唐俊妮,羅雙華,劉 驥,趙燕英,陳 娟,湯 承
(西南民族大學生命科學與技術學院,四川 成都 610041)
金黃色葡萄球菌(Staphylococcus aureus,S.aureus)是一種常見的食源性和醫(yī)源性致病菌,能夠分泌多種毒素,如腸毒素/類腸毒素(staphylococcal enterotoxins/staphylococcal enterotoxins-like,SEs/SEls)、剝脫毒素和中毒性休克毒素(toxic shock syndrome toxin,簡寫為TSST-1,原命名腸毒素 SEF)等.其中,SEs/SEls的分泌是金黃色葡萄球菌引起食物中毒的主要原因[1-2].SEs/SEls是一類結構相似,具有超抗原(superantigen,SAg)活性的細菌毒素,在極低劑量(ng或pg)時即可刺激T細胞,在T細胞抗原受體上進行增殖,并能明顯增強T細胞活性[3-4].SEs/SEls根據(jù)發(fā)現(xiàn)的基因型及先后順序目前分為24種,包括傳統(tǒng)腸毒素SEA-SEE、新型腸毒素 SEG-SEJ、類腸毒素 SElKSElY等[2].SEs/SEls也可作為超抗原,具有開發(fā)成為抗腫瘤藥物的潛在可能[5-6].因天然SEs/SEls產(chǎn)量低,從產(chǎn)毒培養(yǎng)的金黃色葡萄球菌上清液中分離純化SEs/SEls比較困難[7-8].因此,關于上述多數(shù)SEs/SEls的活性及功能研究受到限制,大多數(shù)新型腸毒素或類腸毒素(SEs/SEls)的致病性及其引起的免疫耐受性等相關作用機制尚不清楚.
葡萄球菌腸毒素P(簡稱SEP),是新型腸毒素的一種,其分子量約為27.89 kD,具有刺激T細胞增殖及催吐特性的超抗原毒素[9].研究還認為SEP可能與耐甲氧西林金黃色葡萄球菌菌株引起的菌血癥相關聯(lián)[10].如果要對SEP進行深入的結構和功能研究,還需純化蛋白作為基礎.但目前國內外關于SEP蛋白相關報道比較少[9-10].
因此,本研究擬進行sep基因的克隆和重組質粒pET-30a-SEP的構建,在此基礎上,進行重組蛋白原核表達條件優(yōu)化與重組蛋白的純化,為后續(xù)深入研究SEP的結構與功能奠定基礎.
菌株和質粒:表達宿主大腸桿菌(E.coli)菌株DH5α、BL 21(DE 3)、BL 21(DE3)pLySs、Rosetta(DE3)、pMD18-T質粒、原核表達質粒 pET-30a均購自天根生化科技(北京)有限公司.
主要試劑:卡那霉素、氯霉素、IPTG 購自Sigma公司;丙烯酰胺、甲叉丙烯酰胺、咪唑購自Amresco公司;SDS-PAGE上樣緩沖液購自康為世紀生物科技有限公司;Ni2+-NTA-Sepharose 購自 GE Healthcar公司;Millipore 10 KD超濾管購自Millipore公司;PCR擴增試劑、核酸分子量標準、限制性內切酶NdeI和XhoI購自寶生物工程(大連)公司.
主要儀器設備:HZQ-F160全溫振蕩培養(yǎng)箱江蘇省太倉市實驗設備廠;GHP-9080水式恒溫培養(yǎng)箱上海齊欣科學儀器有限公司;MLS-3020電熱自動滅菌鍋日本SANYO公司;5804R冷凍離心機Eppendorf公司;SC-15數(shù)控超級恒溫槽、JY92-IIN超聲破碎儀寧波新芝生物科技股份有限公司;恒溫金屬浴、UV-6100分光光度計上海美普達儀器有限公司;伯樂Mini-PROTEAN Tetra Cell電泳儀伯樂科技有限公司.
