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上海地區(qū)小鼠諾瓦克病毒的檢測分析及病毒分離

2014-02-06 06:27劉芹魏曉鋒田立立高誠2
關(guān)鍵詞:陽性率陽性樣本

劉芹,魏曉鋒,田立立,高誠2,

(1.復(fù)旦大學(xué),上海 200032;2.上海市計(jì)劃生育科學(xué)研究所,上海 200032;3.上海實(shí)驗(yàn)動(dòng)物研究中心,上海 201203)

諾瓦克病毒(Norwalk-like viruses,NLV),也稱為諾如病毒(Noroviruses,NVs)或小圓結(jié)構(gòu)病毒(Small round structured virus),是一種高致病性、低致病劑量病毒[1],該病毒于1972 年由Kapikian[2]應(yīng)用免疫電鏡(IEM)從患者糞便標(biāo)本中首次找到致病病毒顆粒,將其命名為諾瓦克病毒(Norwalk viruses,NVs)。

小鼠諾瓦克病毒(MNV)屬于杯狀病毒科,諾如病毒屬,無包膜,呈線性,是單股正鏈RNA 病毒[3],基因組RNA 長約7.4 kb,3’端有一個(gè)多聚A 尾結(jié)構(gòu),5’端共價(jià)連接病毒蛋白VPg[4]。NVs 的RNA 基因組由三個(gè)主要的開放閱讀框(Open Reading Frames,ORFs)組成[5,6]。據(jù)文獻(xiàn)報(bào)道小鼠諾瓦克病毒(Murine norovirus,MNV)是目前發(fā)現(xiàn)的第一個(gè)能在細(xì)胞內(nèi)增殖的諾瓦克病毒,它既可以在原代巨噬細(xì)胞和樹突狀細(xì)胞內(nèi)生長,也可以在傳代細(xì)胞小鼠巨噬細(xì)胞系RAW264.7 細(xì)胞內(nèi)生長并產(chǎn)生細(xì)胞病變效應(yīng)(cytopathic effects,CPE)[7],同時(shí),MNV 被認(rèn)為是實(shí)驗(yàn)小鼠內(nèi)流行最廣泛的一種病毒,其在小鼠中的感染率是排在第二位的細(xì)小病毒的10 倍[8]。目前國內(nèi)對(duì)MNV 的相關(guān)研究較少,2010 年袁文等[9]對(duì)廣東省內(nèi)7 個(gè)小鼠繁育設(shè)施進(jìn)行了MNV 感染情況的調(diào)查,陽性率為37.38%,這是國內(nèi)首次有關(guān)實(shí)驗(yàn)小鼠攜帶MNV 的報(bào)道。本實(shí)驗(yàn)利用RTPCR 方法及ELISA 方法對(duì)上海地區(qū)各實(shí)驗(yàn)動(dòng)物生產(chǎn)或使用機(jī)構(gòu)送檢小鼠的MNV 感染狀況進(jìn)行調(diào)查研究,并對(duì)兩種檢測方法的結(jié)果進(jìn)行分析比較。

1 材料和方法

1.1 動(dòng)物、MNV 毒株及細(xì)胞

動(dòng)物:上海地區(qū)實(shí)驗(yàn)動(dòng)物生產(chǎn)或使用單位委托上海市實(shí)驗(yàn)動(dòng)物質(zhì)量監(jiān)督檢驗(yàn)站檢測的實(shí)驗(yàn)小鼠,采樣時(shí)間為2012 年11 月至2013 年8 月,共13 家檢測單位的319 只SPF 級(jí)小鼠。MNV 毒株(MNV strain Guangzhou/K162/09/CHN, GenBank 序 列 號(hào):HQ317203.1)由廣東省實(shí)驗(yàn)動(dòng)物監(jiān)測所贈(zèng)送。實(shí)驗(yàn)所用RAW264.7 細(xì)胞株購自中國科學(xué)院上海細(xì)胞庫。

