王秀華,武和英,楊 冰,張 琴,于黨輝,黃 倢
(1.中國(guó)水產(chǎn)科學(xué)研究院黃海水產(chǎn)研究所,青島海洋科學(xué)與技術(shù)國(guó)家實(shí)驗(yàn)室海洋漁業(yè)科學(xué)與食物產(chǎn)出過(guò)程功能實(shí)驗(yàn)室,農(nóng)業(yè)農(nóng)村部海水養(yǎng)殖病害防治重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室,青島市海水養(yǎng)殖流行病學(xué)與生物安保重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室,山東青島 266071;2.廣西壯族自治區(qū)海洋研究所,廣西海洋生物技術(shù)重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室,廣西北海 536000)
隨著水產(chǎn)養(yǎng)殖用地的逐年減少和養(yǎng)殖用水資源的日益短缺,集約化高密度的養(yǎng)殖模式已成為水產(chǎn)養(yǎng)殖業(yè)發(fā)展的趨勢(shì)。而在高密度水產(chǎn)養(yǎng)殖系統(tǒng)中,因殘餌、糞便分解導(dǎo)致的高濃度氨氮及亞硝基氮等有害物質(zhì)給養(yǎng)殖動(dòng)物帶來(lái)了潛在的危害,如影響?zhàn)B殖動(dòng)物正常的生理代謝[1],破壞機(jī)體免疫力,加速病害發(fā)生[2]。因此研究降解養(yǎng)殖水體中氨氮、亞硝基氮的技術(shù)方法,將有助于促進(jìn)當(dāng)前水產(chǎn)養(yǎng)殖業(yè)的健康發(fā)展。
本研究從山東德州市一羅非魚養(yǎng)殖場(chǎng)循環(huán)水養(yǎng)殖系統(tǒng)的脫氮池中分離到一株具有高效脫氮特性的細(xì)菌,研究了不同培養(yǎng)條件對(duì)其脫氮效果的影響,采用Biolog細(xì)菌鑒定系統(tǒng)及16S rDNA序列比對(duì)方法對(duì)該菌進(jìn)行了初步的分類鑒定,同時(shí)對(duì)該菌進(jìn)行了生物安全性評(píng)價(jià),以期為該菌的開發(fā)利用提供技術(shù)支持。
1.1.1 樣品來(lái)源
菌株安全性評(píng)價(jià)用斑馬魚(daniorerio)300尾,購(gòu)買于市場(chǎng),平均體長(zhǎng)(2.0±0.1)cm、平均體重(0.25±0.01)g。攻毒感染前,實(shí)驗(yàn)室暫養(yǎng)2周。
1.1.2 脫氮培養(yǎng)基
氨氮培養(yǎng)基與亞硝酸鹽培養(yǎng)基配制方法參照文獻(xiàn)[6],氨氮培養(yǎng)基(g/L):丁二酸鈉 1.69;NH4Cl 0.08;MgSO4·7H2O 0.2;KH2PO40.05;Na2HPO40.5;NaCl 5.0;pH 6~7。亞硝酸鹽培養(yǎng)基(g/L):丁二酸鈉 1.69;NaNO20.1;MgSO4·7H2O 0.2;KH2PO40.05;Na2HPO40.5;NaCl 5.0;pH 6~7。配制氨氮培養(yǎng)基、亞硝酸鹽培養(yǎng)基,分別先配制不含有NH4Cl、NaNO2的基礎(chǔ)成分。基礎(chǔ)成分配制完畢后,各培養(yǎng)基均經(jīng)121 ℃高壓滅菌20 min,之后將經(jīng)0.22 μm微孔濾膜過(guò)濾除菌的一定濃度的NH4Cl、NaNO2母液,按相應(yīng)的比例加入到滅菌后的培養(yǎng)基中。在液體培養(yǎng)基的基礎(chǔ)上加入2%的瓊脂則為固體培養(yǎng)基。
