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新疆地區(qū)維、漢民族缺血性卒中與ADP基因多態(tài)性的相關(guān)性研究①

2014-11-27 10:26張震中梁曉鷹呂光耀新疆醫(yī)科大學(xué)烏魯木齊830054
中國免疫學(xué)雜志 2014年6期
關(guān)鍵詞:脂聯(lián)素等位基因多態(tài)性

張震中 梁曉鷹 呂光耀 姚 華(新疆醫(yī)科大學(xué),烏魯木齊 830054)

腦卒中目前是導(dǎo)致人類死亡的三大疾病之一,腦卒中是遺傳因素和環(huán)境因素共同作用的多基因病,確定腦卒中的易感基因乃至找到關(guān)鍵基因,可以從分子水平對腦卒中的發(fā)病機(jī)制有進(jìn)一步認(rèn)識,由于腦卒中是多基因病,在檢測多基因病的多個基因微效效應(yīng)方面,候選基因關(guān)聯(lián)分析主要是選擇與多基因疾病有生物學(xué)聯(lián)系的基因或者與該疾病已知相關(guān)基因具有同源性的基因作為候選基因,研究該候選基因與該疾病的發(fā)病是否具有相關(guān)性。薈萃分析結(jié)果提示脂聯(lián)素基因單核苷酸多態(tài)性與腦卒中之間存在著顯著的關(guān)聯(lián)[1]。一項(xiàng)Meta分析提示脂聯(lián)素水平降低與腦卒中的發(fā)生密切相關(guān)[2]。胡曉波等[3]研究發(fā)現(xiàn)脂聯(lián)素基因-3971A/G多態(tài)性的 GG型可能是缺血性卒中發(fā)病的一個獨(dú)立危險因子。脂聯(lián)素(Adiponectin,APN)是新近發(fā)現(xiàn)的脂肪組織特異性分泌的激素蛋白,研究表明APN在多種疾病的發(fā)生、發(fā)展過程中發(fā)揮抵抗作用,是一種保護(hù)性脂肪因子[4,5]。APN 具有血管內(nèi)皮保護(hù)作用,增加內(nèi)皮源性NO的產(chǎn)生與釋放[6]。APN增加脂肪酸的氧化,降低血TG水平,減少脂質(zhì)沉積,促進(jìn)巨噬細(xì)胞的裂解,從而抑制血管平滑肌細(xì)胞和外周血單核細(xì)胞的增殖及巨噬細(xì)胞向泡沫細(xì)胞的轉(zhuǎn)變,抑制動脈粥樣硬化(Atherosclerosis,AS)的形成[7]。臨床研究表明,缺血性卒中患者血清APN水平較健康對照組顯著降低[8]。

新疆屬我國的腦卒中高發(fā)地區(qū),存在明確的民族及環(huán)境特征,由于動脈粥樣硬化是心腦血管最為常見的共同病因基礎(chǔ),本研究定位于脂質(zhì)代謝相關(guān)的脂肪細(xì)胞因子Adiponectin,對新疆維漢民族缺血性腦卒中患者進(jìn)行脂聯(lián)素基因多態(tài)性及其相關(guān)的研究,通過分子生物學(xué)原理研究其與腦卒中的相關(guān)性及其在維漢民族之間有無差異。

1 材料與方法

1.1 研究對象和分組

1.1.1 病例組 所有入選的研究對象均來源于2011年3月至2013年3月在新疆醫(yī)科大學(xué)附屬中醫(yī)醫(yī)院神經(jīng)內(nèi)科及喀什地區(qū)第一人民醫(yī)院神經(jīng)內(nèi)科的住院病人210例,其中漢族121例,平均年齡(58.71±9.32)歲,男67例,女54例;維吾爾族89例,平均年齡(57.44±10.15)歲,男53例,女36例。全部均符合《中國急性缺血性腦卒中診治指南2010》[9]的急性腦卒中的診斷。

1.1.2 對照組 同期在新疆醫(yī)科大學(xué)附屬中醫(yī)醫(yī)院體檢人群104例,其中漢族47例,平均年齡(55.21±10.92)歲,男26例,女21例;維吾爾族57例,平均年齡(56.24±11.37)歲,男34例,女23例;所有患者均排除腦血管病、自身免疫性疾病、肝腎功能不全和惡性疾病。

