劉麗麗 王健 吳巍 王海勝 閆艷春
(中國(guó)農(nóng)業(yè)科學(xué)院研究生院,北京 100081)
1981年美國(guó)俄勒岡大學(xué)著名遺傳學(xué)家George Streisinger在《Nature》雜志上發(fā)表關(guān)于斑馬魚(yú)人工雌核發(fā)育的研究論文,標(biāo)志著斑馬魚(yú)開(kāi)始進(jìn)入實(shí)驗(yàn)室模式生物研究領(lǐng)域,至今已有超過(guò)30年的歷史。20世紀(jì)90年代中國(guó)開(kāi)始參與斑馬魚(yú)研究。近幾年,隨著斑馬魚(yú)模式生物南方中心、北方中心和國(guó)家種質(zhì)資源庫(kù)相繼成立,中國(guó)斑馬魚(yú)研究也開(kāi)始進(jìn)入高速發(fā)展階段。由于體積小、代時(shí)短、胚胎透明、體外發(fā)育等特點(diǎn),斑馬魚(yú)在模式生物研究中的地位越來(lái)越重要。隨著顯微注射、重組體構(gòu)建以及熒光標(biāo)記等技術(shù)的快速發(fā)展,轉(zhuǎn)基因斑馬魚(yú)已經(jīng)廣泛用于脊椎動(dòng)物基因表達(dá)調(diào)控、發(fā)育分化、形態(tài)發(fā)生、人類(lèi)疾病、藥物篩選和環(huán)境檢測(cè)等研究領(lǐng)域。本文將就斑馬魚(yú)在轉(zhuǎn)基因動(dòng)物研究中的應(yīng)用進(jìn)行介紹,并對(duì)該領(lǐng)域存在的問(wèn)題進(jìn)行總結(jié)。
模式生物(model organism)能夠代表一類(lèi)生物的基本特點(diǎn),結(jié)構(gòu)相對(duì)簡(jiǎn)單并易于進(jìn)行試驗(yàn)操作,因此普遍用于遺傳學(xué)、發(fā)育生物學(xué)、生理學(xué)和分子細(xì)胞學(xué)等方面的研究。其普遍特點(diǎn)是:首先,生理特征能夠代表生物界的某一大類(lèi)群;其次,試驗(yàn)材料容易獲得,并易于在實(shí)驗(yàn)室內(nèi)飼養(yǎng)、繁殖速度快,研究維持費(fèi)用低;最后,容易進(jìn)行試驗(yàn)操作,特別是遺傳學(xué)分析[1]。一般認(rèn)為模式生物的應(yīng)用源于格里高·約翰·孟德?tīng)枺℅regor Johann Mendel)以豌豆為材料對(duì)遺傳學(xué)的研究。1866年孟德?tīng)栐l(fā)表文章說(shuō)他的試驗(yàn)是“解決問(wèn)題的唯一方法”。此后對(duì)模式生物的選擇遵循兩個(gè)方面的原則:一是該物種在系統(tǒng)進(jìn)化中的地位符合研究目的,二是該物種特性適于特定研究的試驗(yàn)需要[2]。在漫長(zhǎng)的科學(xué)研究歷史中,各領(lǐng)域發(fā)展了多種模式生物,如大腸桿菌、釀酒酵母、秀麗隱桿線蟲(chóng)、海膽、果蠅、擬南芥及小鼠等。模式生物的應(yīng)用大大促進(jìn)了基礎(chǔ)生命科學(xué)和實(shí)驗(yàn)技術(shù)的發(fā)展。為闡明模式生物的遺傳背景,促進(jìn)基因組研究,人類(lèi)基因組計(jì)劃(HGP)最先提出模式生物基因組計(jì)劃,并初步確定了6種模式生物:大腸桿菌、酵母、線蟲(chóng)、果蠅、擬南芥和小鼠。
自從萊德伯格(Joshua Lederberg)應(yīng)用大腸桿菌(Escherichia coli,E. coli)進(jìn)行遺傳學(xué)研究以來(lái)[3],大腸桿菌迅速成為廣泛應(yīng)用的原核模式生物。它具有遺傳背景清楚、操作技術(shù)簡(jiǎn)便、成本低、易于大規(guī)模培養(yǎng)等特點(diǎn)和優(yōu)點(diǎn),而且還特別適合作為外源基因表達(dá)的宿主。因此,大腸桿菌是目前應(yīng)用最廣泛、最成功的克隆原核基因的表達(dá)體系。釀酒酵母(Saccharomyces cerevisiae)作為最簡(jiǎn)單的低等單細(xì)胞真核生物之一,是研究細(xì)胞周期、胚胎形態(tài)發(fā)生、染色體穩(wěn)定性和衰老的優(yōu)秀模型,哈特維爾(Leeland H. Hartwell)和納斯(P. M. Nurse)以釀酒酵母為材料,為揭示細(xì)胞周期的調(diào)控機(jī)理作出了重要貢獻(xiàn)。