余 蕾,閻光宇,孫繼鵬,易瑞灶,蘇永全
金屬硫蛋白(metallothionein,MT),化學名金屬硫組氨酸三甲基內(nèi)鹽,是一類普遍存在于生物體內(nèi)的、低分子量(2-7 kD)的、富含半胱氨酸(20%-30%)、不含芳香族氨基酸和組氨酸的一類金屬結合蛋白質(zhì)。MT可被金屬、細胞因子、有機化學藥物和應激、荷爾蒙等誘導,具有維持生物體內(nèi)金屬含量動態(tài)平衡和重金屬解毒作用雙重機制,且具有清除自由基和抗輻射、提高機體免疫力、增強機體抗應激能力等多種主要的生物學作用[1-3]。因此,MT在食品保健、醫(yī)學、農(nóng)業(yè)、生物工程、環(huán)保等領域得到了廣泛的應用。
目前,國內(nèi)市場上常見的MT多數(shù)是從兔肝臟中提純[4],提取工藝繁復,產(chǎn)量極低,致使MT的價格極其昂貴(純度在 95% 以上價格為 45 000~50 000 元/g),MT原料來源已成為制約該領域發(fā)展的瓶頸之一,從而使其應用和研究受到限制。利用益生菌基因重組技術大規(guī)?;a(chǎn)制備 MT 是解決其來源限制瓶頸的熱點研究方向。
畢赤酵母(Pichia pastoris)表達系統(tǒng)具有優(yōu)良特性,是目前廣泛應用的微生物表達系統(tǒng)之一,作為真核生物,其不僅具備原核表達系統(tǒng)的繁殖速度快、操作簡單及價格低廉、外源蛋白表達量高等優(yōu)點,還能夠?qū)ν庠吹鞍走M行翻譯后加工、折疊及修飾,自身分泌的蛋白質(zhì)少便于分離純化,更適用于大批量發(fā)酵生產(chǎn)。目前,已有多種外源基因在巴斯德畢赤酵母表達系統(tǒng)中成功地重組表達[5-7]。底棲雙殼類海洋動物為濾食性生物,對重金屬有較強的生物富集能力,其體內(nèi)MT基因?qū)χ亟饘倬哂懈呙舾械膽ば猍8-10],且與環(huán)境中金屬濃度具有一定的相關性。相對于陸地源 MT,海洋源 MT 具有獨特的化學結構和特殊的生物活性。本研究采用畢赤酵母 GST115 菌株表達海洋源 MT。畢赤酵母菌株 GST115 利用強效的醇氧化酶1(AOX1)啟動子,已成功高效表達了多種外源蛋白,且其與酵母基因組整合的機理決定酵母多拷貝重組子的出現(xiàn)。本研究旨在解決制約MT產(chǎn)業(yè)發(fā)展原料來源瓶頸,應用基因重組技術,將褶牡蠣(Ostrea plicatula)內(nèi)臟團中克隆得到的金屬硫蛋白基因全長序列 OpMT,插入到表達載體 pPICZαA -SUMO 的相應位點,并轉(zhuǎn)入畢赤酵母菌GS115中,擬構建安全高效分泌表達的重組畢赤酵母菌MT基因工程菌。以期能獲得具高安全性、高產(chǎn)量和高活性的高純海洋源 MT 蛋白,解決 MT 原料來源限制的瓶頸,為以后開發(fā)天然、高效海洋源重金屬解毒劑提供理論基礎。
1.1.1 質(zhì)粒、菌株和主要試劑 本實驗室所用菌株和質(zhì)粒見表1。主要試劑見表2。
表1 質(zhì)粒和菌株
表2 主要試劑
1.2.1 融合分泌表達載體pPICZαA-SUMO-OpMT的構建 根據(jù)NCBI GeneBank中褶牡蠣金屬硫蛋白基因OpMT序列(登錄號:KP875559),設計引物(F1:TGG ACC GGA TGT AAT GTG GT /R1:TTG GGT CCT TTG TTA CAC GC),從褶牡蠣內(nèi)臟團總RNA中擴增得到目的基因序列。連接至克隆載體pMD-19,并轉(zhuǎn)化到E.coli DH5α 中,送至上海生物工程技術公司進行序列測定。酶切(BamHI/SmaI)后連接至pPICZαA-SUMO 表達載體上,并轉(zhuǎn)化到E.coli DH5α細胞,抗生素(100 μg/mL 氨芐青霉素Amp)平板篩選陽性轉(zhuǎn)化子并加以驗證。
