)制備膠,稱取0.3g瓊脂糖凝膠倒入燒瓶,加入30 ml 0.5×TBE緩沖液,配制成濃度為1.0%的凝膠,加熱約3 min;(2)灌膠,將凝膠冷卻至60℃左右,加入0.2 μg/ml EB 1 μl,搖勻后緩慢倒入制膠模具,凝膠厚度為3~5 mm,迅速插入梳子,避免產(chǎn)生氣泡,置常溫下凝固;(3)待凝膠完全凝固后,移去梳子,將凝膠置于電泳槽;(4)加入0.5×TBE緩沖液至電泳槽,液面高出凝膠表面約1 mm;(5)加樣孔中加入5 μl PCR擴(kuò)增產(chǎn)物及50 bp DNA Ladder Marker對(duì)照;(6)凝膠電泳,電壓80V,電泳30 min;(7)ImageQuant-300凝膠成像系統(tǒng)觀察DNA條帶,拍照。
序列測定 取目的條帶亮、無雜帶的PCR產(chǎn)物和上下游引物送至北京華大基因公司進(jìn)行純化測序。
在測序結(jié)果中尋找突變位點(diǎn) 通過Chromas軟件讀出測序結(jié)果,在基因數(shù)據(jù)庫(www.ncbi.nlm.nih.gov/BLAST)中與 gi|224589802:61563142~61563342進(jìn)行比較,搜索突變位點(diǎn)。
統(tǒng)計(jì)學(xué)分析 用SPSS19.0統(tǒng)計(jì)軟件進(jìn)行統(tǒng)計(jì)學(xué)處理,SLE活動(dòng)指數(shù)2000(SLEDAI 2000)與腎臟組織細(xì)胞凋亡指數(shù)(AI)進(jìn)行相關(guān)分析,基因突變頻率及基因型分布在LN患者、胃癌患者、健康者間的比較采用χ2檢驗(yàn)。
30例LN患者中,細(xì)胞凋亡檢測全部陽性,凋亡細(xì)胞呈散在分布(圖1),LN病理分型與AI、SLEDAI 2000的關(guān)系見表2。相關(guān)性分析顯示,SLEDAI 2000與 AI正相關(guān),r=0.39,P=0.032(圖 2)。
圖1 LN患者腎臟組織細(xì)胞凋亡檢測圖;A圖箭頭所示凋亡細(xì)胞核為棕褐色;B圖為陰性對(duì)照;C圖為陽性對(duì)照(TUNEL,×200)
表2 狼瘡性腎炎病理類型與AI、SLEDAI關(guān)系
圖2 細(xì)胞凋亡指數(shù)(AI)與系統(tǒng)性紅斑狼瘡活動(dòng)指數(shù)2000 度評(píng)分(SLEDAI,2000)呈正相關(guān)
目的基因經(jīng)PCR后瓊脂糖凝膠電泳凝膠成像見1~3條帶為LN患者,4、5條帶為胃癌患者,6、7健康(圖3)。擴(kuò)增后的目的基因進(jìn)行測序,并對(duì)測序結(jié)果與基因數(shù)據(jù)庫中人Fen1基因進(jìn)行比較后,LN患者、胃癌、健康者 Fen1基因存在 C/—(+61563189)、A/T(+61563198)、A/—(+61563-204),G/T(+61563303)、T/C(+61563304)位點(diǎn)突變(基因測序結(jié)果見圖 4~6(A),Blast結(jié)果見圖4~6(B),上述各突變位點(diǎn)統(tǒng)計(jì)分析(P>0.05),未發(fā)現(xiàn)有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義的堿基變異(表3,4)。
圖3 瓣?duì)顑?nèi)切核酸酶1目的基因61563142~61563342片段電泳凝脈成像
圖4 A:狼瘡性腎炎(LN)患者目的基因測序圖譜,B:LN患者目的基因Blast結(jié)果
圖5 A:胃癌患者目的基因測序圖譜;B:胃癌患者目的基因Blast結(jié)果
圖6 A:健康人群目的基因測序圖譜;B:健康人群目的基因Blast結(jié)果
表3 狼瘡性腎炎(LN)組與胃癌組堿基變異統(tǒng)計(jì)分析結(jié)果
表4 狼瘡性腎炎(LN)組與健康組堿基變異統(tǒng)計(jì)分析結(jié)果
