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基于高通量測序的結(jié)直腸癌組織中環(huán)狀RNA 功能研究與預后分析

2021-03-19 08:25:06傅中懋戎澤印章建明李騰飛余志龍
關(guān)鍵詞:直腸癌測序通路

傅中懋,羅 再,戎澤印,章建明,李騰飛,余志龍,黃 陳

上海交通大學附屬第一人民醫(yī)院普外科,上海200080

結(jié)直腸癌是當今世界最常見的惡性消化道腫瘤之一,每年新增結(jié)直腸癌患者人數(shù)為185 萬,新增死亡人數(shù)為88 萬[1]。在美國,結(jié)直腸癌的發(fā)病率與病死率在男性和女性罹患的惡性腫瘤中均排第三[2]。據(jù)我國腫瘤中心登記的數(shù)據(jù)顯示,2015 年結(jié)直腸癌在總新發(fā)腫瘤中發(fā)病率與病死率均排第五[3]。結(jié)直腸由可治愈的局部惡性病變發(fā)展到轉(zhuǎn)移性結(jié)直腸癌需要經(jīng)過一個漫長的時間窗,因此早期診斷的意義重大。目前,結(jié)直腸癌檢查主要為直腸指診和結(jié)腸鏡檢查。由于侵入式檢查會給患者帶來不適感,患者往往不愿意定期檢查[4]。計算機斷層掃描檢查雖然為非侵入性,但由于其局限于形態(tài)成像,可能會將殘余糞便誤診為腫瘤而導致假陽性結(jié)果[5],因此血源性生物標志物被認為是一種侵入性最小的選擇。近年來,癌胚抗原(carcinoembryonic antigen,CEA)、糖類抗原19-9(carbohydrate antigen 19-9,CA19-9)、CA242 等已被證實與結(jié)直腸癌的診斷和預后相關(guān)[6]。但是這些指標的特異性往往有所欠缺,例如在其他惡性腫瘤如卵巢癌、胰腺癌,甚至在良性疾病如炎癥性腸病中,CEA 的水平也會升高[7]。因此為了改善患者預后,深入研究結(jié)直腸癌的發(fā)生機制,挑選新型生物標志物至關(guān)重要。

隨著二代測序技術(shù)與生物信息技術(shù)的發(fā)展,人們對環(huán)狀RNA(circular RNA,circRNA)的研究與認識越發(fā)深入。circRNA在哺乳動物中普遍存在,作為一種不具有5'端帽子結(jié)構(gòu)和3'端多腺苷酸尾部結(jié)構(gòu)的特殊環(huán)狀閉合RNA,其結(jié)構(gòu)穩(wěn)定,不易被核酸外切酶降解[8]。由于circRNA的廣泛性、組織發(fā)育階段特異性、高度保守性等特點,其具有成為新型臨床診斷標志物的潛力[9]。circRNA因其在真核生物中所具有的細胞或組織特異性以及發(fā)育階段特異性,已被證實參與不同疾病的致病過程[10]。同時,circRNA 結(jié)構(gòu)特異性決定了其特有的生物學功能,如調(diào)節(jié)蛋白翻譯、基因轉(zhuǎn)錄等[11]。目前,越來越多的證據(jù)表明circRNA 作為競爭性內(nèi)源性RNA 在細胞質(zhì)參與miRNA 結(jié)合競爭,從而在致癌過程中發(fā)揮著重要作用,如circNHSL1 通過miR-1306-3p/SIX1/vimentin 途徑促進癌癥進程[12]。但是當前在結(jié)直腸癌中關(guān)于表達差異circRNA 的選擇、circRNA 的生物學功能及其與患者預后關(guān)系的研究仍很少。

本研究通過對12 對結(jié)直腸癌患者的新鮮結(jié)直腸癌組織和癌旁組織進行高通量測序分析,篩選出表達差異的circRNA 并進行功能預測,借助實時熒光定量PCR(realtime fluorescent quantitative PCR,RT-qPCR)技術(shù)驗證測序結(jié)果的準確性,構(gòu)建circRNA 與微RNA(microRNA,miRNA)、mRNA 的互作網(wǎng)絡,并初步研究差異表達的circRNA與患者預后的關(guān)系,以期為結(jié)直腸癌發(fā)生機制與新型臨床標志物的篩選提供研究基礎(chǔ)。