前者提出了細(xì)胞周期關(guān)卡(cell-cycle checkpoint)的概念,并確定了大量的控制細(xì)胞周期的基因(cdc),后者從粟酒酵母(S. pombe)中分離到第一個(gè)基因cdc2,并提出來(lái)相關(guān)的調(diào)控體系[4]。秀麗隱桿線蟲(chóng)(Caenorhabditis elegans)結(jié)構(gòu)非常簡(jiǎn)單,一條雌雄同體的秀麗隱桿線蟲(chóng)只有不超過(guò)1 000個(gè)細(xì)胞,遵循特定的分裂模式。同時(shí),它還具有多細(xì)胞生物的基本特征,如復(fù)雜的器官系統(tǒng)(complex organ system)、社會(huì)行為、性行為和學(xué)習(xí)行為等,為傳染性疾?。?]和多種人類(lèi)疾?。?]的研究提供模型。許多生物進(jìn)化的保守機(jī)制都是通過(guò)秀麗隱桿線蟲(chóng)闡明的,包括程序性細(xì)胞死亡(programmed cell death)[7]、胰島素信號(hào)[8]、衰老[9]和神經(jīng)生物學(xué)(neurobiology)[10],也使自然免疫和RNA干擾(RNAi)機(jī)制的研究取得了巨大進(jìn)展[11]。20世紀(jì)70-80年代,基于對(duì)果蠅(Drosophila melanogaster)的研究工作,興起了胚胎學(xué)和分子生物學(xué),從此果蠅成為遺傳學(xué)研究最重要的材料之一。試驗(yàn)中分離鑒定到大量的果蠅突變體,促進(jìn)了動(dòng)物發(fā)育學(xué)和疾病的研究。擬南芥(Arabidopsis thaliana)是植物界最重要的模式生物,在研究器官發(fā)育、植物干細(xì)胞生 物 學(xué)[12]、圖 式 形 成(pattern formation)[13]、先天免疫(innate immunity)[14]、晝夜節(jié)律(circadian rhythm)[15]、各種性征的自然突變[16]以及諸多發(fā)育機(jī)制中都取得了重要的進(jìn)展。由于與人類(lèi)的近親關(guān)系,小鼠(Musmusculus)是人類(lèi)基因組研究最主要的模式生物之一,也是哺乳動(dòng)物研究領(lǐng)域最重要的模式生物,廣泛用于發(fā)育學(xué)、分子生物學(xué)、分子遺傳學(xué)、免疫學(xué)和生物醫(yī)學(xué)等研究領(lǐng)域[17]。小鼠為人類(lèi)疾病的研究,包括癌癥、動(dòng)脈粥樣硬化、高血壓、糖尿病、骨質(zhì)疏松和青光眼等作出巨大貢獻(xiàn)。同時(shí),基因組的靶標(biāo)操作[18]、正向遺傳突變篩選[19]和體外成像技術(shù)[20]的高速發(fā)展也使小鼠成為干細(xì)胞研究的主要模式生物之一。
作為模式生物,斑馬魚(yú)(Danio rerio)不僅有脊椎生物的一般特點(diǎn),而且具備諸多技術(shù)優(yōu)勢(shì):飼養(yǎng)簡(jiǎn)單、成本較低、繁殖力強(qiáng)、胚胎透明、個(gè)體較小、時(shí)代時(shí)間短、遺傳信息豐富、擁有大量實(shí)驗(yàn)室突變系、可進(jìn)行正向和反向遺傳分析等[21,22]。
斑馬魚(yú)個(gè)體較小,可以在較小的空間里繁殖高密度的種群,利于節(jié)省試驗(yàn)成本。時(shí)代時(shí)間較短,僅3-4個(gè)月,有助于長(zhǎng)期的遺傳學(xué)研究。實(shí)驗(yàn)室條件下,斑馬魚(yú)可常年產(chǎn)卵,允許連續(xù)大規(guī)模繁殖后代。通常,雌性每周可產(chǎn)卵一次,每次產(chǎn)卵50-200枚。胚胎發(fā)育快,受精后24 h(hpf)身體成型,大部分器官96 hpf內(nèi)發(fā)育完全。斑馬魚(yú)胚胎個(gè)體小,可在微孔反應(yīng)板上培養(yǎng);與哺乳動(dòng)物胚胎在子宮內(nèi)發(fā)育的情況不同,斑馬魚(yú)是體外發(fā)育(圖 1),便于人工操作,如通過(guò)控制培養(yǎng)液直接對(duì)胚胎進(jìn)行水處理(water treatment);胚胎透明度高,且發(fā)育快速,易于觀察,適于進(jìn)行顯微注射。斑馬魚(yú)全基因組測(cè)序已于2005年完成(http://zebrafish.org/zirc/home/guide.php),豐富的遺傳信息為確定斑馬魚(yú)各種生物學(xué)參數(shù)的標(biāo)準(zhǔn)值、鑒定試驗(yàn)突變體提供了依據(jù)?;趯?shí)驗(yàn)室研究的迅速發(fā)展,現(xiàn)已獲得多種具有不同特性的斑馬魚(yú)突變品系,能滿足不同試驗(yàn)需求[23]。
