鐘立強,王明華,張世勇,姜虎成,陳校輝,朱廣偉,邊文冀*
(1.江蘇省淡水水產(chǎn)研究所,南京210017;2.中國科學院南京地理與湖泊研究所 湖泊與環(huán)境國家重點實驗室 太湖湖泊生態(tài)系統(tǒng)研究站,南京210008;3.中國科學院大學,北京100049)
中國是全球最大的漁業(yè)養(yǎng)殖和水產(chǎn)品消費國家,水產(chǎn)養(yǎng)殖產(chǎn)量占世界水產(chǎn)養(yǎng)殖總產(chǎn)量的60%以上[1]。而內(nèi)陸淡水池塘養(yǎng)殖又是其中最主要的養(yǎng)殖方式,2018 年養(yǎng)殖面積達252.7 萬hm2,養(yǎng)殖產(chǎn)量2 212.2 萬t,占全國水產(chǎn)品總產(chǎn)量的32.9%[2]。池塘養(yǎng)殖時,強調(diào)“養(yǎng)魚先養(yǎng)水”,即魚苗在下塘養(yǎng)殖前,要提前對養(yǎng)殖池塘的水體進行施肥等管理工作,使得養(yǎng)殖水體保持“肥、活、嫩、爽”。從生態(tài)學角度講,這個過程就是通過施肥加速養(yǎng)殖水體富營養(yǎng)化,促進藻類及浮游動物的生長,從而提高水體生產(chǎn)力,為魚類提供充足的生物餌料,形成相對穩(wěn)定并適合魚類生活的微生態(tài)環(huán)境。
與自然水域生態(tài)系統(tǒng)不同,淡水池塘養(yǎng)殖是特殊的人為操縱生態(tài)系統(tǒng)。充足的營養(yǎng)鹽通過上行效應提高魚類產(chǎn)量的同時,大量投入的有機質也為池塘生態(tài)系統(tǒng)食物網(wǎng)的腐屑鏈提供了能量和物質基礎。細菌在腐屑鏈中占據(jù)著重要地位,一方面細菌起著降解作用,是物質和能量的貯存者,另一方面,它們是重要的生產(chǎn)者,能夠將有機質轉化為細菌菌體蛋白,直接被浮游動物和魚類攝食[3]。已有研究表明,細菌群落與水體的營養(yǎng)水平及浮游植物的生物量存在明顯關系[4-5]。養(yǎng)殖池塘中,由于富營養(yǎng)化和魚類的牧食壓力,小型浮游植物和浮游動物占據(jù)優(yōu)勢[6],進而可能對池塘生態(tài)系統(tǒng)中的細菌群落結構造成影響。因此,對養(yǎng)殖池塘水體細菌群落結構開展研究十分必要。本文采用16S rRNA 基因片段高通量測序技術對南京斑點叉尾鮰(Ictalurus punctatus)淡水養(yǎng)殖池塘水體細菌群落的周年變化開展了研究,目的主要是:(1)了解斑點叉尾鮰養(yǎng)殖池塘水體細菌群落組成、多樣性的年度變化特點;(2)明確斑點叉尾鮰養(yǎng)殖池塘水體細菌群落結構的主要影響因子。這些研究結果將對斑點叉尾鮰養(yǎng)殖池塘水體的精細化管理和健康養(yǎng)殖提供幫助。
試驗在江蘇省淡水水產(chǎn)研究所國家斑點叉尾鮰遺傳育種中心養(yǎng)殖基地開展。養(yǎng)殖池塘面積0.21 hm2(50 m×42 m),位于南京市江寧區(qū)祿口鎮(zhèn)(31°77′03″N,118°88′29″E)。養(yǎng)殖開始前一個月抽干池水,漂白粉清塘后,加水至1.5 m左右,池塘中央設置一臺增氧機。4—10 月,每晚23:00 開啟增氧機至次日凌晨4:00,晴天中午11:00 點開啟2 h,保證養(yǎng)殖水體溶氧充足。夏季每月月中補水,春秋季則每2 月補水一次。池塘內(nèi)放入2 747 尾斑點叉尾鮰魚種(平均18.91 g·尾-1),養(yǎng)殖從11月底至次年12月初。每日早晚兩次投喂漂浮性顆粒配合飼料(蛋白含量35%),飼料投喂量為魚體質量的3%左右。
