国产日韩欧美一区二区三区三州_亚洲少妇熟女av_久久久久亚洲av国产精品_波多野结衣网站一区二区_亚洲欧美色片在线91_国产亚洲精品精品国产优播av_日本一区二区三区波多野结衣 _久久国产av不卡

?

S100P在NSCLC中的表達(dá)、信號通路和預(yù)后關(guān)系生物信息分析及驗(yàn)證

2020-07-08 05:35湯山松劉娟
國際呼吸雜志 2020年13期
關(guān)鍵詞:組織化學(xué)腺癌例數(shù)

湯山松 劉娟

1資陽市人民醫(yī)院腫瘤科641300;2四川省人民醫(yī)院病理科,成都610000

肺癌是臨床上最為常見的惡性腫瘤,其發(fā)病率在男性為第一位,女性為第二位,且病死率位居所有腫瘤的第一位[1]。一直以來,肺癌都是影響人類生存健康的重大難題之一。近期發(fā)布的全球癌癥統(tǒng)計(jì)報(bào)告顯示,肺癌、氣管和支氣管腫瘤發(fā)病率及病死率居各種癌癥之首位[2]。因此,找出特異度、敏感度更高的蛋白及基因標(biāo)志物,對于肺癌的早期診治及評估預(yù)后具有重要價(jià)值。

近些年的研究表明S100P 在人類多種惡性腫瘤中呈現(xiàn)明顯上調(diào)表達(dá),并與患者腫瘤病理學(xué)特征存在一定的關(guān)系[3]。然而S100P 在非小細(xì)胞肺癌(non-small cell lung cancer,NSCLC)患者腫瘤組織和癌旁組織中的表達(dá)情況及其與NSCLC 患者生存關(guān)系研究鮮有報(bào)道。本研究采用生物信息學(xué)方法分析TCGA 數(shù)據(jù)庫中S100P的表達(dá)水平及其高低表達(dá)與NSCLC 患者總生存期 (overall survival,OS)和無疾病進(jìn)展生存期 (disease free survival,DFS)的關(guān)系。同時(shí),采用免疫組織化學(xué)法檢測48例NSCLC患者腫瘤組織中S100P 蛋白表達(dá)水平,并分析其與患者臨床病理特征的關(guān)系,對前述生物信息分析結(jié)果進(jìn)行驗(yàn)證。

1 對象與方法

1.1 S100P表達(dá)水平分析 在TCGA 數(shù)據(jù)庫中分析“肺癌”“非小細(xì)胞肺癌” “鱗癌” “腺癌”和“S100P基因”檢索物種為人類,分析S100P 基因在多種組織中的變動(dòng)情況,并比較其在腫瘤組織和對應(yīng)的癌旁正常組織中的差異表達(dá)情況。認(rèn)為存在組織差異表達(dá)的條件為S100P基因m RNA 上調(diào)或下調(diào)表達(dá)超過2 倍 (|Log2FC|>1),且P<0.05[4]。

1.2 S100P 蛋白網(wǎng)絡(luò)分析 采用STRING 數(shù)據(jù)庫,與S100P相互作用蛋白網(wǎng)絡(luò),并分析其相關(guān)蛋白聚類情況,S100P 蛋白-蛋白相互作用網(wǎng)絡(luò)構(gòu)建條件為置信度大于0.5,相互作用來源為共表達(dá)、基因功能和比鄰關(guān)系[5]。

1.3 共表達(dá)及生存分析 在TCGA 數(shù)據(jù)庫中,依據(jù)與S100P基因共表達(dá)關(guān)系,選取正相關(guān)和負(fù)相關(guān)表達(dá)最為明顯的2個(gè)基因進(jìn)行分析,計(jì)算相關(guān)系數(shù);根據(jù)S100P基因在NSCLC患者癌組織中表達(dá)的中位數(shù),分為高表達(dá)組和低表達(dá)組,采用Logrank檢驗(yàn)分析比較S100P 基因表達(dá)與患者預(yù)后的關(guān)系。

1.4 免疫組織化學(xué)檢測S100P蛋白表達(dá) 回顧性分析四川省資陽市人民醫(yī)院收治的NSCLC患者48例,采用免疫組織化學(xué)法檢測患者手術(shù)標(biāo)本中NSCLC患者癌組織和癌旁正常組織中S100P蛋白表達(dá)水平,分析比較S100P 基因編碼蛋白表達(dá)與患者臨床病理特征的關(guān)系。本研究符合《赫爾辛基宣言》的原則。免疫組織化學(xué)檢測S100P 蛋白表達(dá)按試劑盒操作說明進(jìn)行。S100P蛋白表達(dá)高低表達(dá)判定,在高倍鏡下隨機(jī)選取5個(gè)視野,根據(jù)著色強(qiáng)弱和陽性細(xì)胞比例綜合判定S100P 表達(dá)強(qiáng)度。按色強(qiáng)度評分:不著色 (0分)、淺黃 (1分)、棕黃(2分)、棕褐色(3分);按照每高倍鏡 (SP×200)下陽性細(xì)胞所占的比例分為<10% (0分)、≥10%且<25% (1分);≥25%且<50% (2分)、≥51%且<75% (3分);≥75% (4分)??傮w評分值=陽性細(xì)胞比例評分×染色強(qiáng)度評分。最終評判:<6分為低表達(dá),≥6分為高表達(dá)。低表達(dá)率(%)=低表達(dá)例數(shù)/總例數(shù)×100%。高表達(dá)率(%)=高表達(dá)例數(shù)/總例數(shù)×100%。