圖1 斑馬魚(yú)體外受精
豐富的遺傳信息、充足的突變體材料和多種技術(shù)優(yōu)勢(shì)使斑馬魚(yú)成為脊椎生物發(fā)育學(xué)、遺傳學(xué)、生態(tài)學(xué)、基礎(chǔ)生物醫(yī)藥學(xué)、毒理學(xué)等多個(gè)領(lǐng)域的優(yōu)秀模式生物。(1)斑馬魚(yú)體外受精,胚胎透明度高,可活體觀察表型變化,進(jìn)行表型篩選 。(2)高度的光學(xué)透明性也允許在保持胚胎完整的條件下,甚至活體條件下,對(duì)相關(guān)基因的時(shí)空表達(dá)模式進(jìn)行觀察分析。如通過(guò)整體胚胎原位雜交技術(shù)檢測(cè)基因轉(zhuǎn)錄產(chǎn)物的表達(dá)[24],或通過(guò)免疫組化技術(shù)檢測(cè)基因翻譯產(chǎn)物的表達(dá),其他技術(shù)如RT-PCR、免疫共沉淀也可用于斑馬魚(yú)基因表達(dá)信息研究[25]。(3)后代數(shù)目大、胚胎體積小、發(fā)育快,允許斑馬魚(yú)用于高通量篩選,而且許多人類(lèi)疾病在胚胎早期即表現(xiàn)病變性狀[26],其在表形篩選方面的獨(dú)特優(yōu)勢(shì)使斑馬魚(yú)成為發(fā)現(xiàn)新藥的有效藥理學(xué)工具[27]。(4)斑馬魚(yú)還用于研究傳染性和遺傳性人類(lèi)疾病的研究,如分歧桿菌?。?8]和神經(jīng)性疾?。?9]。(5)可利用斑馬魚(yú)進(jìn)行正向遺傳篩選發(fā)現(xiàn)疾病中基因的新功能。斑馬魚(yú)是迄今為止唯一能進(jìn)行大規(guī)模正向遺傳篩選的脊椎動(dòng)物[30]。(6)斑馬魚(yú)也是常用的脊椎動(dòng)物毒理學(xué)模型,用作生態(tài)毒理學(xué)測(cè)試物種,檢測(cè)水質(zhì)中化學(xué)物質(zhì)對(duì)魚(yú)類(lèi)生存、生長(zhǎng)和繁殖狀況的影響。但基于動(dòng)物權(quán)益維護(hù)和環(huán)境保護(hù)的需要,目前斑馬魚(yú)胚胎毒理學(xué)測(cè)試僅作為備用手段用于減少或代替實(shí)時(shí)監(jiān)測(cè) 。
但實(shí)驗(yàn)室養(yǎng)殖斑馬魚(yú)也有困難,該種群易發(fā)生微孢子蟲(chóng)病和分枝桿菌病,這兩種難治愈且不易根除的傳染性疾?。?1]。此外,斑馬魚(yú)生物學(xué)和生態(tài)學(xué)的信息還十分有限[32],基因組數(shù)據(jù)庫(kù)也不完善,不能滿足當(dāng)前研究的需要。目前斑馬魚(yú)的反向遺傳學(xué)手段應(yīng)用較少,使用特殊設(shè)計(jì)并合成的嗎啉代寡聚核糖核酸(morpholino)可以暫時(shí)性的抑制目的基因的表達(dá)。
20世紀(jì)80年代,中國(guó)科學(xué)院朱作言領(lǐng)導(dǎo)的實(shí)驗(yàn)室在世界上率先開(kāi)展了魚(yú)類(lèi)基因工程定向育種研究,建立了完整的轉(zhuǎn)基因魚(yú)理論模型和完善的試驗(yàn)技術(shù)體系,為轉(zhuǎn)基因魚(yú)育種奠定了理論基礎(chǔ)[33]。30年來(lái),斑馬魚(yú)轉(zhuǎn)基因技術(shù)的迅速發(fā)展為斑馬魚(yú)基礎(chǔ)理論研究和實(shí)際應(yīng)用奠定了基礎(chǔ)。目前,實(shí)驗(yàn)室有幾種技術(shù)成功用于斑馬魚(yú)轉(zhuǎn)基因研究。
