倪曉田, 黃小杰, 王 凱, 周 健
(1. 同濟(jì)大學(xué)附屬第一婦嬰保健院產(chǎn)科,上海 201204; 2. 同濟(jì)大學(xué)附屬第一婦嬰保健院轉(zhuǎn)化中心實驗室,上海 201204)
妊娠期糖尿病(gestational diabetes mellitus, GDM)是全球范圍內(nèi)高發(fā)的妊娠期特有的代謝性疾病,國外報道其發(fā)病率在5.8%~9.5%,而且近年有持續(xù)升高的趨勢[1-3]。GDM對母兒健康均有影響,近期影響包括增加巨大兒、肩難產(chǎn)的發(fā)生率、剖宮產(chǎn)率[4]以及胎兒肺部成熟延遲[5],遠(yuǎn)期影響有增加母親未來發(fā)生Ⅱ型糖尿病[6-8]和心血管疾病[7-8]的機(jī)會,增加后代發(fā)生心血管疾病[9]、呼吸窘迫綜合征[5]和神經(jīng)心理疾病[10]的風(fēng)險。
胎盤是孕期連接母體和胎兒的主要器官,是研究妊娠相關(guān)疾病的一個重要窗口。GDM對胎盤的發(fā)育和功能都有不良影響。研究表明GDM可以使胎盤重量增加[11],胰島素信號通路缺陷[12],使胎盤血管內(nèi)皮生長因子A和血管內(nèi)皮生長因子受體2表達(dá)下降,使終末絨毛血管生成發(fā)生退行性變化[13]。已有研究報道GDM改變部分胎盤基因表達(dá)[14-16],但所報道的差異表達(dá)基因(DEGs)不同。本研究選擇單純飲食和運動治療的GDM病例,檢測單純飲食和運動治療的GDM胎盤基因表達(dá)及功能變化,有助于進(jìn)一步理解妊娠期糖尿病胎盤的基因表達(dá)及功能變化。
選擇2016年3月至2016年4月在同濟(jì)大學(xué)附屬第一婦嬰保健院建卡產(chǎn)檢并在38~40周接受選擇性剖宮產(chǎn)分娩的孕婦共6例,其中正常組孕婦3例,GDM組3例。GDM診斷采用IADPSGC診斷標(biāo)準(zhǔn),即75g口服葡萄糖實驗空腹血糖≥5.1mmol/L或1h血糖≥10.0mmol/L或2h血糖≥8.5mmol/L診斷為GDM,選擇經(jīng)飲食和運動治療血糖控制理想者。研究對象既往健康,排除妊娠合并其他疾病如哮喘、高血壓、子癇前期及妊娠前患糖尿病等。本研究符合赫爾辛基宣言所規(guī)定的以人類為研究對象的研究標(biāo)準(zhǔn),通過了同濟(jì)大學(xué)附屬第一婦嬰保健院倫理委員會的審批。受試者獲得知情同意并簽署了知情同意書。6例受試者的臨床參數(shù)詳見表1。
表1 用于芯片分析的標(biāo)本臨床參數(shù)
與對照組相比,*P<0.05
TRIzol試劑購自美國Life Technologies公司;RNeasy mini試劑盒及RNase-Free DNase Set購自德國QIAGEN公司;單色低輸入快速放大標(biāo)記試劑盒、基因表達(dá)雜交試劑盒、雜交爐、基因表達(dá)洗滌液試劑盒、芯片掃描儀及Feature Extraction 10.7軟件購自美國安捷倫科技有限公司;芯片著色盤購自美國Thermo Shandon公司;Moloney鼠白血病病毒反轉(zhuǎn)錄酶購自美國Promega公司;SYBR?Green反應(yīng)混合物購自日本ToYoBo公司。
1.3.1 RNA提取 采用TRIzol方法提取胎盤組織總RNA,分別采用分光光度法(Nanodrop)和凝膠電泳法檢測RNA純度和完整性。分離的RNA貯存于-80℃?zhèn)溆?。總RNA用RNeasy mini試劑盒和RNase-Free DNase Set進(jìn)行純化后用作芯片分析。
