課題組長(zhǎng)俞作仁教授
同濟(jì)大學(xué)轉(zhuǎn)化醫(yī)學(xué)高等研究院/同濟(jì)大學(xué)附屬東方醫(yī)院轉(zhuǎn)化醫(yī)學(xué)研究中心俞作仁教授,早年師從細(xì)胞生物學(xué)專家、中國(guó)科學(xué)院薛社普院士,于2003年獲得中國(guó)醫(yī)學(xué)科學(xué)院/中國(guó)協(xié)和醫(yī)科大學(xué)博士學(xué)位,之后赴美賓夕法尼亞大學(xué)醫(yī)學(xué)院做博士后研究,自此開(kāi)始步入非編碼RNA(ncRNA)研究領(lǐng)域。2009年至2011年受聘于美國(guó)托馬斯杰弗遜大學(xué)為正式教職員工,并任職科研助理教授,2011年全職回國(guó),加盟同濟(jì)大學(xué)東方轉(zhuǎn)化醫(yī)學(xué)研究中心和腫瘤干細(xì)胞研究所,擔(dān)任課題組長(zhǎng)和研究中心副主任,參與創(chuàng)建了上海東方轉(zhuǎn)化醫(yī)學(xué)公共技術(shù)服務(wù)平臺(tái)。
作為一名研究基礎(chǔ)醫(yī)學(xué)的科研工作者,俞作仁教授肩上所賦予的重荷也許是常人難以想象的,在他所從事的腫瘤生物學(xué)研究中,醫(yī)學(xué)的龐復(fù)繁雜、科研的精密枯燥都匯集其中。他自2011年進(jìn)入東方醫(yī)院開(kāi)始組建自己的研究團(tuán)隊(duì)以來(lái),主持和參與了科技部“973”重點(diǎn)研究項(xiàng)目、國(guó)家自然科學(xué)基金項(xiàng)目、上海市科委重點(diǎn)項(xiàng)目等的研究,先后發(fā)表了30多篇SCI學(xué)術(shù)論文,參編了兩本英文專著。他與美國(guó)研究所合作發(fā)現(xiàn)了細(xì)胞周期蛋白調(diào)控乳腺腫瘤發(fā)生的一種新機(jī)制,這項(xiàng)研究為腫瘤發(fā)生領(lǐng)域帶來(lái)了廣泛的啟示,其研究成果已于2013年發(fā)表在《Nature Communications》上,美國(guó)《每日科學(xué)》以首發(fā)新聞的方式進(jìn)行了報(bào)道;我國(guó)生物通、轉(zhuǎn)化醫(yī)學(xué)網(wǎng)等以《同濟(jì)研究員解析乳腺癌》為標(biāo)題進(jìn)行了專題報(bào)道;同時(shí)他還研究發(fā)現(xiàn)了一條癌細(xì)胞之間信號(hào)傳遞的新機(jī)制[首次將微小RNA(miRNA)的功能從癌細(xì)胞內(nèi)擴(kuò)展到癌細(xì)胞外異源信號(hào)通路調(diào)控],該成果已發(fā)表在美國(guó)科學(xué)院學(xué)報(bào)。論文發(fā)表當(dāng)月,歐洲《Oncology News》雜志主編Denys Wheatley便在刊首對(duì)其研究做了重要評(píng)價(jià)……
近日,本刊記者就上述話題,深入采訪了俞作仁教授。
發(fā)現(xiàn)細(xì)胞周期蛋白間
負(fù)反饋調(diào)控環(huán)路