目前應(yīng)用糖皮質(zhì)激素和免疫抑制劑聯(lián)合治療可緩解多數(shù)LN患者病情,但仍有部分患者對(duì)傳統(tǒng)的免疫抑制劑治療無效或效果差。隨著對(duì)LN發(fā)病機(jī)制的深入研究,針對(duì)發(fā)病機(jī)制中某一環(huán)節(jié)或影響發(fā)病及疾病進(jìn)展的關(guān)鍵分子進(jìn)行選擇性靶向治療,已成為LN治療的新方向。細(xì)胞凋亡清除異常,形成自身抗原,誘發(fā)機(jī)體產(chǎn)生抗體,導(dǎo)致免疫系統(tǒng)紊亂是LN 發(fā)生、發(fā)展的中心環(huán)節(jié)[6,11,12],我們對(duì) 30 例 LN患者的腎組織標(biāo)本進(jìn)行凋亡檢測,所有患者腎組織凋亡檢測均陽性,凋亡細(xì)胞散在分布腎小球及腎小管,根據(jù)ISN/RPS 2003制定的病理分型標(biāo)準(zhǔn),30例LN患者中以Ⅳ型最多(40.00%),其次Ⅱ型(26.67%),Ⅲ型 16.67%,Ⅴ型 13.33%,Ⅵ 型3.33%,無Ⅰ型病變患者。回顧分析臨床資料進(jìn)行SLEDAI 2000評(píng)分發(fā)現(xiàn),SLEDAI與 AI呈正相關(guān)。上述結(jié)果表明LN患者存在細(xì)胞凋亡清除障礙,當(dāng)大量的凋亡小體在腎組織中滯留時(shí),導(dǎo)致凋亡物質(zhì)“進(jìn)出”平衡失調(diào),造成凋亡物質(zhì)的累積,未及時(shí)清除的凋亡細(xì)胞質(zhì)膜破裂后釋放出大量的自身內(nèi)容物,包括核小體碎片、DNA、組蛋白成分等凋亡物質(zhì),引發(fā)炎癥反應(yīng)和自身免疫,成為維持自身免疫應(yīng)答的反復(fù)性的刺激源,不斷攻擊已經(jīng)致敏的免疫系統(tǒng),破壞其對(duì)自身抗原的中樞和外周耐受,出現(xiàn)組織器官受損,進(jìn)而引發(fā)炎癥和免疫應(yīng)答,促使LN的發(fā)生、發(fā)展[13,14]。本研究發(fā)現(xiàn),凋亡細(xì)胞的數(shù)量越多,SLE病情越活躍,說明在LN進(jìn)程中,凋亡產(chǎn)物累積越多,造成的腎臟損害越嚴(yán)重,進(jìn)一步證明細(xì)胞凋亡障礙在其疾病進(jìn)展及惡化中的作用。
探尋LN患者細(xì)胞凋亡障礙的機(jī)制,有效地對(duì)其進(jìn)行扳正和修復(fù),才能獲得LN根本的治療效果,而對(duì)LN凋亡障礙機(jī)制的探討,更多應(yīng)著眼于其分子病因?qū)W的研究。基因組穩(wěn)定性的維持,及DNA的復(fù)制和修復(fù),都需要一系列的核酸內(nèi)切酶和外切酶的參與,F(xiàn)en1就是其中之一[8],F(xiàn)en1基因E160D點(diǎn)突變影響Fen1核酸酶功能,致使細(xì)胞凋亡過程中核小體DNA鏈不能有效分解,當(dāng)大量的凋亡小體在機(jī)體組織中滯留時(shí),作為具有免疫原性的靶抗原,構(gòu)成危險(xiǎn)信號(hào)對(duì)免疫系統(tǒng)造成威脅,誘發(fā)腫瘤、自身免疫性疾病等[7,10]。
目前Fen1基因和人類疾病的研究多見于腫瘤領(lǐng)域[9,10],在SLE中鮮見報(bào)道。我們曾對(duì)43例 LN患者和26例健康者的外周血標(biāo)本,采用全血基因組DNA柱式試劑盒提取DNA,直接PCR方法擴(kuò)增Fen1基因外顯子包含E160D位點(diǎn)的目的片段,擴(kuò)增后PCR產(chǎn)物應(yīng)用基因測序方法檢測Fenl基因序列,并對(duì)測序結(jié)果與基因數(shù)據(jù)庫中Fenl基因進(jìn)行比較結(jié)果發(fā)現(xiàn),LN患者正向測序中存在946位堿基C缺失突變(未發(fā)表資料)。
本研究進(jìn)一步收集50例LN患者,25例健康者,20例胃癌患者的外周血標(biāo)本,對(duì)Fen1基因外顯子包含E160D位點(diǎn)的61563142~61563342目的片段進(jìn)行擴(kuò)增,擴(kuò)增后的目的基因進(jìn)行測序,比較LN患者、胃癌、健康者Fen1基因突變情況。結(jié)果顯示,三組Fen1基因外顯子61563142~61563342目的片段未發(fā)現(xiàn)有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義的堿基變異,E160D位點(diǎn)未變異,可能原因?yàn)闃颖玖啃?,人群分布存在差異等,但由于試?yàn)樣本量有限,而且未對(duì)Fen1基因全序列進(jìn)行測序,F(xiàn)en1基因在LN發(fā)病及進(jìn)展中的意義還需要擴(kuò)大樣本量進(jìn)行進(jìn)一步研究。
對(duì)Fen1基因進(jìn)行全序列研究可能對(duì)其在LN發(fā)病機(jī)制中的作用更有價(jià)值,F(xiàn)en1基因異常在LN動(dòng)物模型中的研究也為該基因在LN發(fā)病機(jī)制中的作用提供很大的價(jià)值,我們的進(jìn)一步研究將圍繞LN細(xì)胞凋亡異常,對(duì)大樣本的LN人群進(jìn)行Fen1基因全基因組關(guān)聯(lián)研究,同時(shí)在LN動(dòng)物模型中對(duì)Fen1基因的異常在LN細(xì)胞凋亡過程及疾病發(fā)生發(fā)展進(jìn)程中的作用做進(jìn)一步探索。