斑馬魚(yú)胚胎顯微注射技術(shù)是進(jìn)行基因瞬時(shí)表達(dá)、過(guò)量表達(dá)、降低表達(dá)、制備轉(zhuǎn)基因斑馬魚(yú)或誘發(fā)突變的重要手段,該方法操作相對(duì)簡(jiǎn)單、效果可靠,是斑馬魚(yú)轉(zhuǎn)基因研究的主要方法,獲得轉(zhuǎn)基因斑馬魚(yú)種系的頻率為10%-30%[34]。一般認(rèn)為,質(zhì)粒DNA注射到受精卵細(xì)胞質(zhì)后立即形成大分子量多聯(lián)體(concatemers),并可能參與基因重組[35]。但是外源基因的多聯(lián)體整合,容易為染色體內(nèi)重組提供條件,最終可能導(dǎo)致外源基因表達(dá)的改變。
顯微注射技術(shù)通常使用含標(biāo)記蛋白的質(zhì)粒載體(如pEGFP-N1),現(xiàn)在一些其他類(lèi)型的載體也用于斑馬魚(yú)轉(zhuǎn)基因研究。GAL4/UAS轉(zhuǎn)錄激活系統(tǒng)可以同時(shí)表達(dá)兩個(gè)外源基因,以提高其在宿主細(xì)胞中表達(dá)水平[36],并越來(lái)越多的用于斑馬魚(yú)基因調(diào)控和轉(zhuǎn)錄沉默機(jī)制的研究。通常斑馬魚(yú)中使用的Tol2轉(zhuǎn)座子去除了內(nèi)部原有的轉(zhuǎn)座酶編碼區(qū)域并用EGFP基因序列代替,注射時(shí)將其與轉(zhuǎn)座酶一起轉(zhuǎn)到斑馬魚(yú)受精卵中,轉(zhuǎn)座酶以一定幾率完整切割轉(zhuǎn)座元件,這些轉(zhuǎn)座元件隨之整合到斑馬魚(yú)基因組中。有學(xué)者將Gal4/UAS與Tol2元件聯(lián)合使用,成功實(shí)現(xiàn)了斑馬魚(yú)基因組水平上的插入表達(dá)[37]。
擬型反轉(zhuǎn)錄病毒也已經(jīng)成功用于斑馬魚(yú)研究,它的插入效率比Tol2轉(zhuǎn)座子更高,而且與顯微注射相比,使用該方法得到的轉(zhuǎn)基因奠基者(transgenic founder)之間表達(dá)范圍的差異性比較小。盡管如此,由于逆轉(zhuǎn)錄病毒轉(zhuǎn)基因技術(shù)所需的構(gòu)建、包裝、效價(jià)評(píng)定和轉(zhuǎn)染耗時(shí)較長(zhǎng),因此該技術(shù)不能用于常規(guī)轉(zhuǎn)基因斑馬魚(yú)的構(gòu)建和啟動(dòng)子及基因功能的分析[38]。重組桿狀病毒介導(dǎo)法是一種更新的方法。桿狀病毒可以高效地轉(zhuǎn)導(dǎo)哺乳動(dòng)物細(xì)胞,Huang等[39]對(duì)桿狀病毒加以改進(jìn):使用巨細(xì)胞病毒早早期啟動(dòng)子(CMV-IE),以加強(qiáng)型綠色熒光蛋白(EGFP)作報(bào)告基因。結(jié)果發(fā)現(xiàn)重組桿狀病毒可以將外源基因高效地導(dǎo)入已分化的魚(yú)類(lèi)細(xì)胞,轉(zhuǎn)基因細(xì)胞培養(yǎng)15 d內(nèi)熒光持續(xù)較高亮度,繼續(xù)培養(yǎng)一段時(shí)間可觀察到熒光細(xì)胞的數(shù)目并未減少。
圖2 轉(zhuǎn)基因斑馬魚(yú)(5 dpf,受精后5 d)在激發(fā)光下表達(dá)熒光
隨著綠色熒光蛋白(GFP)的發(fā)現(xiàn)及其晶體結(jié)構(gòu)的破解,GFP越來(lái)越多地作為報(bào)告基因用于轉(zhuǎn)基因研究。除野生型GFP外,現(xiàn)已發(fā)展了3種突變體,EGFP、GFP-S65T和RS-GFP[40]。GFP作為報(bào)告基因無(wú)需底物,現(xiàn)象明顯易于觀察,反應(yīng)更敏感,成為轉(zhuǎn)基因斑馬魚(yú)報(bào)告基因的理想選擇(圖2)。2003年,新加坡國(guó)立大學(xué)宮之遠(yuǎn)教授成功將綠色、紅色、黃色和橙色熒光蛋白與肌肉特異性mylz-2啟動(dòng)子融合,成功構(gòu)建了在骨骼肌高度表達(dá)熒光蛋白的各色轉(zhuǎn)基因斑馬魚(yú)品系,日光和紫外燈下都可以肉眼觀察到轉(zhuǎn)基因斑馬魚(yú)發(fā)出熒光[41]。
