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髓系腫瘤胚系易患因素研究進(jìn)展

2020-12-19 10:52:42聶代靜王芳周曉蘇劉銘李綿洋劉紅星
分子診斷與治療雜志 2020年8期
關(guān)鍵詞:體細(xì)胞中位基因突變

聶代靜 王芳 周曉蘇 劉銘 李綿洋 劉紅星,,4★

腫瘤的發(fā)生是遺傳和環(huán)境共同作用的結(jié)果。2015年本團(tuán)隊(duì)曾撰文強(qiáng)調(diào)血液腫瘤的遺傳和先天易感因素值得重視[1]。在2016年修訂的世界衛(wèi)生組織(world health organization,WHO)造血和淋巴組織腫瘤分類中,一個(gè)重要的更新是將“具有胚系易患因素的髓系腫瘤(myeloid neoplasms with germline predisposition,MNGPs)”列為獨(dú)立的分類[2]。美國血液學(xué)會(huì)(the American Society of Hematology,ASH)已聯(lián)合臨床基因組資源協(xié)會(huì)(the Clinical Genome Resource,ClinGen)成立髓系腫瘤(myeloid neoplasms,MNs)變異治療專家組,制定胚系易感突變相關(guān)的指南[3]。本文結(jié)合筆者近年的相關(guān)研究和工作經(jīng)驗(yàn),介紹該領(lǐng)域的最新研究進(jìn)展。

1 MNGPs 鑒定的臨床意義

既往認(rèn)為MNGPs 罕見,臨床診療中常忽視遺傳綜合征相關(guān)體征的檢查和家族史調(diào)查,或因條件限制無法進(jìn)行相關(guān)檢測(cè)。近年來新一代高通量基因測(cè)序(next generation sequencing,NGS)技術(shù)的進(jìn)展和推廣應(yīng)用,使基因檢測(cè)的臨床常規(guī)應(yīng)用和MNGPs 的正確診斷成為可能。

MNGPs 不僅見于兒童和青少年,也可于中年甚至老年發(fā)?。?,4]。相當(dāng)比例的患者不伴特征性體征或家族史,表現(xiàn)為散發(fā)的MNs[2,4]。因此,年齡、體征和家族史都不能作為排除MNGPs 的依據(jù)。既往認(rèn)識(shí)不足和缺乏基因檢查的依據(jù)時(shí),MNGPs 的發(fā)生率被低估。盡管特定基因相關(guān)的MNGP 發(fā)生率不高,但目前可鑒定的各種MNGPs 的總發(fā)生率可達(dá)MDS 和AML 的4%~15%[4-6]。不同的MNGPs的內(nèi)在原因、進(jìn)展規(guī)律和治療反應(yīng)各有特征,因此需要針對(duì)胚系病因制定更合適的治療策略[1,2,4]。MNGPs 患者的家庭成員也可能攜帶致病突變,并有發(fā)生MNs 的風(fēng)險(xiǎn)。因此還應(yīng)進(jìn)行家系調(diào)查,密切隨訪突變攜帶者,必要時(shí)進(jìn)行醫(yī)療干預(yù)[2]。

2 既往無器官功能異常的MNGPs

這類MNGPs 主要以血液腫瘤發(fā)病,目前已鑒定的主要有CEBPA-MNGP 和DDX41-MNGP。

CEBPA是AML 中最常發(fā)生體細(xì)胞突變的基因之一[1,7]。CEBPA-MNGP 患者發(fā)生AML 時(shí)常為雙CEBPA等位基因突變(CEBPAdouble mutation,CEBPAdm),胚系突變常位于基因5′端,體細(xì)胞突變常位于3′端。CEBPA-MNGP 接近完全外顯,常于兒童及青少年期發(fā)生AML,但也有46 歲發(fā)病的報(bào)道[8]。CEBPA-MNGP 的形態(tài)和免疫表型與體細(xì)胞CEBPA突變的AML 相似,發(fā)病前常無血細(xì)胞異常和MDS 病史[9]?;颊邔?duì)化療敏感,但易復(fù)發(fā)或發(fā)生第二次的原發(fā)AML,這部分患者需異基因造血干細(xì)胞移植(allogeneic hematopoietic stem cell transplantation,allo-HSCT)治療[10]。在本團(tuán)隊(duì)的一項(xiàng)研究中,5.3%的CEBPAdm-AML 患者攜帶胚系CEBPA突變,即為CEBPA-MNGP[10]。所報(bào)道的4 例患者分別于4、9、11 和23 歲發(fā)病,其中3 例分別在化療緩解后10、26和66個(gè)月復(fù)發(fā),1例在隨訪期間持續(xù)緩解。

