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中藥藥理信息平臺數(shù)據(jù)庫建立的研究*

2014-11-21 07:17:34河北中醫(yī)學院王建嶺李仁玲石家莊050091
河北中醫(yī)藥學報 2014年1期
關鍵詞:藥理中藥數(shù)據(jù)庫

河北中醫(yī)學院 王建嶺 李仁玲 (石家莊050091)

中藥藥理具有豐富的信息資源,包括中藥藥物、期刊文獻、教育及實驗信息等,這些信息對中藥藥理學習和研究非常有用,但是信息分散不方便獲取和利用。為了拓寬中藥藥理信息的獲取渠道,搜集、整理中藥藥理信息,結合網(wǎng)絡和數(shù)據(jù)庫技術,為信息需求者提供服務,提高資源的價值。[1]

1 中藥藥理信息數(shù)據(jù)庫結構

中藥藥理信息系統(tǒng)為中醫(yī)藥科研、教育提供中藥藥理信息支持,這些信息包括中藥基本信息、毒理、實驗方法等等??蒲腥藛T和學習者可以查詢中藥化學成分、臨床藥理等方面,并可利用數(shù)據(jù)挖掘技術,獲取這些信息中蘊含的非常有價值的知識。本系統(tǒng)的體系結構如圖1所示。

圖1 中藥藥理信息系統(tǒng)結構

中藥藥理信息系統(tǒng)內設立科學研究、教育資源及論壇等??茖W研究為科研人員開展中藥藥理研究提供中藥藥理信息、研究現(xiàn)狀及研究方法等基本信息。另外,科研人員及學生可利用本系統(tǒng)方便快捷地查詢到相關實驗研究方法等。教育資源為師生學習中藥藥理學的平臺,包含中藥藥理學教學視頻、課程、課件等。科學研究展現(xiàn)中藥藥物信息、中藥藥理學研究現(xiàn)狀、研究方法及相關實驗研究方法等信息。論壇是中藥藥理研究者學習交流的空間,彼此交換信息,解答學習中的疑惑,促進中藥藥理學學習的深入。

中藥藥理信息系統(tǒng)強大的服務能力來自后臺強健又有大量數(shù)據(jù)的數(shù)據(jù)庫支持。數(shù)據(jù)庫首先設計數(shù)據(jù)庫的結構及數(shù)據(jù)表字段的選擇,數(shù)據(jù)表與數(shù)據(jù)表間建立適當?shù)年P系,以便在信息使用中進行信息關聯(lián)和檢索。因此,充分分析理解中藥藥理信息,發(fā)掘中藥藥理信息數(shù)據(jù)間的內涵關系。這些數(shù)據(jù)包含中藥藥物基本信息(包括藥物屬性、化學成分等)、文獻信息(包括文獻題名、來源、作者、關鍵詞、摘要等)、實驗方法信息(包括樣品、儀器、動物、造模方法、實驗步驟等)、動物信息(包括動物名稱、種屬等)和檢測方法信息(包括檢測方法、效應部位、指標等)等。

2 中藥藥理信息數(shù)據(jù)庫的建立

2.1 中藥藥理信息數(shù)據(jù)庫主題的確定 在數(shù)據(jù)庫建立中,首先分析不同中藥的藥理信息特點,實驗方法等,確定中藥信息、實驗等的重要屬性,從而確立數(shù)據(jù)庫的主題內容、數(shù)據(jù)結構及粒度,根據(jù)不同類型的信息建立相關數(shù)據(jù)表及其相關聯(lián)信息的關系。

中藥藥理信息內容豐富,對信息進行分類并在數(shù)據(jù)庫中確定主題,如藥物、文獻、實驗方法等。主題中數(shù)據(jù)的粒度是衡量數(shù)據(jù)庫中數(shù)據(jù)的運用能力,反映數(shù)據(jù)倉庫所能回答的問題多少,也會影響倉庫中數(shù)據(jù)的存儲量。數(shù)據(jù)的粒度劃分的越細,則實例的屬性描述的越豐富、越準確。[2]然而,粒度過小數(shù)據(jù)的綜合運用能力下降。數(shù)據(jù)庫設計中根據(jù)中藥藥理信息的特征,以及用戶對信息的需求情況,確定中藥藥理及相關信息數(shù)據(jù)的粒度。這樣數(shù)據(jù)庫既能準確描述中藥藥理及相關內容的信息,又能為用戶提供更加豐富的信息用于學習研究和發(fā)掘有價值的信息應用。例如:

文獻:文獻題名、來源、作者、關鍵詞、中文摘要、英文摘要……

中藥:藥名、別名、英譯名、藥材基原、動植物形態(tài)、資源分布、性味、歸經(jīng)、功效、主治、用法用量、產地、化學成份、藥理作用、毒理學、藥材基原、資源分布、栽培或養(yǎng)殖、采集加工、炮制方法、藥材鑒別……

