高永強，孫芳

1.內(nèi)蒙古鄂爾多斯市第二人民醫(yī)院肝病科，內(nèi)蒙古鄂爾多斯017000；2.內(nèi)蒙古鄂爾多斯市中心醫(yī)院保健科2區(qū)，內(nèi)蒙古鄂爾多斯017000

采用Graphpad prism 5.0繪制生存曲線

高永強1，孫芳2

1.內(nèi)蒙古鄂爾多斯市第二人民醫(yī)院肝病科，內(nèi)蒙古鄂爾多斯017000；2.內(nèi)蒙古鄂爾多斯市中心醫(yī)院保健科2區(qū)，內(nèi)蒙古鄂爾多斯017000

醫(yī)學(xué)論文經(jīng)常涉及對統(tǒng)計學(xué)及圖表的應(yīng)用，本文簡要闡述科學(xué)圖形軟件Graphpad Prism5.0在生存曲線繪制、圖表修改方面的應(yīng)用。

統(tǒng)計學(xué)；科學(xué)圖形軟件；生存分析

Graphpad Prism是一款集數(shù)據(jù)分析和作圖于一體的數(shù)據(jù)處理軟件，它可以直接輸入原始數(shù)據(jù)，也可以輸入初步統(tǒng)計數(shù)據(jù)，然后自動進(jìn)行基本的生物統(tǒng)計，如t檢驗、卡方檢驗、生存分析等，并根據(jù)需要制作科學(xué)圖表。雖然其數(shù)據(jù)分析統(tǒng)計功能沒有SAS、SPSS等專業(yè)軟件強大，但其所具有的功能實用精煉，操作簡單，圖表繪制頗具特色，深受生命科學(xué)研究領(lǐng)域的研究者喜愛。

生存分析為預(yù)后研究的通用方法，主要目的是了解影響疾病病程和轉(zhuǎn)歸的各種預(yù)后因素,為醫(yī)生預(yù)判患者結(jié)局并選擇適當(dāng)?shù)母深A(yù)措施提供依據(jù)[1]。目前國內(nèi)學(xué)者的醫(yī)學(xué)論文中統(tǒng)計分析及插圖繪制出錯屢見不鮮，有學(xué)者指出應(yīng)從插圖的物理意義、物理量與單位的搭配以及版面的需求和美學(xué)的觀點等方面審核插圖,合理布局,和諧統(tǒng)一[2]。生存曲線繪制對于醫(yī)生或者研究生來說也有不小的挑戰(zhàn)。

GraphPad Prism擁有基本的生物統(tǒng)計、曲線擬合和科學(xué)作圖功能，并能將3者緊密結(jié)合。由于該軟件易于操作，適合應(yīng)用于生命科學(xué)領(lǐng)域中的數(shù)據(jù)作圖與分析[3]。

1 軟件打開

打開Prism→選擇survival→選擇第一或第四個圖。Show result as中選擇“Fractions”那么縱坐標(biāo)是從0～1，選擇“Percents”那么縱坐標(biāo)是從0～100。點擊create，進(jìn)入下一步(圖1)。

2 數(shù)據(jù)錄入

錄入生存數(shù)據(jù)。數(shù)據(jù)的排列格式如下（以兩組隨訪資料比較為例）(圖2)。

圖1 GraphPad Prism軟件數(shù)據(jù)作圖與分析

①第一列（X軸）：是研究中患者的隨訪時間。單位可以是月、年等。

②第二列（甲）：是第一組患者對應(yīng)的生存或死亡的情況，這里0代表生存，1代表死亡。第一行在表中是1,0，說明該患者隨訪了1個月，1個月隨訪時狀態(tài)是生存，這一組第一個死亡的病例在表中是：10,1，說明該患者在10個月的時候死亡。

圖2 GraphPad Prism數(shù)據(jù)的排列格式

③第三列（乙）：是第二組患者對應(yīng)的生存或死亡的情況，解釋同上。

數(shù)據(jù)都錄入好了就可以直接點左側(cè)Graphs的Data1 (圖3)，這樣可以得到最初的生存曲線(圖4)。

圖3 Graphs的Data1

目前曲線不能直接用，不符合論文統(tǒng)計圖要求，生存曲線需要Y軸的最高點是1或100%，這個圖明顯不合適。下面我們來改改這個圖讓它更符合我們的要求。

3 曲線編輯

把鼠標(biāo)點向Y軸，雙擊出現(xiàn)以下對話框（圖5）。

①點擊去掉Automatically determine the range and interval。

圖4 最初的生存曲線

②把range中的maximum改成100。

③點擊”O(jiān)K“就可以獲得我們常?？吹降纳媲€了(圖6)。

圖5 曲線編輯

4 曲線的美化

①雙擊任一生存曲線可以改變曲線的顏色，線型。改的同時圖示中的顏色和線型也會同步改過來。

②雙擊Y軸可以添加參考線。大多數(shù)研究會討論中位生存時間，只要我們在圖中雙擊Y軸，在”Additional ticks and grid lines“中寫入50，點選Tick Line在Details按鈕中選擇參考線的顏色和線型即可?？梢缘玫揭韵逻@條符合要求的生存曲線了（圖7）。