1.2.1 菌株的采集和分離純化
從山東省德州市一羅非魚養(yǎng)殖場(chǎng)循環(huán)水養(yǎng)殖系統(tǒng)的脫氮池和山東省濰坊市一內(nèi)陸對(duì)蝦養(yǎng)殖場(chǎng)的半咸水對(duì)蝦養(yǎng)殖池中分別采集水樣,置入無(wú)菌采樣瓶,低溫條件下帶回實(shí)驗(yàn)室,用LB平板劃線分離純化(LB培養(yǎng)基:蛋白胨 1%;酵母提取物 0.5%;NaCl 1%),對(duì)不同的菌株編號(hào)入菌種資源庫(kù)保存?zhèn)溆谩?/p>
1.2.2 脫氮菌株的篩選
1.2.3 脫氮菌株碳源的篩選
1.2.4 菌株在不同鹽度中的脫氮效果
1.2.5 菌株在不同pH中的脫氮效果
1.2.6 菌株在不同C ∶N比中的脫氮效果
1.2.7 菌株在硝化和亞硝化培養(yǎng)基中的生長(zhǎng)曲線及對(duì)應(yīng)的脫氮效果
1.2.9 菌株安全性實(shí)驗(yàn)評(píng)價(jià)
用LB液體培養(yǎng)基將待測(cè)菌株28 ℃活化24 h后,4 ℃ 4 000g離心15 min,沉淀用PBS稀釋成菌懸液,并用曝氣48 h后的自來(lái)水將菌懸液分別稀釋成2×104、2×105、2×106、2×107、2×108CFU/mL五個(gè)濃度梯度的菌液,用于浸泡感染實(shí)驗(yàn),空白組加入10%的PBS。實(shí)驗(yàn)用水族箱每個(gè)有效水體5 L,每組放入斑馬魚40尾,每組設(shè)置兩個(gè)平行。
感染用斑馬魚實(shí)驗(yàn)前停喂餌料24 h,置入菌液后24 h恢復(fù)正常投喂管理,每天進(jìn)行吸污和換水,日換水量為30%。每天早晚2次觀察并記錄每組斑馬魚的死亡情況,直到一周之內(nèi)不再死亡即停止觀察,然后統(tǒng)計(jì)累計(jì)死亡率。
1.2.10 菌株鑒定
16S rDNA序列分析比對(duì)及系統(tǒng)發(fā)育分析法:細(xì)菌DNA提取采用細(xì)菌基因組 DNA 快速抽提試劑盒(生工生物工程(上海)股份有限公司),細(xì)菌16S rDNA序列擴(kuò)增方法參照文獻(xiàn)[8]。擴(kuò)增產(chǎn)物委托上海生工生物工程技術(shù)有限公司進(jìn)行分析,所得序列在NCBI數(shù)據(jù)庫(kù)中利用BLAST進(jìn)行同源性比對(duì),選取同源性較高的序列,利用MEGA 5.0 進(jìn)行多重比較后通過(guò)鄰接法構(gòu)建系統(tǒng)發(fā)育樹,以確定分離菌株的分類地位。
Biolog細(xì)菌鑒定:采用Biolog微生物自動(dòng)分析系統(tǒng)(MICROSTATION,Biolog,美國(guó)),細(xì)菌純培養(yǎng)采用Biolog BUG 的固體培養(yǎng)基,28 ℃恒溫培養(yǎng)12 h,再將菌落用液體培養(yǎng)基(IF-B)稀釋(Biolog,美國(guó)),稀釋的菌液加入到Gen III 微板中(每個(gè)孔100 μL),28 ℃恒溫培養(yǎng)24 h,然后用MICROSTATION進(jìn)行鑒定。
1.2.11 數(shù)據(jù)分析
