張伊茗,張 雪,顏天華
中國(guó)藥科大學(xué) 基礎(chǔ)醫(yī)學(xué)與臨床藥學(xué)學(xué)院生理教研室,南京 210009
心肌肥厚是心臟在壓力、容量等變化下為了維持原有灌注功能而形成的一種狀態(tài)[1],病理性心肌肥大伴隨著一系列不良心血管事件發(fā)生,包括心律失常、心力衰竭等[2]。
心室肥大與胎兒基因的再激活有關(guān),包括心鈉肽(atrial natriuretic peptide,ANP)、腦鈉肽 (brain natriuretic peptide,BNP)和 β-肌球蛋白重鏈(β-myosin heavy chain,β-MHC),以及成人心臟中肌漿網(wǎng)Ca2+-ATP酶 (sarcoplasmic reticulum Ca2+-ATPase,SERCA2a)和 α-肌球蛋白重鏈(α-myosin heavy chain,α-MHC)基因的抑制[3]。研究顯示,染色質(zhì)重塑和組蛋白修飾在心肌發(fā)育和心臟疾病的發(fā)生過(guò)程中發(fā)揮重要作用;而LncRNAs可能參與該過(guò)程,并且在心臟病理性肥大中發(fā)揮著重要作用[4,5]。
哺乳動(dòng)物的基因中三分之二轉(zhuǎn)錄為RNA,但編碼蛋白質(zhì)的基因比例僅為1.5%[6]。各種不翻譯成蛋白質(zhì)的RNA轉(zhuǎn)錄物稱為非編碼RNA(ncRNAs),其中大部分為含有超過(guò) 200個(gè)核苷酸的RNA轉(zhuǎn)錄物,稱為長(zhǎng)鏈非編碼RNA(long noncoding RNAs,LncRNAs)。LncRNAs 和 微 小 RNA (microRNAs,miRNAs)是 ncRNAs的兩種重要類型。許多 miRNAs被證實(shí)在心肌肥厚過(guò)程中起關(guān)鍵作用,如miR-1、miR-133和miR-214等。LncRNAs可以折疊成熱力學(xué)穩(wěn)定的二級(jí)結(jié)構(gòu),如雙螺旋、發(fā)夾環(huán)、凸起和假結(jié),這使它們能夠和DNA、RNA、蛋白質(zhì)等生物大分子發(fā)生更為復(fù)雜的相互作用[7]。LncRNAs可以作為信號(hào)符號(hào)、蛋白質(zhì)誘餌、指導(dǎo)物和支架模塊,因此它參與了細(xì)胞內(nèi)大部分反應(yīng)和諸多信號(hào)通路的調(diào)控[6,8,9]。
LncRNAs廣泛參與染色質(zhì)重塑 (chromatin remodeling)過(guò)程,包括核小體轉(zhuǎn)位、重組及穩(wěn)定性降低等改變。例如,LncRNAs HOTAIR (HOX transcript antisense RNA,HOTAIR) 及 LncRNA Xist(X-inactive specific transcriptional gene,Xist)能夠分別募集多梳抑制復(fù)合物2(Polycomb repressive complex,PRC2)到 HOXD 基因簇、X 染色體,從而使組蛋白H3的賴氨酸27殘基三甲基化(H3K27me3),以致誘導(dǎo)異染色質(zhì)形成,抑制基因表達(dá)[9]。
LncRNAs直接與DNA結(jié)合形成三螺旋結(jié)構(gòu)抑制基因表達(dá)。除此之外,LncRNAs可以調(diào)節(jié)RNA聚合酶Ⅱ的活性,包括通過(guò)與RNA聚合酶Ⅱ或者起始復(fù)合物的相互作用影響DNA的轉(zhuǎn)錄[10,11]。LncRNAs也充當(dāng)調(diào)節(jié)轉(zhuǎn)錄因子活性的輔因子,例如,在小鼠中,LncRNA Evf2由超保守的遠(yuǎn)端增強(qiáng)子轉(zhuǎn)錄,并募集轉(zhuǎn)錄因子D1X2與該增強(qiáng)子的結(jié)合和作用,以誘導(dǎo)相鄰蛋白質(zhì)編碼基因的表達(dá)[12]。
