陸芳,李慶娜,趙陽,高蕊
中國中醫(yī)科學(xué)院西苑醫(yī)院臨床藥理研究所,北京 100091
中藥新藥臨床研究數(shù)據(jù)管理應(yīng)用CDISC標(biāo)準(zhǔn)的初步探討
陸芳,李慶娜,趙陽,高蕊
中國中醫(yī)科學(xué)院西苑醫(yī)院臨床藥理研究所,北京 100091
以一個(gè)中藥新藥Ⅲ期臨床研究為例,簡要介紹在數(shù)據(jù)庫中構(gòu)建人口統(tǒng)計(jì)學(xué)、受試者特征、臨床事件、病史、量表、實(shí)驗(yàn)室檢查、不良事件等7個(gè)中藥新藥臨床研究中常用的數(shù)據(jù)采集模塊,以及將其轉(zhuǎn)換到研究數(shù)據(jù)表格模型(SDTM)的過程,探討臨床數(shù)據(jù)交換標(biāo)準(zhǔn)協(xié)會(huì)(CDISC)臨床數(shù)據(jù)交換標(biāo)準(zhǔn)在中藥新藥臨床研究中應(yīng)用的可行性和需要注意的問題。
中藥新藥臨床研究;臨床數(shù)據(jù)交換標(biāo)準(zhǔn);數(shù)據(jù)管理
臨床數(shù)據(jù)交換標(biāo)準(zhǔn)協(xié)會(huì)(Clinical Data Interchange Standards Consortium,CDISC)是一個(gè)全球性的、開放的、多學(xué)科的、非盈利性組織,通過建立一系列臨床研究數(shù)據(jù)的標(biāo)準(zhǔn),如臨床數(shù)據(jù)采集標(biāo)準(zhǔn)(Clinical Data Acquisition Standards Harmonization,CDASH)、實(shí)驗(yàn)室數(shù)據(jù)模型(Laboratory Model,LAB)、操作數(shù)據(jù)模型(Operational Data Model,ODM)、研究數(shù)據(jù)表格模型(Study Data Tabulation Model,SDTM)、分析數(shù)據(jù)庫模型(Analysis Dataset Model,ADaM)等,來支持臨床研究數(shù)據(jù)與元數(shù)據(jù)的采集、交換、遞交和儲(chǔ)存,以優(yōu)化研究實(shí)施、數(shù)據(jù)交流、統(tǒng)計(jì)分析及最后向管理部門遞交資料的流程,大大縮短研究周期、節(jié)省費(fèi)用[1]。2014年12月,美國食品藥品監(jiān)督管理局(Food and Drug Administration,F(xiàn)DA)發(fā)布了具有約束力的數(shù)據(jù)申報(bào)標(biāo)準(zhǔn)指南,要求24個(gè)月后開始的臨床試驗(yàn)必須使用FDA要求的標(biāo)準(zhǔn)、格式和術(shù)語進(jìn)行注冊申請遞交,以避免管理部門在審查研究數(shù)據(jù)時(shí)花費(fèi)較多的資源[2]。我國藥政當(dāng)局也正在著手制定適合我國,特別是中藥新藥臨床研究的數(shù)據(jù)采集和申報(bào)標(biāo)準(zhǔn),本文從中藥新藥研究應(yīng)用CDISC標(biāo)準(zhǔn)實(shí)例出發(fā),探討其應(yīng)用的可行性和需要注意的問題。
筆者曾對(duì)CDISC標(biāo)準(zhǔn)進(jìn)行過解讀[3],CDASH由CDISC于2008年10月制定,其目的是簡化和規(guī)范各個(gè)臨床研究中心的數(shù)據(jù)采集,為設(shè)計(jì)病例報(bào)告表(Case Report Form,CRF)提供標(biāo)準(zhǔn)。其由一個(gè)基本的數(shù)據(jù)采集字段集(包括定義變量名稱、解釋、元數(shù)據(jù))組成,適用于臨床研究階段絕大多數(shù)CRF的設(shè)計(jì)。SDTM圍繞著臨床研究過程中采集的一系列觀察信息構(gòu)建,它規(guī)定遞交到藥政管理部門的臨床研究數(shù)據(jù)庫和數(shù)據(jù)庫變量的標(biāo)準(zhǔn),包括數(shù)據(jù)庫的結(jié)構(gòu)、目的、特征和其所包含的內(nèi)容,從而使評(píng)審人員能夠正確理解所遞交的數(shù)據(jù)庫信息。
