徐燕,蔣衛(wèi)平,蔣慧玲,史楊,程慧斐,黃桂英,裴立紅,周麗紅
(麗水市中心醫(yī)院,浙江 麗水 323000)
宮頸鱗狀細(xì)胞癌是女性最常見的生殖道惡性腫瘤,高危型人乳頭瘤病毒感染是宮頸鱗狀細(xì)胞癌發(fā)生的主要原因,同時宿主因素也起著重要作用,即不同的群體和個體對宮頸鱗狀細(xì)胞癌的易感性存在差異。宮頸鱗狀細(xì)胞癌的發(fā)病風(fēng)險與某些基因單核苷酸多態(tài)性(SNP)相關(guān)[1-2],X-射線交錯互補(bǔ)修復(fù)基因 1(X-ray repair cross complementing group1,XRCC1)是一種重要的DNA修復(fù)基因,在DNA堿基切除修復(fù)途徑(BER)中起重要作用[3-4]。以往對麗水地區(qū)婦女HPV感染流行病學(xué)調(diào)查顯示,本地區(qū)患者最常見的高危型HPV為16、18、52和58型[5]。為此,作者在本地區(qū)進(jìn)行XRCC1基因Arg194Trp、Arg280His、Arg399Gln單核苷酸多態(tài)性與 HPV(16、18、52、58)感染宮頸鱗狀細(xì)胞癌相關(guān)性研究。
1.1 一般資料 選擇2016年5月-2019年7月本院住院治療的高危型 HPV(16、18、52、58)感染宮頸鱗狀細(xì)胞癌115例(宮頸鱗狀細(xì)胞癌組),所有病例均經(jīng)組織病理證實(shí)為宮頸鱗狀細(xì)胞癌,經(jīng)HPV分型檢測為四個型別的單一或混合感染。同期選擇本院體檢的婦女143例(對照組),經(jīng)HPV分型檢測均為陰性,薄層液基細(xì)胞學(xué)檢查(TCT)診斷為未見上皮內(nèi)病變及惡性細(xì)胞(NILM)或良性反應(yīng)性細(xì)胞改變(炎癥)。宮頸鱗狀細(xì)胞癌組年齡(52.8±9.2)歲,對照組年齡(53.1±8.9)歲,兩組差異無統(tǒng)計學(xué)意義(P>0.05)。所有血液標(biāo)本均成功進(jìn)行了基因型分型,所有宮頸分泌物標(biāo)本成功進(jìn)行了HPV分型。宮頸鱗狀細(xì)胞癌組和對照組XRCC1基因Arg194Trp、Arg280His、Arg399Gln三個多態(tài)性位點(diǎn)的基因型頻率分布均符合Hardy-Weinberg平衡。受試者均為麗水籍并簽署知情同意書,研究經(jīng)醫(yī)院倫理委員會審批通過。
1.2 方法 所有受試者均采集宮頸分泌物和靜脈血,宮頸分泌物用專用細(xì)胞保存液保存,靜脈血用EDTA-K2抗凝,受試標(biāo)本的所有項目當(dāng)天完成檢測。
1.2.1 HPV分型檢測 采用廣州安必平醫(yī)藥科技股份有限公司產(chǎn)品,該試劑運(yùn)用PCR-反向點(diǎn)雜交法,具體為針對人乳頭瘤病毒基因組晚期區(qū)L1區(qū)設(shè)計特異性引物和28型探針,并將特異性探針包被在尼龍膜上,再通過生物素標(biāo)記的引物進(jìn)行靶片斷擴(kuò)增,PCR產(chǎn)物和膜條上的特異性探針雜交,通過雜交、洗膜,靶標(biāo)中的型特異性片斷會和特異性探針結(jié)合,最后進(jìn)顯色,并進(jìn)行結(jié)果分析,從而檢測出人乳頭瘤病毒28種基因型DNA,包括:15種高危型別:16、18、31、33、35、39、45、51、52、56、58、59、68、73、82(MM4);3 種疑似高危型別:26、53、66;10 種低危型別:6、11、40、42、43、44、54、61、81(cp8304)、83(MM7)。
1.2.2 基因多態(tài)性檢測 (1)核酸提取或純化。采用江蘇康為世紀(jì)生物科技有限公司產(chǎn)品,該試劑運(yùn)用柱式提取法,具體為樣本經(jīng)蛋白酶K結(jié)合、裂解后,DNA特異性結(jié)合到Spin Columns柱上,污染物經(jīng)離心丟棄,PCR抑制劑可通過兩步有效的洗滌被完全去除,結(jié)合在離心柱上的核酸可用洗脫液洗脫,得到純化的DNA,基因組DNA要求:經(jīng)紫外分光光度計檢測260/280≥1.7,260/230≥1.5,純度5-10ng/μL。(2)XRCC1 多態(tài)性檢測。采用美國 ABI公司產(chǎn)品,貨號4351379,該試劑運(yùn)用實(shí)時熒光PCR技術(shù)進(jìn)行檢測,針對XRCC1Arg194Trp、Arg280His、Arg399Gln三個位點(diǎn)設(shè)計引物和探針,在194-Trp、280-His、399-Gln的探針上標(biāo)記FAM熒光素,在194-Arg、280-Arg、399-Arg的探針上標(biāo)記 VIC 熒光素,通過實(shí)時熒光PCR分析其單核苷酸多態(tài)性(single nucleotide polymorphims,SNP)。
