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SUMO化修飾融合蛋白表達(dá)系統(tǒng)研究進(jìn)展

2020-01-07 15:10唐楚煜張耀方王英超陳曦王博張欣瑤
生物化工 2020年4期
關(guān)鍵詞:殘基泛素底物

唐楚煜,張耀方,王英超,陳曦,王博,張欣瑤

(天津農(nóng)學(xué)院基礎(chǔ)科學(xué)學(xué)院,天津 300384)

小泛素相關(guān)修飾物(SUMO)廣泛分布于真核生物細(xì)胞內(nèi),是一類(lèi)大小約15 kD的高度保守小蛋白,其結(jié)構(gòu)和反應(yīng)方式與泛素相似,但卻具有不同的功能[1]。SUMO化修飾可以保持融合蛋白基因的穩(wěn)定性,使多肽正常折疊,提高融合蛋白的可溶性[2]。SUMO化修飾和去修飾是一個(gè)可逆過(guò)程,在這個(gè)過(guò)程中,SUMO酶扮演著重要的角色。SUMO酶可以高效地將SUMO從融合蛋白上切除且不殘留氨基酸殘基[3]。因此,SUMO常常作為融合基因促進(jìn)外源蛋白的表達(dá)。

1 SUMO的結(jié)構(gòu)及SUMO化修飾的功能

1.1 SUMO的結(jié)構(gòu)

SUMOs是一類(lèi)高度保守的蛋白質(zhì)家族,為大多數(shù)真核細(xì)胞生存所必需,SMT3是該家族于研究中發(fā)現(xiàn)的第一個(gè)成員。SUMO由大約100個(gè)氨基酸殘基組成,是一類(lèi)廣泛存在于真核生物中具序列高度保守的低分子量蛋白[4]。SUMO主要通過(guò)對(duì)靶蛋白進(jìn)行共價(jià)修飾的方式來(lái)調(diào)節(jié)蛋白質(zhì)的結(jié)構(gòu)與功能。酵母只有1個(gè)SUMO基因,又稱(chēng)SMT3,人類(lèi)含有3種SUMO基因,分別為SUMO-1、SUMO-2、SUMO-3。在人類(lèi)SUMO家族中,SUMO-1與SUMO-2和SUMO-3有50%的序列同源性[5]。

1.2 SUMO化修飾過(guò)程

SUMO對(duì)蛋白的修飾主要在3種酶的參與下完成。(1)通過(guò)消耗ATP使SUMO的C-端Gly被腺苷化,在SUMO活化酶E1的作用下,腺苷化的SUMO通過(guò)硫酯鍵和E1上的Cys殘基相連并釋放出AMP。(2)活化之后的SUMO被轉(zhuǎn)移到SUMO連接酶E2上,形成SUMO-E2中間體。(3)在SUMO連接酶E3的催化下,SUMO-E2中間體上的SUMO被轉(zhuǎn)移到底物上[6]。

1.3 SUMO化修飾蛋白表達(dá)系統(tǒng)的優(yōu)勢(shì)

SUMO作為一種融合標(biāo)簽越來(lái)越多地應(yīng)用于表達(dá)系統(tǒng)中。使用SUMO化修飾蛋白表達(dá)系統(tǒng)有以下2點(diǎn)優(yōu)勢(shì)。(1)提高蛋白的可溶性,使用原核表達(dá)系統(tǒng)表達(dá)外源蛋白,由于蛋白含有二硫鍵,因此,常常因?yàn)殄e(cuò)誤折疊形成包涵體。SUMO作為融合標(biāo)簽,可以促進(jìn)外源蛋白的正確折疊,調(diào)節(jié)融合蛋白與其他蛋白之間的作用,提高融合蛋白的溶解性[7]。(2)提高蛋白的穩(wěn)定性:SUMO和泛素都能與底物蛋白的賴(lài)氨酸結(jié)合,因此,SUMO能與泛素競(jìng)爭(zhēng),抑制蛋白的降解,提高融合蛋白的穩(wěn)定性[2]。相比于其他傳統(tǒng)標(biāo)簽的應(yīng)用,SUMO還具有分子伴侶的功能,SUMO修飾蛋白的穩(wěn)定性、正確折疊和抗性都有提高。

