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白背飛虱幾丁質(zhì)合成酶1基因的結(jié)構(gòu)及特性研究

2018-01-31 03:45陳靜張道偉錢正敏
生物技術(shù)通報(bào) 2018年1期
關(guān)鍵詞:白背飛虱幾丁質(zhì)飛虱

陳靜 張道偉 錢正敏

(1. 遵義醫(yī)學(xué)院基礎(chǔ)醫(yī)學(xué)院,遵義 563000;2. 遵義師范學(xué)院生命科學(xué)學(xué)院,遵義 563002)

幾丁質(zhì)是一種在真菌、甲殼動(dòng)物及節(jié)肢動(dòng)物中廣泛存在的多糖類生物高分子,是昆蟲氣管、表皮、圍食膜等組織的重要組成部分,在對昆蟲內(nèi)部組織器官的保護(hù)和抵抗外源生物的侵染中發(fā)揮著非常重要的作用[1-3]。幾丁質(zhì)的合成和降解是昆蟲生長發(fā)育的重要過程,所以也成為害蟲控制的理想靶標(biāo)。幾丁質(zhì)對昆蟲具有保護(hù)作用,但同時(shí)也限制了昆蟲的生長,所以當(dāng)昆蟲成長到一定階段時(shí),就需要蛻去舊表皮,合成更大的新表皮,以適應(yīng)昆蟲的生長。而新表皮的合成就是由幾丁質(zhì)合成酶(Chitin synthase,CHS)等酶系催化合成新的幾丁質(zhì)到新的表皮中。

CHS是幾丁質(zhì)合成的關(guān)鍵酶之一。理論分子量為160-180 kD,是糖基轉(zhuǎn)移酶家族成員[4-5]。通過對不同種昆蟲的CHS蛋白序列進(jìn)行比對,結(jié)果發(fā)現(xiàn)CHS有3個(gè)相對保守的結(jié)構(gòu)域:結(jié)構(gòu)域A、B、C。結(jié)構(gòu)域A位于CHS的N端,是一段跨膜螺旋結(jié)構(gòu);結(jié)構(gòu)域B位于CHS的活性中心,含有2個(gè)保守的氨基酸組成EDR和QRRRW;結(jié)構(gòu)域C位于CHS的C端,包含一段相對保守的氨基酸序列和7個(gè)跨膜螺旋,這個(gè)區(qū)域被認(rèn)為參與對幾丁質(zhì)合成的調(diào)控。在大多數(shù)昆蟲中存在兩個(gè)CHS:CHS1和CHS2,這兩個(gè)CHS被認(rèn)為參與不同組織器官的幾丁質(zhì)合成。其中,CHS1主要參與表皮和氣管中幾丁質(zhì)的合成,CHS2主要參與圍食膜中幾丁質(zhì)的合成。另外,有研究發(fā)現(xiàn)在岡比亞按蚊Anopheles gambiae的復(fù)眼中可以檢測到CHS1和CHS2基因的表達(dá)。赤擬谷盜中可以檢測到CHS1基因主要在卵和蛹期中表達(dá)[6-7]。對不同種昆蟲中CHS基因的結(jié)構(gòu)研究發(fā)現(xiàn),大多數(shù)昆蟲的CHS1基因存在一個(gè)可變剪接的外顯子,而CHS2基因中沒有發(fā)現(xiàn)可變剪接的現(xiàn)象。CHS基因的序列在多種昆蟲中已被陸續(xù)獲得,如銅綠蠅(Lucilia cuprina)、埃及伊蚊(Aedes aegypti)、果蠅(Drosophila melanogaster)、赤擬谷盜(Tribolium castaneum)、甜菜夜蛾(Spodoptera exigua)、岡比亞按蚊(A.gambiae)等,但是還有待于更深層次的研究[8]。RNA干擾(RNAi,RNA interference)技術(shù)已被廣泛應(yīng)用于基因功能研究中。利用RNAi技術(shù)研究CHS1基因?qū)|亞飛蝗(Locusta migratoria manilensis)生長發(fā)育的影響,結(jié)果發(fā)現(xiàn)沉默CHS1的可變外顯子a會導(dǎo)致東亞飛蝗發(fā)育遲緩,蛻皮障礙,而沉默CHS1的可變外顯子b會引起腿部畸形[9]。

