李德利,丁鵬敏,劉雙月,楊秀偉,王如峰*
1.北京中醫(yī)藥大學(xué) 生命科學(xué)學(xué)院,北京 102488;2.北京大學(xué) 藥學(xué)院,北京 100083
腸道微生物是指一群生活在動物腸道內(nèi)的微生物群落,其體系龐大,種類和數(shù)量繁多,在進(jìn)化過程中一直維持著動態(tài)平衡。腸道微生物主要由厚壁菌門和擬桿菌門的種類組成,另有少量變形菌門、放線菌門、疣微菌門和梭桿菌門的種類[1]。腸道微生物動態(tài)平衡的維持是微生物之間、微生物與宿主之間相互作用的結(jié)果。已有研究表明,定植抗性是腸道內(nèi)部維持穩(wěn)態(tài)的關(guān)鍵[2]。作為不同的生物體系,微生物與微生物之間,以及微生物與人體之間的相互作用應(yīng)該通過分泌和接受化學(xué)介質(zhì)來實現(xiàn)。與高等生物一樣,腸道微生物也存在初生代謝和次生代謝,其代謝產(chǎn)物分泌到腸道中會對周圍的微生物產(chǎn)生影響,這應(yīng)該是實現(xiàn)微生物定植抗性的關(guān)鍵因素。通過分泌這些代謝產(chǎn)物,特別是具有生物活性的代謝產(chǎn)物,某種腸道微生物影響其他微生物的生存和發(fā)展,使自身在生存競爭中處于有利地位,這些活性代謝產(chǎn)物被人體吸收后也應(yīng)該對人體的健康產(chǎn)生影響。
有研究報道奇異變形桿菌Proteusmirabilis對病原菌如白色念珠菌Candidaalbicans和鰻弧菌Vibrioanguillarum具有較強(qiáng)抑制活性[3],從而有助于其生存并對其宿主有一定的保護(hù)作用。奇異變形桿菌屬于腸桿菌科的變形桿菌屬(Proteus),該屬主要包括普通變形桿菌P.vulgaris、奇異變形桿菌P.mirabilis、彭氏變形桿菌P.penneri、黏液變形桿菌P.myxofaciens、豪氏變形桿菌P.huuseri和3個未命名的基因種[4]。變形桿菌是腸道內(nèi)常見的條件致病菌,正常情況下與宿主共生,參與調(diào)節(jié)菌群穩(wěn)定,只在菌群紊亂時才具有致病性。在海洋動物的腸道中分離出的普通變形桿菌、奇異變形桿菌和彭氏變形桿菌體現(xiàn)出益生菌特性,這主要與細(xì)菌素的產(chǎn)生及其對致病菌的拮抗作用有關(guān)[5]。
既然腸道微生物可能通過分泌化學(xué)物質(zhì)對其周圍的微生物和宿主產(chǎn)生影響,這些化學(xué)物質(zhì)到底是什么?它們通過什么機(jī)制來實現(xiàn)?這些問題的答案可能是揭示腸道菌群與人體健康關(guān)系的金鑰匙。因此,開展腸道微生物的代謝產(chǎn)物研究,對于闡明腸道微生物與人體疾病發(fā)生機(jī)制和藥物作用機(jī)制相關(guān)性的物質(zhì)基礎(chǔ)具有重要意義。鑒于此,筆者以變形桿菌為例,開展了此類研究。
糞便樣品來源于健康成年志愿者。指示菌株為本實驗室凍存菌株:金黃色葡萄球菌Staphylococcusaureus、銅綠假單胞菌Pseudomonasaeruginosa、奇異變形桿菌Proteusmirabilis、肺炎克雷伯菌Klebsiellapneumoniae、大腸埃希菌Escherichiacoli、腸炎沙門氏菌Salmonellaenteritidis。
DNA-marker、細(xì)菌DNA提取試劑盒、PCR擴(kuò)增試劑盒購自博邁德科技發(fā)展有限公司;成套變形桿菌生化鑒定管購自青島海博生物技術(shù)有限公司;細(xì)菌通用引物由生工生物工程(上海)股份有限公司合成;培養(yǎng)基成分購自北京奧博星生物科技有限公司;化學(xué)試劑正丁醇、甲醇、乙酸乙酯、石油醚等購自北京化工廠;其他實驗耗材如牛津杯、96孔板、微孔濾膜等由北京蘭博利德商貿(mào)有限公司提供。
MLS-3780高壓滅菌鍋(日本Sanyo公司);JB-CJ-1500超凈工作臺(北京昌平長城空氣凈化設(shè)備有限公司);EPOCH全波長酶標(biāo)儀(美國伯騰儀器有限公司);PCR反應(yīng)擴(kuò)增儀(加拿大BBI公司);DK-8D型穩(wěn)壓溫流電泳儀(上海斯特分析儀器有限公司);恒溫振蕩培養(yǎng)箱(北京東聯(lián)哈爾儀器制造有限公司)。