俞作仁教授介紹說(shuō):“我在美國(guó)以及回國(guó)之后,主要是從事腫瘤生物學(xué)研究。利用國(guó)際前沿的非編碼基因以及腫瘤干細(xì)胞,尋找能夠有效預(yù)防或者抑制腫瘤細(xì)胞增殖和轉(zhuǎn)移的方法。在東方醫(yī)院,以惡性乳腺腫瘤和腫瘤干細(xì)胞作為主要研究對(duì)象,結(jié)合臨床樣本分析,重點(diǎn)開(kāi)展如何增加腫瘤細(xì)胞對(duì)藥物的敏感性,如何預(yù)防和治療腫瘤復(fù)發(fā)和轉(zhuǎn)移的研究,同時(shí)探索miRNA與抗腫瘤化學(xué)藥物的聯(lián)合使用方案。通過(guò)miRNA干預(yù)增加腫瘤干細(xì)胞對(duì)藥物的敏感性,尋求一種從患者體內(nèi)徹底清除或抑制腫瘤細(xì)胞,有效防治腫瘤復(fù)發(fā)和轉(zhuǎn)移的miRNA干預(yù)方案。此外,由于東方醫(yī)院在診治心臟病方面的強(qiáng)大臨床實(shí)力,我加盟了心衰研究所,逐步開(kāi)展了心肌干細(xì)胞和心肌重構(gòu)的應(yīng)用研究,主持了上海市科委兩項(xiàng)重點(diǎn)項(xiàng)目的研究?!?/p>
ncRNA包括微小miRNA和長(zhǎng)鏈非編碼RNA(lncRNA),是近年來(lái)生命科學(xué)領(lǐng)域研究熱點(diǎn)之一。miRNA 調(diào)控基因表達(dá)參與胚胎發(fā)育和多種生理及病理過(guò)程已經(jīng)被廣泛證實(shí)。對(duì)lncRNA的認(rèn)識(shí)雖然還處于初步階段,但已有研究表明,lncRNA參與染色質(zhì)修飾、基因轉(zhuǎn)錄調(diào)控及疾病調(diào)控等。細(xì)胞周期蛋白D1(CCND1),作為細(xì)胞周期G0/G1-S轉(zhuǎn)變的重要調(diào)控因子,在超過(guò)50%的乳腺癌組織異常高表達(dá)。CCND1可導(dǎo)致乳腺癌細(xì)胞分裂周期失控,擴(kuò)增異常。CCND1轉(zhuǎn)基因能夠誘導(dǎo)小鼠乳腺腫瘤的發(fā)生。很多研究報(bào)道證實(shí)了miRNA對(duì)細(xì)胞周期以及乳腺癌的特異調(diào)控作用。細(xì)胞周期調(diào)控與miRNA調(diào)控如何相互作用,協(xié)同抑制或約束,誘導(dǎo)了乳腺癌發(fā)生和發(fā)展?帶著這個(gè)問(wèn)題,俞作仁教授分析了乳腺癌異常表達(dá)的miRNA,并就miRNA和CCND1的靶向調(diào)控做了深入研究,最早證明了miR-17/20通過(guò)靶向抑制細(xì)胞周期蛋白D1,抑制乳腺癌細(xì)胞增殖,同時(shí)發(fā)現(xiàn)CCND1對(duì)miR-17/20轉(zhuǎn)錄的誘導(dǎo)功能,提出乳腺癌調(diào)控中CCND1-miR-17/20負(fù)反饋環(huán)路,二者既協(xié)同作用又互相制約,精確調(diào)控細(xì)胞周期和增殖的分子機(jī)制。一旦這種調(diào)控失衡,則導(dǎo)致腫瘤發(fā)生和發(fā)展。該研究成果發(fā)表在美國(guó)細(xì)胞生物學(xué)雜志(Journal of Cell Biology,2008)。論文發(fā)表6年來(lái),Google Scholar引用率超過(guò)200多次。
