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國外開放資源建設(shè)案例研究

2014-07-12 17:10:22陳雪飛黃金霞
數(shù)字圖書館論壇 2014年12期
關(guān)鍵詞:出版物資助資源

陳雪飛,黃金霞

(中國科學(xué)院文獻(xiàn)情報(bào)中心,北京 100190)

國外開放資源建設(shè)案例研究

陳雪飛,黃金霞

(中國科學(xué)院文獻(xiàn)情報(bào)中心,北京 100190)

開放資源建設(shè)是資源建設(shè)的重要內(nèi)容之一,也是未來的發(fā)展方向。文章闡述了開放資源建設(shè)的內(nèi)涵,以歐盟委員會和NIH作為樣本機(jī)構(gòu),選取4個(gè)有影響力的開放資源建設(shè)案例進(jìn)行研究,對樣本案例從資源機(jī)制、服務(wù)機(jī)制、政策機(jī)制3個(gè)方面進(jìn)行了考察。最后對樣本案例的經(jīng)驗(yàn)進(jìn)行了總結(jié),提出擴(kuò)大資源類型、進(jìn)行聯(lián)盟建設(shè)、開發(fā)知識服務(wù)及產(chǎn)品的建議。

開放獲取資源;資源建設(shè);OPENAIRE;Zenedo;REPORTER;PMC

在數(shù)字網(wǎng)絡(luò)技術(shù)的推動下,用戶對信息資源的需求越來越趨于數(shù)字化、開放化、知識化,科技學(xué)術(shù)論文開放獲取迅速成為學(xué)術(shù)交流主流模式之一,開放數(shù)據(jù)正成為政府?dāng)?shù)據(jù)和科研數(shù)據(jù)的基本準(zhǔn)則,開放信息開始成為新一代科技知識基礎(chǔ)資源[1]。歐盟研究與創(chuàng)新董事會發(fā)布的報(bào)告稱,科研文獻(xiàn)的開放獲取要比預(yù)想的增長得更快,2011年發(fā)表的大約50%的論文現(xiàn)在都可以在線免費(fèi)獲取,全球科研成果正在向開放獲取方式轉(zhuǎn)變[2]。布達(dá)佩斯宣言相關(guān)組織召開會議,明確提出10年后在世界上的任何國家或地區(qū)任何學(xué)科領(lǐng)域的同行評議學(xué)術(shù)論文均實(shí)現(xiàn)開放存儲與開放獲取[3]??梢源_定的是,當(dāng)前的學(xué)術(shù)信息資源建設(shè)正面臨開放信息環(huán)境的挑戰(zhàn)和機(jī)遇。

為了迎合這一趨勢,包括圖書館在內(nèi)的組織和機(jī)構(gòu)開始啟動建設(shè)開放資源服務(wù)設(shè)施和系統(tǒng),開放資源建設(shè)從創(chuàng)新期、鞏固期、持續(xù)期發(fā)展到目前的戰(zhàn)略期,OA相關(guān)問題已經(jīng)能放到國家層面上討論和解決,科研資助者、OA組織轉(zhuǎn)為支持更深層次的OA知識服務(wù)[4],開放資源建設(shè)在實(shí)踐方面已經(jīng)積累了眾多優(yōu)秀的經(jīng)驗(yàn)。本文在闡述開放資源建設(shè)范疇的基礎(chǔ)上,從建設(shè)機(jī)構(gòu)角度選取國外若干開放資源建設(shè)案例進(jìn)行考察,以期為我國開展開放資源建設(shè)工作提供借鑒。