要提交符合SDTM的數(shù)據(jù),為減少后期數(shù)據(jù)庫的映射工作,最捷徑的做法是在創(chuàng)建數(shù)據(jù)庫時(shí)即按照CDASH和SDTM對(duì)變量及元數(shù)據(jù)進(jìn)行定義,并通過define.xml文件對(duì)數(shù)據(jù)的結(jié)構(gòu)和內(nèi)容進(jìn)行描述。筆者參照CDASH和SDTM制定了本機(jī)構(gòu)臨床研究數(shù)據(jù)采集標(biāo)準(zhǔn),其中數(shù)據(jù)采集模塊共分為18大類,即一般識(shí)別變量(Common Identifier Variables)、不良事件(Adverse Events,AE)、伴隨治療(Concomitant Medications,CM)、人口統(tǒng)計(jì)學(xué)(Demographics,DM)、研究處理情況(Disposition,DS)、藥物依從性(Drug Accountability,DA)、心電圖檢查(ECG Test Results,EG)、研究藥物(Exposure,EX)、納入排除標(biāo)準(zhǔn)(Inclusion/Exclusion Criteria Not Met,IE)、實(shí)驗(yàn)室檢查(Laboratory Test Results,LB)、病史(Medical History,MH)、體格檢查(Physical Examination,PE)、方案偏離(Protocol Deviation,DV)、受試者特征(Subject Characteristics,SC)、物質(zhì)使用情況(Substance Use,SU)、生命體征(Vital Signs,VS)、量表(Questionnaire,QS)、臨床事件(Clinical Event,CE)。數(shù)據(jù)庫中的變量分為CDISC和機(jī)構(gòu)標(biāo)準(zhǔn),能夠直接按照CDASH或SDTM命名的變量為CDISC,否則為機(jī)構(gòu)標(biāo)準(zhǔn),在中藥新藥臨床研究中參照此標(biāo)準(zhǔn)進(jìn)行數(shù)據(jù)采集。
以一個(gè)中藥新藥Ⅲ期臨床研究為例,簡要介紹臨床研究中需要采集的受試者特征、人口統(tǒng)計(jì)學(xué)、臨床事件、病史、量表、不良事件、實(shí)驗(yàn)室檢查等7類數(shù)據(jù)及將其轉(zhuǎn)換為便于藥政管理部門審核的SDTM數(shù)據(jù)集的過程。
研究實(shí)例:A藥治療急性氣管-支氣管炎(痰熱阻肺證)隨機(jī)雙盲、安慰劑平行對(duì)照、多中心Ⅲ期臨床研究。研究對(duì)象為符合急性氣管-支氣管炎西醫(yī)診斷標(biāo)準(zhǔn)及痰熱阻肺證中醫(yī)辨證標(biāo)準(zhǔn),年齡在18~65歲之間,自愿簽署知情同意書者。試驗(yàn)組藥物為A藥(10 mL/次,每日3次),對(duì)照組為安慰劑(10 mL/次,每日3次),療程6 d。主要療效指標(biāo)為咳嗽、咳痰癥狀的改善。本試驗(yàn)數(shù)據(jù)管理基于電子化數(shù)據(jù)管理系統(tǒng),在臨床試驗(yàn)開始前,需要對(duì)整個(gè)試驗(yàn)中的數(shù)據(jù)管理做出安排,根據(jù)試驗(yàn)方案及相關(guān)文件,制定數(shù)據(jù)管理計(jì)劃。參考機(jī)構(gòu)數(shù)據(jù)采集標(biāo)準(zhǔn),明確所要收集的數(shù)據(jù)及其類型,設(shè)計(jì)數(shù)據(jù)采集表格。為方便后期數(shù)據(jù)庫的建立、數(shù)據(jù)的錄入和提取,在設(shè)計(jì)數(shù)據(jù)采集表格時(shí),參考CDASH,盡量以CDASH提供的域?yàn)閱挝贿M(jìn)行CRF模塊布局,使用各域中推薦的變量,其他變量根據(jù)方案要求靈活選擇;同時(shí),使用CDISC提供的受控術(shù)語作為變量結(jié)果代碼。完成紙質(zhì)CRF的設(shè)計(jì)及注釋后,在電子數(shù)據(jù)采集系統(tǒng)中構(gòu)建電子病例報(bào)告表(eCRF)。在數(shù)據(jù)庫設(shè)計(jì)階段引入CDISC標(biāo)準(zhǔn),保持?jǐn)?shù)據(jù)標(biāo)準(zhǔn)的統(tǒng)一和數(shù)據(jù)的可追溯性,可從數(shù)據(jù)庫中直接抽取出大量符合SDTM的數(shù)據(jù)集,進(jìn)而減少后期繁雜的映射轉(zhuǎn)換。