甲組的中位生存時間大概是16個月，B組的中位生存時間大概是25個月。當(dāng)然，要是愿意增加25%或75%都是可以的。只要在”Additional ticks and grid lines“中根據(jù)需要添加即可。同樣方法雙擊X軸可以得到1年生存率等等。還可以雙擊修改圖片名稱、坐標(biāo)軸名稱等等（圖7，圖8）。

圖6 生存曲線1

圖7 生存曲線2

5 圖像輸出

首先選擇上方一排中的工具欄，找到其中的導(dǎo)出（export）工具，接著導(dǎo)出窗口會顯示出來，然后在其中做正確的選擇。選擇不同是依照不同的目的。因研究需要最終投稿印刷。故選擇導(dǎo)出TIF格式[2]。接著在導(dǎo)出的選項中，選擇輸出分辨率（1200dpi）（為保障打印清晰，線圖必須保證在1000dpi以上）。顏色模式（Color mode）選擇RGB顏色，真彩色（millions of colors）選項。在Size選項里輸入8 cm（該研究需打印半版面8 cm，若打印2/3整版面就填15 cm、若打印整個版面就填17 cm）[4]。接著在導(dǎo)出地址的選擇，選擇要導(dǎo)出的文件夾。以及為導(dǎo)出的圖片命名，點擊OK。

圖8 生存曲線3

圖9 整版圖片

該軟件包含另外一個功能，它支持在軟件中將多個圖表同時進(jìn)行排版，最后輸出一張集合在一起的整版圖片。關(guān)鍵要點是選擇排版布局（Layouts）進(jìn)行完成[3]，見圖9。

一個圖像的大小和清晰度，主要看它的分辨率和尺寸。大小相同的圖像，分辨率越高圖像顯示越清晰。分辨率大小是指單位尺寸范圍內(nèi)包含的像素數(shù)目，所以像素與分辨率有直接關(guān)系。在像素數(shù)額定前提下，圖像尺寸改變，其分辨率也會發(fā)生變動。

科技期刊內(nèi)，線條圖的比例占有成分很大。為了達(dá)到清晰的圖形效果，往往都將模糊的圖形進(jìn)行重新描繪。

而這樣得出的圖形，不同程度上失去了其原貌，尤其是在兩幅圖差別本來就極小，如波形圖，從而造成圖像混淆、重疊等現(xiàn)象，圖像的質(zhì)量得不到認(rèn)可，且描圖時所需工作量很大，既費時又費力。而采該研究的處理方法使用后，一是圖形不失真，二是工作量較小，圖形也可以自己負(fù)責(zé)處理，這對于自行排版的論文人而言，無疑是有巨大實用價值的。

總之，插圖是科技論文中最具表現(xiàn)力的部分規(guī)范而準(zhǔn)確的插圖不僅具有活躍和美化版面的功能，還能提高論文的質(zhì)量和可讀性，對基礎(chǔ)研究、臨床實踐、醫(yī)學(xué)教研都有很高的實用價值[5]。計算機(jī)軟件科學(xué)的發(fā)展促進(jìn)和提高了科技論文圖片的編輯加工水平。

[1]李楠,陶立元,趙一鳴.生存分析—兒科預(yù)后研究的常用工具[J].中華兒科雜志,2015(2):152.

[2]王蕾.科技論文插圖審核應(yīng)注意的幾個問題[J].天津科技, 2015，42(4):68-70.

[3]周登遠(yuǎn),崔壯，焦振山.臨床醫(yī)學(xué)研究中的統(tǒng)計分析和圖形表達(dá)實例詳解[M].北京：軍事醫(yī)學(xué)科學(xué)出版社,2011：238-244.

[4]許卓文,杜媛鯤.醫(yī)學(xué)論文中插圖的正確表達(dá)和編輯加工[J].臨床薈萃,2013,28(9):1079-1080.

[5]唐增煦,陳海峰,崔彥紅,等.科技期刊論文插圖常見問題分析[J].衛(wèi)生研究,2013,42(2):350-352.

Drawing Survival Curve by Graphpad Prism 5.0 Software

GAO Yong-qiang1，SUN Fang2
1.Department of Liver Disease Section,The Second People's Hospital of Ordos City,Ordos,Inner Mongolia，017000 China；2.Department of Care Division 2 Area,Ordos City of Inner Mongolia Hospital,Ordos,Inner Mongolia，017000 China

Statistics and charts was often involved in medical academic papers.This paper briefly expounds the methods of drawing survival curve by scientific graphics software graphpad prism5.0 and modifying the chart.

Statistics;Scientific graphics software;Survival analysis

R19

A

1672-5654(2015）05(b）-0012-04

2015-02-11）

高永強（1979.9-），男，陜西榆林人，碩士，主治醫(yī)師，目前從事消化系統(tǒng)疾病、老年病臨床研究及衛(wèi)生統(tǒng)計相關(guān)工作。