1 對象與方法

1.1 研究對象

收集2017 年1 月—2018 年12 月在上海交通大學附屬第一人民醫(yī)院普外科行結(jié)直腸癌根治術(shù)的12 例患者的癌組織和癌旁組織(距離癌組織>5 cm)用于高通量測序。收集2015年1月—2017年12月行結(jié)直腸癌根治術(shù)的44 例患者的癌組織和癌旁組織(距離癌組織>5 cm),用于RTqPCR 實驗。納入標準:①符合結(jié)直腸癌診斷標準。②患者病歷資料完整,隨訪數(shù)據(jù)完整。③術(shù)前未經(jīng)過新輔助放射治療和化學治療。④患者無其他系統(tǒng)嚴重疾病。排除標準:①合并其他部位原發(fā)惡性腫瘤患者。②患者臨床、隨訪資料不完整。組織標本取出后即刻放入液氮盒或?80 ℃冰箱保存。研究獲上海交通大學附屬第一人民醫(yī)院倫理委員會批準(批件編號2019SQ274)。所有患者或其家屬均簽署知情同意書。

1.2 circRNA高通量測序

RNA 高通量測序由上海歐易生物醫(yī)學科技有限公司提供。使用mirVana miRNA (AM1561,中國Ambion)分離試劑盒提取樣品總RNA,用ribo-zero 試劑盒(RS-122-2301,美國Illumina)捕獲并去除核糖體RNA,用RNA 碎片化試劑(AM8740,美國ABI)將RNA 片段化,配置一鏈合成體系通過六堿基隨機引物合成第一鏈cDNA,隨后在此基礎(chǔ)上配置二鏈合成體系,用上標Ⅱ反轉(zhuǎn)錄酶(18064014,美國Invitrogen)增加cDNA 產(chǎn)量,其中dUTP 代替dTTP 合成第二鏈cDNA,用UNG 酶法將富含dUTP 的第一鏈消化,將第二鏈cDNA 進行純化,將純化后的cDNA 末端補平,加A 尾修飾和加測序接頭,qPCR 擴增構(gòu)建測序文庫。將構(gòu)建好的文庫使用安捷倫2100 生物分析儀(5067-1511,美國Aglient)檢測RNA完整性,RNA 完整性參數(shù)(RIN)≥7 的樣品進行后續(xù)分析,在Illumina 測序平臺(HiSeq 2500,美國Illumina)對這些文庫進行測序。最后根據(jù)篩選標準:基因表達值倍數(shù)變化(fold change,F(xiàn)C)>2 或FC

1.3 差異表達circRNA的功能預測分析

1.3.1 差異表達circRNA GO 富集分析 基因本體(gene ontology,GO)分析主要通過分析細胞組分、分子功能、生物過程3個方面來描述基因行使的主要功能。在得到差異表達的circRNA 后,根據(jù)circRNA 來源基因的GO 功能注釋信息,計算每個GO條目中差異表達的circRNA數(shù)量,超幾何分布檢驗差異circRNA 在GO 條目中富集的程度,以P<0.05 為閾值篩選顯著富集的GO 條目,結(jié)合GO 注釋結(jié)果,預測差異表達的circRNA所行使的主要生物學功能。

1.3.2 差異表達circRNA KEGG 信號通路分析 circRNA信號通路分析主要依賴于京都基因和基因組百科全書(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes,KEGG)公共數(shù)據(jù)庫,通過基因的KEGG 注釋結(jié)果研究疾病信號通路和轉(zhuǎn)導。在得到差異表達的circRNA 后,計算統(tǒng)計每個信號通路中差異circRNA 來源基因的富集程度,根據(jù)P<0.05進行KEGG富集通路篩選分析。

1.4 RT-qPCR驗證分析

在篩選出的具有表達差異的circRNA 中各挑選2 個顯著上調(diào)與顯著下調(diào)的RNA,在44 對結(jié)直腸癌組織與癌旁組織中進行RT-qPCR 驗證circRNA 含量;其中挑選的上調(diào)的circRNA 為表達差異倍數(shù)最大前5 中的hsa_circ_0023984 與hsa_circ_0008192,挑選的下調(diào)的circRNA 為表達差異倍數(shù)最大的hsa_circ_0020093 與hsa_circ_0069922。4 個circRNA 和內(nèi)參甘油醛-3-磷酸脫氫酶(glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase,GAPDH) 基因的引物序列如表1 所示。首先使用PrimeScriptTMRT 試劑盒(RR036A,日本TaKaRa) 反轉(zhuǎn)錄500 ng RNA 為cDNA,然后用SYBR?Premix Ex TaqTM(RR820A,日本TakaRa)擴增cDNA 進行RT-qPCR。將GAPDH 作為內(nèi)部對照,用公式2-ΔΔCt計算circRNA的相對表達水平。