1.2 主要試劑

AMV 反轉(zhuǎn)錄酶,recombinant RNase inhibitor(RRI),dNTP(2.5/10 mmol/L),Oligo d(T)18Primer,rTaq DNA 聚合酶,DNA 分子量marker 等購自Takara 公司;病毒RNA 提取試劑盒(QIAamp Viral RNA Mini Kit)購自Qiagen 公司;ELISA 試劑盒購自Biotech Trading Partners(SMART-M35,美國);DMEM、FBS、Pen-Strep 購自美國GIBCO 公司。

1.3 RT-PCR 方法

1.3.1 樣本采集及處理

小鼠安樂死后,無菌采集約米粒大小的小鼠盲腸內(nèi)容物,置于去RNA 酶的1.5 mL 離心管內(nèi),加入400 μL DEPC 水配置的無菌PBS 溶液,震蕩渦旋30 s,4000 g/min 離心20 min,取上清液經(jīng)0.22 μm的濾膜過濾待用。

1.3.2 RNA 提取

按照QIAamp Viral RNA Mini Kit 試劑盒說明書進(jìn)行操作,提取所采集盲腸內(nèi)容物樣本總RNA,取預(yù)處理樣本140 μL,最終得到60 μL 總RNA,測量RNA 濃度,-80℃保存?zhèn)溆谩?/p>

1.3.3 引物

根據(jù)文獻(xiàn)[10]報(bào)道,由Invitrogen(上海)公司合成,上游引物F:CAGATCACATGCTTCCCAC,下游引物R :AGACCACAAAAGACTCATCAC,引物位于MNV 序列保守區(qū)域衣殼蛋白基因ORF2 編碼區(qū)位置,其擴(kuò)增產(chǎn)物大小為187 bp(5473-5659nt)。

1.3.4 反轉(zhuǎn)錄

在去RNA 酶的0.2 mL 離心管內(nèi)依次加入如下試劑:模板RNA 4 μL,5 × AMV buffer 4 μL,dNTP(10 mmol/L)2 μL,RRI 0.5 μL,AMV 1μL,Oligo d(T)181μL,DEPC-H2O 補(bǔ)足反應(yīng)體系至20 μL。混勻后室溫放置10 min,42℃水浴1 h,置冰上冷卻2 min,得到的反應(yīng)產(chǎn)物即為cDNA。

1.3.5 PCR

以反轉(zhuǎn)錄得到的cDNA 為模板進(jìn)行PCR 擴(kuò)增,在一無菌的0.2 mL 離心管內(nèi)依次加入cDNA 模板4 μL,10 ×PCR buffer(Mg2+free)2 μL,dNTP(2.5 mmol/L)1.6 μL,MgCl21.2 μL,上下游引物F/R(20 μmol/L)各0.4 μL,rTaq DNA 聚合酶0.2 μL,滅菌ddH2O 補(bǔ)足反應(yīng)體系至20 μL,混勻。95℃預(yù)變性5 min,然后94℃變性30 s,60℃退火30 s,72℃延伸30 s,共35 個(gè)循環(huán),最后72℃延伸10 min。每次反應(yīng)均以ddH2O 替代模板cDNA 做陰性對(duì)照,以廣東MNV 毒株為陽性對(duì)照進(jìn)行RT-PCR 擴(kuò)增。

1.3.6 凝膠電泳及測序

取PCR 產(chǎn)物在1%瓊脂糖凝膠電泳,純化回收陽性產(chǎn)物,并送上海生工生物工程技術(shù)服務(wù)有限公司進(jìn)行序列測定,用NCBI 的BLAST 軟件對(duì)測序結(jié)果進(jìn)行分析。

1.4 血清學(xué)方法

1.4.1 樣本處理

無菌條件下采用摘眼球法采集小鼠血液,室溫靜置2 h,3000 r/min 離心10 min,小心將上層血清吸出分裝,-20℃儲(chǔ)存?zhèn)溆谩?/p>

1.4.2 酶聯(lián)免疫吸附試驗(yàn)

參考相關(guān)文獻(xiàn)[11],采用美國Biotech Trading Partners 公司的ELISA 試劑盒(SMART-M35),按照試劑盒說明書進(jìn)行操作:取經(jīng)RT-PCR 檢測小鼠中的180 份凍存血清進(jìn)行檢測,血清樣本及試劑盒內(nèi)的標(biāo)準(zhǔn)液均作50 倍稀釋,陰陽性對(duì)照不稀釋,孵育30 min,洗板,加酶結(jié)合物孵育30 min,洗板,加底物顯色10 min,加入終止液輕拍混勻,用酶標(biāo)儀測450 nm光吸收值并分析結(jié)果。