1 Foster MH.T cells and B cells in lupus nephritis.Semin Nephrol,2007,27(1):47-58.
2 Goodnow CC,Sprent J,F(xiàn)azekas de St Groth B,et al.Cellular and genetic mechanisms of self tolerance and autoimmunity.Nature,2005,435(7042):590-597.
3 de Zubiria Salgado A,Herrera-Diaz C.Lupus nephritis:an overview of recent findings.Autoimmune Dis,2012,2012:849684.
4 Crispín JC,Liossis SN,Kis-Toth K,et al.Pathogenesis of human systemic lupus erythematosus:recent advances.Trends Mol Med,2010,16(2):47-57.
5 Wong M,Tsao BP.Current topics in human SLE genetics.Springer Semin Immunopathol,2006,28(2):97-107.
6 Kalaaji M,F(xiàn)enton KA,Mortensen ES,et al.Glomerular apoptotic nucleosomes are central target structures for nephritogenic.Kidney Int,2007,71(7):664-672.
7 Kim I,Hur NW,Shin HD,et al.Associations ofDNaseIV polymorphisms with autoantibodies in patients with.Rheumatology(Oxford),2008,47(7):996-999.
8 Liu Y,Kao HI,Bambara RA.Flap endonuclease 1:a central component of DNA metabolism.Annu Rev Biochem,2004,73:589-615.
9 Zheng L,Dai H,Zhou M,et al.Polyploid cells rewire DNA damage response networks to overcome replication.Nat Commun,2012,3:815.
10 Zheng L,DaiH,Zhou M,etal.Fen1 mutationsresultin autoimmunity,chronic inflammation and cancers.Nat Med,2007,13(7):812-819.
11 Cauwe B,Opdenakker G.Intracellular substrate cleavage:a novel dimension in the biochemistry,biology and pathology ofmatrix metalloproteinases.Crit Rev Biochem Mol Biol,2010,45(5):351-423.
12 Dieker JW,van der Vlag J,Berden JH.Deranged removal of apoptotic cells:its role in the genesis of lupus.Nephrol Dial Transplant,2004,19(2):282-285.
13 Guerra SG,Vyse TJ,Cunninghame Graham DS.The genetics of lupus:a functional perspective.Arthritis Res Ther,2012,14(3):211.
14 Mu?oz LE,Lauber K,Schiller M,et al.The role of defective clearance of apoptotic cells in systemic autoimmunity.Nat Rev Rheumatol,2010,6(5):280-289.