表1 RT-qPCR 引物序列Tab 1 Primer sequences of RT-qPCR

1.5 circRNA-miRNA靶向作用預測

挑選上述實驗的差異表達circRNA, 通過CircInteractome 分析網(wǎng)站挑選具有潛在結(jié)合circRNA 能力的miRNA,根據(jù)結(jié)合位點個數(shù)及context+score percentile評分綜合篩選出最優(yōu)的的miRNA。接著通過MicroRNA、TargetScan 與TangetMiner 網(wǎng)站對篩 選 的miRNA 進行靶基因預測,取3 個預測結(jié)果的交集,得到miRNA 靶基因。最后根據(jù)度分析指標在Cytoscape 軟件上構(gòu)建circRNAmiRNA-mRNA網(wǎng)絡。

1.6 患者預后分析

將表達上調(diào)的hsa_circ_0023984、hsa_circ_0008192與表達下調(diào)的hsa_circ_0020093 與hsa_circ_0069922 按照表達水平高低與44 例結(jié)直腸癌患者臨床資料相匹配,通過分析總生存期(overall survival,OS)研究表達上調(diào)或下調(diào)的circRNA與患者預后之間的聯(lián)系。

1.7 統(tǒng)計學方法

采用SPSS 23.0 軟件進行數(shù)據(jù)分析。測量circRNA 表達量的RT-qPCR 實驗重復3 次,最終結(jié)果用x±s 表示。結(jié)直腸癌組與癌旁正常組之間circRNA 表達水平的比較采用配對t檢驗。P<0.05認為差異有統(tǒng)計學意義。

2 結(jié)果

2.1 結(jié)直腸癌組織中circRNA的表達分析

經(jīng)高通量測序后共檢測出20 924個circRNA,其中有9 796個circRNA 在circBase數(shù)據(jù)庫中,第6對樣本預測表達circRNA數(shù)量最多(圖1A、B)。相較于正常的結(jié)直腸癌旁組織,在結(jié)直腸癌組織中異常顯著表達的circRNA共有373 個(︱log2FC︱>1,P<0.05),其中上調(diào)顯著的有243個,下調(diào)顯著的有130個。將有顯著差異表達的circRNA數(shù)據(jù)制成火山圖(圖1C)和聚類分析熱圖(圖1D),在RNA測序結(jié)果中篩選上調(diào)與下調(diào)最顯著的5個circRNA,具體信息見表2。其中hsa_circ_0079534 表達上調(diào)最多,F(xiàn)C 為14.24;hsa_circ_0020093下調(diào)最明顯,F(xiàn)C為?8.27。

2.2 結(jié)直腸癌組織中circRNA的功能分析

圖1 結(jié)直腸癌組織及癌旁組織中差異表達circRNA的可視化分析Fig 1 Visual analysis of the differential expression of circRNAs in colorectal cancer and adjacent tissues

表2 circRNA測序結(jié)果中表達差異最顯著的10種circRNATab 2 Ten circRNAs with the most significant expression in the sequencing result

通過GO 富集分析與KEGG 通路分析預測差異表達circRNA 的功能。部分差異表達的circRNA 對應1 個GO注釋,分別根據(jù)生物過程、細胞定位、分子功能3個部分對應將最富集的前10條篩選出來。差異顯著circRNA在生物過程預測顯示較為富集的是細胞排泄、細胞內(nèi)源性pH的調(diào)節(jié)、對cAMP合成過程的負向調(diào)控以及對草酸運輸調(diào)控等;其細胞定位主要在生殖核、紡錘體中央?yún)^(qū)、細胞質(zhì)膜以及刷狀緣膜等處;差異表達的circRNA分子功能分析提示結(jié)直腸癌發(fā)病機制與部分轉(zhuǎn)運蛋白活性密切相關(guān),如硫酸鹽跨膜轉(zhuǎn)運蛋白與次級活性硫酸鹽跨膜轉(zhuǎn)運蛋白活性、草酸跨膜轉(zhuǎn)運蛋白活性、G蛋白偶聯(lián)受體活性等(圖2A)。KEGG通路分析表明,在circRNA相關(guān)通路中最富集的通路是對腫瘤微環(huán)境中蛋白聚糖的調(diào)控,同時circRNA調(diào)控的血管內(nèi)皮生長因子(vascular endothelial growth factor,VEGF)信號通路、趨化因子信號通路、紅細胞白血病病毒癌基因同源物(v-erb-b2 avian erythroblastic leukemia viral oncogene homolog,ErbB)信號通路與結(jié)直腸癌發(fā)生息息相關(guān),circRNA相關(guān)的白細胞經(jīng)內(nèi)皮遷移也可能參與了結(jié)直腸癌的致病過程(圖2B)。

