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核仁小RNA在腫瘤發(fā)生發(fā)展中的研究進(jìn)展

2019-03-14 04:55:13劉琳付婷牟相成朱文靜
癌癥進(jìn)展 2019年16期
關(guān)鍵詞:核苷酸特異性標(biāo)志物

劉琳,付婷,牟相成,朱文靜#

1青島市婦女兒童醫(yī)院藥學(xué)部,山東 青島266000

2青島市市立醫(yī)院藥劑科,山東 青島266000

3東營市廣饒縣中醫(yī)院影像科,山東 東營257300

腫瘤將成為21世紀(jì)世界范圍內(nèi)人類疾病死亡的主要原因[1]。腫瘤是因維持細(xì)胞生長(zhǎng)和凋亡的蛋白質(zhì)編碼基因及非編碼基因的表達(dá)紊亂引起的。人類基因組中約含有25 000個(gè)具有編碼蛋白質(zhì)功能的基因,這些基因占基因組總序列的比例不超過2%,絕大部分DNA序列被轉(zhuǎn)錄為不具有編碼蛋白質(zhì)功能的RNA,即非編碼RNA(non-coding RNA,ncRNA),根據(jù)片段的長(zhǎng)度可分為小分子ncRNA和長(zhǎng)鏈ncRNA,其比編碼蛋白質(zhì)的基因更加復(fù)雜[2-6]。ncRNA包括微小RNA(microRNA,miRNA)、核仁小RNA(small nucleolar RNA,snoRNA)、干擾小RNA(small interfering RNA,siRNA)、pi蛋白結(jié)合RNA(piwi-interacting RNA,piRNA)、小卡哈爾體特異性RNA(small Cajal body-specific RNA,scaRNA)、核小RNA(small nuclear RNA,sn-RNA)。研究表明,人類腫瘤的miRNA表達(dá)譜已經(jīng)用于腫瘤的診斷、治療以及預(yù)后評(píng)估[7-10]。snoRNA是一類長(zhǎng)度為60~300個(gè)核苷酸的小分子ncRNA,具有保守的結(jié)構(gòu)元件,在核糖體RNA(ribosomal RNA,rRNA)前體的剪接加工和轉(zhuǎn)錄后修飾過程中起重要作用[11-14]。研究表明,部分小分子ncRNA與腫瘤的發(fā)生、發(fā)展密切相關(guān),尤其是snoRNA的異常表達(dá)直接影響著腫瘤的發(fā)生、發(fā)展及預(yù)后[1,15-17]。

1 snoRNA的結(jié)構(gòu)與功能

snoRNA位于真核生物細(xì)胞的核仁中,根據(jù)snoRNA保守的結(jié)構(gòu)元件將其分為C/D box snoRNA和H/ACA box snoRNA兩類,常與組蛋白形成snoRNP而發(fā)揮作用[12-13],主要功能是指導(dǎo)rRNA的修飾、加工和折疊過程。常見的snoRNA主要有三類:C/D box snoRNA、H/ACAbox snoRNA和scaRNA[13]。

C/D box snoRNA包含兩個(gè)短的序列元件,即位于 5'端的C box(5'PuUGAUGA3')和3'端的D box(5'CUGA3'),其內(nèi)部含有類似于C box和D box的結(jié)構(gòu),分別稱為box C'和box D',兩端有4~6個(gè)核苷酸的反向重復(fù)序列,通過堿基互補(bǔ)配對(duì)形成單個(gè)發(fā)夾結(jié)構(gòu)。C/D box snoRNA在rRNA前體的剪接加工過程中起重要作用,其引導(dǎo)序列長(zhǎng)度為10~21個(gè)核苷酸的rRNA的折疊,并且在一些情況下,snoRNA可增強(qiáng)甲基化rRNA的甲基化修飾[18]。C/D box snoRNA主要通過堿基互補(bǔ)作用行使功能,參與指導(dǎo)rRNA上特定位點(diǎn)的2'-O-核糖甲基化修飾[19-20]。而構(gòu)成C/D box snoRNP的其他蛋白質(zhì)組分如Nop56、Nop58和Snu13(在人類中為15.5K),使前體rRNA與鄰近box D/D'的snoRNA更容易發(fā)生堿基配對(duì)。

