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傳統(tǒng)發(fā)酵香腸中菌種的分子生物學(xué)鑒定

2015-12-20 06:59李丙超胡衛(wèi)東唐文才李興玲
食品與機(jī)械 2015年3期
關(guān)鍵詞:香腸菌種乳酸菌

李丙超 胡衛(wèi)東 唐文才 李興玲

鐘 強(qiáng) 李再新 張 智

(四川理工學(xué)院化學(xué)與制藥工程學(xué)院,四川 自貢 643000)

發(fā)酵香腸亦稱生香腸,是利用自然界有益微生物發(fā)酵生產(chǎn)和保存的一種肉食制品。發(fā)酵香腸的制作是將切成小塊豬、牛和羊等瘦肉和部分肥肉與鹽、糖和香辛料等混合,灌入腸衣,經(jīng)微生物發(fā)酵、風(fēng)干而制成具有特殊發(fā)酵香味的肉制品[1,2],或者采用人工添加微生物發(fā)酵劑進(jìn)行制品發(fā)酵,調(diào)節(jié)微生物發(fā)酵群落變化,形成特殊風(fēng)味。人工添加微生物制劑可以縮短發(fā)酵時(shí)間,改善香腸的色澤和風(fēng)味,抑制有害雜菌生長[3],并延長香腸的保存期[4]。

中國發(fā)酵香腸歷史悠久,類型眾多,主要分為川味香腸和廣味香腸。其主要區(qū)別為廣味甜,川味辣。在發(fā)酵過程中,適合在香腸中生長的微生物種類較多,但有益于香腸發(fā)酵形成特殊風(fēng)味口感的微生物并不是很多[5]。為篩選和鑒定香腸發(fā)酵的有益微生物,克服傳統(tǒng)微生物物種鑒定的不足,本研究擬通過從傳統(tǒng)優(yōu)良發(fā)酵香腸中分離、篩選菌株,其后通過真菌ITS以及細(xì)菌16SrDNA分子鑒定,構(gòu)建系統(tǒng)發(fā)育樹[6],確定其屬種,以期將獲得的優(yōu)良肉制品菌種發(fā)酵劑應(yīng)用于發(fā)酵肉和發(fā)酵香腸的生產(chǎn)中,進(jìn)一步提高發(fā)酵肉制品品質(zhì)。

1 材料與方法

1.1 材料與儀器

1.1.1 菌株

菌株:從四川簡陽某肉制品市場的傳統(tǒng)羊肉香腸中采集。

1.1.2 試劑

蛋白胨、牛肉膏、酵母浸膏、瓊脂:分析純,北京鼎國昌盛生物技術(shù)有限責(zé)任公司;

蛋白酶K:30U/mg,德國 Merck公司;

SDS:分析純,德國Sigma公司;

PCR所用試劑:Taq酶2.5U/μL、dNTPs 2.5mmol/L、10×PCR buffer等,大連寶生物工程有限公司。

1.1.3 主要儀器與設(shè)備

電子分析天平:SA5103N型,梅特勒—托利多儀器(上海)有限公司;

生化培養(yǎng)箱:SHP-100型,金壇市晶玻實(shí)驗(yàn)儀器廠;

凝膠成像儀:TS2-310型,美國UVP LLC公司;

Eppendorf PCR儀:Mastrcycler nexus gradient型,美國Eppendorf公司。

1.2 試驗(yàn)方法

1.2.1 菌種的分離 無菌條件下取25g香腸于225mL無菌生理鹽水中,充分振蕩,即為10-1樣品稀釋液,用生理鹽水按10倍稀釋比稀釋至10-6。分別取10-4,10-5,10-6樣品稀釋液涂布于MRS(蛋白胨10g,牛肉膏10g,酵母浸膏5g,K2HPO42g,檸檬酸二銨2g,乙酸鈉5g,葡萄糖20g,吐溫80mL,MgSO4·7H2O 0.5g,MnSO40.25g,蒸餾水1 000 mL,pH值6.2~6.4,121℃滅菌20min)固體平板,33℃培養(yǎng)48h。根據(jù)培養(yǎng)皿上菌落的顏色、表面光滑度、干濕度以及邊緣形態(tài)將菌落進(jìn)行初篩。采用反復(fù)劃線分離單菌落的方法,將初篩的菌株進(jìn)一步分離,選擇沒有蔓延且單獨(dú)的菌落,并鏡檢分析。

1.2.2 生化試驗(yàn)檢測 將分離培養(yǎng)的疑似酵母菌接種于YPD、TTC顯色平板,30℃培養(yǎng)24h,觀察顯色結(jié)果。將分離的疑似葡萄球菌和疑似乳酸菌分別接種到滅菌脫脂牛奶(含石蕊25g/L),37℃培養(yǎng)24~36h,另將此兩種菌進(jìn)行過氧化氫觸酶試驗(yàn)即將對數(shù)生長期的細(xì)菌挑取到潔凈玻片上,并立即滴加新鮮的3%過氧化氫,立即觀察有無氣泡。

