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我國科學(xué)家完成大蒜基因組測序和組裝

2020-01-19 19:59
中國食品學(xué)報(bào) 2020年8期
關(guān)鍵詞:紫皮二水大蒜

近日, 中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院麻類研究所南方蛋白飼料植物資源開發(fā)與利用團(tuán)隊(duì)聯(lián)合有關(guān)高校和企業(yè),歷時(shí)4年完成了大蒜基因組的測序和組裝工作。 相關(guān)研究成果在線發(fā)表在《分子植物》上。

據(jù)課題組劉頭明研究員介紹, 大蒜是重要的蔬菜作物之一, 我國大蒜的年播種面積達(dá)到1000 萬畝以上。大蒜具有膨大的鱗莖,富含大蒜素,不僅可用作蔬菜和調(diào)味料食品,也被廣泛用于醫(yī)藥產(chǎn)業(yè)。 然而,栽培種大蒜一般不育,嚴(yán)重阻礙了大蒜生物學(xué)研究及大蒜育種工作。

大蒜基因組龐大且復(fù)雜,具有重復(fù)序列高、雜合度大等特點(diǎn)。 該研究發(fā)現(xiàn),基于對基因組系統(tǒng)進(jìn)化分析,大蒜與天門冬目石蒜科物種親緣關(guān)系最近,并推斷大蒜的3 次全基因組復(fù)制事件及重復(fù)序列急劇擴(kuò)張是驅(qū)動大蒜基因組龐大的根本原因。 大蒜素作為蔥屬作物中特有的化合物,該研究通過基因組擴(kuò)張收縮分析,結(jié)合轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù),確立了大蒜素生物合成通路。

據(jù)悉,此次完成測序的品種為二水早紫皮蒜,也就是俗稱的四川蒜。 劉頭明解釋,之所以將二水早紫皮蒜選為首個(gè)測序的品種,是因?yàn)樗m用性廣,在我國種植地域也最廣。

劉頭明表示,作為首個(gè)蔥屬物種中完成測序的基因組,大蒜基因組測序組裝工作的完成,對于研究物種進(jìn)化具有重要的意義。 該研究得到國家重點(diǎn)研發(fā)計(jì)劃項(xiàng)目、中國農(nóng)科院科技創(chuàng)新工程和國家自然科學(xué)基金項(xiàng)目資助。

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