1 開放資源建設(shè)的內(nèi)涵

開放學(xué)術(shù)信息資源體系涵蓋的資源內(nèi)容,從來源角度,包括開放狀態(tài)的數(shù)字化學(xué)術(shù)信息資源以及用戶創(chuàng)造的資源(UCC)等;從載體類型角度,包括開放期刊、機(jī)構(gòu)知識庫、開放會議、開放課件、開放報(bào)告、行業(yè)信息、產(chǎn)業(yè)信息、科學(xué)數(shù)據(jù)、科研工具、儀器設(shè)備以及廣泛的經(jīng)濟(jì)社會和法律信息資源等[5]。Peter Suber認(rèn)為,原則上任何內(nèi)容都可以O(shè)A,只是資源類型不同,OA的操作難度也不同。Peter Suber列舉了已經(jīng)有成功OA案例的一些學(xué)術(shù)信息資源,包括同行評議論文、預(yù)印本、學(xué)位論文、研究數(shù)據(jù)、政府?dāng)?shù)據(jù)、源碼、會議資源、學(xué)術(shù)專著、教科書、新聞、存檔記錄和手稿、圖像、開放教育資源以及數(shù)字化印本資源[6]。

從Peter Suber的觀點(diǎn)來看,開放資源的數(shù)量將不可估量。除了常規(guī)出版物外,非常規(guī)信息資源的開放獲取與利用也漸受重視,例如實(shí)驗(yàn)日志的開放存儲[7]、開放獲取基因組計(jì)劃的誕生[8]等,科研過程中產(chǎn)生的海量科學(xué)數(shù)據(jù),互聯(lián)網(wǎng)上以TB為單位的開放資源,在大數(shù)據(jù)時(shí)代的推動下成為開放的可計(jì)算的知識。美國政府開發(fā)運(yùn)營的開放政府?dāng)?shù)據(jù)網(wǎng)站data.gov體現(xiàn)了大數(shù)據(jù)時(shí)代所需要的基本特征:數(shù)以十萬計(jì)的開放數(shù)據(jù)庫,數(shù)以千計(jì)的數(shù)據(jù)分析工具,對任何第三方開放,歡迎來自其他國家、企業(yè)和個(gè)人的參與建設(shè)和創(chuàng)新[9]。

開放資源的開放性、規(guī)模性、復(fù)雜性,導(dǎo)致開放資源的建設(shè)不能搞“數(shù)據(jù)獨(dú)占”,必須支持全流程的開放性建設(shè)。因此,開放資源建設(shè)是對涵蓋所有在線可開放獲取資源的獲取與組織、評價(jià)與遴選、管理與開放存儲、開放許可與開放重用的過程,這一過程涉及資源、服務(wù)、政策、技術(shù)規(guī)范4方面的因素。其中“資源”是解決建設(shè)對象的問題,“服務(wù)”是解決實(shí)現(xiàn)功能的問題,政策屬于開放建設(shè)中的頂層設(shè)計(jì),是解決建設(shè)全流程管理的問題,“技術(shù)規(guī)范”是解決如何實(shí)現(xiàn)其他三個(gè)因素的問題,貫穿于其他三個(gè)因素的建設(shè)過程中,這四個(gè)因素構(gòu)成了開放信息資源建設(shè)的內(nèi)涵(如圖1)。

圖1 開放信息資源建設(shè)要素圖

2 案例研究

從技術(shù)時(shí)間線來看,開放資源建設(shè)已經(jīng)進(jìn)入一個(gè)全新的時(shí)期,從1.0時(shí)代的數(shù)字圖書館、數(shù)據(jù)庫技術(shù)到2.0時(shí)代科研社交網(wǎng)絡(luò)、開放共享創(chuàng)作平臺的興起,如今在大數(shù)據(jù)時(shí)代的推動下資源建設(shè)正走向科研成果開放集成、發(fā)現(xiàn)和計(jì)算。從地區(qū)來看,目前歐美地區(qū)的應(yīng)用建設(shè)比較成熟,并且從國家和地區(qū)層面著力于建設(shè)和完善相關(guān)機(jī)制,以項(xiàng)目形式啟動建設(shè)一系列開放資源服務(wù)系統(tǒng)。從資源角度,其建設(shè)模式分為元數(shù)據(jù)集成和全文集成兩種模式[10],集成的學(xué)科類型則包括綜合集成和學(xué)科集成。本文根據(jù)開放資源建設(shè)開展的影響力和規(guī)模性,以及目前開放資源發(fā)展到戰(zhàn)略期這一宏觀趨勢[4],重點(diǎn)研究歐盟和美國NIH機(jī)構(gòu)的開放資源建設(shè)進(jìn)展,介紹歐盟OPENAIRE機(jī)構(gòu)知識庫網(wǎng)絡(luò)、知識倉儲Zenodo、NIH在開放政府計(jì)劃推動下啟動的REPORTER系統(tǒng)、學(xué)科倉儲PMC,其基本情況如下表1。