1.3 統(tǒng)計學(xué)處理 采用SPSS19.0進(jìn)行統(tǒng)計學(xué)分析,采用Haploview4.2進(jìn)行Hardy-Weinberg平衡檢驗,計量資料比較采用t檢驗,兩組間基因多態(tài)性分布比較采用χ2檢驗,以非條件Logistic回歸方法計算相對風(fēng)險度的比值比(OR)及其95%可信區(qū)間(CI)。
2.1 SNP基因位點(diǎn)信息 作者通過https://www.ncbi.nlm.nih.gov/snp/rs1799782查詢到XRCC1中的rs1799782基因多態(tài)性位點(diǎn),580C>T表示在第580個堿基位置中編碼精氨酸(Arg)的密碼子CGG中的第一個堿基C突變成T形成編碼色氨酸(Trp)的密碼子TGG,編碼的氨基酸位置為第194個,表示為Arg194Trp;通過https://www.ncbi.nlm.nih.gov/snp/rs25489查詢到XRCC1中的rs25489基因多態(tài)性位點(diǎn),839G>A表示在第839個堿基位置中編碼精氨酸(Arg)的密碼子CGT中的第二個堿基G突變成A形成編碼組氨酸(His)的密碼子CAT,編碼的氨基酸位置為第280個,表示為Arg280His;同理,通過https://www.ncbi.nlm.nih.gov/snp/rs25487查詢到XRCC1中的rs25487基因多態(tài)性位點(diǎn),1196G>A表示第1196個堿基位置中編碼精氨酸(Arg)的密碼子CGG中的第二個堿基G突變成A形成編碼谷氨酰胺(Gln)的密碼子CAG,編碼的氨基酸位置為第399個,表示為Arg399Gln。
2.2 HPV基因型分布 對照組143例HPV檢測均為陰性,宮頸鱗狀細(xì)胞癌組115例HPV檢測均為陽性,基因型分布具體情況詳見表1,其中31例同時感染其他型別的HPV。
表1 宮頸鱗狀細(xì)胞癌組感染HPV基因型分布(n=115)
2.3 Hardy-Weinberg平衡分析 HWE軟件檢測結(jié)果顯示,宮頸鱗狀細(xì)胞癌組和對照組XRCC1-Arg194Trp、Arg280His和Arg399Gln基因型頻率分布均符合Hardy-Weinberg平衡定律(P>0.05)。詳見表2-4。
表2 XRCC1-Arg194Trp基因型和等位基因分布頻率
表3 XRCC1-Arg280His基因型和等位基因分布頻率
表4 XRCC1-Arg399Gln基因型和等位基因分布頻率
2.4 XRCC1基因型和等位基因頻率分布 宮頸鱗狀細(xì)胞癌組和對照組XRCC1-Arg194Trp和Arg399Gln基因型和等位基因頻率分布差異有統(tǒng)計學(xué)意義(P<0.05),宮頸鱗狀細(xì)胞癌組和對照組XRCC1-Arg280His基因型和等位基因頻率分布差異無統(tǒng)計學(xué)意義(P>0.05)。 詳見表 2-4。
2.5 XRCC1-Arg194Trp、Arg280His 和 Arg399Gln基因多態(tài)性與宮頸鱗狀細(xì)胞癌的關(guān)系 XRCC1-Arg194Trp多態(tài)性位點(diǎn)中,攜帶Trp基因的個體HPV(16、18、52、58)感染宮頸鱗狀細(xì)胞癌發(fā)病風(fēng)險是 Arg個體的 1.793 倍(OR=1.793,95%CI=1.190~2.702,P<0.05);XRCC1-Arg399Gln 多態(tài)性位點(diǎn)中,攜帶 Gln 基因的個體 HPV(16、18、52、58)感染宮頸鱗狀細(xì)胞癌發(fā)病風(fēng)險是Arg個體的1.668倍(OR=1.668,95%CI=1.126~2.472,P<0.05); 而 XRCC1-Arg280His 的多態(tài)性位點(diǎn)與 HPV(16、18、52、58)感染宮頸鱗狀細(xì)胞癌發(fā)病風(fēng)險無關(guān)(OR=1.210,95%CI=0.753~1.945,P>0.05)。 詳見表 5。