1.2 研究方法 對符合納入標(biāo)準(zhǔn)的維族、漢族缺血性腦卒中患者和對照組人群抽取血樣,進(jìn)行DNA提取,統(tǒng)一進(jìn)行基因檢測工作。實(shí)驗(yàn)步驟:(1)通過haploview軟件,設(shè)定 Taggle_SNPs,篩選 MAF>0.5以上的SNPs位點(diǎn)信息并與之前查找的基因進(jìn)行比對,確定本次研究所需SNPs位點(diǎn)信息。(2)基因DNA提取:所有研究對象均取外周血采用苯酚氯仿抽提法。見圖1。(3) SNaPshot技術(shù)檢測Adiponectin基因SNPs。(4)引物設(shè)計及合成:根據(jù)SNP位點(diǎn)序列信息,使用Premier 5.0軟件設(shè)計、擴(kuò)增、延伸并合成引物。(5)PCR反應(yīng)體系:10 μl PCR 反應(yīng)體系:2.5×Buffer 4.0 μl,上游引物(10 μmol/L)0.2 μl,下游引物(10 μmol/L)0.2 μl,Tag(5 U/μl)0.1 μl,DNA(50~ 100 ng/μl)1.0 μl,ddH2O 4.7 μl。擴(kuò)增程序:95℃ 5 min;94℃ 30 s,60℃ 30 s,72℃ 30 s×32 cycles;72℃ 8 min。預(yù)擴(kuò)增產(chǎn)物質(zhì)檢:取2 μl上樣,2%瓊脂糖凝膠電泳。(6)3730XL測序儀檢測:①96孔板中每孔加入分子量內(nèi)標(biāo)和甲酰胺混合液(0.5、8.5)9 μl,PCR 產(chǎn)物0.8 μl;②95℃變性3 min,上機(jī)檢測;(7)PCR直接測序:直接測序是確定突變位點(diǎn)堿基的金標(biāo)準(zhǔn),由北京閱微基因生物公司完成測序和測序峰圖。

1.3 統(tǒng)計學(xué)方法 應(yīng)用SPSS18.0統(tǒng)計軟件,計數(shù)資料的比較采用χ2檢驗(yàn),基因型和等位基因頻率的比較采用χ2檢驗(yàn)。Hardy-weinberg平衡檢驗(yàn)采用擬合優(yōu)度χ2檢驗(yàn)。

2 結(jié)果

2.1 Adiponectin基因3個位點(diǎn)Hardy-weinberg平衡檢驗(yàn)結(jié)果 分別對病例組和對照組ADP基因SNP位點(diǎn)分型采用了擬合優(yōu)度卡方檢驗(yàn),計算其Ho、He,結(jié)果顯示病例組和對照組基因SNP位點(diǎn)基因型頻率分布沒有偏離Hardy-weinberg平衡(P>0.05)(表1),因此我們選取的樣本人群具有代表性適合做遺傳學(xué)分析。

2.2 Adiponectin基因3個位點(diǎn)SNaPshot方法判定基因類型 使用SNaPshot方法進(jìn)行SNP位點(diǎn)測序,峰值圖見圖2~4。

圖1 電泳結(jié)果Fig.1 Electrophoresis results

表1 Adiponectin基因Hardy-weinberg平衡檢驗(yàn)結(jié)果Tab.1 Results of Adiponectin gene Hardy-weinberg equilibrium test

2.3 病例組與對照組Adiponectin基因頻率比較將兩組研究對象分為病例組和對照組后,根據(jù)不同基因SNPs位點(diǎn)進(jìn)行比較,從表2中可以看出,rs6444175G/A位點(diǎn)基因頻率分布有統(tǒng)計學(xué)差異(χ2=13.882,P=0.001)。由于病例組rs6444175G/A基因型GA頻率(44.3%)高于對照組(23.1%),因此對rs6444175G/A位點(diǎn)GA基因型進(jìn)一步進(jìn)行統(tǒng)計學(xué)處理,如表3所示,應(yīng)用條件Logistic回歸校正傳統(tǒng)危險因素,如高血壓、糖尿病、冠心病、高脂血、吸煙,GA基因型頻率病例組明顯高于對照組,差異有統(tǒng)計學(xué)意義(OR=1.269;95%CI:1.001~1.952;P=0.012),提示rs6444175GA基因型是缺血性腦卒中的獨(dú)立危險因素,患缺血性腦卒中的風(fēng)險率增加至1.269倍。

2.4 維、漢族人群病例組和對照組 Adiponectin基因型頻率比較 維、漢族人群與其對照組進(jìn)行比較,Adiponectin 3個SNP位點(diǎn)基因型類型分布,通過χ2檢驗(yàn),未見顯著差異。但從表4中可以看出,維吾爾族rs182052基因型CC+CT病例組中占到85.2%,對照組中占到84.2%;rs6444175基因型GG+GA病例組中占到89.9%,對照組中占到92.9%;rs1501296基因型GA+AA病例組中占到89.9%,對照組中占到87.7%;與整組研究對象相比,維族人群中病例組與對照組各個SNP位點(diǎn)基因型分布呈一致性。

圖2 Adiponectin SNPrs182052測序峰值圖Fig.2 Adiponectin SNPrs182052 sequencing peak figure