營養(yǎng)肉湯培養(yǎng)基:牛肉膏3.0 g,蛋白胨10.0 g,NaCl 5.0 g,蒸餾水1000 mL,調(diào)節(jié)pH至7.2~7.4,121 ℃滅菌25 min。
營養(yǎng)瓊脂培養(yǎng)基:牛肉膏3.0 g,蛋白胨10.0 g,NaCl 5.0 g,瓊脂20.0 g,蒸餾水1000 mL,調(diào)節(jié)pH至7.2~7.4,121 ℃滅菌25 min。
改良高氏一號培養(yǎng)基:可溶性淀粉20.0 g,KNO31.0 g,K2HPO40.5 g,MgSO4·7H2O 0.5 g,NaCl 0.5 g,F(xiàn)eSO4·7H2O 0.01 g,瓊脂20.0 g,重鉻酸鉀50.0 mg,蒸餾水1000 mL,調(diào)節(jié)pH至7.2~7.4,121 ℃滅菌25 min。
發(fā)酵培養(yǎng)基:大豆蛋白胨10.0 g,蛋白胨2.0 g,葡萄糖20.0 g,可溶性淀粉5.0 g,酵母膏2.0 g,NaCl 4.0 g,K2HPO40.5 g,MgSO4·7H2O 0.5 g,CaCO32.0 g,蒸餾水1000 mL,調(diào)節(jié)pH至7.2~7.4,121 ℃滅菌25 min。
取志愿者糞便適量置于無菌0.9%氯化鈉溶液中,150 r·min-1振蕩1 h,使糞便充分分散,靜置,上清液即為混合菌液。采用梯度稀釋法將混合菌液稀釋至10-4、10-5、10-6、10-7,分別吸取各梯度稀釋液接種于改良高氏一號液體培養(yǎng)基中,37 ℃、150 r·min-1振蕩培養(yǎng)12~24 h,獲得混合菌群。將所得混合菌群用稀釋涂布法接種于營養(yǎng)瓊脂培養(yǎng)基中,待菌落長成后,用接種環(huán)挑取優(yōu)勢單菌落,劃線法接種于營養(yǎng)瓊脂培養(yǎng)基中。將長成的菌落進(jìn)一步純化,得到單菌株。
1.5.1樣品預(yù)處理 將純化得到的單菌株用營養(yǎng)肉湯培養(yǎng)基培養(yǎng)活化且培養(yǎng)至穩(wěn)定后,分別以2%的接種量接種于5 mL發(fā)酵培養(yǎng)基中,于37 ℃、150 r·min-1搖床培養(yǎng)3~7 d。吸取各單菌株發(fā)酵液,5000 r·min-1(離心半徑為6.60 cm)離心10 min,取上清液,經(jīng)0.22 μm無菌濾膜過濾后,于4 ℃保存。
1.5.2抗菌活性篩選 采用牛津杯法驗證發(fā)酵液活性:指示菌(金黃色葡萄球菌、銅綠假單胞菌、奇異變形桿菌、肺炎克雷伯菌、大腸埃希菌、腸炎沙門氏菌)菌液濃度分別調(diào)至1.5×108CFU·mL-1,吸取100 μL接種至固體培養(yǎng)基,表面放置牛津杯,管內(nèi)加150 μL待測樣品,以空白培養(yǎng)基為實驗對照組,每組設(shè)置3個重復(fù)。平皿37 ℃靜置8~16 h,通過觀察牛津杯周圍有無透明圈確定發(fā)酵液樣品有無抗菌活性,用直尺測量透明圈的直徑并記錄,結(jié)果取平均值。
1.6.1生理生化鑒定 參考文獻(xiàn)[6]變形桿菌的鑒定方法,采用成套變形桿菌生化鑒定管進(jìn)行鑒定。
1.6.216S rDNA鑒定 用細(xì)菌基因組DNA提取試劑盒提取菌液DNA,采用35 μL反應(yīng)體系進(jìn)行16S rDNA序列全長擴(kuò)增,所用引物為細(xì)菌通用引物(27F:5′ AGAGT TTGAT CCTGG CTCAG 3′;1492R:5′ TACGG YTACC TTGTT ACGAC TT 3′)。反應(yīng)體系:模板3 μL,上下游引物各1 μL,5×fast Pfu Buffer 7 μL,2.5 mol·L-1dNTP 3 μL,F(xiàn)astPfu DNA Polymerase 1 μL,ddH2O 19 μL。反應(yīng)條件:95 ℃預(yù)變性2 min,95 ℃變性1 min,51 ℃退火15 s,72 ℃延伸1 min,循環(huán)35次,72 ℃延伸5 min,反應(yīng)結(jié)束后于4 ℃保存。