1.2.2 畢赤酵母重組工程菌構建和篩選利用電轉(zhuǎn)化法將質(zhì)粒 pPICZαA-SUMO-OpMT轉(zhuǎn)入畢赤酵母菌 GST115中,利用含有不同濃度抗生素(博來霉素)的MD 平板進行初步篩選得到陽性轉(zhuǎn)化子菌株,命名為 GST115/pPICZαA- SUMO-OpMT (圖 1)。
圖1 重組質(zhì)粒 pPICZαA- SUMO-OpMT 的構建
篩選得到的重組酵母菌株用 YPD (Yeast Extract Peptone Dextrose Medium) 液體培養(yǎng)基培養(yǎng)至同一生長周期,取 2 mL 菌液依次接種在0, 0.25, 0.50, 1.0, 1.5, 2.0, 3.0, 4.0 mg/mL 博來霉素的 YPD 平板上。在耐受高質(zhì)量濃度博來霉素的 YPD 平板上篩選陽性高拷貝GST115/pPICZαA- SUMO-OpMT 重組酵母。
Mut+表型的重組菌株一般是由于 SalI 線性化質(zhì)粒電轉(zhuǎn)化 GS115 后,大多數(shù)在 HIS4 位點發(fā)生了重組。可以利用MMH 和 MDH平板進行區(qū)分檢測。因此,進一步對高濃度博來霉素的 YPD 平板上的 GST115//pPICZαA -SUMO- OpMT 重組酵母菌株進行甲醛利用型篩選Mut+型,分別利用含有博來霉素的 MMH 和 MDH 平板篩選。在 MMH 平板上很小或者不長,而在 MDH 平板上能夠正常生長的為 Muts 型,其余為 Mut+ 型。同時挑取單菌落進行PCR 擴增鑒定(引物 F2:ATG TCT GAT CCA TGT AAC /R2:TC ATT TCT TAC AGA CAC ATC)。
1.2.3 融合蛋白誘導表達和分離純化 100 mL GST115/pPICZαA- SUMO-OpMT 于BMGY 菌液擴大培養(yǎng),培養(yǎng)條件:30 ℃,24 h , 220 r /min 振蕩培養(yǎng)至OD600 值為 6.0,再轉(zhuǎn)入 BMMY 培養(yǎng)基中誘導培養(yǎng),加入0.5% 甲醛誘導,每 24 h 補加1次甲醇,分別在 2, 4, 6, 8 h 分別離心收集發(fā)酵液上清,進行 SDS-PAGE 凝膠電泳定性,分離膠 12%,濃縮膠 5%。另一組空白畢赤酵母菌 GS115作為對照。電泳結束后凝膠染色 4-6 h,將脫色后的凝膠保存于去離子水中,用 Bio-Rad 凝膠成像系統(tǒng)拍照。
對發(fā)酵液進行His-tag標簽親和純化。首先平衡鎳柱(TBS pH 8.0),上樣,設流速為1 mL/min,之后用含有50 mmol/L 咪唑的TBS(pH 8.0)洗滌,最后用含有300 mmol/L 咪唑的TBS(pH 8.0)洗脫目的蛋白。收集洗脫峰值,分別進行目的蛋白定性檢測(的SDS-PAGE 凝膠電泳)和定量檢測(Bradford method)。
1.2.4 融合蛋白的 Western blotting 鑒定 將重組畢赤酵母工程菌誘導表達2, 4, 6, 8 h 后的發(fā)酵液和空白對照組(畢赤酵母菌 GS115)的發(fā)酵液,經(jīng) TCA 沉淀后進行 SDS-PAGE 凝膠電泳,轉(zhuǎn)膜,加入His 抗體,用 Bio-Rad 凝膠成像系統(tǒng)拍照。
1.2.5 褶牡蠣金屬硫蛋白HPLC檢測 收集菌液(7 000 r/min 10 min),水浴(80 ℃/5 min), 離心取上清(12 000 r/min 10 min)。進行MT含量測定,采用HPLC方法測定其中-SH含量進行MT間接定量[11]。標樣為兔肝MT,圖7(A)為色譜條件下得到的兔肝MT標樣色譜圖,MT保留時間為7.3~7.7 min。