白背飛虱隸屬同翅目飛虱科,是危害我國水稻正常生長的主要害蟲之一[10]。白背飛虱除了自身刺吸水稻汁液外,還會傳播水稻病毒,給水稻的生產(chǎn)帶來毀滅性的災(zāi)難[11-12]。本研究基于白背飛虱的轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)獲得了白背飛虱CHS1基因的全長序列,對該基因序列的兩個(gè)可變外顯子進(jìn)行了分析并探究了白背飛虱中CHS1基因在各齡期發(fā)育階段及各組織器官中的表達(dá)水平。通過顯微注射的方法對白背飛虱的CHS1基因進(jìn)行了RNAi實(shí)驗(yàn)。通過上述研究,旨為闡明CHS1基因在白背飛虱中的生理作用,為利用CHS1基因治理白背飛虱奠定基礎(chǔ)。

1 材料與方法

1.1 材料

1.1.1 實(shí)驗(yàn)材料 白背飛虱由本實(shí)驗(yàn)室飼養(yǎng)于人工氣候室無任何處理的水稻上。飼養(yǎng)條件:(27±1)℃,相對濕度70%,光周期16L∶8D。

1.1.2 試劑 PCR相關(guān)試劑,反轉(zhuǎn)錄RT-PCR相關(guān)試劑,熒光定量PCR相關(guān)試劑,克隆載體pMD-18T,DNA分子量標(biāo)準(zhǔn)Marker均購自TAKARA公司;動(dòng)物RNA提取試劑盒,膠回收試劑盒、質(zhì)?;厥赵噭┖匈徸员本┨旄荆淮竽c桿菌感受態(tài)細(xì)胞DH5α購自北京全式金公司;dsRNA合成試劑盒T7 RiboMax Express RNAi System購自Promega公司;引物合成及序列測定由上海生工公司完成,其它常規(guī)試劑均為國產(chǎn)分析純。

1.2 方法

1.2.1 白背飛虱CHS1基因的獲得 通過對本課題組前期獲得的白背飛虱轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)的分析,得到白背飛虱CHS1基因。根據(jù)這段序列設(shè)計(jì)全長擴(kuò)增的驗(yàn)證引物SfCHS1-F和SfCHS1-R(引物序列見表1)。PCR擴(kuò)增程序:94℃預(yù)變性5 min,94℃變性30 s,56℃退火30 s,72℃延伸5 min,35個(gè)循環(huán),72℃延伸10 min。擴(kuò)增產(chǎn)物經(jīng)凝膠回收后與pMD-18T載體連接,轉(zhuǎn)化感受態(tài)細(xì)胞DH5α,菌落PCR鑒定正確后進(jìn)行測序。

1.2.2 白背飛虱CHS1基因可變剪接的驗(yàn)證 根據(jù)已有研究報(bào)道,昆蟲CHS1基因存在可變剪接現(xiàn)象,所以我們對比了不同昆蟲CHS1基因可變剪接出現(xiàn)的位置,在可變剪接位點(diǎn)附近設(shè)計(jì)了引物SfCHS1-YZF和SfCHS1-YZR(表1)進(jìn)行驗(yàn)證。PCR擴(kuò)增程序:94℃預(yù)變性5 min;94℃變性30 s,56℃退火30 s,72℃延伸 1 min,35個(gè)循環(huán);72℃延伸 10 min。擴(kuò)增產(chǎn)物經(jīng)凝膠回收后與pMD-18T載體連接,轉(zhuǎn)化感受態(tài)細(xì)胞DH5α,菌落PCR鑒定正確后進(jìn)行測序。

表1 本實(shí)驗(yàn)所用的引物

1.2.3 白背飛虱CHS1基因的時(shí)空表達(dá)特異性檢測 取4齡1-3 d,5齡1-3 d的白背飛虱若蟲,羽化1 d和2 d的白背飛虱成蟲,分別用RNA提取試劑盒進(jìn)行RNA的提取及反轉(zhuǎn)錄。采用實(shí)時(shí)熒光定量PCR技術(shù)檢測SfCHS1基因在白背飛虱4齡到成蟲各蟲期的表達(dá)情況。