表1 歐盟和NIH開放資源建設(shè)項(xiàng)目類型

2.1 歐盟及NIH開放資源建設(shè)體系比較

(1)歐盟委員會

使公共資助的研究成果最大化開放獲取是歐盟開放資源建設(shè)的戰(zhàn)略目標(biāo)和主要方向。2008年歐盟委員會提出FP7開放獲取先導(dǎo)計(jì)劃,要求由EC或FP7資助產(chǎn)生的科研成果在6個(gè)月或12個(gè)月內(nèi)開放獲取[15];到2014年,地平線2020計(jì)劃取代FP7,除了延續(xù)FP7開放獲取政策外,開始重視研究數(shù)據(jù)的開放和重用,形成包括出版物和研究數(shù)據(jù)在內(nèi)的開放共享機(jī)制,如圖2。

圖2 地平線2020:開放獲取出版物和研究數(shù)據(jù)的利用和傳播[16]

2012年,歐盟委員會提交了《科學(xué)信息訪問和保存建議》報(bào)告[17],認(rèn)為要擴(kuò)展開放獲取的范圍,將目前的政策應(yīng)用到所有接受公共資助的研究。報(bào)告中提出對于科研成果開放建設(shè)的建議,包括建設(shè)開放數(shù)字信息基礎(chǔ)設(shè)施,實(shí)現(xiàn)科研出版物以及科研數(shù)據(jù)的開放獲取,科研資助機(jī)構(gòu)、學(xué)術(shù)機(jī)構(gòu)、出版商、研究人員通力支持參與等(圖3)。

圖3 歐盟委員會提出的開放資源建設(shè)架構(gòu)

(2)NIH

NIH作為國家級的科研資助機(jī)構(gòu)和研究機(jī)構(gòu),一直致力于開放獲取在政策和實(shí)施層面的推進(jìn)。與歐盟類似,NIH也同時(shí)推動出版物和研究數(shù)據(jù)的開放獲取,其中,公眾獲取政策要求在符合版權(quán)法的范圍內(nèi),所有由NIH資助產(chǎn)生的同行評議文章必須在出版后12個(gè)月提交到PMC以供開放獲取[18]。NIH還開發(fā)了適應(yīng)于單年度申請金額在50萬美元以上項(xiàng)目的數(shù)據(jù)共享政策[19],要求申請者提供數(shù)據(jù)共享計(jì)劃,使NIH資助產(chǎn)生的最終研究數(shù)據(jù),尤其是那些unique data要能為其他研究者所用。這些數(shù)據(jù)來自于基礎(chǔ)研究、臨床研究、調(diào)查研究、其他類型研究等。一旦數(shù)據(jù)可用,研究人員既不可以設(shè)置任何限制問題或方法,也不能以合作者作為獲取數(shù)據(jù)的條件,需要出臺適當(dāng)?shù)奈募源_保他人使用,防止誤用、誤解和混淆。

開放資源建設(shè)方面,2004年NLM面向開放獲取后,其網(wǎng)站的訪問人數(shù)增加了一百倍[20]。PUBMED由收費(fèi)索引轉(zhuǎn)向在線免費(fèi)獲取,PUBMED CENTRAL的誕生及在歐美地區(qū)的分布式建設(shè),以及研究項(xiàng)目資源集成建設(shè)——REPORTER,成為開放獲取進(jìn)程中具有里程碑式的事件。另外,NIH設(shè)立了許多開放獲取的數(shù)據(jù)庫,包括基因型與表型數(shù)據(jù)庫dbGaP,擴(kuò)大基因和臨床數(shù)據(jù)開放獲取的SHARe[21],千人基因組計(jì)劃全部數(shù)據(jù)免費(fèi)對外開放,數(shù)據(jù)總量達(dá)到200TB,是世界上最大的人類基因變異數(shù)據(jù)集,由亞馬遜旗下的云計(jì)算公司——“亞馬遜網(wǎng)絡(luò)服務(wù)”存儲[22]。2014年,NIH推動生物醫(yī)藥大數(shù)據(jù)開放教育資源項(xiàng)目[23],致力于推動生物醫(yī)藥開放教育資源(OER)的利用,提高從業(yè)人員應(yīng)用和分析生物醫(yī)藥大數(shù)據(jù)能力,并支持MOOCS發(fā)布和傳播。