1.5 病毒分離

取2 個(gè)RT-PCR 檢測結(jié)果為陽性的樣本進(jìn)行病毒分離。復(fù)蘇RAW264.7 細(xì)胞,用含10%胎牛血清、100 U/mL 青霉素、100 μg/mL 鏈霉素的DMEM 培養(yǎng)液傳代培養(yǎng)。待細(xì)胞在24 h 內(nèi)長滿培養(yǎng)瓶90%左右時(shí),棄去原來的培養(yǎng)液,并用DMEM 沖洗兩次,將糞便樣本用PBS 溶液稀釋并通過0.22 μm 濾膜過濾,取100 μL 濾液輕輕覆蓋在細(xì)胞表面,放37℃5% CO2的培養(yǎng)箱內(nèi)孵育1 h,期間每隔15 min 輕輕晃動(dòng)培養(yǎng)瓶,防止細(xì)胞表面干涸。1 h 后棄去接種病毒液,立即加入含4%胎牛血清的DMEM 維持液并于培養(yǎng)箱內(nèi)培養(yǎng),72 h 內(nèi)觀察細(xì)胞是否出現(xiàn)CPE。因樣本中可能含有其他致細(xì)胞病變物質(zhì),可將細(xì)胞凍融三次后的過濾液繼續(xù)進(jìn)行盲傳,待細(xì)胞能在24~72 h 內(nèi)出現(xiàn)穩(wěn)定的CPE 時(shí),將細(xì)胞凍融三次后回收病毒并用RT-PCR方法鑒定,保存在-80℃。

1.6 統(tǒng)計(jì)學(xué)處理

應(yīng)用SPSS 13.1 版本統(tǒng)計(jì)學(xué)軟件,計(jì)數(shù)資料比較采用χ2檢驗(yàn),計(jì)量資料以±s 表示,比較采用t 檢驗(yàn),P<0.05 表示差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義。

2 結(jié)果

2.1 PCR 產(chǎn)物電泳及測序結(jié)果

PCR 產(chǎn)物電泳,在凝膠成像系統(tǒng)下觀察,陽性樣本在187 bp 處顯示目的條帶,與陽性對(duì)照位置一致(圖1)。送上海生物工程技術(shù)服務(wù)有限公司進(jìn)行測序,PCR 產(chǎn)物大小為187 bp。應(yīng)用NCBI 的BLAST 軟件對(duì)測序結(jié)果進(jìn)行分析顯示,與GenBank 中登陸的廣州株(HQ317203)核酸同源性為99.5%(圖2),由此可證實(shí)引物擴(kuò)增的片段為MNV 基因片段,陽性檢測結(jié)果的小鼠有MNV 感染。GenBank 中登陸的MNV毒株多為歐美國家,也有亞洲的韓國、日本、中國臺(tái)灣,中國大陸登錄株為廣州株(HQ317203)。

圖1 部分樣本RT-PCR 電泳結(jié)果Note:M:DNA marker DL2000;Lane 1-12:samples;Lane 13:positive control;Lane14:negative controlFig.1 Electrophoresis of RT-PCR products from some samples

2.2 RT-PCR 檢測結(jié)果

RT-PCR 檢測的319 份盲腸內(nèi)容物樣本中95 份為陽性,陽性率為29.78%。13 家送檢單位的實(shí)驗(yàn)小鼠均有MNV 檢出,陽性率最低為11.11%,最高為91.67%,卡方檢驗(yàn)分析顯示不同送檢單位之間的MNV 自然感染率差異有顯著性(P<0.05)(表1)。近交系、封閉群、免疫缺陷小鼠和基因工程小鼠均有MNV 感染,不同品系的實(shí)驗(yàn)小鼠之間MNV感染狀況也不同,卡方檢驗(yàn)分析顯示不同品系小鼠之間的MNV 自然感染率差異有顯著性(P<0.05),其中ICR 小鼠陽性率最高(47.13%),而免疫缺陷小鼠陽性率最低(13.95%)(表2)。