DDX41突變見于約1.5%的MNs,其中一半伴胚系突變[4]。DDX41-MNGP 發(fā)病年齡大(中位年齡62歲),多以MDS 發(fā)病,也可為AML。DDX41-MNGP預(yù)后差,但對(duì)去甲基化治療反應(yīng)好。在一項(xiàng)中國的報(bào)道中:DDX41-MNGP 在MNs 中的發(fā)生率為1.6%,發(fā)病中位年齡67 歲;88%的DDX41-MNGP患者伴另一DDX41等位基因體細(xì)胞突變;這些患者對(duì)去甲基化治療的反應(yīng)率可達(dá)69%[11]。

3 伴既往血小板異常的MNGPs

家族性血小板異常伴AML 易患(familial platelet disorder with predisposition to AML,F(xiàn)PD/AML)是一種RUNX1基因突變的常染色體顯性遺傳綜合征[1-2]。RUNX1編碼一種在造血中起重要作用的轉(zhuǎn)錄因子蛋白,其體細(xì)胞突變和RUNX1-RUNX1T1融合基因在MNs 中常見且具有重要臨床意義。在WHO2016 版分類標(biāo)準(zhǔn)中,伴RUNX1-RUNX1T1的AML 和RUNX1-MNGP 各被列為獨(dú)立的AML 遺傳學(xué)分型,RUNX1體細(xì)胞突變的AML(RUNX1-AML)被列為暫定分型[2]。最近的報(bào)道發(fā)現(xiàn)高達(dá)30%的RUNX1-AML 患者攜帶胚系RUNX1突變,即屬于RUNX1-MNGP[12]。RUNX1-MNGP 與體細(xì)胞突變的RUNX1-AML 具有不同的伴隨基因突變譜[13]。

RUNX1 調(diào)節(jié)巨核細(xì)胞發(fā)育和血小板生成。RUNX1-MNGP 以血小板數(shù)量和功能異常為特點(diǎn),常在較年輕時(shí)進(jìn)展為MDS/AML(中位發(fā)病年齡33 歲)[1-2,4]。不同RUNX1家系外顯率差異很大(11%~100%,中位數(shù)44%),同一家系中患者的臨床表現(xiàn)亦不相同[4]。胚系RUNX1突變多位于5′端,進(jìn)展為AML 時(shí)常伴隨其他基因的體細(xì)胞突變。另一RUNX1等位基因的體細(xì)胞突變常見,但非必須。關(guān)于RUNX1-MNGP 的研究相對(duì)較多,但對(duì)于各種RUNX1突變,如何判斷其病理意義仍是重要問題。ASH/ClinGen 專家組已發(fā)布關(guān)于胚系RUNX1突變變異致病意義的專家建議,初步制定了含52 個(gè)變異的注釋列表[3,14]。

2 型血小板減少癥(thrombocytopenia 2,THC2)是ANKRD26基因突變導(dǎo)致的常染色體顯性遺傳病,以輕至中度血小板減少和MDS/AML易患(較總體人群高約30 倍)為特征[1-2,15]。ANKRD26突變多位于5′端非編譯區(qū),影響RUNX1等轉(zhuǎn)錄因子與其啟動(dòng)子的結(jié)合。ANKRD26-MNGP患者常表現(xiàn)為輕度血小板減少和輕度出血傾向,血漿促血小板生成素常升高,骨髓檢查可見巨核系造血異常、小巨核細(xì)胞伴核分葉異常等[16]。

ETV6基因突變可導(dǎo)致5 型血小板減少癥(thrombocytopenia 5,THC5),表現(xiàn)為常染色體顯性的家族性血小板減少和血液腫瘤[1,2,4,17]?;颊甙椴煌潭妊“鍦p少,輕至中度出血傾向。ETV6突變多位于結(jié)合DNA 的ETS 結(jié)構(gòu)域,以二聚體和顯性負(fù)效應(yīng)影響正常ETV6 蛋白的核定位,從而導(dǎo)致血小板相關(guān)基因異常表達(dá)。THC5 更多進(jìn)展為急性淋巴細(xì)胞白血病,但也可發(fā)生MDS/AML。

