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關(guān)于新型冠狀病毒命名的思考與建議

2020-05-06 09:01:57張冬梅姜世勃石正麗
中國(guó)科技術(shù)語(yǔ) 2020年2期
關(guān)鍵詞:命名肺炎病毒

張冬梅 姜世勃 石正麗

摘 要:2019年12月,一種由新型冠狀病毒(2019-nCoV)引起的病毒性肺炎開始在武漢暴發(fā)流行。2020年2月11日,世界衛(wèi)生組織(WHO)將新型冠狀病毒肺炎命名為COVID-19(冠狀病毒病2019),國(guó)際病毒分類學(xué)委員會(huì)(ICTV)的冠狀病毒研究小組(CSG)建議把新型冠狀病毒命名為SARS-CoV-2(嚴(yán)重急性呼吸綜合征冠狀病毒2),既沒有與疾病名稱一致,也沒有完全真實(shí)地顯示該病毒本身的特征,因而立即引發(fā)關(guān)注和爭(zhēng)議?;贑OVID-19的病原學(xué)、流行病學(xué)和臨床特征的基本信息,建議將新型冠狀病毒命名為“人類冠狀病毒2019”(human coronavirus 2019,簡(jiǎn)稱HCoV-19)。文章回顧并評(píng)價(jià)了CSG的命名方法,指出他們使用基于基因序列信息進(jìn)行病毒命名的方法并不合適,建議采用傳統(tǒng)的聯(lián)系疾病的病毒命名方法對(duì)具有明顯疾病特點(diǎn)的病毒如2019-nCoV進(jìn)行命名。

關(guān)鍵詞:冠狀病毒;肺炎;2019新型冠狀病毒;人類冠狀病毒2019;冠狀病毒病2019

引 言

2019年12月在武漢出現(xiàn)的不明原因肺炎造成了中國(guó)乃至世界的恐慌。2020年1月初,中國(guó)幾個(gè)研究小組相繼發(fā)現(xiàn)該肺炎為一個(gè)全新的B亞群β屬冠狀病毒(β-B CoV)感染所致[1-3]。2020年1月12日,世界衛(wèi)生組織(WHO)將該病毒臨時(shí)命名為“2019新型冠狀病毒”(2019-nCoV)。

2020年2月11日,WHO將新型冠狀病毒肺炎命名為“冠狀病毒病2019” (coronavirus disease 2019,COVID-19)。就在同一天,國(guó)際病毒分類學(xué)委員會(huì)(ICTV)的冠狀病毒研究小組(CSG)在bioRxiv預(yù)印本網(wǎng)站上公開的一篇文章中將2019-nCoV命名為“嚴(yán)重急性呼吸綜合征冠狀病毒2”(SARS-CoV-2),該文于2020年3月2日在Nature Microbiology 雜志上在線發(fā)表[4]。根據(jù)Science雜志2020年2月12日的報(bào)道,WHO并不接受這個(gè)名稱[5]。明尼蘇達(dá)大學(xué)傳染病研究與政策中心主任Mike Osterholm表示不會(huì)使用這個(gè)名稱,認(rèn)為這個(gè)名稱不準(zhǔn)確,它實(shí)際上把一種完全不同的疾病(SARS)和COVID-19混淆了[5]。在WHO的文件中仍然使用“COVID-19病毒(the COVID-19 virus)”或“可導(dǎo)致COVID-19的病毒(the virus responsible for COVID-19)”[6]。Nature雜志在2020年2月13日?qǐng)?bào)道了中國(guó)病毒學(xué)家對(duì)CSG將2019-nCoV 命名為SARS-CoV-2的關(guān)注[7]。針對(duì)SARS-CoV-2這個(gè)病毒名,中國(guó)病毒學(xué)界的學(xué)者并不認(rèn)可,認(rèn)為新型冠狀病毒應(yīng)該有一個(gè)自己獨(dú)立的名稱[8]。

眾所周知,不同知識(shí)背景、不同工作經(jīng)歷、不同視野、不同洞察力和擁有不同信息的人通常對(duì)相同的一件事?lián)碛胁煌挠^點(diǎn)。學(xué)術(shù)爭(zhēng)議和辯論非常有益,本文作者認(rèn)為新型冠狀病毒需要一個(gè)獨(dú)特的名字以取代SARS-CoV-2。為了充分討論這一議題,將首先回顧C(jī)OVID-19疫情的基本情況,中國(guó)在該領(lǐng)域的科技實(shí)力和突出成果,然后描述、分析和評(píng)價(jià)CSG采用的命名方法。