圖3 Adiponectin SNP rs6444175測序峰值圖Fig.3 Adiponectin SNP rs6444175 sequencing peak figure

圖4 Adiponectin SNP rs1501296測序峰值圖Fig.4 Adiponectin SNP rs1501296 sequencing peak figure

2.5 病例組和對照組Adiponectin等位基因頻率比較 等位基因水平研究結(jié)果顯示,病例組與對照組比較,Adiponectin基因rs6444175G/A等位基因A在病例組中攜帶頻率明顯高于對照組,當(dāng)個體攜帶A等位基因時,病例組的相對患病風(fēng)險率顯著增加至1.481倍(OR=1.481;95%CI:1.219~1.910;P=0.000)(見表5)。

2.6 維、漢族人群病例組和對照組 Adiponectin等位基因頻率比較 維、漢族人群中病例組與對照組比較發(fā)現(xiàn),Adiponectin各位點(diǎn)等位基因頻率分布未見明顯差異,均無統(tǒng)計學(xué)意義(見表6)。

表2 病例組與對照組Adiponectin基因型頻率比較〔n(%)〕Tab.2 Comparison of Adiponectin genotype frequency in cases and controls〔n(%)〕

表3 rs6444175GA基因型條件Logistic回歸校正結(jié)果Tab.3 Results of rs6444175GA genotypes of conditional Logistic regression calibration

表4 維、漢族病例組和對照組Adiponectin基因型頻率比較[n(%)]Tab.4 Comparison of Adiponectin genotype frequency in Uygur,Han case and control groups[n(%)]

表5 病例組和對照組Adiponectin等位基因頻率比較Tab.5 Comparison of Adiponedtin allele frequency in case and control group

表6 維、漢族病例組和對照組Adiponectin等位基因頻率比較Tab.6 Comparison of frequency of Adiponectin allele on Uygur and Han case and control groups

3 討論

現(xiàn)代分子生物遺傳學(xué)證實(shí)多數(shù)疾病都是由特定的基因來調(diào)控的,本次研究選取與腦卒中相關(guān)糖脂代謝相關(guān)的基因,即脂聯(lián)素基因,通過分析脂聯(lián)素SNP rs182052、rs6444175、rs1501296位點(diǎn)的相關(guān)性,試圖找尋其與缺血性腦卒中之間的關(guān)系,并篩查其產(chǎn)生的基因型及等位基因與疾病的敏感度,并從維漢民族缺血性腦卒中的基因型特點(diǎn)上探討其基因位點(diǎn)有無差異。

3.1 維、漢民族脂聯(lián)素基因多態(tài)性與缺血性腦卒中危險因素之間的關(guān)系 Adamczak等[10]首次報道了脂聯(lián)素與原發(fā)性高血壓(EH)之間的關(guān)系,結(jié)果顯示EH患者脂聯(lián)素水平明顯低于正常對照組,在所有研究對象中血清脂聯(lián)素水平與血壓水平呈負(fù)相關(guān),推論脂聯(lián)素可能與高血壓的臨床進(jìn)程有一定的關(guān)系。研究表明,高血壓患者血漿脂聯(lián)素水平較血壓正常者明顯降低,并與收縮壓、舒張壓和平均動脈血壓均成負(fù)相關(guān),脂聯(lián)素是發(fā)生高血壓的獨(dú)立危險因素。相關(guān)研究提示脂聯(lián)素T45G多態(tài)性與T2DM的相關(guān)性可能存在種族差異[11],新疆維吾爾族的T2DM高發(fā)是漢族的2倍,其SNP276多態(tài)性位點(diǎn)與T2DM相關(guān);2型糖尿病患者血漿脂聯(lián)素濃度明顯低于正常人群,血漿脂聯(lián)素水平降低與胰島素抵抗和胰島β細(xì)胞功能障礙的病理生理改變具有一定的相關(guān)性,脂聯(lián)素是糖尿病發(fā)生發(fā)展的重要生物學(xué)標(biāo)志物[12,13]。何慧婧等[14]研究發(fā)現(xiàn)脂聯(lián)素基因SNP 45多態(tài)性與涼山州漢族居民2型糖尿病的關(guān)聯(lián)尚不確定。Bang等[15]對231例腦梗死患者的研究發(fā)現(xiàn),代謝異常的患者血清脂聯(lián)素水平較低(P=0.002),而且卒中類型不同血清脂聯(lián)素水平亦不相同。楊秀娟等[16]收集動脈粥樣硬化性腦梗死患者的血標(biāo)本,發(fā)現(xiàn)276G/T多態(tài)性可能參與中國湖南漢族人群動脈粥樣硬化性腦梗死的發(fā)生,且可能影響血脂水平;Chen等[17]研究證實(shí):APN通過NF-κB信號通路起到明顯抗炎效應(yīng),降低腦缺血再灌注損傷,表明具有神經(jīng)保護(hù)作用,APN是潛在的治療缺血性腦梗死的分子靶點(diǎn)。脂聯(lián)素還可通過提高肝臟合成高密度脂蛋白而促進(jìn)膽固醇的逆行轉(zhuǎn)運(yùn),高密度脂蛋白除具有膽固醇逆轉(zhuǎn)運(yùn)功能外,還具有抗氧化和抗炎癥作用。