圖2 差異表達circRNA 的GO分析和KEGG分析Fig 2 GO analysis and KEGG analysis of differentially expressed circRNAs

2.3 RT-qPCR 檢 測 結(jié) 果 與circRNA-miRNA-mRNA 網(wǎng) 絡分析

在所有差異表達的circRNA 中挑選出表達差異最顯著的4 個circRNA,分別為hsa_circ_0023984、hsa_circ_0008192、hsa_circ_0020093 與hsa_circ_0069922。前兩者在測序結(jié)果中預測表達上調(diào),后兩者預測表達下調(diào)。我們在44 對結(jié)直腸癌及癌旁組織樣本中使用RT-qPCR 技術(shù)進一步驗證circRNA 測序結(jié)果的準確性。用于RT-qPCR驗證的44 例患者年齡為35~84 歲,男性26 例,女性18例;患者分期依據(jù)國際抗癌聯(lián)盟第8 版結(jié)直腸癌TNM 分期標準:Ⅰ期3 例,Ⅱ期19 例,Ⅲ期20 例,Ⅳ期2 例。結(jié)果(圖3A)顯示:hsa_circ_0023984在結(jié)直腸癌腫瘤組織與癌旁組織中的相對表達量分別為0.179 6±0.446 6 與0.012 2±0.017 4 (t=2.480,P=0.017);hsa_circ_0008192在結(jié)直腸癌腫瘤組織與癌旁組織中的相對表達量分別為0.089 4±0.186 7 與0.032 6±0.052 4(t=2.190,P=0.034);hsa_circ_0020093 在結(jié)直腸癌腫瘤組織與癌旁組織中的相對表達量分別為0.057 8±0.146 1 與0.457 6±0.625 5(t=4.725,P<0.000 1);hsa_circ_0069922 在結(jié)直腸癌腫瘤組織與癌旁組織中的相對表達量分別為0.030 9±0.030 9 與0.409 5±0.279 4(t=8.645,P<0.000 1)。通過RT-qPCR 證實了circRNA測序結(jié)果的準確性。

利用CircInteractome、MicroRNA、TargetScan 等網(wǎng)站對上調(diào)明顯的hsa_circ_0023984 和hsa_circ_0008192 及下調(diào)顯著的hsa_circ_0020093 和hsa_circ_0069922 進行下游miRNA 及最終調(diào)控的mRNA 預測。根據(jù)預測結(jié)果優(yōu)先選擇相關(guān)系數(shù)最高的4 個miRNA 和20 個mRNA 構(gòu)建circRNA-miRNA-mRNA 互作網(wǎng)絡,通過Cytoscape 軟件將其可視化為核心網(wǎng)絡圖(圖3B)。該圖顯示含鋅指和BTB 結(jié)構(gòu)域蛋白1(zinc finger and BTB domain containing 1, ZBTB1)、 SEC23 同 源 物A (SEC23 homolog A,SEC23A)、脆性X 智力低下蛋白翻譯調(diào)節(jié)蛋白1(FMRP translational regulator 1,F(xiàn)MR1)、煙酰胺磷酸核糖轉(zhuǎn)移酶(nicotinamide phosphoribosyltransferase,NAMPT)、具有植物同源結(jié)構(gòu)域的鋅指蛋白20 樣蛋白1(PHD finger protein 20 like 1,PHF20L1)等為靶向關(guān)系最多的mRNA原始基因。

2.4 差異表達circRNA與患者預后的關(guān)系

結(jié)合患者的臨床資料,通過Kaplan-Meier 生存分析顯示,hsa_circ_0008192 在患者腫瘤組織中高表達時其OS 較差(P=0.026 2),同時對于hsa_circ_0023984 高表達的患者OS 也趨于變短(P=0.039 8)(圖4A、B)。hsa_circ_0020093 在患者腫瘤組織中高表達時其OS 較好(P=0.000 1,圖4C),對于同樣表達下調(diào)的hsa_circ_0000111 也有類似的結(jié)果(P=0.002 2,圖4D)。我們的研究結(jié)果提示,差異表達的circRNA 可能是判斷結(jié)直腸癌患者預后的一個獨立且有價值的指標。