由于胚胎體積小、透明度高、發(fā)育快等特點(diǎn),斑馬魚(yú)成為研究脊椎動(dòng)物基因表達(dá)調(diào)控和發(fā)育分化、形態(tài)發(fā)生、人類(lèi)疾病、藥物篩選和環(huán)境檢測(cè)等領(lǐng)域最重要的模式生物之一。
以斑馬魚(yú)為模式生物,利用轉(zhuǎn)基因技術(shù),科學(xué)家們對(duì)脊椎動(dòng)物熱生物學(xué)進(jìn)行了系統(tǒng)的研究,包括溫度對(duì)斑馬魚(yú)生長(zhǎng)發(fā)育、繁殖和性別分化的影響,溫度對(duì)生理節(jié)律、動(dòng)物行為的調(diào)節(jié),溫度對(duì)基因表達(dá)(如熱激蛋白)的影響等。此外,對(duì)生物鐘系統(tǒng)、細(xì)胞周期、神經(jīng)發(fā)育學(xué)都有廣泛的研究。孟安明,林碩[42]利用斑馬魚(yú)GATA-2基因5'側(cè)翼調(diào)控序列和GFP基因,獲得了只在中樞神經(jīng)細(xì)胞表達(dá)GFP或在神經(jīng)細(xì)胞和表層細(xì)胞都表達(dá)GFP的轉(zhuǎn)基因斑馬魚(yú)種系,同時(shí)還進(jìn)一步證實(shí)了GATA-2基因在胚胎發(fā)育中的時(shí)空表達(dá)譜。
為觀察胰外分泌腺細(xì)胞的分化、增殖和形態(tài)發(fā)生,用彈性蛋白酶A啟動(dòng)子調(diào)控GFP在斑馬魚(yú)胰腺外分泌腺中特異性表達(dá),發(fā)現(xiàn)胰腺在發(fā)育早期是一個(gè)緊密結(jié)合的實(shí)體,然后沿腸向后延伸[43]。Kawakami等[44]將GFP融合斑馬魚(yú)nanos1基因3' UTR,合成RNA后注射到幾種硬骨魚(yú)體內(nèi),成功觀察到原生殖細(xì)胞向生殖脊遷移,但是這種方法目前并不能適用于所有硬骨魚(yú)類(lèi)。
斑馬魚(yú)遺傳操作簡(jiǎn)單,已經(jīng)成功用于多種人類(lèi)疾病模型的構(gòu)建,在研究人類(lèi)疾病發(fā)病機(jī)理、治療手段等方面作出了卓越貢獻(xiàn)。例如,通過(guò)斑馬魚(yú)啟動(dòng)子表達(dá)顯性突變基因,構(gòu)建熒光重組體,瞬時(shí)過(guò)表達(dá)和反義基因敲除技術(shù)的應(yīng)用,對(duì)人類(lèi)中央核性疾病、亨廷頓舞蹈癥、多谷氨酰胺疾病和老年癡呆癥等多種疾病進(jìn)行了深入研究[45]。
Wan等[43]將elaA:gfp轉(zhuǎn)入猥因子接受缺陷型斑馬魚(yú)突變體slow muscle omitted,發(fā)現(xiàn)猥因子為外分泌腺形態(tài)發(fā)生所必需,但不影響細(xì)胞分化。對(duì)該轉(zhuǎn)基因品系進(jìn)行嗎菲林基因敲除和毒劑介導(dǎo)的細(xì)胞切除,發(fā)現(xiàn)胰腺外分泌腺發(fā)育依賴Islet-1基因。注射elaA啟動(dòng)子驅(qū)動(dòng)的白喉毒素DTA導(dǎo)致外分泌細(xì)胞選擇性消融,但內(nèi)分泌腺和其他內(nèi)胚層發(fā)育來(lái)的器官不受影響。該研究成功揭示了猥因子和白喉毒素對(duì)胰腺正常發(fā)育的重要影響?;驘晒鈽?biāo)記魚(yú)類(lèi)與反求遺傳學(xué)方法聯(lián)合起來(lái)可以分析在特殊的發(fā)育途徑中已知基因的作用規(guī)律。
近年來(lái),國(guó)內(nèi)外運(yùn)用轉(zhuǎn)基因斑馬魚(yú)檢測(cè)水體環(huán)境中的重金屬毒性、環(huán)境激素、綜合毒性和有機(jī)污染物毒性等,成效顯著,日益受到關(guān)注。目前主要通過(guò)3種途徑使用轉(zhuǎn)基因斑馬魚(yú)對(duì)環(huán)境污染物進(jìn)行監(jiān)測(cè)[46]。第一種方法是使用整合了大量大腸桿菌穿梭載體的轉(zhuǎn)基因斑馬魚(yú)檢測(cè)環(huán)境誘變劑,如以熒光定位的轉(zhuǎn)換來(lái)測(cè)試誘變劑的活性;第二種方法是使用受到不同環(huán)境污染物,如芳烴、重金屬或環(huán)境雌激素污染影響的啟動(dòng)調(diào)控元件,利用該元件誘導(dǎo)熒光或熒光酶的表達(dá);第三種方法是利用組織特異性表達(dá)的熒光魚(yú)篩選隨特殊發(fā)育途徑產(chǎn)生特殊作用的環(huán)境毒素。