PCR產(chǎn)物經(jīng)1%瓊脂糖凝膠電泳,觀察凝膠成像系統(tǒng)的擴(kuò)增效果并拍照,將擴(kuò)增成功的PCR產(chǎn)物送至生工生物工程(上海)股份有限公司進(jìn)行雙向測序。測序結(jié)果與GenBank中已知的核酸序列比對,從中選取同源性較高的序列,再用DNAMAN軟件比對,并用MEGA 5.0軟件構(gòu)建系統(tǒng)發(fā)育樹。
1.7.1活性物質(zhì)定位 取預(yù)處理后的發(fā)酵上清液和空白培養(yǎng)基,分別加至3 kD的超濾管中,以離心半徑6.60 cm、7000 r·min-1離心25 min,取下層濾液即為除蛋白后樣品和空白培養(yǎng)基。采用微量稀釋法,測定添加不同體積的樣品后對銅綠假單胞菌指示菌的生長抑制率。具體操作如下:用營養(yǎng)肉湯培養(yǎng)基將活化后的銅綠假單胞菌菌液調(diào)整濃度至1.5×107CFU·mL-1,取96孔板,分別加入20、30、40、50、60 μL待測樣品,對照組加同量的空白培養(yǎng)基,再加入菌液20 μL。用培養(yǎng)基補(bǔ)足體積至200 μL,每組設(shè)置4個重復(fù)孔。將96孔板置于微量振蕩器上振蕩幾分鐘以充分混勻,37 ℃培養(yǎng)8~12 h。培養(yǎng)結(jié)束后將孔板取出,用酶標(biāo)儀測定各組在600 nm處的吸光度值(A)。將實驗結(jié)果與相同條件下不除蛋白的發(fā)酵液和空白培養(yǎng)基的抑制率進(jìn)行比較,分析發(fā)酵液去除蛋白前后抗菌活性的變化。按公式(1)計算抑制率。
(1)
1.7.2活性物質(zhì)提取 采用有機(jī)溶劑萃取法提取發(fā)酵液中的活性物質(zhì),運用1.5.2中所述的牛津杯法比較不同極性溶劑(石油醚、乙酸乙酯、正丁醇)依次萃取和直接萃取得到的萃取相和萃余相活性,確定最佳提取溶劑。
1.7.3活性物質(zhì)純化與結(jié)構(gòu)鑒定 以銅綠假單胞菌為活性追蹤指示菌,運用大孔樹脂吸附柱色譜法、薄層色譜法、硅膠柱色譜法、凝膠柱色譜法和高效液相色譜法,對發(fā)酵液中的活性物質(zhì)進(jìn)行分離純化。利用質(zhì)譜技術(shù)、核磁共振技術(shù)對所得純化合物進(jìn)行結(jié)構(gòu)鑒定。
將各化合物用DMSO溶解后,加水稀釋至適宜濃度,以銅綠假單胞菌為指示菌,采用微量稀釋法測定化合物的最低抑菌濃度(MIC),96孔板內(nèi)化合物的終質(zhì)量濃度為500、250、125、……0.98 mg·L-1,DMSO的終質(zhì)量分?jǐn)?shù)為5% ,以無菌生長的最低濃度為單體化合物的MIC,實驗重復(fù)3次。
通過改良高氏一號培養(yǎng)基直接培養(yǎng)法縮減腸道微生物的種類,剔除了大部分對重鉻酸鉀敏感的腸道菌,最終從人源糞便中篩選得到1株具有廣譜抗菌活性的菌株,編號為HA-3151。該菌株發(fā)酵液能抑制金黃色葡萄球菌和銅綠假單胞菌的生長,在牛津杯周圍能看見清晰的透明圈,對金黃色葡萄球菌的抑菌圈直徑約為15.9 mm(見圖1,A、B),對銅綠假單胞菌的抑菌圈直徑約為16.4 mm(見圖1,C、D)。此外對奇異變形桿菌、肺炎克雷伯菌、大腸埃希菌、腸炎沙門氏菌的生長也有抑制作用,其抑菌圈直徑大小見表1。
注:A、B.金黃色葡萄球菌;C、D.銅綠假單胞菌。圖1 菌株HA-3151發(fā)酵液的抑菌圈展示圖
表1 菌株HA-3151對指示菌的抑菌結(jié)果
2.2.1生理生化鑒定 結(jié)合菌落形態(tài)和革蘭氏染色陰性結(jié)果,對菌株HA-3151的生理生化實驗結(jié)果(表2)進(jìn)行分析,初步判定HA-3151為腸桿菌科變形桿菌屬普通變形桿菌P.vulgaris。
表2 菌株HA-3151生理生化鑒定結(jié)果
注:+為陽性;-為陰性。
2.2.216S rDNA鑒定 PCR產(chǎn)物的1%瓊脂糖凝膠電泳成像結(jié)果見圖2,各樣品在1500 bp左右有明亮單一條帶,無雜帶污染。測序后發(fā)現(xiàn)其16S rDNA序列全長為1476 bp。