養(yǎng)殖周期內(nèi),每月的月末開展水樣采集。每次上午10:00,利用Schindler 采水器(5 L)采集3處池塘表層50 cm 的水樣,放入滅菌塑料瓶。水樣放入4 ℃保溫箱帶回實驗室,分析時樣品為3 個點水樣的混合樣。取300 mL 混合水樣經(jīng)0.22 μm 的聚碳酸酯膜(Millipore,Cork,Ireland)負壓過濾,得到濾膜樣品,放入2 mL 的無菌離心管,-80 ℃超低溫冰箱冷凍保存,留待DNA 提取。另取200 mL 混合水樣4 ℃低溫保存,進行水質的化學因子分析。
利用多功能水質參數(shù)儀(YSI6920v2,USA)現(xiàn)場測定溫度(Temp)、酸堿度(pH)、總溶解性懸浮物(TDS)、濁度(Tur)以及溶解氧(DO)等環(huán)境因子。塞氏盤測定水體透明度(SD)。其他水質指標在實驗室內(nèi)按以下方法測定:總氮(TN)采用堿性過硫酸鉀消解紫外分光光度法(GB 11894—1989);銨態(tài)氮(NH-N)采用納氏試劑分光光度法(GB 7479—1987);硝態(tài)氮(NO-N)采用酚二磺酸分光光度法(GB 7480—1987);亞硝態(tài)氮(NO-N)采用分光光度法(GB 7493—1987);總磷(TP)和正磷酸鹽(PO-P)采用磷鉬藍比色法(HJ 670-2013);總有機碳(TOC)采用燃燒-非分散紅外吸收法(GB 13193—1991);化學需氧量(CODMn)采用高錳酸鉀滴定法(GB 11892—1989)。水樣經(jīng)Whatman GF/C 0.45μm濾膜過濾后,分光光度法(HJ 897—2017)測定葉綠素a(Chl a)含量。
水樣過濾收集濾膜,用預先經(jīng)75%酒精擦拭過的醫(yī)用剪刀剪碎后,利用Qiagen DNeasy Blood & Tissue Kit試劑盒(Qiagen,CA,USA)提取微生物總DNA。提取的DNA 經(jīng)紫外分光光度計和1%的瓊脂糖凝膠電泳檢測濃度及純度后,-20 ℃保存?zhèn)溆?。以通用引?38F 和806R 擴增16S rRNA 基因V3-V4 高變區(qū)[7],建庫及高通量測序在上海美吉生物醫(yī)藥科技有限公司完成。
生物信息學分析前,先用Trimmomatic軟件[8]去除測序原始序列的引物和barcode 標簽,再用FLASH 軟件[9]對序列進行拼接,使用VSEARCH(1.9.6)將序列以97%相似性聚類成操作分類單元(Operational taxonomic units,OTUs),比對的參考數(shù)據(jù)庫是Silva_132 16SrRNA database(http://www.arb-sliva.de)[10]。
所有統(tǒng)計分析及可視化分析均利用R 語言中的vegan和ggplot2程序包(Version 3.2.2)以及上海美吉生物醫(yī)藥科技有限公司I-sanger 云平臺完成。多樣性分析前,根據(jù)每個樣本中最少的序列數(shù)進行抽平。利用mothur 軟件計算α 多樣性[11]。計算β 多樣性前,對抽平后的物種數(shù)據(jù)進行Hellinger 轉化[12],再進行非度量多維尺度分析(Nonmetric multi-dimensional scaling,NMDS)[13]。對環(huán)境因子進行999次Monte Carlo置換檢驗的前向選擇后,采用冗余分析(Redundancy analysis,RDA)對環(huán)境因子與微生物群落進行典范對應分析[14]。采用相似性分析(Analysis of similarities,ANOSIM)檢驗季節(jié)間差異。最后,通過多物種線性差異判別分析(Linear discriminant analysis effect size,LEfSe),根據(jù)分類學組成對樣本按照不同分組條件進行線性判別分析(LDA),找出具有季節(jié)顯著性差異的菌群[15]。