2.1 受試者特征
SC是與受試者相關(guān),并且沒有被采集到其他域中的數(shù)據(jù)。如受試者姓名拼音首字母、婚姻狀況、受教育程度等。SC域是DM數(shù)據(jù)的擴(kuò)展,每位受試者只采集1次數(shù)據(jù),一般情況下試驗(yàn)期間該域中的數(shù)據(jù)是不會(huì)更改的。
從電子化數(shù)據(jù)管理系統(tǒng)導(dǎo)出的數(shù)據(jù)看,SC數(shù)據(jù)集為非標(biāo)準(zhǔn)化結(jié)構(gòu)(見表1)。經(jīng)過轉(zhuǎn)換,原來在數(shù)據(jù)庫中的變量名“MARISTAT(婚姻)”、“EDLEVEL(受教育程度)”“EMPJOB(工作性質(zhì))”轉(zhuǎn)化為變量“SCTESTCD(受試者特征簡稱)”和“SCTEST(受試者特征)”的觀測結(jié)果,數(shù)據(jù)結(jié)構(gòu)呈現(xiàn)符合SDTM的結(jié)構(gòu)(見表2)。
表1 SC數(shù)據(jù)采集數(shù)據(jù)集(CDASH)結(jié)構(gòu)示例
表2 SC數(shù)據(jù)提交數(shù)據(jù)集(SDTM)結(jié)構(gòu)示例
2.2 人口統(tǒng)計(jì)學(xué)
DM數(shù)據(jù)的結(jié)構(gòu)是固定的,包括出生日期、年齡、性別、民族、人種及國家。在創(chuàng)建DM模塊變量池時(shí),為了收集受試者的民族信息情況,我們使用了CDASH中的變量ETHNIC(族群),另外建立了一個(gè)變量“ETHNIOTH(其他民族)”,作為機(jī)構(gòu)標(biāo)準(zhǔn)(見表3的CDASH數(shù)據(jù)集)。在轉(zhuǎn)化為SDTM數(shù)據(jù)集時(shí),按照CDISC中“RACEOTH(其他人種)”的處理方式,將相關(guān)數(shù)據(jù)放在DM域補(bǔ)充數(shù)據(jù)集(見表3的SUPPDM數(shù)據(jù)集)中。對(duì)于以SDTM形式上報(bào)的數(shù)據(jù),要定義一段時(shí)間作為受試者“接受試驗(yàn)干預(yù)”的參照時(shí)間段,開始和結(jié)束日期分別以變量“RFSTDTC(參照開始日期)”和“RFENDTC(參照結(jié)束日期)”表示。RFSTDTC是為研究開始的第1日,在本實(shí)例研究中,根據(jù)試驗(yàn)方案,把這段時(shí)間定義為從第1次服藥日期到最后1次服藥日期的時(shí)間。
表3 DM數(shù)據(jù)采集和提交數(shù)據(jù)集結(jié)構(gòu)示例
2.3 臨床事件
CE域是獲取研究中疾病的發(fā)作癥狀或體征,或者雖然可能導(dǎo)致不良事件,但事件本身并不構(gòu)成不良事件。本實(shí)例的研究疾病是急性氣管-支氣管炎(痰熱阻肺證),有關(guān)該疾病的診斷信息,為區(qū)別于既往病史信息的采集,將其記錄在CE域。需要說明的是,在CDASH中并沒有CE域,為了方便數(shù)據(jù)收集,在建庫時(shí)分西醫(yī)診斷和中醫(yī)辨證2個(gè)變量收集原始數(shù)據(jù),后期再轉(zhuǎn)換為縱向CE數(shù)據(jù)集。事件名稱需轉(zhuǎn)換為術(shù)語,由變量“CEDECOD(源于詞典的術(shù)語)”收集,西醫(yī)診斷可以使用國際醫(yī)學(xué)用語詞典(MedDRA)中的規(guī)范術(shù)語,中醫(yī)辨證可參考《中醫(yī)臨床診療術(shù)語·證候部分》(GB/T 16751.2-1997)中的術(shù)語。見表4、表5。
表4 CE數(shù)據(jù)采集數(shù)據(jù)集結(jié)構(gòu)示例