H/ACA box snoRNA具有“發(fā)夾-鉸鏈-發(fā)夾-尾部”的典型二級(jí)結(jié)構(gòu),絞鏈區(qū)和尾部分別具有H box(ANANNA)和ACA box保守序列元件,ACA box通常位于3'末端上游3個(gè)核苷酸處。大多數(shù)H/ACA box snoRNA指導(dǎo)真核生物rRNA和snRNA中特定位點(diǎn)的假尿嘧啶化修飾,即指導(dǎo)RNA分子由尿嘧啶向假尿嘧啶進(jìn)行轉(zhuǎn)換[13,20]。由于H box(5'-ANNA-3')和ACA box的存在,H/ACA box snoRNA可以形成雙發(fā)夾結(jié)構(gòu)。H/ACA box snoRNA與前體rRNA的堿基配對(duì)發(fā)生在雙發(fā)夾內(nèi)部的“假尿苷化口袋”中,與靶向的尿苷發(fā)生非堿基配對(duì),因此,可通過假尿苷合成酶Cbf5進(jìn)行異構(gòu)化。構(gòu)成H/ACA box snoRNP的其他成分如Nop10、Nhp2和Gar1,主要發(fā)揮穩(wěn)定三級(jí)折疊結(jié)構(gòu)的功能,確保靶RNA在Cbf5活性位點(diǎn)的精確定位[21]。此外,scaRNA是snoRNA的一個(gè)特定子集,其在哈爾卡體內(nèi)積累,并指導(dǎo)剪接體RNA的轉(zhuǎn)錄后修飾[22]。

2 snoRNA的組織特異性表達(dá)

不同類型的snoRNA在不同組織中的表達(dá)水平不同,C/D box snoRNA和H/ACA box snoRNA在不同組織中的表達(dá)水平亦不同[17,23-25]。通過分析11種人類組織中全基因組snoRNA的表達(dá)水平發(fā)現(xiàn),同一類型的snoRNA在下丘腦、睪丸、脾臟組織中的表達(dá)水平存在差異[24]。而且,部分snoRNA如腦特異性表達(dá)的snoRNA(brain-specific snoRNA,bsnoRNA)]廣泛表達(dá)于大腦組織中[23,26],且這些bsnoRNA不參與rRNA或snRNA的修飾,它們可能參與信使RNA(messenger RNA,mRNA)亞基的剪切[27]。例如,腦特異性C/D box snoRNA HBⅡ-52與5-羥色胺2C受體mRNA的關(guān)鍵區(qū)段具有18個(gè)互補(bǔ)的保守核苷酸序列,指示了腦特異性C/D box snoRNA在該mRNA加工過程中的潛在作用[25]。

3 snoRNA宿主基因的異常表達(dá)與腫瘤的關(guān)系

在哺乳動(dòng)物中,大部分snoRNA位于蛋白質(zhì)編碼或非蛋白質(zhì)編碼基因的內(nèi)含子中,而這些基因稱為snoRNA的宿主基因[28]。隨著對(duì)snoRNA研究的不斷深入,發(fā)現(xiàn)snoRNA通過影響其宿主基因的表達(dá)從而影響腫瘤的發(fā)生、發(fā)展和預(yù)后[16]。C/D box snoRNA的主基因ZFAS1是乳腺發(fā)育的調(diào)控因子,也是乳腺癌的潛在標(biāo)志物[29]。snoRNA的主基因生長(zhǎng)抑制特異性基因5(growth arrest specific 5,GAS5)在乳腺癌組織中的轉(zhuǎn)錄水平低于正常乳腺上皮組織,表明GAS5參與乳腺癌的發(fā)生、發(fā)展過程[30-31]。GAS在乳腺癌和頭頸部鱗狀細(xì)胞癌中發(fā)揮著抑癌基因的作用,其表達(dá)水平的降低與乳腺癌和頭頸部鱗狀細(xì)胞癌患者的預(yù)后不良有關(guān),而且位于其內(nèi)含子中的snoRNARNU44也與患者的預(yù)后有一定的關(guān)系[32]。snoRNA的主基因SNHG1和SNHG16的高表達(dá)可以促進(jìn)肝癌和結(jié)直腸癌的發(fā)生、發(fā)展[33-34]。其中,SNHG1的表達(dá)與骨肉瘤、結(jié)直腸癌、肝細(xì)胞癌、非小細(xì)胞肺癌、食管癌、卵巢癌、神經(jīng)膠質(zhì)瘤和胃癌患者的總生存期均有關(guān)[35]。另外,SNHG1在多種腫瘤的診斷中具有重要的意義[36-37]。