1.3.2 芯片雜交和數(shù)據(jù)分析 總RNA標(biāo)本提取方法如上,用單色低輸入快速放大標(biāo)記試劑盒擴(kuò)增mRNA并進(jìn)行標(biāo)記。用RNeasy mini試劑盒將cRNA進(jìn)行純化。cRNA上樣量為1.65μg,使用基因表達(dá)雜交試劑盒,將芯片置于65℃雜交爐10r/min,持續(xù)17h。然后將芯片放入著色盤中,用基因表達(dá)洗滌液試劑盒進(jìn)行洗滌。雜交的芯片用Agilent芯片掃描儀進(jìn)行掃描,用Feature Extraction 10.7軟件進(jìn)行定量分析,并采用Quantile方法將數(shù)據(jù)進(jìn)行處理。
1.3.3 反轉(zhuǎn)錄定量PCR(RT-qPCR) 采用TRIzol方法提取胎盤組織總RNA。測定RNA濃度后,用Moloney鼠白血病病毒反轉(zhuǎn)錄酶及長度為12~18 nt的寡核苷酸(Oligo dT)將mRNA反轉(zhuǎn)為cDNA,用RT-qPCR方法及SYBR?Green反應(yīng)混合物對SLC16A1、ATP2C2、KCNJ2、ABCA6、IGFL2、BDKRB2、FGF12、SGK2基因進(jìn)行定量分析。熔解溫度設(shè)為61℃。每個標(biāo)本中mRNA絕對數(shù)量都根據(jù)循環(huán)數(shù)對應(yīng)的標(biāo)準(zhǔn)曲線計算。為了控制取樣誤差,每個樣本都檢測保守基因β-actin,用目的基因比β-actin得到的值代表目的基因的表達(dá)量。用熔解曲線及PCR產(chǎn)物凝膠電泳檢測引物的特異性。擴(kuò)增以上基因所用的引物序列詳見表2。
表2 用于RT-qPCR的引物序列
1.3.4 DEGs的GO、KEGG分析 DEGs分析所使用的數(shù)據(jù)來自于FunNet 1.00-12軟件。FunNet是一種基于芯片表達(dá)數(shù)據(jù)庫用于分析基因相互關(guān)系的可靠的系統(tǒng)工具[17-18]。本實驗使用的FunNet 1.00-12軟件更新時間是2011年5月20日。
該研究使用的基因芯片包括41000種基因,其中1773種(4.3%)基因兩組間的表達(dá)差異有統(tǒng)計學(xué)意義。627種基因上調(diào)表達(dá),1146種基因下調(diào)表達(dá),熱圖詳見圖1。去除非特指的基因,本研究列出20個上調(diào)表達(dá)且倍數(shù)(fold change, FC)≥2的基因(表3)和26個下調(diào)表達(dá)且FC≤0.5的基因(表4)。
圖1 正常和GDM胎盤基因芯片熱圖Fig.1 Heatmap of normal and GDM placental gene chipsA1、A2、A3為GDM胎盤組織,B1、B2、B3為正常胎盤組織,將6例胎盤組織分別用6張芯片(Agilent GeneChips, 4×44K transcripts)進(jìn)行檢測。熱圖顯示與正常胎盤相比,GDM胎盤中627個基因表達(dá)顯著上升(P<0.05,紅色),1146個基因表達(dá)顯著下降(P<0.05,綠色)
采用RT-qPCR方法對基因芯片結(jié)果進(jìn)行驗證,驗證的8個基因包括: 溶質(zhì)載體家族16成員1(SLC16A1)、ATP酶分泌途徑Ca2+轉(zhuǎn)運2(ATP2C2)、鉀離子通道亞家族成員2(KCNJ2)、ATP結(jié)合盒亞家族成員6(ABCA6)、胰島素樣生長因子家族成員2(IGFL2),緩激肽B2受體(BDKRB2)、成纖維細(xì)胞生長因子12(FGF12)、絲氨酸/蘇氨酸激酶2(SGK2)。以上8個基因用芯片和RT-qPCR這2種方法檢測,GDM組和正常組的比值見圖2。
表3 GDM胎盤組織水平表達(dá)上調(diào)的基因
表4 GDM胎盤組織水平表達(dá)下調(diào)的基因