試驗(yàn)數(shù)據(jù)用平均數(shù)±標(biāo)準(zhǔn)方差(x±s,n=3)的方法來(lái)表示,運(yùn)用軟件SPSS18.0,經(jīng)One-Way ANOVA 分析,采用Duncan’s多重檢驗(yàn)分析試驗(yàn)結(jié)果平均數(shù)的差異顯著性,設(shè)差異水平α=0.05 (P<0.05為差異顯著)。
從羅非魚養(yǎng)殖系統(tǒng)和對(duì)蝦養(yǎng)殖池中共分離出13株菌株,其中有6個(gè)菌株既能在硝化培養(yǎng)基中生長(zhǎng)也能在亞硝酸鹽培養(yǎng)基中生長(zhǎng),結(jié)果見(jiàn)表1。選取去氨氮效果最佳的菌株DZYC2016100902(簡(jiǎn)稱DZYC02菌株)為本實(shí)驗(yàn)的目的菌株用于后續(xù)研究,該菌株在硝化培養(yǎng)基及亞硝酸鹽培養(yǎng)基中菌落呈白色、圓形、邊緣整齊,菌落1 mm左右,在LB培養(yǎng)基中為乳白色,圓形、邊緣整齊,菌落2 mm左右,表面濕潤(rùn)有光澤。
表1 不同菌株對(duì)氨氮的去除率Tab.1 Removal rates of ammonia nitrogen by different bacterial strains %
菌株DZYC02在不同碳源條件下對(duì)氨氮的去除率如圖1所示??芍暝诓煌奶荚粗?8 h對(duì)氨氮的去除率由低到到高的碳源排列是丁二酸鈉、葡萄糖、蔗糖、可溶性淀粉、乙酸鈉、檸檬酸鈉。以檸檬酸鈉為碳源時(shí),在24 h和48 h的氨氮去除率均達(dá)到100%,均顯著高于其它組的氨氮去除率,其它組48 h氨氮去除率也明顯高于24 h;當(dāng)丁二酸鈉為碳源時(shí),24 h和48 h氨氮去除率均低于其他組,差異顯著;當(dāng)乙酸鈉為碳源時(shí),24 h氨氮去除率低于葡萄糖、蔗糖、可溶性淀粉組,差異顯著,但以葡萄糖、蔗糖、可溶性淀粉作為唯一碳源時(shí)氨氮去除率差異不顯著;而乙酸鈉組48 h氨氮去除率高于葡萄糖、蔗糖組,差異顯著,也高于可溶性淀粉組,差異不顯著。說(shuō)明碳源種類差異影響菌株DZYC02氨氮的去除率。
不同鹽度、pH及C ∶N環(huán)境中菌株DZYC02脫氨氮效果見(jiàn)圖2。由實(shí)驗(yàn)結(jié)果可知,當(dāng)鹽度由0升
圖1 不同碳源對(duì)菌株氨氮去除率的影響Fig.1 Effects of carbon sources on ammonia nitrogen removal rates of strain DZYC02 標(biāo)有不同小寫字者表示24 h時(shí)組間差異顯著;標(biāo)有相同小寫字母者表示組間差異不顯著;標(biāo)有不同*者表示48 h時(shí)組間差異顯著;標(biāo)有相同*者表示組間差異不顯著
高到15時(shí),發(fā)酵液中氨氮的去除率一直保持100%;當(dāng)鹽度大于15時(shí),該菌株的脫氮能力開始下降,脫氮率隨著鹽度的升高而降低,當(dāng)鹽度為30時(shí),該菌株的脫氮率趨于0。
當(dāng)pH值由4升高到5時(shí),菌株氨氮去除率由(3.2±1.2)%升到的100%。當(dāng)pH處于5~7時(shí),氨氮去除率維持在(99.9±0.1)%,該pH范圍內(nèi)3個(gè)組間的脫氨氮效果差異不顯著;當(dāng)pH值由7升高到9時(shí),菌株發(fā)酵液中氨氮的去除率顯著下降,脫氮率由(99.8±0.1)%下降到(2.9±0.6)%。表明pH是影響該菌株脫氨氮效果的因子之一,該菌適宜于弱酸環(huán)境。
當(dāng)C ∶N由5提高至15時(shí),發(fā)酵液中氨氮的去除率隨C ∶N的升高而顯著增大;當(dāng)C ∶N在15~30時(shí),各組氨氮去除率均在100%,趨于穩(wěn)定。
