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C反應(yīng)蛋白基因單核苷酸多態(tài)性與缺血性腦卒中相關(guān)性的Meta分析

2020-07-17 03:04:06
關(guān)鍵詞:顯性等位基因異質(zhì)性

腦卒中發(fā)病率高,已成為我國(guó)致死的第一大病因,給社會(huì)、家庭帶來(lái)了沉重的負(fù)擔(dān)[1]。傳統(tǒng)的危險(xiǎn)因素諸如高血壓病、糖尿病、肥胖、高同型半胱氨酸血癥、吸煙及飲酒等僅能解釋部分事件,因此,腦卒中發(fā)病機(jī)制目前尚未完全闡明。缺血性腦卒中(ischemic stroke, IS)作為卒中的常見(jiàn)亞型,是一種環(huán)境和遺傳因素相互作用的多基因病[2-3]。在眾多的IS候選基因中,C反應(yīng)蛋白(C-reactive protein, CRP)作為一種參與動(dòng)脈粥樣硬化的炎性標(biāo)記物[4],與IS的發(fā)生[5-6]及預(yù)后[7]密切相關(guān)。大量流行病學(xué)資料和臨床研究已經(jīng)證實(shí),CRP基因單核苷酸多態(tài)性(single nucleotide polymorphism, SNP)與血漿CRP水平密切相關(guān)[8-9]。近年來(lái),亦有多項(xiàng)研究報(bào)道認(rèn)為CRP基因SNP與IS易感相關(guān),如rs1800947、rs3093059。然而由于種群間異質(zhì)性、單個(gè)研究統(tǒng)計(jì)效力的局限性等因素的影響,使得結(jié)果頗有爭(zhēng)議。Chen等[10-11]研究認(rèn)為rs1800947與IS的發(fā)生風(fēng)險(xiǎn)相關(guān)。Shen等[8]研究顯示rs3093059與IS的易感性相關(guān)。Morita等[12]在日本人群中研究發(fā)現(xiàn),rs1800947位點(diǎn)C等位基因與IS的發(fā)生相關(guān)。而Ladenvall 等[13]在瑞典人群、Das等[14]在印度人群證實(shí)了rs1800947多態(tài)性與IS無(wú)關(guān)。Chen等[15]研究顯示rs3093059與IS的易感性無(wú)關(guān)。探究CRP 基因在IS發(fā)生中的具體作用機(jī)制,對(duì)于IS的預(yù)防、治療及預(yù)后具有重要意義。基于此,通過(guò)收集CRP基因rs1800947、rs3093059位點(diǎn)多態(tài)性與IS相關(guān)性的病例對(duì)照研究,運(yùn)用Meta分析的方法對(duì)既往研究結(jié)果進(jìn)行綜合定量評(píng)價(jià),提高關(guān)聯(lián)分析統(tǒng)計(jì)效力,進(jìn)一步得出更為貼切的結(jié)論,以期為IS臨床用藥靶點(diǎn)和預(yù)防提供依據(jù)。

1 資料與方法

1.1 文獻(xiàn)納入標(biāo)準(zhǔn)及排除標(biāo)準(zhǔn) 納入標(biāo)準(zhǔn):①國(guó)內(nèi)外公開(kāi)發(fā)表的關(guān)于CRP基因rs1800947(1059G>C)、rs3093059(-757T>C)多態(tài)性與IS相關(guān)性的文獻(xiàn);②病例對(duì)照研究;③IS的診斷符合全國(guó)第四屆腦血管病學(xué)術(shù)會(huì)議修訂的《腦卒中診斷標(biāo)準(zhǔn)》;④樣本量明確,各基因型及等位基因數(shù)據(jù)可直接獲得或通過(guò)數(shù)據(jù)計(jì)算獲得;⑤對(duì)照組基因頻率分布符合哈迪-溫伯格平衡(Hardy-Weinberg eguilibrium,HWE)遺傳平衡定律;⑥納入文獻(xiàn)若同時(shí)報(bào)道兩個(gè)不同人群的研究結(jié)果,每個(gè)人群在Meta分析中將視為一個(gè)獨(dú)立的研究報(bào)道。