俞作仁教授分析說(shuō),生物學(xué)和病理學(xué)調(diào)控是多基因、多通路參與的復(fù)雜網(wǎng)絡(luò),我們研究發(fā)現(xiàn),CCND1體內(nèi)基因敲除或者體外特異敲低,伴隨著miRNA表達(dá)的整體下調(diào)。一個(gè)基因如何抑制一類非編碼分子的表達(dá)?與乳腺癌發(fā)生有何因果關(guān)系?針對(duì)這個(gè)問(wèn)題,我們系統(tǒng)研究了CCND1在miRNA生物生成、運(yùn)輸、降解等各個(gè)環(huán)節(jié)的作用,發(fā)現(xiàn)CCND1在體內(nèi)、體外均能誘導(dǎo)DICER 基因的表達(dá),促進(jìn)miRNA整體的生物合成,同時(shí)調(diào)控組蛋白(H3K9)甲基化。在DICER基因的啟動(dòng)子區(qū)發(fā)現(xiàn)細(xì)胞周期蛋白D1的特異結(jié)合序列,該序列對(duì)DICER轉(zhuǎn)錄調(diào)控起關(guān)鍵作用。我們通過(guò)近2200例乳腺癌臨床標(biāo)本信息分析,發(fā)現(xiàn)細(xì)胞周期蛋白D1與DICER協(xié)同作用,在管腔A型及基底型乳腺癌發(fā)揮重要功能。
原創(chuàng)性發(fā)現(xiàn)癌轉(zhuǎn)移
異源信號(hào)傳遞通路
癌細(xì)胞和微環(huán)境之間的關(guān)系,類似于種子和土壤之間的關(guān)系。微環(huán)境不僅為癌細(xì)胞提供了生存環(huán)境,更為重要的是介導(dǎo)了癌細(xì)胞之間的信號(hào)傳遞。癌細(xì)胞和間質(zhì)細(xì)胞分泌到細(xì)胞外的各類生長(zhǎng)因子、趨化因子對(duì)癌細(xì)胞特征具有重要調(diào)控作用。俞作仁教授研究發(fā)現(xiàn),miR-17/20過(guò)表達(dá)不影響乳腺癌細(xì)胞的遷移和侵襲,但細(xì)胞上清液能夠明顯抑制三陰性乳腺癌細(xì)胞的遷移和轉(zhuǎn)移。通過(guò)進(jìn)一步研究,他們發(fā)現(xiàn)miR-17/20可選擇性抑制乳腺癌細(xì)胞的分泌功能,降低癌細(xì)胞微環(huán)境IL8、CXCR1、Cytokeratin 8和alpha-Enolase的含量。Cytokeratin 8和alpha-Enolase是癌細(xì)胞表面plasminigen受體的激活劑,與癌細(xì)胞遷移和侵襲功能密切相關(guān)。該研究首次將miRNA功能從細(xì)胞內(nèi)擴(kuò)展到細(xì)胞外,不僅證明了miRNA調(diào)控癌癥轉(zhuǎn)移的新機(jī)制,也提出了調(diào)控癌細(xì)胞之間信號(hào)傳遞的新途徑。該調(diào)控途徑一年后得到美國(guó)普林斯頓大學(xué)的研究證實(shí);該研究成果發(fā)表在美國(guó)科學(xué)院學(xué)報(bào)PNAS。論文發(fā)表4年,Google Scholar的引用率已超過(guò)200次,包括Nature Medicine, Cancer Research, Oncogene等期刊的論文引用。
俞作仁教授針對(duì)miR-17/20調(diào)控乳腺癌開(kāi)展的一系列研究,不僅發(fā)現(xiàn)miRNA-微環(huán)境-癌轉(zhuǎn)移的異源信號(hào)傳遞通路,證明癌基因(CCND1、MYC、E2F等)與miRNA17/20之間的負(fù)反饋調(diào)控環(huán)路,還發(fā)現(xiàn)miR-17/20作為乳腺癌化療藥物“增敏劑”,參與促進(jìn)p53誘導(dǎo)細(xì)胞凋亡調(diào)控,增加乳腺癌細(xì)胞對(duì)藥物的敏感性,具有臨床應(yīng)用潛力。