年度養(yǎng)殖試驗過程中,水溫(Temperature)呈現(xiàn)出明顯的季節(jié)性變化,從冬季的1月末逐步升高,夏季7月末達到峰值33.78 ℃,之后緩慢下降,除春季和秋季外,其他季節(jié)間水溫都存在顯著性差異(P<0.05)。總溶解性懸浮物(TDS)和水體透明度(SD)都呈現(xiàn)出持續(xù)下降的趨勢,且都是冬春季顯著高于夏秋季(P<0.05)。全年水樣pH 介于7.68~9.50,始終保持偏堿性,冬季水體的堿性顯著強于夏季(P<0.05)。水體溶氧(DO)含量為6.12~16.39 mg·L-1,適合魚類養(yǎng)殖,冬季水體的溶氧含量也顯著高于其他3 個季節(jié)(P<0.05)。水體總氮(TN)和總磷(TP)濃度始終維持較高水平,一直處于富營養(yǎng)化狀態(tài),四季間TN 變化不大,但冬季TP 濃度顯著低于夏秋季節(jié)(P<0.05)。氨氮(NH+4-N)、亞硝酸鹽(NO-2-N)、硝酸鹽(NO-3-N)隨季節(jié)的變化表現(xiàn)出一定的差異,但正磷酸鹽(PO3-4-P)則全年無顯著性變化??傆袡C碳(TOC)也表現(xiàn)為冬春季顯著高于夏秋季(P<0.05)。葉綠素a(Chl a)夏秋季要高于冬春季,其中夏季顯著高于其他3 個季節(jié),并在7 月達到年度峰值,冬季的葉綠素a 濃度最低。水體理化特征見表1。
表1 斑點叉尾鮰養(yǎng)殖池塘水體理化性質Table 1 Summary of physicochemical parameters for water samples of channel catfish pond
經(jīng)優(yōu)化處理后,共獲得356 877條序列,平均每個樣品有29 741 條高質量序列,序列平均長度為434.55 bp。這些序列被聚類為1 023 個OTUs。稀釋曲線分析中所有樣本的都接近平緩,表明本次試驗抽樣充分,測序深度足以反映每個樣本細菌群落的生物信息。
選取Ace指數(shù)、Chao1指數(shù)、Shannon指數(shù)和Simp-son指數(shù)用來反映養(yǎng)殖池塘水體細菌群落的物種豐富度和多樣性。結果顯示(圖1),養(yǎng)殖年度內(nèi),Ace 指數(shù)和Chao1指數(shù)變化趨勢較為一致:冬春季呈S形變化,最小值出現(xiàn)在冬季2 月,并與相鄰的1 月以及初春的3 月形成細菌群落物種豐富度的小低谷,之后的3 個月又持續(xù)上升;7 月Ace 指數(shù)和Chao1 指數(shù)大幅下降,之后鋸齒狀震蕩上升,并在10 月達到年度最大值。使用單因素方差分析(ANOVA)對4 個季度的Ace 指數(shù)和Chao1 指數(shù)進行多重比較,結果表明,兩個指數(shù)只有秋季和冬季之間存在顯著性差異(P<0.05)。年度內(nèi)養(yǎng)殖池塘水體細菌群落的Shannon 指數(shù)和Simpson指數(shù)變化趨勢呈相反的趨勢,表明細菌群落多樣性變化相對穩(wěn)定,預測結果較為一致。Shannon 指數(shù)和Simpson指數(shù)為對應的“山”字狀,7月是細菌群落多樣性的最低值,且與其他月份差別較大,3月則是倒數(shù)第二低值,其他月份變化都不大(圖1)。單因素方差分析與多重比較(ANOVA)結果顯示,4 個季度Shannon指數(shù)和Simpson指數(shù)間無顯著性差異(P>0.05)。