1.2.6 融合蛋白活性檢測 配置含有不同濃度CdCl2的 YPD固體培養(yǎng)基平板(0, 50, 100, 200, 500, 700 μmol/L),取100 μL OD600為4.0的畢赤酵母菌重組OpMT工程菌分別均勻涂布于上述平板上,同時以畢赤酵母菌GS115菌株為對照組,30 ℃ 倒置培養(yǎng)12-16 h 觀察菌落生長情況。
圖2 融合表達載體pPICZαA-SUMO-OpMT的酶切鑒定注:為SUMO-OpMT表達載體的酶切圖;M:DNA Marker;1:表達質(zhì)粒雙酶切
PCR 擴增褶牡蠣內(nèi)臟團總 RNA 得到約為 324 bp的目的基因片段 OpMT 后,與SUMO 基因(約660 bp)一起經(jīng)酶切連接至融合表達載體 pPICZαA,得到構建重組質(zhì)粒 pPICZαA-SUMO-OpMT。該質(zhì)粒的酶切驗證見圖 2。
目的基因整合進畢赤酵母,His+轉(zhuǎn)化子出現(xiàn) 1%-10% 概率的多拷貝插入,整合了多拷貝表達的重組酵母,有利于高效表達外源蛋白??衫每股?博來霉素)濃度梯度法進行篩選,耐受抗生素(博來霉素)濃度越高,越容易篩選出多拷貝表達的重組酵母菌。設置7個濃度梯度(0.25-4.0 mg/mL)的博來霉素平板篩選,到耐受4.0 mg/mL博來霉素的 GST115/pPICZαA-SUMO-OpMT 重組酵母菌株(見圖3),表明本研究篩選得到酵母基因組 DNA 上整合了多拷貝目的基因 MT 表達單元的重組酵母菌。
將篩選得到的重組酵母菌株經(jīng)PCR擴增(F1:TGG ACC GGA TGT AAT GTG GT /R1:TTG GGT CCT TTG TTA CAC GC)后送至上海生物工程技術公司進行序列測定。
圖3 高拷貝重組畢赤酵母菌株的篩選(圖中數(shù)據(jù)為 Zeocin 濃度(mg/mL)
圖4 重組酵母工程菌甲醛利用型篩選
通過含博來霉素的 MMH 和 MDH 平板篩選,在MMH 平板上需找到 2 株甲醛利用型(Mut+型)的 GST115/pPICZαA-SUMO-OpMT 重組酵母菌株(圖 4)。
高拷貝甲醛利用型 GST115/pPICZαA-SUMO-OpMT 菌液進行甲醛擴大誘導培養(yǎng)(1 L),培養(yǎng)條件:30 ℃,8 h,0.5% 甲醛,2, 4, 6, 8 h 分別離心(12 000 r/min,4 ℃,30 min)收集發(fā)酵液上清,利用 His-tag 標簽親和純化 SUMO-OpMT 融合蛋白,Bradford method 分析純化得到融合蛋白結果表明,蛋白純度在 95% 以上,目的蛋白得率0.436 mg/mL。
將收集得到純化蛋白進行SDS-PAGE 電泳分析和 Westernblotting (His-Tag 單抗)鑒定(圖5)。以未轉(zhuǎn)入表達載體的 GST115畢赤酵母菌培養(yǎng)液為空白對照。分析圖 5 (左圖和右圖)發(fā)現(xiàn)在 23 kD(其中 OpMT 編碼蛋白為10.5kD)位置分別出現(xiàn)了一條明顯的特異性條帶,說明多拷貝融合蛋白在宿主菌中得到了表達,且融合蛋白為可溶形式表達,表達量并隨著誘導時間延長增加。
圖5 GST115/pPICZαA-SUMO-OpMT 的 SDS-PAGE 電泳檢測(左)和Western Blotting 鑒定(右)M: 蛋白 Marker; ?. 未轉(zhuǎn)化(陰性對照); 紅色箭頭指示目的蛋白
