国产日韩欧美一区二区三区三州_亚洲少妇熟女av_久久久久亚洲av国产精品_波多野结衣网站一区二区_亚洲欧美色片在线91_国产亚洲精品精品国产优播av_日本一区二区三区波多野结衣 _久久国产av不卡

?

β1-腎上腺素能受體基因編碼區(qū)1165位單核苷酸多態(tài)性與腸道病毒A71感染的關系

2018-10-15 09:18李幫濤雷智賢李虹艾崔蘭海元平黃婷向偉
中華實驗和臨床病毒學雜志 2018年4期
關鍵詞:等位基因多態(tài)性基因型

李幫濤 雷智賢 李虹艾 崔蘭 海元平 黃婷 向偉

570206???,海南省婦幼保健院(海南省兒童醫(yī)院)重癥醫(yī)學科(李幫濤、海元平、雷智賢、黃婷、向偉);570206???,南華大學附屬海南醫(yī)院兒內科(李虹艾);570206???,海南醫(yī)學院附屬醫(yī)院兒內科(崔蘭)

腸道病毒 A71型(enterovirus A71,EV-A71)呈高度嗜神經性,是引起重癥手足口病(hand,foot and mouth disease,HFMD)的最主要病原體。重癥HFMD的發(fā)生機制非常復雜,其中兒茶酚胺類遞質參與全身血管血流動力學變化,促進重癥HFMD的進展[1]。 β1-腎上腺素能受體(β1-adrenoceptor,β1-AR)是介導兒茶酚胺作用的重要組織受體,其中最具有功能性意義的β1-AR位點可能為G1165C位點[2],鳥嘌呤(G)與胞嘧啶(C)的置換突變可能產生具有臨床意義的基因多態(tài)性。本研究對β1-AR基因編碼區(qū)1 165位進行測序,探討該位點單核苷酸多態(tài)性(single nucleotide polymorphism,SNP)與 EVA71感染的關系。

1 材料與方法

1.1 研究對象 EV-A71感染組:2015年10月至2016年9月期間來自海南省婦幼保健院(海南省兒童醫(yī)院)117例臨床診斷為HFMD的患兒,其中EVA71感染77例,男性57例,女性20例,年齡2.3±1.2歲,其中輕癥HFMD 22例,重癥HFMD 55例,臨床診斷標準均符合《HFMD診療指南(2010年版)》,經實驗室檢測咽拭子的病毒核酸PCR(熒光標記PCR法)陽性,或血清EV-A71 IgM抗體(北京萬泰ELISA法)陽性為入組標準,確診為EV-A71感染。健康對照組:同時期同地區(qū)我院門診健康體檢的兒童共66例,男性31例,女性35例,年齡2.9±1.1歲,且符合咽拭子的病毒核酸PCR和血清EVA71 IgM抗體陰性,無HFMD、中樞神經系統(tǒng)損傷、嗜鉻細胞瘤、高血壓及心臟、腎臟疾病等病史,排除EV-A71感染。 兩組性別(χ2=0.594,P =0.279)和年齡(t=0.246,P=0.130)比較差異均無統(tǒng)計學意義。

1.2 方法

1.2.1 標本采集:HFMD患兒急性期(病程前3 d內)咽拭子標本和靜脈EDTA抗凝血3 ml(基因檢測部分保存至-70℃冰箱)。

1.2.2 核酸檢測:選擇EV-A71 HFMD患兒77例和健康體檢兒童66例進行核酸檢測。用OMEGA血樣DNA提取試劑盒(D3471-02)提取采集樣本的基因組 DNA。 依據 NCBI發(fā)布的 β1-AR(GenBank序列號:NG_012187.1)的編碼區(qū)序列設計擴增引物, Arg389Gly UP: 5′-CAGAAACATGCTGAAGT CCCG-3′, Arg389Gly DOWN: 5′-GATGGGCAGGAA GGACACC-3′。引物由上海蘭衛(wèi)檢驗公司合成。PCR擴增反應總體系為25μl,其中10 × LAmp Buffer 2.5 μl,dNTP 2 μl,ADRB1-F1/F2/F3/F4 1 μl,ADRB1-R1 /R2 /R3/R4 1 μl,LAmp Taq 0.25 μl;5 ×C SolutionⅠ5 μl;DNA 模板1 μl,ddH2O 12.25 μl。 PCR 反應條件:99 ℃ 10 min;99 ℃ 30 s,60 ℃45 s,72 ℃ 90 s,共38個循環(huán);72 ℃ 7 min。 PCR 擴增產物經1%瓊脂糖凝膠電泳鑒定。PCR擴增產物進行Sanger測序。將獲得的序列與NCBI ADRB1基因參考序列比對,確定SNP分型。