4 snoRNA作為腫瘤標(biāo)志物和腫瘤治療的靶點(diǎn)

部分snoRNA可以作為腫瘤標(biāo)志物,不僅能夠通過影響其主基因的表達(dá)從而影響腫瘤的發(fā)生、發(fā)展,還會(huì)影響腫瘤患者的預(yù)后;另外,snoRNA亦可以作為腫瘤患者治療的新靶點(diǎn)。snoRNA是篩查早期結(jié)直腸癌的生物標(biāo)志物,SNORA21和SNORA42可促進(jìn)結(jié)直腸癌的發(fā)生、發(fā)展,并且可以作為預(yù)測(cè)結(jié)直腸癌預(yù)后的生物標(biāo)志物[38-40]。沉默SNORA74B基因可以提高PHLPP基因的表達(dá)水平,阻斷蛋白激酶B(protein kinase B,PKB,又稱AKT)/雷帕霉素靶蛋白(mechanistic target of rapamycin,MTOR)信號(hào)通路,從而抑制胃癌的發(fā)生、發(fā)展,提示SNORA74B可能成為胃癌治療的新靶點(diǎn)[41]。有研究發(fā)現(xiàn),上調(diào)SNORD47的表達(dá)不但能夠抑制膠質(zhì)瘤細(xì)胞的增殖,誘導(dǎo)細(xì)胞阻滯于G2期,從而抑制膠質(zhì)瘤細(xì)胞的侵襲和上皮-間充質(zhì)轉(zhuǎn)化過程,還能夠增強(qiáng)替莫唑胺的抗腫瘤作用[42]。另外,snoRNA還可通過影響細(xì)胞周期、細(xì)胞凋亡及上皮-間充質(zhì)轉(zhuǎn)化過程從而影響腫瘤的發(fā)生、發(fā)展。在非小細(xì)胞肺癌中,抑制SNORD78的表達(dá)可以誘導(dǎo)細(xì)胞周期停滯在G0/G1期,從而抑制非小細(xì)胞肺癌細(xì)胞的增殖。此外,SNORD78還可通過誘導(dǎo)上皮-間充質(zhì)轉(zhuǎn)化的發(fā)生從而促進(jìn)非小細(xì)胞肺癌細(xì)胞的侵襲。SNORD78在腫瘤干細(xì)胞樣細(xì)胞中的表達(dá)也明顯上調(diào),是非小細(xì)胞肺癌自我更新的必需環(huán)節(jié)[43]。有研究發(fā)現(xiàn),SNORA42的表達(dá)與非小細(xì)胞肺癌患者的生存情況呈負(fù)相關(guān)(P<0.05),且與CD133-對(duì)應(yīng)物相比,SNORA42在CD133+的非小細(xì)胞肺癌細(xì)胞中的表達(dá)水平較高;敲除SNORA42降低了體外腫瘤起始細(xì)胞的增殖和自我更新能力,但SNORA42在非腫瘤起始細(xì)胞中的高表達(dá)卻可以增強(qiáng)細(xì)胞的增殖和自我更新能力[44],提示snoRNA能夠通過影響腫瘤細(xì)胞的干性從而影響腫瘤的發(fā)生、發(fā)展。

綜上所述,snoRNA的異常表達(dá)與腫瘤的發(fā)生、發(fā)展密切相關(guān),其在腫瘤的早期診斷、腫瘤治療方案的優(yōu)化、患者預(yù)后的判斷等方面具有重要的指導(dǎo)意義。另外,snoRNA的特征使其成為腫瘤治療的理想靶點(diǎn),例如,通過介導(dǎo)snoRNA所在區(qū)域的基因轉(zhuǎn)錄從而引起snoRNA沉默的途徑可能具有良好的腫瘤治療效果,其通過選擇性地沉默致癌的snoRNA從而抑制腫瘤的發(fā)生、發(fā)展,在腫瘤治療中已經(jīng)得到了應(yīng)用;但是,其發(fā)揮致癌或抑癌作用的具體分子機(jī)制尚不十分明確,仍需進(jìn)一步研究。

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