2.3 ELISA 檢測結(jié)果

ELISA 檢測的180 份血清樣本中有70 份血清抗體陽性,陽性率為38.89%。11 家送檢單位均有抗體陽性檢出,陽性率在14.29%到75%之間,卡方檢驗(yàn)分析顯示不同送檢單位之間的MNV 抗體陽性率差異有顯著性(P<0.05)(表1)。不同品系小鼠間MNV 抗體陽性率差異有顯著性(P<0.05),封閉群ICR 小鼠MNV 抗體陽性率最高(71.05%),免疫缺陷小鼠陽性率最低(25%)(表2)。

2.4 共同檢測結(jié)果

在同時(shí)經(jīng)過RT-PCR 擴(kuò)增和ELISA 檢測的180只小鼠中,陽性小鼠分別為45 只和70 只,陽性率分別為25%和38.89%,兩種方法同為陽性的有34只,陽性率為18.89%。

2.5 病毒分離結(jié)果

陽性樣本經(jīng)RAW264.7 細(xì)胞盲傳至第5 代,接種病毒液的細(xì)胞與未接毒的細(xì)胞相比,在24 h 內(nèi)出現(xiàn)CPE,72 h 內(nèi)CPE 逐漸明顯,主要表現(xiàn)為細(xì)胞變圓,變大,接觸抑制消失,而未接毒的細(xì)胞逐漸脫落死亡(圖3,見彩插8)。細(xì)胞凍融3 次之后,接毒后的細(xì)胞培養(yǎng)物經(jīng)RT-PCR 方法,在187 bp 處出現(xiàn)預(yù)期目的條帶,測序結(jié)果顯示與組織樣本擴(kuò)增測序結(jié)果一致,而未接毒的對(duì)照細(xì)胞凍融液無目的條帶(圖4)。

圖2 與廣州株(HQ317203)的序列對(duì)比結(jié)果Fig.2 Alignment results of DNA fragments with HQ317203

表1 各送檢單位小鼠MNV 的感染情況Tab.1 MNV infection of different tested units

表2 不同品系小鼠MNV 感染情況Tab.2 MNV infection in mice of different strains

圖4 RAW264.7 細(xì)胞凍融液RT-PCR 結(jié)果Note:M:DNA marker DL2000;Lane 1-2:inoculated with stool filtrate(72 h);Lane 3:un-inoculated with stool filtrate(72 h);Lane 4:positive control;Lane 5:negative control.Fig.4 RT-PCR results of RAW 264.7 cells freezethaw liquid

3 討論

2003 年,Karst[12]等在信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)蛋白和轉(zhuǎn)錄激活因子(STAT1)以及重組體激活基因2(RAG2)缺陷(RAG/STAT1-/-)小鼠中首次發(fā)現(xiàn)并分離得到MNV,并將其命名為MNV-1,MNV-1 可以導(dǎo)致RAG/STAT1-/-小鼠發(fā)生致死性感染,病變主要有腦炎、腦膜炎、腦脈管炎、肝炎和肺炎,并且MNV-1在干擾素α、β、γ 受體陰性(IFN-αβγR-/-)小鼠內(nèi)較野生型小鼠內(nèi)表現(xiàn)出更強(qiáng)的毒力,而在免疫功能正常小鼠內(nèi)通常無明顯臨床癥狀。自MNV-1 發(fā)現(xiàn)之后,各地又陸續(xù)分離得到其他多個(gè)MNV 毒株,不同的MNV 毒株會(huì)導(dǎo)致不同程度的腸道病變及CPE等[13]。