取5齡1 d的白背飛虱若蟲,CO2麻醉后于冰上解剖出表皮、氣管和腸。分別用RNA提取試劑盒進(jìn)行RNA的提取及反轉(zhuǎn)錄。采用實(shí)時(shí)熒光定量PCR技術(shù)檢測SfCHS1基因在白背飛虱表皮,氣管,腸中表達(dá)情況。用于檢測SfCHS1基因時(shí)空表達(dá)特異性的引物為:SfCHS1-YGF和SfCHS1-YGR(表1)。以白背飛虱β-actin基因?yàn)閮?nèi)參進(jìn)行熒光定量PCR,檢測引物為β-actin-YGF和β-actin-YGR。熒光定量PCR反應(yīng)體系:SYBR(2×)5 μL,cDNA 模板 1 μL,上、下游引物各 0.2 μL,ddH2O 3.6 μL。反應(yīng)條件為 :95℃預(yù)變性10 s,95℃變性5 s,60℃延伸30 s,35

個(gè)循環(huán)。每個(gè)樣品重復(fù)3次測定。

1.2.4 顯微注射RNAi實(shí)驗(yàn) 設(shè)計(jì)用于合成SfCHS1基因dsRNA的引物SfCHS1-dsRNA-F和SfCHS1-dsRNA-R及陰性對照綠色熒光蛋白GFP基因的引物 GFP-dsRNA-F 和 GFP-dsRNA-R( 表 1), 按 照dsRNA合成試劑盒的說明進(jìn)行SfCHS1基因及GFP基因dsRNA的合成,用微量注射儀(Eppendorf公司)將dsRNA導(dǎo)入白背飛虱5齡1 d的若蟲體內(nèi)(10 ng/頭,注射方法參照文獻(xiàn)[12]),以無關(guān)dsRNA-GFP作為對照,采用實(shí)時(shí)熒光定量PCR方法檢測SfCHS1基因的相對表達(dá)量。

1.2.5 序列及數(shù)據(jù)分析 引物設(shè)計(jì)采用Primer 5軟件,測序結(jié)果用DNAMAN軟件進(jìn)行拼接,SfCHS1基因開放閱讀框分析采用DNAstar軟件。氨基酸序列同源比對采用BLASTx程序,蛋白系統(tǒng)進(jìn)化樹構(gòu)建采用MEGA 7.0 軟件,以Neighbor-joining算法進(jìn)行分析,蛋白分子量及等電點(diǎn)預(yù)測采用在線軟件(http://www.expasy.org),糖基化位點(diǎn)預(yù)測采用在線軟件(http://www.cbs.dtu.dk/services/NetNGlyc/), 數(shù) 據(jù)的統(tǒng)計(jì)分析采用SPSS 19.0軟件。

2 結(jié)果

2.1 白背飛虱CHS1基因的序列驗(yàn)證及分析

通過對轉(zhuǎn)錄組測序數(shù)據(jù)的分析及全長擴(kuò)增驗(yàn)證,獲得了白背飛虱SfCHS1基因全長序列(GenBank登陸號:KY987034.1)。SfCHS1基因開放閱讀框ORF長4 719 bp,編碼1 572個(gè)氨基酸。預(yù)測蛋白的分子量為180.6 kD,等電點(diǎn)為6.72。預(yù)測有6個(gè)N-糖基 化 位 點(diǎn)(18-21:NFSD;425-428:NLTI;917-920:NISL;956-959:NWTS;1 289-1 292:NSSV;1 327-1 330:NISY),有16個(gè)跨膜螺旋結(jié)構(gòu)。根據(jù)已有研究報(bào)道,昆蟲CHS1基因存在可變剪接現(xiàn)象,所以對比了不同昆蟲CHS1基因可變剪接出現(xiàn)的位置,在可變剪接位點(diǎn)附近設(shè)計(jì)了引物,然后通過PCR擴(kuò)增和測序,獲得了白背飛虱幾丁質(zhì)合成酶1的兩個(gè)可變外顯子SfCHS1a和SfCHS1b,兩個(gè)外顯子區(qū)共有54個(gè)核苷酸和13個(gè)氨基酸的差異(圖1)??勺兺怙@子包含一個(gè)跨膜區(qū)段。

圖1 白背飛虱SfCHS1基因兩個(gè)可變外顯子的核苷酸和蛋白序列比對結(jié)果

2.2 白背飛虱CHS1基因的進(jìn)化樹分析

利用Mega 7軟件將白背飛虱CHS1基因的蛋白序列與其它昆蟲的CHS1基因的蛋白序列進(jìn)行進(jìn)化樹分析,結(jié)果(圖2)發(fā)現(xiàn)白背飛虱的CHS1基因與同為同翅目飛虱科的灰飛虱(L striatellus)及褐飛虱(N. lugens)的親緣關(guān)系最近,達(dá)到97%。這個(gè)結(jié)果與Vector NTI軟件分析出的白背飛虱CHS1蛋白序列與其他昆蟲的CHS1蛋白序列比對的結(jié)果一致。