2 SUMO蛋白酶的結(jié)構(gòu)和功能

2.1 SUMO蛋白酶的結(jié)構(gòu)

SUMO蛋白酶又稱(chēng)泛素樣蛋白加工酶(Ubiquitinlike protein-progressing enzymes,Ulps),是半胱氨酸蛋白酶超家族的成員之一。近年來(lái),科學(xué)家們?cè)诮湍钢邪l(fā)現(xiàn)兩種SUMO蛋白酶,在人類(lèi)中發(fā)現(xiàn)了7種SUMO特異性蛋白酶。酵母SUMO蛋白酶分別為Ulp1和Ulp2,由于Ulp1是最早被人們發(fā)現(xiàn)具有切割SUMO活性的SUMO蛋白酶,所以對(duì)于Ulp1的研究較為集中。Ulp1是位于核孔復(fù)合體中由621個(gè)氨基酸殘基組成的蛋白質(zhì)多肽,具有兩個(gè)結(jié)構(gòu)域,分別為C-端結(jié)構(gòu)域和N-端結(jié)構(gòu)域,前者具有催化活性而后者為非保守序列,因此具有定位和底物結(jié)合功能。Mossessova等人[8]發(fā)現(xiàn),SUMO蛋白酶的氨基酸即使序列有所差別,但在其C-末端都具有一段保守的約有200個(gè)氨基酸的Ulp結(jié)構(gòu)域,而此結(jié)構(gòu)域的存在也正是使SUMO蛋白酶具有催化活性的原因;不同SUMO蛋白酶的N-端因序列的不同而使蛋白酶的存在位置有所不同。

2.2 SUMO蛋白酶的生理功能

在真核生物體內(nèi),SUMO蛋白酶主要行使兩種生理功能:(1)將SUMO前體的C末端的-GG-ATY序列切割暴露出雙Gly殘基,使之成為成熟SUMO,執(zhí)行修飾和運(yùn)轉(zhuǎn)等功能;(2)去SUMO化過(guò)程,水解SUMO底物蛋白偶合物,使之成為SUMO和底物,SUMO與蛋白結(jié)合后,也可以被SUMO蛋白酶從靶蛋白上切除,這個(gè)過(guò)程稱(chēng)為蛋白的去SUMO化。SUMO對(duì)蛋白質(zhì)的修飾是一種可逆過(guò)程,在細(xì)胞的不同生命周期中,SUMO化和去SUMO化是處于變化之中的。實(shí)驗(yàn)發(fā)現(xiàn),在Ulp1保守C-端的404~621 aa活性片段中具有全長(zhǎng)的Ulp1酶切活性,能夠識(shí)別SUMO的三級(jí)結(jié)構(gòu),與其他蛋白酶作用不同的是,它在酶切后靶蛋白上不存在多余的氨基酸[9]。因此,可人工制備404~621 aa的活性片段用于SUMO化修飾蛋白的切割[10]。

3 結(jié)語(yǔ)

就SUMO蛋白酶的研究而言,雖然已經(jīng)取得很好的成績(jī),但其活性機(jī)制尚未研究透徹,結(jié)構(gòu)和各種調(diào)控功能還需要進(jìn)一步的研究。且與其他融合標(biāo)簽相比,SUMO融合蛋白表達(dá)還非常低,尚有待改善,其分離純化過(guò)程需要先分離純化SUMO融合蛋白,再使用SUMO蛋白酶切割后再進(jìn)行蛋白的分離純化。因此,在分離純化過(guò)程中會(huì)造成蛋白的損失,故距其規(guī)?;瘧?yīng)用還有一段距離。

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