1.2.3 菌株基因組DNA提取 取2.0mL發(fā)酵液于離心管中,12 000×g離心1min,棄上清,收集菌體。采用SDS—酶法[7-10],其步驟如下:2mL過夜發(fā)酵液于12 000×g離心1min,收集菌體,再加入500μL Tris緩沖液(pH 8.0)和300 μL 10%SDS充分混勻后65℃水浴1h,立即置于-80℃放置15min再65℃水浴15min,如此反復(fù)凍融3次,再4℃6 000×g離心10min,取上清加入等體積的酚—氯仿—異戊醇(25∶24∶1,V∶V∶V),漩渦震蕩5min,室溫靜置10min后1 3000×g離心20min,取上清加入0.6倍體積異戊醇,室溫沉淀1.5h,13 000×g離心20min,去上清,用1mL 70%乙醇洗沉淀一次,室溫?fù)]發(fā)10min,加入50μL滅菌水并于65℃水浴1h后-20℃保存,作為PCR模板。

1.2.4 菌株16SrDNA和ITS序列分析 以30ng提取的基因組DNA為模板,采用Taq酶和引物(細(xì)菌16SrDNA引物:1492R:5’-GTA TTA CCG CGG CTG CTG G-3’,8F:5’-AGA GTT TGA TCC TGG CTC AG-3’;真菌ITS引物序列:ITS1:5′-TCC GTA GGT GAA CCT GCG G-3′,ITS4:5′-TCC TCC GCT TAT TGA TAT GC-3′)對細(xì)菌16SrDNA和真菌ITS進(jìn)行PCR擴(kuò)增。細(xì)菌的PCR擴(kuò)增反應(yīng)體系為:滅菌水33μL;10×PCR buffer 5μL;dNTPs(2.5mmol/L)4 μL;MgCl2(25mmol/L)3μL;1492R(20mmol/L)1μL;8F(20mmol/L)1μL;Taq酶(2.5U/μL)1.5μL;模板(10 ng/μL)3μL;真菌的PCR擴(kuò)增反應(yīng)體系為:滅菌水30.5μL;10×PCR buffer 5μL;dNTPs(2.5mmol/L)4μL;MgCl2(25mmol/L)3μL;ITS1(20mmol/L)2μL;ITS4(20 mmol/L)2μL;Taq酶(2.5U/μL)1.5μL;模板(10ng/μL)3μL。PCR擴(kuò)增反應(yīng)條件:94℃預(yù)變性50s,94℃變性30 s,55℃退火25s,72℃延伸1min,共25個(gè)循環(huán),72℃延伸10min,4℃保存。PCR擴(kuò)增產(chǎn)物用1%瓊脂糖凝膠電泳檢測。回收陽性PCR產(chǎn)物,送上海生工生物工程技術(shù)服務(wù)有限公司測序。將測序結(jié)果輸入GenBank數(shù)據(jù)庫,與數(shù)據(jù)庫中收錄的16SrDNA和ITS序列比對,得到與分離菌序列相似的菌種16SrDNA和ITS基因序列,用MegAlign軟件得到系統(tǒng)發(fā)育樹。

2 結(jié)果與分析

2.1 菌種的分離結(jié)果

經(jīng)過MRS培養(yǎng)基分離與鏡檢,得到3種優(yōu)勢菌,它們的主要形態(tài)特征為:A菌菌落較大且表面干燥,突起,邊緣圓滑較濕潤,呈乳白色,不透明,鏡檢顯示菌體個(gè)體形態(tài)較大,呈卵球形;B菌菌落較小,表面扁平且較濕潤,邊緣光滑,呈淡乳白色,不透明,革蘭氏染色鏡檢顯示個(gè)體形態(tài)呈鏈狀或者線狀,部分呈“X”形、“Y”形的革蘭氏染色陽性菌;C菌菌落較小,表面扁平、平滑、較干燥,呈黃色,不透明,革蘭氏染色鏡檢顯示為陽性菌,且個(gè)體形態(tài)較小,呈典型的球狀,無鏈接狀。初步將此3種菌分為:A疑似酵母菌、B疑似乳酸菌、C疑似葡萄球菌。

2.2 生化分析

將疑似酵母菌直接點(diǎn)樣接種于YPD平板上培養(yǎng)24h后,再在上層倒入TTC培養(yǎng)基,發(fā)現(xiàn)平板上顯示紅色菌落(圖1A),初步判定為酵母菌。石蕊牛奶試驗(yàn)結(jié)果顯示疑似葡萄球菌和疑似乳酸菌都能使石蕊牛奶變紅(圖1B和1C),過氧化氫觸酶試驗(yàn)顯示疑似乳酸菌不產(chǎn)生氣泡為陰性,疑似葡萄球菌產(chǎn)生大量氣泡為陽性。