4 伴其他器官功能異常的MNGPs

主要包括GATA2-MNGP、遺傳性骨髓衰竭綜合征(inherited bone marrow failure syndromes,IBMFS)、Bloom 綜合征(Bloom syndrome,BSyn)和遺傳性端粒疾?。╰elomere biology disorders,TBD)等[2]。這些綜合征多涉及一組基因,具有多種臨床表現(xiàn)。

胚系GATA2突變可見于編碼區(qū)和非編碼區(qū),多為單等位基因的錯(cuò)義、無義或調(diào)節(jié)區(qū)突變。突變攜帶者可表現(xiàn)為免疫缺陷、淋巴水腫、耳聾及MDS/AML 易患[2],也可僅以中性粒細(xì)胞減少或骨髓衰竭發(fā)?。?]。GATA2相關(guān)疾病的發(fā)病年齡和疾病表型具有很強(qiáng)的異質(zhì)性:中位年齡約20 歲,64%表現(xiàn)為感染,9%表現(xiàn)為淋巴水腫,21%以MDS/AML 為首發(fā)?。患s70%的GATA2胚系突變攜帶者會(huì)進(jìn)展為MDS/AML,中位年齡29 歲[18]。多數(shù)GATA2-MNGP 兒童病例表現(xiàn)為散發(fā)性MDS/AML,并無MNs 家族史或其他綜合征表現(xiàn)。GATA2-MNGP 預(yù)后較差,合并NRAS等體細(xì)胞突變可能會(huì)促進(jìn)向AML 的進(jìn)展[19-20]。Allo-HSCT 可改善這部分患者的預(yù)后,但易發(fā)生移植相關(guān)的神經(jīng)毒性反應(yīng)和血栓事件[19]。

IBMFS 包括范可尼貧血(Fanconi anemia,F(xiàn)A)、Shwachman-Diamond 綜合征、Diamond-Blackfan 貧血和先天性重型中性粒細(xì)胞減少癥(severe congenital neutropenia,SCN)等。其中FA 最為常見,約25%~30%的FA 患者并無畸形、皮膚色素異常及身材矮小等綜合征表現(xiàn)[2,4,21]。FA 患者發(fā)生各種腫瘤的概率是總體人群的600~800 倍,MDS/AML可能是首發(fā)病。到50 歲時(shí)有40%的FA 患者發(fā)生MDS,40 歲時(shí)有20%發(fā)生AML,其中FANCD1/BRCA2突變攜帶者常更早期發(fā)生白血?。?]。目前已鑒定22 種FA 相關(guān)的基因,F(xiàn)ANCA突變最常見,約23%~40%的FANCA突變?yōu)榛蚱稳笔?,在常?guī)NGS panel 測(cè)序或WES 分析時(shí)容易被忽略[22]。

編碼DNA 解旋酶的BLM基因突變可導(dǎo)致BSyn,患者常有發(fā)育異常、光敏性皮炎、免疫缺陷等表現(xiàn)[1,23]。BSyn 患者到40 歲時(shí)有80.9%發(fā)生腫瘤,其中白血病可占40%[1,23]。本團(tuán)隊(duì)曾報(bào)道一例患者于8 歲時(shí)被診斷為再生障礙性貧血(aplastic anemia,AA),曾對(duì)激素和環(huán)孢素治療有反應(yīng),但3年后進(jìn)展為AML[23]。體格檢查有皮膚色素沉著和輕度頭顱骨發(fā)育異常,但無其他BSyn 相關(guān)的典型體征。經(jīng)聯(lián)合WES 和轉(zhuǎn)錄組測(cè)序發(fā)現(xiàn)該患者攜帶兩個(gè)遺傳性的BLM截短型突變,并且RUNX1-PRDM16融合基因陽性。該患者的AML 常規(guī)化療未能緩解,經(jīng)挽救性allo-HSCT 獲得了持續(xù)的完全緩解。