關(guān)于LncRNAs如何參與基因轉(zhuǎn)錄后的調(diào)控,目前存在一種競(jìng)爭(zhēng)性內(nèi)源 RNA(competing endogenous RNAs,ceRNA)的假說(shuō)[13],即多種RNA可與同種miRNA上的miRNA反應(yīng)元件(microRNA response element,MRE)結(jié)合。若 LncRNAs 和mRNAs存在相同的MRE時(shí),LncRNAs可以競(jìng)爭(zhēng)性的結(jié)合miRNAs,間接調(diào)控mRNAs的表達(dá)水平。大多數(shù)哺乳動(dòng)物基因表達(dá)反義轉(zhuǎn)錄本,這可能構(gòu)成一類特別適合調(diào)節(jié)mRNAs動(dòng)態(tài)的 ncRNAs[14]。
LncRNA Chaer(cardiac-hypertrophy-associated epigenetic regulator,Chaer)是一種心臟肥大相關(guān)的表觀遺傳調(diào)節(jié)因子,其表達(dá)主要局限于心臟[15]。在壓力刺激誘導(dǎo)下,LncRNA Chaer和PRC2與催化亞基EZH2結(jié)合,阻礙了心肌肥厚相關(guān)基因啟動(dòng)子區(qū)域上的H3K27me3,而對(duì)其他組蛋白沒(méi)有影響[16]。與此同時(shí),上述壓力刺激下發(fā)生的LncRNA Chaer和PRC2間相互作用與雷帕霉素受體蛋白(mechanistic target of rapamycin,mTOR)的激活有關(guān)[17]。
心臟肥大相關(guān)轉(zhuǎn)錄物 (cardiac hypertrophy-associated transcript,Chast)是一種促肥大的 LncRNA,它抑制基因自噬調(diào)節(jié)因子含Pleckstrin同源結(jié)構(gòu)域M蛋白家族成員1(Pleckstrin homology domain-containing family M member 1,Plekhm1)的表達(dá),從而阻礙心肌細(xì)胞自噬,誘發(fā)心肌肥厚。Chast的表達(dá)部分由活化T細(xì)胞核因子(nuclear factor of activated T-cells,NFAT)誘導(dǎo)[18]。此外,Chast與 Wnt信號(hào)通路相關(guān),而Wnt信號(hào)通路的激活能夠驅(qū)動(dòng)心肌肥厚[19]。
LncRNA Braveheart(Bvht)對(duì)心血管譜系規(guī)范至關(guān)重要;通過(guò)富含G的基序,Bvht與細(xì)胞核酸結(jié)合蛋白 (cellular nucleic acid-binding protein,CNBP)相互作用,促進(jìn)小鼠胚胎干細(xì)胞的心臟分化[20]。Bvht在促進(jìn)心臟發(fā)育的心臟基因表達(dá)程序和之后的組織重塑中起著關(guān)鍵作用[21]。中胚層后部1(Mesoderm posterior 1,MESP1)基因在心臟發(fā)育以及在上皮-間充質(zhì)轉(zhuǎn)化(epithelial-mesenchymal transition,EMT)過(guò)程中發(fā)揮作用,Bvht可能作為MESP1的上游調(diào)節(jié)因子參與心肌肥厚的調(diào)控。Bvht與PRC2的SUZ12亞基相互作用,導(dǎo)致MESP1啟動(dòng)子位置的SUZ12水平下調(diào),阻礙 H3K27me3,激活MESP1基因表達(dá),促進(jìn)心肌肥厚的進(jìn)展[22]。