一 COVID-19疫情的基本情況和中國(guó)在該領(lǐng)域的突出成果

在這次針對(duì)COVID-19的戰(zhàn)疫中,中國(guó)科學(xué)家以創(chuàng)紀(jì)錄的速度取得研究進(jìn)展并及時(shí)與世界分享信息。2020年1月10日,復(fù)旦大學(xué)生物醫(yī)學(xué)研究院張永振教授領(lǐng)導(dǎo)的協(xié)作團(tuán)隊(duì)完成了2019-nCoV基因組序列的工作,并將該基因組序列信息首次在virological.org網(wǎng)站公布。幾小時(shí)后,美國(guó)國(guó)家健康研究院(NIH)下屬的國(guó)家過敏和傳染病研究所(NIAID)主任Anthony S. Fauci召開高級(jí)別會(huì)議啟動(dòng)針對(duì)2019-nCoV的疫苗研發(fā)工作,中國(guó)和美國(guó)的快速反應(yīng)均以前所未有的速度與病毒賽跑[9]。中國(guó)石正麗研究員、譚文杰研究員和張永振研究員等學(xué)者領(lǐng)導(dǎo)的團(tuán)隊(duì)第一時(shí)間分離出2019-nCoV病毒并進(jìn)行了多株病毒的全基因組測(cè)序[1-3]。

石正麗研究團(tuán)隊(duì)通過基因序列比對(duì),發(fā)現(xiàn)2019-nCoV與2002—2003年的SARS-CoV相似度僅為79.6%,與蝙蝠來(lái)源的SL-CoV RaTG13則有96%的相似度;2019-nCoV與SARS-CoV一樣均通過血管緊張素轉(zhuǎn)換酶2(ACE2)受體進(jìn)入人體細(xì)胞,兩者的受體結(jié)合域有較高的相似性,因而推測(cè)新型冠狀病毒的最初來(lái)源很可能為蝙蝠[2]。

2019-nCoV與SARS-CoV和MERS-CoV一樣,同屬于β冠狀病毒屬。冠狀病毒是一類有包膜RNA病毒,目前已鑒定出7種人類冠狀病毒(HCoVs),包括HCoV-229E、HCoV-HKU1、HCoV-OC43、HCoV-NL63、SARS-CoV、MERS-CoV和2019-nCoV[1-2]。2019-nCoV所屬的冠狀病毒家族可引發(fā)從輕微的感冒到致命性肺炎的一系列呼吸系統(tǒng)疾病。COVID-19已被WHO定性為全球大流行[6]?;趥鞑ニ俣瓤?、疾病程度嚴(yán)重和對(duì)全球經(jīng)濟(jì)影響巨大,COVID-19這一威脅屬于百年一遇[10]。截至北京時(shí)間2020年3月22日15∶17,全球共有185個(gè)國(guó)家(地區(qū))出現(xiàn)COVID-19確診病例,累計(jì)確診病例306 223人,累計(jì)死亡12 979人。其中,中國(guó)確診患者累計(jì)81 501人,累計(jì)死亡3 267人。(數(shù)字來(lái)自鳳凰衛(wèi)視官網(wǎng):https://news.ifeng.com/c/special/7tPlDSzDgVk。)

