馬競 劉飛 麥光興 梁卉 熊禮寬 馬端
(1. 深圳市寶安區(qū)婦幼保健院,廣東 深圳 518000;2. 復(fù)旦大學(xué)出生缺陷研究中心,上海 200032)
肌萎縮側(cè)索硬化家系致病基因SOD1的突變檢測
馬競1,2劉飛2麥光興1梁卉1熊禮寬1馬端2
(1. 深圳市寶安區(qū)婦幼保健院,廣東 深圳 518000;2. 復(fù)旦大學(xué)出生缺陷研究中心,上海 200032)
目的 檢測一個香港肌萎縮側(cè)索硬化(ALS)家系的銅、鋅超氧化物歧化酶基因(Cu/Zn superoxide dismutase,SOD1)的突變位點(diǎn)。方法 對先證者SOD1的5個外顯子進(jìn)行PCR擴(kuò)增后進(jìn)行sanger測序。結(jié)果 在先證者的SOD1第5外顯子發(fā)現(xiàn)一個已知的致病性錯義突變c.(449 T>C)(p.Ile150Thr)。對家系中其他患者和未發(fā)病者進(jìn)行驗(yàn)證,發(fā)現(xiàn)此突變在該家系中與疾病共分離。結(jié)論SOD1錯義突變c.(449T>C)(p.Ile150Thr)是該肌萎縮側(cè)索硬化家系患者發(fā)病的的原因。
肌萎縮側(cè)索硬化;SOD1;錯義突變
肌萎縮側(cè)索硬化(aroyotrophic lateral sclerosis, ALS)是最常見的運(yùn)動神經(jīng)元疾病,發(fā)病率約每年(1~3)/10萬,患病率為每年(4~8)/10萬[1]。病變主要累及大腦皮質(zhì)、腦干、脊髓前角等處的運(yùn)動神經(jīng)元,導(dǎo)致運(yùn)動神經(jīng)元細(xì)胞死亡。臨床上以上、下運(yùn)動神經(jīng)系統(tǒng)受累為主要表現(xiàn),包括肌肉無力、肌肉萎縮、肌束震顫及肌張力增高、腱反射亢進(jìn)等,一般無感覺異常及大小便障礙。80%~90%的患者于發(fā)病后3~5年死亡,其病因與發(fā)病機(jī)制尚不明確[2]。
ALS可分為家族性肌萎縮側(cè)索硬化癥和散發(fā)性肌萎縮側(cè)索硬化癥。家族性ALS(FALS)主要有12個亞型:ALS1-ALS8、合并ALS的額顳葉癡呆綜合征、X性連鎖遺傳的ALS、關(guān)島型ALS-Parkinson-癡呆綜合征、進(jìn)行性下運(yùn)動神經(jīng)元疾病等。按照遺傳方式,F(xiàn)ALS可分為常染色體顯性遺傳(AD)和常染色體隱性遺傳(AR),前者占絕大多數(shù),后者罕見。按照起病年齡可分為兩種:成年型FALS和青少年型FALS,二者以25歲為界線。成年型FALS有很多種類,其中以ALS1最常見,呈AD 遺傳,致病基因?yàn)殂~/鋅超氧化物歧化酶1基因(Cu Zn superoxide dismutase,SOD1)[3]。
目前在FALS患者中發(fā)現(xiàn)了100余種SOD1的致病性突變,大多數(shù)為錯義突變,第1外顯子中第4個密碼子由丙氨酸(Ala)突變?yōu)槔i氨酸(Val)為最常見的突變,約占所有突變的40%~50%[4]。尚無資料顯示臨床表型的嚴(yán)重程度、進(jìn)展以及病程長短與突變類型之間有相關(guān)性。
本研究針對一個香港ALS家系進(jìn)行系統(tǒng)的臨床觀察和SOD1測序,以期確定SOD1某種突變類型與臨床表現(xiàn)之間的關(guān)系。
1.1 研究對象 2012年在深圳寶區(qū)安婦幼保健院收集到1個香港ALS家系,家系圖見圖1。所有患者均由兩個副教授以上職稱的神經(jīng)科醫(yī)生收集病史并查體。每個患者均做肌電圖、頸椎磁共振和常規(guī)生化檢查。全部病例均按照國際診斷標(biāo)準(zhǔn)進(jìn)行診斷。家系中所有收集到的患者和正常人均簽署了知情同意書。該研究經(jīng)深圳寶安區(qū)婦幼保健醫(yī)院醫(yī)學(xué)倫理委員會批準(zhǔn)。