圖2 RT-qPCR方法驗證芯片部分結(jié)果Fig.2 RT-qPCR verification for gene chips黑色柱代表芯片篩查結(jié)果,白色柱代表RT-qPCR結(jié)果;橫坐標(biāo)代表GDM胎盤基因表達(dá)與正常胎盤的比值
將DEGs經(jīng)GO聚類從生物學(xué)過程、細(xì)胞成分和分子功能三方面進(jìn)行功能分析,結(jié)果顯示: 在生物學(xué)過程方面,差異基因中38.8%與基于DNA的轉(zhuǎn)錄調(diào)節(jié)有關(guān),10.5%與蛋白磷酸化有關(guān),9.5%與基因表達(dá)有關(guān);在細(xì)胞成分方面,大部分差異基因位于細(xì)胞核(51.1%)和細(xì)胞質(zhì)(44%)。分子功能分析大部分基因涉及蛋白結(jié)合(51.8%)、金屬離子結(jié)合(33.3%)、鋅離子結(jié)合(24.4%)和DNA結(jié)合(23.7%)。DEGs在生物學(xué)過程、分子功能和細(xì)胞成分三方面的功能分布見圖3。差異基因相關(guān)的信號通路,位于前3位的分別是Wnt、Spliceosome和TGF-β信號通路,見圖4。
圖3 GO對DEGs的功能分析結(jié)果Fig.3 Functional analysis of DEGs by GOA: DEGs相關(guān)的生化過程分析;B: DEGs相關(guān)的細(xì)胞成分分析;C: DEGs相關(guān)的分子功能分析
圖4 KEGG對DEGs相關(guān)信號傳導(dǎo)通路的分析結(jié)果Fig.4 Analysis of DEGs related signal transduction pathway by KEGG
GDM雖然是一種妊娠期特有的疾病,但對母親和胎兒均有不良影響。隨著GDM發(fā)病率的上升,研究GDM發(fā)病機(jī)制的必要性越來越迫切。臨床根據(jù)是否需要藥物治療將GDM分為A1型(即飲食控制的GDM)和A2型(即需要藥物治療的GDM)。胎盤作為孕期連接母體和胎兒的重要器官,與GDM的發(fā)生機(jī)制相關(guān),同時其結(jié)構(gòu)及功能也受該疾病的影響。既往只有少數(shù)研究采用基因芯片方法研究GDM胎盤基因表達(dá)變化。Radaelli等[14]發(fā)現(xiàn)GDM組16.2%的基因表達(dá)發(fā)生顯著性變化,并且發(fā)現(xiàn)炎癥標(biāo)記物和炎癥介質(zhì)的表達(dá)顯著增加。Enquobahrie等[15]卻發(fā)現(xiàn)只有10.9%的基因表達(dá)發(fā)生變化,且只有部分基因的表達(dá)變化與Radaelli等結(jié)果一致。本實驗選擇A1型GDM病例,3例GDM通過飲食控制,空腹血糖均控制在5.3mmol/L以下,餐后2h血糖維持在6.7mmol/L。孕期產(chǎn)檢尿常規(guī)提示+~++,尿酮體均為陰性。新生兒出生后常規(guī)給予口服少量葡萄糖水預(yù)防低血糖,新生兒均無低血糖表現(xiàn)。雖然孕婦通過飲食控制血糖在正常范圍,但通過檢測胎盤41000個基因的表達(dá)發(fā)現(xiàn),1773個(4.3%)基因存在差異表達(dá),進(jìn)一步用RT-qPCR方法驗證8個基因的表達(dá)情況,其中5個基因的表達(dá)與芯片結(jié)果相符合(SGK2、BDKRB2、IGFL2、ABCA6、SLC16A1),符合率達(dá)60%。考慮基因芯片篩查和RT-qPCR兩種不同的檢查方法具有較高的符合率,因此認(rèn)為基因芯片的篩查結(jié)果具有很好的參考價值。進(jìn)一步分析實驗結(jié)果缺乏重疊性的原因發(fā)現(xiàn),Radaelli等[14]選取的GDM病例均為A2型,Enquobahrie等[15]選擇的病例包括A1型和A2型,而本實驗選取的病例則均為A1型,從而推測A1型和A2型GDM對胎盤基因表達(dá)影響程度不同。