圖1 斑點叉尾鮰養(yǎng)殖池塘水體微生物群落α多樣性Figure 1 The alpha diversity of bacterial community in channel catfish pond
使用非度量多維尺度分析(NMDS)展示養(yǎng)殖池塘水樣細菌群落的β 多樣性。NMDS 分布圖(圖2A)顯示,所有樣本呈現(xiàn)出較好的季節(jié)性排列趨勢,即4個季度的樣本可以被明顯地區(qū)分,同一季度內(nèi)的樣品間距離更近,其微生物群落也更加相似。同時,整個年度水體細菌群落也呈現(xiàn)出連續(xù)的演替特征,從排序圖的左側連續(xù)往右排列,只有夏季樣品的群落稍有例外,與秋季略有重疊,但整體排在右側。NMDS 分析的Stress值為0.042,也表明排序結果可靠。細菌群落層次聚類分析的結果與NMDS類似,所有群落聚為兩簇(圖2B):夏季和秋季樣品(11 月樣品除外)聚為一簇,冬季和春季的樣品聚為另一簇。各分簇內(nèi)部,每個季節(jié)的樣品也聚類為一支。
1 023 個OUT 被注釋為27 個門(Phyla)、60 個綱(Classes)和347個屬(Genera)。為了減少群落的復雜性和冗余性,相對豐度低于1%的群落都歸為稀有種,并為“Others”[16]。
養(yǎng)殖池塘水體樣本中OTU 數(shù)量從高到低呈現(xiàn)為秋季>春季>夏季>冬季。4個季節(jié)樣本共享的OUT有324個,占全部OTU 的31.67%,3個季節(jié)和2個季節(jié)樣品間共享OUT分別為274個和267個,占比26.78%和26.09%。而單季樣品獨有的OUT 數(shù)量最少,只有158個,占比15.44%。其中,冬季和秋季樣品獨有OUT 最多,分別為48個和47個,占比4.69%和4.59%,夏季樣品獨有OUT最少,僅29個,占比2.83%。
圖2 斑點叉尾鮰養(yǎng)殖池塘水體微生物群落NMDS排序圖和層級聚類分析Figure 2 NMDS plot and hierarchical clustering analysis of the compositional dissimilarities of the bacterial communities
ANOSIM 檢驗表明4個季度養(yǎng)殖池塘水體樣品間細菌群落組成存在顯著性差異(P<0.01)。然而,分析細菌群落結構組成,所有樣品在門水平上組成較為相似。相對豐度從高到低依次為:藍藻門Cyanobacteria(29%)、放線菌門Actinobacteria(25%)、變形菌門Proteobacteria(20%)和 擬 桿 菌 門 Bacteroidetes(12%),這4 個門占全部群落的86%。而疣微菌門Verrucomicrobia(3.9%)、浮 霉 菌 門Planctomycetes(3.2%)、厚壁菌門Firmicutes(2.5%)、綠菌門Chlorobi(1.8%)和綠彎菌門Chloroflexi(1.4%)相對豐度都低于4%。
門水平上,冬季水體樣品中放線菌門相對豐度最高,之后依次為變形菌門、藍藻門以及擬桿菌門。而春、夏、秋3 季的水體樣品中藍藻門相對豐度最高,之后分別為放線菌門、變形菌門和擬桿菌門。各個季度樣品內(nèi)其他菌門的相對豐度都低于5%。從時間角度上看,養(yǎng)殖池塘水體中4 個主要菌門的相對豐度呈現(xiàn)出截然不同的變化趨勢(圖3)。藍藻門的相對豐度呈單峰形變化,夏季達到最高峰(37%),春秋季略有下降(30%和32%),冬季最低(17.45%)。其中,3 月和7 月水體中藍藻門相對豐度出現(xiàn)了兩次明顯的升高,分別為49.97%和56.77%。放線菌門相對含量則表現(xiàn)為增長的趨勢,從春季的20%一直增加至冬季的29%。變形菌門1 年內(nèi)的相對豐度保持相對穩(wěn)定,維持在20%左右。擬桿菌門則呈U字形變化,即冬春季高(15%左右),夏秋季低(8.5%)。