表5 CE數(shù)據(jù)提交數(shù)據(jù)集(SDTM)結(jié)構(gòu)示例
2.4 病史
MH數(shù)據(jù)指受試者在試驗(yàn)開始之前的病史,包括一般病史、過敏病史、生殖病史或其他特定疾病的病史。本實(shí)例在數(shù)據(jù)庫中采用1個(gè)病例多條記錄的模式收集MH數(shù)據(jù),導(dǎo)出的數(shù)據(jù)為縱向數(shù)據(jù)結(jié)構(gòu),其中以“MHCAT(病史分類)”區(qū)分“一般病史”和“過敏病史”(見表6)?!癕HENRF(結(jié)束狀態(tài))”是根據(jù)研究參考時(shí)期定義病史的結(jié)束狀態(tài),對(duì)于參考時(shí)期的定義每個(gè)研究可以不同。本實(shí)例研究參考時(shí)期以人口統(tǒng)計(jì)學(xué)數(shù)據(jù)集中的定義為準(zhǔn),即以第1次服藥日期作為研究開始時(shí)間,結(jié)束時(shí)間為最后1次服藥日期。該參考時(shí)期內(nèi)如果病史未結(jié)束,則結(jié)果記為“繼續(xù)”,病史結(jié)束日期為“空”;否則,則要記錄病史結(jié)束日期。
表6 MH數(shù)據(jù)轉(zhuǎn)換為SDTM數(shù)據(jù)結(jié)構(gòu)示例
2.5 量表
QS設(shè)置的每個(gè)問題均有一個(gè)特定的數(shù)字“得分”,計(jì)算這些得分的總和可得到總評(píng)分。QS數(shù)據(jù)可包括但不限于受試者報(bào)告的結(jié)果及驗(yàn)證或未經(jīng)驗(yàn)證的調(diào)查量表,如漢密頓抑郁量表、阿爾茨海默病評(píng)定量表等。
在中醫(yī)臨床研究中一般會(huì)收集中醫(yī)臨床癥狀積分情況,本例在建庫時(shí)將中醫(yī)癥狀觀察作為QS域中的一個(gè)分類。對(duì)于這類標(biāo)準(zhǔn)二維表格式的數(shù)據(jù),我們可以直接導(dǎo)出縱向結(jié)構(gòu)數(shù)據(jù)(見表7采集數(shù)據(jù)集),轉(zhuǎn)化為SDTM數(shù)據(jù)集時(shí),我們將變量“QSCAT(量表分類)”賦值為“QSCSO(臨床癥狀觀察)”;對(duì)于變量“QSTESTCD(問題簡稱)”尚未形成規(guī)范的受控術(shù)語,則以模塊名稱QSCSO加阿拉伯?dāng)?shù)字的形式表示(見表7提交數(shù)據(jù)集)。變量“QSDY(研究天數(shù))”描述了從參考日期作為第1日到本次訪視量表填寫日期的天數(shù),該變量通過量表填寫日期與DM域“RFSTDTC(參照開始日期)”的比較而得到。從RFSTDTC每過1 d“QSDY(研究天數(shù))”的值就增加1,往前1 d變量值就減1。
表7 QS數(shù)據(jù)采集和提交數(shù)據(jù)集結(jié)構(gòu)示例
2.6 不良事件
對(duì)于AE,和病史的數(shù)據(jù)采集一樣,直接應(yīng)用SDTM采集,在數(shù)據(jù)庫中采用1個(gè)病例多條記錄的模式收集數(shù)據(jù),導(dǎo)出的數(shù)據(jù)為縱向數(shù)據(jù)結(jié)構(gòu),其SDTM數(shù)據(jù)集樣式見表8。其中,必需變量“AEDECOD(字典編碼事件名稱)”一般使用MedDRA中的首選語(PT),但中醫(yī)臨床試驗(yàn)中出現(xiàn)的一些不良事件名稱如“上火”“潮熱”等還不能在MedDRA中找到規(guī)范的編碼。此外,對(duì)于與該條AE關(guān)聯(lián)的實(shí)驗(yàn)室檢查結(jié)果,使用相關(guān)記錄(RELREC)數(shù)據(jù)集進(jìn)行關(guān)聯(lián),其關(guān)系類型(RELTYPE)為一對(duì)一(ONE),對(duì)該名受試者的關(guān)系標(biāo)識(shí)符(RELID)為“A”(見表9)。
表8 AE數(shù)據(jù)(SDTM)結(jié)構(gòu)示例
表9 AE與LB的關(guān)聯(lián)結(jié)構(gòu)示例
2.7 實(shí)驗(yàn)室檢查
