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遼寧省首例D8基因型麻疹病毒的分離與鑒定

2018-11-14 11:34王艷郝爽王文思韓一楠方興姚文清
中華實驗和臨床病毒學雜志 2018年5期
關鍵詞:麻疹核苷酸基因型

王艷 郝爽 王文思 韓一楠 方興 姚文清

110005沈陽,遼寧省疾病預防控制中心免疫規(guī)劃所(王艷、郝爽、王文思、方興、姚文清);116021大連市疾病預防控制中心免疫規(guī)劃所(韓一楠)

麻疹是由麻疹病毒(measles virus,MV)引起的急性呼吸道傳染病,臨床以發(fā)熱伴出疹為主要癥狀。2010年12月,世界衛(wèi)生組織(world health organization,WHO)消除麻疹定義為:麻疹監(jiān)測系統(tǒng)(measles surveillance system,MSS)運轉良好的前提下,明確的地理區(qū)域內無本土麻疹病毒傳播≥12個月[1]。因此病毒基因型的基線調查是做好麻疹消除工作的前提。近20年的監(jiān)測顯示遼寧省流行的麻疹野病毒基因型均為H1a[2]。2018年5月,遼寧省首次在大連1例麻疹患者的咽拭子標本中分離并鑒定出D8基因型病毒。

1 材料與方法

1.1 病例來源 該病例相關信息均來自遼寧省MSS。

1.2 標本采集、運送和初步篩查 按照全國麻疹監(jiān)測方案要求,采集病例咽拭子和血標本并運送到市級麻疹實驗室進行檢測。血標本用ELISA法同時檢測麻疹和風疹IgM抗體;提取咽拭子中的病毒核酸并使用熒光PCR法檢測麻疹和風疹病毒核酸。按照遼寧省麻疹網絡實驗室要求,對核酸篩查陽性的咽拭子標本在10日內上送至省疾病預防控制中心分離病毒和基因分型。

1.3 病毒分離 按照《麻疹診斷》WS 296—2017附錄B.1處理標本并將標本接種至單層Vero/Slam細胞,逐日觀察細胞是否產生病變(CPE)。如出現麻疹病毒典型的融合CPE可連續(xù)傳至3代后收獲,3代后仍無CPE的視為陰性棄去。

1.4 毒株鑒定 使用RT-PCR方法對收獲的毒株進行鑒定。使用Qiagen公司 One-Step RT-PCR Kit擴增MV H基因全長和N基因羧基末端的676個核苷酸。實驗條件及引物序列參照文獻[3]。

1.5 序列分析 將PCR產物送北京Invitrogen生物技術有限公司測序。將返回序列與WHO MV 24個基因型的參考株序列,使用MEGA 5.0軟件分別對H基因和N基進行核苷酸和氨基酸的變異比對分析,并構建基因親緣關系進化樹。

2 結 果

2.1 病例的流行病學 病例為男性,1983年出生,大連市戶籍,待業(yè)。2018年4月30日出現發(fā)熱和呼吸道卡他癥狀,5月1日出現皮疹,臨床診斷為麻疹并進行網絡直報?;颊卟磺宄欠窠臃N過麻疹疫苗,發(fā)熱前7~21 d無外出史,無醫(yī)院就診史,與明確感染出疹性疾病患者無接觸史。

2.2 血清麻疹、風疹IgM抗體檢測和咽拭子核酸檢測 麻疹IgM抗體和病毒核酸均為陽性,風疹IgM抗體和病毒核酸均為陰性。該病例為麻疹實驗室確診病例。

2.3 病毒分離、復核和標準命名 接種咽拭標本的細胞于第一代就出現了典型的融合病變,轉種至3代后收獲病毒。該病毒序列經國家麻疹參比實驗室復核并確認為D8基因型。按照WHO麻疹野病毒的標準命名方法,將該麻疹病毒分離株命名為:MVi/Liaoning.CHN/18.18/1。

