余丹純 聶玉強(qiáng) 賈 林 黃耀星 孫小娟
廣州市第一人民醫(yī)院消化內(nèi)科(廣州 511457)
?
胃癌組織miR-9的表達(dá)及其與臨床病理的關(guān)系
余丹純聶玉強(qiáng)賈林黃耀星孫小娟
廣州市第一人民醫(yī)院消化內(nèi)科(廣州 511457)
【摘要】目的觀察miR-9在胃癌組織中的表達(dá)水平及其與臨床病理的相關(guān)性。方法采用實(shí)時(shí)熒光定量PCR方法分別檢測(cè)28例胃癌及正常胃組織中miR-9的表達(dá)水平,并分析其表達(dá)情況與臨床病理資料的關(guān)系。結(jié)果胃癌組織miR-9的表達(dá)水平[0.0078(0.0031~0.0142)]顯著低于相應(yīng)正常胃組織[0.0177(0.0084~0.0311),P<0.05],尤其是伴淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移者[0.0021(0.0006~0.0685)]miR-9表達(dá)水平明顯降低。結(jié)論胃癌組織中miR-9低表達(dá),且與胃癌淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移有關(guān)。
【關(guān)鍵詞】胃腫瘤臨床病理學(xué)逆轉(zhuǎn)錄聚合酶鏈反應(yīng)miR-9
微小RNA(miRNA)是真核生物中一類22個(gè)核苷酸的非編碼小分子RNA,在進(jìn)化上具有高度保守性,能通過與靶基因mRNA特異性的堿基互補(bǔ)配對(duì),引起靶基因m-RNA降解或抑制其翻譯,從而對(duì)基因進(jìn)行轉(zhuǎn)錄后的表達(dá)調(diào)控,作為一類潛在的癌基因或抑癌基因發(fā)揮作用[1-3],成為近年研究的熱點(diǎn)。多個(gè)研究發(fā)現(xiàn),miR-9在神經(jīng)腫瘤、乳腺癌、宮頸癌、食道癌、結(jié)直腸癌、淋巴瘤等腫瘤的發(fā)生、發(fā)展和轉(zhuǎn)移中起重要作用[4-10]。由于miRNA具有組織特異性,不同細(xì)胞來源的腫瘤可能會(huì)有不同的miRNA上調(diào)或下調(diào)[11],目前尚未有關(guān)于miR-9表達(dá)與胃癌關(guān)系的研究報(bào)道,本研究擬探討miR-9在胃癌組織中的表達(dá)水平及其與臨床病理特征的相關(guān)性。
1資料與方法
1.1標(biāo)本收集廣州醫(yī)科大學(xué)附屬廣州市第一人民醫(yī)院2012年11月—2013年11月外科手術(shù)切除并經(jīng)病理確診的28例胃癌患者,所有患者術(shù)前均未接受任何抗腫瘤治療。手術(shù)標(biāo)本取新鮮胃癌及遠(yuǎn)離癌灶至少5cm的正常黏膜組織各1塊,沖洗干凈后立即置于液氮中保存。正常黏膜組織進(jìn)行病理學(xué)檢查未見癌細(xì)胞浸潤(rùn)。
1.2臨床資料采集所有入組患者的臨床資料,包括性別、年齡、影像學(xué)檢查(CT或MR)、術(shù)中所見及術(shù)后病理結(jié)果。其中男21例,女7例,平均年齡(58.3±13.1)歲;高分化腺癌3例,中分化腺癌9例,低分化腺癌16例;伴淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移19例,無淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移9例;按照胃癌TNM分期方法:Ⅰ期2例,Ⅱ期6例,Ⅲ期9例,Ⅳ期11例。
1.3總RNA的提取鑒定和cDNA合成及保存將100 mg組織于液氮中研碎,加入1 mL Trizol(美國(guó) Invitrogen),按照說明書提取RNA后用分光光度計(jì)檢測(cè)RNA的濃度和純度,并行電泳鑒定,置于-80°C保存?zhèn)溆?。每個(gè)標(biāo)本分別取2 μg總RNA,按照miRNA逆轉(zhuǎn)錄試劑盒(EXIQON)說明書操作合成第一鏈cDNA,合成cDNA置于-20°C保存?zhèn)溆谩?/p>