圖2 鹽度、pH及C ∶N對(duì)菌株DZYC02脫氮效果的影響Fig.2 Effects of salinity,pH and C ∶N on ammonia nitrogen removal rates of strain DZYC02
菌株DZYC02在氨氮及亞硝酸鹽液體培養(yǎng)基中的生長(zhǎng)曲線見(jiàn)圖3。在硝化培養(yǎng)基中,菌株DZYC02在經(jīng)3 h左右的遲緩期后,進(jìn)入對(duì)數(shù)生長(zhǎng)期,又經(jīng)12 h后菌液OD600 nm值增長(zhǎng)趨于平緩,隨后進(jìn)入穩(wěn)定期。在細(xì)菌對(duì)數(shù)生長(zhǎng)期,培養(yǎng)液中的氨氮濃度快速降低,表明細(xì)菌增殖過(guò)程中可利用培養(yǎng)基中的氨氮。
菌株DZYC02在亞硝氮液體培養(yǎng)基中,經(jīng)12 h左右的遲緩期后,進(jìn)入對(duì)數(shù)生長(zhǎng)期;21 h左右又經(jīng)一次遲緩增殖,到36 h菌株又開始進(jìn)入對(duì)數(shù)生長(zhǎng)期,到42 h發(fā)酵液OD600 nm值達(dá)到最大,隨后進(jìn)入下降趨勢(shì);39 h以后培養(yǎng)基中的亞硝氮濃度仍逐漸降低,至48 h亞硝基氮濃度接近為零,表明細(xì)菌增殖過(guò)程中可利用培養(yǎng)基中的亞硝基氮。
圖3 菌株在氨氮及亞硝氮培養(yǎng)基中的生長(zhǎng)曲線Fig.3 The growth curve of strain DZYC02 in ammonia nitrogen and nitrate nitrogen medium
結(jié)果顯示,斑馬魚經(jīng)菌株DZYC02浸泡感染兩周時(shí)間內(nèi),高濃度實(shí)驗(yàn)組(2.0×108CFU/mL)和低濃度實(shí)驗(yàn)組(2.0×104CFU/mL)及對(duì)照組(PBS)的斑馬魚,均未出現(xiàn)死亡,并且在此期間斑馬魚正常攝食,游動(dòng)活潑。而僅在2.0×105CFU/mL濃度組出現(xiàn)1尾死亡。根據(jù)實(shí)驗(yàn)結(jié)果綜合判斷,該菌株對(duì)斑馬魚不具有感染力。
PCR擴(kuò)增菌株DZYC02的16S rDNA序列,PCR電泳圖見(jiàn)圖4,將該擴(kuò)增產(chǎn)物進(jìn)行序列分析,得1 377 bp的堿基序列(NCBI 登錄號(hào)為SUB5864511),提交到NCBI網(wǎng)站進(jìn)行BLAST序列比對(duì)),發(fā)現(xiàn)該菌與肺炎克雷伯氏菌Klebsiellapneumoniae的親緣關(guān)系最近,同源性達(dá)到99%。選取與該菌源性相近的16株菌的16S rDNA序列構(gòu)建系統(tǒng)發(fā)育樹,結(jié)果見(jiàn)圖5,可見(jiàn)該菌與K.pneumoniaesubsp.rhinoscleromatis ATCC 13884菌聚為一類,初步判定該菌為一株克雷伯氏菌K.pneumoniae。Biolog鑒定結(jié)果顯示菌株DZYC02與K.pneumoniae的相似度達(dá)到 0.615,大于0.5,遺傳距離3.977,小于5。綜合兩種鑒定結(jié)果,判定該菌株為一株肺炎克雷伯桿菌。