1.5 統(tǒng)計(jì)學(xué)分析SAS 9.1統(tǒng)計(jì)學(xué)軟件進(jìn)行相關(guān)分析,計(jì)量資料以x-±s表示,數(shù)據(jù)比較采用t檢驗(yàn);計(jì)數(shù)資料采用例數(shù)(百分比)表示,數(shù)據(jù)比較采用χ2檢驗(yàn)。S100P基因高低表達(dá)組生存期采用Logrank檢驗(yàn)。P<0.05為差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義。

2 結(jié)果

2.1 S100P 基因表達(dá) TCGA 數(shù)據(jù)庫中,S100P蛋白在大多數(shù)腫瘤組織中呈現(xiàn)高表達(dá);在肺腺癌組織中S100P 基因表達(dá)水平顯著高于癌旁組織(P<0.05)。同時(shí),S100P表達(dá)水平在NSCLC不同臨床分期差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義 (F=3.74,P<0.05)。見圖1、2。

圖1 S100P基因mRNA 在肺腺癌、肺鱗癌及對應(yīng)正常組織中的表達(dá) A:肺腺癌與對應(yīng)正常組織;B:肺鱗癌與對應(yīng)正常組織

圖2 S100P基因m RNA 表達(dá)與非小細(xì)胞肺癌患者臨床分期的關(guān)系

2.2 S100P 蛋白-蛋白相互作用網(wǎng)絡(luò) 蛋白-蛋白相互作用關(guān)系采用String數(shù)據(jù)進(jìn)行分析,選取了與S100P 蛋白相互作用較為緊密的蛋白網(wǎng)絡(luò)節(jié)點(diǎn)數(shù)50個(gè),相互作用關(guān)系236個(gè),區(qū)域聚類指數(shù)為0.39,蛋白相互作用網(wǎng)絡(luò)富集顯著 (P<0.05)。

2.3 相關(guān)分析 共表達(dá)分析顯示,與S100P基因正相關(guān)表達(dá)最顯著的基因?yàn)镕URIN 基因 (r=0.55,P<0.05),與S100P 基因負(fù)相關(guān)表達(dá)最顯著的基因?yàn)镃AMK1 (r=-0.38,P<0.05)。

2.4 生存分析 生存分析顯示高表達(dá)組與低表達(dá)組OS 差異無統(tǒng)計(jì)學(xué)意義 (HR=1.1,P>0.05),高表達(dá)組患者DFS低于低表達(dá)組(HR=1.3,P<0.05),見圖3、4。肺腺癌中S100P高表達(dá)患者OS 和DFS 生存均低于低表達(dá)組 (P值均<0.05)。

圖3 S100P基因m RNA 在非小細(xì)胞肺癌患者中總生存期的受試者工作特征曲線

圖4 S100P基因m RNA 在非小細(xì)胞肺癌患者中無疾病進(jìn)展生存期的受試者工作特征曲線

2.5 S100P基因編碼蛋白表達(dá)情況 免疫組織化學(xué)顯示S100P 蛋白主要表達(dá)于肺癌或正常肺組織細(xì)胞核,呈現(xiàn)棕褐色顆粒 (圖5)。S100P 在NSCLC患者癌和癌旁組織中的陽性表達(dá)率分別為54.2% (26/48)和16.7% (8/48),癌組織中陽性標(biāo)的率顯著高于癌旁組織 (χ2=14.76,P<0.05)。

2.6 S100P 蛋白表達(dá)與NSCLC 患者臨床病理特征關(guān)系 S100P 蛋白在癌組織中的陽性表達(dá)與NSCLC患者的臨床分期和縱隔淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移有關(guān)(P值均<0.05),而與患者年齡、性別、腫瘤大小、病理類型、病例分級和有無胸水無關(guān) (P值均>0.05),見表1。

3 討論

S100P是介導(dǎo)鈣離子結(jié)合蛋白S100家族重要成員[6-7]。自1992 年S100P 被報(bào)道以來,這種相對分子質(zhì)量10 400的鈣結(jié)合蛋白就受到了研究這的廣泛的關(guān)注。雖然S100P 自身在人體組織中并非廣泛表達(dá),但人體胚胎發(fā)育以及腫瘤發(fā)生、發(fā)展中發(fā)揮重要作用[8-10]。