中藥化學成分:品名、化學名稱、理化性質、分子式、藥理作用、功效、臨床應用、毒性、不良反應、用途分類……

藥理研究方法:方法名稱、方法介紹、操作過程、特點……

2.2 中藥藥理信息數(shù)據(jù)庫的關系建立 中藥藥理信息數(shù)據(jù)庫中邏輯模型就是關系模型,一個主題就表示一個關系。各主題的數(shù)據(jù)表間存在某種聯(lián)系,關系數(shù)據(jù)庫中將數(shù)據(jù)表間的聯(lián)系都用關系來表示。[3]因此,中藥藥理數(shù)據(jù)庫中數(shù)據(jù)組織都用關系來表示。便于用戶檢索和挖掘中藥藥理信息,建立各項中藥藥理主題關系,比如中藥藥物、實驗、文獻等一級關系。對一級關系進一步細化,建立更加精細的關系,如中藥藥物關系又包括藥物信息、中藥藥理作用、中藥化學成分、實驗等,例如中藥藥理數(shù)據(jù)庫中部分關系如圖2。

圖2 數(shù)據(jù)庫部分關系

2.3 中藥藥理信息數(shù)據(jù)庫的系統(tǒng)建立 中藥藥理信息平臺數(shù)據(jù)庫架構關鍵在于數(shù)據(jù)庫的建立和數(shù)據(jù)應用平臺的建設。

信息系統(tǒng)是采用基于B/S 的3 層體系結構,運用SQL server 數(shù)據(jù)庫技術、JDBC 技術和JSP 技術進行設計與實現(xiàn)。

數(shù)據(jù)庫采用SQL Server 建立數(shù)據(jù)庫模型。SQL Server 建立數(shù)據(jù)庫對數(shù)據(jù)有效組織和管理,用戶可以聯(lián)機檢索和建立數(shù)據(jù)分析。此外,SQL Server 的多種工具創(chuàng)建對數(shù)據(jù)的聯(lián)機分析處理(OLAP),并且具有對數(shù)據(jù)進行數(shù)據(jù)挖掘方案。

采用B/S 模式,可以提高用戶對數(shù)據(jù)庫的利用效率和方便性。使用JSP 及Javabean 技術開發(fā)Web 服務器,用戶利用瀏覽器遠程登錄服務器對數(shù)據(jù)進行管理和應用。并且系統(tǒng)提供專門窗口對數(shù)據(jù)庫進行管理,例如數(shù)據(jù)錄入、數(shù)據(jù)整理、數(shù)據(jù)清理、數(shù)據(jù)分析等。

3 中藥藥理信息數(shù)據(jù)庫系統(tǒng)的應用

中藥藥理信息系統(tǒng)主要服務模塊有科學研究、教育資源、論壇??茖W研究模塊中用戶可以利用數(shù)據(jù)庫錄入的文獻信息,藥物信息,藥理實驗等大量中藥藥理相關信息。研究人員可以查詢各種中藥的藥理文獻、藥理機理、實驗模型等等信息。還可以利用數(shù)據(jù)挖掘技術,如人工神經(jīng)網(wǎng)絡、遺傳算法、規(guī)則推理等,在大量數(shù)據(jù)中發(fā)掘潛在的有價值信息,以幫助研究者找到各種中藥的新應用,從而生成新的信息和知識,并可以幫助研究者開發(fā)新藥及療法。

教育模塊主要提供中藥藥理學習資源,如中藥藥理主要教材、名家講義和視頻教程、藥理實驗操作及視頻等等信息。供教師和學生學習中藥藥理知識,了解藥理實驗過程和藥物作用,提高學習中藥藥理的效率,為校外人員提供學習的環(huán)境和條件,促進中藥知識的普及。

論壇為中藥藥理學習提供交流平臺,分為多項學術專題討論區(qū)、疑難問題解答區(qū)等。在這些專題區(qū)中,可以共享中藥藥理信息資源,例如,文件、光盤,提高信息資源的利用率,使用戶更方便地獲取中藥藥理的信息。交互討論區(qū)使用戶可以與其他人做到即時的聯(lián)機交談,解決中藥藥理研究和學習中的疑難問題,探討中藥藥理研究機理及發(fā)展的。

4 結語

利用計算機技術來整理、分析中藥藥理信息,建立廣泛應用的數(shù)據(jù)庫,收錄中藥藥理及相關信息,為中藥藥理學的研究和教學提供豐富的信息資源和可挖掘的寶貴數(shù)據(jù)。通過此平臺研究者和學習者可以交流探討中藥藥理知識和方法,推動中藥藥理學的發(fā)展。

[1]王建嶺,李仁玲,段彥蕊,等.中藥藥理信息系統(tǒng)建設初議[J].河北中醫(yī)藥學報,2011,26 (3):48-49

[2]呂海燕,車曉偉.數(shù)據(jù)倉庫中數(shù)據(jù)粒度的劃分[J].計算機工程與設計,2009,9:2 323-2 325

[3]Rosina S,Mohammad S.Design of a hospital-based database system [J].International Journal on Computer Science and Engineering,2010,2 (8):2 616-2 621

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