表5 Logistic回歸分析
XRCC1是主要的堿基切除修復(fù)基因,定位于人19號染色體的長臂 (19q13.2-13.3),大小為33kb,包含17個外顯子[3]。XRCCI編碼的蛋白質(zhì)共有3個功能域,在DNA損傷修復(fù)過程中分別和不同的酶相互作用,參與DNA修復(fù)反應(yīng)中的堿基切除修復(fù)和單鏈斷裂修復(fù)[3-4],對維持機(jī)體的遺傳穩(wěn)定性起著重要作用。XRCC1基因有60多個多態(tài)性位點(diǎn),出現(xiàn)變異頻率最高、研究最多的是保守序列區(qū)的3個多態(tài)性位點(diǎn),分別是Arg194Trp、Arg280His、Arg399Gln[6],此3個多態(tài)性位點(diǎn)已成為研究腫瘤易感性及腫瘤治療反應(yīng)性的遺傳性分子指標(biāo)。
本文首次以麗水地區(qū)人群為研究對象,探討了XRCC1-Arg194Trp、Arg280His和XRCC1-Arg399Gln基因多態(tài)性與宮頸鱗狀細(xì)胞癌發(fā)生的關(guān)系,兩組樣本3個基因型分布頻率符合Hardy-Weinberg平衡,表明研究對象具有群體代表性,分別代表了麗水地區(qū)健康婦女和感染 HPV(16、18、52、58)的宮頸鱗狀細(xì)胞癌患者。結(jié)果顯示,Arg194Trp多態(tài)性基因型在宮頸鱗狀細(xì)胞癌組和對照組中的分布有顯著性差異(P<0.05),XRCC1 基因Arg194Trp 位點(diǎn)多態(tài)性使宮頸鱗狀細(xì)胞癌發(fā)生的風(fēng)險增加了1.793倍;而Arg280 His多態(tài)性與本地區(qū)宮頸鱗狀細(xì)胞癌發(fā)病風(fēng)險無關(guān),XRCC1基因Arg399 Gln位點(diǎn)多態(tài)性使宮頸鱗狀細(xì)胞癌發(fā)生的風(fēng)險增加了1.668倍。
2007年浙江省婦女生殖健康實(shí)驗室(杭州)Huang等[7]對539例宮頸鱗狀細(xì)胞癌和473例宮頸上皮內(nèi)瘤樣病變(CIN)患者和800例正常女性進(jìn)行了病例對照研究,發(fā)現(xiàn)與Arg399Arg(GG)相比,攜帶純合子Gln399Gln(AA)基因型的受試者宮頸鱗狀細(xì)胞癌風(fēng)險顯著增加2.32倍 (95%CI 1.47-3.65),雜合子 Arg399Gln(GA)基因型也與宮頸鱗狀細(xì)胞癌風(fēng)險顯著增加相關(guān);調(diào)整后的比值比(OR)為 1.58(95%CI 1.24-2.00);同樣,與 Arg194Arg(CC)野生型基因型相比,癌癥的風(fēng)險升高與Trp194Trp(TT)相關(guān)(OR:2.09,95%CI:1.45-3.02),而雜合子Arg194Trp(CT)的風(fēng)險不相關(guān),而 Arg280His多態(tài)性與宮頸鱗狀細(xì)胞癌發(fā)病風(fēng)險無關(guān)。針對XRCC1全部3個位點(diǎn)的基因多態(tài)性研究,本文結(jié)果與Zhang等[8]的研究結(jié)果較吻合。但查閱相關(guān)文獻(xiàn)[8-12],發(fā)現(xiàn)在世界范圍內(nèi)多地區(qū)中XRCC1基因多態(tài)性與宮頸鱗狀細(xì)胞癌發(fā)病風(fēng)險的關(guān)系不明確,受民族或種族、地域等的影響,甚至可能得到相反的結(jié)果,故XRCC1-Arg194Trp、Arg280His和Arg399Gln多態(tài)性與宮頸鱗狀細(xì)胞癌發(fā)病風(fēng)險還有待于進(jìn)一步的研究。
本文運(yùn)用實(shí)時熒光PCR檢測XRCC1-Arg194Trp、Arg280His和Arg399Gln多態(tài)性在麗水地區(qū)宮頸鱗狀細(xì)胞癌患者與健康女性中的分布頻率,首次闡明了本地區(qū)XRCC1多態(tài)性與宮頸鱗狀細(xì)胞癌易感性之間的相關(guān)性,為進(jìn)一步探討宮頸鱗狀細(xì)胞癌發(fā)病機(jī)制及研究宮頸鱗狀細(xì)胞癌發(fā)病的地域性和種族性提供了可參考的分子遺傳學(xué)依據(jù),也為本地區(qū)宮頸鱗狀細(xì)胞癌高危人群的早期預(yù)防和診斷提供新的思路。