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長鏈非編碼RNA SNHG7在胃癌中的表達及功能

2017-06-05 15:18費正華
浙江實用醫(yī)學 2017年2期
關鍵詞:細胞系引物編碼

費正華

(溫州醫(yī)科大學附屬第一醫(yī)院,浙江 溫州325000)

·實驗研究·

長鏈非編碼RNA SNHG7在胃癌中的表達及功能

費正華

(溫州醫(yī)科大學附屬第一醫(yī)院,浙江 溫州325000)

目的 了解長鏈非編碼RNA SNHG7在胃癌組織中的表達情況,以及對胃癌細胞增殖和凋亡的影響。方法 采用實時熒光定量PCR(qRT-PCR)法檢測SNHG7在82例胃癌、癌旁組織及胃癌細胞系中的表達情況,分析胃癌組織中SNHG7表達量與臨床病理參數(shù)的相關性;用siRNA干擾人胃癌BGC823細胞SNHG7表達后,分別用CCK-8法、流式細胞術檢測細胞增殖和凋亡。 結(jié)果 SNHG7在胃癌組織較癌旁組織中表達明顯升高(P<0.01);胃癌組織中SNHG7的表達水平與腫瘤的浸潤深度(P<0.01),臨床分期(P<0.01)、區(qū)域淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移(P<0.05)有關。SNHG7表達被抑制后,BGC823細胞增殖能力下降,細胞凋亡率增加(P<0.01)。 結(jié)論 SNHG7在胃癌組織中顯著高表達,有望成為預測胃癌預后的標記物。

胃癌;長鏈非編碼RNA;SNHG7;增殖,凋亡

胃癌是一種嚴重危害人類生命安全的常見惡性腫瘤,晚期胃癌患者5年生存率不足10%,胃癌復發(fā)和轉(zhuǎn)移是其致死的主要原因,故發(fā)現(xiàn)調(diào)控胃癌細胞侵襲和遷移的相關基因,并尋找新的胃癌特異性生物標志物和藥物靶點迫在眉睫[1]。隨著對長鏈非編碼RNA(long non-coding RNA,lncRNA)了解的深入[2,3],越來越多的lncRNA被證實在胃癌中存在異常表達,具有甲基化、組蛋白修飾、染色體重塑、剪接、轉(zhuǎn)錄及翻譯調(diào)控等多種生物學功能,與胃癌發(fā)生、發(fā)展密切相關。本課題組在對基因表達綜合(Gene Expression Omnibus,GEO)數(shù)據(jù)庫中的芯片數(shù)據(jù)GSE51575進行了基因重注釋分析,發(fā)現(xiàn)差異表達在2倍以上的lncRNA有20個,其中異常表達的長非編碼RNA SNHG7位于人類染色體9q34.3,轉(zhuǎn)錄出長為869bp的轉(zhuǎn)錄本?;谝陨闲酒Y(jié)果,作者對SNHG7作為胃癌潛在分子標志物及其功能進行了初步研究。

1 材料與方法

1.1 組織標本 胃癌細胞系SGC7901、BGC823、MGC803、MKN45及正常胃黏膜上皮細胞GES-1由上海生物細胞庫提供,并收集本院2013年1月~2014年12月手術切除并經(jīng)病理確診的胃癌標本82例,所有患者術前均未接受抗腫瘤治療,年齡34~78歲,男49例,女33例。79例行D2淋巴結(jié)清掃的根治性胃切除手術,3例行姑息性手術。取距癌組織邊緣5cm以上的癌旁組織作為對照組。