在受熱、重金屬等壓力脅迫條件下,生物體細(xì)胞中的熱激蛋白HSP會(huì)在保護(hù)和修復(fù)途徑中發(fā)揮重要作用。Seok等[47]利用斑馬魚(yú)轉(zhuǎn)基因技術(shù)研究硫酸銅對(duì)人類(lèi)HSP70啟動(dòng)子的特異性激活,表明斑馬魚(yú)可以作為轉(zhuǎn)基因生物傳感器檢測(cè)環(huán)境中的異生毒性物質(zhì)。紀(jì)喜文等[48]構(gòu)建了一種GFP 轉(zhuǎn)基因斑馬魚(yú)報(bào)告系統(tǒng)。利用芳香烴反應(yīng)元件AHRDtk 控制報(bào)告基因綠色熒光蛋白在斑馬魚(yú)體內(nèi)的表達(dá),通過(guò)顯微鏡觀察轉(zhuǎn)基因斑馬魚(yú)體內(nèi)的綠色熒光表達(dá)情況,可以直觀判斷水環(huán)境中是否含有該類(lèi)化學(xué)物質(zhì)。上海復(fù)旦大學(xué)的研究人員[49]經(jīng)過(guò)多年研究,成功構(gòu)建了卵黃蛋白原1(vtg1)啟動(dòng)子調(diào)控綠色熒光蛋白表達(dá)的轉(zhuǎn)基因斑馬魚(yú)品系,可以簡(jiǎn)便直觀快速地監(jiān)測(cè)環(huán)境中的雌激素類(lèi)物質(zhì),如β-雌二醇(E2)、氯化鎘(CdCl2)、玉米烯酮和雌三醇(E3)等。
由于斑馬魚(yú)基因組為二倍體,目前鑒定到的許多同源基因,尚不能確定是真正的同源基因還是由于注釋不完整而對(duì)同一基因的不同解釋?zhuān)园唏R魚(yú)數(shù)據(jù)庫(kù)亟待完善。斑馬魚(yú)轉(zhuǎn)基因技術(shù)最主要的問(wèn)題仍然是基因轉(zhuǎn)化效率問(wèn)題。目前最可靠、最普遍的方法是顯微注射,該方法對(duì)操作人員的技術(shù)水平要求很高,在操作精確的條件下,轉(zhuǎn)化率最高也僅維持在30%左右。另一個(gè)問(wèn)題是嵌合體問(wèn)題。由于基因整合的隨機(jī)性和多樣性,轉(zhuǎn)基因魚(yú)親本是攜帶外源基因的嵌合體,外源基因在各個(gè)性腺細(xì)胞基因組內(nèi)的整合的數(shù)量與位點(diǎn)不盡相同,由此導(dǎo)致子代群體在攜帶外源基因(包括數(shù)量和整合位點(diǎn))上出現(xiàn)分離[33]。其他問(wèn)題包括因使用其他物種的啟動(dòng)子序列可能導(dǎo)致的轉(zhuǎn)基因沉默,外源基因整合位點(diǎn)的隨機(jī)性,外源基因整合形成多聯(lián)體等。
綜上所述,斑馬魚(yú)因具有體積小、代時(shí)短、胚胎透明、體外發(fā)育等獨(dú)特的優(yōu)勢(shì),使之成為轉(zhuǎn)基因動(dòng)物研究領(lǐng)域最重要的模式生物之一,在研究基因表達(dá)、發(fā)育調(diào)控、形態(tài)發(fā)生、細(xì)胞遷移、人類(lèi)疾病、發(fā)育毒素、環(huán)境監(jiān)測(cè)、藥物篩選等領(lǐng)域作出巨大貢獻(xiàn)。作為新型模式生物,轉(zhuǎn)基因斑馬魚(yú)在各領(lǐng)域得到廣泛應(yīng)用的同時(shí),其理論研究和操作技術(shù)都亟待發(fā)展:外源基因在斑馬魚(yú)胚胎細(xì)胞內(nèi)的重組機(jī)制尚不明確;基因轉(zhuǎn)化效率有待提高;轉(zhuǎn)基因斑馬魚(yú)體系的代系維持需要加強(qiáng),同時(shí)還需要尋找更加高效靈敏的報(bào)告基因。隨著研究理論和技術(shù)手段的日趨成熟,模式生物斑馬魚(yú)研究將引起更多關(guān)注并在更多的科學(xué)研究中發(fā)揮重要作用。
致謝:感謝中國(guó)科學(xué)院遺傳與發(fā)育生物學(xué)研究所吳乃虎研究員在本文寫(xiě)作過(guò)程中給予指導(dǎo)和修正;感謝北京大學(xué)生命科學(xué)院張博實(shí)驗(yàn)室在試驗(yàn)研究過(guò)程中給予大力支持與幫助。
[1] 郭炳冉.發(fā)育生物學(xué)模式生物[J].生物學(xué)教學(xué), 2008, 33(9):61-62.