圖4 菌株DZYC02的16S rDNA 電泳圖Fig.4 PCR products of 16S rDNA gene of bacterial strains DZYC02
利用生物脫氮技術(shù)進(jìn)行水質(zhì)處理已較早用于污水處理行業(yè),近年來(lái)生物脫氮技術(shù)也被用于水產(chǎn)養(yǎng)殖[9,10]。目前已經(jīng)發(fā)現(xiàn)的脫氮菌種類多,根據(jù)其同化作用類型,分為自養(yǎng)硝化細(xì)菌、異養(yǎng)硝化細(xì)菌[11,12]、自養(yǎng)反硝化細(xì)菌、異養(yǎng)反硝化細(xì)菌[13,14 ]。而有些脫氮菌兼具有硝化與反硝化能力[12,15 ],如肺炎克雷伯氏菌為異養(yǎng)硝化好氧反硝化細(xì)菌[16],常見(jiàn)于污水處理系統(tǒng)中,其脫氮特性與攜帶的編碼羥胺氧化酶、周質(zhì)硝酸鹽還原酶、亞硝酸鹽還原酶的基因表達(dá)有關(guān)[17,18]。有研究表明,異養(yǎng)硝化菌在氨代謝過(guò)程中,由氨單氧酶催化氨形成羥胺后,經(jīng)非血紅素鐵羥胺氧化酶的催化,直接形成N2O及N2[19],而不同于自養(yǎng)硝化細(xì)菌,在氨氧化過(guò)程中產(chǎn)生亞硝基氮。
圖5 根據(jù)16S rDNA基因序列構(gòu)建的菌株DZYC02與相近的菌株系統(tǒng)發(fā)育樹Fig.5 Phylogenetic tree base on 16S rDNA sequences generated of strain DZYC02 with other similar stains節(jié)點(diǎn)數(shù)表示bootstrap支持率,1 000次重復(fù).
微生物脫氮過(guò)程與環(huán)境理化因子及營(yíng)養(yǎng)物質(zhì)密切相關(guān),不同的脫氮菌對(duì)環(huán)境及營(yíng)養(yǎng)的需求差異較大,適宜的鹽度、溫度、pH、溶解氧及C ∶N等能夠提高脫氮效果[20-24]。有研究發(fā)現(xiàn),從養(yǎng)殖場(chǎng)沉積淤泥中分離的產(chǎn)酸克雷伯菌(K.oxytoca)適宜最佳脫氮條件為pH 7~9,鹽度0~5,當(dāng)鹽度大于15時(shí)不具脫氮效果[25],且采用不同的碳源,其脫氮效果存在差異。本研究中所分離的菌株DZYC02為一羅非魚循環(huán)水養(yǎng)殖池中的菌株,在中性至偏弱酸(pH 5~7)低鹽度(0~15)環(huán)境中對(duì)氨氮及亞硝基氮具有良好的去除作用,環(huán)境中添加適量的碳源可提高該菌的脫氮效果??芍瑸橐粚俚膬芍昃蛏娴沫h(huán)境不同,其脫氮條件存在一定的差異。
肺炎克雷伯氏菌屬于腸桿菌科克雷伯氏菌屬,為革蘭氏陰性桿菌,該菌廣泛分布在自然界,因含有多種毒力因子[26],對(duì)人畜均具有致病力[27,28]。肺炎克雷伯氏菌能夠引起團(tuán)頭魴(Megalobramaamhlycephala)出血性敗血癥[29],該菌也可從海水魚中分離到[30]。 感染實(shí)驗(yàn)初步證實(shí),本研究中所分離的肺炎克雷伯氏菌為一無(wú)毒株,浸泡感染斑馬魚不具有毒力,而在分離該菌的羅非魚循環(huán)養(yǎng)殖池中,也未發(fā)現(xiàn)養(yǎng)殖羅非魚出現(xiàn)發(fā)病的現(xiàn)象,但為了養(yǎng)殖動(dòng)物的安全,在開發(fā)應(yīng)用該菌前,還需要對(duì)該菌對(duì)魚類的侵染力、毒力等相關(guān)因子開展進(jìn)一步的研究。