1.2.1 基因sep的克隆與表達載體構建
金黃色葡萄球菌基因組DNA采用微波加熱法提取[11].根據(jù)GenBank中報道的金黃色葡萄球菌sep基因序列(NC_004740),采用 Premier 6.0軟件進行引物設計,基因 sep克隆引物上游序列(P1):5′-CGTACGCATATGAGTAAAATAAAAAAAACAACA(下劃線為NdeI酶切位點,ATG為起始密碼子);下游序列(P2) :5′-CGCTAGCTCGAGTCAAGTTGTATATAAATATATATCAA(下劃線為XhoI酶切位點);引物由生工生物公司(上海)合成.
PCR 擴增條件:PCR buffer 5 μL,dNTP (2.5 mmol/L) 3 μL,Mg2+(25 mmol/L) 4 μL,上下游引物P1和P2等量混合物 (濃度為10 μmol/L)3 μL,金黃色葡萄球菌基因組DNA模板1μL,Pfu DNA Polymerase 1μL,ddH2O 33 μL,反應體系共計50 μL.PCR反應條件為:95 ℃ 4 min;94 ℃,40 s;65 ℃ 50 s;72 ℃60 s,35個循環(huán);72℃,8 min.擴增所得片段經(jīng)瓊脂糖凝膠電泳檢測及PCR產(chǎn)物純化試劑盒純化后,與質粒載體pMD18-T進行T-A連接,分別將插入sep基因的pMD18-T質粒與空載質粒pET-30a用NdeI/XhoI雙酶切,將上述雙酶切獲得的純化片段用T4 DNA連接酶連接,使得目的基因定向克隆至表達載體pET-30a中.將插入sep基因的陽性質粒命名為pET-30a-SEP,同時將質粒進行雙酶切驗證和送生工生物公司(上海)測序.
1.2.2 最佳表達宿主菌的確定
將酶切鑒定的重組質粒pET-30a-SEP分別轉入表達宿主大腸桿菌 BL 21(DE 3)、BL 21(DE3)pLySs和BL 21(Rosetta)中,分別涂布于含相應抗生素的平板上,其中,BL 21(DE 3)和 BL21(DE3)pLysS 涂布于含卡那霉素30 μg/mL的LB瓊脂上,BL 21(Rosetta)涂布于含氯霉素10 μg/mL的LB瓊脂上,設置對照,37℃恒溫培養(yǎng)12~16 h,之后隨機挑取含重組質粒的單菌落于含相應抗生素的液體LB中,過夜培養(yǎng),在設定條件下誘導表達,離心收集菌體,SDS-PAGE分析各表達宿主菌蛋白的表達情況.
1.2.3 重組蛋白不同表達條件優(yōu)化
選擇1.2.2中最優(yōu)表達菌株,分別確定最優(yōu)IPTG濃度(37 ℃誘導6 h,IPTG 濃度梯度為0.1、0.2、0.3、0.4、0.5、0.6、0.7、0.8 mmol/L)、最佳誘導時間(37℃,最優(yōu) IPTG 濃度,分別誘導 0、2、4、6、8、10、12、24 h)、最佳誘導溫度(最優(yōu)IPTG濃度,最佳誘導時間,分別在37、27、17℃下誘導)和最佳 Zn2+濃度(最佳誘導時間、溫度、IPTG濃度,設置Zn2+濃度梯度為0、1、5、10、15、20、25 mmol/L).SDS-PAGE 分析不同條件下蛋白的表達情況.
1.2.4 重組蛋白rSEP純化
用上述確定的最佳表達條件大量培養(yǎng)重組宿主菌(2 L的培養(yǎng)基),測菌液吸光度(A600nm)至0.6~0.7時,加入最佳濃度IPTG誘導劑誘導,之后離心收集菌體,重懸于Buffer A緩沖液(50 mmol/L Tris-HCl,0.5 mol/L NaCl,pH 8.0)中,冰浴超聲破碎(超聲3 s,間隔6 s,共30 min),在4℃,12000 rpm 條件下離心20 min收集上清,采用緩沖液平衡好的 Ni2+-NTASEPharose親和層析柱中反復穿透上清液1 h,隨后用洗脫緩沖液(50 mmol/L Tris-HCl,0.5 mol/L NaCl,20~200 mmol/L咪唑,pH 8.0)梯度洗脫,收集目的蛋白,采用SDS-PAGE檢測純化的目的蛋白.