本研究分別采用核酸檢測和血清學(xué)檢測兩種方法對(duì)上海地區(qū)實(shí)驗(yàn)動(dòng)物生產(chǎn)或使用單位送檢的SPF小鼠進(jìn)行了MNV 自然感染狀況的調(diào)查。結(jié)果顯示各送檢單位小鼠均有MNV 感染,采用RT-PCR 核酸檢測的陽性率為29.78%,ELISA 檢測的血清抗體陽性率為38.89%,由此可見上海地區(qū)實(shí)驗(yàn)小鼠普遍存在MNV 的自然感染,檢測結(jié)果顯示不同品系的實(shí)驗(yàn)小鼠均有陽性結(jié)果檢出,這一方面說明感染的普遍性,另一方面也說明MNV 的感染或許與動(dòng)物飼養(yǎng)環(huán)境、飼養(yǎng)密度等相關(guān)。MNV 屬于RNA 病毒,在自身增殖過程中較易發(fā)生突變,如果突變發(fā)生在與病毒毒力相關(guān)的減毒位點(diǎn),則容易引起動(dòng)物的持續(xù)性感染[14]。所以應(yīng)該加強(qiáng)實(shí)驗(yàn)動(dòng)物飼養(yǎng)管理,及時(shí)處理發(fā)生病變或病原感染的實(shí)驗(yàn)動(dòng)物,保證實(shí)驗(yàn)動(dòng)物的質(zhì)量。

Hsu[15]建立了一種高通量的新型血清學(xué)檢測方法——流式熒光微球檢測技術(shù),檢測小鼠血清中MNV 抗體,密蘇里大學(xué)的實(shí)驗(yàn)動(dòng)物檢測中心從美國和加拿大的研究機(jī)構(gòu)送檢的實(shí)驗(yàn)小鼠(n =12639)血清樣本中,經(jīng)復(fù)用熒光免疫測定(Multiplexed fluorescent immunoassay,MFI)測得血清抗MNV-1 抗體陽性率為22.1%。本實(shí)驗(yàn)檢測的319 只實(shí)驗(yàn)小鼠中,有180 只小鼠既采用RT-PCR 擴(kuò)增,同時(shí)又對(duì)血清進(jìn)行了ELISA 檢測,結(jié)果顯示通過RT-PCR 擴(kuò)增為陽性的有45 只,通過ELISA 檢測為陽性的有70只,兩種檢測方法均顯示為陽性的有34 只。ELISA檢出率比RT-PCR 方法稍高,共同檢出率比單獨(dú)檢出率略低,出現(xiàn)這種情況可能與以下因素相關(guān):一是與小鼠感染MNV 的時(shí)間、感染量和樣本種類有關(guān),MNV 屬于腸道病毒,RT-PCR 僅檢測盲腸內(nèi)容物中的病毒核酸。Hsu[15]通過人工灌胃的方法造成10只小鼠感染MNV,分別收集0-7d 的糞便,結(jié)果發(fā)現(xiàn)第1 天時(shí)全部呈現(xiàn)陽性,第7 天時(shí)僅有兩只為陽性。也有研究表明小鼠感染MNV 后8 周仍可在糞便中檢測到病毒核酸,感染具有很強(qiáng)的持續(xù)性[10,12]。ELISA 法用于檢測血清抗體,當(dāng)小鼠感染MNV 后,體內(nèi)抗體的形成需要一定時(shí)間,Hsu[10]通過人工灌胃法造成10 只小鼠感染MNV,利用MFI法檢測小鼠血清中MNV 抗體,結(jié)果發(fā)現(xiàn)第1 周有兩只小鼠處于臨界值范圍,其余8 只呈陰性;第2~5周有7 只處于臨界值或呈陽性。因?yàn)閮煞N檢測方法不同,所檢測的對(duì)象不同,所以檢出率會(huì)出現(xiàn)一定差異。在感染初期,免疫抗體尚未產(chǎn)生時(shí)可以采用RT-PCR 檢測病毒核酸,感染2 周后可以采用ELISA方法檢測血清中的抗體。二是核酸檢測與實(shí)驗(yàn)操作過程緊密相關(guān),如果糞便樣本處理不當(dāng)或樣本中病毒量過少,RT-PCR 方法可能出現(xiàn)假陰性。所以兩種方法相結(jié)合可以從一定程度上提高檢出率。另外需要注意的是,免疫缺陷小鼠亦有MNV 病毒核酸和血清抗體陽性的檢出,這或許暗示MNV 感染與機(jī)體的免疫系統(tǒng)相關(guān),有待進(jìn)一步研究MNV 感染的機(jī)制。