以兔肝MT為標樣,兔肝MT標品(0.1 mg/mL)和畢赤酵母菌重組工程菌發(fā)酵液HPLC結果見圖6。兔肝MT目的峰的保留時間為7.3~7.7 min。結果顯示,畢赤酵母菌重組工程菌發(fā)酵液在7.7 min有峰出現(xiàn),說明畢赤酵母重組工程菌發(fā)酵液中含有目的蛋白,畢赤酵母菌重組工程菌成功表達了目的蛋白OpMT,表達量為0.37 mg/mL。
圖6 兔肝MT標品(A)和畢赤酵母重組工程菌發(fā)酵液(B)HPLC色譜圖
將含有SUMO-OpMT質(zhì)粒的畢赤酵母菌重組工程菌和不含SUMO-OpMT質(zhì)粒的畢赤酵母菌空載體分別涂布于含有不同濃度CdCl2的培養(yǎng)基上,37 ℃培養(yǎng)12-16 h后發(fā)現(xiàn)(圖7),隨著CdCl2濃度的增加,平板上菌落數(shù)減少。當CdCl2的濃度達到100 μmol/L時,MT重組工程菌在CdCl2的濃度為50 μmol/L的平板上生長良好,在CdCl2的濃度為100 μmol/L的平板上生長較差,在CdCl2的濃度為200 μmol/L的平板上未能檢測到,即MT重組工程菌的最大耐受CdCl2的濃度為100 μmol/L,而空載體在CdCl2的濃度為50 μmol/L的平板上生長較差,,在CdCl2的濃度為100 μmol/L的平板上未能檢測到菌落。說明含有SUMO-OpMT的重組畢赤酵母菌工程菌對重金屬鎘的耐受能力增強。
圖7 YPD固體培養(yǎng)基上重組工程菌對鎘的耐受能力
利用基因重組和發(fā)酵技術制備重組蛋白是目前獲取大量外源蛋白的首選。目前,國內(nèi)外對金屬硫蛋白基因工程方面研究大多集中在原核表達系統(tǒng)[11],其應用也多關注于環(huán)境治理和修復以及微生物解毒[12-13],對 MT 的工業(yè)化應用關注較少,具有工業(yè)化生產(chǎn)價值的基因工程菌株報道更是極少。本課題組前期研究利用 E. coli 高效表達了海洋源 MT,但是表達的蛋白仍以包涵體的形式存在。這與鄧小亮、He Y等報道一致[14-16]。另外,本課題組前期研究還運用枯草芽孢桿菌作為宿主[17],成功實現(xiàn) SUMO(small ubiquitin-related modifier)與海洋源 MT 的融合分泌表達,并得到高純度的、有活性的可溶性目的蛋白,但表達量較低,仍無法滿足 MT 的工業(yè)化生產(chǎn)要求。
畢赤酵母作為真核宿主菌不僅具有原核生物的優(yōu)點,有利于低成本大規(guī)模生產(chǎn),同時,可高表達有生物學活性的分泌型功能性外源目的蛋白、極少分泌自身蛋白、不含內(nèi)毒素、使用安全的優(yōu)點,成為實驗室研究及商業(yè)生產(chǎn)重組蛋白的新寵,具有極好的生產(chǎn)應用前景。畢赤表達系統(tǒng)作為生產(chǎn)外源蛋白的重要宿主菌已成功表達多種蛋白(其中一些產(chǎn)物已應用于臨床試驗,包括酶、膜蛋白、抗原、抗體和調(diào)節(jié)蛋白等[18-20]),但未見有利用畢赤酵母表達系統(tǒng)實現(xiàn)海洋源 MT 表達的報道。本研究以畢赤酵母 GS115為宿主菌,成功實現(xiàn) SUMO 與海洋源 MT 在畢赤酵母菌 GS115 中融合分泌表達,并得到高表達的、有活性的可溶性目的蛋白,使海洋源 MT 具有極大的應用于實際工業(yè)生產(chǎn)潛能,為天然高效重金屬生物解毒劑的成功開發(fā)和推廣提供理論依據(jù)。
當前,畢赤酵母菌株 GST115 成功、高效表達多種外源蛋白多依賴 AOX1 啟動基因,而 AOX1 為甲醇依賴型啟動子,所以在培養(yǎng)過程中存在一定火災隱患。因此, GAP、FLD1、PEX8、PGAP 和 YPT1 等不以甲醇為唯一誘導物的啟動子具有更大吸引力,也將是本研究下一步研究的重點。