2018年,WHO第一次提出“X疾病”(由一個(gè)未知的病原體引起大流行的傳染?。┑母拍睿⒑粲醣M快研發(fā)防控X疾病的疫苗和藥物時(shí),姜世勃等人[11]認(rèn)為第一個(gè)X疾病很可能是來(lái)自于蝙蝠的冠狀病毒所引起的高致病性傳染病,并著手開始研發(fā)廣譜抗冠狀病毒多肽融合抑制劑,用于預(yù)防和治療當(dāng)時(shí)正在流行的中東呼吸綜合征冠狀病毒(MERS-CoV)及其他人類冠狀病毒的感染,以及將來(lái)新發(fā)與再現(xiàn)的高致病性冠狀病毒感染。他們以病毒表面刺突(S)蛋白S2亞單位內(nèi)氨基酸序列非常保守的HR1區(qū)域?yàn)榘袠?biāo),成功地設(shè)計(jì)和研發(fā)出一個(gè)冠狀病毒的通用抑制劑多肽——EK1。EK1能抑制所有5個(gè)被測(cè)試的人類冠狀病毒感染及3個(gè)來(lái)自于蝙蝠的SARS相關(guān)冠狀病毒(SARSr-CoV)感染。此次新型冠狀病毒肺炎暴發(fā)之后,姜世勃等人第一時(shí)間呼吁研發(fā)安全有效的防治策略[12-13],并快速設(shè)計(jì)和檢測(cè)了衍生于新型冠狀病毒S蛋白HR2區(qū)域的多肽和優(yōu)化的EK1多肽——EK14C多肽,發(fā)現(xiàn)這兩個(gè)多肽能抑制新型冠狀病毒S蛋白介導(dǎo)的膜融合及新型冠狀病毒活病毒及假病毒的感染[14-15]。肖庚富、胡志紅、鐘武合作團(tuán)隊(duì)使用體外活病毒感染系統(tǒng)很快篩選出5個(gè)具有抑制新型冠狀病毒潛力的美國(guó)食品藥品監(jiān)督管理局(FDA)批準(zhǔn)上市的藥物或進(jìn)入臨床試驗(yàn)II期的候選藥物,其中瑞德西韋(Remdesivir)和磷酸氯喹(chloroquine)EC50分別為0.77和1.13微摩爾,體外抑制效應(yīng)較為顯著[16]。2020年3月20日,P. Gautret等人[17]報(bào)道了他們對(duì)氯喹治療新型冠狀病毒肺炎的臨床試驗(yàn)結(jié)果。每個(gè)患者每天接受600毫克羥基氯喹,并根據(jù)臨床表現(xiàn),適時(shí)給予阿奇霉素。盡管樣本量很小(共36名患者),但結(jié)果提示羥基氯喹因治療與新型冠狀病毒肺炎患者體內(nèi)的病毒載量降低/消失明顯相關(guān),與阿奇霉素聯(lián)合使用可顯著地提高其降低病毒載量的效果。

SARS和MERS患者的癥狀較重,且是在癥狀出現(xiàn)后才釋放大量病毒,這時(shí)患者已經(jīng)在尋求醫(yī)療服務(wù),其人傳人主要發(fā)生在衛(wèi)生服務(wù)場(chǎng)所,致病性強(qiáng)而傳染性弱,故這兩個(gè)傳染病容易得到控制[10,18]。與前兩者相比,COVID-19致病性較弱但傳染性及傳染的隱蔽性較強(qiáng),不僅有癥狀的患者能傳播病毒,而且無(wú)癥狀者(病毒攜帶者)或輕微癥狀但感知無(wú)癥狀者也能傳播病毒,1個(gè)感染者平均傳染2個(gè)人以上,有超級(jí)傳播者,傳染性強(qiáng),致病性弱,難以控制,為疫情控制帶來(lái)極大挑戰(zhàn);危重病例和死亡病例大多數(shù)是老年人和患有基礎(chǔ)疾病的病例,COVID-19的病死率為1.4%[19-25]?;谥袊?guó)現(xiàn)有在國(guó)際權(quán)威期刊發(fā)表的論文數(shù)據(jù),考慮到假定的無(wú)癥狀者或輕微癥狀者的數(shù)量是報(bào)道病例數(shù)的幾倍,美國(guó)NIAID主任Anthony S.Fauci、NIAID臨床研究和特殊項(xiàng)目副主任兼臨床研究部主任Lane H.Clifford、美國(guó)疾病控制和預(yù)防中心(CDC)主任Robert R.Redfield認(rèn)為COVID-19的病死率低于1%,這提示在醫(yī)療資源有效應(yīng)對(duì)的情況下,它的整個(gè)臨床結(jié)果最終可能更類似于一個(gè)嚴(yán)重的季節(jié)性流感(病死率約為0.1%)或大流行性流感(類似于1957年、1968年和2009年),而不是類似SARS(病死率為9%~10%)或MERS(病死率為36%)[26]。預(yù)計(jì)到2020年3月底中國(guó)能夠基本控制COVID-19疫情,中國(guó)戰(zhàn)疫很快成功是由于中國(guó)政府采取超強(qiáng)的防控行動(dòng)、全國(guó)人民的奉獻(xiàn)支持、海內(nèi)外華人包括國(guó)際友人的齊心投入。2020年3月6日,Science雜志發(fā)文建議其他國(guó)家學(xué)習(xí)和借鑒中國(guó)的戰(zhàn)疫實(shí)踐,應(yīng)對(duì)COVID-19全球大流行[27]。最近,歐洲呼吸學(xué)會(huì)向鐘南山院士請(qǐng)教和借鑒中國(guó)抗疫經(jīng)驗(yàn),意大利、西班牙整個(gè)國(guó)家也在借鑒武漢封城的中國(guó)實(shí)踐。預(yù)計(jì)更多的國(guó)家將會(huì)學(xué)習(xí)和借鑒中國(guó)戰(zhàn)疫富有成效的實(shí)踐經(jīng)驗(yàn)。2020年3月13日,武漢大學(xué)中南醫(yī)院重癥監(jiān)護(hù)室主任彭志勇、中日友好醫(yī)院副院長(zhǎng)曹彬、上海復(fù)旦大學(xué)附屬華山醫(yī)院感染科張文宏,通過線上視頻交流向美國(guó)頂級(jí)醫(yī)療專家和政界人士分享抗疫經(jīng)驗(yàn)。所以,中國(guó)在COVID-19方面的豐碩研究成果,為世界及時(shí)貢獻(xiàn)了戰(zhàn)疫的知識(shí)和信息,能夠指導(dǎo)其他國(guó)家的戰(zhàn)疫實(shí)踐。