圖1 ALS-HK家系圖■:男性發(fā)??;●:女性發(fā)??;□:男性未發(fā)病;○:女性未發(fā)病/死亡;箭頭所示為先證者
1.2 研究方法
1.2.1 DNA的提取 采集外周靜脈血2 ml,2% EDTA 1∶9抗凝后-80 ℃分裝保存。取200 μl血樣,用QIAamp DNA Blood Mini kit (Qiagen, Germany)試劑盒進(jìn)行DNA抽提,雙蒸水洗脫。應(yīng)用Primer3軟件設(shè)計(jì)SOD1 5個外顯子的引物,引物序列見表1,包含全外顯子部分及其側(cè)翼100 bp序列堿基。
表1 SOD1 5個外顯子引物序列
1.2.2 PCR擴(kuò)增 反應(yīng)體積為25 μl,含25 ng的模板DNA,dNTP各200 μmol/L,2.5 mmol/L MgCl2,正向反向引物各0.5 μmol/L。Touch-down PCR條件:95 ℃預(yù)變性3分鐘;95 ℃變性30秒,68 ℃復(fù)性30秒,72 ℃延伸1分鐘,2個循環(huán);95 ℃變性30秒,66 ℃復(fù)性30秒,72 ℃延伸1分鐘,2個循環(huán);95 ℃變性30秒,64 ℃復(fù)性30秒,72 ℃延伸1分鐘,2個循環(huán);95 ℃變性30秒,62 ℃復(fù)性30秒,72 ℃延伸分鐘,2個循環(huán);95 ℃變性30秒,60 ℃復(fù)性30秒,72 ℃延伸1分鐘,2個循環(huán);95 ℃變性30秒,58 ℃復(fù)性30秒,72 ℃延伸1分鐘,2個循環(huán);95 ℃變性30秒,56 ℃復(fù)性30秒,72 ℃延伸1分鐘,2個循環(huán);95 ℃變性30秒,55 ℃復(fù)性30秒,72 ℃延伸1分鐘,28個循環(huán);72 ℃充分延伸10 分鐘;4 ℃保存。
1.2.3 Sanger法測序 SAP酶純化后,用ABI 3730XL 測序,Mutation Surveyor V4.0.5 (Softgenetics, USA)查看測序結(jié)果。
2.1 患者臨床表現(xiàn) Ⅲ:1:先證者,43歲,2011年5月發(fā)病,主訴肌束震顫、手麻痹、四肢無力,夜間腳和小腿抽筋,難以入睡,腰痛。病情呈進(jìn)行性加重。2012年10月來本院就診。根據(jù)臨床變現(xiàn),通過神經(jīng)電生理檢查和影像學(xué)等輔助檢查,最終診斷為肌萎縮側(cè)索硬化癥。
2.2 遺傳分析 由家系圖分析,3代中均有患者,疾病連續(xù)傳遞,推測為常染色體顯性遺傳(圖1)。對家系中的先證者Ⅲ:1進(jìn)行SOD1所有編碼區(qū)進(jìn)行測序,發(fā)現(xiàn)cDNA的第449位T突變?yōu)镃(GeneBank No.:NM_000454.4),導(dǎo)致SOD1蛋白第150位異亮氨酸密碼子ATT變?yōu)樘K氨酸密碼子ACT(圖2)。進(jìn)一步的測序表明該家系的所有患者都具有Ile150Thr突變,而家系中其他正常成員皆未發(fā)現(xiàn)這一SOD1突變。提示這一錯義突變是引起本家系成員患有肌萎縮側(cè)索硬化證的原因所在。HGMD數(shù)據(jù)庫顯示,1995年P(guān)ramatarova等發(fā)現(xiàn)該突變位點(diǎn)是引起肌萎縮側(cè)索硬化證的致病位點(diǎn)[5]。
圖2 SOD1測序圖A:家系中正常人SOD1測序圖;B:家系中先證者Ⅲ:1SOD1基因的測序圖
SOD1基因位于21q22,長11Kb,含5個外顯子,編碼的銅/鋅超氧化物歧化酶1(SOD1)含153個氨基酸,大小為32KD。SOD1屬于金屬酶,包含兩個方向相反的亞基,每個亞基均含有一個Cu2+和一個Zn2+[6]。SOD1是SOD家族中最重要的一種抗氧化酶,其基本功能是維持細(xì)胞內(nèi)活性氧內(nèi)穩(wěn)態(tài)的平衡,以達(dá)到解毒的目的。最初認(rèn)為SOD1突變體導(dǎo)致 ALS 的原因可能與酶失活有關(guān),然而大量研究表明,SOD1突變體導(dǎo)致 ALS 的原因是突變產(chǎn)生的獲得性毒性新功能,機(jī)制尚不清楚[7]。