以篩選攜帶sep基因的金黃色葡萄球菌DNA為模板進行PCR擴增,sep基因擴增的PCR條帶見圖1(A),凝膠電泳表明 PCR擴增的目的基因片段大小與預期理論大小相符合,證明擴增得到了預期的sep基因片段.進一步對該片段進行克隆和測序鑒定,表明序列正確.通過酶切轉化篩選,獲得陽性克隆子.進一步對構建的重組表達載體pET-30a-SEP進行雙酶切驗證,得到了兩條與預期大小吻合的酶切產(chǎn)物片段,見圖1(B).至此,表明重組表達質粒載體 pET-30a-SEP構建成功.
圖1 sep基因的PCR擴增電泳圖(A)和表達載體pET-30a-SEP雙酶切電泳圖(B)Fig.1 The results for sep gene PCR amplification and pET-30a-SEP expression vector construction
針對表達宿主菌的優(yōu)化,如圖2所示,圖2A中的表達宿主菌BL 21(DE3)pLySs菌株中融合蛋白表達量明顯高于 BL 21(Rosetta)(圖 2B)和 BL 21(DE 3)(圖2C)中融合蛋白的表達量.因此,后續(xù)實驗選取BL 21(DE3)pLySs為最佳表達宿主菌株.
針對表達時間的優(yōu)化,如圖3(A)所示,誘導時間為8 h時融合蛋白表達量高(3A中的泳道6);針對IPTG的優(yōu)化濃度,如圖3(B)所示,IPTG濃度為0.2 mmol/L時融合蛋白表達量高(3B中的泳道2);針對溫度和Zn2+濃度優(yōu)化條件,如圖3(C)和3(D)所示,結果表明37℃和Zn2+濃度為1 mmol/L時融合蛋白表達量高(3C中的泳道2,3D中的泳道2),從而優(yōu)化得到重組質粒的最佳表達條件.
進一步在最優(yōu)表達條件(37℃,0.2 mmol/L IPTG,1 mmol/L Zn2+濃度,誘導 8 h)下,對 BL 21(DE3)pLySs宿主菌的單克隆進行小量誘導和表達驗證,如圖4所示,多次平行試驗均獲得了rSEP的高效可溶性表達(圖4).證實優(yōu)化得到的最佳表達條件成功(表達宿主菌選擇BL 21(DE3)pLysS、最佳IPTG濃度為0.2 mmol/L、最佳誘導時間為8 h、最佳表達溫度為37℃、最佳添加的Zn2+濃度為1 mmol/L).
圖2 pET-30a-SEP質粒在不同大腸桿菌表達宿主中目的蛋白的SDS-PAGE圖Fig.2 The protein expression of pET-30a-SEP in differentE.coli expression host bacteriaA 表達宿主菌為 BL 21(DE3)pLySs;B 表達宿主菌為 BL 21(Rosetta);C 表達宿主菌為 BL 21(DE3);M為蛋白分子量標準,泳道1為未誘導;泳道2-7為6個隨機挑取的表達菌株在IPTG誘導下的表達
圖3 不同表達條件的優(yōu)化結果Fig.3 The optimization results of pET-30a-SEP protein expression conditions
圖4 rSEP重組蛋白在最優(yōu)條件下表達的SDS-PAGE圖Fig.4 SDS-PAGE analysis for the optimal expression conditions of rSEP proteinM為蛋白分子量標準;泳道1為未誘導;泳道2~7為最優(yōu)條件下6個隨機挑取的菌株表達的目的蛋白
按上述最優(yōu)條件進行擴大培養(yǎng),經(jīng)過超聲波破碎,粗提液進行鎳親和層析純化,分別用含20、50和200 mM咪唑的緩沖液梯度洗脫雜蛋白,并進行SDSPAGE分析,結果見圖5.由圖5(A)的第7泳道可見,重組蛋白rSEP采用200 mM咪唑緩沖液洗脫效果最好.進一步驗證純化條件,結果見圖5(B),表明獲得純度較高的rSEP蛋白,通過蛋白定量試劑盒測定純化的rSEP蛋白濃度為1.8 mg/mL,可滿足后續(xù)研究.
