李麗 陳弟詩 陳斌 鄧飛 邵靚 丁夢蝶 周莉媛
摘要:豬腹瀉相關(guān)的冠狀病毒是可引起豬只嘔吐、腹瀉和脫水等相關(guān)癥狀的傳染性疾病,仔豬感染后死亡率可達(dá)100%,對養(yǎng)豬業(yè)造成了巨大的經(jīng)濟(jì)損失,為此,眾多學(xué)者對該病的診斷與檢測方法進(jìn)行了大量的研究,建立了臨床診斷、病原分離等傳統(tǒng)的診斷方法以及免疫學(xué)、分子生物學(xué)等新興診斷方法。研究豬腹瀉相關(guān)冠狀病毒的診斷與檢測方法對該類疫病的防控具有重要的意義。對豬腹瀉相關(guān)冠狀病毒的檢測方法研究進(jìn)展進(jìn)行了綜述。
關(guān)鍵詞:豬;腹瀉;冠狀病毒;病原學(xué);免疫學(xué);分子生物學(xué);檢測方法
中圖分類號:S858.28? ? ? ? 文獻(xiàn)標(biāo)識碼:A? ? ? ? 文章編號:1007-273X(2020)07-0011-03
豬腹瀉病是危害養(yǎng)豬業(yè)的主要傳染病之一,引起豬只腹瀉的病因很多,包括有營養(yǎng)性腹瀉、病毒性腹瀉、細(xì)菌性腹瀉和寄生蟲感染等,其中以病毒性腹瀉的發(fā)生率最高、危害最嚴(yán)重[1]。常見引起豬只腹瀉的病毒有豬流行性腹瀉病毒(Porcine epidemic diarrhea virus,PEDV),豬傳染性胃腸炎病毒(Transmissible gastroenteritis virus of swine,TGEV)和豬Delta冠狀病毒(Porcine deltacorona virus,PDCoV)[2]。這3種病毒均屬冠狀病毒科冠狀病毒亞科。病毒分類委員會將冠狀病毒分為甲型冠狀病毒、乙型冠狀病毒、丙型冠狀病毒和丁型冠狀病毒,其中PEDV和TGEV屬于甲型冠狀病毒,PDCoV屬于丁型冠狀病毒[3]。冠狀病毒是一種有囊膜的單股正鏈RNA病毒,病毒顆粒呈球形或橢圓形,大小在60~220 nm,基因組全長25~32 kb,含有多個開放閱讀框(Open reading frame,ORF)。豬冠狀病毒基因組的結(jié)構(gòu)、復(fù)制方式和病毒蛋白的表達(dá)與人及其他動物的冠狀病毒相似,大多數(shù)冠狀病毒包含四種結(jié)構(gòu)蛋白:一個大的表面糖蛋白(Spike或S),一個小的膜蛋白(SM),一個完整的膜糖蛋白(M)以及一個核衣殼蛋白(N)。甲型冠狀病毒其基因組由5非編碼區(qū)、0RF1、ORF1b、S、ORF3、E、M、N、3非編碼區(qū)組成。丁型冠狀病毒基因組從5-3依次為5非編碼區(qū)、ORF1ab、S、E、M、NS6、N、NS7、N和3非編碼區(qū)組成[4]。其中S基因保守區(qū)域,M基因和N基因常用作檢測的靶基因。PEDV、TGEV和PDCoV都能引起仔豬發(fā)生嘔吐和水樣腹瀉,嚴(yán)重還會導(dǎo)致厭食、脫水等癥狀,潛伏期短,傳播迅速,多發(fā)生在冬季,且以混合感染比較常見。病理剖檢以小腸內(nèi)壁明顯變薄,腸腔內(nèi)積滿黃色黏稠液體以及腸壁小腸黏膜絨毛萎縮、壞死為主要特征。這3種病臨床癥狀相似且常有混合感染的情況,給病原的鑒別診斷帶來了一定難度,因此對這3種病原進(jìn)行準(zhǔn)確快速的鑒別診斷,對該病的防控具有重要的意義。本文對此類疫病的病原檢測方法研究進(jìn)展進(jìn)行了綜述。
1? 病原學(xué)檢測
1.1? 病毒的分離與鑒定