1.4引物設(shè)計(jì)及合成在miRNA Base數(shù)據(jù)庫和Gene Bank數(shù)據(jù)庫中查找miR-9及內(nèi)參基因U6的基因序列,使用primer-Express 2.0軟件設(shè)計(jì)引物,由EXIQON公司合成。miR-9上游引物:5′-ACACTCCAGCTGGGTCTTTGGTTATCTAGCT-3′,下游引物:5′-CTCAACTGGTGTGGAGTCGGCAATTCAGTTGAGTCATACAG-3′。U6上游引物:5′-ATTGGAACGATACAGAGAAGATT-3′,下游引物:5′-GGAACG-CTTCACGAATTTG-3′。
1.5qRT-PCR檢測(cè)miR-9的表達(dá)水平按照qRT-PCR試劑盒(丹麥 EXIQON)使用說明書,在MJR option 2熒光定量PCR儀上同時(shí)進(jìn)行標(biāo)準(zhǔn)品及樣品U6及miR-9表達(dá)水平測(cè)定。反應(yīng)條件:95°C 5 min預(yù)變性,然后95°C 10 s,62°C 45 s,72°C 10 s,共40個(gè)循環(huán)。根據(jù)標(biāo)準(zhǔn)曲線,實(shí)時(shí)定量PCR儀直接計(jì)算出每一樣品各基因的表達(dá)量(每個(gè)標(biāo)準(zhǔn)品及樣品均作3個(gè)復(fù)孔,取平均值進(jìn)行數(shù)據(jù)分析)。為了校準(zhǔn)標(biāo)本間RNA治療和逆轉(zhuǎn)錄效率差異,對(duì)每一樣品檢測(cè)所得miR-9的表達(dá)量進(jìn)行標(biāo)準(zhǔn)化。miR-9標(biāo)化表達(dá)量=同一份標(biāo)本miR-9表達(dá)量/U6表達(dá)量。
2結(jié)果
2.1總RNA的鑒定每份組織標(biāo)本提取的總RNA濃度5~11 g/L,A260/A280值均在1.85~2.00之間。紫外線下在1%瓊脂糖凝膠上可見28S、18S、5S 3條帶,28S和18S的亮度比約為1.5∶1~2∶1,5S條帶比較淡,見圖1。表明提取的總RNA純度高,降解少,可用于后續(xù)實(shí)驗(yàn)。
2.2miR-9的表達(dá)水平癌組織中miR-9中位表達(dá)量0.0078(0.0031~0.0142)顯著低于相應(yīng)正常胃組織0.0177(0.0084~0.0311)(Z=-2.733,P=0.008)。
2.3胃癌組織中miR-9表達(dá)與臨床病理特征的關(guān)系miR-9的表達(dá)下調(diào)與患者年齡、性別、腫瘤分化程度和TNM分期無關(guān)(P>0.05),與淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移有關(guān)(P<0.05),見表1。
圖1 組織總RNA 1%瓊脂糖凝膠電泳圖
3討論
胃癌(Gastric Cacinoma)是最常見的消化道惡性腫瘤,占全球癌癥死亡原因的第二位。盡管近年來治療手段不斷改進(jìn),早期胃癌5年生存率可達(dá)90%,但晚期胃癌5年生存率僅為14%,其治療效果取決于腫瘤大小、分期、病理類型、侵襲和轉(zhuǎn)移等。因此,尋找特異性的分子標(biāo)記物,對(duì)明確早期腫瘤的生物學(xué)特性,實(shí)施針對(duì)性治療有著重要意義。
近年來miRNA在人類惡性腫瘤性疾病中的作用受到高度的重視。在腫瘤組織中染色體常發(fā)生缺失、增加或重排現(xiàn)象,而miRNA位于染色體的脆性位點(diǎn),因此異常表達(dá)的miRNA可能在腫瘤形成中扮演重要角色,可能是控制細(xì)胞增殖和凋亡的抑癌基因或致癌基因[12-13]。miRNA表達(dá)的改變可以導(dǎo)致遺傳信息表達(dá)的改變從而導(dǎo)致相應(yīng)的病理生理狀態(tài),而處于一定病理生理狀態(tài)的組織常伴有特定的miRNA表達(dá)[14]。對(duì)腫瘤miRNA表達(dá)的研究有助于多種癌癥的分型和預(yù)后判斷[15]。尋找并研究特異性的miRNA及其靶基因的表達(dá)有助于胃癌的分型和預(yù)后判斷,可為治療提供新的思路。
表1 胃癌組織中miR-9表達(dá)與
注:M(Q25~Q75)分別是miR-9標(biāo)化表達(dá)量的中位數(shù)及上下四分位數(shù),*P<0.05