1.2 方法

1.2.1 主要試劑 胎牛血清、DMEM購自Gibco公司;Trizol、LipofectAmine2000試劑購自美國Invitrogen公司;RNA反轉(zhuǎn)錄試劑盒、熒光定量PCR試劑盒購自TaKa Ra公司,CCK-8試劑盒、凋亡試劑盒購自南通碧云天生物科技有限公司;PCR引物由上海生工生物工程公司按以下序列合成:SNHG7引物序列:上游引物5'-CTAGGGGACTGGGCTGCT-3',下游引物5'-AGGGTCTTAGGTTCCAGGCA-3';βactin引物序列:上游引物5'-CTCCATCCTGGCCTCGCTGT-3',下游引物5'-GCTGTCACCTTCACCGTTCC-3'。

1.2.2 qRT-PCR 按 Trizol說明書要求提取組織總RNA,按qRT-PCR說明書要求配制50μL反應體系,并采用以下條件進行反轉(zhuǎn)錄反應: 50℃反轉(zhuǎn)錄反應30分鐘,92℃反應3分鐘變性反轉(zhuǎn)錄酶。所得到的cDNA按如下條件進行PCR擴增反應:92℃變性10秒,55℃退火20秒,68℃延伸20秒,擴增40個循環(huán)。以β-actin基因作為內(nèi)參,采用2-△△Ct法計算SNHG7 mRNA相對表達量。

1.2.3 細胞轉(zhuǎn)染 取2×105對數(shù)期生長細胞接種于6孔板中,混勻。置于37℃、5%CO2培養(yǎng)箱孵育24小時,將si SNHG7和LipofectAmine2000分別加入Opti-MEM中,輕輕振搖5分鐘后混勻,制成轉(zhuǎn)染液,室溫靜置20分鐘后,將轉(zhuǎn)染液加入細胞中,輕輕混勻,孵育6小時后棄去轉(zhuǎn)染液,加10%FBSDMEM繼續(xù)培養(yǎng)。SNHG7干擾RNA(si SNHG7)及陰性對照 (si SNHG7-N)序列由上海生工公司合成,SNHG7特異性 siRNA (上游引物 5'-CCGATTCTTAAGTTCTGCTATTGTG-3',下游引物5'-GCTATTGTGGTATTCTGGTGGAGAA-3'。

1.2.4 CCK-8法檢測細胞增殖 將轉(zhuǎn)染SNHG7干擾序列和NC序列的BGC823細胞按5×103/孔接種于96孔板,每組設置6個復孔,于接種后24、48、72和96小時按照CCK8試劑盒說明檢測細胞增殖。于450nm波長處測定每組細胞的吸光度值。取6孔平均值為結(jié)果(A值),以時間為橫軸,A值為縱軸繪制細胞增殖曲線。

1.2.5 流式細胞儀檢測細胞凋亡率 將2×105個細胞種于6孔板中,24小時后用不含EDTA的胰蛋白酶消化收集后,1000r/min離心5分鐘,棄上清,用預冷的PBS洗滌2次后重懸于75%乙醇,并于-20℃固定過夜,洗滌離心后加入含有10mg/L溴化丙啶(PI)和0.1%R Nase A的PBS液500μL,室溫避光染色10分鐘后,用流式細胞儀測定細胞凋亡時消化收集細胞,分別加入5μL AnnexinV-FITC和10μL碘化丙啶(PI),混勻。在室溫下,避光反應5~15分鐘檢測細胞凋亡率,以百分數(shù)表示細胞凋亡率。