二 CSG采用的命名方法和對(duì)該方法的評(píng)價(jià)

2020年3月2日CSG在Nature Microbiology雜志介紹的命名方法[4],是根據(jù)基因組序列這一明確特征定義病毒的,命名原則基于病毒之間的種系關(guān)系和分類學(xué)(分析方法是聚類分析)。他們根據(jù)2019-nCoV基因組測(cè)序信息,分析了它的進(jìn)化史,認(rèn)定它不是一個(gè)新的病毒種類,而是與SARS-CoV基因接近,屬于同一個(gè)種類。但CSG在文章中也提到,從病毒新穎性上看,SARS-CoV-2與 SARS-CoV和MERS-CoV不同;又根據(jù)已有的流行病學(xué)、臨床表現(xiàn)、診斷方法方面的資料,指出SARS-CoV-2與SARS-CoV也明顯不同。CSG在文章中指出SARS-CoV-2雖然確實(shí)不是SARS-CoV的后代(見文中圖2),但這兩個(gè)病毒在基因上如此接近,以致它們的進(jìn)化史和特征可以互相提供信息。

顯而易見,即便是基于CSG自己的描述,把2019-nCoV命名為SARS-CoV-2邏輯上也是說不通的。

第一,SARS-CoV和SARS-CoV-2在系統(tǒng)發(fā)生上是否屬于親緣關(guān)系應(yīng)有客觀標(biāo)準(zhǔn),從系統(tǒng)發(fā)生關(guān)系上,CSG的文中圖2顯示SARS-CoV-2與SARS-CoV既不是并列也不是后代關(guān)系。

第二,二者感染致病在流行病學(xué)、臨床表現(xiàn)、診斷方法等方面均不相同,病毒的命名應(yīng)當(dāng)對(duì)防控和臨床實(shí)踐提供指導(dǎo),將2019-nCoV命名為SARS-CoV-2無(wú)助于防控和臨床實(shí)踐,甚至可能帶來(lái)不利的影響。

第三,在既沒有SARS-CoV-1命名的,也沒有其他冠狀病毒按照該編號(hào)命名的情況下,卻將新型冠狀病毒命名為SARS-CoV-2,隨意性較大,給人類冠狀病毒的命名體系帶來(lái)不必要的混亂。

第四,CSG中沒有中國(guó)大陸的專家,也沒有征求中國(guó)大陸從事冠狀病毒研究的專家特別是新型冠狀病毒發(fā)現(xiàn)者的意見,這也與慣例不符。

從CSG文中圖2可以看出,分析時(shí)納入的冠狀病毒種類數(shù)量少,這會(huì)影響聚類分析結(jié)果的可靠性。任何統(tǒng)計(jì)分析方法都有適用條件和局限性,統(tǒng)計(jì)分析是為專業(yè)服務(wù)的,脫離了醫(yī)學(xué)專業(yè)知識(shí)和常識(shí)的統(tǒng)計(jì)分析方法和結(jié)果沒有任何意義。

總之,我們認(rèn)為,在已經(jīng)有可用的流行病學(xué)、臨床表現(xiàn)和總的臨床結(jié)果數(shù)據(jù)時(shí),僅僅基于基因測(cè)序信息給新出現(xiàn)的病毒命名,這種方法值得商榷。