3 討論

盡管當前結(jié)直腸癌總的發(fā)病率與病死率持續(xù)下降,但進展期的結(jié)直腸癌依舊給公共衛(wèi)生體系帶來極大的負擔;進一步研究結(jié)直腸癌的發(fā)病機制對早期識別結(jié)直腸癌與指導治療有著重要的意義[13]。circRNA 作為單鏈共價閉合的RNA 分子,具有與線性RNA 完全不同的結(jié)構(gòu),其3' 末端和5' 末端連接在一起構(gòu)成了特殊的環(huán)狀結(jié)構(gòu)[14]。circRNA 的穩(wěn)定性很大程度由其結(jié)構(gòu)決定。由于circRNA 缺乏類似線性RNA 的3'尾和5'帽子結(jié)構(gòu),其在很大程度避免了脫帽反應、脫腺苷化反應等相關(guān)的線性RNA 降解方式,因此細胞質(zhì)中circRNA 的半衰期可達48 h以上而線性RNA半衰期均僅為10 h[15-16]。與此同時,circRNA 在不同組織及不同發(fā)育階段存在特異性表達[9]。目前越來越多研究[12,17]發(fā)現(xiàn),circRNA 與腫瘤的發(fā)生與促進腫瘤的進展密切相關(guān)。在腫瘤組織中差異表達的circRNA 如胃癌中高表達circMLLT10 的患者預后明顯更差,提示circRNA 可作為判斷腫瘤患者預后的生物標志物[18]。由于circRNA 所具有的穩(wěn)定性、細胞類型或發(fā)育階段特異性、結(jié)構(gòu)保守性,使circRNA 可能成為新型生物診斷標志物[9]。因此,研究circRNA 在結(jié)直腸癌中的作用意義重大。

本研究通過高通量測序獲得了結(jié)直腸癌circRNA 表達數(shù)據(jù)庫,從2 萬多個circRNA 中篩選了具有顯著表達差異的373 個circRNA。在對表達差異的circRNA 進行功能分析時,我們通過GO分析和KEGG通路注釋分析預測了這些circRNA 的潛在功能。在GO 分析中顯示,在生物學過程中最富集的是細胞排泄與對細胞內(nèi)源性pH 的調(diào)節(jié),分別各有6 種circRNA 與此過程相關(guān)。在細胞定位分析中發(fā)現(xiàn)差異表達的circRNA 大多都分布在細胞質(zhì)膜上,這與circRNA主要位于細胞質(zhì)或儲存于外泌體中相一致[19]。分子功能分析提示結(jié)直腸癌的發(fā)病機制與部分轉(zhuǎn)運蛋白活性密切相關(guān);目前已有研究已經(jīng)證實了在結(jié)直腸中circRNA 與轉(zhuǎn)運蛋白如G 蛋白偶聯(lián)受體之間存在聯(lián)系[20]。將這些差異表達的circRNA 進行KEGG 信號通路富集分析發(fā)現(xiàn),共有173 條通路與結(jié)直腸癌發(fā)生機制密切相關(guān),其中包括了VEGF 信號通路、趨化因子信號通路、ErbB信號通路等。對于結(jié)直腸癌中的VEGF 信號通路,Li等[21]發(fā) 現(xiàn)circCCT3 通 過 充 當miR-613 的 海 綿 來 調(diào) 節(jié)VEGF 信號,從而促進結(jié)直腸癌的遠處轉(zhuǎn)移。此外Zhong等[22]發(fā)現(xiàn)circMYLK 可充當miR-29a 的競爭內(nèi)源性RNA(competing endogenous RNA,ceRNA),通過激活血管內(nèi)皮生長因子A (vascular endothelial growth factor A,VEGFA)/血管內(nèi)皮生長因子受體2(vascular endothelial growth factor receptor 2,VEGFR2)和下游Ras/細胞外信號調(diào)節(jié)蛋白激酶(extracellular signal-regulated protein kinase,ERK)信號通路來促進上皮間質(zhì)轉(zhuǎn)換,從而導致膀胱癌的進展。