排除標(biāo)準(zhǔn):①非入選基因位點(diǎn);②重復(fù)報(bào)道,文獻(xiàn)質(zhì)量差;③數(shù)據(jù)不完整或通過(guò)計(jì)算不能得出完整數(shù)據(jù);④非病例對(duì)照研究。

1.2 納入文獻(xiàn)的檢索流程與篩選 檢索數(shù)據(jù)庫(kù)包括:PubMed、MedLine、Springer、EMbase、OVID、Cochrane Library、中國(guó)期刊全文數(shù)據(jù)庫(kù)(CNKI)、中國(guó)生物醫(yī)學(xué)文獻(xiàn)數(shù)據(jù)庫(kù)(CBM)、萬(wàn)方數(shù)據(jù)庫(kù)(WanFang Data)、維普中文期刊數(shù)據(jù)庫(kù)(VIP)中,檢索時(shí)間自數(shù)據(jù)庫(kù)建庫(kù)至2020年1月1日。中文檢索式:(腦卒中 OR 腦梗死 OR 腦中風(fēng)) AND (C反應(yīng)蛋白 OR CRP) AND (基因 OR 多態(tài)性)。英文檢索式:(C reactive protein OR CRP) AND (ischemic stroke OR cerebral infarction OR cerebral ischemia)AND (polymorphism OR polymorphisms OR genotype OR genetic OR gene)。并通過(guò)手動(dòng)檢索文獻(xiàn)的方式,追溯查找可能的相關(guān)文獻(xiàn)。以PubMed為例,其具體檢索策略為:

#1 C reactive protein

#2 CRP

#3 ischemic stroke

#4 cerebral infarction

#5 cerebral ischemia

#6 polymorphism

#7 polymorphisms

#8 genotype

#9 genetic

#10 gene

#11 (#1 OR #2) AND (#3 OR #4 OR #5) AND (#6 OR #7 OR #8 OR #9 OR #10)

1.3 文獻(xiàn)篩選、資料提取及質(zhì)量評(píng)價(jià) 本研究由兩名研究者進(jìn)行文獻(xiàn)篩選,并進(jìn)行交叉核對(duì),不一致時(shí)進(jìn)行討論或提交至第三方解決。提取信息包括第一作者姓(名)、發(fā)表年份、病例組和對(duì)照組的人數(shù)、基因型及等位基因分布數(shù)據(jù)、實(shí)驗(yàn)方法、次要等位基因頻率,對(duì)照組來(lái)源等。納入文獻(xiàn)質(zhì)量采用Newcastle-Ottawa Scale(NOS)量表進(jìn)行評(píng)價(jià),以星級(jí)對(duì)病例組和對(duì)照組的選擇、可比性以及危險(xiǎn)因素的暴露情況進(jìn)行評(píng)價(jià),當(dāng)評(píng)分≥6分為高質(zhì)量文獻(xiàn)。

1.4 研究效應(yīng)測(cè)定指標(biāo) CRP基因SNP與IS發(fā)病風(fēng)險(xiǎn)關(guān)聯(lián)采用以下3種模型。①顯性效應(yīng)模型:以野生型(WT)為對(duì)照,計(jì)算雜合型(HT)和突變型(MT)與IS風(fēng)險(xiǎn)關(guān)聯(lián)程度;②隱性效應(yīng)模型:以WT+HT為對(duì)照,計(jì)算MT與IS風(fēng)險(xiǎn)關(guān)聯(lián)程度;③等位基因模型:rs1800947、rs3093059分別以G等位基因、T等位基因?yàn)閷?duì)照,計(jì)算C等位基因與IS發(fā)病風(fēng)險(xiǎn)的關(guān)聯(lián)程度。

1.5 統(tǒng)計(jì)學(xué)處理 采用Review Manager 5.1軟件進(jìn)行Meta分析。以比值比(odds ratio, OR)和95%置信區(qū)間(95%CI)作為每項(xiàng)研究結(jié)果的研究效應(yīng)指標(biāo)。采用Q檢驗(yàn)評(píng)估研究間的異質(zhì)性[16],若存在顯著異質(zhì)性(P≤0.10,I2>50%),則選用隨機(jī)效應(yīng)模型進(jìn)行合并;若無(wú)顯著異質(zhì)性(P>0.10,I2<50%),則選擇固定效應(yīng)模型進(jìn)行合并。計(jì)算病例組和對(duì)照組 rs1800947位點(diǎn)顯性模型(GG與GC+CC)、等位基因模型(G與C),以及rs3093059顯性模型 (TT與TC+CC),隱性模型(TT+TC 與 CC)、等位基因模型(T與C)比較的合并OR值及95%CI。采取逐一排除的方法進(jìn)行敏感性分析。應(yīng)用STATA 10.0軟件Egger檢驗(yàn)進(jìn)行發(fā)表偏倚評(píng)價(jià)。當(dāng)P<0.05時(shí),認(rèn)為存在發(fā)表偏倚。