LB域存儲(chǔ)CRF采集或來自中心實(shí)驗(yàn)室的檢查數(shù)據(jù)。在本實(shí)例研究中,為了方便數(shù)據(jù)的采集,在建庫時(shí),將LB域分為幾個(gè)亞模塊,分別采集血常規(guī)、血生化、尿常規(guī)和便常規(guī)數(shù)據(jù)。在轉(zhuǎn)化為符合SDTM標(biāo)準(zhǔn)要求的數(shù)據(jù)集時(shí),需要將幾個(gè)亞模塊進(jìn)行拼接,并將變量“LBCAT(實(shí)驗(yàn)室檢查種類)”賦值為檢查結(jié)果對(duì)應(yīng)的亞模塊的名稱。例如,血常規(guī)檢查數(shù)據(jù)對(duì)應(yīng)的LBCAT的結(jié)果為“血常規(guī)”。另外,對(duì)于LB域,除了收集是否在正常值范圍內(nèi)外,還經(jīng)常會(huì)收集“臨床意義判定”和“異常解釋說明”。但是在CDASH和SDTM中實(shí)驗(yàn)室檢查域均無該變量,故筆者建庫時(shí)在LB域中增加變量“LBCLSIG(是否有臨床意義)”和“LBCOVAL(異常解釋說明)”。在轉(zhuǎn)化為SDTM標(biāo)準(zhǔn)變量時(shí),將變量LBCLSIG記錄在LB域補(bǔ)充數(shù)據(jù)集SUPPLB,變量LBCOVAL記錄在注釋域(Comment Domain,CO)中,以“RDOMAIN(關(guān)聯(lián)域名)”、“IDVAR(標(biāo)識(shí)變量)”和“IDVARVAL(標(biāo)識(shí)變量值)”將LB域與補(bǔ)充數(shù)據(jù)集SUPPLB和COMMENTS數(shù)據(jù)集聯(lián)系起來(見表10)。
表10 LB數(shù)據(jù)結(jié)構(gòu)示例
從數(shù)據(jù)庫建庫開始引入CDASH和SDTM,具有一些明顯的優(yōu)勢[4]。統(tǒng)一的數(shù)據(jù)收集定義可促進(jìn)不同項(xiàng)目研究間數(shù)據(jù)庫設(shè)計(jì)和結(jié)構(gòu)的標(biāo)準(zhǔn)化,使數(shù)據(jù)直接以上報(bào)遞交的SDTM格式儲(chǔ)存,簡化甚至消除了提取數(shù)據(jù)的再操作,使數(shù)據(jù)流程更加合理化[5]。但也存在一定缺陷,雖然CDASH是根據(jù)SDTM結(jié)構(gòu)建立的數(shù)據(jù)采集標(biāo)準(zhǔn),但畢竟二者的目的不同,因此增加了數(shù)據(jù)庫內(nèi)的映射復(fù)雜性。同時(shí)由于CDASH優(yōu)化的線性法要依賴使用的數(shù)據(jù)庫系統(tǒng),如果其基本表結(jié)構(gòu)對(duì)應(yīng)并不友好的錄入界面,還可能會(huì)使數(shù)據(jù)錄入過程復(fù)雜化[6-7]。
通過實(shí)例分析,中醫(yī)和西醫(yī)之間其臨床研究數(shù)據(jù)采集并沒有太多差異,基本可以按照CDASH或SDTM中的域或變量結(jié)構(gòu)來采集數(shù)據(jù)。同時(shí),受控術(shù)語對(duì)于數(shù)據(jù)標(biāo)準(zhǔn)化亦很重要,CDISC受控術(shù)語是一套CDISC開發(fā)或CDISC采納的標(biāo)準(zhǔn)表達(dá)(值),適用于CDISC定義的數(shù)據(jù)集里的數(shù)據(jù)條目,支持CDISC各個(gè)基本標(biāo)準(zhǔn)(如SDTM、CDASH、ADaM和SEND)及所有疾病/治療領(lǐng)域數(shù)據(jù)標(biāo)準(zhǔn)對(duì)受控術(shù)語的需求[8]。目前,在應(yīng)用CDISC標(biāo)準(zhǔn)的過程中,存在的主要問題是中醫(yī)臨床研究相關(guān)標(biāo)準(zhǔn)及其術(shù)語的缺乏,包括中醫(yī)臨床癥狀類量表和具有中醫(yī)特點(diǎn)的控制術(shù)語,如CDISC中合并用藥的“劑量單位”“劑型”“給藥途徑”,應(yīng)補(bǔ)充中醫(yī)特有的控制術(shù)語,如艾灸一壯(劑量單位),湯劑、散劑、膏方(劑型),煙熏、沐?。ńo藥途徑)。