人miR-9有23個(gè)核苷酸,有3種類型:miR-9-1、miR-9-2和miR-9-3,分別定位于1q22、5q14.3、15q26.1,具有促癌和抑癌雙向調(diào)節(jié)作用,在不同細(xì)胞來源的腫瘤組織其表達(dá)及作用不盡相同。多項(xiàng)研究發(fā)現(xiàn),miR-9在神經(jīng)腫瘤、乳腺癌、宮頸癌、食道癌、結(jié)直腸癌、淋巴瘤等腫瘤的發(fā)生、發(fā)展和轉(zhuǎn)移中起重要作用[4-10]。NASS D等[4]還發(fā)現(xiàn)miR-9在原發(fā)性腦腫瘤中表達(dá)明顯上調(diào),而在其他腦轉(zhuǎn)移瘤中表達(dá)明顯下調(diào),對(duì)于區(qū)別是否原發(fā)性腦腫瘤具有重要的意義。而在宮頸癌患者中,miR-9的表達(dá)與其生存率有關(guān)[6]。目前尚未有關(guān)于miR-9在胃癌組織中表達(dá)情況的報(bào)道。
本研究發(fā)現(xiàn),胃癌組織miR-9的表達(dá)水平顯著低于相應(yīng)正常胃組織,通過對(duì)miR-9的表達(dá)水平與患者性別、年齡、腫瘤分化程度、TNM分期及淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移進(jìn)行相關(guān)性分析發(fā)現(xiàn),伴淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移者miR-9表達(dá)水平明顯下調(diào),提示miR-9低表達(dá)與胃癌的侵襲和轉(zhuǎn)移有關(guān)。miR-9低表達(dá)也與黑色素瘤[16]和食管癌的侵襲、轉(zhuǎn)移有關(guān),提示miR-9可以作為評(píng)估侵襲能力的指標(biāo)。人類腫瘤組織CpG島啟動(dòng)子區(qū)域甲基化是抑癌miRNA表達(dá)缺失的重要機(jī)制之一[17],而表達(dá)miR-9的三個(gè)基因座位均具有CpG島。在惡性黑色素瘤中可見到miR-9基因位點(diǎn)高甲基化現(xiàn)象[18],胃癌組織中miR-9表達(dá)下調(diào)表達(dá)也可能與miR-9的異常甲基化有關(guān),有待我們更進(jìn)一步的研究證實(shí)。
總之,胃癌組織中miR-9低表達(dá),且與淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移有關(guān),是一有潛在價(jià)值的特異性miRNA,可能為將來胃癌的靶向治療提供新方向。
參考文獻(xiàn):
[1] LAGOS-QUINTANA M, RAUHUT R, LENDECKEL W, et al. Identification of novel genes coding for small expressed RNAs[J]. Science, 2001, 294(5543): 853-858.
[2] BARTEl DP. MicroRNAs: genomics, biogenesis, mechanism, and function[J]. Cell, 2004, 116(2): 281-291.
[3] CIAFRE SA, GALARDI S, MANGIOLA A, et al. Extensive modulation of a set of microRNAs in primary glioblastoma[J]. Biochem Biophys Res Commun, 2005, 334(4): 1351-1358.
[4] NASS D, RENWALD S, MEIRI E, et al. MiR-92b and miR-9/9 are specifically expressed in brain primary tumors and can be used to differentiate primary from metastaic brain tumors[J]. Brain Palhol, 2009, 19: 375-383.
[5] LEHMANN U, HASEMEIER B, CHRISTGEN M, et al. Epigenetic inactivation of microRNA gene has-mir-9-1 in hunman breast cancer[J]. J Pathol, 2008, 214(1): 17-24.