此外,俞作仁教授還實(shí)驗(yàn)證實(shí)了三陰性乳腺癌治療的潛在靶點(diǎn):非編碼RNA miR-221/222。俞作仁教授對(duì)此介紹說(shuō),占乳腺癌大約15%的三陰性乳腺癌,因?yàn)槿狈Υ萍に厥荏w(ER)、孕激素受體(PR)和人表皮生長(zhǎng)因子受體(HER2),缺乏內(nèi)分泌及抗HER2治療的靶點(diǎn),臨床尚無(wú)有效治療方案。他帶領(lǐng)的研究小組篩查了miRNA在各類乳腺癌細(xì)胞株的表達(dá)譜,分析了上百例乳腺癌患者的miRNA表達(dá)特征,發(fā)現(xiàn)miR-221/222在三陰性乳腺癌細(xì)胞株和癌組織特異高表達(dá),有的甚至高達(dá)上百倍。俞作仁教授近期研究表明,miR-221/222對(duì)乳腺腫瘤干細(xì)胞具有特異調(diào)控作用,特異敲低miR-221/222能夠促進(jìn)抑制乳腺腫瘤干細(xì)胞再生腫瘤的能力,而且能夠提高三陰性乳腺癌細(xì)胞對(duì)抗癌藥的敏感性。
記者了解到,如何利用非編碼RNA對(duì)乳腺癌細(xì)胞的調(diào)控功能,提高癌細(xì)胞對(duì)藥物的敏感性,是俞作仁教授近期主要研究?jī)?nèi)容之一。他們研究發(fā)現(xiàn),miR-17/20可促進(jìn)p53表達(dá),參與p53誘導(dǎo)的細(xì)胞凋亡過(guò)程的調(diào)控,并能夠提高乳腺癌細(xì)胞對(duì)阿霉素的敏感性,降低藥物半數(shù)致死量。俞作仁教授表示,該研究結(jié)果提示非編碼RNA可作為癌細(xì)胞對(duì)藥物的“增敏劑”。miR-17/20聯(lián)合阿霉素給藥治療乳腺癌,作為新型抗癌方案(基因治療+化學(xué)治療)的一個(gè)例子,體外已經(jīng)證實(shí)其有效性,體內(nèi)效果他們正在研究中?!霸擁?xiàng)目是我們?cè)谵D(zhuǎn)化醫(yī)學(xué)方向邁出的一小步,相信其研究結(jié)果將為抑癌研究思路和抗癌治療方案提供一些有用的信息。”俞作仁教授說(shuō)。
俞作仁教授還在早期通過(guò)克隆測(cè)序手段,在生殖干細(xì)胞中發(fā)現(xiàn)10個(gè)新的miRNA分子,并獲得了官方認(rèn)可和命名。miRNA信息和資源的官方網(wǎng)站miRBase中的miR-449a,miR-463,miR-464,miR-465,miR-466,miR-467,miR-468,miR-469,miR-470,miR-471序列是俞作仁教授首次發(fā)現(xiàn)并提交miRBase、經(jīng)專家審核認(rèn)定并由官方命名的;其研究成果發(fā)表在生殖生物學(xué)雜志上(Biology of Reproduction),屬于生殖生物學(xué)領(lǐng)域首篇miRNA系統(tǒng)研究論文。該雜志兩位主編當(dāng)期對(duì)論文給予特別點(diǎn)評(píng),稱其為“具有震撼力的突破性成果(Ground-breaking work)”。
投身東方轉(zhuǎn)化,偶然中的必然