病原的分離鑒定是傳統(tǒng)的檢測方法,常采用細(xì)胞培養(yǎng),雞胚接種和動物接種3種方法分離病原,其中細(xì)胞培養(yǎng)是目前分離冠狀病毒的最常用的方法??捎秘i唾液腺、豬小腸上皮和豬甲狀腺原代細(xì)胞以及Vero、McClurkinST、LIC-PK和豬腎傳代細(xì)胞細(xì)胞系進(jìn)行病毒的分離培養(yǎng),根據(jù)病毒在細(xì)胞培養(yǎng)中增殖的指標(biāo)即細(xì)胞代謝變化、血細(xì)胞吸附(HAd)、干擾現(xiàn)象和細(xì)胞病變效應(yīng)(CPE)評價病毒的感染效果,病毒數(shù)量與感染性指標(biāo)通過蝕斑實(shí)驗(yàn)(PFU)和50%組織細(xì)胞感染量(TCID50)進(jìn)行測定。常用Vero細(xì)胞分離PEDV,ST細(xì)胞分離TGEV以及LIC-PK細(xì)胞分離PDCoV。如任玉鵬等[5]等將疑似感染PEDV病豬病料處理后接種Vero細(xì)胞,經(jīng)連續(xù)傳代成功分離到PEDV DY毒株;孫秋燕等[6]利用ST細(xì)胞成功分離到兩株TGEV;秦毅斌等[7]利用LLC-PK傳代細(xì)胞系分離到一株P(guān)DCoV。研究證實(shí),胰蛋白酶、氟林蛋白酶以及TMPRSS2蛋白酶等參與冠狀病毒S蛋白的激活,在冠狀病毒的感染和釋放中起重要作用,因此可通過添加蛋白酶增加相關(guān)病毒的分離率[8]。
1.2? 病毒的電鏡觀察
電鏡觀察也是檢測病原常用的方法之一,可通過電鏡負(fù)染法觀察病原的分布,在發(fā)病期間,病毒存在于病豬的許多器官中。尤其在空腸、十二指腸和腸系膜淋巴結(jié)中含病毒量最高。通過電鏡觀察,病毒粒子多分布于胞漿的空泡和腸壁微絨毛間隙,但這3種病原均為冠狀病毒且形態(tài)相似,普通透射電鏡觀察時很難區(qū)分,需要利用免疫電鏡技術(shù)進(jìn)行鑒別,免疫電鏡技術(shù)是一種將含有特殊標(biāo)記的抗原與抗體相互配對融合,借助特殊電子顯微鏡對抗原做出定位、定性和半定量的技術(shù)手段。王繼科等[9]設(shè)計出能快速定性PEDV和TGEV且具備3次篩選作用的電鏡技術(shù),施雯[10]對PEDV進(jìn)行分離培養(yǎng)鑒定,借助普通透射電鏡和免疫電鏡對比觀察,證實(shí)其表面具有典型的纖突結(jié)構(gòu),該方法具有高度精確、快速靈敏等優(yōu)點(diǎn),但是需要通過特殊的電鏡儀器,造價昂貴且不適用于大批量的樣本檢測。
2? 免疫學(xué)診斷技術(shù)
2.1? 血清中和實(shí)驗(yàn)
中和實(shí)驗(yàn)的原理是利用抗原抗體的特異性結(jié)合,當(dāng)兩者結(jié)合后會減弱或消滅病毒感染力的實(shí)驗(yàn)。動物受到病毒感染后,體內(nèi)產(chǎn)生特異性中和抗體,并與相應(yīng)的病毒粒子呈現(xiàn)特異性結(jié)合,可通過檢測病原或產(chǎn)生的相應(yīng)抗體進(jìn)行確診。具體操作方法包括豬的接種法和細(xì)胞培養(yǎng)法,根據(jù)發(fā)病或細(xì)胞病變的情況判定結(jié)果。中和試驗(yàn)常用的稀釋方法有兩種,一種是固定病毒量與等量系列倍比稀釋的血清混合,另一種是固定血清用量與等量系列對數(shù)稀釋的病毒混合。此類檢測方法操作簡單,檢測快速,適用于大批量的樣本檢測,但抗體間存在交叉反應(yīng),特異性不強(qiáng),且因豬從感染病毒到產(chǎn)生抗體需要一定時間,所以也不適用于早期診斷。
2.2? 酶聯(lián)免疫吸附實(shí)驗(yàn)