心臟肥大相關(guān)因子 (cardiac hypertrophy-related factor,CHRF)與其他LncRNA不同,它是作為miRNA的內(nèi)源性“海綿體”促進(jìn)心肌肥厚。在橫向主動(dòng)脈收縮小鼠模型和心衰患者心臟樣本中,CHRF顯著增加。Wang K等[23]在細(xì)胞和動(dòng)物模型中發(fā)現(xiàn)miR-489通過(guò)抑制髓樣分化因子88(myeloid differentiation factor 88,Myd88)基因的表達(dá),抑制核因子 κB(nuclear factor-kappa B,NF-κB)通路激活,對(duì)抗心肌肥厚;此外,在血管緊張素Ⅱ (Ang-Ⅱ)誘導(dǎo)的心肌肥厚模型中,CHRF水平呈時(shí)間依賴性升高,并驗(yàn)證了CHRF降低miR-489的表達(dá)水平及活性。這些研究數(shù)據(jù)表明,CHRF結(jié)合miR-489促進(jìn)Myd88表達(dá),進(jìn)而激活NF-κB誘導(dǎo)心肌肥厚。
心肌梗死相關(guān)轉(zhuǎn)錄本 (myocardial infarction associated transcript,MIAT)在心肌肥厚過(guò)程中顯著增加。Zhu XH等[24]在小鼠模型和H9c2細(xì)胞中,發(fā)現(xiàn)MIAT siRNA抑制AngⅡ誘導(dǎo)的H9c2細(xì)胞中ANP、BNP和β-MHC的上調(diào),其機(jī)制可能是通過(guò)抑制miR-150促進(jìn)心肌肥厚的進(jìn)展。
肌球蛋白重鏈相關(guān)轉(zhuǎn)錄物 (myosin heavy chain associated RNA transcripts,Mhrts) 是心肌細(xì)胞核中的 ncRNAs,在心臟中特異性表達(dá)。多項(xiàng)研究證明,Mhrts是一種心肌保護(hù)因子。Brahma 相關(guān)基因 1(brahma-related gene1,Brg1)是一種染色質(zhì)重塑因子,由應(yīng)激激活,觸發(fā)異常基因表達(dá)和心肌病。心臟處于病理應(yīng)激條件下,Brg1激活,形成Brg1-Hdac-Parp復(fù)合物,其通過(guò)a1~a4啟動(dòng)子抑制Mhrt的表達(dá)。Brg1抑制肌球蛋白重鏈6(myosin heavy chain 6,Myh6)并激活肌球蛋白重鏈 7(myosin heavy chain 7,Myh7),導(dǎo)致 Myh6/7 表達(dá)的轉(zhuǎn)換,這是心肌病的病理特征之一[25]。在肥厚性、缺血性或特發(fā)性心肌病組織中,Mhrt分別減少 82.8%、72.8%和 65.9%[26]。Mhrt調(diào)節(jié)心臟肥大和病理性重塑通過(guò)與組蛋白乙?;蜃覤rg1的直接相互作用;Mhrt可以與Brg1的解旋酶結(jié)構(gòu)域結(jié)合,阻止Brg1識(shí)別靶基因,防止染色質(zhì)重塑[27]。Han P等[26]研究發(fā)現(xiàn),在橫向主動(dòng)脈縮窄 (TAC)模型中,Mhrt水平下調(diào)46%~68%,但是在TAC開(kāi)始1~2周后誘導(dǎo)Mhrt779(具有779個(gè)核苷酸,最為豐富的Mhrt),8周內(nèi)心肌肥厚減少23%,同時(shí)射血分?jǐn)?shù)增加33%。