可喜的是,目前在國家食品藥品監(jiān)督管理總局倡導(dǎo)下已經(jīng)成立臨床試驗(yàn)數(shù)據(jù)標(biāo)準(zhǔn)化工作指導(dǎo)組,其下設(shè)的TCM專業(yè)小組對(duì)中醫(yī)臨床研究如何實(shí)現(xiàn)CDISC標(biāo)準(zhǔn)進(jìn)行了研究和有益的探索[9]。CDISC標(biāo)準(zhǔn)在中醫(yī)臨床研究中的使用還處于起步階段,由于對(duì)CDISC標(biāo)準(zhǔn)理解的不同,可能會(huì)造成數(shù)據(jù)庫的建設(shè)和后期轉(zhuǎn)換整理時(shí)映射難度和映射結(jié)果的差異,例如,有的數(shù)據(jù)管理單位可能會(huì)把研究疾病相關(guān)中醫(yī)臨床癥狀放在事件或干預(yù)的“相關(guān)發(fā)現(xiàn) (Findings About)”中進(jìn)行收集。對(duì)此,應(yīng)加強(qiáng)對(duì)CDISC標(biāo)準(zhǔn)的學(xué)習(xí)和研討,逐漸形成行業(yè)內(nèi)的標(biāo)準(zhǔn),實(shí)現(xiàn)助力數(shù)據(jù)審評(píng)、數(shù)據(jù)交換的最終目的。
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A Preliminary Discussion of Application of CDISC Standards in Clinical Research Data Management of New Traditional Chinese Medicine
LU Fang, LI Qing-na, ZHAO Yang, GAO Rui
(Clinical Pharmacology Institute of Xiyuan Hospital, China Academy of Chinese Medical Sciences, Beijing 100091, China)
In this article, a new TCM clinical trial of phase Ⅲ was served as an example of application of Clinical Data Interchange Standards Consortium (CDISC). It briefly introduced seven data acquisition modules commonly used in clinical research of new traditional Chinese medicine, namely demographics, subject characteristic, clinical event, medical history, questionnaire, laboratory inspection and adverse event. It also introduced the process of transferring the above modules to Study Data Tabulation Models (STDM), and discussed the feasibility and some issues that required attention of CDISC application in clinical research of new traditional Chinese medicine.
clinical research of new traditional Chinese medicine;clinical data interchange standards;data management
10.3969/j.issn.1005-5304.2016.01.002
R2-05
A
1005-5304(2016)01-0009-06
2015-06-18)
(
2015-07-20;編輯:蔡德英)
中醫(yī)藥行業(yè)科研專項(xiàng)(201107006);國家科技重大專項(xiàng)-重大新藥創(chuàng)制(2012ZX09303-010-002)
高蕊,E-mail:ruigao@126.com