注:M. DNA Marker; 1~6. PCR產(chǎn)物。圖2 PCR產(chǎn)物的瓊脂糖凝膠電泳圖
通過與GenBank數(shù)據(jù)庫的同源性比較,結(jié)果顯示菌株HA-3151與變形桿菌屬同源性最高。根據(jù)Blast比對結(jié)果,下載了有文獻(xiàn)報道的變形桿菌屬的代表菌株序列,采用MEGA 5.0軟件進(jìn)行1000次相似重復(fù)度計算,構(gòu)建系統(tǒng)發(fā)育樹見圖3。從圖3可知,HA-3151與普通變形桿菌P.vulgaris聚在同一分支,可信度值為100。
圖3 菌株HA-3151的系統(tǒng)發(fā)育樹
2.3.1活性物質(zhì)定位 超濾法除去蛋白質(zhì)的發(fā)酵液與未除蛋白質(zhì)的發(fā)酵液對銅綠假單胞菌生長的抑制率見圖4,兩者差異無統(tǒng)計學(xué)意義。在加入體積為60 μL(終體積為200 μL)時,兩者都完全抑制銅綠假單胞菌的生長。
圖4 發(fā)酵液去除蛋白質(zhì)前后抑菌活性對比
2.3.2活性物質(zhì)提取 發(fā)酵液經(jīng)不同極性溶劑依次萃取和直接萃取后,各有機(jī)萃取相和萃余相的物質(zhì)活性用牛津杯法進(jìn)行檢測,結(jié)果見表3。直接用正丁醇萃取的正丁醇相的抑菌活性最好,且在萃余相中活性很弱,因此正丁醇是發(fā)酵液中活性物質(zhì)萃取的最佳溶劑,并通過增加萃取次數(shù)來減弱萃余相中的活性物質(zhì)殘余,提高萃取得率。
2.3.3活性物質(zhì)純化與結(jié)構(gòu)鑒定 從變形桿菌HA-3151發(fā)酵液中分離得到了13個化合物,包括有機(jī)酸類3個(D-3-苯基乳酸、丁香酸、3-甲氧基沒食子酸),二肽類4個[環(huán)(丙-苯丙)二肽、環(huán)(酪-酪)二肽、環(huán)(酪-亮)二肽、環(huán)(酪-異亮)二肽],黃酮類6個(黃豆黃苷、大豆苷、大豆苷元、染料木苷、5-甲氧基大豆苷元、染料木黃酮)。各化合物的結(jié)構(gòu)式見圖5,鑒定結(jié)果如下:
D-3-苯基乳酸(D-3-phenyllactic acid),白色結(jié)晶;[α]+19.80°;ESI-MSm/z165.056 2[M-H]-;1H-NMR(400 MHz,DMSO-d6):δ 7.23 (m,5H,H-Phe),4.13 (t,1H,J=3.6 Hz,H-2),2.95 (d,1H,J=13.6 Hz,H-3a),2.78 (dd,1H,J=13.6,8.4 Hz,H-3b);13C-NMR(100 MHz,DMSO-d6):δ 40.33 (C-3),71.25 (C-2),126.29 (C-7),128.15(C-5,9),129.58 (C-6, 8),138.35 (C-4),175.34 (COOH)。以上數(shù)據(jù)與文獻(xiàn)報道的D-3-苯基乳酸數(shù)據(jù)一致[7-8]。
丁香酸(syringic acid),無色結(jié)晶;ESI-MSm/z197.046 3[M-H]-;1H-NMR (400 MHz,MeOD-d4):δ 7.33 (s,2H,H-3,5),3.88 (s,6H,2OCH3);13C-NMR (100 MHz,MeOD-d4):δ 57.08 (OCH3),108.65 (C-3,5),122.20 (C-4),142.06 (C-2,6),149.14 (C-1),170.22 (COOH)。以上數(shù)據(jù)與文獻(xiàn)報道的丁香酸數(shù)據(jù)一致[9]。
3-甲氧基沒食子酸(3-methoxygallic acid),白色結(jié)晶;1H-NMR (400 MHz,DMSO-d6):δ 7.07 (s,1H,H-6),7.02 (s,1H,H-4),3.77 (s,3H,OCH3);13C-NMR (100 MHz,DMSO-d6):δ 56.00 (OCH3),104.96 (C-6),110.87 (C-4),120.67 (C-5),139.11 (C-2),145.35 (C-3),147.93 (C-1),167.58 (COOH)。以上數(shù)據(jù)與文獻(xiàn)報道的3-甲氧基沒食子酸數(shù)據(jù)一致[10]。