2 結(jié) 果

2.1 文獻(xiàn)檢索結(jié)果 本研究經(jīng)初步數(shù)據(jù)庫(kù)檢索共獲得相關(guān)文獻(xiàn)157篇,經(jīng)過(guò)逐層篩選,共納入9篇[8-12,17-20]文獻(xiàn),其中陳聲妹等[17]為兩項(xiàng)研究,故最終共納入10項(xiàng)研究。本研究納入文獻(xiàn)NOS量表評(píng)分均大于6分,提示納入文獻(xiàn)質(zhì)量較好。文獻(xiàn)篩選流程見(jiàn)圖1。

圖1 文獻(xiàn)篩選流程圖

2.2 納入文獻(xiàn)的基本特征(見(jiàn)表1)

表1 納入文獻(xiàn)的基本特征

注: PHWE為Hardy-Weinberg平衡檢驗(yàn);MAF為最小等位基因頻率。

2.3 Meta分析

2.3.1 CRP基因rs1800947位點(diǎn)與IS的相關(guān)性 各研究rs1800947位點(diǎn)各基因型分布見(jiàn)表1。5篇文獻(xiàn)比較了病例組和對(duì)照組rs1800947位點(diǎn)的頻率分布差異[10-12,17-18],其中陳聲妹等[17]分別報(bào)道了海南籍黎族和漢族人群,故最終納入6項(xiàng)研究,累計(jì)病例組721例,對(duì)照組1 043例。因rs1800947位點(diǎn)CC基因型頻率較低,故僅對(duì)顯性模型、等位基因模型進(jìn)行研究。結(jié)果發(fā)現(xiàn),各研究顯性模型比較存在異質(zhì)性(I2=66%,P=0.01),故采用隨機(jī)效應(yīng)模型進(jìn)行Meta分析,合并效應(yīng)量差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義[OR=1.30,95%CI(0.74,2.26),P=0.36]。詳見(jiàn)圖2。各研究等位基因模型也存在異質(zhì)性(I2=69%,P=0.007),采用隨機(jī)效應(yīng)模型合并,結(jié)果顯示[OR=1.25,95%CI(0.72,2.18),P=0.42]。詳見(jiàn)圖3。

圖2 兩組rs1800947位點(diǎn)顯性模型比較的Meta分析

圖3 兩組rs1800947位點(diǎn)等位基因模型比較的Meta分析

2.3.2 CRP基因rs3093059位點(diǎn)與IS的相關(guān)性 各研究rs3093059位點(diǎn)各基因型分布見(jiàn)表1。5篇文獻(xiàn)比較了病例組和對(duì)照組rs3093059位點(diǎn)的頻率分布差異[8-10,19-20],累計(jì)病例組1 790例,對(duì)照組3 065例。顯性模型各研究間比較無(wú)統(tǒng)計(jì)學(xué)異質(zhì)性可接受(I2=23%,P=0.29),采用固定效應(yīng)模型分析,結(jié)果顯示CRP基因rs3093059位點(diǎn)頻率分布降低[OR=0.88, 95%CI(0.78,0.99),P=0.04]。詳見(jiàn)圖4。隱性模型比較亦無(wú)統(tǒng)計(jì)學(xué)異質(zhì)性(I2=11%,P=0.34),采用固定效應(yīng)模型進(jìn)行分析,結(jié)果顯示合并效應(yīng)量無(wú)統(tǒng)計(jì)學(xué)意義[OR=1.09, 95%CI(0.77,1.55),P=0.62]。詳見(jiàn)圖5。等位基因模型比較無(wú)統(tǒng)計(jì)學(xué)異質(zhì)性(I2=38%,P=0.17),采用固定效應(yīng)模型分析,結(jié)果顯示合并效應(yīng)量無(wú)統(tǒng)計(jì)學(xué)意義[OR=0.91, 95%CI(0.82,1.02),P=0.10]。詳見(jiàn)圖6。