圖5 純化重組蛋白rSEP的SDS-PAGE分析Fig.5 SDS-PAGE analysis for the rSEP fusion protein purification
金黃色葡萄球菌是引起食物中毒的重要致病菌之一,而腸毒素的產(chǎn)生是導致食物中毒的主要原因[12].金黃色葡萄球菌腸毒素基因種類繁多,sep基因作為眾多腸毒素基因的一種,在臨床上不斷被檢出,如Hait等[13]在引起食物中毒事件的面包店中檢測出sep基因;Liu等[14]從河南省2013~2014年收集的健康動物和醫(yī)院病人樣本中檢出sep基因,發(fā)現(xiàn)其攜帶率為14.69%;Wu等[15]從零售蔬菜分離的金黃色葡萄球菌中檢出sep基因,攜帶率高達70.0%.這些研究說明sep基因在金黃色葡萄球菌中普遍流行,該基因表達的SEP蛋白也可能具有潛在的食品安全威脅.但目前關于SEP蛋白的致病機制和功能研究報道不多,面臨的主要困難是天然SEP蛋白產(chǎn)量低,從產(chǎn)毒培養(yǎng)液中分離純化困難,如果需要制備SEP蛋白純品,需對sep基因編碼蛋白進行克隆表達與純化.因此,本研究中,我們根據(jù)GenBank中報道的金黃色葡萄球菌sep基因序列(NC_004740)設計引物,又從我們實驗室保存的臨床分離金黃色葡萄球菌菌株中篩選獲得sep基因序列,為成功構建重組表達載體 pET-30a-SEP奠定了基礎.
在表達條件的優(yōu)化實驗中,我們首先對經(jīng)典的大腸桿菌表達宿主菌 BL 21(DE 3)、BL 21(DE3)pLySs、BL 21(Rosetta)進行原核表達系統(tǒng)的優(yōu)化,實驗發(fā)現(xiàn)表達宿主 BL 21(DE3)pLySs效果更佳,BL21(DE3)PlySs是在BL21(DE3)基礎上,附帶了T7溶菌酶基因,可更嚴謹控制T7聚合酶的表達.因此,在后續(xù)的蛋白表達中,選擇BL 21(DE3)pLySs作為rSEP融合蛋白的表達宿主菌.在此基礎上,本研究進一步對誘導時間、IPTG濃度、溫度、以及Zn2+濃度進行優(yōu)化,最終獲得rSEP融合蛋白的最優(yōu)表達條件.通過多次驗證,均實現(xiàn)了對融合蛋白rSEP的高效可溶性表達.在對表達蛋白純化的研究中,本研究采用 Ni2+-NTASEPharose親和層析柱反復穿透上清液,并對洗脫緩沖液中咪唑濃度進行優(yōu)化探索,針對rSEP融合蛋白,采用200 mM的咪唑洗脫效果更好,最終獲得了純度較高的rSEP蛋白,實現(xiàn)了本研究的目的.
至此,本研究成功構建了金黃色葡萄球菌SEP腸毒素的重組表達載體pET-30a-SEP,對rSEP蛋白進行表達和純化,并獲得了純度較高的rSEP蛋白,為后續(xù)制備單抗、診斷試劑及SEP致病機制研究奠定了基礎.同時,本研究的優(yōu)化條件也可為其他葡萄球菌腸毒素蛋白的表達與純化提供借鑒.