4 個季度樣品間的細菌群落結構比較顯示,厚壁菌門、綠菌門和Saccharibacteria門存在顯著性差異(P<0.05)。其中,冬春季的厚壁菌門相對數(shù)量顯著高于夏秋季,綠菌門相對數(shù)量則是夏秋季顯著高于冬春季,而秋季Saccharibacteria 門的相對數(shù)量顯著高于其他3個季節(jié)。
圖3 斑點叉尾鮰養(yǎng)殖池塘水體微生門級水平細菌群落結構的年度變動Figure 3 Annual dynamic of bacterial community composition at the phylum level
屬水平上,養(yǎng)殖池塘水體的優(yōu)勢菌屬為hgcI_clade、藍細菌屬norank_c__Cyanobacteria、聚球藻屬Syn?echococcus、CL500-29、CL500-3和多核桿菌屬Polynu?cleobacterium。聚類熱圖表明,屬水平上,所有樣品聚為冬春和夏秋兩簇(圖4)。其中,腸球菌屬Enterococ?cus、芽孢桿菌屬Bacillus、乳球菌屬Lactococcus、單胞菌屬Polaromonas、紅育菌屬Rhodoferax和黃桿菌屬Flavobacterium的相對豐度在冬春季明顯高于夏秋季。而甲基嗜酸菌屬Candidatus_Methylacidiphilum、球衣菌屬Sphaerotilus、玫瑰單胞菌屬Roseomonas、不動桿菌屬Acidibacter和湖沉積桿菌屬Limnobacter的相對豐度則是夏秋季明顯高于冬春季。
圖4 養(yǎng)殖池塘水體微生物屬級水平的分層聚類熱圖Figure 4 Bacterial community heatmap analysis in genus level
4個季度樣品間的細菌群落結構比較在3個菌門發(fā)現(xiàn)了顯著性差異,在時間維度上進一步采用LefSe軟件對養(yǎng)殖水體細菌群落樣本進行線性判別分析(LDA),以找到各個季節(jié)顯著性對應的群落或物種。對LDA 判別值大于3.5 的細菌類群進行分析,共有不同分類水平的53個細菌類群,在4個季節(jié)間具有顯著差異(圖5)。春、夏和秋3 個季節(jié)的顯著優(yōu)勢種相對集中,主要分布于一兩個門。其中,春季的水體中,優(yōu)勢性菌群主要集中于厚壁菌門中的腸球菌屬Entero?coccus,以及藍藻門中的SubsectionIV。夏季水樣中,優(yōu)勢性菌群集中于變形菌門中的δ-變形菌綱Deltaproteobacteria,寡彎菌屬Oligoflexaceae,以及變形菌門中的球衣菌屬Sphaerotilus和藍藻門中的顫藻屬Oscillatoria。秋季的樣品優(yōu)勢菌群則主要集中于綠菌門中的OPB56 屬、Saccharibacteria 門,以 及 藍 藻 門 中 的 屬FamilyI和變形菌門中的紅螺菌目Rhodospirillales 與玫瑰單胞菌屬Roseomonas。冬季具有顯著優(yōu)勢菌群最多,共有2 個綱、6 個目、9 個科和10 個屬。其中,疣微菌門中的疣微菌綱Verrucomicrobiae 疣微菌科Verrucomicrobiaceae、豐佑菌綱OpitutaeVadin中的HA64屬、放線菌門中的PeM15 綱、從棒狀桿菌綱Corynebacteriales中的分枝桿菌屬Mycobaterium、厚壁菌門中的芽孢桿菌目Bacillales 芽孢桿菌屬Bacillus、鏈球菌科Streptococcaceae 乳球菌屬Lactococcus、變形菌門中的紅細菌目Rhodobacterales 到紅桿菌屬Rhodobacte?raceae、MNG 科、以及其他零星分布的普雷沃氏菌科Prevotellaceae、球形紅桿菌屬Candidatus_Aquirestis、嗜甲基菌屬Methylotenera、單胞菌屬Polaromona和Limnohabitans屬。