S100P在進(jìn)化方面也相對較新,因?yàn)樗淮嬖谟诩棺祫?dòng)物的基因組中。在子宮壁激素節(jié)律性波動(dòng)過程中觀察到這種蛋白的表達(dá),它可能與胚胎著床以及發(fā)育中的胚胎有密切關(guān)系。然而,大多數(shù)已發(fā)表的研究認(rèn)為S100P在多種人類惡性腫瘤的發(fā)生、發(fā)展中發(fā)揮重要作用。在人類惡性腫瘤中,S100P越來越被認(rèn)為是一種潛在的診斷和治療靶點(diǎn)。

相關(guān)研究顯示,S100P在多種不同類型的腫瘤中大多呈現(xiàn)高水平表達(dá)[11],這與我們生物信息分析結(jié)果也較為一致。此外,大量來自轉(zhuǎn)錄組學(xué)和蛋白質(zhì)組學(xué)分析實(shí)驗(yàn)數(shù)據(jù)顯示S100P 在體外和體內(nèi)過度表達(dá),腫瘤細(xì)胞的生物學(xué)功能發(fā)生明顯改變,包括增殖、遷移能力等。S100P的表達(dá)受多種激素的影響,并受多種轉(zhuǎn)錄因子的調(diào)節(jié)。相關(guān)實(shí)驗(yàn)證實(shí)S100P在雄激素[12]、smad、stat/creb和sp/klf[13]以及孕酮[14]等因子作用下明顯上調(diào)。在體外研究中,BMP4 也被確定為S100P 表達(dá)的調(diào)節(jié)因子,在這兩種蛋白質(zhì)之間觀察到正相關(guān)表達(dá)[15]。同時(shí),在轉(zhuǎn)移性和雄激素難治性前列腺癌細(xì)胞中觀察到IL-6和S100P表達(dá)之間的相關(guān)性,并推測IL-6可刺激S100P表達(dá)[16]。

表1 S100P基因編碼蛋白表達(dá)與非小細(xì)胞肺癌患者臨床病理特征關(guān)系 [例 (%)]

S100P在NSCLC中的表達(dá)研究報(bào)道不多,其在NSCLC中的表達(dá)及其與患者預(yù)后關(guān)系研究鮮有報(bào)道。根據(jù)S100P 在其他腫瘤中的表達(dá)情況及生物學(xué)功能,我們推測S100P在NSCLC的預(yù)后和臨床病理特征中也可能發(fā)揮重要作用。因此,我們分別采用生物信息和免疫組織化學(xué)方法探討S100P的表達(dá)情況及其與NSCLC 的關(guān)系。本研究發(fā)現(xiàn),S100P在NSCLC患者,尤其是肺腺癌患者癌組織中的表達(dá)水平明顯上調(diào),并與患者預(yù)后相關(guān)。S100P高表達(dá)患者OS 和DFS 明顯降低,提示S100P 可能是NSCLC 預(yù)后不良的危險(xiǎn)因素。同時(shí),免疫組織化學(xué)檢測也證實(shí)S100P 高表達(dá)患者分期較晚,縱隔淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移率較高。也證實(shí)了其作為NSCLC預(yù)后不良的危險(xiǎn)因素。

因此,S100P基因在NSCLC 患者腫瘤組織中呈現(xiàn)高表達(dá),并與NSCLC患者預(yù)后不良有關(guān),有望成為NSCLC患者預(yù)后相關(guān)分子標(biāo)志物,并成為NSCLC靶向治療的潛在靶點(diǎn)。

利益沖突 所有作者均聲明不存在利益沖突

猜你喜歡
組織化學(xué)腺癌例數(shù)
勘誤聲明
二維超聲與四維超聲聯(lián)合診斷產(chǎn)前胎兒畸形的臨床價(jià)值
人工膝關(guān)節(jié)翻修例數(shù)太少的醫(yī)院會增加再翻修率:一項(xiàng)基于23 644例的研究
更正
益肺解毒方聯(lián)合順鉑對人肺腺癌A549細(xì)胞的影響
食管鱗狀細(xì)胞癌中FOXC2、E-cadherin和vimentin的免疫組織化學(xué)表達(dá)及其與血管生成擬態(tài)的關(guān)系
大口黑鱸鰓黏液細(xì)胞的組織化學(xué)特征及5-HT免疫反應(yīng)陽性細(xì)胞的分布
HIF-1a和VEGF-A在宮頸腺癌中的表達(dá)及臨床意義
免疫組織化學(xué)和免疫熒光染色在腎活檢組織石蠟切片磷脂酶A2受體檢測中的應(yīng)用
GSNO對人肺腺癌A549細(xì)胞的作用
大姚县| 凌海市| 河东区| 锦屏县| 泰和县| 外汇| 永德县| 德安县| 陇西县| 武穴市| 比如县| 武川县| 荔浦县| 台东县| 博客| 法库县| 汤阴县| 绥芬河市| 江西省| 临澧县| 浮梁县| 赤峰市| 额尔古纳市| 睢宁县| 浙江省| 平遥县| 六枝特区| 东兰县| 长乐市| 西乡县| 饶河县| 福贡县| 明光市| 武安市| 商丘市| 民和| 临清市| 荔浦县| 盐津县| 宜宾市| 沅江市|