3.2 維、漢族缺血性腦卒中脂聯(lián)素基因多態(tài)性分析

本次研究納入了維族和漢族人群,使用SNaPshot技術(shù)檢測脂聯(lián)素基因3個 SNP位點(diǎn):rs182052、rs6444175、rs1501296,研究發(fā)現(xiàn)SNP位點(diǎn)均呈二態(tài)性分布。其中維族Adiponectin基因SNP rs182052位點(diǎn),在整組人群中,CT型占絕大比例,TT型為最少;rs6444175位點(diǎn)中以 GA型最多,AA型最少;rs1501296位點(diǎn),以AA型居多,GG最少,但3個位點(diǎn)病例組和對照組均無明顯差異。其中漢族Adiponectin基因 SNP rs182052位點(diǎn),在整組人群中,CT型占絕大比例,TT型為最少;rs6444175位點(diǎn)中以GG型最多,AA型最少;rs1501296位點(diǎn),以GA型居多,GG最少,但3個位點(diǎn)病例組和對照組均無明顯差異。Adiponectin基因SNP rs182052位點(diǎn)等位基因,維、漢族人群均以 C等位基因?yàn)橹?rs6444175位點(diǎn)等位基因,兩組均以G等位基因居多;rs1501296位點(diǎn)等位基因,整組人群均以A等位基因?yàn)橹?,但均未見顯著差異。本研究首次報告了新疆維、漢族缺血性卒中人群ADP基因多態(tài)性,此次的研究工作,發(fā)現(xiàn)脂聯(lián)素3個SNP位點(diǎn)的基因型、等位基因頻率均未見明顯差異,原因考慮可能與樣本量較少和對缺血性卒中的納入標(biāo)準(zhǔn)存在差別有關(guān),需進(jìn)一步做深入研究。

3.3 病例組與對照組脂聯(lián)素基因多態(tài)性分析 研究病例組與對照組兩組對象發(fā)現(xiàn)rs6444175G/A位點(diǎn)基因頻率分布有統(tǒng)計學(xué)差異(χ2=13.882,P=0.001),由于病例組rs6444175G/A基因型GA頻率(44.3%)高于對照組(23.1%),因此對rs6444175G/A位點(diǎn)GA基因型行進(jìn)一步統(tǒng)計學(xué)處理,和基因型GG、AA比較,GA基因型頻率病例組明顯高于對照組,應(yīng)用條件Logistic回歸校正傳統(tǒng)危險因素后,差異有統(tǒng)計學(xué)意義(OR=1.269;95%CI:1.001~1.952;P=0.012),提示 rs6444175GA基因型是缺血性腦卒中的獨(dú)立危險因素,患缺血性腦卒中的風(fēng)險率增加至1.269倍。通過對病例組人群脂聯(lián)素的3個SNP位點(diǎn)的等位基因頻率進(jìn)行研究,發(fā)現(xiàn)部分差異:病例組人群中 Adiponectin SNPrs6444175等位基因 A頻率高于對照組,P=0.000,OR=1.481,可能為缺血性腦卒中的易感基因位點(diǎn)。說明缺血性腦卒中患者存在著明顯的基因位點(diǎn)變異。

綜上所述,通過研究發(fā)現(xiàn),缺血性腦卒中Adiponectin基因rs6444175G/A等位基因A可能是其發(fā)病的易感基因位點(diǎn),而維漢民族之間,雖然在基因型分布上兩組人群未存在顯著差異,但在基因位點(diǎn)發(fā)現(xiàn)不同SNP位點(diǎn)基因型,存在顯著差異,具有統(tǒng)計學(xué)意義,說明兩組人群存在一定的民族異質(zhì)性,這種差異可能需要我們在以后的研究中進(jìn)一步尋找相關(guān)的基因位點(diǎn)進(jìn)行研究,脂聯(lián)素基因位點(diǎn)多態(tài)性差異應(yīng)該是維、漢民族腦卒中發(fā)病的重要危險相關(guān)因素。本研究對新疆地區(qū)維吾爾族和漢族在缺血性卒中患者ADP基因的多態(tài)性進(jìn)行分析,探討了其與缺血卒中的關(guān)系。發(fā)病上可能有不同的遺傳易感因素,但對ADP基因與缺血卒中的確切關(guān)系以及它是如何與其他致病基因相互作用引發(fā)缺血卒中的,仍有待進(jìn)一步研究。

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