2.2 資源機(jī)制

資源機(jī)制指資源的發(fā)現(xiàn)、獲取、遴選,以向用戶提供需求內(nèi)容的機(jī)制。這4個(gè)開放資源建設(shè)項(xiàng)目都面向科研項(xiàng)目資源,但其資源機(jī)制不盡相同。

OPENAIRE是由歐洲38個(gè)合作國共同支持開發(fā)的開放知識庫網(wǎng)絡(luò),對歐盟委員會通過FP7或歐洲研究委員會(ERC)資助的成果提供在線免費(fèi)獲取。但OPENAIRE本身并不提供資源內(nèi)容本身,而是通過建設(shè)泛歐網(wǎng)絡(luò)架構(gòu)和技術(shù)架構(gòu),實(shí)現(xiàn)資源在元數(shù)據(jù)層的集成和存儲(圖4)。目前OPENAIRE提供beta版的集成搜索引擎,資源類型包括出版物、數(shù)據(jù)、項(xiàng)目、研究人員、機(jī)構(gòu)、數(shù)據(jù)來源,學(xué)科領(lǐng)域涉及健康、能源、環(huán)境、部分信息通訊技術(shù)和科研基礎(chǔ)設(shè)施、社會科學(xué)、人文等。Zenodo由OpenAIRE和CERN創(chuàng)建,European Commission資助,為研究成果提供一站式存儲服務(wù)。因此,盡管基于和OpenAIRE一樣的理念,但不同于OpenAIRE收集知識庫的資源元數(shù)據(jù)記錄,Zenodo作為OpenAIRE知識庫網(wǎng)絡(luò)中的一員,由研究人員上載數(shù)據(jù)。而且,Zenodo支持“長尾”研究成果的存儲,接收任何類型、任何階段、任何學(xué)科、任何格式、任何許可的數(shù)據(jù)。

圖4 OpenAIRE架構(gòu)[24]

REPORTER由NIH開發(fā),對NIH以及美國其他健康和公共服務(wù)機(jī)構(gòu)資助的項(xiàng)目的信息進(jìn)行集成,是一個(gè)完善的、功能全面的、資源多樣的項(xiàng)目資源系統(tǒng)。此外,除項(xiàng)目的具體信息外,這些項(xiàng)目產(chǎn)生的出版成果和專利信息也提供使用。REPORTER是NIH“政府公開計(jì)劃”的一個(gè)重要組成部分,以展現(xiàn)NIH活動的透明度,促進(jìn)數(shù)據(jù)收集的質(zhì)量,提高資源利用率。除了REPORTER項(xiàng)目、出版成果、專利數(shù)據(jù)集外,REPORTER中的信息還來源于一些已有的數(shù)據(jù)庫——eRA數(shù)據(jù)庫、Medline、PubMed Central、NIH院內(nèi)數(shù)據(jù)庫以及iEdison。PMC是NIH期刊論文的倉儲,由于其開放存繳政策的要求,資源主要來源于作者提交以及出版商按照PMC的格式進(jìn)行自動發(fā)布。資源的內(nèi)容包括生物醫(yī)藥領(lǐng)域的開放獲取論文、NIH資助的研究成果論文等。表2總結(jié)了4個(gè)項(xiàng)目的資源屬性。

表2 4個(gè)項(xiàng)目的資源屬性

2.3 服務(wù)機(jī)制

開放資源建設(shè)的目的在于基于資源向用戶提供增值服務(wù),方便用戶利用知識,促進(jìn)開放知識資源的傳播和利用。服務(wù)類型包括知識組織服務(wù)、情報(bào)服務(wù)(包括資源評價(jià)、計(jì)量、分析、可視化等服務(wù))、長期保存服務(wù)、再利用服務(wù)、Web 2.0服務(wù)等。