1.3 統(tǒng)計學處理 采用SPSS17.0統(tǒng)計軟件進行分析。計量資料以(±s)表示,組間比較采用t檢驗;計數(shù)資料采用χ2檢驗。

2 結(jié)果

2.1 GEO數(shù)據(jù)分析 芯片GSE51575分析顯示一共有125條lncRNA在胃癌組織中存在差異表達,其中有20條表達升高或下降1倍以上,詳見表1。

表1 芯片GSE51575中相對癌旁組織升高或下降1倍以上的lncRNAs

2.2 SNHG7在胃癌組織和胃癌細胞系中的表達SNHG7在胃癌組織中表達是其癌旁正常組織的2.2倍,基于以上結(jié)果,本文采用RT-PCR法檢測82例胃癌患者癌組織和配對癌旁組織的SNHG7的表達差異。結(jié)果顯示,SNHG7在胃癌組織中呈高表達,相對癌旁組織表達量的中位數(shù)為3.5倍,差異具有統(tǒng)計學意義(P<0.01),見圖1。體外實驗中,胃癌細胞系SGC7901,BGC823,MGC803和MKN45的SNHG7表達均明顯高于胃上皮細胞系GES-1(P<0.01),見圖2。其中BGC823細胞SNHG7表達較GES-1細胞升高4.5倍,故本文選擇BGC823細胞進行進一步體外實驗。

圖1 SNHG7在胃癌和癌旁組織中表達

圖2 SNHG7在胃上皮細胞和胃癌細胞系中表達

2.3 SNHG7表達水平與胃癌臨床病理特征的關系根據(jù)SNHG7在胃癌組織中位表達量 (3.5倍),將82例胃癌組織分為SNHG7高表達組(41例)和低表達組(41例)。研究發(fā)現(xiàn),SNHG7的表達與腫瘤的浸潤深度、臨床分期和區(qū)域淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移有關,而與患者的性別、年齡、腫瘤部位、遠處轉(zhuǎn)移及腫瘤大小無明顯關系。浸潤深度T3~T4患者的SNHG7表達水平明顯高于T1~T2患者(P<0.01);存在區(qū)域淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移越多的患者SNHG7表達水平明顯高于無轉(zhuǎn)移患者 (P<0.05);TNMⅢ~Ⅳ期患者的SNHG7表達水平明顯高于TNMⅠ~Ⅱ期(P<0.01),詳見表2。

2.4 干擾SNHG7表達對胃癌細胞BGC823增殖和凋亡的影響 胃癌細胞BGC823在siRNA轉(zhuǎn)染后,SNHG7下調(diào)明顯 (P<0.01);與對照組相比,siRNA-SNHG7組細胞72、96小時增殖明顯受到抑制 (P<0.05);siRNA-SNHG7組細胞凋亡比例為(15.27±2.54)%,明顯高于對照組細胞的 (4.14± 0.87)%(P<0.01),詳見圖5。

3 討論

LncRNA為一類長度超過200bp的轉(zhuǎn)錄本,由于其自身缺乏明顯的開放閱讀框架,不參與蛋白質(zhì)的編碼功能,起初lncRNA被認為是RNA聚合酶Ⅱ轉(zhuǎn)錄的副產(chǎn)物,是基因組轉(zhuǎn)錄的“噪音”,不具有生物功能。但后續(xù)研究顯示,lncRNA可通過染色質(zhì)修飾、轉(zhuǎn)錄激活與干擾等參與包括腫瘤在內(nèi)的多種細胞內(nèi)信號調(diào)控過程[4-5]。lncRNA FENDRR在胃癌組織中表達降低,低表達的患者腫瘤浸潤更深,更容易發(fā)生局部淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移,并與FN1、MMP2/MMP9表達改變相關[6]。CCAT1在胃癌中表達上調(diào),該lncRNA可能通過結(jié)合到C-Myc啟動子區(qū)域,促進癌細胞的侵襲、轉(zhuǎn)移能力[7]。以上研究表明LncRNA可能在胃癌的發(fā)生、發(fā)展中起重要調(diào)節(jié)作用。

表2 胃癌組織中SNHG7表達與臨床病理參數(shù)的關系

圖3 RT-PCR檢測SNHG7在BGC823細胞中的表達量

圖4 CCK-8法檢測SNHG7抑制后BGC823細胞的增殖

圖5 流式細胞儀檢測BGC823細胞凋亡(5A:空白載體組;5B:siRNA組)