三 新型冠狀病毒需要一個(gè)獨(dú)特名字的充分理由

21世紀(jì)暴發(fā)了3次冠狀病毒感染疫情,分別是2002—2003年的SARS流行、2012年的MERS流行和2019—2020年的COVID-19全球大流行。SARS和COVID-19都首先在中國(guó)暴發(fā)流行,SARS在2003年夏季突然消失,至今沒有再出現(xiàn);COVID-19是否在夏季消失,目前尚不確定,有專家認(rèn)為可能明年再度暴發(fā)或成為像季節(jié)性流感那樣的疾病[28]。SARS和COVID-19的流行病學(xué)特征、臨床表現(xiàn)和總的臨床結(jié)果完全不同,二者病毒的基因測(cè)序信息相似度只有79.6%。實(shí)際上,國(guó)際組織如WHO和Anthony S.Fauci、Lane H.Clifford、Robert R.Redfield、Kristiam G.Andersen、Mike Osterholm等知名學(xué)者在其文章中盡量不使用SARS-CoV-2[5-6,26]。WHO在官方文件中使用COVID-19 virus 或virus causing COVID-19,也有人使用中國(guó)學(xué)者建議的HCoV-19,全球流感數(shù)據(jù)共享組織(GISAID)網(wǎng)站已經(jīng)全部改用HCoV-19。

2020年2月5日,姜世勃等人發(fā)文建議將2019-nCoV命名為 “肺炎相關(guān)的呼吸道綜合征冠狀病毒”(pneumonia-associated respiratory syndrome coronavirus,簡(jiǎn)稱PARS-CoV)[29]。2020年2月9日,姜世勃和石正麗建議將2019-nCoV改名為 “傳染性急性呼吸綜合征冠狀病毒”(transmissible acute respiratory syndrome coronavirus,簡(jiǎn)稱TARS-CoV)[13]。2020年2月19日,姜世勃等7位中國(guó)病毒學(xué)專家(包括4位新型冠狀病毒的發(fā)現(xiàn)人)以“新型冠狀病毒需要一個(gè)截然不同的名字”為題目,在Lancet雜志上發(fā)文,強(qiáng)調(diào)基于特殊的臨床、病毒學(xué)和流行病學(xué)特征以及新型冠狀病毒的不確定性,為了避免誤導(dǎo)和困惑以及幫助科學(xué)家和公眾更好地溝通,建議將新型冠狀病毒命名為“人類冠狀病毒2019”(human coronavirus 2019,簡(jiǎn)稱HCoV-19)[8]。這個(gè)名稱既可以將之與SARS-CoV相區(qū)別,又使其與WHO命名的疾病名稱COVID-19保持一致[6],同時(shí),也與既往的HCoV-229E、HCoV-HKU1、HCoV-OC43和HCoV-NL63等長(zhǎng)期在人間循環(huán)感染的人類冠狀病毒的命名習(xí)慣一脈相承。

CSG提出的病毒名目前還只是建議,最后的定名要等ICTV開會(huì)確定。建議中國(guó)的相關(guān)機(jī)構(gòu)成立一個(gè)專家委員會(huì)來(lái)討論新型冠狀病毒的命名議題。中國(guó)專家達(dá)成共識(shí)后,寫一份正式的提議分別發(fā)給ICTV的有關(guān)專家和WHO。中國(guó)專家共識(shí)中應(yīng)建議ICTV采用傳統(tǒng)的病毒命名方法,新出現(xiàn)病毒的命名應(yīng)與該病毒引起的疾病相關(guān)聯(lián),因?yàn)槟壳耙呀?jīng)有較為充足的流行病學(xué)、臨床表現(xiàn)和總的臨床結(jié)果的數(shù)據(jù);也建議CSG今后將根據(jù)疾病和根據(jù)基因序列信息命名這兩種方法進(jìn)行比較,探索出以基因測(cè)序信息命名的適用場(chǎng)景。比如,對(duì)不引起人類疾病而只有基因組信息的病毒,可以僅根據(jù)基因組信息命名。2013年WHO命名的MERS曾引發(fā)抗議,該疾病名及其病毒名MERS-CoV有地域性。為了避免不準(zhǔn)確或污名化的命名,WHO在2015年推出全新的命名規(guī)則[30]。COVID-19是依據(jù)新規(guī)則命名的,CO表示corona,VI表示virus,D表示disease,19表示出現(xiàn)的年份。疾病名稱和對(duì)應(yīng)的病原體名稱最好保持一致,便于記憶和交流。由于冠狀病毒種類較多,這種命名方式將為未來(lái)可能出現(xiàn)的新的冠狀病毒命名提供一種新的模式,這種模式命名因?yàn)椴幻胺溉魏稳撕偷貐^(qū)故不會(huì)引起爭(zhēng)議。病毒是全人類面臨的共同敵人,本文作者建議將引起COVID-19的病毒命名為“人類冠狀病毒2019”(human coronavirus 2019,簡(jiǎn)稱HCoV-19)。

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