圖4 兩組rs3093059位點(diǎn)顯性模型比較的Meta分析

圖5 兩組rs3093059位點(diǎn)隱性模型比較的Meta分析

圖6 兩組rs3093059位點(diǎn)等位基因模型比較的Meta分析

2.4 敏感性分析

2.4.1 rs1800947位點(diǎn)敏感性分析 采用逐一排除的方法進(jìn)行敏感性分析,發(fā)現(xiàn)剔除鄧可等[11]研究后,兩組顯性模型比較結(jié)果發(fā)生反轉(zhuǎn)。兩組顯性模型比較中,各研究無(wú)統(tǒng)計(jì)學(xué)異質(zhì)性(I2=39%,P=0.16),采用固定效應(yīng)模型分析,結(jié)果OR=1.62,95%CI(1.16,2.28),P=0.005。兩組等位基因模型比較,各研究存在統(tǒng)計(jì)學(xué)異質(zhì)性(I2=51%,P=0.09),采用隨機(jī)效應(yīng)模型分析,OR=1.54,95%CI(0.96,2.46),P=0.07。

2.4.2 rs3093059位點(diǎn)敏感性分析 采用逐一排除的方法進(jìn)行敏感性分析,結(jié)果均未發(fā)生方向性變化,提示結(jié)果穩(wěn)定性較好。

2.5 發(fā)表偏倚評(píng)估 采用STATA 10.0軟件對(duì)發(fā)表偏倚進(jìn)行評(píng)價(jià)。rs1800947位點(diǎn)、rs3093059位點(diǎn)顯性模型、隱性模型、等位基因模型進(jìn)行Egger檢驗(yàn)。結(jié)果提示各模型發(fā)表偏倚對(duì)結(jié)果影響較小(P>0.05)。詳見(jiàn)表2。

表2 CRP基因rs1800947和rs3093059發(fā)表偏移的Egger檢驗(yàn)

3 討 論

研究表明,CRP作為動(dòng)脈粥樣硬化的炎性反應(yīng)標(biāo)志物,與IS的發(fā)生密切相關(guān)[4-5]。CRP基因位于1q 21~1q23,基因組全長(zhǎng)2.3 kb,包括1個(gè)內(nèi)含子和2個(gè)外顯子,共編碼206個(gè)氨基酸。既往研究證實(shí)血CRP水平受遺傳因素的影響可達(dá)22%~56%[21-22]。其中,rs1800947G>C是位于第2外顯子的一個(gè)氨基酸同義變異,可能調(diào)節(jié)蛋白質(zhì)表達(dá)量的改變導(dǎo)致疾病發(fā)生。而rs3093059T>C位于啟動(dòng)子區(qū),其可能在一定程度上調(diào)控CRP基因的表達(dá),二者均突變頻率較高。既往研究已證實(shí),二者等位基因突變可影響血壓及CRP水平,且與頸動(dòng)脈粥樣硬化的關(guān)系密切[23-24]。

本研究納入的10項(xiàng)研究,CRP基因rs1800947、rs3093059與IS的相關(guān)性結(jié)果并不一致。部分研究認(rèn)為突變基因型增加IS易感性[10,12,17],部分研究認(rèn)為與IS發(fā)生無(wú)關(guān)[5,9,10,17,20],甚至部分文獻(xiàn)報(bào)道可降低IS的易感性[8,11,19]。各研究種族、對(duì)照來(lái)源、分子生物學(xué)技術(shù)、人群暴露因素等存在差異,可能導(dǎo)致文獻(xiàn)間出現(xiàn)異質(zhì)性。因此,CRP基因多態(tài)性與IS發(fā)生的關(guān)系仍是困擾研究人員的難題。