2.3 白背飛虱CHS1基因的時(shí)間表達(dá)特性

選取4齡1-3 d,5齡1-3 d,成蟲1-2 d共8個(gè)時(shí)間點(diǎn)對SfCHS1基因的表達(dá)進(jìn)行了分析,結(jié)果(圖3)發(fā)現(xiàn)SfCHS1基因在4齡和5齡期的第1天,也即蛻皮完成后,合成新的表皮時(shí)表達(dá)量最高,在表皮合成后的幾天快速下降,在成蟲期的第1天也會上升,而后逐漸下降。在4齡和5齡期的最后1 d,SfCHS1基因的表達(dá)量最低。

2.4 白背飛虱CHS1基因的組織表達(dá)特異性

選取5齡1 d的白背飛虱若蟲解剖后進(jìn)行組織特異性表達(dá)檢測。定量PCR檢測結(jié)果(圖4)表明,白背飛虱的CHS1基因主要在表皮中大量表達(dá),相對表達(dá)量為25,其次為氣管,相對表達(dá)量為7.8,在腸中也有少量表達(dá),相對表達(dá)量為2.5。

圖2 CHS1蛋白的進(jìn)化樹分析

圖3 定量PCR檢測SfCHS1 mRNA發(fā)育表達(dá)模式

2.5 顯微注射RNAi后CHS1基因的表達(dá)分析

選取5齡1 d的白背飛虱若蟲,用顯微注射儀將SfCHS1基因的dsRNA(10 ng/頭)導(dǎo)入白背飛虱體內(nèi),在注射后的24 h和 48 h分別檢測SfCHS1基因的表達(dá)量。結(jié)果如圖5所示,在注射SfCHS1基因dsRNA后的24 h,即可檢測到SfCHS1基因的表達(dá)量出現(xiàn)顯著下降,為對照組表達(dá)量的40%,注射48 h后,SfCHS1基因的表達(dá)量僅為對照的9%,均存在極顯著差異(P<0.01,t-test)。

圖4 SfCHS1基因在不同組織中的相對表達(dá)量

2.6 顯微注射RNAi后白背飛虱的存活率

選取5齡1 d的白背飛虱若蟲,用顯微注射儀將SfCHS1基因及GFP基因的dsRNA(10 ng/頭)導(dǎo)入白背飛虱體內(nèi)(每組20頭蟲,3組重復(fù)),在注射后的24 h、48 h、72 h、96 h分別統(tǒng)計(jì)白背飛虱的存活率。結(jié)果如圖6所示,CHS1基因干擾后對白背飛虱的存活率有極大的影響,注射48 h后,存活率與對照相比,有極顯著性差異(P<0.01,t-test),為對照的0.6倍,注射72 h后,存活率為對照的0.3倍,注射96 h后,存活率為對照的0.13倍。