1.3 統(tǒng)計學方法 本研究應用SPSS 18.0統(tǒng)計學軟件進行統(tǒng)計學分析,計數資料以頻數或百分比表示,采用R?C表χ2檢驗比較,P<0.05差異具有統(tǒng)計學意義。

2 結果

2.1 SNP多態(tài)性分布的性別差異 從表1可看出,在男童中,EV-A71感染組和健康對照組C等位基因均占優(yōu)勢,但基因型頻率經χ2檢驗分析,分布差異無統(tǒng)計學意義(χ2=0.135,df=2,P =0.935);等位基因頻率經χ2檢驗分析,分布差異無統(tǒng)計學意義(χ2=0.069, df=1, P =0.868)。 在女童中,EVA71感染組和健康對照組C等位基因均占優(yōu)勢,但基因型頻率經χ2檢驗分析,分布差異無統(tǒng)計學意義(χ2=1.677,df=2, P =0.432);等位基因頻率經 χ2檢驗分析,分布差異無統(tǒng)計學意義(χ2=0.866,df=1,P=0.380)。說明β1-AR基因編碼區(qū)1 165位SNP基因型和等位基因無明顯的性別差異。

2.2 健康對照組和EV-A71感染組SNP多態(tài)性分布比較 從表1可看出,66名健康兒童和77例EVA71 HFMD患兒均存在 β1-AR基因編碼區(qū)1 165位SNP,有3種基因型:GG、GC和CC。 在EVA71 HFMD患兒中,GG、GC和CC基因型頻率分別為10%、47%、43%,G、C等位基因頻率分別為34%、66%;在健康兒童中,GG、GC和CC基因型頻率分別為7%、41%、52%,G、C等位基因頻率分別為28%、72%。EV-A71感染組與健康對照組相比,基因型頻率經χ2檢驗分析,分布差異無統(tǒng)計學意義(χ2=1.154, df=2, P =0.562);等位基因頻率經 χ2檢驗分析,分布差異無統(tǒng)計學意義(χ2=1.091,df=1, P =0.296)。

表1 健康對照組和EV-A71感染組1 165位單核苷酸多態(tài)性基因型和等位基因頻率的分布Tab.1 Distribution of single nucleotide polymorphism at locus 1 165 in EV-A71 and control group infection

2.3 EV-A71感染輕癥組和重癥組SNP多態(tài)性分布比較 從表2可看出,按嚴重程度分組進一步發(fā)現,EV-A71感染輕癥組和重癥組相比,基因型頻率經χ2檢驗分析,分布差異無統(tǒng)計學意義(χ2=3.945, df=2,P =0.139);等位基因頻率經 χ2檢驗分析,分布差異無統(tǒng)計學意義(χ2=3.763,df=2,P=0.052)。說明β1-AR基因編碼區(qū)1 165位 SNP與EV-A71感染及其嚴重程度無關聯。

表2 EV-A71感染輕癥組和重癥組1 165位單核苷酸多態(tài)性基因型和等位基因頻率的分布Tab.2 Distribution of single nucleotide polymorphism at locus 1 165 in the mild and severe group of EV-A71 infection