本研究對芯片GSE51575數(shù)據(jù)進行了基因重注釋分析,發(fā)現(xiàn)SNHG7在26例胃癌組織中高表達。本文用RT-PCR法檢測了SNHG7在82例胃癌和癌旁組織中表達情況,發(fā)現(xiàn)SNHG7在胃癌組織中存在高表達,是癌旁組織表達量的3.5倍。SNHG7表達越高,腫瘤的浸潤深度越深,并具有更高的臨床分期和更多的區(qū)域淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移,而胃癌浸潤至漿膜外、較多的區(qū)域淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移本身就是腫瘤惡性程度高的標志,提示胃癌組織中l(wèi)ncRNASNHG7較高表達患者術后隨訪和監(jiān)測應更嚴密,以防復發(fā)。She等[8]研究發(fā)現(xiàn),SNHG7在肺癌組織中存在高表達,抑制SNHG7表達后,可通過增加FAIM2蛋白表達,促進肺癌A549細胞凋亡。本研究體外實驗表明,在不同胃癌細胞系中SNHG7表達均較正常胃黏膜上皮細胞GES-1高,與胃癌組織中表達一致。通過siRNA抑制胃癌細胞SNHG7表達后,72、96小時的細胞增殖能力明顯下降,而流式細胞儀檢測也進一步證明,BGC823細胞SNHG7表達抑制后,凋亡率明顯增加,達(15.27±2.54)%,顯著高于對照組的 (4.14±0.87)%。通過對GSE51575芯片中數(shù)據(jù)進行基因富集分析,發(fā)現(xiàn)細胞周期及細胞增殖相關的基因富集在SNHG7高表達的患者上,說明SNHG7可能通過抑制凋亡基因或促進增殖相關基因而調(diào)控胃癌細胞生長,為下一步研究SNHG7通過何種途徑調(diào)控胃癌細胞增殖提供理論依據(jù)。

綜上所述,本研究表明SNHG7在胃癌組織中表達上調(diào),且與腫瘤的浸潤深度、淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移密切相關,下調(diào)SNHG7能夠增加胃癌細胞增殖和凋亡。綜上所述,SNHG7在胃癌的發(fā)生發(fā)展中發(fā)揮癌基因的作用,有可能用于胃癌患者預后監(jiān)測和發(fā)現(xiàn)新的治療靶點。

[1] Bollschweiler E,Berlth F,Baltin C,et al.Treatment of early gastric cancer in the Western World.World JGastroenterol,2014,20(19):5672

[2] Qi P,Du X.The long non-coding RNAs,a new cancer diagnostic and therapeutic goldmine.Mod Pathol,2013,26(2):155

[3]Hu Y,Wang J,Qian J,et al.Long noncoding RNA GAPLINC regulates CD44-dependent cell invasiveness and associates with poor prognosis of gastric cancer.Cancer Res,2014,74(23):6890

[4] Gupta RA,Shah N,Wang KC,et al.Long non-coding RNA HOTAIR reprograms chromatin state to promote cancer metastasis.Nature,2010,464(7291):1071

[5] Fei ZH,Yu XJ,Zhou M,et al.Upregulated expression of long non-coding RNA LINC00982 regulates cell proliferation and its clinical relevance in patients with gastric cancer.Tumour Biol,2016,37(2):1983

[6] Xu TP,Huang MD,Xia R,et al.Decreased expression of the long non-coding RNA FENDRR is associated with poor prognosis in gastric cancer and FENDRR regulates gastric cancer cellmetastasis by affecting fibronectin1 expression.J Hematol Oncol,2014,7:63

[7] Guo X,Hua Y.CCAT1:an oncogenic long noncoding RNA in human cancers.JCancer Res Clin Oncol,2017:143(4):555

[8]She K,Huang J,Zhou H,et al.lncRNA-SNHG7 promotes the proliferation,migration and invasion and inhibits apoptosis of lung cancer cells by enhancing the FAIM2 expression.Oncol Rep,2016,36(5):2673

溫州市科技局計劃項目(Y20160121)

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