環(huán)(丙-苯丙)二肽[cyclo (L-Ala-L-Phe)],無定形粉末;[α]+10.00°;1H-NMR (400 MHz,MeOD-d4):δ 7.14-7.26 (m,5H,-Phe),4.22 (s,1H,H-5),3.42 (m,1H,H-3),3.00 (d,1H,J=14.0 Hz,H-8a),2.64 (d,1H,J=17.6 Hz,H-8b),0.51 (d,3H,J=6.4 Hz,CH3);13C-NMR (100 MHz,MeOD-d4):δ 21.10 (C-7),41.56 (C-6),45.35 (C-8),58.22 (C-3),129.16 (C-4),130.30 (C-11,13),132.18 (C-10,14),137.07 (C-9),169.37 (C-5),170.73 (C-2)。以上數(shù)據(jù)與文獻(xiàn)報道的環(huán)(丙-苯丙)二肽數(shù)據(jù)一致[11]。
環(huán)(酪-酪)二肽[cyclo (L-Tyr-L-Tyr)],無定形粉末;[α]+39.39°;ESI-MSm/z327.135 5[M+H]+;1H-NMR (400 MHz,DMSO-d6):δ 9.18 (s,2H,H-1),7.74 (s,2H,OH),6.83 (d,4H,J=7.6 Hz,H-2′,2″,6′,6″),6.66 (d,4H,J=7.6 Hz,H-3′,3″,5′,5″),3.84 (s,2H,H-3,6),2.52 (dd,2H,J=13.6,6.0 Hz,H-7,7′a),2.10 (dd,2H,J=13.6,6.0 Hz,H-7,7′b);13C-NMR (100 MHz,DMSO-d6):δ 38.8 (C-7,7′),56.22 (C-3,6),115.51 (C-2′,2″,6′,6″),127.03 (C-4′,4″),131.22 (C-1′,1″),156.55 (C-3′,3″,5′,5″),166.73 (C-2,5)。以上數(shù)據(jù)與文獻(xiàn)報道的環(huán)(酪-酪)二肽數(shù)據(jù)一致[12]。
表3 不同萃取方法活性對比 mm
注:—表示無抑菌圈。
環(huán)(酪-亮)二肽[cyclo (L-Tyr-L-Leu)],無定形粉末;[α]+10.00°;1H-NMR (400 MHz,MeOD-d4):δ 6.93 (d,2H,J=8.4 Hz,H-13,17),6.64 (d,2H,J=8.4 Hz,H-14,16),4.16 (s,2H,H-1,4),3.69 (dd,1H,J=10.0,4.0 Hz,H-6),3.13 (dd,1H,J=14.0,4.8 Hz,H-11a),2.76 (dd,1H,J=14.0,4.8 Hz,H-11b),1.37 (m,1H,H-8),0.82 (m,3H,CH3);13C-NMR (100 MHz,MeOD-d4):δ 21.67 (C-10),23.69 (C-9),24.98 (C-8),39.72 (C-11),45.55 (C-7),54.42 (C-6),57.93 (C-3),116.74 (C-14),127.33 (C-12),132.74 (C-13),133.07 (C-17),158.49 (C-15),169.44 (C-2),170.97 (C-5)。以上數(shù)據(jù)與文獻(xiàn)報道的環(huán)(酪-亮)二肽數(shù)據(jù)一致[13-14]。