袁文等[9]對(duì)廣東省實(shí)驗(yàn)小鼠感染MNV 的調(diào)查中,近交系、封閉群、免疫缺陷小鼠的陽性率均在60%以上。本實(shí)驗(yàn)中檢測的實(shí)驗(yàn)小鼠各品系也均存在MNV 感染,卡方檢驗(yàn)分析MNV 的感染率差異有顯著性,兩種檢測方法結(jié)果顯示ICR 小鼠感染MNV的陽性率最高,免疫缺陷小鼠的陽性率最低(表2),這可能與免疫缺陷小鼠的飼養(yǎng)環(huán)境更加嚴(yán)格有關(guān)。

CPE 是病毒在細(xì)胞內(nèi)增殖及其對(duì)細(xì)胞產(chǎn)生損害的最明顯表現(xiàn),不同病毒作用于不同細(xì)胞會(huì)產(chǎn)生特異性CPE,組織培養(yǎng)細(xì)胞內(nèi)CPE 的出現(xiàn),一般可以認(rèn)為是病毒增殖的確切證據(jù),接種物內(nèi)的非特異性毒性物質(zhì)導(dǎo)致的非特異性CPE 在盲傳過程中可消失,而病毒可由于其對(duì)細(xì)胞培養(yǎng)物的適應(yīng)導(dǎo)致CPE提前出現(xiàn),病變更明顯[16]。本實(shí)驗(yàn)RAW264.7 細(xì)胞接種陽性盲腸內(nèi)容物后,經(jīng)過盲傳至第5 代,細(xì)胞在24h 內(nèi)出現(xiàn)CPE,72h 內(nèi)逐漸明顯,與MNV-1 致CPE 表現(xiàn)[17]相似,細(xì)胞變圓、變大、接觸抑制消失。同時(shí)接種病毒液后的細(xì)胞培養(yǎng)物經(jīng)RT-PCR 鑒定得到187bp 的目的條帶,未接種病毒的細(xì)胞培養(yǎng)物無目的條帶,說明成功分離到病毒毒株,但為排除其他腸道病原體的存在,需進(jìn)一步采用蝕斑純化方法,挑取單克隆進(jìn)行病毒純化。

目前MNV 感染的小鼠對(duì)動(dòng)物實(shí)驗(yàn)有何影響尚無定論,但是國外相關(guān)實(shí)驗(yàn)動(dòng)物機(jī)構(gòu)如Charles River,Harlan 等已越來越重視對(duì)實(shí)驗(yàn)小鼠MNV 的監(jiān)測,并已開發(fā)出相應(yīng)的檢測方法。國內(nèi)一些CRO 公司也要求實(shí)驗(yàn)動(dòng)物檢測機(jī)構(gòu)能開展對(duì)MNV 的檢測。本文通過對(duì)上海地區(qū)MNV 感染狀況的調(diào)查,在一定程度上了解了國內(nèi)MNV 的感染狀況。同時(shí)本研究建立的檢測方法可在實(shí)驗(yàn)動(dòng)物生產(chǎn)單位和使用單位中推廣應(yīng)用,為進(jìn)一步補(bǔ)充完善實(shí)驗(yàn)動(dòng)物質(zhì)量控制體系提供技術(shù)支持,促進(jìn)實(shí)驗(yàn)動(dòng)物事業(yè)的健康發(fā)展。另外,全世界范圍內(nèi)90%以上的非細(xì)菌性胃腸炎是由人諾瓦克病毒(Human Norovirus,HuNV)引起的[12],由于HuNV 缺乏有效的細(xì)胞培養(yǎng)體系及實(shí)驗(yàn)動(dòng)物模型,無法在體外進(jìn)行增殖,相關(guān)研究受到限制,而MNV 與HuNV 在基因組大小、結(jié)構(gòu)和功能、病毒粒子大小(直徑28~35 nm)、形狀、浮力密度、致病癥狀以及在自然界的傳播方式(主要通過糞口途徑傳播)等[18]方面有一定的相似性,MNV 可以作為HuNV 的研究模型,通過對(duì)MNV 的研究,有助于開展對(duì)HuNV 的研究,可以指導(dǎo)治療及預(yù)防HuNV 引起的胃腸炎,減少由HuNV 感染導(dǎo)致的醫(yī)療損失。

(本文圖3 見彩插8)。

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