圖5 斑點叉尾鮰養(yǎng)殖池塘四季間差異性菌群多物種線性差異判別分析Figure 5 LEfSe identified the most differentially abundant taxa in the channel catfish pond among four seasons
與樣本菌群組成相關的環(huán)境因子很多,但其中部分因子存在共線性,所以先進行篩選,保留相互作用較小的環(huán)境因子。方差膨脹因子(Variance inflation factor,VIF)分析表明自變量間的多重共線性關系嚴重,過濾掉VIF 大于20的環(huán)境因子NO-3-N 和Chl a,多次篩選后,剩下的環(huán)境因子對應的VIF 值全部小于20。Monte Carlo 排序檢驗表明Temp、TDS、pH、NO2-N、TOC與細菌群落之間存在顯著的相關性(P<0.05)。這5個因子對細菌群落格局的影響大?。╮2)依次順序是:TDS>Temp>pH>NO-2-N>TOC(表2)。
利用前置檢驗挑選出來的5 個與細菌群落顯著相關的環(huán)境因子進行RDA 排序分析,結果表明,RDA1 軸和RDA2 軸分別解釋了細菌群落變異的44.53%和10.98%,主要菌群被聚為2 簇(圖6)。第1簇由冬季和春季樣品組成,第2 簇由夏季和秋季樣品組成,兩簇被RDA2軸分隔。其中,第1簇冬春季樣本分布比較緊密,主要受pH、TOC和TDS的影響;第2簇夏秋季樣本分布較為分散,且夏秋季樣品被RDA1 軸分 隔,主 要 受NO-2-N 和Temp 的 影 響。RDA 結 果 顯示,斑點叉尾鮰養(yǎng)殖池塘水體微生物具有比較明顯的季節(jié)性,4個季節(jié)的樣品沿著RDA1軸從左往右排列。
本文通過分析斑點叉尾鮰養(yǎng)殖池塘水體細菌群落的年度變化過程,闡明斑點叉尾鮰養(yǎng)殖池塘水體細菌群落的變化規(guī)律。研究表明,養(yǎng)殖池塘的微生物群落與營養(yǎng)鹽、水質、養(yǎng)殖對象及日常管理都具有重要的關系[3]。本研究結果表明,斑點叉尾鮰養(yǎng)殖池塘水體優(yōu)勢菌群為藍藻門、放線菌門、變形菌門和擬桿菌門,與三疣梭子蟹和吉富羅非魚養(yǎng)殖塘水體較為相似,但是主要優(yōu)勢菌群的相對豐度排序略有差別[17-18]。不同養(yǎng)殖品種,甚至同一養(yǎng)殖品種的不同養(yǎng)殖階段,其養(yǎng)殖水體的微生物群落都有明顯的差別,這與養(yǎng)殖對象的棲息方式、食性特征以及養(yǎng)殖周期等差異有關[18]。斑點叉尾鮰和吉富羅非魚養(yǎng)殖過程中投餌量大,產(chǎn)生大量的殘餌和糞便,往往造成過量的營養(yǎng)物輸入至養(yǎng)殖池塘,同時,斑點叉尾鮰和羅非魚都是底棲性魚類,因此優(yōu)勢細菌群落較為相似。