酶聯(lián)免疫吸附實(shí)驗(yàn)(ELSA)是用特殊標(biāo)記抗原或抗體以檢測與之對應(yīng)的抗體或抗原的微量診斷技術(shù),也是目前實(shí)驗(yàn)室使用最廣泛的檢測方法之一。Rodak等[11]采用PEDV M蛋白的單抗設(shè)計出競爭ELISA,結(jié)果表明該方法適用于調(diào)查分析豬腹瀉病。張清真[12]建立了TGEV雙抗夾心ELASA檢測方法,最低檢測量為17.5 ng/μg,靈敏度高。Thachil等[13]利用PDCoV S1蛋白保守區(qū)域作為抗原建立間接ELISA方法。如今還衍生出細(xì)胞ELISA和ABS-ELASA等更高效、更快捷的新型檢測技術(shù)。該方法雖然具備很好的靈敏度、特異性和穩(wěn)定性,診斷速度快且適用于大量的血清樣品鑒別分析,但是容易產(chǎn)生交叉反應(yīng),造成誤檢。
2.3? 膠體金試紙條檢測技術(shù)
膠體金是一種常用的標(biāo)記技術(shù),是以膠體金作為示蹤標(biāo)志物應(yīng)用于抗原抗體的一種新型技術(shù),目前在檢測中的應(yīng)用主要是免疫層析法和快速免疫金滲濾法,此方法檢測病原具有簡單、快速、準(zhǔn)確和無污染等優(yōu)點(diǎn)。賈宇旻等[14]等建立了快速檢測豬流行性腹瀉病毒(PEDV)的膠體金免疫層析方法(GICA),與RT-PCR陽性符合率為93%,檢測快速且對檢測人員無特殊要求,適合豬場腹瀉病原的快速檢測,但檢測結(jié)果有待進(jìn)一步確認(rèn)。
3? 分子生物學(xué)診斷技術(shù)
3.1? 聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)
聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)是實(shí)驗(yàn)室常用且十分重要的分子生物學(xué)技術(shù)之一,它是以待檢或需要特定擴(kuò)增的DNA片段為模板,利用DNA聚合酶的酶促反應(yīng),通過特異性引物,經(jīng)變性、退火和延伸組成一個完整反應(yīng)周期進(jìn)行循環(huán)復(fù)制。由于異物序列與目的基因必須嚴(yán)格配對,這也決定PCR方法具有很高的特異性。隨后出現(xiàn)的商品化PCR檢測試劑盒使得該檢測技術(shù)在操作上更加簡單、方便和快捷,得到廣泛應(yīng)用。在實(shí)際生產(chǎn)中,人們根據(jù)不同需求,運(yùn)用傳統(tǒng)生物技術(shù)結(jié)合近代基因工程衍生出熒光定量PCR、原位PCR、巢氏PCR、多重PCR和恒溫隔絕式PCR等一些新型的PCR方法。其中針對M基因、N基因和S基因保守區(qū)域設(shè)計引物的RT-PCR法是目前臨床應(yīng)用中最常用的方法,該方法特異性好,成本低,結(jié)果準(zhǔn)確。韋學(xué)雷等[15]針對PEDV、PDCoV和TGEV的M、N、S基因保守區(qū)域設(shè)計引物,建立了能同時檢測3種病原的多重RT-PCR方法。與單重RT-PCR方法相比,多重RT-PCR方法可實(shí)現(xiàn)單次多種病原的同時檢測,省時省力。熒光定量PCR也是近年發(fā)展迅速的一門檢測技術(shù),通過在PCR體系中加入熒光基團(tuán),利用熒光信號積累實(shí)時監(jiān)測整個PCR進(jìn)程,并實(shí)現(xiàn)對未知模板定量分析。這種方法克服了傳統(tǒng)PCR易污染和缺乏準(zhǔn)確定量的缺點(diǎn),具有特異性強(qiáng)、靈敏度高、重復(fù)性好、定量準(zhǔn)確、速度快和全封閉反應(yīng)等優(yōu)點(diǎn),國內(nèi)外眾多學(xué)者建立了多種針對PEDV、TGEV和PDCoV的單重或多重?zé)晒舛縋CR方法。如施開創(chuàng)等[16]建立了PEDV、TGEV和PRCoV多重TaqMan熒光定量RT-PCR檢測方法,此方法可快速、高效、準(zhǔn)確地對病原實(shí)現(xiàn)鑒別診斷,為疾病的早期防控奠定了基礎(chǔ)。除此之外,適用于現(xiàn)場快速檢測的恒溫隔絕式PCR也得到廣泛的應(yīng)用,這種方法解除了實(shí)驗(yàn)設(shè)備及復(fù)雜操作的束縛,可實(shí)現(xiàn)產(chǎn)房現(xiàn)場快速檢測,實(shí)現(xiàn)病原的早診斷、早預(yù)防。