環(huán)(酪-異亮)二肽[cyclo (L-Tyr-L-Ile)],無定形粉末;[α]-32.56°;1H-NMR (400 MHz,MeOD-d4):δ 6.93 (d,2H,J=8.4 Hz,H-13,17),6.69 (d,2H,J=8.4 Hz,H-14,16),4.26 (s,2H,H-1,4),3.70 (dd,1H,J=4.4,1.6 Hz,H-6),3.19 (dd,1H,J=14.0,4.4 Hz,H-11a),2.89 (dd,1H,J=14.0,4.4 Hz,H-11b),0.79~0.67 (m,6H,CH3);13C-NMR (100 MHz,MeOD-d4):δ 12.20 (C-10),15.66 (C-9),24.98 (C-8),39.20 (C-11),40.14 (C-7),57.70 (C-5),61.22 (C-2),116.59 (C-14,16),127.80 (C-12),132.93 (C-13,15),158.23 (C-15),169.64 (C-2,5)。以上數(shù)據(jù)與文獻(xiàn)報道的環(huán)(酪-異亮)二肽數(shù)據(jù)一致[15]。
黃豆黃苷(glycitin),白色粉末;1H-NMR (400 MHz,DMSO-d6):δ 8.38 (s,1H,H-2),7.48 (s,1H,H-5),7.33 (s,1H,H-8),7.41 (d,2H,J=7.6 Hz,H-2′,6′),6.81 (d,2H,J=7.6 Hz,H-3′,5′),5.19 (d,1H,J=4.0 Hz,H-1″),3.46 (m,1H,H-2″),3.48 (m,1H,H-3″),3.16 (m,1H,H-4″),3.46 (m,1H,H-5″),5.18 (d,1H,J=4.0 Hz,OH-1″),5.14 (d,1H,J=4.0 Hz,OH-2″),5.41 (d,1H,J=4.0 Hz,OH-3″),5.08 (d,1H,J=4.0 Hz,OH-4″),4.64 (m,1H,OH-6″),3.88 (s,3H,CH3),9.54 (s,1H,OH-4′);13C-NMR (100 MHz,DMSO-d6):δ 153.22 (C-2),123.31 (C-3),174.56 (C-4),104.91 (C-5),147.64 (C-6),151.72 (C-7),103.61 (C-8),151.40 (C-9),118.00 (C-10),122.77 (C-1′),130.25 (C-2′),115.16 (C-3′),157.37 (C-4′),115.16 (C-5′),130.2 (C-6′),99.79 (C-1″),73.20 (C-2″),76.94 (C-3″),69.76 (C-4″),77.39 (C-5″),60.81 (C-6″),56.01 (OCH3)。上述數(shù)據(jù)與文獻(xiàn)報道的黃豆黃苷一致[16]。
大豆苷(daidzin),白色粉末;1H-NMR (400 MHz,DMSO-d6):δ 9.55 (s,1H,OH-4′),8.39 (s,1H,H-2),8.05 (d,1H,J=9.2 Hz,H-1),7.41 (d,2H,J=7.6 Hz,H-2′,6′),7.23 (s,1H,H-8),7.14 (d,1H,J=8.8 Hz,H-6),6.81 (d,2H,J=8.0 Hz,H-3′,5′),5.18 (d,1H,J=4.0 Hz,OH-1″),5.14 (d,1H,J=4.0 Hz,OH-2″),5.41 (d,1H,J=4.0 Hz,OH-3″),5.08 (d,1H,J=4.0 Hz,OH-4″),4.64 (m,1H,OH-6″);13C-NMR (100 MHz,DMSO-d6):δ 60.82 (C-6″),69.80 (C-4″),73.31 (C-2″),76.66 (C-3″),77.39 (C-5″),100.16 (C-8),103.56 (C-1″),115.16 (C-3′,5′),115.76 (C-6),118.64 (C-10),122.49 (C-1′),123.88 (C-3),127.13 (C-5),130.26 (C-2′,6′),153.51 (C-2),157.21 (C-4′),157.44 (C-9),161.58 (C-7),174.92 (C-4)。以上數(shù)據(jù)與文獻(xiàn)報道的大豆苷數(shù)據(jù)[16]一致。