2011年,俞作仁教授與東方醫(yī)院簽訂引進(jìn)合同,當(dāng)年年底到東方醫(yī)院工作,開(kāi)始組建自己的研究團(tuán)隊(duì)。他說(shuō)自己到東方醫(yī)院“有一定的偶然性,也有一定的必然性,對(duì)自己個(gè)人來(lái)說(shuō)也是一次人生重大選擇。偶然性是指回國(guó)前我在美國(guó)從事科研工作8年,工作穩(wěn)定(回國(guó)前是大學(xué)科研助理教授),有了綠卡,買了房子,孩子上了中學(xué),可以說(shuō)已在美國(guó)安居樂(lè)業(yè),沒(méi)有想過(guò)有一天會(huì)回國(guó)發(fā)展。說(shuō)必然,是因?yàn)樵谘芯糠较蛏?,我始終有一個(gè)理念:從事應(yīng)用型研究,學(xué)習(xí)有所用,研究有所實(shí),成果有所被享。正是東方給予了我這個(gè)平臺(tái),使我可以馳騁于東方、可以遨游于轉(zhuǎn)化醫(yī)學(xué)的研究?!?/p>
俞作仁教授總是說(shuō)臨床與科研其實(shí)沒(méi)有本質(zhì)的區(qū)別,前者著眼于當(dāng)下為患者解除病痛,后者著眼于未來(lái)為患者解除病痛,兩者需要互相支撐,協(xié)同發(fā)展。他認(rèn)為:“只要我的研究不是一張紙、一篇論文,而是有益于減輕患者疾苦,惠利于患者病痛的,我都愿意去為之努力。同濟(jì)東方轉(zhuǎn)化醫(yī)學(xué)研究中心的模式和理念,在美國(guó)幾乎不可能實(shí)現(xiàn)。”
俞作仁教授從上中學(xué)起就對(duì)生物學(xué)有著濃厚的興趣,考大學(xué)時(shí)報(bào)考的都是生物學(xué)專業(yè)。此后在醫(yī)院的工作經(jīng)歷,以及在協(xié)和醫(yī)科大學(xué)的博士學(xué)習(xí),更加讓他堅(jiān)定了醫(yī)學(xué)生物研究的信念。博士畢業(yè)之后,他就隨著協(xié)和畢業(yè)生大軍,遠(yuǎn)赴美國(guó)常青藤大學(xué)賓夕法尼亞大學(xué)醫(yī)學(xué)院,進(jìn)行博士后深造。
在2011年春節(jié)前后,俞作仁教授和一個(gè)已經(jīng)回國(guó)發(fā)展的朋友電話聊天,他提起了國(guó)內(nèi)轉(zhuǎn)化醫(yī)學(xué)的發(fā)展勢(shì)頭,尤其提到該校裴鋼校長(zhǎng)到任同濟(jì)之后對(duì)轉(zhuǎn)化醫(yī)學(xué)研究中心的新理念:在醫(yī)院建立研究所,臨床和科研專家聯(lián)手,開(kāi)展轉(zhuǎn)化醫(yī)學(xué)研究。這一下子挑動(dòng)了俞作仁教授潛意識(shí)里的一根神經(jīng)。在美國(guó)做科研,俞作仁教授充分體會(huì)到獲得臨床標(biāo)本和開(kāi)展臨床合作的艱難。在醫(yī)院建立轉(zhuǎn)化醫(yī)學(xué)研究機(jī)構(gòu),看似簡(jiǎn)單,但的確是一個(gè)創(chuàng)新型思維,而且實(shí)際操作難度也不小,關(guān)鍵是人員、空間、投入、后續(xù)研究經(jīng)費(fèi)等。俞作仁教授馬上上網(wǎng)查閱了東方轉(zhuǎn)化醫(yī)學(xué)研究中心的很多新聞和信息,有一種被震撼了的感覺(jué)?!拔耶?dāng)時(shí)趁著一股熱情,一周之內(nèi)就做了一個(gè)人生很大的決定:加盟東方,開(kāi)展轉(zhuǎn)化醫(yī)學(xué)研究?!庇嶙魅式淌诨貞浾f(shuō)。
三大價(jià)值一路支撐科研信念