圖1 疑似菌生化結(jié)果Figure 1 The result of biochemical experiment

2.3 PCR擴(kuò)增16S和ITS序列結(jié)果

以分離菌基因組DNA為模板,利用16SrDNA和ITS引物進(jìn)行PCR擴(kuò)增,分別得到了約630bp(a泳道)、1 410bp(b泳道)和1 480bp(c泳道)的目的條帶(見圖2),結(jié)果與預(yù)期相符。

圖2 細(xì)菌16SrDNA和真菌ITS序列PCR擴(kuò)增Figure 2 Electrophoresis of PCR products

2.4 測序及系統(tǒng)進(jìn)化樹的構(gòu)建

2.4.1 酵母菌ITS序列分析結(jié)果 PCR擴(kuò)增酵母菌ITS序列,測序分析結(jié)果表明該序列大小為636bp,將該基因與NCBI數(shù)據(jù)庫進(jìn)行比對。BLAST比對結(jié)果發(fā)現(xiàn)該序列與德巴利酵母 ATCCMYA-4749(HQ999977.1)的ITS序列相似度達(dá)到99%,利用MegAlign軟件構(gòu)建的系統(tǒng)發(fā)育樹(見圖3),結(jié)果表明二者處在同一分支上,進(jìn)化距離近,最終判斷該酵母菌為德氏酵母。

圖3 系統(tǒng)發(fā)育樹Figure 3 System growth trees

2.4.2 葡萄球菌16SrDNA結(jié)果 測序結(jié)果表明PCR擴(kuò)增的16SrDNA序列大小為1 411bp,將該序列與NCBI數(shù)據(jù)庫進(jìn)行比對。BLAST比對結(jié)果發(fā)現(xiàn)該序列與腐生葡萄球菌YSY1-6株(GU197535.1)的16SrDNA 序列相似度 達(dá)到100%,利用MegAlign軟件構(gòu)建的系統(tǒng)發(fā)育樹(見圖4)表明二者處在同一分支上,進(jìn)化距離近,最終判斷為YSY1-6腐生葡萄球菌。

2.4.3 乳酸菌16SrDNA結(jié)果 測序結(jié)果表明PCR擴(kuò)增的16SrDNA序列大小為1 489bp,將該序列與NCBI數(shù)據(jù)庫進(jìn)行比對。BLAST比對結(jié)果發(fā)現(xiàn)該序列與德式乳桿菌NBRC3376株(AB680073.1)的16SrDNA序列相似度達(dá)到99%,利用MegAlign軟件構(gòu)建的系統(tǒng)發(fā)育樹(見圖5)表明二者處在同一分支上,進(jìn)化距離近,最終判斷為德式乳桿菌。

圖4 系統(tǒng)發(fā)育樹Figure 4 System growth trees

圖5 系統(tǒng)發(fā)育樹Figure 5 System growth trees

3 結(jié)論

發(fā)酵香腸是中國人喜愛的食品,不同工藝和調(diào)味料配方,產(chǎn)生不同的風(fēng)味、香型。其制作過程中的微生物種類及數(shù)量變化對香腸品質(zhì)十分重要[11]。傳統(tǒng)微生物技術(shù)鑒定香腸中細(xì)菌和霉菌的方法主要是依據(jù)它們的形態(tài)特征和生理特征,但往往只能鑒定到屬水平,不能反映與其它物種之間的親緣關(guān)系,而且耗時(shí)、工作量大,不利于工業(yè)化生產(chǎn)的在線檢測[12]。隨著分子生物學(xué)、基因工程的發(fā)展,越來越多的技術(shù)被應(yīng)用于菌種的鑒定,在大大減少工作量的同時(shí)顯著提高了鑒定的準(zhǔn)確性。本研究利用微生物rRNA序列的保守性,從傳統(tǒng)羊肉香腸中分離酵母和細(xì)菌,以細(xì)菌16SrDNA和酵母ITS為指標(biāo)來鑒定香腸中的微生物,結(jié)果發(fā)現(xiàn)香腸中德氏酵母、YSY1-6腐生葡萄球菌、德式乳酸乳桿菌亞種較豐富。目前工業(yè)上用于發(fā)酵香腸的發(fā)酵劑主要由乳酸菌、片球菌等混合而成[13],本研究結(jié)論也證明了發(fā)酵香腸中的微生物主要組成。根據(jù)王永霞[14]的介紹這些細(xì)菌降低了香腸的pH且還原了亞硝酸鹽,對發(fā)酵香腸的質(zhì)地有明顯影響。傳統(tǒng)的自然發(fā)酵香腸風(fēng)味往往是乳酸菌、酵母等優(yōu)勢菌與其它雜菌競爭的結(jié)果,受季節(jié)、地區(qū)等外界環(huán)境的影響不易大規(guī)模生產(chǎn)。通過生理生化與基因鑒定方法,可以得到自然發(fā)酵香腸中的優(yōu)勢菌,為模擬自然發(fā)酵的風(fēng)味提供了基礎(chǔ)。

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