ANOSIM 檢驗表明斑點叉尾鮰養(yǎng)殖池塘水體4個季度樣品間細菌群落組成存在顯著性差異(P<0.01),NMDS 分析(圖2A)也驗證了所有樣本呈現(xiàn)出較好的季節(jié)性排列趨勢。斑點叉尾鮰養(yǎng)殖池塘水體優(yōu)勢菌中,擬桿菌門相對豐度冬春季顯著高于夏秋季節(jié),LefSe 分析進一步表明,主要差異菌群為冬季的普雷沃氏菌科Prevotellaceae、球形紅桿菌屬Candida?tus_Aquirestis。普雷沃氏菌科Prevotellaceae 能夠利用和降解蛋白質及各類有機物[19],而斑點叉尾鮰養(yǎng)殖池塘的總有機碳顯著高于夏秋季節(jié),為普雷沃氏菌科細菌的繁殖提供了適合的環(huán)境。球形紅桿菌屬Candi?datus_Aquirestis廣泛分布于內(nèi)陸高硬度水體,冬春季也會在自然水體中形成明顯的生物量高峰,秋冬季則維持較低的豐度[20],與斑點叉尾鮰養(yǎng)殖池塘水體的明顯季節(jié)性變化一致。
表2 環(huán)境因子對排序結果的相關性系數(shù)及顯著性檢驗值Table 2 Coefficient correlations between physicochemical parameters and RDA axis
圖6 細菌群落與環(huán)境因子之間的RDA分析Figure 6 RDA bioplot of the distribution of bacterial community and environmental variables
藍藻門作為廣泛分布于各類水體的細菌門類,其豐度狀況與水體富營養(yǎng)化程度密切相關。水產(chǎn)養(yǎng)殖環(huán)境中,因為營養(yǎng)鹽和有機物的密集投入,水體長期維持富營養(yǎng)化狀態(tài),藍藻水華爆發(fā)已經(jīng)變得越來越頻繁[21]。斑點叉尾鮰池塘的藍藻含量雖然沒有發(fā)現(xiàn)顯著的季節(jié)性差異,但是其相對豐度依然存在季節(jié)性的變化規(guī)律。春季3月和夏季7月斑點叉尾鮰養(yǎng)殖池塘出現(xiàn)了兩次藍藻生物量的高峰,藍藻生物量占總細菌生物量的49.98%和56.77%,同時,3 月和7 月藍藻生物量的上升導致池塘水體細菌群落α 多樣性顯著降低。LefSe分析表明,春、夏和秋季藍藻門的顯著優(yōu)勢菌群各不相同。春季優(yōu)勢藍藻主要是念珠藻目的g__norank_f__FamilyI_o__SubsectionIV屬,大 都 呈 絲狀,形成厚壁孢子,在長換水周期、高pH、高溫和高光照強度等條件下,更具有優(yōu)勢[22]。斑點叉尾鮰養(yǎng)殖池塘水體沒有劇烈波動,冬春季pH 一直較高,3 月末溫度已經(jīng)接近15 ℃,營養(yǎng)鹽也一直維持較高濃度,因此在3月末,藍藻迅速生長,并導致了葉綠素a濃度的上升。之后4 月藍藻大量死亡并氧化分解,消耗水體溶氧并產(chǎn)生乳酸等酸性物質,導致4 月池塘溶氧含量降低,pH 也略有下降。夏季優(yōu)勢的顫藻屬Oscillatoria是常見的淡水藍藻群體,呈絲狀不分枝,會節(jié)律性顫動。斑點叉尾鮰養(yǎng)殖池塘水體夏季顫藻屬快速生長,成為優(yōu)勢類群,并在7 月形成藍藻水華的最高峰,此時池塘水體葉綠素a 濃度也是全年最高,這個過程與開放湖庫的夏季藍藻水華演替較為相似[23]。秋季g__norank_f__FamilyI_o__SubsectionI屬的藍藻替代顫藻屬成為優(yōu)勢藍藻類群,該屬歸屬于藍藻綱Subsection I,皆為單細胞藍藻,有空泡,并合成藻膽蛋白,是湖泊、水庫等天然水體中秋季常見的水華藍藻種類[24]。