知識組織方面,OpenAIRE作為知識庫網(wǎng)絡(luò)門戶需要向知識庫成員執(zhí)行一套統(tǒng)一的元數(shù)據(jù)體系,以便進(jìn)行內(nèi)容收割、聚合和展示。因此,OPENAIRE面向主要的科研產(chǎn)出——出版物和研究數(shù)據(jù)分別開發(fā)了相應(yīng)的指南(面向CRIS系統(tǒng)的指南正在制定中),定義了出版物和研究數(shù)據(jù)的描述規(guī)范。其中,出版物在DC元數(shù)據(jù)schema下,采用info:eu-repo通用詞匯表,以促進(jìn)開放獲取領(lǐng)域內(nèi)標(biāo)準(zhǔn)詞表的推廣使用。對于數(shù)據(jù)類,OpenAIRE采用DataCite元數(shù)據(jù)schema,通過實(shí)施這一指南,旨在促進(jìn)增強(qiáng)出版物的創(chuàng)建以及為關(guān)聯(lián)數(shù)據(jù)基礎(chǔ)設(shè)施的建設(shè)奠定基石[25]。Zenodo作為OpenAIRE知識庫成員之一,也遵循這一標(biāo)準(zhǔn)的描述規(guī)范。另外,OpenAIRE及Zenodo也積極推動知識關(guān)聯(lián),OpenAIRE后續(xù)啟動OpenAIRE plus項(xiàng)目,開展國家層面上出版物與相關(guān)信息(如數(shù)據(jù)集、多媒體、作者信息、資助信息等)的關(guān)聯(lián)。Zenodo則基于OpenAIRE泛歐倡議,擴(kuò)展研究成果與數(shù)據(jù)集和資助信息在歐洲和國家背景下的鏈接,并為科學(xué)團(tuán)體創(chuàng)建特定集合,例如,一個(gè)EC資助的項(xiàng)目可能會為他們所有的研究成果創(chuàng)建一個(gè)協(xié)作空間,并能分配一系列許可,包括Creative Commons,每個(gè)數(shù)據(jù)集和出版物都被分配一個(gè)DOI[26]。REPORTER的元數(shù)據(jù)非常詳盡,每個(gè)元數(shù)據(jù)是否有值取決于來源的數(shù)據(jù)庫。NIH應(yīng)用“研究、條件、疾病分類系統(tǒng)”(RCDC)[27]對項(xiàng)目進(jìn)行自動描述和分類,RCDC詞匯表匯總了MESH等7個(gè)詞匯表,并采用專家選詞和對詞匯設(shè)置權(quán)重的方法,一定程度實(shí)現(xiàn)了語義的豐富化和關(guān)聯(lián)化。PMC采用了NIH開發(fā)的JATS標(biāo)簽集,互操作和通用性較強(qiáng)。作為項(xiàng)目資源集成工具,REPORTER跨庫知識鏈接服務(wù)非常強(qiáng)大,實(shí)現(xiàn)了項(xiàng)目產(chǎn)出知識及相關(guān)知識的關(guān)聯(lián)整合以及平臺與外部資源的關(guān)聯(lián)。PMC則實(shí)現(xiàn)從參考文獻(xiàn)直接鏈接到PubMed、CrossRef的跨庫鏈接。

在利用服務(wù)方面,OpenAIRE使用OAI-PMH2.0協(xié)議開放出版物元數(shù)據(jù)。Zenodo提供豐富的接口來鏈接對象和資金信息,可通過OAI-PMH對任何上傳的數(shù)據(jù)或創(chuàng)建的集合進(jìn)行全文收割,以方便把數(shù)據(jù)集合展示給PubMed Central或本地機(jī)構(gòu)[26]。REPORTER并不提供接口服務(wù),但可通過ExPORTER站點(diǎn)進(jìn)行整庫下載(EXCEL格式)重用。PMC支持全部元數(shù)據(jù)的自動獲取,但對于全文內(nèi)容僅支持OA子集全文的FTP批量獲取。情報(bào)服務(wù)方面,OpenAIRE開通資源監(jiān)測功能,對資源進(jìn)行實(shí)時(shí)分類統(tǒng)計(jì)、分析,并引入可視化圖表呈現(xiàn);REPORTER也提供項(xiàng)目及資助信息、出版物的可視化分析,并可以選擇不同可視化類型,以及通過谷歌地圖接口呈現(xiàn)機(jī)構(gòu)的地理位置。存儲服務(wù)方面,PMC和Zenodo作為倉儲都提供存儲服務(wù),Zenodo為每個(gè)用戶提供2GB的存儲空間。Web 2.0交互方面,基本都提供RSS服務(wù),但其他交互方式不多。