本研究涉及rs1800947位點(diǎn)包含6項(xiàng)研究,共納入病例組721例,對(duì)照組1 043例,納入研究結(jié)果間存在較大的異質(zhì)性,結(jié)果僅能表明亞洲人群,尤其中國(guó)人群rs1800947多態(tài)性與IS易感性不相關(guān)。而Chen等[10]、Morita等[12]認(rèn)為rs1800947位點(diǎn)C等位基因可增加IS的易感性,鄧可等[11]認(rèn)為C等位基因可降低IS易感性,與本研究結(jié)果不同。通過(guò)敏感性分析,剔除鄧可等[11]研究后,各研究間異質(zhì)性變小,兩組顯性模型、等位基因模型比較結(jié)果發(fā)生反轉(zhuǎn)。各研究結(jié)論的不一致以及本次Meta結(jié)果的不穩(wěn)定性可能仍與目前研究較少有關(guān),雖Egger檢驗(yàn)無(wú)顯著發(fā)表偏移,但仍需要以后開(kāi)展更多關(guān)于CRP基因rs1800947多態(tài)性與IS易感性的研究來(lái)證實(shí)兩者關(guān)系。本研究結(jié)論與國(guó)外Ladenvall等[13]、與Kuhlenbaeumer等[25]研究結(jié)論一致。Ladenvall 等[13]為一項(xiàng)瑞典人群病例對(duì)照研究,納入600例IS病人和600例匹配的對(duì)照人群,證實(shí)rs1800947與IS無(wú)關(guān)。Kuhlenbaeumer等[25]為德國(guó)人群病例對(duì)照研究,納入了1 699例IS卒中病人和1 432例對(duì)照人群,雖證實(shí)rs1800947與IS亞型(小動(dòng)脈閉塞型卒中)發(fā)生密切相關(guān),但與整體IS發(fā)生無(wú)關(guān)。以上兩項(xiàng)研究因數(shù)據(jù)無(wú)法獲得,遺憾未納入本次Meta分析。

本研究對(duì)CRP基因rs3093059多態(tài)性與IS發(fā)生的相關(guān)性共納入5項(xiàng)研究,病例組1 790例,對(duì)照組3 065例,均為中國(guó)人群,顯性模型研究發(fā)現(xiàn)(TC+CC)基因型與IS易感性呈負(fù)相關(guān),而隱性模型與等位基因模型分析得出陰性結(jié)論。納入研究結(jié)果間顯性模型異質(zhì)性小,采用逐一排除的方法進(jìn)行敏感性分析,結(jié)果均未發(fā)生方向性變化,提示結(jié)果穩(wěn)定性較好。本次分析結(jié)果表明,中國(guó)人群攜帶CRP基因rs3093059位點(diǎn)攜帶(TC+CC)基因型較TT基因型IS易感性下降。通過(guò)Egger檢驗(yàn)對(duì)發(fā)表偏倚進(jìn)行定量分析后,發(fā)現(xiàn)rs3093059各模型均無(wú)明顯發(fā)表偏移,提示結(jié)果可信。但由于本研究納入文獻(xiàn)數(shù)較少,部分程度上可能影響結(jié)論的可信度。

本研究亦存在一定的局限性。首先,本研究納入文獻(xiàn)均為病例-對(duì)照研究,無(wú)法避免在人群來(lái)源、分配和實(shí)施等階段帶來(lái)的偏倚風(fēng)險(xiǎn);其次,本研究納入研究數(shù)量少,未能從亞組分析探討異質(zhì)性來(lái)源,可能會(huì)影響結(jié)果的準(zhǔn)確性;最后,納入人群幾乎為中國(guó)人群,尚需擴(kuò)大檢索范圍,補(bǔ)充全球有關(guān)CRP基因與IS關(guān)聯(lián)的研究,進(jìn)一步增強(qiáng)研究對(duì)象的代表性、研究結(jié)果的科學(xué)性。

綜上所述,本研究表明CRP基因rs1800947位點(diǎn)與IS的發(fā)病風(fēng)險(xiǎn)不相關(guān),而人群rs3093059位點(diǎn)攜帶(TC+CC)基因型較TT基因型IS易感性下降,為初步確定IS易感人群提供了部分客觀的循證醫(yī)學(xué)證據(jù)。由于受納入研究數(shù)量的限制,上述研究結(jié)論尚待更多高質(zhì)量研究予以驗(yàn)證?;诖?,需要在以后的研究中統(tǒng)一方法,充分考慮研究種族、對(duì)照來(lái)源、環(huán)境暴露等因素,以增強(qiáng)各研究的科學(xué)性及可比性。

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