大豆苷元(daidzein),白色粉末;1H-NMR(400 MHz,DMSO-d6):δ 10.77 (s,1H,OH-7),9.53 (s,1H,OH-4′),8.27 (s,1H,H-2),7.95 (d,1H,J=8.4 Hz,H-5),7.37 (d,2H,J=8.4 Hz,H-2′,6′),6.92 (d,1H,J=8.8 Hz,H-6),6.85 (s,1H,H-8),6.80 (d,2H,J=8.4 Hz,H-3′,5′);13C-NMR (100 MHz,DMSO-d6):δ 102.57 (C-8),115.42 (C-3′,5′),115.59 (C-6),117.10 (C-10),123.01 (C-3),123.95 (C-1′),127.76 (C-5),130.54 (C-2′,6′),153.28 (C-2),157.64 (C-4′),157.90 (C-9),162.98 (C-7),175.16 (C-4)。以上數(shù)據(jù)與文獻(xiàn)報道的大豆苷元數(shù)據(jù)[16]一致。
染料木苷(genistin),白色粉末;1H-NMR (400 MHz,DMSO-d6):δ 12.93 (s,1H,OH-5),9.60 (s,1H,OH-4′),8.42 (s,1H,H-2),7.39 (d,2H,J=8.4 Hz,H-2′,6′),6.81 (d,2H,J=8.4 Hz,H-3′,5′),6.71 (s,1H,H-8),6.46 (s,1H,H-6),5.19 (d,1H,J=4.0 Hz,H-1″),3.46 (m,1H,H-2″),3.48 (m,1H,H-3″),3.16 (m,1H,H-4″),3.46 (m,1H,H-5″),5.18 (d,1H,J=4.0 Hz,OH-1″),5.14 (d,1H,J=4.0 Hz,OH-2″),5.41 (d,1H,J=4.0 Hz,OH-3″),5.08 (d,1H,J=4.0 Hz,OH-4″),4.64 (m,1H,OH-6″);13C-NMR (100 MHz,DMSO-d6):δ 60.81 (C-6″),69.77 (C-4″),73.26 (C-2″),76.59 (C-3″),77.38 (C-5″),94.71 (C-8),99.76 (C-1″),100.02 (C-6),106.27 (C-10),115.28 (C-3′,5′),121.18 (C-1′),122.74 (C-3),130.36 (C-2′,6′),154.79 (C-2),157.41 (C-4′),157.69 (C-9),161.82 (C-5),163.20 (C-7),180.70 (C-4)。以上數(shù)據(jù)與文獻(xiàn)報道的染料木苷數(shù)據(jù)[16]一致。
5-甲氧基大豆苷元(5-methoxydaidzein),淡黃色粉末;1H-NMR (400 MHz,DMSO-d6):δ 10.59 (s,1H,OH-7),9.52 (s,1H,OH-4′),8.29 (s,1H,H-2),7.44 (s,1H,H-5),7.39 (d,2H,J=8.4 Hz,H-2′,6′),6.95 (s,1H,H-8),6.81 (d,2H,J=8.4 Hz,H-3′,5′),3.89 (s,3H,CH3);13C-NMR (100 MHz,DMSO-d6):δ 56.01 (OCH3),103.00 (C-8),104.89 (C-6),115.12 (C-3′,5′),115.13 (C-10),122.96 (C-3),123.13 (C-1′),130.24 (C-2′,6′),147.11 (C-4′),151.90 (C-7),152.68 (C-9),157.29 (C-5),174.50 (C-4)。以上數(shù)據(jù)與文獻(xiàn)報道的5-甲氧基大豆苷元數(shù)據(jù)一致[17]。