2.4 D8基因型確定 將遼寧省D8基因型麻疹病毒與WHO 24個基因型參考株、GenBank上下載的北京、香港的D8基因型麻疹病毒流行株和2017—2018年麻疹病毒D8基因型其他國家流行株基于N基因羧基端450個核苷酸序列構建基因親緣關系進化樹(圖1)。MVi/Liaoning.CHN/18.18/1麻疹野病毒與WHO D8基因型麻疹病毒參考株MVi/Manchester.GBR/30.94/D8最為接近,其 Bootstrap值為98.9%。該分離株屬于D8基因型。

2.5 遼寧D8基因型麻疹病毒分離株H和N基因變異分析 遼寧株與WHO D8基因型參考株Manchester.GBR/30.94 N基因核苷酸和氨基酸同源性分別為98.9%和97.3%;H基因核苷酸和氨基酸同源性均為98.9%。與中國優(yōu)勢流行H1參考株Hunan.CHN/93/7 N基因核苷酸和氨基酸同源性分別為92.4%和91.3%,H基因核苷酸和氨基酸同源性分別為93.8%和95.8%(表1)。

3 討 論

麻疹病毒基因型別分布具有明顯的地理特征,并且野病毒流行與年代存在一定的相關性[4]。D8基因型麻疹病毒主要流行于印度、孟加拉等南亞國家,美國和澳大利亞近年來也多次監(jiān)測到D8基因型的流行。中國首例輸入性D8基因型麻疹病例由上海市疾病預防控制中心于2012年報道[5]。2013年在北京出現2起由D8基因型麻疹病毒感染引起的暴發(fā)疫情,2016年之后又在廣東、湖北、內蒙古、云南和安徽等省出現D8病毒的傳播(GenBank上未獲得相應序列資料)。經分析遼寧省此次D8基因型病毒與GenBank上傳的中國香港2012—2016年流行序列100%同源,與2018年在哥倫比亞分離的MVi/LosPatios.COL/11.18/D8序列同源性為100%。與2013年北京流行的D8基因型麻疹病毒處于不同的分支。

圖1 遼寧省D8基因型麻疹病毒分離株與WHO各基因型參考株構建的基因親緣性關系樹D8 genotype strains of China;2017-2018 D8 genotype strains from other countries;WHO D8 genotype strain;Liaoning isolateFig.1 The phylogenetic tree of Liaoning D8 strains compared to the WHO reference strains for each genotype

自患者確診為麻疹后經過1個麻疹最長的潛伏期,未發(fā)現2代病例,大連麻疹疫情平穩(wěn)。H基因變異分析顯示,該D8麻疹病毒分離株與疫苗株S191相比在重要抗原位點變異程度與遼寧H1分離株相似,結合流行病學信息表明通過疫苗接種或者自然感染本土H1a基因型麻疹病毒后,體內產生的抗體對阻斷D8基因型病毒的擴散和傳播起一定作用。

遼寧D8基因型毒株與2016年于安徽和上海流行的D8基因型麻疹病毒同源性均為100%(國家麻疹實驗室未發(fā)表數據),因此推測D8基因型有可能已經在我國呈現小范圍流行,該推測還需要綜合分析全國麻疹病毒學監(jiān)測數據進行進一步研究加以證實。隨著我國本土H1基因型麻疹病毒傳播的減少,非本土基因型麻疹野病毒的輸入就會凸顯,越來越多的病毒基因型輸入引起的病例就會被監(jiān)測到。需要加強流行病學和實驗室監(jiān)測,密切追蹤D8基因型麻疹病毒在我國的流行態(tài)勢,以便采取有效措施及時阻斷該病毒在我國的進一步轉播。

表1 遼寧省D8基因型麻疹病毒分離株與24個WHO不同基因型參考株N和HN基因平均遺傳距離Tab.1 N and H mean p-distances for nucleotides and amino acids for measles viruses D8 isolated of Liaoning province with WHO 24 genotype representative strains

利益沖突 無

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