圖3 circRNA差異表達及circRNA-miRNA-mRNA網(wǎng)絡圖Fig 3 Differential expression of circRNA and circRNA-miRNA-mRNA network plot

圖4 4種差異表達circRNA的臨床預后分析Fig 4 Clinical prognosis analysis of four differentially expressed circRNAs

此外,我們在circRNA 表達數(shù)據(jù)庫挑選了顯著上調(diào)和顯著下調(diào)共4個circRNA在44對新鮮的結(jié)直腸癌組織及其癌旁組織中進行了RT-qPCR分析,驗證結(jié)果與在測序結(jié)果中驗證基本一致。結(jié)合患者的臨床資料,初步研究了高表達與低表達的circRNA與患者預后的關(guān)系。結(jié)果發(fā)現(xiàn)結(jié)直腸癌組織中高表達的hsa_circ_0008192 和hsa_circ_0023984 患者OS 較差,而高表達的hsa_circ_0020093 和hsa_circ_0069922 患者OS 較好。但考慮患者的例數(shù)較少,我們準備在后續(xù)實驗中擴大樣本量繼續(xù)驗證。

在目前已知的circRNA 中,僅有少部分同時含內(nèi)部核糖體進入位點(internal ribosome entry site,IRES)和小開放閱讀框(small open reading frame,sORF)結(jié)構(gòu)才可翻譯并編碼多肽。如在肝癌中高表達的circβ-catenin 可以通過編碼多肽β-catenin-370aa 來減弱β-catenin 磷酸化,從而激活Wnt/β-catenin 通路,促進肝癌的進展[23]。在結(jié)直腸癌中,差異表達的circLgr4 通過編碼多肽Lgr4-aa 來激活Wnt/β-catenin 通路經(jīng)上皮間質(zhì)轉(zhuǎn)換促進結(jié)直腸癌轉(zhuǎn)移[24]。大多數(shù)circRNA通過與miRNA形成ceRNA,負向調(diào)控miRNA 的功能使其靶基因表達失調(diào),參與并促進腫瘤發(fā)生和進展[21-22,25]。因此,我們對挑選的4 個circRNA進行了circRNA-miRNA-mRNA 的靶向預測,發(fā)現(xiàn)了ZBTB1、SEC23A、FMR1、NAMPT、PHF20L1 等為靶向關(guān)系最多的mRNA原始基因。

在這些靶向基因中,由煙酰胺磷酸核糖轉(zhuǎn)移酶(nicotinamide phosphoribosyltransferase,NAMPT)基因編碼的蛋白是煙酰胺腺嘌呤二核苷酸(NAD)生物合成過程中的關(guān)鍵酶。它可在組織或細胞水平影響機體代謝、細胞增殖分化與凋亡,尤其是衰老過程。NAMPT 在人類多種惡性腫瘤中上調(diào),包括乳腺癌、前列腺癌、甲狀腺癌、胃癌和多種造血系統(tǒng)惡性腫瘤[26-27]。與此同時,在一些惡性腫瘤如胃癌、甲狀腺癌和前列腺癌中,NAMPT的表達與腫瘤侵襲和化學治療耐藥相關(guān)[28]。有文獻[29]也報道了在結(jié)直腸癌中NAMPT 明顯上調(diào),且NAMPT 通過控制干細胞信號途徑增加了癌癥起始細胞的數(shù)量,從而導致了結(jié)直腸癌的發(fā)生。通過對circRNA 網(wǎng)絡的分析,hsa-miR-576-5p 與hsa-miR-1228 與NAMPT 關(guān) 系 密 切,因此我們推測hsa_circ_0008192 或hsa_circ_0023984 高表達患者OS 總體變短可能與circ0023984-miR-576-5p-NAMPT或circ0008192-miR1228-NAMPT調(diào)控軸相關(guān)。

綜上,本研究利用高通量測序篩選了差異表達的circRNA并對相應功能進行分析,用RT-qPCR驗證了測序結(jié)果的準確性,結(jié)合患者資料分析了預后,此外構(gòu)建了部分與結(jié)直腸癌密切相關(guān)的circRNA-miRNA-mRNA 調(diào)控軸。在后續(xù)研究中,我們將從體內(nèi)外方向共同驗證和完善本研究預測的circRNA-miRNA 靶向結(jié)合網(wǎng)絡,旨在進一步研究結(jié)直腸癌發(fā)病機制,從而為結(jié)直腸癌的早期診斷與治療提供新的研究思路。

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