染料木黃酮(genistein),白色粉末;1H-NMR (400 MHz,DMSO-d6):δ 12.94 (s,1H,OH-5),9.57 (s,1H,OH-4′),8.31(s,1H,H-2),7.39(d,2H,J=8.4 Hz,H-2′,6′),6.81 (d,2H,J=8.4 Hz,H-3′,5′),6.37 (s,1H,OH-8),6.21 (s,1H,OH-6);13C-NMR (100 MHz,DMSO-d6):δ 93.85 (C-8),99.15 (C-6),104.64 (C-10),115.24 (C-3′,5′),121.39 (C-1′),122.46 (C-3),130.34 (C-2′,6′),154.17 (C-2),157.60 (C-4′),157.77 (C-9),162.18 (C-5),164.47 (C-5),180.40 (C-4)。以上數(shù)據(jù)與文獻(xiàn)報道的染料木黃酮數(shù)據(jù)[16]一致。
圖5 從普通變形桿菌HA-3151發(fā)酵液分離的化合物的結(jié)構(gòu)式
經(jīng)微量稀釋法測定各化合物對銅綠假單胞菌的MIC結(jié)果見表4;其他化合物無抗菌活性。
表4 單體化合物抗銅綠假單胞菌實驗結(jié)果(n=3)
本研究從人源腸道菌群中得到1株能產(chǎn)生抗菌活性物質(zhì)的普通變形桿菌Proteusvulgaris菌株,并從其培養(yǎng)液中分離純化了一系列具有抗菌活性的有機(jī)酸、黃酮和二肽類化合物。這是普通變形桿菌代謝產(chǎn)物具有抗菌活性的首次報道,也是腸道菌通過分泌次生代謝產(chǎn)物產(chǎn)生定植優(yōu)勢進(jìn)而影響人體的有力證據(jù)。
根據(jù)我們的實驗結(jié)果,結(jié)合文獻(xiàn)報道,分離得到的這些代謝產(chǎn)物普遍具有抗菌活性。3-苯基乳酸和丁香酸最早發(fā)現(xiàn)于蜂蜜中,是其最主要的抗菌物質(zhì)[18]。3-苯基乳酸是天然存在的抗菌劑,對人和動物安全無毒,有望作為一種新型防腐劑運用于食品、醫(yī)藥及化妝品行業(yè)。目前報道3-苯基乳酸主要由乳酸桿菌屬菌株產(chǎn)生,它參與苯丙氨酸代謝途徑。由于乳酸脫氫酶的種類不同,生成的苯基乳酸構(gòu)型也不相同[19],D-苯基乳酸的抗菌活性大于L-苯基乳酸[20],本研究中變形桿菌HA-3151所產(chǎn)生的苯基乳酸即為D型。丁香酸為常見的藥用植物代謝產(chǎn)物,是白蒿的主要抗菌成分,對金黃色葡萄球菌、枯草芽孢桿菌、大腸桿菌均有抑制作用[21-22]。本研究證明環(huán)(丙-苯丙)二肽、環(huán)(酪-酪)二肽具有抗菌活性,另有文獻(xiàn)報道環(huán)(酪-亮)二肽對犬小孢菌有抑制作用(MIC為50 mg·L-1)[23],環(huán)(酪-異亮)二肽對多種海洋細(xì)菌有抑制作用(MIC為200 mg·L-1)[24]。黃酮類化合物的抗菌活性多有報道,本研究中分離得到的大豆苷元、染料木苷和染料木黃酮經(jīng)檢測有抗菌作用,推測這些成分均為普通變形桿菌的抗菌活性組成成分。
本研究確認(rèn)了普通變形桿菌通過分泌代謝產(chǎn)物對其他細(xì)菌的抑制作用,這證明腸道內(nèi)確實存在微生物間相互制衡的物質(zhì)基礎(chǔ)。這些抗菌活性代謝產(chǎn)物被人體吸收后會進(jìn)入血液循環(huán),對人體其他部位的感染疾病起到干預(yù)作用。然而,抗菌活性物質(zhì)只是腸道菌分泌的代謝產(chǎn)物的一部分,其他代謝產(chǎn)物包括活性物質(zhì)和毒性物質(zhì)也同樣會對人體健康產(chǎn)生有利或不利影響。越來越多的研究證實,腸道菌群的紊亂與疾病的發(fā)生發(fā)展密切相關(guān)[25-27],這是因為紊亂的菌群表現(xiàn)為有益菌減少,有害菌增多。我們認(rèn)為,菌群的結(jié)構(gòu)改變只是表象,而致病的根源應(yīng)該歸因于兩者分泌的化學(xué)介質(zhì)的差異。藥物通過調(diào)節(jié)菌群的結(jié)構(gòu)治療疾病也應(yīng)該是由于不同的菌群結(jié)構(gòu)釋放的化學(xué)介質(zhì)不同而造成的。因此,開展不同種類的腸道菌的代謝產(chǎn)物研究,應(yīng)該能為揭秘腸道菌群與人體健康的相關(guān)性問題提供科學(xué)依據(jù)。