[6] HU X, SCHWARZ JK, LEWIS JS JR, et al. A mircroRNA expression signature for cervical cancer prognosis[J]. Cancer Res, 2010, 70(4):1441-1448.
[7] HU Y, CORREA AM, HOQUE A, et al. Prognostic significance of differentially expressed miRNAs in esophageal cancer[J]. Int J Cancer, 2011, 128(1): 132-143.
[8] 馮巨濱, 張桂炎, 麥冠梁,等. 食管癌組織和癌旁組織miR-9表達(dá)差異研究[J]. 海南醫(yī)學(xué)院學(xué)報(bào), 2014, 20(4): 458-461, 464.
[9] ONNIS A, DE FALCO G, ANTONICELLI G, et al. Alteration of microRNAs regulate by c-Myc in Burkitt lymphoma[J]. PLoS One, 2010, 5(9): 0012960.
[10] 胡亮, 韓建波, 龍啟強(qiáng),等. Has-miR-9在結(jié)直腸癌組織中的表達(dá)水平及意義[J]. 中國(guó)老年學(xué)雜志, 2014, 5(34): 2087-2088.
[11] BARAD O, MEIRI E, AVNIEL A, et al. MicroRNA expression detected byoligonucleotide microarrays system establishment and expression profiling inhuman tissues[J]. Genome Res, 2004, 14(12): 2486-2494.
[12] CALIN GA, DUMITRU CD, SHIMIZU M, et al. Frequent deletions and down-regulation of microRNA genes miR-15 and miR-16 at 13q14 in chronic lymphocytic leukemia[J]. Proc Natl Acad Sci USA, 2002, 99: 15524-15529.
[13] NAIRZ K, ROTTIG C, RINTELEN F, et al. Overgrowth caused by misexpression of a microRNA with dispensable wild type function[J]. Dev Biol, 2006, 291:314-324.
[14] COHN DE, FABBRI M, VALERI N, et al. Comprehensive miRNA profiling of surgically staged endometrial cancer[J]. Am J Obstet Gynecol, 2010, 202(6): 656.
[15] CUMMINS JM, VELCULESCU VE. Implications of microRNA profiling for cancer diagnosis[J]. Oncogene, 2006, 25: 6220- 6227.
[16] LIU S, KUMAR SM, LU H, et al. MicroRNA-9 up-regulate E-cadherin through inhibition of NF-κB1-Snail pathway in melanoma[J]. J Pathol, 2012, 226(1): 61-72.
[17] LOPEZ-SERRA P, ESTELLER M. DNA methulation-assiociated silencing of tumor-suppressor microRNAs in cancer[J]. Oncogene, 2012, 31(13): 1609-1622.
[18] SATO F, TSUCHIYA S, MELTZEr SJ, et al. MicroRNAS and epigenetics[J]. FEBS, 2011, 278(10): 1598-1609.
The correlation between miR-9 expression and clinicopathology in gastric carcinoma
YuDanchun,NieYuqiang,JiaLin,etal.
DepartmentofGastroenterology,GuangzhouFirstPeople’sHospital,Guangzhou510180,China
【Abstract】ObjectiveTo investigate the correlation between the level of miR-9 expression and clinicopathology in gastric carcinoma.MethodsThe expression of miR-9 in 28 cases of gastric carcinoma tissues and normal gastric tissues were detected by quantitative real-time PCR, and the relationship between the expression and clinicopathology was analyzed.ResultsThe expression of miR-9 expression in gastric carcinoma tissues [0.0078(0.0031~0.0142)] was significantly lower compared with the corresponding normal gastric tissues [0.0177(0.0084~0.0311),P<0.05], especially in lymph node-invasive carcinoma [0.0021(0.0006~0.0685)].ConclusionmiR-9 was down regulated in gastric cancer tissues, which was significantly associated with lymph node metastasis.
【Key words】Gastric neoplasms; Clinicopathology; Reverse transcriptase polymerase chain reaction; miR-9
DOI:10.3969/j.issn.1000-8535.2016.03.003
(收稿日期:2015- 02-15)