Monte Carlo 檢驗和RDA 排序分析表明斑點叉尾鮰養(yǎng)殖池塘水體細菌群落與環(huán)境因子間具有顯著的相關性,主要的環(huán)境因子包括TDS、Temp、pH、NO-N和TOC。5 個環(huán)境因子都表現(xiàn)出明顯的季節(jié)性差異,冬春季的TDS、pH 和TOC 顯著高于夏秋季,Temp 和NO-N 則是夏秋季顯著高于冬春季。其中,TDS 和Temp 對細菌群落的影響最大。TDS 能干擾水體的氧傳遞和降低細菌活性,從而影響硝酸鹽、有機物和COD 的去除[25]。大量的研究都表明溫度對細菌群落組成有重要影響。溫度會影響細菌降解有機物、再生營養(yǎng)以及參與微食物鏈等方面的生物學功能[26-27],同時還對水體浮游植物的演替產(chǎn)生影響,改變水體微生態(tài)系統(tǒng)[28],從而驅動細菌群落組成的改變。水溫季節(jié)性的波動造成棲息環(huán)境的季節(jié)性變化,進一步推動水體細菌群落組成呈現(xiàn)出季節(jié)性的響應[29]。此外,不同菌群對溫度的敏感差異,也會導致不同溫度下細菌群落結構的差異[30]。斑點叉尾鮰養(yǎng)殖池塘春季和夏季的水溫升高提高了藍藻門的生長速率,并給藍藻門帶來了競爭優(yōu)勢[31],最終與其他因素共同導致斑點叉尾鮰養(yǎng)殖池塘3月和7月的兩次藍藻爆發(fā)。
pH 被認為是生物化學地球轉換過程中重要的調(diào)控因子,它能調(diào)節(jié)水體中離子和微量金屬的利用率,從而對細菌的生長起到抑制或者促進的作用[32]。養(yǎng)殖水體光合作用的強弱對pH影響較大,因此pH會隨著光照強度和初級生產(chǎn)力的改變呈現(xiàn)出明顯的季節(jié)性變化。本研究中pH 冬春明顯高于夏秋,這可能與本試驗池塘水體初級生產(chǎn)力相對較低有關,葉綠素a濃度明顯低于草魚、烏鱧和羅非魚等品種的養(yǎng)殖池塘[33-34]。同時,夏季池塘補水量大,可能也會引起pH的降低。N 和P 一直被認為是細菌和浮游植物生長的限制性因子[35],TOC 也被認為能夠直接影響細菌的生物量和組成,從而改變細菌群落結構[36]。然而,斑點叉尾鮰養(yǎng)殖水體一直呈人為的富營養(yǎng)化狀態(tài),大部分的營養(yǎng)鹽(TN、NH-N、NO-N、TP 和PO-P)都沒有對細菌群落結構的塑造起到顯著性作用。而NO-N是水體中氮素存在的一個中間態(tài),本研究池塘溶氧持續(xù)充足,整個養(yǎng)殖年度內(nèi)NO-N 濃度一直維持在較低的狀態(tài)。因此,NO-N的低濃度加上夏秋高冬春低的波動,會對細菌群落如亞硝酸鹽硝化細菌等產(chǎn)生顯著的影響。斑點叉尾鮰養(yǎng)殖池塘水體的C/N[可由TOC(/NH-N+NO-N+NO-N)粗略計算]只有7~14,遠低于細菌生長的最適范圍20~30[37],因此C(主要是TOC)是斑點叉尾鮰養(yǎng)殖池塘細菌生長的限制因子。擬桿菌門的菌群能夠高效利用低碳物質[38],冬春季的TOC 濃度顯著高于夏秋季節(jié)(P<0.05,表1),因此冬春季的擬桿菌門Bacteroidetes 豐度也顯著高于夏秋季。
本研究運用16S rDNA 擴增技術研究斑點叉尾鮰養(yǎng)殖池塘微生物群落,結果表明斑點叉尾鮰養(yǎng)殖池塘水體細菌群落結構呈現(xiàn)出季節(jié)性變化,優(yōu)勢菌群為藍藻門、放線菌門、變形菌門和擬桿菌門。環(huán)境因子中,總溶解性懸浮物、水溫、酸堿度、亞硝酸鹽和總有機碳對水體細菌群落結構有顯著的影響。但是本研究局限于一個地方的斑點叉尾鮰池塘主養(yǎng)模式,而斑點叉尾鮰養(yǎng)殖已經(jīng)遍布全國,因此,后續(xù)研究仍需進一步針對斑點叉尾鮰的不同養(yǎng)殖模式在不同地域開展大尺度的養(yǎng)殖池塘微生物群落結構比較,從而為不同地域不同模式的斑點叉尾鮰養(yǎng)殖管理提供精確理論指導。