談到當(dāng)初為什么會(huì)選擇生物醫(yī)學(xué)專業(yè),俞作仁教授說(shuō),一方面是受了從事醫(yī)學(xué)工作的父親的影響,一方面是自己從小對(duì)生物學(xué)的興趣?!皬氖驴蒲泄ぷ?,有幾個(gè)原因,一是我自身性格特點(diǎn)。我生性安靜,善于思考,不喜歡也不樂(lè)于表現(xiàn)自我或者從事社會(huì)性工作。另外一個(gè)原因,是我碩士畢業(yè)之后在一家省級(jí)三甲醫(yī)院工作期間,雖然不在臨床一線,但目睹了很多患者無(wú)助的眼神和醫(yī)生無(wú)奈的表情。我們對(duì)許多疾病的了解和治療手段很有限,這凸顯了醫(yī)學(xué)科研的滯后,或者說(shuō)有著無(wú)限的發(fā)展空間?;谶@兩個(gè)原因,我于2000年到北京協(xié)和醫(yī)科大學(xué)攻讀博士學(xué)位,從此開(kāi)始了科研生涯。讓我震撼也影響我職業(yè)生涯的是我在協(xié)和讀博士期間,有一位50歲左右的男士找到我們實(shí)驗(yàn)室,希望捐助100萬(wàn)元人民幣,讓我們開(kāi)展一項(xiàng)研究——他女兒患某疾病,現(xiàn)有醫(yī)學(xué)無(wú)法醫(yī)治。他愿意傾家蕩產(chǎn)讓我們研究,寄一絲希望能挽留他女兒的生命。盡管我們無(wú)法幫他,但這事兒讓我對(duì)科研事業(yè)的追求更加執(zhí)著?!?/p>
ncRNA作為近年來(lái)生命醫(yī)學(xué)領(lǐng)域的研究熱點(diǎn),與疾病密切相關(guān),日益引起生命學(xué)術(shù)界和臨床醫(yī)學(xué)界的關(guān)注。俞作仁教授自2004年步入microRNA領(lǐng)域,屬于ncRNA早期研究人員。從早期測(cè)序簽定新的miRNA分子,到研究miRNA作用機(jī)制和篩選靶基因,再到體內(nèi)、體外實(shí)驗(yàn)探索miRNA對(duì)癌細(xì)胞增殖和轉(zhuǎn)移的調(diào)控,直至今天拓寬研究范疇到lncRNA,更聚焦于惡性程度高的三陰性乳腺癌和癌干細(xì)胞的研究。其科研成果在本領(lǐng)域內(nèi)的科學(xué)價(jià)值主要體現(xiàn)在三個(gè)方面:一是有助于推動(dòng)ncRNA在抗癌轉(zhuǎn)化醫(yī)學(xué)研究中的應(yīng)用;二是有助于從ncRNA角度探索乳腺癌發(fā)生和轉(zhuǎn)移的分子機(jī)制;三是有助于從ncRNA中探尋癌癥治療的新靶點(diǎn)。不難想象在這些科研成果背后,他所經(jīng)歷的“昨夜西風(fēng)凋碧樹(shù),獨(dú)上高樓,望盡天涯路”的科研孤獨(dú)與艱辛;他所堅(jiān)守的“衣帶漸寬終不悔,為伊消得人憔悴”的科研理念的執(zhí)著與不懈,以及他所獲得的“眾里尋他千百度,驀然回首,那人卻在燈火闌珊處”的科研之果,這都完美地詮釋了他的科學(xué)研究的三種境界。
從年少時(shí)的生物學(xué)興趣到以后從事的醫(yī)學(xué)研究,從醫(yī)學(xué)生到博士后,從協(xié)和醫(yī)科大學(xué)到美國(guó)常青藤大學(xué)賓夕法尼亞大學(xué)醫(yī)學(xué)院,從美國(guó)助理教授到東方醫(yī)院轉(zhuǎn)化醫(yī)學(xué)研究中心的管理者,俞作仁教授一路走來(lái),是一種科研的信念支撐著他,就如同他所說(shuō)的“科研是著眼于未來(lái)的”,他正是那個(gè)抓住未來(lái)、追上未來(lái),把“未來(lái)”轉(zhuǎn)為“現(xiàn)在”的人!