3.2? 環(huán)介導(dǎo)等溫擴(kuò)增技術(shù)
介導(dǎo)等溫擴(kuò)增技術(shù)(Loop-mediated isothermal amplification,LAMP)是一種新的體外擴(kuò)增特定DNA片段的方法。該技術(shù)依賴于自動循環(huán)的鏈置換反應(yīng),在等溫條件下,1 h內(nèi)即能擴(kuò)增1×109拷貝的靶序列,核酸研究和病原學(xué)檢測等方面得到了廣泛的應(yīng)用。羅亞坤等[17]建立了豬流行性腹瀉病毒的LAMP檢測方法,在60 ℃恒溫下反應(yīng)60 min,能特異性地擴(kuò)增出豬流行性腹瀉病毒的核酸片段,與常規(guī)RT-PCR方法的符合率達(dá)到97.3%,LAMP檢測方法無需額外的昂貴設(shè)備,僅需要水浴或加熱塊在30~60 min內(nèi)擴(kuò)增大量核酸且結(jié)果易觀察,操作方法簡便、敏感性和特異性高,可以用于相關(guān)冠狀病毒臨床病料的快速檢測,但由于其費(fèi)用昂貴且容易產(chǎn)生氣溶膠污染,在臨床上并未得到廣泛應(yīng)用。
3.3? 基因芯片、核酸探針雜交技術(shù)
基因芯片技術(shù)是同時將大量的探針分子固定到固相支持物上,借助核酸分子雜交配對的特性對DNA樣品的序列信息進(jìn)行高效解讀和分析,如劉志鵬[18]建立了同時檢測PEDV、TGEV、GAR和PDCoV的可視化寡核苷酸芯片,為4種豬腹瀉病毒的同步鑒別診斷提供了一種新的分子診斷技術(shù)。核酸探針是將特定標(biāo)記物通過隨機(jī)引物法、PCR法和缺口平移法等標(biāo)記到某段特定的核苷酸上,與待檢核酸樣品在一定的支持物上進(jìn)行雜交,然后通過一定顯示系統(tǒng)來探查靶核酸的一種特異性檢測方法。這2種新興技術(shù)具有特異性好、靈敏度高和便捷快速等優(yōu)點(diǎn),在臨床診斷上具有良好的發(fā)展前景。
3.4? 限制性酶切片段長度多態(tài)性分析
限制性酶切片段長度多態(tài)性分析(Restriction fragmen tlength polymorphism,RFLP)是一種區(qū)分具有抗原相關(guān)性病毒的有效手段,將抗原性較近的病毒核酸用特定的限制性內(nèi)切酶進(jìn)行酶切,然后對酶切的產(chǎn)物進(jìn)行分析,從而可以達(dá)到區(qū)分被檢病毒核酸的目的。此方法可以用來鑒別野毒株與疫苗株及強(qiáng)毒株和弱毒株[19],利于對流行毒株進(jìn)行精準(zhǔn)檢測,以便從分子層面制定防控措施。
4? 討論
豬腹瀉病毒流行廣泛,危害嚴(yán)重。與仔豬病毒性腹瀉相關(guān)的猜原主要以冠狀病毒為主,包括TGEV、PEDV、PDCoV、PHEV和SADS-CoV,雖然豬的冠狀病毒都有共同的分子生物學(xué)特征,但要求對不同的疾病采取有針對性的預(yù)防和控制措施。尤其是前3種病毒已在我國豬群中長期存在且污染面廣,由于它們在臨床上都可以引起豬的嘔吐、腹瀉等癥狀,而且都屬于冠狀病毒,難以從臨床癥狀和病原學(xué)形態(tài)方面加以區(qū)分,因此必須通過實(shí)驗(yàn)室診斷而確診,只有開展快速有效的檢測,才能早診斷、早預(yù)防,為開展疾病的綜合防控奠定基礎(chǔ)。