H19是一種非蛋白質(zhì)編碼印跡和母系表達(dá)的LncRNA,分布于細(xì)胞質(zhì)和細(xì)胞核中,主要在成人的骨骼肌和心臟中表達(dá)[28]。近年研究發(fā)現(xiàn),H19對(duì)心肌肥厚、心力衰竭等心臟疾病具有調(diào)節(jié)作用[29]。Liu L等[30]用腎上腺素處理心肌細(xì)胞發(fā)現(xiàn),使用腺病毒過(guò)表達(dá)H19,心肌細(xì)胞的肥大被抑制;經(jīng)siRNAH19處理后,心肌細(xì)胞增大。H19可能充當(dāng)miR-675的前體在心肌肥厚的過(guò)程中發(fā)揮作用。鈣/鈣調(diào)蛋白依賴性蛋白激酶Ⅱ型 δ鏈 (calcium/calmodulin-dependent protein kinase typeⅡ delta chain,CaMKⅡδ)是一種主要存在于心臟中的多功能絲氨酸/蘇氨酸蛋白激酶,可以磷酸化離子通道、轉(zhuǎn)錄因子、信號(hào)分子和其他對(duì)心臟電活動(dòng)和結(jié)構(gòu)至關(guān)重要的膜蛋白[31,32]。CaMKⅡδ可作為心臟肥大的誘導(dǎo)因子[33]。研究證明,CaMKⅡδ是心肌細(xì)胞中miR-675的直接靶標(biāo),miR-675下調(diào)CaMKⅡδmRNA和蛋白質(zhì)水平[30]。因此,H19可能通過(guò)miR-675調(diào)節(jié)CaMKⅡδ抑制心肌細(xì)胞肥大。
Bernhard Herrmann所領(lǐng)團(tuán)隊(duì)將出現(xiàn)在心臟和腹側(cè)體壁祖細(xì)胞中的一種LncRNA命名為FOXF1相鄰的非編碼發(fā)育調(diào)節(jié) RNA(FOXF1 adjacent non-coding developmental regulatory RNA,F(xiàn)endrr)。研究發(fā)現(xiàn),小鼠體內(nèi) Fendrr下調(diào),會(huì)導(dǎo)致心臟和腹側(cè)體壁產(chǎn)生畸形。Fendrr在體內(nèi)可與PRC2和TrxG家族的混合譜系白血病組蛋白修飾復(fù)合物 (mixed lineage leukemia,MLL)結(jié)合,增加 H3K27me3,抑制肥大基因表達(dá)[34]。
磷脂爬行酶 4(phospholipid scramblase 4,Plscr4)是磷脂爬行酶基因家族的一員,編碼一組Ca2+依賴的多棕櫚?;蛐湍さ鞍住v L等[35]發(fā)現(xiàn),LncRNA Plscr4過(guò)表達(dá)減弱了AngⅡ和TAC誘導(dǎo)的心肌細(xì)胞肥大;相反,抑制Plscr4誘導(dǎo)心肌細(xì)胞肥大。體內(nèi)外實(shí)驗(yàn)證實(shí),Plscr4過(guò)表達(dá)可下調(diào)miR-214,促進(jìn)線粒體融合蛋白-2(mitofusin-2,Mfn2)表達(dá),減弱心肌肥厚。
綜上所述,LncRNAs通過(guò)多個(gè)環(huán)節(jié)參與心肌肥厚的調(diào)控,有望成為臨床干預(yù)和治療的新靶點(diǎn);但是還有諸多問(wèn)題需要思考和改善。例如,Chaer抑制劑的潛在臨床應(yīng)用仍然具有挑戰(zhàn)性。通過(guò)化學(xué)修飾的siRNA實(shí)現(xiàn)了該轉(zhuǎn)錄物的沉默,但是這種影響似乎只持續(xù)了很短的一段時(shí)間。并且LncRNAs的介入治療也需要充分考慮病理應(yīng)激發(fā)作的關(guān)鍵時(shí)間窗口。同時(shí)LncRNAs、miRNAs調(diào)節(jié)網(wǎng)絡(luò)錯(cuò)綜復(fù)雜,更精準(zhǔn)的作用機(jī)制及通路尚待進(jìn)一步探究。