本研究利用基因GO平臺對差異表達(dá)基因進(jìn)行了生物過程、分子功能和細(xì)胞成分三方面分析。差異基因涉及的生物過程包括: 以DNA為基礎(chǔ)的轉(zhuǎn)錄調(diào)節(jié)過程、蛋白磷酸化、基因表達(dá)、細(xì)胞周期等。最引人矚目的是以DNA為基礎(chǔ)的轉(zhuǎn)錄調(diào)節(jié)過程中涉及到多達(dá)75種鋅指蛋白,而且多表達(dá)于細(xì)胞核,在蛋白金屬離子結(jié)合、鋅離子結(jié)合和DNA結(jié)合等分子功能方面起著重要作用。鋅指蛋白可以結(jié)合DNA、RNA、脂質(zhì)、蛋白質(zhì)和小分子,在多種生理過程中發(fā)揮重要作用[19]。近期有研究開始關(guān)注鋅指蛋白在生殖系統(tǒng)方面發(fā)揮的作用[20-21],但未發(fā)現(xiàn)有對GDM胎盤鋅指蛋白表達(dá)變化的報道。GDM對鋅指蛋白的影響及對胎盤功能的負(fù)面影響值得進(jìn)一步研究。MICA和MICB在GDM胎盤中的表達(dá)顯著增加,二者參與胎盤多種生物過程,包括熱反應(yīng)、細(xì)胞溶解、抗原加工提呈、gamma-delta T細(xì)胞活化等,其表達(dá)與胎兒-母體免疫識別相關(guān)[22],二者表達(dá)增加可能對母體對胎盤的免疫耐受不利。芯片結(jié)果提示多種與胎盤能量代謝及離子代謝相關(guān)的基因下調(diào)表達(dá),如KCNJ2、ATP2C2、SLC16A1等,其中KCNJ2和SLC16A1在胎盤大量表達(dá),KCNJ2主要參與調(diào)節(jié)鉀離子代謝,SLC16A1主要與單碳化合物如乳酸、丙酮酸代謝相關(guān),其表達(dá)量的變化可能直接影響胎兒宮內(nèi)營養(yǎng)素的改變。
另外,本研究用基因KEGG數(shù)據(jù)庫分析了變化基因相關(guān)的信號通路。在存在差異的信號通路中Wnt信號通路居于首位。目前所知,本實驗是首次報道Wnt信號通路在妊娠期糖尿病中的變化。Wnt是一種分泌性糖蛋白受體,在調(diào)節(jié)很多生物過程中起重要作用,這些生物過程包括胚胎發(fā)育,細(xì)胞結(jié)局、增殖、遷移,干細(xì)胞維持,腫瘤細(xì)胞抑制,腫瘤生成和組織平衡[23]。研究報道Wnt配體復(fù)合物可能在人類胎盤發(fā)育過程中發(fā)揮重要作用[24]。Wnt信號通路還在胎盤滋養(yǎng)層細(xì)胞的功能異常[25]、滋養(yǎng)層細(xì)胞種植、蛻膜化和胎盤分化[26]中起關(guān)鍵作用。妊娠期糖尿病中Wnt信號通路的作用和機(jī)制需要進(jìn)一步研究。KEGG分析還提示DEGs參與剪接體、TGF-β信號通路、ErbB信號通路等,但以上結(jié)果限于基因芯片篩查結(jié)果,需進(jìn)一步實驗驗證。
綜上所述,GDM胎盤部分基因表達(dá)及功能發(fā)生變化,這些變化可能導(dǎo)致胎盤功能發(fā)生變化,從而影響胎兒與胎盤之間的對話。GDM胎盤部分基因表達(dá)變化涉及多種生物學(xué)過程、分子功能及信號通路,但具體胎盤基因表達(dá)對功能及信號通路的影響需進(jìn)一步實驗研究。研究GDM胎盤基因表達(dá)及功能變化有助于充分理解GDM疾病并指導(dǎo)臨床診療。
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