2.4 政策機(jī)制

政策機(jī)制是指為了保障資源系統(tǒng)有效運(yùn)行,促進(jìn)資源開放利用和傳播而制定或采取的采集、保存、利用政策或許可協(xié)議等。下面分別對四個(gè)資源項(xiàng)目的數(shù)據(jù)權(quán)利政策、保存政策、利用政策進(jìn)行分析(表3)。

表3 資源政策分析

3 結(jié)語

開放獲取資源的迅速增長帶來了開放資源建設(shè)的迫切需求,同時(shí)也對傳統(tǒng)資源建設(shè)的模式提出了挑戰(zhàn),開放獲取成為大規(guī)??茖W(xué)文獻(xiàn)計(jì)算的可能條件[28]。根據(jù)本文介紹的開放資源建設(shè)案例的經(jīng)驗(yàn)可知:首先,面向科研活動的信息服務(wù)體系不再局限于傳統(tǒng)出版物,研究數(shù)據(jù)以及其他任何形式的知識在開放信息環(huán)境下變得更易獲取和利用,面向科研活動全過程和知識生命周期全過程的資源建設(shè)成為現(xiàn)實(shí)。其次,開放資源打破了資源專有壁壘,開放資源開始上升到國家層面甚至國際層面進(jìn)行聯(lián)盟建設(shè)和戰(zhàn)略布局,資源得到了最大化整合和共享。再次,目前基于描述性元數(shù)據(jù)的文獻(xiàn)集成與系統(tǒng)互操作仍是主流,信息資源主要呈現(xiàn)為文檔和自由文本形式的文獻(xiàn)對象,缺乏結(jié)構(gòu)化、數(shù)據(jù)化、語義化描述與知識組織[29],而開放資源建設(shè)的優(yōu)勢和核心在于應(yīng)用開放知識組織體系,從而將開放信息資源體系轉(zhuǎn)換為可計(jì)算的開放知識資源[5]。因此需要支持資源層的開放集成與內(nèi)容層的知識發(fā)現(xiàn),如開放性綜合集成平臺、知識庫、知識搜索引擎、資源嵌入式開放服務(wù)產(chǎn)品等的開發(fā)。另外,強(qiáng)制性政策的推動是開放獲取的重要助推劑,要求研究成果的開放獲取和存儲,推動商業(yè)資源、非公開科研信息資源的開放,也是重要使命之一。

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[29]曾蕾. DCMI 2013聽會點(diǎn)滴[J].數(shù)字圖書館論壇,2013(12):19-23.

Best Practice Study on Open Access Resources Development

CHEN XueFei, HUANG JinXia
(Library, Chinese Academy of Sciences, Beijing 100190, China)

Open access resources development is one of the most important components in the collection development of libraries, which is also the future trends. 4 Open access resources development cases from European Commission and NIH were analyzed as samples according to their resources mechanisms, services designs and policy systems. Especially, at the basis of the demonstration experience of these outstanding practices, we should continue to expand resources scopes, pay attention to alliance and cooperation, and develop knowledge tools and products.

Open access resources; Resources development; OpenAIRE; Zenedo; REPORTER; PMC

G201

10.3772/j.issn.1673—2286.2014.12.004

2014-12-11)

陳雪飛,女,1987年生,研究方向:開放資源,E-mail:chenxuefei@mail.las.ac.cn。

黃金霞,女,1972年生,研究方向:開放資源建設(shè)、知識組織,E-mail:huangjx@mail.las.ac.cn。

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