[2] Müller B. Model organisms-A historical perspective[J]. Journal of Proteomics, 2010, 73(11):2054-2063.
[3] Lederberg J. Genetic recombination in Escherichia coli:disputation at Cold Spring Harbor, 1946-1996[J]. Genetics, 1996, 144(2):439-443.
[4] Hartwell LH. Yeast and cancer[J]. Bioscience Reports, 2004, 24(4-5):523-544.
[5] Yu ZY, Zhang J, Yin DQ. Toxic and recovery effects of copper on Caenorhabditis elegans by various food- borne and water- borne pathways[J]. Chemosphere, 2012, 87(11):1361-1367.
[6] Shi YC, Liao VHS, Pan TM. Monascin from red mold dioscorea as a novel antidiabetic and antioxidative stress agent in rats and Caenorhabditis elegans[J]. Free Radical Biology and Medicine, 2012, 52(1):109-117.
[7] Horvitz H. Worms, life, and death(Nobel lecture)[J]. Chembiochem, 2003, 4(8):697-711.
[8] Tatar M, Bartke A, Antebi A. The endocrine regulation of aging by insulin-like signals[J]. Science, 2003, 299(5611):1346-1351.
[9] Kenyon CJ. The genetics of ageing[J]. Nature, 2010, 464:504-512.
[10] Colon-Ramos DA. Synapse formation in developing neural circuits[J]. Current Topics in Developmental Biology, 2009, 87:53-79.
[11] Elliott SL, Sturgeon CR, Travers DM, Montgonery MC. Mode of bacterial pathogenesis determines phenotype in elt-2 and elt-7 RNAi Caenorhabditis elegans[J]. Developmental& Comparative Immunology, 2011, 35(5):521-524.
[12] Stahl Y, Simon R. Plant primary meristems:shared functions and regulatory mechanisms[J]. Current Opinion in Plant Biology, 2010, 13(1):53-58.
[13] Petricka JJ, Benfey PN. Root layers:complex regulation of developmental patterning[J]. Current Opinion in Genetics & Development, 2008, 18(4):354-361.
[14] Ryan CA, Huffaker A, Yamaguchi Y. New insights into innate immunity in Arabidopsis[J]. Cell Microbiol, 2007, 9(8):1902-1908.
[15] Mas P, Yanovsky M. Time for circadian rhythms:plants get synchronized[J]. Current Opinion in Plant Biology, 2009, 12(5):574-579.
[16] Alonso-Blanco C, Aarts M, Bentsink L, et al. What has natural variation taught us about plant development, physiology, and adaptation[J]. Plant Cell, 2009, 21(7):1877-1896.
[17] Dwinell MR, Lazar J, Geurts AM. The emerging role for rat models in gene discovery[J]. Mammalian Genome, 2011, 22(7-8):466-475.
[18] Hogan B. A shared vision[J]. Developmental Cell, 2007, 13(6):769-771.
[19] Gondo Y, Fukumura R, Murata T, et al. Next-generation gene targeting in the mouse for functional genomics[J]. Bmb Reports, 2009, 42:315-323.
[20] Nowotschin S, Eakin G, Hadjantonakis A. Live-imaging fluorescent proteins in mouse embryos:multi-dimensional, multi-spectral perspectives[J]. Trends in Biotechnology, 2009, 27(5):266-276.
[21] Chen S, Zhu Y, Xia W, et al. Automated analysis of zebrafish images for phenotypic changes in drug discovery[J]. Journal of Neuroscience Methods, 2011, 200(2):229-236.
[22] Nathan DL, Wolfe SA. Forward and reverse genetic approaches for the analysis of vertebrate development in the zebrafish[J]. Developmental Cell, 2011, 21(1):48-64.
[23]http://zfin.org/action/fish/search.
[24] Long Y, Li Q, Zhong S, et al. Molecular characterization and functions of zebrafish ABCC2 in cellular efflux of heavy metals[J]. Comparative Biochemistry and Physiology, Part C, 2011, 153(4):381-391.
[25] Xu X, Zhang L, Weng S, et al. A zebrafish(Danio rerio)model of infectious spleen and kidney necrosis virus(ISKNV)infection[J]. Virology, 2008, 376(1):1-12.
[26] Williams A, Sarkar S, Cuddon P, et al. Novel targets for Huntington's disease in an mTOR-independent autophagy pathway[J]. Nature Chemical Biology, 2008, 4:295-305.