圖5 RNAi后SfCHS1基因的相對表達(dá)量

圖6 RNAi后白背飛虱的存活率

3 討論

昆蟲在生長發(fā)育的過程中要經(jīng)歷舊表皮的蛻去和新表皮的生長,而幾丁質(zhì)作為昆蟲表皮的主要成分,其合成和分解也是被嚴(yán)格調(diào)控的。在幾丁質(zhì)合成的過程中,CHS扮演著非常重要的作用,是幾丁質(zhì)合成的關(guān)鍵酶。通過本課題組前期的白背飛虱轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)分析,獲得了白背飛虱CHS1基因的全長序列。目前,研究發(fā)現(xiàn)在很多昆蟲中CHS1基因存在可變剪接的現(xiàn)象,如岡比亞按蚊、赤擬谷盜、桔小實(shí)蠅、褐飛虱等[13-17]。為了探究白背飛虱中是否也存在這樣的可變剪接,對比了白背飛虱和褐飛虱的CHS1基因序列,在可能出現(xiàn)可變剪接的位置設(shè)計(jì)了引物進(jìn)行序列的擴(kuò)增和測序,結(jié)果發(fā)現(xiàn)在白背飛虱中也是存在兩個(gè)可變外顯子。利用進(jìn)化樹分析軟件Mega 7分析白背飛虱與其它昆蟲CHS1蛋白的進(jìn)化關(guān)系,結(jié)果顯示白背飛虱CHS1蛋白與同為同翅目的昆蟲親緣關(guān)系較近,聚為一小支,其中,又與飛虱科的褐飛虱及灰飛虱的關(guān)系最近。進(jìn)化樹分析的結(jié)果在一定程度上反映了CHS1蛋白的進(jìn)化歷程,為后續(xù)CHS1基因功能的研究奠定基礎(chǔ)。然后采用熒光定量PCR的方法對白背飛虱CHS1基因在8個(gè)不同的時(shí)間點(diǎn)的mRNA表達(dá)量進(jìn)行了檢測。結(jié)果發(fā)現(xiàn)CHS1基因存在明顯的時(shí)間表達(dá)特異性,在白背飛虱若蟲4齡和5齡期的第1天表達(dá)量最高,隨即快速下降,在成蟲期的第1天也會上升,而后逐漸下降。這一結(jié)果表明在每個(gè)齡期初始,即需要大量幾丁質(zhì)參與表皮形成時(shí),參與幾丁質(zhì)合成的CHS1基因的mRNA表達(dá)量會快速升高,而在每個(gè)齡期的最后1 d,即蛻皮開始時(shí),表達(dá)量是最低的。同樣,采用熒光定量PCR的方法,我們檢測了CHS1基因在白背飛虱3個(gè)組織器官中mRNA的表達(dá)水平。結(jié)果發(fā)現(xiàn)CHS1基因在檢測的3個(gè)組織即表皮、氣管和中腸中都有表達(dá),但是表達(dá)量存在極顯著差異。其中,在表皮中的表達(dá)量最高。應(yīng)該是在表皮合成的過程中,需要大量幾丁質(zhì)的原因。另外,幾丁質(zhì)也是氣管的重要組成部分,所以在氣管中也檢測到了CHS1基因的表達(dá),只是表達(dá)量顯著低于表皮中。在中腸中也檢測到了CHS1基因的少量表達(dá),推測可能是在中腸中有含有幾丁質(zhì)的組織,也有可能是解剖中腸的時(shí)候,上面粘黏了氣管組織。

目前,褐飛虱已成為我國水稻上的首要害蟲,而殺蟲劑大規(guī)模使用帶來的害蟲抗藥性和對環(huán)境的污染使無害防治理念逐漸形成。目前,利用RNAi技術(shù)防治褐飛虱的研究報(bào)道已有很多,像通過飼喂法RNAi技術(shù)研究海藻糖合成酶的功能[18],構(gòu)建RNAi載體轉(zhuǎn)化水稻研究特定基因的功能等[19]。而RNAi轉(zhuǎn)基因水稻將有可能成為防治褐飛虱的潛在方法。在本實(shí)驗(yàn)中,通過注射法RNAi干擾檢測SfCHS1基因在mRNA表達(dá)水平上的沉默效果。結(jié)果顯示,注射較低劑量(10 ng/頭)的雙鏈RNA即可產(chǎn)生較好的干擾效果,顯著降低SfCHS1基因的表達(dá)及產(chǎn)生明顯的死亡表型。通過本研究對SfCHS1基因的干擾研究,為探究其功能和作用機(jī)理奠定了基礎(chǔ)。

4 結(jié)論

本研究通過前期對白背飛虱進(jìn)行了轉(zhuǎn)錄組的測序和數(shù)據(jù)分析,獲得了白背飛虱幾丁質(zhì)合成酶1基因 SfCHS1的cDNA全長序列。SfCHS1基因開放閱讀框?yàn)? 719 bp,編碼1 572個(gè)氨基酸。PCR擴(kuò)增及測序結(jié)果表明SfCHS1基因存在兩個(gè)可變剪切,產(chǎn)生兩個(gè)轉(zhuǎn)錄本(CHS1a和CHS1b)。時(shí)間表達(dá)特異性分析結(jié)果表明,SfCHS1在每個(gè)齡期的第1天即幾丁質(zhì)合成時(shí)的表達(dá)量最高。組織特異性檢測結(jié)果表明,SfCHS1主要在白背飛虱的表皮中表達(dá),其次為氣管,在中腸中也有少量表達(dá)。顯微注射RNAi的結(jié)果表明該方法能顯著降低SfCHS1基因的轉(zhuǎn)錄水平,達(dá)到良好的RNAi效果并產(chǎn)生顯著的死亡表型。

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