3 討論

β1-AR基因已有多個SNP被識別,而G1165C位點是β1-AR基因編碼區(qū)的主要功能位點,目前國內外學者針對β1-AR基因G1165C位點基因多態(tài)性的研究主要集中在心血管疾?。?-4],與EV-A71感染的關系研究甚少。β1-AR核苷酸第1 165位核苷酸C被G替換,導致第389氨基酸由Gly變?yōu)锳rg,多項研究表明Arg389β1-AR的腺苷酸環(huán)化酶(AC)活性水平較 Gly389β1-AR 顯著升高[5-7]。 因此,結合EV-A71感染重癥HFMD的兒茶酚胺風暴現象及G1165C位點的研究理論,理論上β1-AR G1165C位點的置換突變,參與G偶聯調節(jié)細胞內cAMP水平和L型通道的開放頻率,調節(jié)機體的生理功能,影響病情的嚴重程度。

由于遺傳背景差異(包括常染色體和性染色體),不同性別的位點基因多態(tài)性分布可能存在差異。王浩等[8]發(fā)現男性和女性不同基因型攜帶者之間的靜息心率存在統(tǒng)計學差異,β1-AR基因A145G位點可能與男性靜息心率相關。但本研究發(fā)現G1165C位點基因型和等位基因在EV-A71感染組和健康對照組的分布無統(tǒng)計學差異,可排除性別對β1-AR基因G1165C位點基因型分布的影響。本研究對77例EV-A71 HFMD患兒和66名健康對照者的β1-AR基因編碼區(qū)1 165位SNP基因型進行檢測和分析,發(fā)現兩組基因型和等位基因頻率的分布無統(tǒng)計學差異,且按病情嚴重程度分析,發(fā)現輕癥組和重癥組的分布亦無統(tǒng)計學差異。提示β1-AR基因編碼區(qū)1 165位SNP與EV-A71感染及其嚴重程度無關聯,不會增加EV-A71感染和病情加重的風險。分析原因可能為:①可能存在HFMD的其他易感基因或β-AR基因上的其他SNP,與β1-AR基因編碼區(qū)1 165位SNP相互作用或連鎖不平衡。②EV-A71 HFMD的易感性不但受遺傳因素,可能還受到病毒毒力、環(huán)境影響,單個基因突變引起的作用較小。③研究樣本量偏小,且地區(qū)局限,可能對統(tǒng)計效能有一定影響。

因此在未來的研究中,應加強多中心、多樣本研究β1-AR多態(tài)性位點,并關注與之存在連鎖不平衡以及相互作用的其他基因SNP位點,同時研究EVA71感染HFMD兒茶酚胺水平與β1-AR基因多態(tài)性的關系,深化對重癥HFMD發(fā)病機制的認識,從基因水平為HFMD的防治提供新的研究思路。

利益沖突 無

猜你喜歡
等位基因多態(tài)性基因型
單核苷酸多態(tài)性與中醫(yī)證候相關性研究進展
親子鑒定中Penta E稀有等位基因28的確認1例
MTHFR C677T基因多態(tài)性與頸動脈狹窄及其側支循環(huán)形成的關系
親子鑒定中男性個體Amelogenin基因座異常1例
廣東漢族人群Penta D基因座off-ladder稀有等位基因分析
貴州漢族人群23個STR基因座的OL等位基因研究
結核分枝桿菌北京基因型菌株大片段的多態(tài)性研究
蒙古斑在維吾爾族新生兒中分布的多態(tài)性
作物遺傳育種研究進展Ⅴ.表型選擇與基因型選擇
ZNF804A rs1344706多態(tài)性與精神分裂癥的關聯分析
东光县| 延津县| 札达县| 陆良县| 利津县| 莎车县| 洛宁县| 泸西县| 鞍山市| 平邑县| 黄大仙区| 洞口县| 金沙县| 壤塘县| 横山县| 康马县| 麟游县| 梁平县| 临沂市| 阿拉善右旗| 南乐县| 嘉祥县| 萍乡市| 遵化市| 玉溪市| 顺昌县| 门源| 公安县| 大连市| 红原县| 邯郸市| 新干县| 贵南县| 额济纳旗| 兴业县| 措美县| 巩留县| 河间市| 伊宁县| 理塘县| 灌阳县|