中國人群也廣泛存在SOD1基因突變。2006年,F(xiàn)ong GC等[7]在一個香港家系發(fā)現(xiàn)了SOD1基因突變p.Ile150Thr,此錯義突變影響了SOD1的亞基與銅離子的結(jié)合部位,從而導(dǎo)致了酶功能發(fā)生改變。2012年,Jinyu Wu等[3]在一個中國北方家系發(fā)現(xiàn)了SOD1基因突變 p.Cys146X,該突變造成SOD1發(fā)生截短突變,使重要的功能結(jié)構(gòu)域丟失,導(dǎo)致蛋白質(zhì)功能異常,從而影響了清除自由基的能力。
HGMD數(shù)據(jù)庫最新數(shù)據(jù)顯示,迄今共發(fā)現(xiàn)SOD1基因致病突變180種,與家族性ALS發(fā)病有關(guān)的突變150種,其中包括錯義和無義突變126種,剪接位點(diǎn)突變6種,缺失突變14種,插入突變4種,多集中在歐美國家,在亞洲人群鮮有報(bào)道[8]。盡管SOD1幾乎表達(dá)于所有組織,但突變后的臨床表現(xiàn)僅累及運(yùn)動神經(jīng)元,且大多為成年起病。不同的SOD1突變導(dǎo)致的ALS臨床表型上也有差別,包括外顯率、紅細(xì)胞SOD1活性、起病年齡、生存期、組織病理學(xué)等。不同的SOD1突變對ALS病程也有影響,如A4V突變平均病程為1~2年,E100G突變?yōu)?.7年,而H46R和G37R為18~20年[9]。家族遺傳性ALS約占所有ALS的20%,家系成員多在40~50歲起病,發(fā)病后2~5年死亡。
我們對收集到的一個香港ALS家系進(jìn)行了SOD1基因所有5個外顯子測序,結(jié)果發(fā)現(xiàn)先證者及家系中所有患者均存在SOD1第5外顯子一個錯義突變c. (449 T>C) (p.Ile150Thr),該突變在家系中與疾病共分離,因此可以判斷此錯義突變是該ALS家系的致病突變。
盡管p.Ile150Thr突變之前已經(jīng)被報(bào)道過,但每一個ALS家系SOD1致病位點(diǎn)的確認(rèn),都會豐富SOD1的基因突變譜,從而為ALS的基因診斷提供更多數(shù)據(jù)。
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編輯:宋文穎
Objective To screen the mutation of copper, zinc superoxide dismutase (SOD1) gene in a Hong Kong amyotrophic lateral sclerosis (ALS) family. Method All the 5 exons ofSOD1 gene from the proband were amplified by PCR and then sequenced by Sanger’s method. Resuls A known pathogenic missense mutation c. (449 T>C) (p. Ile150Thr) in exon 5 ofSOD1was found in theproband and this mutationwas cosegregatewith the disease in this pedigree. Conclusions The missense mutation (449 T>C) (p. Ile150Thr) ofSOD1was the cause of the amyotrophic lateral sclerosis in the Hongkong family.
ALS;SOD1; missense mutation
10.13470/j.cnki.cjpd.2015.04.007
R714.55
A
2015-09-30)