[27] Hill AJ, Teraoka H, Heideman W, et al. Zebrafish as a model vertebrate for investigating chemical toxicity[J]. Toxicological Sciences, 2005, 86(1):6-19.
[28] Prouty MG, Correa NE, Barker LP, et al. Zebrafish-Mycobacterium marinum model for mycobacterial pathogenesis[J]. FEMS Microbiology Letters, 2003, 225(2):177-182.
[29] Fleming A, Rubinsztein DC. Zebrafish as a model to understand autophagy and its role in neurological disease[J]. Biochimica et Biophysica Acta, 2011, 1812:520-526.
[30] McGonnell IM, Fowkes RC. Fishing for gene function—endocrine modelling in the zebrafish[J]. Journal of Endocrinology, 2006, 189:425-439.
[31] Lawrence C. Advances in zebrafish husbandry and management[J]. Methods in Cell Biology, 2011, 104:429-451.
[32] Spence R, Gerlach G, Lawrence C, et al. The behavior and ecology of the zebrafish, Danio rerio[J]. Biological Reviews, 2008, 83:13-34.
[33] 朱作言, 許克圣, 謝岳峰, 等.轉(zhuǎn)基因魚(yú)模型的建立[J].中國(guó)科學(xué)B輯, 1989, 2:147-155.
[34] Udvadia AJ, Linney E. Windows into development:historic, current, and future perspectives on transgenic zebrafish[J]. Development Biology, 2003, 256(1):1-17.
[35] 陳建泉, 成國(guó)祥, 徐少甫.顯微注射外源DNA在早期胚胎中的命運(yùn)[J].細(xì)胞生物學(xué)雜志, 1999, 21:23-26.
[36] Akitake CM, Macurak M, Halpern ME, Goll MG. Transgenerational analysis of transcriptional silencing in zebrafish[J]. Developmental Biology, 2011, 352(2):191-201.
[37] Asakawa K, Kawakami K. The Tol2-mediated Gal4-UAS method for gene and enhancer trapping in zebrafish[J]. Methods, 2009, 49(3):275-281.
[38] Linney E, Hardison NL, Lonze BE. Transgene expression in zebrafish:a comparison of retroviral-vector and DNA-injection approaches[J]. Developmental Biology, 1999, 213(1):207-216.
[39] Huang F, Cao S, Cui X, et al. Efficient gene delivery into fish cells by an improved recombinant baculovirus[J]. Journal of Virological Methods, 2011, 173(2):294-299.
[40] 林愛(ài)星, 劉小軍, 陳永福.綠色熒光蛋白及其在轉(zhuǎn)基因表達(dá)檢測(cè)中的應(yīng)用[J].農(nóng)業(yè)生物技術(shù)學(xué), 1997, 5:280-285.
[41] Gong Z, Wan H, Tay TL, et al. Development of transgenic fish for ornamental and bioreactor by strong expression of fluorescent proteins in the skeletal muscle[J]. Biochemical and Biophysical Research Communications, 2003, 308(1):58-63.
[42] 孟安明, 林碩.利用GATA-2調(diào)控成分制備組織特異性表達(dá)GFP的轉(zhuǎn)基因斑馬魚(yú)[J].科學(xué)通報(bào), 1999, 21:2283-2287.
[43] Wan H, Korzh S, Li Z, et al. Analyses of pancreas development by generation of gfp transgenic zebrafish using an exocrine pancreasspecific elastaseA gene promoter[J]. Experimental Cell Research, 2006, 312(9):1526-1539.
[44] Kawakami Y, Saito T, Fujimoto T, et al. Visualization and motility of primordial germ cells using green fluorescent protein fused to 3'UTR of common carp nanos-related gene[J]. Aquaculture, 2011, 317(1-4):245-250.
[45] Fleming A, Rubinsztein DC. Zebrafish as a model to understand autophage and its role in neurological disease[J]. Biochimica et Biophysica Acta, 2011, 1812(4):520-526.
[46] 吳玉萍, 熊茜, 張廣獻(xiàn), 等.斑馬魚(yú)基因工程的研究進(jìn)展[J].遺傳學(xué)報(bào), 2004, 31(10):1167-1174.
[47] Seok SH, Park JH, Baek MW. Specific activation of the human HSP70 promoter by copper sulfate in mosaic transgenic zebrafish[J]. Journal of Biotechnology, 2006, 126(3):406-413.
[48] 紀(jì)喜文, 田雪, 徐殿勝.一種新型轉(zhuǎn)基因斑馬魚(yú)毒物檢測(cè)系統(tǒng)的建立[J].化學(xué)與生物工程, 2010, 9:69-72.
[49] Chen H, Hu J, Yang J, et al. Generation of a fluorescent transgenic zebrafish for detection of environmental estrogens[J]. Aquatic Toxicology, 2010, 96(1):53-61.