SCN 以持續(xù)的中性粒細(xì)胞減少和嚴(yán)重的細(xì)菌感染為特征,已鑒定的致病基因有ELANE、G6PC3、GFI1、WAS和HAX1等[1,4]。近年來粒細(xì)胞集落刺激因子(granulocyte colony-stimulating factor,G-CSF)的應(yīng)用幫助90%的患者顯著改善了生存,但累積發(fā)生MDS/AML 的風(fēng)險(xiǎn)也增加,并且呈G-CSF 劑量相關(guān)性。使用G-CSF 超過10年的SCN 患者中,每年約2.3%發(fā)生MDS/AML,進(jìn)展為AML 時(shí)常繼發(fā)CSF3R突變。

先天性角化不良(dyskeratosis congenita,DC)是TBD 的臨床表現(xiàn)形式之一,除骨髓衰竭和腫瘤易患以外,還可伴肺/肝纖維化。指甲發(fā)育不良、花斑狀皮膚色素異常和黏膜白斑是其典型體征,MDS/AML 的發(fā)生風(fēng)險(xiǎn)是總體人群的2663 倍[1,2]。部分DC 患者可只表現(xiàn)為造血衰竭,缺乏皮膚黏膜異常等典型表現(xiàn),難以與AA 和低增生性MDS 鑒別。另一方面,15%的MDS 患者攜帶DC 相關(guān)的胚系基因突變[1]。對(duì)于伴MDS 家族史或有血細(xì)胞減少、頭頸部鱗癌、肺/肝纖維化的MDS/AML 患者,應(yīng)篩查DC 相關(guān)的胚系基因突變。

5 其他新發(fā)現(xiàn)的MNGPs

上述MNGPs 只能解釋一少部分具有遺傳傾向MNs[24]。人們對(duì)MNGPs 的認(rèn)識(shí)仍在不斷拓展,近年來報(bào)道的相關(guān)基因有TET2、SAMD9、SAMD9L、SRP72、STG2B和GSKIP等[4,24-26]。在一項(xiàng)對(duì)179 例疑似IBMFS 患者的研究中,用WES 鑒定有48%(86例)為IBMFS,其中18.6%(16/86)為SAMD9或SAMD9L突變,7%(6 例)為MECOM/EVI1突變,8%(7 例)為ERCC6L2突變[24]。SAMD9或SAMD9L胚系雜合突變攜帶者常表現(xiàn)為持續(xù)的血小板減少,易進(jìn)展為伴單體7/7q-的MDS,并且具有多種臨床表型,也可直接以MDS/AML 發(fā)病[4,24]。

TET2體細(xì)胞突變常見于MNs[7],近兩年也開始有胚系TET2突變的血液腫瘤家系報(bào)道[25-26]。在2019年報(bào)道的一個(gè)家系中,攜帶相同的TET2移碼突變的3 名同胞分別于39、45 和46 歲時(shí)發(fā)生不同類型的淋巴瘤[25]。在新近報(bào)道的一個(gè)MNs 家系中,攜帶相同TET2移碼突變的3 名同胞分別于53、60 和61 歲時(shí)診斷為真性紅細(xì)胞增多癥、CMML 和AML[26]。本團(tuán)隊(duì)曾于2016年報(bào)道一例2 歲6 個(gè)月發(fā)病的AML 患者同時(shí)攜帶胚系TET2和NOTCH1突變,該患者同時(shí)有RUNX1-RUNX1T1融合基因、CALR突變和KIT突變陽性,并對(duì)常規(guī)化療方案耐藥[27]。這些報(bào)道提示,胚系TET2突變相關(guān)的血液腫瘤可能具有異質(zhì)性強(qiáng)、難治、預(yù)后差的特點(diǎn)。

6 總結(jié)及展望

本團(tuán)隊(duì)于2017年撰文提出遺傳致病因素的冰山模型,并預(yù)期腫瘤等疾病的遺傳易患因素將越來越多被揭示[28]。高通量基因測(cè)序、基因組分析、大數(shù)據(jù)和人工智能技術(shù)的進(jìn)展正在加速M(fèi)NGPs的發(fā)現(xiàn)和基因檢測(cè)的臨床應(yīng)用[29-31]。越來越多的證據(jù)顯示相當(dāng)比例的血液腫瘤患者存在胚系易患因素[32]。有效檢測(cè)和分析MNGPs 相關(guān)的基因突變可幫助更多患者得到正確診斷和個(gè)體化治療,但亦應(yīng)注意基因變異臨床意義的準(zhǔn)確解釋需要病理學(xué)家、臨床醫(yī)師和臨床遺傳學(xué)家等多學(xué)科的緊密合作[2-3]。

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